2E2OA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in complex with glucose
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
299
structure length
299
Chain Sequence
MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLISD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Sulfolobus tokodaii
molecule keywords HEXOKINASE
total genus 112
structure length 299
sequence length 299
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2oA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2oA01
3FGUA 3ENOA 3D2FB 5BPNA 3VF2A 3SLCA 3EL2A 2P9UA 2P9KB 1NGJA 2A3ZA 3M3ZA 3FFKB 2DPNA 4EFHA 1TUYA 1BDGA 4BRMA 1TUUA 3CJAA 1ATSA 1E4FT 1XC3A 3QB0A 4JN4A 5EXWA 3QBWA 5AFUH 4BC3A 1WUAA 1SAZA 4WQ5A 3VEOA 1V4SA 1Y64A 5AR0A 2Q1NA 4BRAA 2P9SB 4F9OA 5AQMA 1T6DA 2V51B 4BVOA 4BQLA 3ATVA 3CJ1A 5AZJA 4RCHA 2P9KA 1Z05A 2FF6A 1QZ5A 3MDQA 3M6GA 5BR9A 2FXUA 5FPDA 2NRHA 3R6MA 4BRKA 1HX1A 4B9QA 1HUXA 5AQSA 4DHYA 1KAZA 5BRFA 3MK6A 5AZIB 4IJNA 4A61A 2I7PA 1HJOA 4ISGA 4BRHA 3VESA 3H3NO 1R59O 3UE5A 3TPQA 3C7NB 4BRLA 1YVNA 2E2NA 2P9NB 2A5XA 3GE1A 4CZIA 2W41A 1NGCA 3HI0A 1D4XA 4XEIA 3CETA 4H5WA 1WOQA 1NGIA 2WUSA 1QQMA 3H45C 4MO5A 2ASPA 2E1YA 3CJBA 2F9WA 1V4TA 4M7YA 1RDWX 1P8ZA 1X3MA 4FL9A 1QQOA 2Q2RA 4YDUA 2GELA 4Y0WA 5EOYA 1MDUB 5AZIA 1ATNA 3BF3A 4PL7A 3MN6A 5LJVA 3EZWA 3A0IX 4A62A 4FPAA 5I9EB 3C7NA 5AQGA 4CZJA 2P9NA 3U9ZA 2QM1A 3J8AA 5KPTA 1U6ZA 4IXCA 3WQUA 4H5VA 3UKRB 4KBOA 3W0LA 3HBTA 1MWKA 3O1WA 3A5MC 5KPZA 1TYQB 3CIPA 4FWSA 3IMXA 4CBWA 3BEXA 2ASMA 1QZ6A 3L0QA 1NBWA 3CQXA 2P9IB 5BRDA 2HOEA 1C0FA 1BUPA 3EKUA 5LY3A 2E1ZA 2OANA 5AQNA 5BPLA 4BROA 3IDHA 4BR5A 4DB3A 5ADXH 1XUPO 3CI5A 3LM9A 4HTLA 3H1VX 4BR7A 5AQZA 2ZGYA 3D7EO 3UKRA 3GL1A 1KAXA 3VF6A 3AY9A 1LOTB 2CGLA 5AQIA 1NGGA 4PKHA 4CZMA 1QQNA 1TYQA 4XH5A 3LDNA 5JLHA 3HTVA 1BO5O 1NGAA 3CJ9A 2P9IA 4BRCA 4PKGA 1T6CA 2VCPA 4CJ7A 3GG4A 3ID8A 1BA0A 3H3OB 3H6EA 5BN9A 4BRIA 2VWBA 2CGKA 2QWQA 4FWNA 2I7NA 4EHTA 4H5TA 3O08A 5AQYA 3VGKA 3GDQA 3WXJA 5AQHA 3ZEUA 1GLFO 3LDPA 5KPRA 1JCFA 2J4RA 2Q97A 3VOVA 3QMLA 4FWOA 1NWKA 4IZ9A 4H5RA 3R8EA 3C0BA 2HF4A 4PKIA 3VEZA 3CQYA 1NMDA 3QFPA 1S3XA 1DEJA 2QWPA 4FWPA 3ZETB 3D2FA 5B8HA 4C23A 3GOIA 3RSEB 4BR9A 4J8FA 4BGAA 3BUZB 4FWMA 2V52B 3WUHA 3WXIA 4BRQA 3JXUA 1SQKA 2CGJA 3KZBA 1Z6RA 5BN8A 5EVZA 2W40A 3VPZA 2GWKA 3CJ7A 1NGFA 3L6QA 1K8KB 3BP8A 3SMPA 3SJHA 3QFUA 3EKSA 3M1FA 4M63C 4EHUA 1BWFO 3UB5A 2P9SA 4FOEA 4MLEA 3ZETA 4FPBA 4A2AA 4H5NA 3D2EB 2HMPA 2IVOA 4XH4A 3RSEA 3WEEB 3VEYA 4H0XB 4NO7A 5AQPA 4ISEA 1IG8A 3O1BA 4QS9A 3AARA 3L4IA 4CZKA 3EN9A 3LL3A 5F0XA 2E2QA 1NGEA 4BRFA 1RGIA 4BRGA 2EWSA 4BREA 2YCHA 3U9DA 3SK3A 5BRHA 1MWMA 4A2BA 1OKJA 4FWLA 1K8KA 4DQ8A 5AQRA 1LCUA 2NZTA 1X9JA 2E2OA 4XH1A 2H3GX 2IIRA 4FWKA 5BPMA 1EQYA 4AM6A 5EX5A 4CZGA 1HPMA 5AQLA 1BG3A 3VEXA 3IUCA 1H1VA 2A41A 3FZLA 1GLLO 5CE3A 5JLFA 5BREA 1GLDG 2FSNA 2E2PA 5AFUA 2UYTA 2ASOA 5AQFA 3VETA 2ITMA 1E4GT 2AP1A 3O5BA 3VGMA 2FF3B 3DXMB 3B8AX 3S41A 4BG9A 4CZHA 2YJEA 4EIAA 4K42A 2QWNA 4MO4A 5FPMA 1J6ZA 1HKCA 3WXKA 4BG8A 4K41A 1JCGA 4JNEA 3P4IA 4BRPA 2HF3A 3VENA 4JHDB 2QWRA 3AAPA 2D4WA 3SMSA 3EO3A 1XQSC 3VGLA 2A42A 3FLCO 3FZMA 4BQZA 3VEWA 1MA9B 2Q0UA 5AQKA 2GUPA 5AQWA 4BVPA 5FPEA 3ENHA 5ELZA 3FZFA 3DXMA 4H0PA 5FPNA 1QHAA 4BR4A 2QWOA 2A40A 1GLJO 1NGBA 2AA4A 3VERA 1G99A 3DXKB 4FOIA 3KVGA 3U4LA 3CHWA 3A5OC 4H0YB 4AM7A 4CD1A 3WXLA 3JS6A 1HLUA 4BR2A 4O8KA 5AQQA 1NGDA 5F2RA 3WT0A 4JHDA 3MMVA 5AZJB 1HKBA 5TKYA 1YXQA 1YUWA 4B1YB 2D0OA 1BU6O 3VF4A 4LC9B 1BOTO 1IJJA 3HSCA 2D1KA 3QDKA 4BC4A 3O4WA 4HWIA 3O8MA 1RFQA 2QXLA 2FSJA 3H46O 2QWMA 1BA1A 1GLCG 1Q18A 3CJCA 4RWTA 3MN9A 3QICA 3DWLA 3DXKA 4GNIA 4K25A 3AAQA 2CH5A 3LM2A 1SZ2A 5JICA 2YI1A 3ZX2A 2ZWHA 3FZHA 4CBUA 5E84A 4YDUC 4JAXA 5EY4A 3A5NC 3ZX3A 3DAWA 4JD2B 3U8XA 1S22A 1U2VB 3ATUA 4K43A 1NLVA 4H0VB 4GY2B 4RTFD 2ZGZA 1DKGD 1YAGA 3DJCA 4H0OA 3ULEB 3IFRA 1C0GA 5ADXA 2BUPA 2GWJA 3LDLA 1GLAG 2V7ZA 2GEMA 2PAVA 2FLOA 5KQ8A 4FWRA 4BR0A 3F9MA 3GBTA 1T44A 3O80A 5AQJA 3G25A 3CERA 2P9PB 4L3QA 4BGBA 5F1XA 4CD3A 4H03B 1ZXOA 2P9LB 4QS8A 1ATRA 2A6AA 4CZEA 3A8YA 3KHYA 4JD2A 1GLEG 2V7YA 1U2VA 2QW9A 3D2EA 3VEVA 2FSKA 4EAHD 4WQ4C 1ZBSA 3UKUB 3WEEA 5AQTA 1KAYA 1NM1A 2KHOA 3ULEA 4CZLA 3QBXA 3MN5A 4O5FA 2F9TA 3WQTA 3ZX0A 4IWVA 4DCHA 1DGKN 4I6MB 4PL8A 1GLBG 3FE1A 2QWLA 2IVNA 3W3DA 3LDOA 4H0TB 1X3NA 4FSVA 4BC5A 4B1VA 2P9PA 3MN7A 4MLHA 4E1JA 4Z94A 3TU5A 2GTDA 2P9LA 4IO8A 2BTFA 4ISFA 5LJWA 1ESVA 2E8AA 3HM8A 4QS7A 1CZAN 1JCEA 1NGHA 2YHWA 4B1UB 4WYBA 2NLXA 3BF1A 5AQVA 2VYPA 1HKGA 4BRNA 3UKUA 2Q31A 4B1WB 3FZKA 2P9UB 4B1XB 3MCPA 5AQOA 4M7XA 4CZFA 2Q36A 2D0PA 4I6MA 4WQ5C 5AQXA 4B1ZA 3A5LC 3I8BA 2E88A 2YHYA 4BC2A 4BRDA 1ZC6A 3H1QA 4WQ4A 2Q0RA 4CI6A 4IJAA 2CH6A 2YJFA 4FWQA 5AQUA 4NB4A 1KXPA 3ZEUB 3OHRA 3LDQA 4CBXA 3O6WA 2IVPA 2YHXA 3FR0A 3HZ6A 2ZF5O 3I33A 5KQDA 4FO0A 5E26A 5JMVA 2E20A 2PBDA 3R9PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DQIA 4CHYA 3RWUA 3D2FB 5BPNA 2GV9A 5LL6Z 1QSYA 2HW3A 1EKEA 2NRZA 1RT3A 1CZ9A 3SLCA 3BDPA 4DSEA 3EL2A 2PY5A 2P9KB 3OS0A 2HVHA 1QE1A 5CZ2A 1L3TA 2PYJA 4X62K 1TUUA 3MXMA 5JS2A 2HNYA 3QB0A 5EXWA 1OH5A 1S72N 3SPYA 3PY8A 4R5PA 2RHKA 3E1YA 5J2QA 4N47A 1Y64A 3C6TA 1I94K 4OPAA 3ISNC 1SS6A 2Q1NA 3AA3A 3CYMA 1M90O 4F9OA 3HM9A 3ATVA 4Q0BA 2P9KA 2FF6A 1QZ5A 3K9KA 2FXUA 1VSDA 5FPDA 2NRHA 3QNOA 3P1GA 2D0CA 1LWCA 4DHYA 2VGMA 4KPYA 3J7YP 3OS2A 1WB9A 3O9RA 4NCBA 2OZSA 4CJVA 3C7NB 4BRLA 1J5OA 2IDOA 4JEPA 3GE1A 1KVBA 5M1KA 4JYAK 4H5WA 1WOQA 2HSTA 3ZSZA 2WUSA 4DWIA 5C12A 1NK7A 1VQON 5T7BA 2KFNA 2VQEK 3SJJA 4M7YA 4E7HA 1X3MA 3VTIA 2W6LA 2RE2A 2ITGA 4E0DA 1ATNA 3BF3A 3MN6A 5LJVA 2KLAA 5DM7L 4N5SA 3C7NA 1HMVA 2O4GA 4CJSA 3CCJN 2LSNA 2QM1A 5KPTA 1U6ZA 2BANA 4H5VA 2O8EB 3W0LA 2W6KA 3HBTA 1U45A 2NRRA 1Q7YO 1MWKA 5HRNA 3U3YA 2PZSA 3CIPA 4KHWA 3L0QA 1NBWA 3P5JA 3CQXA 2P9IB 5BRDA 4CE9A 4CHQA 1NKBA 1BUPA 1VSHA 3MWPA 1X9MA 2IAJA 4IFEA 1RT6A 2E1ZA 5BPLA 4BROA 5ADXH 1NJXA 4A5BA 4LSLA 4W5TA 2HHXA 1HYVA 4BR7A 4RW4A 4KHNA 2O8EA 4JI2K 1TL3A 1X1PA 3SUPA 1C0TA 3PSFA 4DUYK 3K5MA 4PKHA 3OYLA 1XMQK 4YY3K 1QQNA 3QETA 3A2FA 3LDNA 3ZYYX 3HTVA 2P9IA 2P5OA 4B3OA 3TR8A 2WFBA 2NNWA 2QI2A 3H3OB 3H6EA 3KIOA 4EZ6A 5BN9A 1Q82O 5KRTA 2QWQA 3BZKA 4FWNA 4E7IA 2I7NA 3THXB 4EHTA 3QINA 4OGEA 2PYLA 2F96A 5AQHA 2J4RA 3QMLA 4X66K 3NGYA 4E89A 1T05A 4H5RA 1D5AA 4C8LA 1NMDA 2XY5A 4G9ZA 4M3XA 1YF5L 4J8FA 4BGAA 4DR1K 3BUZB 1W0HA 2FBYA 3THXA 4CF1A 1W2BM 4J2DA 4IOXA 4JKEA 2CGJA 2BE2A 5C42A 5J1EA 1NGFA 3L6QA 4EZ9A 3BP8A 3SMPA 3QFUA 2YNFA 1KLNA 4M63C 4MQ3A 1BWFO 2P9SA 3AV9A 4MLEA 4FPBA 4H5NA 1JLAA 3D2EB 4FLUA 4OKJA 3RVCA 3CG7A 4H0XB 3OYDA 4FK2A 4GKJK 2VGNA 5CYQA 5AQPA 4OGCA 2RF2A 4DR6K 4OX9K 3KWGA 4WFAL 3L4IA 3AGKA 3LL3A 1C0UA 3L2WA 1NGEA 3AVLA 2UU9K 4BRGA 2EWSA 4JK9A 2YCHA 4JKFA 3QIOA 3SK3A 3BY5A 1SL2A 4A2BA 1JXEA 3EE9A 5HRSA 4Z4GA 4IG3A 4Z4HA 2H3GX 1L3UA 1ZBIA 3CC2N 3O3FA 1EQYA 1QVFM 1VHXA 4FK0A 2RN2A 3C94A 4CJQA 3TARA 4A57A 4YOYA 3VEXA 3KD5E 3JSMA 1NJIO 2KW4A 3K5LA 3HOTA 4AH9A 1HYZA 4GVEA 3JAMO 3QEVA 3VETA 2ITMA 2X6NA 1SUQA 3DXMB 3S41A 3DOLA 1YITN 3AVKA 4CZHA 3MEGA 4FLXA 3TAEA 4K42A 4NYNA 1NMNA 4MDBA 3ZLJA 2ZD1A 1Q86O 3V9XA 1J6ZA 1BL3A 2RKIA 4Z4FA 3AAPA 4JI7K 4DV4K 3TTFA 2A1RA 2XO7A 4OKEA 1MA9B 3I55N 1UOCA 2Q0UA 4OO1J 5GAHP 1JL2A 1T7PA 4FJNA 5ELZA 3FZFA 3DXMA 1YHQN 3MX5A 4BR4A 2OPSA 2A40A 1GLJO 3MX2A 1VQ5N 3VQBA 3WNHA 5M1FA 3HL8A 1XMOK 4CEAA 2P5GA 4M3RA 2JWLA 4BR2A 4BDZA 5AQQA 5F2RA 4BWJA 3WT0A 2WC9A 3K5OA 1HKBA 3VMFB 2HHSA 4ZTFA 2D0OA 3VF4A 1ZYQA 3AO5A 4LC9B 3N4PA 3HSCA 4K8ZA 3QDKA 4CGGA 4ID1A 4KH6A 1SV5A 1BA1A 1RBUA 3DLHA 4FLWA 4DF4A 1KLMA 3DWLA 1NJWA 4K25A 3CCLN 1RBVA 2CH5A 4B3SK 4JKAA 3T7ZA 3KLGA 4CBUA 5E84A 4DTNA 3M8PA 4JAXA 4KKOA 3DAWA 4NCAA 4DFJA 5FLXO 2VWJA 1S22A 1TKXA 4UY8O 3LAKA 4K8XA 1NLVA 4GY2B 4RTFD 1Q81O 1HNIA 1N32K 2VG6A 3DJCA 1O13A 1RDAA 3LZIA 3ZSVA 4GMJB 3AVGA 3J7ZO 3UIQA 5HLFA 1VQMN 2F7TA 4F3TA 3G25A 3CERA 2P9PB 1B9FA 4DSKA 5F1XA 4CD3A 4H03B 1ZXOA 4K0KK 4QS8A 3LPUA 1ATRA 4FK4A 1WSJA 4BDYA 3VQQA 5JS1A 3KK3A 4KHYA 4EAHD 3R1XA 1TV6A 5AQTA 1QTMA 1GOCA 2KHOA 2B4JA 4CZLA 4AQYK 3CCSN 4IFYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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