2E88A

Crystal structure of the human hsp70 atpase domain in the apo form
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
b'KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70kDa protein 1A
publication title Direct inter-subdomain interactions switch between the closed and open forms of the Hsp70 nucleotide-binding domain in the nucleotide-free state.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 117
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2e88A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e88A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e88A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2e88A04
3C7NA 5KQ8A 2P9KA 2HF3A 2IVPA 5BREA 1ATSA 2YHWA 5B8HA 5E26A 4BR7A 3O5BA 4H5NA 1ZBSA 4XEIA 5ADXA 3VF6A 2Q1NA 4DHYA 5EXWA 4IZ9A 2P9LA 2Q31A 3SMSA 3VGMA 1E4GT 2HOEA 1Q18A 5ADXH 4JHDB 1YAGA 2P9IA 4ISFA 5LY3A 1NGBA 2NRHA 2YJFA 1BO5O 1ZXOA 3FZMA 4CBWA 4FWNA 2Q0UA 3BEXA 1NGCA 2W41A 4H0TB 2E8AA 2YI1A 3WXJA 4FL9A 2YHYA 4BVOA 3CJ1A 3O6WA 2FSKA 4MO4A 3VEWA 2A6AA 3A0IX 4ISGA 4K43A 5LJWA 3MN6A 3ZX0A 3VEXA 2BTFA 1GLEG 4H03B 3UKUB 4FWLA 2FSNA 3FZLA 1TYQB 4PL7A 3F9MA 4FPBA 5FPMA 4H5VA 5EVZA 3WEEA 2AP1A 4RCHA 1ESVA 4GNIA 3CQYA 4BRMA 1OKJA 1GLFO 3ATVA 4C23A 1K8KB 1MWKA 4H0OA 4PKGA 5AQZA 3C7NB 2D4WA 4K25A 3CJAA 2P9KB 3FE1A 3VERA 1X9JA 1NGEA 4GY2B 4FWMA 3A8YA 1BWFO 4I6MA 1MA9B 4JNEA 1NGAA 4PL8A 2P9LB 4BG9A 2A40A 2I7PA 3WQUA 1HX1A 4F9OA 3H6EA 3UKRA 2CH6A 2P9IB 4FWSA 5KPZA 4CI6A 2VYPA 2QWQA 4K41A 4B1UB 4BC5A 2P9SA 3GE1A 3G25A 4BRLA 4CBXA 3O08A 3ZETA 3L0QA 1T6DA 1RGIA 5AQOA 4BRCA 4H0VB 3MDQA 4L3QA 3AAPA 1NGIA 3KZBA 1CZAN 3ZEUA 3CHWA 5AQJA 4CZGA 3QICA 1SQKA 1NGFA 3H3OB 4BR4A 4Z94A 4O5FA 4XH4A 2E2NA 5KQDA 1HPMA 4J8FA 1NMDA 1HKBA 5AR0A 3HSCA 1TYQA 4XH5A 1NWKA 1S3XA 1V4TA 3LM9A 3WQTA 1BA1A 3WEEB 2A3ZA 3O1WA 4BGAA 2A41A 4BRHA 3H1VX 5ELZA 4B1ZA 2EWSA 3W3DA 3SLCA 1K8KA 1QZ5A 3QBXA 3KVGA 2ASOA 3LDLA 5TKYA 4DQ8A 4BRKA 3WT0A 3CJ7A 3VGKA 3JXUA 3U9DA 5BRDA 3HTVA 4I6MB 5FPEA 2E2OA 1GLCG 2E20A 2FXUA 3VEOA 3I33A 1GLJO 2F9WA 3VESA 3AARA 4BC2A 2E2PA 3EKUA 3UKRB 3VETA 1DEJA 4BRPA 3DWLA 4H0PA 1GLBG 3ID8A 2Q0RA 3B8AX 5BPLA 1GLDG 2P9SB 2CGJA 1XC3A 4FWRA 3ZETB 1MWMA 3GBTA 3QBWA 3AY9A 1NM1A 3DXKB 3CI5A 3CETA 4LC9B 4BQZA 3ATUA 5F0XA 1H1VA 5AQXA 2IIRA 3JS6A 4H0XB 3CJCA 4CZIA 3ZEUB 4BRIA 2VWBA 2D0OA 1QQMA 2A42A 3RSEA 4CD1A 4FWKA 2HMPA 3FZKA 2GWJA 3DJCA 2NZTA 3KHYA 4CBUA 2DPNA 4FWOA 3M6GA 3QMLA 3MK6A 4BC3A 5FPDA 3A5LC 3GL1A 3VF2A 3GOIA 3BUZB 5JICA 1QHAA 1JCFA 5BN8A 4BRQA 4HWIA 2GELA 4FO0A 3M1FA 4KBOA 5BN9A 4BR5A 5E84A 3WUHA 3A5NC 3TPQA 4BRNA 4DCHA 3GG4A 3FR0A 1WOQA 5JLHA 3U8XA 2VCPA 1LCUA 5AQQA 4K42A 1HKCA 2P9PA 4EFHA 3LL3A 3R9PA 5KPTA 4WYBA 5BPMA 1WUAA 4XH1A 5AQKA 1RFQA 4B1YB 2HF4A 3A5MC 4BR2A 4H5WA 1NGGA 1NGJA 4CZEA 4B1XB 5AQWA 3VEVA 4MLHA 3VF4A 1QQNA 1X3NA 4QS9A 5AQMA 2OANA 3L4IA 2ASPA 3U9ZA 1BUPA 2GUPA 3J8AA 1R59O 2YHXA 4IO8A 4H5RA 1GLLO 4CZHA 3DXKA 2FF6A 4EIAA 2IVNA 1S22A 2PBDA 2D0PA 4A2BA 2PAVA 4M63C 3O1BA 1EQYA 1DGKN 2GTDA 3HI0A 1MDUB 3MMVA 4WQ5A 5AQGA 5AQUA 5AZIA 1QZ6A 3RSEB 5BRHA 2J4RA 2IVOA 3BF3A 3ENOA 3A5OC 1HJOA 3D2EA 1Z6RA 1IJJA 3CJBA 4BVPA 4JD2A 4CZMA 2V7ZA 2ZWHA 1TUYA 2E1YA 4EAHD 2QWMA 4ISEA 4RWTA 1Y64A 3EL2A 1KAZA 1DKGD 1E4FT 3BF1A 3GDQA 5F1XA 3QFPA 2E2QA 4DB3A 3D2FA 3AAQA 2YJEA 5JLFA 3O80A 4BC4A 4JN4A 1KAXA 5AZJA 1U6ZA 2QXLA 5AQFA 3R6MA 5BRFA 4A62A 2P9PB 3IFRA 2FLOA 4BRFA 4BR9A 2GWKA 2E88A 1D4XA 4WQ4A 3QDKA 4IJNA 5I9EB 3VENA 2W40A 3DXMA 1NLVA 4CZLA 1ATRA 1P8ZA 4PKHA 3LDPA 1SAZA 3HBTA 4WQ5C 3LDNA 2QM1A 4IXCA 5AQPA 3SJHA 2V7YA 3UB5A 4JAXA 3VPZA 1NGDA 4QS8A 2FSJA 4BG8A 2NLXA 4B1VA 4FWQA 5EOYA 2QWPA 2CGLA 3QB0A 2P9NA 4H0YB 2V51B 4FWPA 3ULEB 3FZHA 1C0FA 4IWVA 3H1QA 1U2VA 3WXLA 3VEZA 5AZIB 1JCEA 3FGUA 3O8MA 4MO5A 2I7NA 3MCPA 3D2EB 4EHUA 4Y0WA 4JD2B 3SMPA 1HKGA 5EX5A 2P9UA 3IMXA 1JCGA 4NB4A 4WQ4C 5CE3A 1TUUA 1ZC6A 3VGLA 4B9QA 1KXPA 1X3MA 4HTLA 2H3GX 4YDUC 5EY4A 3HZ6A 3D2FB 3I8BA 1BU6O 2Q2RA 3LDOA 3W0LA 5AZJB 3LDQA 3P4IA 3M3ZA 2GEMA 2QWOA 3EKSA 2ZGYA 2F9TA 4FOIA 3O4WA 4O8KA 1BOTO 4IJAA 4BRGA 1BDGA 1T44A 4MLEA 1GLAG 3HM8A 5AQYA 3OHRA 3DXMB 1NBWA 2E1ZA 1XQSC 2QW9A 5BPNA 1BG3A 4CZFA 3ZX2A 4EHTA 5AQVA 5AQTA 3ZX3A 3WXKA 2BUPA 3H46O 1C0GA 3LM2A 2ZGZA 4BRAA 3CQXA 3EO3A 2QWLA 4A61A 4BR0A 3IDHA 2P9NB 3SK3A 3ULEA 4FPAA 5KPRA 1ATNA 1G99A 2Q97A 2WUSA 1YXQA 3CJ9A 2ASMA 1U2VB 3EZWA 1YUWA 4BREA 4FOEA 3MN7A 4BRDA 2D1KA 4JHDA 4AM6A 5BR9A 3H3NO 3U4LA 4AM7A 1YVNA 3BP8A 3WXIA 5AQRA 1RDWX 3VOVA 1BA0A 2CGKA 3H45C 3S41A 5F2RA 1HUXA 2P9UB 2V52B 4M7XA 4A2AA 4CD3A 4H5TA 4M7YA 1J6ZA 4E1JA 5AQHA 2CH5A 4BGBA 3MN5A 3FZFA 2FF3B 3VEYA 5AQSA 2UYTA 3QFUA 3L6QA 3UE5A 4BROA 4PKIA 1QQOA 3FLCO 1LOTB 3EN9A 4RTFD 3CERA 3CIPA 5LJVA 5AQLA 3UKUA 3IUCA 2KHOA 2AA4A 1SZ2A 2Q36A 5JMVA 3ENHA 1IG8A 1V4SA 5AQNA 3R8EA 3DAWA 1T6CA 5AFUA 3C0BA 4CZKA 4FSVA 2ITMA 3FFKB 2ZF5O 5FPNA 3MN9A 4QS7A 1Z05A 4YDUA 2QWNA 4B1WB 3D7EO 2QWRA 3TU5A 4NO7A 5AFUH 4BQLA 2A5XA 1XUPO 2YCHA 5AQIA 4CZJA 1HLUA 4CJ7A 1KAYA 1NGHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KQ8A 1WBDA 2FC0A 3HOSA 1RT2A 1ATSA 5BREA 3T1YK 1JJ2M 3O5BA 1ZBSA 2Z1GA 2Q1NA 2O8FA 4Z4FA 2Q31A 3MWPA 1OH7A 4JHDB 1YJ9N 1N34K 1IKVA 4KRFA 4DU4A 2NRHA 1CHZA 4FZZA 4KKOA 3VQEA 3QNOA 2Q0UA 1GPSA 3BEXA 4KAZA 1RBUA 4DV5K 3AVCA 4HCBA 3TTFA 2X74A 2A6AA 2SN3A 3ZX0A 5KRSA 2I61A 4CEOA 4H03B 1NK7A 2YNFA 1MYNA 4AHVA 5FPMA 3B6PA 3WEEA 4JRQA 4WE1A 4NCGA 2AP1A 5TKWA 3ZT4A 1RTJA 4RW4A 1ESVA 3VMFB 3GKUA 3QINA 2HNYA 1J9AA 4PHTX 1N36K 3ATVA 1S1WA 1X1PA 4C23A 3VQ5A 4CCHA 4H0OA 3JYTA 1KVAA 3PIOL 3OTOK 4PUOA 4K25A 3CJAA 4XJXA 2P9KB 3CMEN 2AJQA 1JXBA 4GY2B 4H4OA 4CF9A 1BWFO 4LF6K 1NGAA 4E7LA 2P9LB 3AV9A 1YTAA 1B3CA 2HB5A 4CI6A 1N33K 4K41A 2QWQA 3ZT3A 1HYZA 4UQGA 2KFNA 2FBTA 3GE1A 3O08A 3P31A 5AQOA 4CK1A 5CY0A 3OYNA 4NXMK 3KZBA 1VSFA 1D5AA 1CZAN 1VSEA 1VK0A 3TAEA 1I6GA 3VQ8A 1VQNN 1ZBLA 2NRVA 3SQ0A 4BR4A 4Z94A 4LF5K 1W9HA 4F3TA 3KOZA 1IKWA 2RPIA 2F8SA 3PUFA 4CESA 4C1NK 3F9KA 5SZTA 4XH5A 1JZAA 1NWKA 1V4TA 1YT3A 3M8PA 3AA4A 3AA2A 5MLCQ 3SUOA 2BH1A 3C65A 4NLCA 3TAPA 1RTHA 1BMRA 3SLCA 1K8KA 1RT5A 1NJWA 2ASOA 2YIOA 4JI0K 1Q86O 1AYJA 4M3YA 3AO5A 4UADE 3U9DA 1YI2N 1SL1A 2P5GA 4Z4EA 3ZLJA 2E2OA 1GLCG 3VEOA 3I33A 3JSMA 3NVKA 4DU1A 3I56N 5LMNK 3AARA 1IG9A 3VQCA 1KV0A 1I94K 4CGHA 3DWLA 3ID8A 1HR0K 5BPLA 1XC3A 1MWMA 2N2QA 3AY9A 2HBLA 1NM1A 3DXKB 3T3FA 3ATUA 3K5NA 4QAGA 1NJXA 4MDBA 1S1VA 4LH5A 5AQXA 4DSLA 4CF0A 3JS6A 2XY5A 4BRIA 2VWBA 4O55A 4DTUA 2E6MA 4IOXA 3O4NA 2B6AA 1UAXA 2GWJA 4CJ5A 4GV9A 2NRWA 2NZTA 4YFUA 1K73O 1L5UA 4JI8K 4AH9A 4CGFA 3L2QA 3KTQA 3M6GA 1PTXA 2OTLN 1QSYA 3A5LC 3GL1A 2XHBA 4DTMA 5DMRA 1WSIA 5JICA 3QESA 1W97L 2F4VK 1QHAA 1JCFA 4WFAL 3CM5A 2O8BB 4BRQA 2GELA 1VRTA 3CCMN 4KBOA 2N69A 4JRPA 3TPQA 4KB1A 3CPEA 3OY9A 1J5EK 5JLHA 1KRPA 4IBNA 3U8XA 5IT9O 1HMVA 1JLFA 2HNZA 3LANA 1A5XA 4JKAA 2P9PA 3NGZA 4B3TK 4Z4CA 4JI4K 5FRNA 4DTSA 5KPTA 3ID6A 1NKCA 4XH1A 1W0HA 4B1YB 4BR2A 3G4SN 4FYDA 4HE7A 3VEVA 3CCUN 4OLAA 4M3TA 4QS9A 4JKEA 2JWKA 1NPIA 2LT8A 2B3CA 4FK2A 3NCIA 3L4IA 3L2WA 1GLLO 4CZHA 2FF6A 2IVNA 1S22A 3B6OA 1HNXK 1UOCA 2D0PA 1JLGA 1Q82O 3SBTA 1WWNA 4IFYA 1EQYA 4CIEA 1U45A 5M1NA 4FW1A 4HVJA 2BDPA 3VQAA 2Z1HA 5JENA 5BRHA 1RBVA 3E66A 2KZMA 1HJOA 2JDQD 4CK2A 2V7ZA 1RDDA 1RT1A 4NCAA 4ISEA 2QEXN 4RWTA 3E9PA 1KAZA 1VRUA 2E5LK 3GDQA 4ID1A 3QFPA 3IRXA 3THYA 1C1BA 1CXQA 3ASMA 5AZJA 3CPWM 1S72N 5AQFA 4CHOA 4GV3A 3CCLN 4H8KA 3MEGA 4WQ4A 1DTTA 4G9ZA 3NVMA 4DV3K 2PFUA 4CJTA 3VENA 1QSSA 1TL3A 2WBNA 3CCSN 3DXMA 1NLVA 4CZLA 2KFZA 5H1SQ 3LDPA 4WQ5C 3DLBA 4OVLA 4JKGA 1RBTA 1VQKN 3O4QA 1OH6A 3PX0A 3UB5A 2KGQA 2FSJA 2MBKA 5FRMA 1A5WA 1S1UA 2ZD1A 2QWPA 3BDPA 3G6EN 4H0YB 4FWPA 3ULEB 4B3RK 3IKMA 5HRPA 3SI6A 4IWVA 3FFIA 4IFEA 4B9VA 4DS5A 1DJTA 3KOWA 1LQQA 1QVFM 3DOKA 5GAHP 4Y0WA 2ASCA 5GADP 3KWGA 4N5SA 3SMPA 4KV8A 3BZKA 3IMXA 3HP9A 4DQIA 1T03A 5M1QA 1X3MA 2FBXA 4KH5A 1RDBA 1YVUA 2HHXA 4PWDA 1OVQA 3I8BA 4U7BA 3R2VA 3QEPA 1CLQA 3W0LA 4GKJK 3M3ZA 4PA1A 2O8CA 2QWOA 3V1QA 2XO7A 2ZGYA 4O0IA 3E9LA 3O4WA 4C8KA 4CEBA 3CC7N 5LMUK 2OYQA 4F8RA 4ZHRA 4K8ZA 3QNNA 1GLAG 3C6AA 1XQSC 2NY8X 4E0DA 3AVMA 3ZX2A 1TGOA 3KK1A 4IEEA 3CCVN 4DTOA 2E6LA 2WC9A 4DLEA 3ZX3A 3LP0A 3OS1A 3O9UA 1FH3A 1XNQK 4NLBA 3HL8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5KQ8 A;  1WBD A;  2FC0 A;  3HOS A;  1RT2 A;  1ATS A;  5BRE A;  3T1Y K;  1JJ2 M;  3O5B A;  1ZBS A;  2Z1G A;  2Q1N A;  2O8F A;  4Z4F A;  2Q31 A;  3MWP A;  1OH7 A;  4JHD B;  1YJ9 N;  1N34 K;  1IKV A;  4KRF A;  4DU4 A;  2NRH A;  1CHZ A;  4FZZ A;  4KKO A;  3VQE A;  3QNO A;  2Q0U A;  1GPS A;  3BEX A;  4KAZ A;  1RBU A;  4DV5 K;  3AVC A;  4HCB A;  3TTF A;  2X74 A;  2A6A A;  2SN3 A;  3ZX0 A;  5KRS A;  2I61 A;  4CEO A;  4H03 B;  1NK7 A;  2YNF A;  1MYN A;  4AHV A;  5FPM A;  3B6P A;  3WEE A;  4JRQ A;  4WE1 A;  4NCG A;  2AP1 A;  5TKW A;  3ZT4 A;  1RTJ A;  4RW4 A;  1ESV A;  3VMF B;  3GKU A;  3QIN A;  2HNY A;  1J9A A;  4PHT X;  1N36 K;  3ATV A;  1S1W A;  1X1P A;  4C23 A;  3VQ5 A;  4CCH A;  4H0O A;  3JYT A;  1KVA A;  3PIO L;  3OTO K;  4PUO A;  4K25 A;  3CJA A;  4XJX A;  2P9K B;  3CME N;  2AJQ A;  1JXB A;  4GY2 B;  4H4O A;  4CF9 A;  1BWF O;  4LF6 K;  1NGA A;  4E7L A;  2P9L B;  3AV9 A;  1YTA A;  1B3C A;  2HB5 A;  4CI6 A;  1N33 K;  4K41 A;  2QWQ A;  3ZT3 A;  1HYZ A;  4UQG A;  2KFN A;  2FBT A;  3GE1 A;  3O08 A; 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