2E5C | Genus

Total Genus 159

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	159
sequence length	476
structure length	466
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
publication title	Structure and reaction mechanism of human nicotinamide phosphoribosyltransferase pubmed doi rcsb
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus	159
structure length	466
sequence length	476
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2006-12-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2e5cA02

1XUUA 4XBKA 1LDCA 1OHLA 3MW7A 3ZR4A 3S0CA 3R13A 4UTHA 1JCYA 4ORMA 1ALDA 4CNOA 2W6RA 5AHMA 3MYPA 4RX0A 2I14A 1F6PA 1Q6OA 4RKAA 5F4WA 2YYUA 3MWAA 1XC4A 5AHNA 1Q3NA 4DQWA 1GG1A 5C54A 1J4EA 3GKFA 2P1FA 4JTSA 2GJNA 2F84A 5FEXA 4O28A 4FNSA 2C15A 4UFJA 4DEFA 1I2OA 5AHEA 1CW2A 4K37A 5CZ0A 4WXYA 3QC3A 1WYIA 1O5KA 4IMEA 5D2XA 3KVKA 3TC7A 3EWYA 5I3HA 2ZA1A 4LVGA 3BV4A 2A2IA 4HNTA 3QPZA 3W7IA 2FPVA 1K7XA 5DXYA 2ATMA 3VKJA 1L6YA 1T8XA 3L21A 3LCIA 3WJYA 1SW0A 2QJHA 4ALDA 2QKFA 3CWOX 3IVTA 4N6FA 5H91A 2A4AA 1TPFA 1Z44A 1GVFA 1FWNA 2V8ZA 3VE9A 3L66A 3SR7A 4O14A 1IXNA 2ZRXA 1GJPA 4NNAA 2CZDA 4UTJA 1QO5A 1TTQA 4MFDA 3DI1A 1ZALA 5F4XA 4AAJA 4RJEA 5G4EA 3CU2A 3R89A 4EIVA 1F2JA 3LCGA 3EKLA 1SQ7A 2DZPA 3OVPA 1SZEA 2WSYA 4UXDA 3NPWA 1H60A 3M41A 5CG7A 4NT0A 1KM6A 1LORA 3IIOA 4P2VA 2H8ZA 5L6UA 3S5NA 1H61A 3S1VA 3DENA 3NQCA 3A21A 1KM4A 3W85A 3L0NA 3SSJA 3IGSA 3L9CA 4S2CA 4LTSA 2NX1A 2TYSA 4QJ1A 1Q6RA 3O8AA 4LUIA 1YDOA 1G6CA 1HL2A 3Q2DA 2ZZ1A 1OABA 2OMAA 2Y7FA 4GXMA 5DXXA 1W1ZA 3HG5A 1TPUA 3W7JA 2QCHA 5LKYA 5LSMA 2WSRA 1IXOA 1W31A 1Z48A 1JCMP 4O18A 1EA0A 5F2IA 5C2XA 1VCGA 4JTGA 4HNUA 2G95A 2ZRYA 2EKCA 1JCLA 1MSSA 3B0PA 1ZJIA 4QQ3A 1SSDA 1QDSA 1AL8A 4FNPA 1HUVA 1WA3A 3HG4A 1W5PA 3KFTA 3PR2A 4UTTA 3MO7A 3BW2A 1A53A 3NO5A 3W72A 4QSHA 4LU0A 3LCFA 4R34A 3MBFA 4O1DA 2P10A 4HN4A 3WK1A 1SZFA 3YPIA 3GDKA 1FWTA 2RH9A 1B3OA 4JTIA 1YXYA 8TIMA 2Y7EA 5FF0A 3STGA 3QJAA 2P0OA 1D9EA 1BTMA 3GDTA 1JCNA 2E5DA 4WOQA 3DZ1A 1XFBA 1R30A 4MKNA 2FPTA 2ISVA 2R94A 3L5MA 4O10A 1QMLA 3GXTA 3NQAA 1D3HA 2A6NA 4JEQA 1XI3A 4UR8A 3QPYA 4H3DA 3QZEA 4JYEA 3FEMA 3QMSA 5AFDA 3AJXA 1ZAIA 3UYCA 3RK8A 3GKAA 4NXKA 3FJLA 4ZQOA 1RD5A 1R2SA 2V82A 5LHEA 3RLUA 3IVUA 2HS8A 3N2XA 3FA5A 2YFOA 1NSJA 3A22A 5D37A 3TSMA 3LHVA 1ICQA 2R8WA 4OQVA 5FEWA 1ME8A 4RCXA 3UWWA 4O1AA 3IIPA 4P61A 2BTMA 4GNJA 3PUEA 2WOQA 3GNNA 1Z42A 1G4TA 4E0CA 1EX5A 3NQEA 4NNBA 2JGQA 2FPYA 3UWZA 2BLEA 5HWMA 3W1QA 3P7YA 5AHLA 2V30A 1Q6LA 1TRDA 2FLIA 5AHIA 3TXVA 1TTPA 5DY3A 1GTEA 3NDOA 4JTJA 3RLVA 3H53A 4IX0A 3SFKA 5HNRA 1XCFA 2RFGA 5KTLA 1W5QA 2WQPA 2V5LA 1X6UA 1A50A 1UB3A 5EBUA 5KZDA 1IF2A 2RDTA 4A22A 4O52A 2O7QA 4DO5A 4CLMA 1LYXA 3W1AA 3EEGA 4YLWA 1MEWA 4K7VA 1TRIA 4POCA 4YXGA 1R2RA 5AC7A 3DXIA 3P84A 1C8VA 5T26A 5HR7A 5CZJA 4RZ6A 5A5WA 2HSAA 3DFQA 4NZJA 1KFBA 3STEA 1DQWA 3N34A 4YCOA 5F2LA 3KRUA 4CCEA 4WY0F 3TAKA 2ZDRA 2H90A 3GDRA 1THFD 3EX6A 3B4UA 5LZLA 1AW1A 1DJNA 4GUHA 1K8XA 4AXKA 4XZ9A 3GAYA 4O17A 1EUAA 3LHTA 3QQ1A 3SW6A 5D2VA 2QAPA 2QCEA 4AHPA 3HG3A 1M7OA 1V7YA 4K7YA 2WPBA 2OZ0A 2DJXA 4DO6A 3B04A 3WJSA 3EB2A 1JRCA 5FEZA 3T55A 5DELA 4I7WA 3BPWA 4DPPA 4NJJA 2C0AA 4DXVA 1T0OA 4N4QA 3JRKA 3L2IA 2J9XA 2NUWA 4A29A 1ME7A 4IJBA 1UUOA 4M7TA 4HKPA 3GK0A 3IGXA 4UTWC 1OFEA 3W2LA 1YXDA 1H7RA 4FX8A 2B7PA 2V2CA 2EF9A 5EA9A 4XKYA 3W2MA 3N9SA 4K36A 5HMSA 4YL2A 3NG3A 4PL1A 3FIGA 4UFHA 1LLZA 3QQ0A 2QDHA 4JX4A 3JS3A 2NLIA 4JGDA 3P8JA 3W2JA 3LV5A 3IRDA 5BMXA 1VC4A 1VLIA 3R8RA 1UASA 1I2QA 2BSLA 2H3BA 4LS1A 1JQXA 5CGQA 1SFLA 1W56A 2ZRZA 1HG3A 2AGKA 4LVAA 3TK7A 3LGEA 2B7OA 4FNTA 1MXSA 2YPIA 2ZZ6A 2VFGA 3TMLA 1W3TA 1P5BA 1TSIA 1Y0EA 3WFAA 1K8YA 3SZ8A 2VEIA 4JYDA 3BARA 3VFLA 1F76A 4OE7A 3S42A 1G69A 2QJGA 2ZRUA 1WQ5A 3E9AA 3UY7A 3MYOA 4OT7A 1QWGA 3OHIA 3W84A 4UC5A 1LRTA 4LV9A 3G22A 4HNVA 3S5ZA 4EOUA 2O7SA 1MEIA 3E0IA 3U2OA 4GUGA 1IIGA 3G24A 3QRHA 2GQ8A 2WSQA 2VENA 3G18A 2BXVA 5I3FA 2DP3A 1H62A 2XN1A 4I7UA 2ISSA 2GQ9A 3MUXA 3HBLA 5G4WA 4DELA 2ZRVA 3BW4A 5K2ZA 3HGJA 1DORA 3USBA 3I7SA 4IMCA 1KLYA 1HTIA 3NL6A 2J9ZA 3N19B 1BWLA 1FCQA 2YCEA 3MI3A 3PSVA 3TXZA 1QPRA 2NX3A 4LS2A 1NAL1 2CFFA 2C19A 1R2TA 2OT1A 4Z0JA 1OYCA 1XBZA 1GOXA 1ZENA 4OWGA 3C2VA 3NL2A 2A7NA 1BWKA 2NX9A 3MP5A 1B4KA 1Z41A 2H3DA 4MYXA 4N9EA 1EEPA 1KFLA 2E6YA 3OEXA 2KZHA 3PAJA 2C1HA 3TE9A 4N9DA 3UXAA 5IBXA 3ELFA 3CTLA 1IGSA 4O15A 3W7LA 1H7NA 2HTMA 3P80A 4E38A 1TPWA 4IPJA 2FFCA 4N2YA 1W5MA 4UIOA 3T40A 4J9JA 1BKSA 2NWRA 3SJ3A 2QCGA 1YADA 3P61A 3NEVA 1NF0A 3PBVA 1ME9A 1KBIA 3EWWA 3NQDA 1TMHA 3NZRA 3B0UX 4N6EA 3QW4B 3NGJA 2Y62A 2WNNA 3B06A 4MJMA 4FF7A 4BK9A 3F4WA 5D2YA 4AWSA 1FDJA 3LHWA 1PCWA 3UNDA 2ISWA 3P8IA 3W1RA 4BF9A 1O4UA 1P0KA 4NXSA 5LGZA 3MHUA 1PIIA 3W86A 1VH7A 5K3VA 4M6VA 3C2FA 1Q6QA 4K38A 3ZWSA 1YPFA 5J5RA 2CLHA 4PC8A 4XQ6A 4UFLA 3FKRA 5J5DA 4DF0A 4NU7A 1GTHA 3M7WA 2F7FA 4AB4A 1PL9A 2GVGA 3KVLA 4ICNA 3M47A 1GWJA 1MEHA 2Z2UA 1IXPA 5C6MA 3D0CA 1L2UA 1I2RA 3W2UA 5D02A 2ZZ2A 2BZNA 3LHUA 3HPXA 3GDMA 3VE7A 3FLUA 4XTIA 3TFXA 4JDYA 2ZA3A 3PBUA 3G1XA 4KWVA 1OFRA 4OHQA 1HO4A 1EWDA 4MIMA 1EPXA 2YYTA 2JGYA 3T44A 2HMCA 4IWWA 3F4NA 2FTPA 3KXQA 1F05A 1OFPA 3G0XA 3UY8A 1AK5A 5K9CA 3P5ZA 4NJGA 1O60A 3BG9A 2PE4A 1KFEA 1AMKA 1IIHA 4FX7A 4LVBA 3HIJA 3C2OA 2V2HA 5BOOA 5HWNA 3L5LA 2CLLA 2YFNA 4HIBA 5I3JA 1TV7A 4JYFA 4O57A 2NWSA 4Y96A 1SR9A 2YZRA 4IMGA 2Q8LA 2YSWA 1LTDA 3KX6A 3NPUA 2QF7A 2HS6A 2Y70A 1XBXA 3GX9A 3M0ZA 2XN0A 1W54A 2E6DA 5F2GA 1LBLA 3IIZA 3H55A 1SPQA 3P67A 1G4SA 2A21A 1OVDA 1A5CA 5TBOA 4KFNA 2ZTKA 1ZY9A 3DH7A 2ABAA 4ADUA 3TU9A 5E93A 2QUTA 3BLEA 1XXXA 2CWNA 1P1XA 4CCCA 3CLMA 4X3ZA 1H7OA 3W7PA 1FWWA 1LZOA 4L4MA 5EMUA 2Y61A 4O4VA 1GZGA 4JTTA 1NFBA 1SO4A 3LXBA 3T4CA 3C2EA 4NX0A 5CSSA 3W1LA 1SFJA 2OJPA 4NJKA 3HF3A 3VNDA 2WJZA 3PULA 1X1ZA 1J2WA 4H4IA 3P81A 5DCBA 1ZAJA 1RQHA 3TCEA 5D2TA 4BR1A 3JR2A 2C3ZA 1TPDA 2VFEA 3DHDA 2TSYA 4WD0A 3W83A 2PURA 3G1HA 3TV8A 1KTNA 4UMAA 4M19A 1L6WA 4N02A 3L67A 2IQTA 2BWGA 3OVRA 1LROA 3S1WA 1RQBA 4WXZA 5DLCA 1A5BA 1WBJA 1XKYA 3DFPA 1K02A 3NQ6A 1LRNA 1UBSA 4NNCA 4O53A 1ZHAA 4X22A 3W1TA 4ZL1A 3FFSA 2JKPA 1GPWA 5FI8A 2H6RA 3EWZA 1K7FA 2NZLA 1KW1A 3O6DA 1KM0A 2YGYA 3Q94A 1UCWA 2EGZA 1N7KA 5G1TA 4FNUA 3V1PA 4GBUA 5HR6A 4CQ9A 4Z1CA 2B7QA 3NR0A 4JD4A 4WQ6A 1IXQA 3N2MA 5HUOA 4YMZA 3TIMA 1TTIA 3M16A 2QAFA 1F73A 1YYAA 1VRDA 1VS1A 4RXGA 2RKXA 4JTEA 4XBSA 1QPNA 3FKKA 2NXGA 1KM3A 1SU5A 4O1CA 1NEYA 3W87A 1FXPA 3L68A 5K4XA 1KFCA 1EP3A 5CKSA 3W1PA 2NXHA 3NL3A 3GAKA 5HQEA 4O8RA 2GJLA 3TFCA 4IGHA 3PSWA 4GUJA 3LX9A 1H5YA 1TPVA 3O05A 3N73A 2AAMA 4FO4A 1UUMA 2CLFA 4N9CA 4M5PA 1FX6A 3W1NA 5IM51 3MHGA 4JIQA 1YXCA 1SO6A 1WXJA 1OYBA 3LCLA 2VEMA 1SO3A 2ZZ4A 3ABRA 4BFAA 2BX7A 3W2KA 3RF9A 1X7FA 4LC8A 3QH2A 5I3GA 4DBDA 2Z6JA 3I7RA 3QMRA 1PS9A 2C16A 3W1UA 2DJLA 3KVMA 3S6DA 4M6PA 3U6WA 1JRBA 1ZAHA 3UZ5A 2E68A 3SECA 1XDMA 3A5VA 1H50A 3HPZA 3LBMA 4O12A 3B8DA 5LNVA 3UXDA 2DZUA 4LV4A 4UTKA 3QEZA 3HGRA 3NQMA 4FX6M 3ABSA 3P62A 3NQFA 4MYAA 3PY2A 3A23A 3G1AA 4QAIA 1FQ0A 3QW3A 3LB0A 3ABQA 4MZ1A 3M5ZA 5CZTA 4AWTA 4ADSA 3LTPA 4GC4A 5D04C 3BO9A 3TNOA 4S1FA 4CQAA 1EP1A 3OIXA 2YX0A 5D38A 1WV2A 3QF0A 5EPDA 3EX1A 1YTDA 1FUYA 2A85A 1VZWA 2W79A 2QCCA 3PVFA 1TREA 2WNQA 2NUXA 3SY5A 2ZZ3A 5HINA 2YDAA 1G7UA 3WJXA 1AW2A 3O6YX 3TJXA 2ZCGA 2GOUA 4QITA 5AHFA 5AN7A 5FESA 1TPH1 4UNKA 4MY9A 3LRMA 3N3MA 3G1YA 4O50A 5EY5A 4RK8A 1SSGA 3EXSA 2VFDA 1KM5A 3R2GA 4NQ1A 4UFMA 2VEPA 2CW6A 3TR2A 1F6KA 3W73A 3RU6A 3LRKA 4ZQRA 1TB3A 5DCEA 3LCHA 4LVFA 4JR5A 1T99A 3W7DA 5E1QA 1MZHA 4XTDA 2X2GA 2PCQA 5FF3A 4LRTA 2X1TA 1S3HA 1OFBA 3LHZA 1OK4A 4I9AA 1EIXA 3I7QA 4JX6A 4PTNA 3CM4A 4O4WA 3C6CA 5D32A 5C5YA 1J5TA 3LTSA 3W7MA 3TW7A 5G2WA 1JCJA 3UQNA 1YDNA 5DBTA 4IX2A 2TPSA 4JTFA 5F1VA 4BI6A 1F7BA 3KHJA 4EWND 1VQTA 2VC6A 4E2DA 4JTUA 3IIXA 2JKEA 3CPRA 5D2WA 5FEPA 3S5OA 1FY6A 1VHCA 1A5AA 2ZFAA 1OFAA 1KV8A 2E77A 1TPEA 3NZ1A 1W5NA 3PG9A 3QYQA 3W74A 4GE8A 1I45A 3HB9A 4AWUA 3C4UA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2E5CA

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