2E1SA

Crystal structure of the complex of c-terminal half of bovine lactoferrin and arabinose at 2.7 a resolution
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex of C-terminal half of bovine lactoferrin and arabinose at 2.7 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 109
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-10-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2e1sA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2e1sA02
2HFBA 2OWTA 3TTLA 2I58A 1LSTA 1USYH 5AA2D 4OHNA 3S9NC 3VLVA 3PPNA 3RNNA 3O2AA 4MBPA 3Q26A 2XX9A 3KEIA 1QKAA 5I2NA 4QHQA 3UN6A 4HCWA 3K2DA 1WODA 4NF6A 1MQJA 2I3VA 3UP9A 2D5WA 1VFEA 1DPPA 3UORA 3IK6B 4GF8A 4F29A 1I6BA 1QUJA 4EF2A 5IAIA 5A5XB 4F39A 3U8QA 5H8QA 1JETA 5TP9B 1POY1 4WKMA 2NXOA 4NTLA 1P1WA 4MLQA 4ZZEA 1A55A 1SD3A 2ONSA 4R2BA 5I2KB 1MXXA 3SEWA 1BKAA 2PX1A 4MF3A 1POTA 3MZBA 3MUQA 4L17A 1M5EA 2AIXA 4OWDA 4NEDA 2M8CA 2QS2A 3DP6A 4LQ2A 1H3DA 1I6AA 2I49A 4R6YA 2NUVA 3L6HA 1ZKBA 2RF1A 4RA1A 1HSEA 3ODBA 3SEXA 4LATA 3B7DA 4YKJA 4IO2A 3H7MA 4QFPA 3O29A 1SQYA 4QSDA 3G3FA 4QFKA 1FQAA 1NL5A 3SKPA 2QJEA 2GRVA 2Y7IA 5ICTA 4R9GA 4YKIA 5I84A 3VXCA 4NF5A 4AB6A 2XXPA 1AIVA 3TYHA 1AMFA 5B7DA 2DS9A 4LZ7A 1JW4A 2HQ0A 1PB7A 2R71A 2Y7PA 3PV0E 3PU5A 1A8EA 1AH5A 2V3UA 1IXHA 3K0VA 3HCQA 3IL1B 4TLLB 2O1LA 3RTWB 2HZKA 5FHNA 4G8NA 5JK4A 4ZE9A 3PPRA 4GLIA 3K00A 3Q28A 3I5OA 3M3LA 4KYSA 3ILTB 1A99A 2G93A 2Z8FA 4GVOA 3A3CA 2R9JA 2V93A 2QS4A 1II5A 3VVDA 4F1UA 4YU0A 1J1NA 3LSWA 3E9XA 5H8NA 3VXBA 1OVTA 2LAOA 4RJZA 3T22A 1A8FA 4C1TA 2DOJA 4ZE8A 4O3CA 3KSJA 3EN3A 2QMXA 1MQHA 3THIA 4I9DA 4XKNA 2O84X 4DXUA 2Y84A 3IO4A 4Q0CA 2ESNA 2R6GE 4OENA 5TU0A 1ZMGA 4QFOA 5FTHA 2CZLA 3CRBA 4X1BA 1P1NA 5KZTA 3MVYA 4KCDA 4KPTA 3GXAA 5H8HA 3UA8A 4F3PA 5TPAA 1P1QA 3UGWA 2I4CA 3KBRA 2F97A 1B9JA 3QAXA 1B52A 1B5IA 3MQ9A 2PBWA 1Y3NA 1MXZA 3IJOB 4EXKA 4ESWA 5ELVA 2QSXA 1TWYA 4JDFA 2PVUA 2PMSA 1URSA 2RKMA 3TODA 2F7CA 2X7PA 2XX7A 5ICQA 2IA4A 4R73A 1B3EA 1SYIA 4NF8B 5DYHA 3MBPA 1FTMA 3FD3A 2UVHA 5DTBA 3RTFB 5K2YA 3H6TA 4YB6A 4F19A 1B0HA 3CG1A 4GXSB 3JZJA 1XS5A 1HSLA 3AXFA 1B3HA 3T96B 3TCFA 3W15C 1MH3A 3K02A 3G3IA 4AQ4A 3C34A 5CMMA 1SW4A 4OEUA 3KGCA 4ZEIA 1MXWA 3TTKA 5K2XA 4YKPA 2ANJA 3O66A 3IB0A 4OFJA 4G8HA 3HPIA 1YTVA 1JVXA 2OBGA 4FEBA 4THIA 4F22A 5DVJA 3IOTA 4Z0IA 4G68B 1UIVA 1ZLQA 3PMWA 2KLFA 4NWCA 1N76A 1MG1A 1ATGA 4WEPA 4H65A 1VE4A 3TTRA 2ZXTA 4RNSA 4YICA 4NF4A 2HXWA 1NNPA 3TTMA 1B5HA 3T9VA 1P99A 4E0XA 5KDTB 5ISUA 3Q25A 2QS1A 2AL4A 4QFNA 3MVZA 4H5FA 2NOOA 4G68C 4I62A 1TFDA 4U1OA 1LBBA 2UVGA 2O51A 4E0WA 5F7VA 1D4NA 5H8FB 2DVZA 2Z8DA 1UIUA 3S9EA 1ZJLA 4XIGQ 1A7LA 3FZVA 3VVFA 1B3FA 1EH3A 2F8DA 3LUYA 3KSXA 4KYEA 4RYAA 1VFDA 3G7WA 4IGTA 3LSXA 3MJNA 2DWAA 5LOMA 1LLSA 3E4RA 2F78A 3TQLA 3EF7A 1MY2A 4Q5TA 2F7AA 2VP1A 1R9LA 2I6EA 2GFEA 3IORA 3TMGA 5L9MA 2YLNA 1IUDA 3HN0A 4GIZA 3CFLA 1PB8A 4RPOA 1LCTA 1IQ7A 5CC2A 3K6VA 1RKMA 3OSRA 4ELOA 5FHOA 4KHZE 4U1ZA 3IOVA 4X1DA 4ZS9A 1QW0A 3ZKKA 4F3BA 1US5A 3O6GA 3PUWE 4JSDA 1H76A 1GR2A 1LGBC 2O69A 3FUZA 4IO3A 2CMOA 3DP4A 5DVIA 1VR5A 1PDAA 4PP0A 5I56A 1M5CA 3CR9A 4ZDMA 3PUZE 2X7QA 1MM6A 4IO6A 1GVCA 4M4GA 4F1VA 3OSQA 2ONRA 1B46A 3V5AA 3N6UA 4PQJA 5AA1A 5I58B 1ZIUA 3D4CA 4U4SA 5CBSA 1MPBA 1B3LA 2UYFA 2XHDA 2HCAA 3KOTA 2B3BA 3E3KA 2GHBA 3DP8A 5AA2B 3OOAA 4F1YA 2RCBA 4YZZA 1IXCA 4BDMA 1BIYA 1CE2A 1MXYA 1H44A 3S9LC 4QFLA 1XHYA 1MDP1 3BFUA 2H9BA 1MY1A 1ELJA 1JNFA 3I3VA 3V89B 3LSLA 4F18A 3TCHA 1B7UA 3S4UA 1SW2A 2DYXA 4DXCA 5EYFA 1FQCA 3C31A 4FIMA 4G4PA 5A5XA 3LR1A 4DZ1A 5BWJA 4LP2B 4TQUQ 5I2NB 3RN8A 1PBPA 3T9UA 3MZ9A 2Q2CA 3IB1A 1Q1KA 4GL0A 1T0KA 2Q89A 4FEDA 2I0CA 4F2OA 3CFZA 4JBZA 5CMKA 1N7WA 4N07A 2Y7RA 1N7XA 1LBCA 5H8QB 3SESA 4ZEBA 2H4IA 1UTHB 3QK6A 3H6WA 1DTZA 5HM4B 4ELPA 3O9PA 2OWSA 5L9SA 4IB2A 3MP6A 3C36A 4YKKA 3N6TA 5KCJB 4N13A 2Z8EA 4YMAA 2FYIA 1NH7A 2I0BA 1B5JA 4JXIA 1B4ZA 4RXLA 3C33A 3TCGA 1OMPA 1YCJA 4P0IA 1N3WA 4XKQA 2AYSA 1WVJA 3SETA 1LFGA 3T66A 4R74A 2PYYA 4Q8RA 5L9OA 4JWOA 1DTGA 1S50A 4OZ9A 3K6UA 1PEBA 3TPAA 3RLFE 1SI1A 4PFUA 1B7HA 3U1OA 4KR5A 1A54A 3FATA 1N0TA 1TXFA 3I6VA 1B40A 1LFIA 2OZZA 1FQEA 3K1MA 4YAHX 2RC8A 4EQ9A 4MH5A 3U72A 3N26A 3T9XB 4EQ7A 1URDA 2DQVA 4LQ5A 4GD5A 4IO4A 4BDQA 5IKBA 3RT8A 2VOZA 4U2RA 1IEJA 5BUUA 1A40A 3HHFA 4F2QA 1B2HA 3FXQA 3RQTA 2DVCA 3OO9A 3B6TA 1VSOA 1FTLA 3P7IA 4P0GA 4DCXA 3ZS6A 2Q8JA 3UIFA 3PGFA 1B3GA 2O68A 1IITA 2YPNA 3FIRA 3RPWA 2XXQA 2F6GA 1P1OA 3H06B 2ABHA 2ONKE 1N84A 2UXAA 3PPPA 1XVYA 2F36A 4ND9A 3MP8A 1ANFA 2ZNSA 1RYOA 3FASA 2GH9A 2F5XA 3H03A 1MXVA 4GQOA 3IR1A 4JWXA 1D9VA 4KCCA 2QS3A 2G29A 3U94A 3TTNA 3BFTA 1F9BA 2W7YA 2F7BA 3IJXB 3WAFA 3OXNA 2XX8A 1Z7NE 1JW5A 3FVOA 1P1UA 1DOTA 1NNFA 5JTYB 1LAXA 4OMBA 4MLVA 5H8HB 5TPAB 1MY0A 3K4UA 3B6QA 4LZ8A 4RK2A 4BDNA 3TZAA 3E13X 4ESXA 3G3GA 5FTIA 3A3UA 2RCAA 4POXA 1TFAA 4G8MA 5I57A 1Y1MA 1JEUA 3ONMA 3VLWA 1QKBA 4HCYA 1Y20A 1IXGA 2VHAA 1JQFA 3CSGA 2A5SA 1Y4TA 1B4HA 4HS7A 3OO8A 3QIMA 4POWA 2ZNTA 1NNKA 1DPEA 2F6PA 2UYEA 1SW5A 1UTBA 3GZGA 1NKXA 1UQWA 3D4GA 4ZEFA 4X9TA 5AA4B 3IOWA 4GFRA 3CSBA 4NMYA 3LSFB 4O3AA 5I59B 3R6UA 2DSFA 4ZEKA 3QUJA 5ITOA 1FCKA 1EZOA 1HSJA 3KZGA 3EHUA 3HSTA 4H67A 3MW0A 3OO7A 4PETA 3VE1B 2Q2AA 1D3KA 3VFJA 5CRYA 4DDDA 3OD7A 1M5BA 1SW1A 5L8DA 1LB9A 2DE2A 3HHGA 1XOCA 1MQDA 3PD8A 4WXJA 4WEDA 3T9HB 3KOSA 3MP1A 4QSEA 4H5GA 3FJMA 1OQGA 4YB7A 4NF4B 3EHTA 4P11A 3G3JA 2ZYOA 3H3GA 4ECFA 2XXUA 1MQIA 1LB8A 1Y3PA 2O7UA 4FORA 2HAUA 3FGSA 3W9WA 5HBCA 3PPQA 4YB5A 2DXRA 3M3KA 5F1QA 2RC7A 3FVGA 4BDRA 3OEMA 2UVIA 2ZYMA 4H0WA 2DWIA 3KG2A 2YJPA 3KFMA 2XXVA 3ZSFA 5EHSA 3KJ7A 1XT8A 2XXIA 4ELQA 4F31B 1O7TA 1S9TA 2DE4A 1B1HA 1URGA 2H98A 3GLBA 3TQWA 4HW8A 1NH8A 4GWOA 2BJJX 4OXVA 3VVEA 1O63A 3DELB 1H43A 2XXWA 2A5TB 1JEVA 4U23A 3QXMA 2F35A 4RPNA 1ZTYA 1USYE 2H5YA 4PFWA 4GOTA 1TT1A 5EHMA 5I58A 3BBRA 2Z22A 1FW0A 3V83A 3PUYE 5DEXA 1LFHA 4R2FA 1OLAA 4G2ZA 1MS7A 4M1VA 4OFLA 4O3BA 2B65A 3CFXA 2XXTA 4OEVA 3O97A 4LONB 1QVSA 3M8UA 5ITPA 4XTCQ 2XXXA 5AA2A 1DSNA 2DXYA 4OESA 3PPOA 1MXUA 1KWHA 3ECRA 4U22A 3CI8A 3F11A 4X48A 4BDLA 4H8IA 4FECA 1DMBA 3R7XA 1MDQA 3HV1A 3C4MA 1RYXA 3CVGA 4BDOA 4Q30B 2WKYA 5TP9A 3RY3A 4NF6B 1Y3QA 1B7ZA 2H99A 4LVQA 1LAGE 1MM7A 4UA8A 2I3WA 4PE5B 4OYVA 1M5DA 2UVJA 5I2KA 3PD9A 4XKPA 3K1NA 4YMBA 4QSCA 2P0SA 2NWJA 2I4BA 3JYRA 2Z23A 4FE8A 4IY5A 1UTHA 2OCUA 4XKRA 4JSOA 3IB2A 4ZEDA 5KCJA 3U92A 1B6HA 1YPNA 3RUMA 1EZ9A 3N94A 2F34A 1B32A 3RT6B 3OELA 5H8SA 4ZECA 5CMBA 1IZ1A 4G77A 1O64A 4R6HA 3IAZA 3FV2A 4Z7EA 1OQHA 5CM6A 5CBRA 2V25A 4TLMB 1SI0A 3MWBA 3KN7A 3FJ7A 1MRPA 2FNCA 2O7IA 4EUOA 3H6UA 3H4ZA 4U4XA 3EPEA 2VD3A 2NVUB 4I8CA 1IIWA 1D9YA 3MPLA 4QRZA 4F3GA 2V3TA 2QPQA 2PT1A 1US4A 3N5LA 4H1XA 3GBBA 4R6KA 1LAHE 3MVXA 5HPQA 4H8JA 4I1DA 3S9MC 4NF5B 4TOZA 2DP8A 4NE4A 1Y4CA 3MVWA 2V84A 1BTJA 1NFTA 4RK9A 4DCYA 1SDXA 3TDJA 4DXBA 2P2AA 2OLBA 3ILUB 4F3SA 4K3FA 4ONYA 4AB5A 3IX1A 2HZLA 2ZYNA 1MQGA 3USDA 2RC9A 1FQBA 3LC8A 4GRKA 4ELRA 1QUIA 1EZPA 2I48A 4KI0E 1ZU0A 1NMUA 5H8NB 3M3FA 2DE3A 4OERA 4IY6A 3FJGA 4DE8A 1QULA 4KFQA 3EHSA 1MY3A 3O6HA 1R6ZA 1H45A 2V3QA 2XD2A 1MH4A 2AL5A 4KD5A 4NWDA 1FTKA 4OETA 5JEIA 3C9HA 4HTGA 4EQBA 3MPKA 3ZKLA 5JTYA 3K6XA 3KJTA 4EF1A 4XXUA 1FQDA 4FJPA 3K1PA 1MPCA 5M2VA 3SEYA 4LUBA 2QMWA 4C1UA 2DWJA 3OEKA 1AOVA 3FVKA 3B6WA 4NF8A 3LBSA 1B0LA 3TEPA 3MZ1A 4KYDA 5CI5A 1CB6A 5J1DA 3CG3A 1AL3A 3L6GA 4PFTA 3VV5A 4DLDA 5I57B 1OLCA 3MC2A 3JV9A 1XC1A 3IOUA 4LA9A 4BLAA 3SDFA 2Y7WA 1N04A 2VD2A 3CIJA 3TKDA 4FAJA 5AA4A 1GGGA 3G3KA 4U21A 3SEUA 1B05A 1BP5A 2ZYKA 5I59A 2FA7A 4R75A 1S7YA 2HAVA 1UTBB 4QF9A 4G68A 5DT6A 4IGRA 2REGA 4JB7A 2ALUA 1SBPA 2B3FA 1FTOA 3Q29A 2D3IA 3H6VA 3W9VA 3C35A 1L5TA 2XD3A 1N3XA 1JVYA 2HEUA 2GHAA 4EXLA 3Q27A 4GL8A 3EQ1A 3PUVE 1Y1ZA 3IO6A 2THIA 3KN3A 1LCFA 3DLNA 3OO6A 1FQFA 1YAEA 5KDTA 1Y9UA 4OVJA 1LAFE 2XXHA 2O6AA 3V8XB 2DWHA 1MPDA 3QYTA 1IXIA 2E0SA 3PMVA 1M5FA 3SERA 1I6QA 3FVNA 4H6DA 1EU8A 1R9QA 1OIBA 2RINA 4R9FA 4OFOA 5B70A 3PMXA 5H8FA 2X26A 1PB9A 3T93B 3FV1A 3VLUA 3HO7A 4DIGA 1B1XA 1BLFA 2O1MA 1NNTA 1OVBA 2E1SA 3OENA 3TELA 3RGYA 4PFYA 1I69A 1XVXA 2OJTA 3C32A 3FXUA 3U93A 1PC3A 3A09A 1FTJA 1R1NA 4GXAA 2H25A 2Q9TA 1ZBMA 2Q88A 3S2VA 2QRYA 3KN8A 5CMCA 1MY4A 3BKIB 4OTEA 4IO5A 3O6IA 3PUXE 4KQPA 4ZZAA 3TFLA 2PT2A 1QUKA 2VGQA 1GV8A 5AE4A 4C0RA 3SEVA 3VDFA 1PBQA 4LZ5A 3TAJA 3OMBA 4ISUA 4UACA 3GBAA 3K01A 1B58A 4EDPA 2A5TA 4OQOA 3WAEA 1JW1A 2P1SA 3K6WA 2XXRA 4IO7A 3O28A 4N6PA 1Q35A 2Y7KA 1SYHA 3QUFA 2D21A 2IEEA 1WDNA 5I56B 2ZNUA 3QSLA 5AA3A 5FHMA 2QL3A 2XXYA 1B51A 2OK2A 5DVFA 2REJA 2ZMBA 3UK4A 1QJMA 4MFIA 1GTKA 3DM0A 3R26A 3G3HA 3TUSA 4R72A 4FATA 4JWYA 3FXRA 4RY1A 3MAMA 1Z7ME 1SVXB 5DEXB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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