2E8AA

Crystal structure of the human hsp70 atpase domain in complex with amp-pnp
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Direct inter-subdomain interactions switch between the closed and open forms of the Hsp70 nucleotide-binding domain in the nucleotide-free state.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 1A
total genus 127
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2e8aA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e8aA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e8aA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2e8aA04
3VEZA 3O4WA 4PL8A 2GTDA 3JS6A 2PBDA 4M63C 2E2PA 4CZLA 4H5WA 2PAVA 4CZKA 1E4GT 1H1VA 3LDOA 1TYQB 4XH4A 2Q0RA 4MO4A 3MK6A 3UKRB 4FOEA 2D0PA 1K8KB 2NLXA 1U2VB 4BR5A 3R9PA 2V7ZA 3CJ1A 4JHDA 4BVPA 4DQ8A 1HJOA 5CE3A 1HPMA 4CZEA 4BGBA 5JMVA 3O80A 4FWSA 4QS8A 4H03B 3EL2A 5AQLA 4A61A 3SK3A 3KZBA 2P9UA 4PKIA 3IDHA 1XUPO 2P9NA 5AZJA 3HZ6A 4FWRA 4BRKA 4BR2A 4HWIA 4C23A 3ULEA 4BRHA 4FWMA 1V4TA 4BQZA 5AQKA 4NB4A 3QB0A 2E8AA 5AQFA 2FXUA 5BR9A 3H6EA 2QXLA 2V51B 1BDGA 4BVOA 3LL3A 4HTLA 3VGLA 3U4LA 3VENA 4BRNA 4DB3A 4H5TA 1QQMA 4CBWA 3UE5A 1HKCA 1R59O 3VF2A 5KPZA 1OKJA 5AQVA 3U9DA 4BRQA 4BRIA 1C0FA 4BR4A 2Q0UA 2YHYA 2V52B 2A42A 4JNEA 2VYPA 4FOIA 3BUZB 1U2VA 5LJWA 1KAZA 3CJCA 3CJAA 4BREA 4MLHA 2IIRA 3LM9A 4JHDB 3ZX0A 4J8FA 1C0GA 3A5OC 3EO3A 3HBTA 1T6DA 4BRAA 5AQGA 4F9OA 2E20A 3C7NB 3HSCA 4FPAA 3R6MA 1GLDG 2D4WA 1HKBA 4WQ4C 2CGJA 3VPZA 4CZIA 5ADXH 4B1XB 1EQYA 2W41A 2FSNA 1YVNA 2P9PA 2QM1A 3GOIA 2E2OA 5ADXA 1GLLO 3WXJA 3WEEB 3D2EB 1ATRA 3SLCA 5F2RA 3M6GA 1YAGA 3EKUA 1NGIA 1SQKA 4AM6A 4BRFA 5EY4A 2ASOA 1QHAA 5TKYA 4H0YB 1ATSA 1S3XA 4CZFA 3J8AA 4K43A 4I6MB 3VEXA 2AP1A 4CJ7A 3MN6A 4KBOA 5E26A 5AQUA 4QS9A 2CGLA 2ASPA 3DXKA 4B1VA 2CH5A 4H5RA 1SAZA 3H46O 4M7YA 4CD1A 2GELA 1TUUA 3ENHA 3ZX2A 5AQIA 3QFPA 3DWLA 2YI1A 4O5FA 4CZHA 4FWPA 1QQNA 4B1UB 1GLBG 1HUXA 5BREA 1QZ5A 3R8EA 2YJFA 4B1WB 1ESVA 4E1JA 3QFUA 3RSEA 2BUPA 1HX1A 4BGAA 2P9IA 3H3NO 1D4XA 4IZ9A 2I7NA 5AZIA 3IUCA 4XH5A 3QDKA 5FPDA 1DEJA 3ZEUB 5FPEA 3FGUA 4FWKA 1BG3A 4PKHA 4CI6A 3L4IA 2CH6A 2V7YA 2ZF5O 5EOYA 2IVNA 4BQLA 4RTFD 4BR7A 2F9WA 3IMXA 3ENOA 2IVOA 5BPMA 2Q36A 5FPMA 2A5XA 4CZGA 1KAXA 3D2FA 4RWTA 2P9KB 3A5MC 1GLAG 5BPNA 1LOTB 2QW9A 4BC2A 3CI5A 5B8HA 1NM1A 3ZEUA 2D1KA 4DHYA 2YHXA 1MWKA 1ZBSA 3CIPA 4YDUA 3UB5A 1NGBA 5LY3A 4H5NA 1HKGA 3WXLA 3L0QA 3AARA 2E2QA 4IJNA 4BG8A 3UKUA 1XQSC 1YUWA 3TU5A 2ZGZA 4H0PA 5AQNA 1BUPA 3BEXA 4JD2A 1XC3A 1JCEA 1K8KA 3EKSA 3LDLA 1GLJO 2P9IB 2E2NA 2IVPA 2QWMA 1NGJA 3CHWA 3FZHA 5AZIB 2YHWA 5AQOA 4H5VA 2YCHA 4FWNA 4FWLA 2HOEA 2A41A 5AQQA 2GUPA 2ASMA 3CJ9A 4YDUC 3ATUA 3O08A 5AFUH 1RDWX 4A2BA 3A5NC 1NGAA 5BN9A 1P8ZA 3D2FB 3H1QA 3MCPA 5KPTA 2KHOA 3FE1A 1V4SA 3AAPA 4B1ZA 2QWOA 5F1XA 1T44A 2A40A 4H0OA 2FF6A 4IXCA 3C0BA 5AQHA 4H0TB 4ISEA 1NLVA 5AQYA 2GEMA 4LC9B 4EAHD 3FZLA 1BO5O 2HF4A 3QBXA 1GLEG 3LDQA 1HLUA 4A2AA 3LM2A 2GWKA 3VF4A 4K41A 3WQUA 1QZ6A 3LDPA 1DKGD 1S22A 1NMDA 2Q97A 1J6ZA 3H45C 3MN9A 3ID8A 1Z6RA 3FZFA 4B9QA 4BC3A 3VGMA 4QS7A 3DXKB 3D7EO 5BRDA 3SMSA 4MLEA 3EZWA 1BA1A 3ZX3A 2NRHA 2HMPA 1BWFO 3VF6A 3O5BA 2P9LA 2ZGYA 3MN7A 4MO5A 5ELZA 5BN8A 4WQ5C 5FPNA 2FF3B 4PKGA 3HTVA 4EIAA 4EHTA 3G25A 3DXMA 3QBWA 2CGKA 1G99A 5AR0A 3MDQA 4BRGA 3LDNA 1YXQA 3OHRA 2P9KA 2E1YA 2Q1NA 4XH1A 2P9NB 3ZETB 3HI0A 4BC5A 2E88A 3B8AX 3GBTA 1DGKN 3SMPA 1Q18A 2BTFA 2ITMA 3DAWA 2Q2RA 4IO8A 3O6WA 4GY2B 3WUHA 4FPBA 3MMVA 4CZJA 2HF3A 3CETA 1X9JA 1IG8A 1NGHA 4EHUA 1JCFA 1RGIA 1QQOA 4WQ5A 3AAQA 3I33A 4Z94A 3A0IX 5KQDA 5KQ8A 4K25A 3A8YA 3CQYA 2VCPA 3GDQA 4BRLA 3FLCO 3GE1A 1MDUB 4FL9A 4NO7A 1TYQA 3WEEA 4BR9A 2GWJA 4JAXA 3FFKB 3CJ7A 4FWQA 1NGFA 1T6CA 3QICA 3BF1A 3FR0A 4CZMA 2A3ZA 3O1WA 2P9LB 3I8BA 2FSJA 5AQSA 5LJVA 1JCGA 5AQMA 3EN9A 3L6QA 1KXPA 4K42A 5AZJB 4BC4A 2ZWHA 3DXMB 4AM7A 5BPLA 4A62A 1MWMA 2J4RA 3VEVA 1BOTO 4BROA 3GG4A 1ZC6A 4CBUA 4JD2B 4IWVA 3VEYA 4FO0A 4BRCA 3ZETA 3BF3A 5AQWA 3F9MA 4M7XA 3U9ZA 5KPRA 5AQXA 3O1BA 1MA9B 3H1VX 5JLFA 2P9SA 3CERA 2H3GX 3BP8A 1U6ZA 5JLHA 5BRHA 5E84A 1SZ2A 1NGCA 2UYTA 1ZXOA 4BR0A 3VESA 1Y64A 3CQXA 2QWQA 3VEWA 2D0OA 3SJHA 2NZTA 4L3QA 4DCHA 3O8MA 5EVZA 3GL1A 2W40A 2FLOA 3VETA 5AQZA 3VEOA 1GLFO 2I7PA 3RSEB 3W0LA 3KVGA 4EFHA 1IJJA 3S41A 3U8XA 3WQTA 5I9EB 3AY9A 3WXIA 5BRFA 2QWRA 4WYBA 5JICA 3A5LC 4FSVA 5AQTA 3JXUA 3H3OB 5AFUA 1CZAN 3C7NA 2QWNA 3M1FA 1E4FT 4RCHA 5AQJA 4IJAA 4ISGA 5AQPA 5F0XA 4H0XB 3WT0A 3WXKA 3FZKA 1NBWA 3P4IA 1WOQA 1RFQA 3VGKA 4WQ4A 4GNIA 3DJCA 3VOVA 3IFRA 2P9PB 4BRPA 5AQRA 3VERA 3FZMA 4PL7A 3UKRA 2P9SB 3TPQA 2WUSA 2YJEA 1WUAA 4XEIA 3CJBA 1NGEA 2EWSA 4BRDA 5EXWA 1NWKA 4BG9A 4H0VB 5EX5A 4FWOA 3M3ZA 1X3NA 3ATVA 4O8KA 1Z05A 3UKUB 2Q31A 2VWBA 1GLCG 1BA0A 1X3MA 4I6MA 2DPNA 4CD3A 2QWLA 2P9UB 1LCUA 3ULEB 3KHYA 1BU6O 3HM8A 1NGDA 1KAYA 1NGGA 2FSKA 1TUYA 3W3DA 2QWPA 2E1ZA 2F9TA 4JN4A 2AA4A 4Y0WA 2OANA 3D2EA 1ATNA 4CBXA 2A6AA 4ISFA 3MN5A 4B1YB 3QMLA 4BRMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XRIA 1OVQA 4JKGA 3VEZA 3OJSA 1C1BA 3ZT4A 1N8RO 2GTDA 3K9KA 2E2PA 4CZLA 4FLXA 1EP4A 4CZKA 3BY5A 4FJ8A 5C42A 4B9UA 2VGNA 4PWDA 5GADP 2QKBA 4DTMA 2V7ZA 2KFZA 4B8CA 4I2PA 4DU1A 2A7TA 4OGEA 4ZTFA 3O80A 4FVMA 2KW4A 2HVIA 2KZMA 1N36K 3VQAA 3TR8A 4LSLA 3AA4A 2P9NA 4FWRA 3CMEN 4CF2A 4BRKA 1CXUA 3BK3C 1ZYVA 1VNAA 3TAQA 4BRHA 5CZ1A 1RDAA 3OY9A 1TAUA 4NB4A 3QB0A 3OYJA 3H6EA 2KGQA 4DSEA 1MU2A 1EO1A 1BIZA 1JZBA 3CG7A 3P39A 3LL3A 3WNEA 3KIOA 1NNEA 3THYA 4PA1A 4BRNA 4DB3A 4H5TA 4CBWA 3UE5A 3E9OA 1R59O 3NF8A 1OKJA 5AQVA 3T7ZA 4BRQA 2E6MA 3R2VA 1C0FA 4BR4A 1UA0A 4EZ9A 2KQ2A 2VQEK 3T69A 1I2VA 3BUZB 1U2VA 4GW6A 3CJCA 4JKEA 4IFYA 4BREA 3ULDA 2Z1IA 2FBYA 5C15A 4IOXA 1NH5A 2W00A 1UOCA 3EO3A 1L3UA 1JJ2M 3IAYA 3E66A 3T3FA 2D4WA 3VQ4A 1QVFM 1M1KO 1UA1A 1VSIA 2CGJA 3VPZA 5ADXH 3S5TA 4B1XB 2DFHA 2FSNA 2W41A 3GOIA 1GLLO 1ATRA 3SLCA 3HOTA 2Q3SA 2IC3A 1NGIA 3V1QA 2GL1A 1S6PA 4IO9L 5EY4A 2ASOA 3E9PA 4M3TA 4XJXA 3IG1A 4AF1A 1ZBHA 4DQIA 3THYB 3I8DA 3I0SA 4DV5K 4K43A 4DV2K 1SV5A 3VEXA 2YEOA 2F8TA 5DMRA 1J5EK 2UXBK 3C6UA 4I7FA 4B1VA 4FJ5A 3C6HA 1S1VA 3OS1A 2ETJA 4F3OA 4F8RA 4H5RA 1FKOA 3CFPA 3AVBA 3VQDA 4M3XA 1KLNA 2YKMA 2E6LA 4DWIA 3EY1A 3ENHA 2O8FB 3QFPA 1WLJA 1K8BA 2YI1A 3BZKA 3AO1A 4B1UB 1GLBG 2BGGA 2HNYA 5KRTA 1ESVA 1X1PA 4JI8K 1SL2A 3RSEA 4KHYA 4BGAA 4AB0A 3H3NO 4CE9A 4CFAA 4DV7K 1KSPA 4NXMK 1BMRA 3DRSA 4RW4A 1ZBFA 3QDKA 1DEJA 4CF9A 4CK3A 3I0RA 4PKHA 2ASCA 2B68A 5EOYA 4KH5A 4K8ZA 2QEXN 2IVOA 1LWCA 5BPMA 4RWTA 1RCHA 3KLIA 1SKWA 3A5MC 1ASUA 2LI7A 1S1XA 2ZJPL 1L3VA 2PYJA 2D1KA 2YHXA 5CHIA 3N4PA 4AHTA 1RBTA 1NGBA 5LY3A 1ZYQA 3EE8A 1HMVA 4BDPA 2G2KA 3QI7A 3HPGA 4G9ZA 3BZCA 4W5QA 3O3HA 3BEXA 3D6RA 3O9TA 3TARA 2NY9X 3P5JA 1GLJO 4IEIA 3OYIA 4LF8K 4JK7A 5AQOA 4TSXA 1SL1A 4FWLA 1GPSA 2W42A 2HOEA 4FJIA 5AQQA 2GUPA 1BGXT 2HHSA 1NGAA 3BDPA 3SYZA 3VQBA 1T8EA 1V4SA 2QWOA 1HQUA 4H0OA 3NH2A 2HHHK 2FF6A 4IXCA 4Z4HA 4Z4CA 5AQHA 4ISEA 4JS4A 3FZLA 3N4QA 3SBGA 3QBXA 4ZHRA 4MDAA 4B3TK 1RT3A 2YV0X 4A2AA 3J81O 1MR4A 3LM2A 4JK8A 4K41A 5C25A 1O13A 4GV3A 1YI2N 1UGLA 5HLFA 1LQQA 4YNQA 4JKFA 3H45C 1RT5A 4B9QA 1WSJA 4CGJA 2B4JA 4MLEA 3MECA 2HMPA 3O5BA 2ZGYA 3MN7A 3F73A 4HCCA 1J54A 5BN8A 4EP4A 4WQ5C 5CYQA 4LF4K 4CHPA 3VA3A 1S1UA 3CCSN 2FF3B 4KPYA 3QBWA 2CGKA 4B3MK 4BRGA 3H08A 3LDNA 1U47A 4FVUA 2E1YA 2Q1NA 4XH1A 2MN5A 3CXCM 3KP0A 4BC5A 3HI0A 3PUFA 4HUFA 1DGKN 3SMPA 2OA8A 3WUHA 1SUQA 4BEBA 4FPBA 4CZJA 2HF3A 4DFMA 1NGHA 3CC7N 1JCFA 1QQOA 1RILA 4UJ0A 2ZM6K 3RMDA 4N41A 5KQ8A 4CJTA 3E7UX 3MXIA 3G0ZA 3GE1A 4CF0A 3TAEA 1VQ4N 1N6QA 4HVJA 2GWJA 3KOZA 1XMOK 4CFBA 3JSMA 3CJ7A 4AQYK 1GOBA 3EZ5A 3PIPL 1GPTA 3VMFB 3QNNA 3THXA 4CZMA 3FR0A 3KC6A 4DV3K 2X78A 3O1WA 4H8KA 1DTQA 3HOSA 3EN9A 3L6QA 3AVGA 2LR3A 2OZSA 1VSJA 5AZJB 4BC4A 4B9VA 3LAMA 3KLFA 5CZ2A 4AM7A 5BPLA 2P5GA 1BCGA 4W5TA 3SBTA 2J4RA 1BOTO 5M1QA 2ZQBA 4CBUA 4JI3K 5AQWA 4M7XA 3U9ZA 4DUZK 5AQXA 4OPHA 5M1KA 3O1BA 1MA9B 1BI4B 3HVTA 3O3FA 3CERA 3OYBA 1U6ZA 3NF6A 5M1OA 3U3GA 5E84A 1DQ7A 1HPZA 1SKSA 4M3YA 3ZSZA 4JKAA 3S3NA 4KYPA 2BDPA 3VEWA 2D0OA 3SJHA 4IG3A 2G8IA 1LAWA 4KI4A 3CW4A 3DLEA 3V4IA 2FLOA 3VETA 3O9SA 5HP1A 3LP1A 3RSEB 3TWHA 3RR7A 3W0LA 3G71N 4JK9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2XRI A;  1OVQ A;  4JKG A;  3VEZ A;  3OJS A;  1C1B A;  3ZT4 A;  1N8R O;  2GTD A;  3K9K A;  2E2P A;  4CZL A;  4FLX A;  1EP4 A;  4CZK A;  3BY5 A;  4FJ8 A;  5C42 A;  4B9U A;  2VGN A;  4PWD A;  5GAD P;  2QKB A;  4DTM A;  2V7Z A;  2KFZ A;  4B8C A;  4I2P A;  4DU1 A;  2A7T A;  4OGE A;  4ZTF A;  3O80 A;  4FVM A;  2KW4 A;  2HVI A;  2KZM A;  1N36 K;  3VQA A;  3TR8 A;  4LSL A;  3AA4 A;  2P9N A;  4FWR A;  3CME N;  4CF2 A;  4BRK A;  1CXU A;  3BK3 C;  1ZYV A;  1VNA A;  3TAQ A;  4BRH A;  5CZ1 A;  1RDA A;  3OY9 A;  1TAU A;  4NB4 A;  3QB0 A;  3OYJ A;  3H6E A;  2KGQ A;  4DSE A;  1MU2 A;  1EO1 A;  1BIZ A;  1JZB A;  3CG7 A;  3P39 A;  3LL3 A;  3WNE A;  3KIO A;  1NNE A;  3THY A;  4PA1 A;  4BRN A;  4DB3 A;  4H5T A;  4CBW A;  3UE5 A;  3E9O A;  1R59 O;  3NF8 A;  1OKJ A;  5AQV A;  3T7Z A;  4BRQ A;  2E6M A;  3R2V A;  1C0F A;  4BR4 A;  1UA0 A;  4EZ9 A;  2KQ2 A;  2VQE K;  3T69 A;  1I2V A;  3BUZ B;  1U2V A;  4GW6 A;  3CJC A;  4JKE A;  4IFY A;  4BRE A;  3ULD A;  2Z1I A;  2FBY A;  5C15 A;  4IOX A;  1NH5 A;  2W00 A;  1UOC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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