2E2OA

Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in complex with glucose
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
299
structure length
299
Chain Sequence
MMIIVGVDAGGTKTKAVAYDCEGNFIGEGSSGPGNYHNVGLTRAIENIKEAVKIAAKGEADVVGMGVAGLDSKFDWENFTPLASLIAPKVIIQHDGVIALFAETLGEPGVVVIAGTGSVVEGYNGKEFLRVGGRGWLLSDDGSAYWVGRKALRKVLKMMDGLENKTILYNKVLKTINVKDLDELVMWSYTSSCQIDLVASIAKAVDEAANEGDTVAMDILKQGAELLASQAVYLARKIGTNKVYLKGGMFRSNIYHKFFTLYLEKEGIISDLGKRSPEIGAVILAYKEVGCDIKKLISD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEXOKINASE
source organism Sulfolobus tokodaii
molecule tags Transferase
total genus 112
structure length 299
sequence length 299
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2006-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2oA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e2oA01
3SK3A 4CZHA 3JS6A 4IJAA 4NO7A 2QWMA 4I6MA 1JCGA 4BRCA 4Z94A 4XEIA 3MN6A 1NGEA 3BF1A 3FE1A 5BR9A 3FZHA 4JAXA 3VEWA 2E2QA 4XH1A 3LDLA 2Q97A 4AM7A 2CH5A 3H1QA 3UB5A 4IO8A 2GEMA 4CZMA 4FWKA 4A2BA 1KAYA 4BRNA 2Q2RA 4IJNA 1P8ZA 2D0OA 3VPZA 2DPNA 1GLAG 4NB4A 2I7PA 2YJEA 5AQUA 2Q0RA 3GG4A 3U8XA 5KPRA 5I9EB 1BO5O 5BPNA 3ENHA 4BRFA 1BUPA 2J4RA 3O80A 3SLCA 4HWIA 1MWKA 4BC3A 3CJBA 4H0OA 2GELA 2E1YA 3J8AA 1HUXA 1R59O 5BRFA 2D4WA 4IXCA 4CI6A 3C7NB 1SQKA 4BRLA 5ADXH 2D0PA 2A3ZA 1XUPO 2P9NA 3WXJA 1HKBA 4FSVA 2YHYA 3IDHA 3H3NO 3HM8A 4M63C 1SAZA 1ZBSA 1NMDA 3KZBA 5CE3A 3TU5A 2ASMA 5AQWA 3A8YA 2QWRA 3L0QA 4WYBA 3S41A 2QM1A 3LDOA 1BWFO 4H03B 4CZIA 1Z6RA 5ADXA 4BGBA 2IVPA 5BN8A 3BEXA 2A41A 1HKGA 4BC2A 1BA1A 2QWPA 1YUWA 4PL7A 1S3XA 2NLXA 3I8BA 3SMSA 4DQ8A 2QWQA 2AP1A 1BOTO 1NGJA 4H0TB 3ZEUB 3VESA 1GLLO 3GBTA 3W0LA 3A5MC 1NGDA 3IUCA 3D2FA 5BN9A 2PAVA 3A5NC 4BRQA 4YDUC 5FPNA 3IMXA 4GNIA 2IVNA 4BRHA 4JD2A 5LJWA 3GE1A 2UYTA 2QXLA 2BTFA 4PL8A 1EQYA 2ASPA 2P9IA 3LDNA 1WOQA 1GLJO 2V7ZA 5FPMA 4FOEA 1YVNA 1JCEA 3ATVA 3QB0A 4ISFA 1IG8A 4QS9A 4BVPA 2P9SA 2YCHA 4QS8A 2E2OA 3WXLA 5AQPA 3EL2A 1GLFO 5AZIA 3HTVA 5AQMA 4H5VA 3AARA 3L4IA 2HOEA 3C0BA 3HSCA 3O1BA 5AQTA 3CJ7A 5AQSA 1HJOA 1RGIA 4K41A 4RWTA 1X3MA 5FPDA 1V4SA 2D1KA 4BRDA 3H3OB 1C0FA 1GLCG 5AQQA 5AR0A 1CZAN 4A62A 4BRKA 1GLDG 2YHXA 3CIPA 5BRHA 2GUPA 3VEOA 4F9OA 5F2RA 1GLBG 3O5BA 3LDQA 4E1JA 4JN4A 4FWPA 2V7YA 1GLEG 2V52B 5E26A 4FWQA 5AQGA 4A2AA 3M1FA 3D2FB 2ZWHA 3EO3A 1MWMA 5KPZA 1IJJA 4H0XB 3VETA 4JD2B 1YAGA 4CBXA 3FGUA 1DKGD 3EKUA 3QMLA 3HZ6A 3ID8A 2E8AA 3VF6A 5AZJA 4QS7A 4CZFA 4MLEA 3VGMA 3M6GA 1ZXOA 3WUHA 3ATUA 1U6ZA 5F0XA 1HKCA 3BUZB 3CETA 1NGIA 5AQFA 1C0GA 4BC4A 3KVGA 2QW9A 4K25A 5AZIB 1NLVA 4C23A 3R6MA 3MDQA 2HF4A 5AQNA 3SMPA 4EAHD 3ZX2A 5EOYA 4PKGA 1LCUA 4ISGA 3OHRA 2HF3A 4WQ4C 3ULEA 3R9PA 4H0PA 1QQOA 4BR7A 4DB3A 2V51B 4BC5A 3UE5A 4H0YB 3TPQA 5AQVA 4FWRA 5EX5A 1T44A 4FWMA 4I6MB 2P9UA 1NM1A 4H5TA 2F9TA 3CHWA 2QWOA 3CJ1A 2W41A 3VF2A 3BP8A 4BG9A 3EZWA 3H46O 2ZF5O 1BU6O 1S22A 3LM2A 4WQ5C 3CJCA 5AZJB 4BR5A 5LY3A 4BGAA 1NGHA 4FOIA 3QBWA 4IWVA 4JHDA 3VGLA 4CJ7A 1T6DA 2E1ZA 5F1XA 2NZTA 4A61A 2A42A 2FSKA 3DJCA 2YJFA 1RFQA 3M3ZA 5AQYA 3WXKA 3HBTA 2P9PA 3VOVA 2CH6A 2VCPA 2IIRA 3FR0A 3QFPA 2ZGZA 3WQTA 1Z05A 4RCHA 4FPBA 2QWLA 2IVOA 4B9QA 4MLHA 3ULEB 4MO5A 1JCFA 3MN7A 2NRHA 5EXWA 3U9ZA 3BF3A 5BPMA 2P9NB 1TUYA 4KBOA 4M7YA 4M7XA 5AQRA 3IFRA 1MDUB 5ELZA 1RDWX 2P9UB 1QZ5A 1V4TA 4HTLA 4PKHA 2AA4A 3A5LC 4H0VB 3QDKA 3H45C 2VWBA 4BRPA 5AQKA 3VERA 3U4LA 1TYQA 2A5XA 3D7EO 4BRMA 2EWSA 4B1ZA 1ATNA 2BUPA 3UKUA 1NBWA 3R8EA 3GDQA 2H3GX 3MN9A 3AY9A 4BR2A 1HX1A 1U2VA 3DAWA 3ENOA 5AQXA 4JHDB 4YDUA 3O4WA 4BRAA 2GWKA 1QQNA 3P4IA 3FZLA 1HLUA 1TUUA 3ZX0A 4BG8A 5TKYA 3VGKA 1H1VA 2P9LA 3FLCO 4B1UB 4K43A 2VYPA 4FWNA 3VEXA 2P9PB 1DGKN 1NGFA 4IZ9A 2ASOA 4B1VA 3WXIA 1NGBA 5AQZA 4BVOA 2P9IB 3CJ9A 1G99A 3MMVA 3EN9A 3EKSA 3O8MA 4J8FA 1NWKA 1YXQA 3MN5A 1XC3A 2P9SB 4CZGA 4EIAA 3VEZA 1SZ2A 2FSJA 3AAQA 4JNEA 1X9JA 4EFHA 5AQJA 1KAZA 1TYQB 2A40A 1DEJA 4FO0A 4BRGA 2E2PA 3CI5A 3O08A 5JLFA 4LC9B 4BRIA 3UKUB 4O5FA 2P9KA 3JXUA 4CBUA 3FFKB 4DCHA 1U2VB 3SJHA 2Q0UA 3DXKA 1QHAA 2FF6A 3GL1A 3FZKA 4O8KA 4BR0A 4CD3A 3B8AX 4FL9A 4MO4A 2ZGYA 3CQXA 3WEEA 2YI1A 2KHOA 3ZEUA 3CJAA 2E88A 1WUAA 2P9LB 3DXMA 1NGAA 4CZEA 1OKJA 4XH5A 3D2EA 4CBWA 2ITMA 3LM9A 3O6WA 5AQHA 1Q18A 5BPLA 3AAPA 4PKIA 1X3NA 1ATSA 3UKRA 2FLOA 2FSNA 2GTDA 4H5WA 5KQ8A 3FZMA 3HI0A 1QZ6A 3A5OC 3LDPA 4FWOA 4DHYA 4B1XB 2E2NA 1NGGA 4FWSA 5KQDA 4RTFD 5KPTA 5EY4A 4FWLA 4BQZA 2I7NA 3VF4A 3CQYA 4WQ4A 1NGCA 2E20A 2OANA 1K8KA 4EHUA 1ZC6A 4BR9A 4K42A 1LOTB 3I33A 3ZETA 2W40A 4FPAA 3VEYA 4XH4A 3QFUA 3DWLA 3MCPA 4Y0WA 2P9KB 3G25A 3FZFA 2F9WA 5BREA 2CGKA 1HPMA 5JMVA 3DXKB 3KHYA 5JICA 4L3QA 5B8HA 1XQSC 4ISEA 3RSEA 2CGJA 1BG3A 2QWNA 3MK6A 3WEEB 4CZJA 3ZX3A 1E4GT 4GY2B 3VENA 3GOIA 2Q31A 4WQ5A 2WUSA 3O1WA 4BR4A 3DXMB 5FPEA 3H6EA 3QBXA 4BREA 3D2EB 1Y64A 2A6AA 2GWJA 4CZKA 1ESVA 4CD1A 2HMPA 4BROA 3WQUA 2FF3B 4EHTA 3UKRB 5EVZA 2YHWA 3A0IX 3LL3A 5AFUH 5JLHA 4H5RA 3CERA 1J6ZA 5LJVA 1T6CA 3L6QA 5AQIA 1KXPA 3QICA 1ATRA 5BRDA 5E84A 1QQMA 1BDGA 1K8KB 4B1YB 4BQLA 5AFUA 1MA9B 3F9MA 3ZETB 2Q1NA 1D4XA 2FXUA 4CZLA 5AQLA 1E4FT 5AQOA 3W3DA 4H5NA 1KAXA 4AM6A 3U9DA 3C7NA 1BA0A 4B1WB 2CGLA 3VEVA 2Q36A 3WT0A 3H1VX 3RSEB 2PBDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NO7A 3ULDA 3EE8A 3CM6A 2VQFK 4DTXA 5GAGP 1KFSA 1S5JA 2Q97A 4CF0A 4ILHA 4CGFA 1Q9XA 4A2BA 3WNGA 3IS9A 1OH7A 3NGZA 4IJNA 1FW6A 3LANA 4NB4A 2I7PA 2YJEA 5CYMA 4G1QA 1BL3A 2Q0RA 3DM2A 3GG4A 3AVHA 3THYB 4BY9C 5JVGL 3QNOA 1NJZA 4CJUA 4DTOA 3ENHA 1K9MO 4W5TA 5DK5A 1A5WA 3C6UA 4E7LA 1S9EA 3CJBA 3J8AA 1HUXA 1VRUA 4G9ZA 4IXCA 5D3GA 3T7ZA 1SQKA 4M3WA 1SL0A 2HHSA 4BRLA 4HUFA 3LP2A 4WFBL 3WXJA 3L4QA 2OPQA 4CEEA 4CGJA 2OA8A 2A1SA 1SAZA 1YJNN 4OGCA 1NMDA 1XNRK 1WSFA 4H4MA 5AQWA 4WYBA 4JKHA 3LDOA 1J9AA 1W0HA 4YOUA 3DRRA 4RW4A 3BEXA 2A41A 1HKGA 4DWIA 3THXA 4IEIA 4BC2A 5TKWA 4HTUA 2QWPA 4E7JA 1YT3A 4PL7A 1S3XA 2NLXA 1I94K 3AVIA 3SMSA 4DQ8A 4Z4HA 4FLZA 1YTAA 1BOTO 1JJ2M 1GLLO 1YVUA 2HHUA 3A5MC 1NGDA 3E9LA 3NCIA 2BANA 3OYHA 1IKYA 2O8FB 2PAVA 4NCGA 4BRHA 4FM1A 2IS3A 1BHLA 3GE1A 2QXLA 3L2WA 2ASPA 2XHBA 2P9IA 2V7ZA 3DYAA 1J5EK 3WXMB 1OH8A 2OZMA 1YVNA 3O3GA 5J2QA 1RDCA 2DY4A 2P9SA 1XMOK 2JGUA 3WXLA 2E2OA 1U48A 3AARA 3L4IA 5AQTA 3P31A 4Z4GA 4N47A 4DR7K 5LMNK 1SUQA 4B3MK 4RWTA 1JKHA 1X3MA 2WOMA 4BRDA 5HRSA 1HNVA 1T8EA 5AQQA 1CZAN 4A62A 1GLDG 3O9SA 4F9OA 3O3FA 3QEVA 1A5VA 3LDQA 2D0BA 4IEEA 1S1XA 1VK0A 2WONA 3V9XA 2NNWA 2ATQA 1VSFA 4ELVA 3D2FB 5KPZA 2UU9K 4M3TA 1FXXA 2XY6A 4KREA 4HUEA 2O8BA 3VQ9A 3VETA 2E6LA 4DQIA 1DKGD 3ID8A 4FJHA 3OYFA 2X74A 3VGMA 4LFBK 3C6HA 3BUZB 3CETA 5AQFA 4U7BA 4V19S 1C0GA 4BC4A 3TAEA 4CESA 3KVGA 1NK4A 4GV3A 4JI0K 1NLVA 4CERA 3R6MA 1NOYA 2HF4A 4AQYK 1RBSA 3DRPA 3ZX2A 3J7ZO 1HNZK 4PKGA 5SZTA 1BQNA 1LCUA 5C2FA 4RW9A 1C6VA 4AHTA 5JVHL 2HF3A 4H0PA 3UE5A 1LV5A 1KSPA 4OKKA 4C8NA 1OVYA 4I6MB 2P9UA 1QSSA 1NM1A 4IBNA 2QWOA 4J2BA 4A5BA 4CEQA 3KIOA 5MLCQ 4BG9A 1TAQA 3LP3A 1GOAA 3H46O 1BU6O 1S22A 3CPWM 5AZJB 4BR5A 1J54A 4I9LA 4FJNA 1BI4A 3DOKA 1N33K 1JLFA 4BE2A 2A42A 2O8CB 3AVBA 4ELTA 4PQUA 3AVJA 4CEBA 3M3ZA 4LH5A 3HBTA 2P9PA 2CH6A 1JXEA 2VCPA 4YFUA 3QFPA 1RTDA 4K8XA 2NRZA 3WQTA 3CM5A 3J81O 4CJWA 3TABA 4CEDA 4FPBA 5HRNA 3ULEB 3HO1A 4MO5A 1RT4A 3P83D 4KHQA 5EXWA 1R0AA 4KV8A 3NF8A 5BPMA 1TUYA 3CCRN 2VGNA 1RDWX 4BWMA 3K2PA 3LZIA 4PKHA 2AA4A 1YITN 4H0VB 3BZCA 3ZCMA 2A5XA 3VQDA 2GX9A 3PO4A 1ATNA 2BUPA 3LWMA 4UQGA 2HB5A 4AHCA 1NBWA 4LF6K 1Z26A 3GDQA 2H3GX 4X64K 3MN9A 4JHDB 4YDUA 3THYA 4BDZA 2GWKA 1LW0A 4NCBA 3FZLA 2WBNA 3TANA 3ZSOA 3NVKA 4IG0A 4BG8A 3NF9A 4JKDA 1KFDA 2G8WA 4FWNA 4KO0A 4FLTA 2ASOA 2RHKA 4B1VA 2DFFA 1VQ4N 2IAJA 2LSNA 4B9NA 5AQZA 4BVOA 3CJ9A 1G99A 1VQNN 3SQ2A 4IFEA 2HBJA 1YXQA 4C1NI 4DR2K 3AAQA 1X9JA 3HOTA 5AQJA 1YHQN 4DTUA 4E7HA 1DEJA 3PY8A 1L3VA 4EZ9A 1MU2A 3O08A 4C8MA 3SBGA 4BRIA 4JK9A 2D0CA 4PY5A 3PO5A 2OPPA 1U2VB 3SJHA 3K9JA 3DXKA 1QHAA 4CJ4A 3T3FA 4BR0A 1VRTA 4GW6A 4GV9A 1IKWA 4LF8K 3U6FA 4DTMA 3CXCM 1CLQA 1WUAA 1OKJA 1X9SA 3NBPA 4CBWA 3M8QA 2ITMA 3ZSZA 4AHRA 3AAPA 4PKIA 4DFPA 1X3NA 4ZHRA 4CJRA 1ATSA 3UKRA 2W6LA 5H1SQ 2FLOA 1W9HA 4J2EA 4CFAA 4CJPA 3TARA 3HI0A 3KD1E 4ICLA 4FJJA 3SAGA 4FWLA 4FYDA 2I7NA 3CQYA 3RRHA 1VSMA 1ZC6A 3TTFA 3VMFB 4BR9A 3LZJA 3Q7BA 2O8DB 3E66A 4HHTA 2W40A 4FPAA 3CCEN 3MX2A 3FZFA 5BREA 2XRIA 3CD6N 3OYAA 1HPMA 5JMVA 2IGIA 5B8HA 1LW2A 3JYTA 3WEEB 2RKIA 3SJJA 4Y1CA 3AVMA 2IOCA 4CECA 3E9PA 4JK8A 3GOIA 4JV5K 3DXMB 3LAKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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