2DYXA

Structure of the complex of lactoferrin c-lobe with melibiose at 2.0 a resolution
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Structure of the complex of lactoferrin C-lobe with melibiose at 2.0 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 110
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dyxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dyxA02
2Y7IA 4X1BA 1XS5A 3KZGA 1IITA 4ZE9A 2O51A 3T93B 2O69A 2XXYA 4ZE8A 3VE1B 1JW1A 2P2AA 2X7PA 3H6WA 5ICTA 1QJMA 1NH7A 2I4BA 1USYH 3CVGA 4GD5A 1FTLA 1MY2A 4NTLA 5DVJA 4EXLA 1XVXA 1FQCA 1CB6A 3KOSA 4YZZA 3OXNA 4KFQA 2Y7PA 4NMYA 3D4GA 2XXWA 2UVIA 3GZGA 1VFDA 1II5A 3OSQA 2F6GA 4L17A 4EUOA 4LA9A 3A3CA 2D5WA 1BTJA 2I3VA 4ELQA 4QSCA 4OESA 1LAXA 1B52A 5CMKA 4MH5A 3Q25A 4YKPA 1FTOA 3TTKA 4LONB 4DIGA 1PBQA 1MXZA 3K01A 1MY3A 3SETA 3PU5A 1EZ9A 1LB9A 1RKMA 1LBCA 4F19A 3KSXA 3RPWA 2PT1A 2Z23A 1MG1A 2ONSA 3OO7A 2VHAA 4NE4A 4C1UA 5HPQA 3TCFA 3SEUA 1B3EA 3JV9A 4Q5TA 4Q30B 5JTYA 5I84A 4RK2A 1ZJLA 1LLSA 2Q9TA 4BDOA 1Y1MA 4AB6A 2DVCA 2UYEA 3KBRA 3LUYA 1P99A 3VXCA 4OFOA 2ZNSA 3SEWA 3OEMA 3E9XA 2RCAA 3PPNA 5BWJA 2HFBA 1M5EA 5DTBA 4OEUA 2M8CA 3EHSA 4N6PA 1SDXA 3W9VA 1B0HA 4IY5A 4KPTA 1TWYA 1JQFA 1A55A 3SERA 3MZ9A 3QUJA 1H45A 2Y7KA 5H8NA 4QSEA 3FJ7A 4H5GA 3TCGA 1LB8A 2O1LA 3EN3A 3CFLA 5AA3A 4ZECA 2H98A 4H8IA 1FQDA 1IUDA 3DP4A 3S4UA 2QL3A 1B0LA 5I2NB 3K1NA 2RINA 1F9BA 3UN6A 1TT1A 2I0CA 2CZLA 1T0KA 2A5TB 3T22A 4E0XA 2DS9A 3B6TA 5KDTA 1I6BA 2XD2A 4ZEIA 1JETA 2O7UA 4C0RA 4R73A 1JVYA 3TFLA 4Q0CA 1MQHA 4OFLA 1P1UA 3C4MA 3LC8A 2D3IA 3PMWA 4DXBA 4H1XA 1NFTA 2D21A 4DCXA 1BLFA 3VVFA 3PPOA 3HPIA 3TQWA 1QUJA 3IB2A 4ESWA 2FYIA 1FQEA 3EHTA 3B6QA 1B3LA 3Q29A 1XVYA 3MVYA 2DE3A 4TLLB 3CRBA 3TPAA 4U4XA 3FXUA 1P1OA 1FW0A 1MDP1 4WEPA 4P0GA 4ZDMA 4G68A 4YMAA 3M3LA 3K0VA 3UP9A 2R71A 3DM0A 1N7XA 3PMVA 4NF5A 1S7YA 5A5XB 1WODA 4G8NA 1POTA 2QS1A 2E0SA 4YKIA 1H44A 2NXOA 2ZNTA 5TPAA 3MPKA 4ZEKA 4HCWA 1B2HA 2ZXTA 1B46A 4WKMA 1MDQA 3EF7A 1JW5A 5EHSA 3H4ZA 1B51A 1IXCA 1MS7A 4ELRA 3UORA 4DLDA 2HAVA 5TP9A 4MFIA 2X26A 3GBAA 4F2OA 1SYHA 4OXVA 3VV5A 2BJJX 3QAXA 4O3CA 1LGBC 2E1SA 2O7IA 4ND9A 3O29A 1ATGA 3Q27A 3UK4A 5TU0A 1L5TA 1A99A 3T9HB 3PPRA 3QXMA 2QJEA 3TTMA 1I6AA 4DE8A 4ECFA 3TQLA 4QFNA 4OETA 2FA7A 3V89B 1B4HA 1A54A 3TUSA 2ZYOA 1QW0A 1SI0A 3RT8A 2ZYKA 3ZKLA 4JWYA 1SW4A 4Q8RA 4KD5A 5TPAB 4EXKA 2DQVA 4X9TA 4YU0A 3QIMA 1B7UA 2KLFA 3U8QA 3KFMA 3G3GA 3K00A 1MM7A 2DWIA 2DE2A 5TP9B 4TQUQ 2XXPA 1QUIA 4HTGA 3VXBA 2DYXA 1WVJA 1EZPA 1MH4A 4H8JA 2Q89A 4GVOA 3ILUB 3TTNA 3IJOB 2ZMBA 2CMOA 3SEXA 2QS2A 2H9BA 1MXVA 1TFAA 2XXTA 2XXQA 1NNTA 4IB2A 1FQBA 1LAFE 3R7XA 1LSTA 5AA4A 2DE4A 2IEEA 2UVGA 1SBPA 4DXUA 4R75A 1MXWA 4OZ9A 2UXAA 4RYAA 3DP6A 2HEUA 1O7TA 2YJPA 1HSEA 2UVJA 2ZYNA 2QRYA 5H8HB 3OO8A 1IIWA 4RA1A 3MAMA 4F3GA 3OO9A 2VP1A 3EPEA 3OEKA 2QS4A 2B65A 5BUUA 4F22A 4NF6A 3MUQA 1SYIA 3B6WA 5ITPA 4OERA 1DTZA 4K3FA 3MQ9A 4NF8A 1R9QA 4FECA 5AA2A 1LFIA 2HQ0A 4QSDA 4XIGQ 2REGA 4MF3A 3RNNA 1D9YA 1PB7A 1LFGA 4MBPA 1A8FA 3T9UA 3TYHA 1NNFA 1N84A 3KEIA 3HHFA 4I9DA 5ELVA 3E13X 1JW4A 1ZBMA 2ZYMA 4TLMB 4GL8A 4IO6A 5HM4B 4OHNA 5L9MA 3N26A 3BBRA 4BLAA 5EHMA 1GTKA 3I5OA 1I69A 1B5IA 2F97A 1ZTYA 4GXSB 1OVTA 2DP8A 1XT8A 3PUZE 3K6WA 1B32A 2Y7RA 4OTEA 4C1TA 4U1OA 5J1DA 1QULA 1Y4TA 4PQJA 4QRZA 3C32A 3M3KA 3DLNA 4JSOA 4Z0IA 4PETA 2PBWA 3RTWB 3K6XA 1B6HA 3MPLA 1GVCA 1Z7NE 4FEBA 1NKXA 1MM6A 5I2KA 3OELA 4N07A 5F1QA 3TTRA 2B3BA 5I59A 3UGWA 5B70A 4ELOA 4IO2A 2XX7A 3K6VA 1NNKA 1MXXA 4JB7A 4FIMA 1UTHA 2DOJA 1OLCA 3OO6A 1YTVA 3PMXA 1B5HA 3FD3A 4H0WA 1UTBA 4FORA 3OD7A 3VDFA 1H76A 4R6YA 3O9PA 1BP5A 2Z22A 3PUXE 3N94A 4I62A 3Q28A 2Y7WA 3VLUA 3E4RA 3VVDA 1JVXA 5ITOA 2AIXA 3ILTB 3IOVA 2HCAA 4JSDA 3IORA 4OENA 4OEVA 4IGRA 4P11A 4QFPA 3PUVE 2HAUA 1OMPA 1DSNA 1ELJA 1PB9A 4U23A 4ZS9A 2NWJA 3O6IA 1QVSA 2I58A 3SEYA 3KSJA 4F39A 4KHZE 1HSLA 5K2XA 2V3UA 4Z7EA 4WXJA 4R9FA 4LZ5A 4GF8A 3HO7A 2RC8A 4RY1A 3H03A 1GGGA 3CG1A 3O66A 4YKKA 4QFKA 1MQJA 3G3HA 2Q88A 4KCCA 4BDRA 3MP8A 4RJZA 2WKYA 1JEVA 4H6DA 5KCJA 1URDA 4ESXA 3C33A 5JK4A 1N0TA 1OQGA 3RT6B 1IZ1A 1LFHA 1FTJA 2P0SA 4PP0A 2AL5A 4DZ1A 5JTYB 3PUWE 3DELB 4M1VA 3MVXA 4F1VA 4U1ZA 5DVFA 1A40A 4GIZA 4U22A 4N13A 4RPNA 1AOVA 2B3FA 4LATA 3JYRA 4IO3A 1OQHA 4G4PA 1IXHA 1PB8A 2XXIA 3IK6B 3TMGA 4MLQA 1B1XA 1DPEA 2DWAA 4OFJA 1M5CA 5K2YA 1SI1A 4EDPA 2ONRA 1NH8A 3HCQA 3MP1A 3CFXA 2DXYA 3KJTA 5H8NB 4G8HA 3PV0E 3KN7A 1PDAA 4R9GA 1B58A 4QF9A 1MPCA 3VVEA 4JXIA 3P7IA 5DEXA 4DCYA 4KYSA 2REJA 3U94A 4ELPA 4PFWA 1EU8A 4UA8A 1UIVA 2DSFA 3C31A 1YAEA 3O6GA 2F6PA 1XOCA 4G77A 5FHMA 1QKAA 4U4SA 3V5AA 3UA8A 5KDTB 4YAHX 3FZVA 4H5FA 3LR1A 3IX1A 1B05A 3IOWA 4PE5B 4U21A 3LSWA 2VD2A 1DOTA 1S50A 5CBSA 4KQPA 4LVQA 2OWTA 5IAIA 4YMBA 2ALUA 4XXUA 3FJGA 3N6UA 2I49A 1BKAA 3G7WA 1LBBA 3TZAA 3PPPA 4ZEFA 4ZZEA 5I57A 1Z7ME 1XHYA 2F7AA 3OENA 5I58A 3VFJA 2X7QA 3RLFE 3CI8A 3K02A 4F31B 3A09A 5DEXB 4X1DA 2IA4A 1R9LA 4G68B 4YB7A 2F7BA 1Q35A 4ISUA 2G93A 1O64A 3IAZA 3H3GA 4NF5B 3PD8A 5F7VA 3T9VA 1R1NA 4R74A 4NF4A 1ZLQA 1B5JA 3C35A 5CMMA 2Q8JA 2OZZA 1VSOA 4I8CA 3L6HA 4OMBA 3TDJA 2RCBA 2O1MA 3TCHA 3CSGA 2V84A 1A8EA 2W7YA 1US5A 4EF2A 3N6TA 3K6UA 3H06B 2XXUA 4LQ5A 2ZNUA 1B1HA 5DVIA 5I58B 2Z8DA 2V93A 3WAEA 1N76A 4FJPA 1Y4CA 4GOTA 1TXFA 4R2BA 1MH3A 3SESA 1QUKA 2AYSA 1AL3A 1WDNA 3ECRA 4U2RA 3G3KA 3S9NC 1SVXB 1R6ZA 4R6HA 3FV2A 4XKQA 3H6TA 4YB6A 4BDMA 4FATA 1MPBA 4YICA 2GH9A 1B7HA 4OQOA 3OOAA 1A7LA 4F18A 4ZZAA 1DPPA 1O63A 4RK9A 1LCFA 4QHQA 4KCDA 4OYVA 4F3PA 1S9TA 1B4ZA 2RF1A 4GFRA 2OCUA 1ANFA 4YB5A 3S9EA 3FV1A 2YLNA 3C36A 3THIA 5CBRA 3R6UA 3S9MC 3GXAA 1B3GA 2DXRA 2F36A 2DWJA 4OVJA 1MRPA 5AE4A 4P0IA 5HBCA 4F2QA 4POWA 4DDDA 3FGSA 3T66A 3U72A 3RQTA 2QPQA 2G29A 3MVZA 5FHNA 3O97A 4RNSA 5CRYA 3GBBA 4JWXA 3TKDA 3ONMA 2PYYA 1LCTA 1YPNA 5AA4B 3HSTA 4GL0A 3RN8A 3MZBA 2Q2CA 2RKMA 1ZKBA 5B7DA 1VR5A 3RGYA 4HW8A 1MQDA 2ESNA 3KG2A 3TEPA 3DP8A 1OLAA 1EH3A 2NOOA 4IGTA 4NF6B 3SDFA 1KWHA 4LQ2A 3IJXB 1P1WA 2Z8FA 4PFYA 1RYOA 1ZU0A 4NF8B 3KGCA 3Q26A 4JBZA 1AMFA 5AA2B 2F8DA 1SD3A 3PPQA 2PVUA 4R72A 1AH5A 1PEBA 3I6VA 1MQGA 3FXQA 3CSBA 4LUBA 1B7ZA 3LSLA 3QUFA 2XXHA 3RUMA 3V8XB 3FVOA 4O3BA 4I1DA 2V25A 1M5DA 2UYFA 2HZKA 4JDFA 2HXWA 5AA1A 3ODBA 2H99A 2XHDA 2I3WA 4H65A 4XTCQ 4NEDA 2O84X 5M2VA 3O2AA 4ONYA 3E3KA 1M5BA 2VD3A 1N04A 4F1YA 4WEDA 2I6EA 1FTMA 1USYE 2F34A 1UQWA 3EHUA 4NWCA 3HN0A 2I4CA 2P1SA 2PT2A 4HS7A 3ZSFA 5L9OA 3K2DA 1J1NA 3T96B 4QFLA 4EF1A 4F1UA 2V3TA 2OJTA 4OWDA 3RY3A 2NUVA 5I2KB 1Y3QA 5I59B 1IQ7A 1MQIA 5CI5A 2I48A 1URSA 3D4CA 1GR2A 3K1MA 3OMBA 3VLWA 5CMCA 2PMSA 3C9HA 3W15C 3MC2A 4POXA 4E0WA 3SEVA 3FVNA 3PD9A 3KN8A 2Z8EA 1UTHB 2RC9A 5EYFA 1LAGE 1JEUA 1LAHE 3IB0A 4EQ9A 1UTBB 4LP2B 3RTFB 2Y84A 1D4NA 3T9XB 5I2NA 1JNFA 2GFEA 2OBGA 2A5TA 4KR5A 2VOZA 1Y3PA 3EQ1A 1PBPA 1MY0A 1DTGA 3W9WA 3U1OA 2PX1A 5IKBA 4KYDA 1N3WA 1OVBA 4F3SA 1YCJA 4HCYA 1SW5A 1IXGA 1CE2A 4FEDA 3MP6A 1H3DA 2F7CA 4ZEBA 3CG3A 2F5XA 4GXAA 4YKJA 2GHAA 4XKNA 1MXUA 1NNPA 3PUYE 5L8DA 1NL5A 3MJNA 4BDLA 2QMXA 4F3BA 3QYTA 4G68C 2DWHA 1N3XA 2Q2AA 5A5XA 2F78A 3K4UA 2GHBA 2ONKE 3BKIB 1MXYA 1FQFA 3QSLA 1Y3NA 3SKPA 5KCJB 4FAJA 3KOTA 3OSRA 3F11A 2QS3A 1QKBA 1XC1A 2H25A 1B9JA 3FIRA 1IXIA 5ICQA 5CMBA 3ZKKA 2XXRA 3IOTA 2I0BA 4EQ7A 2H4IA 3HV1A 4PFUA 1PC3A 3IR1A 2QMWA 1RYXA 3MVWA 3H7MA 2A5SA 1OIBA 1EZOA 1VE4A 2H5YA 2ABHA 1MY1A 2XXVA 2DVZA 3LSXA 2F35A 2QSXA 3FATA 1NMUA 5L9SA 3S9LC 4R2FA 2HZLA 3LBSA 1B3FA 5LOMA 2O6AA 1MPDA 4THIA 3MZ1A 5DT6A 4G8MA 4NWDA 2R6GE 3IOUA 4GRKA 5H8SA 4GWOA 2YPNA 3H6UA 4GLIA 3O6HA 5H8FA 3FUZA 1N7WA 4H67A 1D9VA 3QK6A 4ZEDA 3A3UA 2XX8A 3MWBA 4MLVA 2NVUB 4RPOA 2LAOA 1URGA 4DXCA 5I56A 5CM6A 3UIFA 5AA2D 4EQBA 3FVKA 4F29A 5KZTA 4PFTA 4LZ7A 3MW0A 3LSFB 5DYHA 5FHOA 1IEJA 3HHGA 2AL4A 2XX9A 1P1QA 1FTKA 1UIUA 5I57B 4IO5A 4IO7A 3R26A 3U92A 4FE8A 4UACA 1GV8A 2ANJA 5H8QA 3BFUA 1SQYA 3IL1B 1P1NA 2GRVA 5H8HA 2R9JA 2THIA 5H8FB 1B40A 3IO6A 3S2VA 5CC2A 1TFDA 1FCKA 2RC7A 3G3IA 1VFEA 1FQAA 2VGQA 5JEIA 4NF4B 3V83A 4JWOA 5I56B 1DMBA 4RXLA 1Y1ZA 3FVGA 3TTLA 5FTIA 2OLBA 4QFOA 3JZJA 4XKPA 3TODA 3I3VA 4M4GA 3TAJA 1ZMGA 4KYEA 3K1PA 3CFZA 3N5LA 5ISUA 1D3KA 2XD3A 5H8QB 3ZS6A 1AIVA 1Y9UA 4X48A 2OK2A 3FXRA 4IY6A 1SW1A 4AB5A 4BDQA 4GQOA 3CIJA 2FNCA 3VLVA 4LZ8A 4TOZA 4AQ4A 1Q1KA 3B7DA 1M5FA 3G3FA 3TELA 3AXFA 4G2ZA 2XXXA 3CR9A 1HSJA 2O68A 4BDNA 4O3AA 3WAFA 1H43A 1MY4A 1US4A 3M3FA 3FASA 3PGFA 3M8UA 1I6QA 3KJ7A 3H6VA 3MBPA 2V3QA 1POY1 4R6KA 3IB1A 4KI0E 3G3JA 1Y20A 1ZIUA 2OWSA 3U93A 4XKRA 1BIYA 3L6GA 3IO4A 3O28A 3BFTA 3GLBA 2UVHA 3FJMA 5FTHA 1B3HA 3USDA 3C34A 4IO4A 3KN3A 1SW2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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