2E88A

Crystal structure of the human hsp70 atpase domain in the apo form
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70kDa protein 1A
publication title Direct inter-subdomain interactions switch between the closed and open forms of the Hsp70 nucleotide-binding domain in the nucleotide-free state.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 117
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2e88A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e88A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e88A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2e88A04
1BO5O 2ZWHA 3ZETB 4WQ5C 4WQ5A 1JCGA 2IIRA 4BRDA 3DWLA 4IO8A 4EHUA 1JCEA 4IZ9A 4QS9A 2D4WA 5BREA 2GTDA 5BPLA 1RFQA 5F0XA 4JN4A 3CETA 1ZXOA 2A6AA 4JNEA 4WYBA 4CI6A 2FF6A 4L3QA 4M7XA 1NMDA 3QICA 4PKIA 1DGKN 3O5BA 4DB3A 3VEYA 1NGCA 2NRHA 3QBXA 4H0XB 1T6DA 2QWLA 4XEIA 3UKUB 4B1WB 5E84A 3O4WA 4YDUC 1RGIA 3BUZB 3S41A 4YDUA 2ZGZA 4CBUA 4BC5A 4K42A 5AFUH 4FWOA 5AQSA 2A41A 3WEEA 2ZF5O 3KHYA 4BC3A 3CQXA 3EKSA 2E2NA 3IMXA 4B9QA 1BA0A 5AQOA 2ASOA 3MDQA 3DXKA 1U2VA 3MN9A 2QXLA 3GDQA 5AQJA 2QW9A 1SAZA 2GEMA 4K41A 3VGLA 2E8AA 5AQIA 3DJCA 3H6EA 3D2EA 2A40A 4RWTA 5ADXA 3QFPA 5AQNA 1YVNA 3ENOA 2E1YA 2P9UA 3WQUA 1KAYA 2ASPA 2UYTA 2Q97A 1BWFO 2PBDA 4KBOA 3EZWA 3H3OB 4JHDA 4CD3A 5BRHA 3HZ6A 5JLHA 2P9LA 3LL3A 2P9SB 4FWPA 3TPQA 3R6MA 3EN9A 3WEEB 3ID8A 3R9PA 4CBWA 3I33A 1IG8A 3UE5A 4H5VA 4DHYA 5JICA 3FGUA 4DQ8A 2Q1NA 1U6ZA 2YI1A 4BQZA 1ZC6A 1U2VB 3H46O 4MLHA 4PKGA 3QB0A 2QWNA 4BRQA 3AAQA 3HBTA 4H5TA 4FOEA 2KHOA 2EWSA 2V51B 2ASMA 2P9IA 3A5LC 4JD2A 3BP8A 4I6MA 4B1YB 3F9MA 4BRNA 3LDLA 3I8BA 3QFUA 3BEXA 3HM8A 3W3DA 4BRPA 3SK3A 3LM9A 3OHRA 1Z05A 4FSVA 1NGIA 2FSJA 4BREA 2YHWA 3MN7A 4H5RA 4BQLA 2FSNA 3DXMB 2P9PA 3EO3A 1OKJA 4AM7A 3VENA 5AQYA 4CJ7A 2FSKA 3ZX2A 4JAXA 3ZX3A 3MN6A 5LJWA 4EIAA 4K43A 2CH5A 2IVOA 5AQMA 3CJ9A 1E4GT 4J8FA 5BRFA 5LJVA 1ATNA 3O1BA 4H5NA 4RTFD 5KQDA 2CGJA 5AQPA 3GBTA 2QWRA 1T6CA 3IUCA 4C23A 3FLCO 1NGFA 1C0GA 4BVOA 3GE1A 3QDKA 5JMVA 4QS7A 4BG9A 2VYPA 4B1ZA 3JS6A 4IJAA 3L4IA 5AQTA 2CGLA 3HTVA 1NM1A 2D1KA 3FE1A 4H5WA 1QZ6A 2QM1A 1QQNA 2Q0UA 4BRGA 2Q0RA 4IXCA 5AQHA 5AQUA 3O8MA 1GLFO 3VEXA 5AZIA 3ULEB 1TUUA 1HKCA 1TUYA 2E2PA 3FZKA 4H0YB 3WXLA 1GLDG 3U9DA 3VF6A 4H0VB 3FFKB 2GWKA 1GLAG 3FZLA 3VF4A 4PL7A 2GWJA 4NB4A 2FF3B 2P9NB 3VESA 1V4SA 1YAGA 1QHAA 2CGKA 5AQQA 5EXWA 1NGJA 1V4TA 5AQGA 5FPDA 5AZJA 3AAPA 3UKRA 4MLEA 4BR0A 1XC3A 1G99A 4A2BA 1RDWX 5AQZA 3ZEUA 2NLXA 3ZX0A 3LDQA 5FPMA 4BRKA 1TYQA 3M3ZA 4HWIA 2H3GX 4H03B 4CZKA 5B8HA 3P4IA 1KXPA 2HMPA 3A5NC 4XH4A 3EKUA 3MK6A 3U8XA 3VEOA 4BRCA 4MO5A 2P9KA 4EFHA 3C7NA 2YHXA 1BUPA 5AQLA 2QWQA 3CJAA 5BPMA 1WOQA 4Y0WA 3SLCA 4WQ4C 1GLCG 1SZ2A 4CZIA 1HPMA 4WQ4A 2E88A 2D0PA 2QWMA 1NGEA 3U4LA 4H0TB 2GUPA 1MA9B 3J8AA 3O1WA 4XH1A 1HKBA 3CQYA 1QZ5A 3DXKB 5AQFA 1TYQB 2V7YA 4LC9B 2E20A 4HTLA 3WT0A 4BR2A 3SMSA 4BVPA 1K8KA 2CH6A 3C0BA 3VOVA 5TKYA 3D2EB 1BA1A 1HX1A 2D0OA 3CJ7A 4BGAA 2Q31A 2P9UB 1YXQA 3FR0A 5FPNA 3C7NB 3M6GA 2IVPA 5AFUA 2NZTA 2BTFA 5ELZA 5KPRA 4BRAA 4JHDB 3WXJA 2HOEA 3D2FA 5EVZA 1YUWA 2P9LB 1X9JA 4CD1A 2YHYA 3BF1A 2A42A 4BRHA 1NLVA 2F9TA 3R8EA 4BG8A 4CZHA 4QS8A 1GLLO 3H1QA 2HF3A 2IVNA 4BRMA 4H0OA 2DPNA 3O6WA 1NBWA 4BRIA 1Q18A 2A5XA 4ISFA 1X3NA 1HUXA 3B8AX 5BN9A 3M1FA 2YCHA 4FWLA 3VERA 1R59O 4XH5A 1KAXA 3HSCA 1H1VA 4FPBA 5EX5A 2E2OA 2P9IB 4JD2B 4I6MB 1BG3A 4IJNA 4B1UB 1ESVA 3D2FB 3MMVA 5AQKA 5LY3A 3LDPA 1BDGA 1J6ZA 2I7NA 4B1XB 1QQMA 3FZFA 3AY9A 3QBWA 4BGBA 4BR4A 4EHTA 5KPTA 2P9PB 4M7YA 3TU5A 1S22A 3WQTA 3RSEA 2W40A 3CI5A 1QQOA 3IFRA 4A61A 1NGBA 3O08A 5ADXH 3UKUA 4K25A 2VWBA 3LDOA 2QWPA 4BROA 3AARA 4CBXA 4BRFA 3WXKA 3KVGA 1GLBG 3HI0A 5AR0A 2WUSA 1XUPO 3L6QA 3JXUA 1IJJA 3H3NO 1P8ZA 4A2AA 1HKGA 2AA4A 4FL9A 1DKGD 4FOIA 4FPAA 4ISEA 4BR7A 3SMPA 1NGHA 3QMLA 4CZJA 5E26A 1C0FA 2BUPA 3RSEB 3U9ZA 5BN8A 1MDUB 1MWKA 5AZIB 5AQRA 2HF4A 4IWVA 4BR9A 4O8KA 1GLJO 4ISGA 2W41A 4F9OA 1CZAN 2GELA 1MWMA 1NWKA 4DCHA 3L0QA 2P9SA 1KAZA 1XQSC 3DAWA 3A5MC 1NGAA 3VF2A 4RCHA 5AZJB 1SQKA 5FPEA 4PL8A 1EQYA 3UKRB 3VEWA 4CZMA 3CJ1A 3ZEUB 1E4FT 4BR5A 3CIPA 3SJHA 5BRDA 3IDHA 1DEJA 2F9WA 2E2QA 3O80A 1GLEG 4BC4A 4A62A 2Q2RA 4FO0A 4EAHD 5KQ8A 3CERA 5F2RA 3ENHA 2E1ZA 3A0IX 1BOTO 2A3ZA 2P9KB 1NGDA 2V7ZA 3A5OC 4AM6A 4CZEA 2YJEA 2FLOA 4Z94A 3GL1A 3DXMA 3GG4A 4CZGA 4FWKA 3VEZA 3LDNA 4FWQA 4O5FA 3ATVA 3WXIA 1LCUA 3WUHA 3EL2A 4BRLA 3MCPA 4FWNA 3FZHA 2PAVA 1ATSA 1JCFA 3CHWA 3VEVA 5EY4A 5AQXA 3UB5A 5AQWA 4FWRA 3CJBA 4H0PA 4BC2A 3VPZA 2FXUA 3CJCA 4E1JA 2V52B 1K8KB 1WUAA 4CZLA 1D4XA 3A8YA 2AP1A 3H1VX 2YJFA 3VETA 4PKHA 2J4RA 4GY2B 3VGKA 2Q36A 3H45C 4CZFA 2VCPA 2ITMA 5AQVA 5BPNA 3ZETA 4FWSA 3KZBA 5EOYA 1X3MA 3BF3A 5CE3A 5KPZA 2OANA 3GOIA 1HLUA 4M63C 5F1XA 3D7EO 1NGGA 4FWMA 2ZGYA 2QWOA 5BR9A 1Z6RA 3ULEA 1LOTB 1ZBSA 1Y64A 5I9EB 1S3XA 1T44A 4NO7A 4GNIA 3LM2A 3W0LA 3MN5A 5JLFA 2P9NA 3VGMA 3ATUA 1BU6O 1ATRA 2I7PA 3G25A 4B1VA 3FZMA 1HJOA 4MO4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ETJA 3F73A 4AHCA 4WQ5C 4CHPA 4WQ5A 3I55N 1JCGA 3T1YK 4FLVA 4IO8A 4KHSA 2WOMA 3KKRA 4UJ0A 4QS9A 1I39A 1ZVEA 5BPLA 1RFQA 2KKZA 4F3OA 3SBTA 1YT3A 1BISA 4V19S 1DGKN 1NGCA 1T6DA 2QWLA 4XEIA 4CFAA 4B1WB 3NE6A 1N34K 3CM6A 2YNHA 4YDUC 2Y1JA 1RGIA 3BUZB 3AVGA 4YDUA 5LMUK 5CZ2A 1KVBA 2K35A 4CECA 1T05A 1SKWA 4KH5A 3WEEA 2ZF5O 4DR6K 4M3TA 4GVEA 3EKSA 4X64K 3L8BA 3TAEA 1S72N 1WT7A 4F3TA 4B9QA 1BA0A 3G4SN 1NOZA 2QXLA 3KIOA 1Z26A 3KJVA 4JS4A 2QW9A 4K41A 1WSFA 4C8OA 1WBBA 3DJCA 3THYA 4IKFA 3ENBA 4HHTA 2HVHA 5AQNA 4JI0K 2GUIA 3ENOA 3WQUA 1KAYA 2ASPA 2Q97A 1SL1A 3KK7A 1C6VA 4W5TA 3ZYYX 4CD3A 1F21A 3HZ6A 1KLMA 2G8WA 3AVFA 3LANA 2OPPA 5FRMA 2LKBA 3R6MA 3QEXA 3WEEB 3ID8A 5M1KA 4JKHA 4FLUA 4IEEA 3FGUA 4DQ8A 3K0SA 4BE1A 2Q1NA 3O9UA 2Z1JA 4DV2K 2KTQA 1ZUTA 1ZC6A 2LR3A 4MLHA 1RBRA 4CJ4A 2HNZA 5J2NA 2QWNA 4ILHA 3D0PA 4O0JA 2G8IA 3HBTA 2DFEA 1S5JA 2WBNA 3N4PA 5HOOA 2ASMA 3A5LC 4FJ9A 4I6MA 3LDLA 5IWAK 3W3DA 1Z05A 3RMCA 4F2RA 4BREA 2YHWA 1ZYVA 2LSNA 4BQLA 2FSNA 3CCUN 4DR1K 5JVGL 1CLQA 3VENA 1B92A 3C6HA 5T7BA 2FSKA 3K59A 1P0AA 5LJWA 4EIAA 2CH5A 3HPGA 4FZXC 5AQMA 4JK9A 4DLEA 4J8FA 5LJVA 4Z4FA 1ATNA 3AO1A 4RTFD 1C0UA 2W6LA 2FC0A 1T3VA 4JKCA 3NH1A 4M3UA 4XIUA 1VQMN 1BGXT 4JI4K 2VYPA 3KTQA 3L4IA 5AQTA 3HTVA 2KFNA 1XNQK 2VGMA 1HPZA 2Q0RA 4IXCA 4DF8A 1VSDA 3I8DA 2W6KA 1U49A 1S1WA 1VHXA 5AZIA 4E3SA 3ULEB 1TUUA 4RW4A 5CR4A 1HKCA 4KHNA 2ATQA 1QVFM 1EO1A 4CJFA 4IG3A 3U9DA 2W42A 3DRSA 4AAZA 2YKNA 3VF4A 4BECA 4OLBA 3SQ1A 3MX2A 4DQIA 3VESA 1W7AA 4DG1A 3R1XA 2NRTA 1QHAA 2HW3A 1JLQA 5AQQA 1V4TA 1GOBA 4KTZA 3JYTA 4HVJA 3UKRA 4FZZA 1DT9A 5MLCQ 4PQUA 1RT3A 1RDCA 5KRTA 5AJ3K 3ZX0A 3P83D 3AVIA 1TYQA 3ZSWA 3M3ZA 5H1SQ 2IDOA 2HMPA 1VQKN 1QE1A 2HHTA 4CJKA 4XH4A 1JKZA 4EP4A 2C1IA 4CVNE 3CPWM 3VEOA 2HBJA 4CJSA 2P9KA 3SUOA 4F2SA 4FJ7A 1BRZA 1JLBA 2BANA 4M3ZA 3U3YA 1SL2A 2KSKA 1BUPA 1JJ2M 3NF6A 1U45A 4X62K 3CJAA 3MEDA 5BPMA 1WOQA 1X1PA 4QCLA 2E88A 1TKXA 3AA2A 4KHPK 4HTUA 4H0TB 4JKBA 4FXDA 4CJ3A 3DLLL 3DXKB 5AQFA 4NYNA 3PO4A 1TYQB 2V7YA 4JRQA 4HTLA 4C8LA 4JKAA 5GAGP 2F7TA 1TAQA 2CH6A 3VOVA 4QOZB 3AA5X 4DV3K 3D2EB 1TV6A 1HX1A 1M90O 3ULDA 1UA1A 1BMRA 4BGAA 2OPSA 2P9UB 3M6GA 3N4QA 2YIPA 3HRGA 4JI1K 1VSFA 2NRXA 1ZBFA 4ZTJA 4BRAA 4JHDB 5EVZA 2KLAA 3K2PA 4NXNK 1TAUA 5JENA 2P9LB 4AHRA 3OYEA 4CD1A 2JWKA 4EZ9A 3BF1A 4BRHA 3MAQA 4BG8A 1NG9A 1GLLO 3H1QA 1WSJA 4BDPA 2HF3A 4BRMA 3AVKA 1S6QA 4R5PA 1KCFA 2PY5A 1Q18A 1TVRA 4ISFA 1NH5A 2NRZA 4Z4GA 2PZSA 5BN9A 3M1FA 5BR8K 2YCHA 3VERA 1H1VA 4FPBA 1T1TA 2P9IB 3NGIA 2KBJA 1FH3A 1Q81O 1ITGA 3THWA 5LMNK 4CIFA 1LWCA 2D0CA 4UQGA 4HUEA 1I94K 5LY3A 3KK1A 2G8UA 1JL1A 3LDPA 2I7NA 2D5RA 4J2DA 1N6QA 4O0IA 1QQMA 3FZFA 4BR4A 3J80O 2E4LA 4DV4K 4KHYA 4G1QA 4ELVA 2G8KA 3TU5A 1GOCA 3DYAA 3LZIA 4A61A 4CESA 1NU0A 3HSTB 3SBGA 5M1PA 3IKMA 3OS1A 1NKCA 4IOCL 2HB5A 4ID5A 3OYCA 3HXMA 4BRFA 3WXKA 5SWMA 2KFZA 3BZCA 1GLBG 4DS5A 1GPSA 1XUPO 3L6QA 4MFBA 3H3NO 1LW0A 1P8ZA 1M1KO 4OKJA 3NBPA 1VRTA 1NJWA 1NGHA 3RMBA 2G8VA 2BUPA 4BE0A 5C24A 1B9DA 3GKUA 2D56A 3G6EN 2IC3A 3KLIA 4KTQA 4BR9A 4FLWA 4G9ZA 4YOVA 4O8KA 1GLJO 4ISGA 2W41A 4PA1A 5DK5A 1XRSB 2VG5A 4DCHA 1NWKA 5JS1A 3L0QA 2A7TA 3RRGA 2FBXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2ETJ A;  3F73 A;  4AHC A;  4WQ5 C;  4CHP A;  4WQ5 A;  3I55 N;  1JCG A;  3T1Y K;  4FLV A;  4IO8 A;  4KHS A;  2WOM A;  3KKR A;  4UJ0 A;  4QS9 A;  1I39 A;  1ZVE A;  5BPL A;  1RFQ A;  2KKZ A;  4F3O A;  3SBT A;  1YT3 A;  1BIS A;  4V19 S;  1DGK N;  1NGC A;  1T6D A;  2QWL A;  4XEI A;  4CFA A;  4B1W B;  3NE6 A;  1N34 K;  3CM6 A;  2YNH A;  4YDU C;  2Y1J A;  1RGI A;  3BUZ B;  3AVG A;  4YDU A;  5LMU K;  5CZ2 A;  1KVB A;  2K35 A;  4CEC A;  1T05 A;  1SKW A;  4KH5 A;  3WEE A;  2ZF5 O;  4DR6 K;  4M3T A;  4GVE A;  3EKS A;  4X64 K;  3L8B A;  3TAE A;  1S72 N;  1WT7 A;  4F3T A;  4B9Q A;  1BA0 A;  3G4S N;  1NOZ A;  2QXL A;  3KIO A;  1Z26 A;  3KJV A;  4JS4 A;  2QW9 A;  4K41 A;  1WSF A;  4C8O A;  1WBB A;  3DJC A;  3THY A;  4IKF A;  3ENB A;  4HHT A;  2HVH A;  5AQN A;  4JI0 K;  2GUI A;  3ENO A;  3WQU A;  1KAY A;  2ASP A;  2Q97 A;  1SL1 A;  3KK7 A;  1C6V A;  4W5T A;  3ZYY X;  4CD3 A;  1F21 A;  3HZ6 A;  1KLM A;  2G8W A;  3AVF A;  3LAN A;  2OPP A;  5FRM A;  2LKB A;  3R6M A;  3QEX A;  3WEE B;  3ID8 A;  5M1K A;  4JKH A; 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