2E8AA

Crystal structure of the human hsp70 atpase domain in complex with amp-pnp
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
b'KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70kDa protein 1A
publication title Direct inter-subdomain interactions switch between the closed and open forms of the Hsp70 nucleotide-binding domain in the nucleotide-free state.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 127
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2e8aA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e8aA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e8aA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2e8aA04
2CGKA 5AQPA 3U9ZA 3VENA 3MN9A 2I7PA 1X9JA 3ULEA 2Q36A 3GDQA 3D7EO 4B1YB 3H46O 3VETA 5EXWA 4JD2B 4JNEA 1LCUA 3GBTA 2HOEA 2CH6A 4A61A 4BR4A 4DQ8A 3I33A 2HF3A 2Q0RA 3GL1A 4GY2B 1EQYA 4FWOA 4B1UB 4A2BA 5AQJA 4NO7A 3LL3A 2E2NA 3JXUA 2F9TA 1KAYA 4BR2A 1NGFA 3ENHA 1QZ6A 1U6ZA 4K42A 4PKGA 4H5WA 5AQLA 2V52B 4FPBA 5E84A 2DPNA 3O8MA 4H5RA 4ISFA 5FPMA 3FZFA 4H5NA 5AQTA 3WT0A 2ASPA 1X3MA 3BF3A 3FZMA 1U2VB 1QZ5A 5ELZA 1BOTO 4XH4A 4L3QA 1GLJO 4YDUC 1TYQA 3DXKB 3WUHA 3B8AX 4PL8A 5KPRA 4H0PA 2YHWA 1MA9B 3O80A 1BA0A 1TUUA 1R59O 2QWRA 4HWIA 2FXUA 2BUPA 4FWRA 2E2QA 3SMSA 4BRCA 2AP1A 2CGJA 2D0PA 2E88A 2FF3B 3F9MA 4O5FA 2QWOA 1G99A 1T44A 5AR0A 1BWFO 1E4FT 3U8XA 1MWKA 3HI0A 2E1ZA 2QM1A 1K8KB 4JAXA 3HTVA 5BRHA 2QWQA 2QXLA 4HTLA 3R6MA 5AQHA 2P9LB 3MN5A 3QFPA 3WEEA 3FZHA 1XQSC 2ZGYA 1YUWA 4IZ9A 4H0XB 1Z05A 2ASOA 1YVNA 5I9EB 5BPNA 1NGGA 3WXJA 4B1ZA 5KQDA 1H1VA 1C0FA 2P9NA 3UE5A 4K25A 3BF1A 2W41A 3L6QA 5LJVA 2E1YA 2YI1A 2E20A 3ZEUB 5FPNA 4BC5A 3R8EA 4GNIA 4FWPA 2CH5A 3KVGA 4PKIA 5AZIA 3UKRA 3TU5A 2YJFA 3RSEB 5LJWA 1OKJA 5AQWA 4A62A 5JICA 4MO4A 4IXCA 4LC9B 1HUXA 3D2FB 1NLVA 3UB5A 3M3ZA 4H5TA 5F1XA 1T6CA 4MLEA 3LDNA 4EIAA 3IDHA 3EKSA 4FPAA 3CERA 3A8YA 3G25A 4FWNA 5AQFA 2VYPA 2FLOA 3EKUA 3HM8A 2P9UA 3D2EA 4E1JA 2WUSA 3DAWA 2ZF5O 2F9WA 3VF4A 3H3OB 1Z6RA 4JN4A 4AM6A 2D4WA 4BRNA 1BUPA 4FOEA 3QFUA 3M1FA 2NRHA 4EHTA 3LDLA 4IJNA 3U9DA 3J8AA 3ZETA 4BRMA 3ATVA 1NGEA 2QWNA 2FSNA 3KZBA 3CQXA 2FSKA 3GG4A 4XH1A 2GEMA 5CE3A 1ZC6A 5KQ8A 5EX5A 3CETA 2IVNA 3SK3A 3W0LA 4B9QA 2NLXA 1TUYA 3WXIA 4BROA 2E8AA 4BG9A 5BREA 1NWKA 3VOVA 1XUPO 4NB4A 3WXLA 1HKBA 4CZEA 4CBXA 4BRPA 3S41A 3CJCA 4H5VA 1HJOA 4C23A 2UYTA 3GOIA 4ISGA 3M6GA 1P8ZA 3BP8A 4CZFA 4BRDA 4BR0A 2Q31A 3FLCO 1WUAA 3C7NB 4QS9A 1HKGA 2YJEA 1BG3A 2Q2RA 3AAPA 3WQUA 3LDQA 3O1WA 3VEOA 2P9IA 1V4SA 4FOIA 4CZMA 1RFQA 5EY4A 4FO0A 1QQNA 4WQ5C 5AFUA 1JCFA 4H0TB 3CQYA 1TYQB 3OHRA 3I8BA 2A42A 3DXKA 2A41A 3W3DA 5AQKA 5BR9A 4B1XB 5FPEA 2ASMA 3CI5A 1HPMA 3EZWA 5KPZA 2QWPA 2A5XA 1KAXA 1MWMA 2D1KA 3CJ9A 4BRQA 1QQMA 2W40A 2PAVA 4BR9A 3CJ1A 2NZTA 2GWKA 5AQMA 3QBXA 5AZJA 5EVZA 3U4LA 4BG8A 1NGJA 2A3ZA 3FGUA 3FR0A 3VEYA 3VGMA 1J6ZA 2GELA 4JHDB 1ATSA 4BR7A 4BVPA 3HBTA 2J4RA 2ITMA 3H1QA 1DGKN 4Y0WA 3EL2A 4BRAA 4EAHD 2P9LA 5F0XA 2GUPA 4ISEA 1ATRA 4M7XA 5BN9A 4FWMA 4WQ4A 4BQZA 2YHXA 2V7ZA 2EWSA 3QMLA 1Y64A 2D0OA 2ZGZA 3SMPA 1HX1A 1YXQA 2ZWHA 1HKCA 3VERA 4BVOA 3AAQA 2I7NA 2P9KA 1KAZA 2YHYA 2A40A 4IJAA 2YCHA 3ZEUA 4CZGA 1SZ2A 4I6MA 4BC4A 5AZIB 3MN6A 4CBUA 3MN7A 3SJHA 1BU6O 1NGCA 4WQ5A 4RWTA 4PKHA 5B8HA 3H3NO 3FFKB 1DKGD 3UKUB 3MK6A 1NGDA 4BRHA 1WOQA 3D2FA 3CJ7A 2HF4A 5AQVA 3FZKA 4O8KA 3LM2A 1ESVA 4EHUA 3DXMA 4XH5A 3VEZA 5LY3A 2CGLA 2P9UB 1NBWA 2P9SB 3CIPA 4MLHA 3A5OC 3IMXA 1YAGA 2E2PA 1NMDA 1IJJA 2AA4A 3LDPA 3A5LC 4CZLA 3LDOA 4A2AA 4BC3A 5BPLA 1NGBA 1IG8A 1SAZA 3EN9A 2P9PA 3HZ6A 1GLEG 1GLDG 3QDKA 3IFRA 3VESA 3ULEB 3KHYA 3ZETB 4CJ7A 5BN8A 4QS8A 3O6WA 3WXKA 2BTFA 1HLUA 3QB0A 5ADXH 5AQXA 1NGAA 3AARA 4CBWA 3ZX3A 2GWJA 2VWBA 4JD2A 2OANA 3VPZA 3L0QA 5KPTA 2QW9A 3L4IA 3LM9A 4FWQA 5BPMA 3CJBA 4B1WB 5F2RA 3R9PA 1GLFO 1JCEA 4FWKA 3JS6A 4WQ4C 5E26A 5TKYA 4BRLA 3DJCA 4FWLA 4K43A 3ZX2A 3QICA 4J8FA 1RDWX 4RCHA 1GLBG 4F9OA 4H0YB 4FWSA 3VF6A 4BR5A 3H6EA 3CJAA 3VGLA 3IUCA 4PL7A 4DCHA 3C7NA 4K41A 3A5MC 2IIRA 3WQTA 3O4WA 4FSVA 3VEWA 1U2VA 2P9IB 4BC2A 4BGAA 3ZX0A 4CI6A 4M7YA 5AQYA 5AQOA 3ENOA 2KHOA 1D4XA 4CZJA 3H45C 5BRDA 3O5BA 3AY9A 5AQUA 1ZBSA 2QWMA 4CZHA 1C0GA 1GLAG 3H1VX 4B1VA 1NGIA 1LOTB 3A5NC 3DWLA 3MDQA 1K8KA 4BRFA 2FF6A 4RTFD 3O1BA 5AZJB 3WEEB 5AFUH 1BDGA 4DB3A 5AQSA 4QS7A 1T6DA 2FSJA 5AQZA 4BGBA 4BRGA 3EO3A 2Q97A 4BREA 4FL9A 2P9NB 3P4IA 4JHDA 4EFHA 3MCPA 5JLFA 4H0OA 1BO5O 2E2OA 4Z94A 5JLHA 3VF2A 3FE1A 1ATNA 1MDUB 1E4GT 3GE1A 2HMPA 4BQLA 3HSCA 5BRFA 4IWVA 3UKRB 5EOYA 4BRIA 3TPQA 2P9KB 3O08A 5AQRA 1CZAN 4DHYA 3VEVA 1QQOA 3RSEA 4CZIA 4I6MB 1S22A 2GTDA 5AQQA 4IO8A 1SQKA 5AQIA 2A6AA 3ATUA 3FZLA 3C0BA 2Q1NA 5AQGA 3VEXA 4AM7A 1RGIA 1BA1A 1ZXOA 3CHWA 4WYBA 3VGKA 1GLCG 1KXPA 1Q18A 2PBDA 3QBWA 4YDUA 3D2EB 3A0IX 3UKUA 3MMVA 1V4TA 4BRKA 2QWLA 3SLCA 3BUZB 3DXMB 2VCPA 4H0VB 1QHAA 5AQNA 4H03B 1NGHA 1X3NA 4CD1A 5ADXA 4KBOA 1DEJA 4XEIA 3BEXA 2Q0UA 4CD3A 2P9SA 2H3GX 4CZKA 1GLLO 2V7YA 1XC3A 5JMVA 2IVOA 1NM1A 1S3XA 1JCGA 5FPDA 4MO5A 4M63C 3ID8A 2P9PB 2V51B 2IVPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RT3A 2FC0A 3V1RA 3GDQA 3L2WA 1ZYWA 3C65A 3ZSOA 3ZT1A 2WFBA 3H46O 2IOCA 5H1SQ 1EWQA 4JNEA 3GBTA 3TTCA 4I7FA 4IKFA 4AH9A 5SWMA 3K5MA 4CGGA 4B3TK 3M8QA 1YTUA 3G6EN 1J5OA 3P39A 1WWNA 2SN3A 4O44A 5KTQA 1VSDA 3GL1A 1B3CA 4FVMA 4FWOA 1Y97A 1EP4A 3KWGA 2OTJN 3QEPA 3M8SA 2F9TA 4CJSA 4DSLA 1TV6A 2KSKA 5BR8K 4OPKA 4PKGA 4C8MA 1WSGA 2V52B 1VQMN 1CZ9A 5E84A 2DPNA 5CY4A 1VQLN 5AQTA 1Q81O 3FZMA 3L4QA 3TWHA 5LL6Z 3OBYA 1CHZA 1TYQA 4K8ZA 3IS9A 3DXKB 3O9QA 4DF4A 2B4JA 1FK9A 4H0PA 3TAEA 2YHWA 1MA9B 1TUUA 1CN2A 4FWRA 2E2QA 4KFBA 1EETA 2E88A 4M42A 1TI5A 3O9RA 4NLCA 1PE4A 1FJGK 5KGXA 1WSFA 2HNDA 1TK5A 1E4FT 4AQYK 3U8XA 5SZTA 4FLYA 2UXCK 2HHTA 3MWPA 2E1ZA 1K8KB 3ZT4A 2HHQA 3THXA 5GAHP 2O8CB 1TVRA 4B9VA 1QSYA 3F2KA 1LWEA 3HPGA 4O55A 4FZXC 4B08A 2OA8A 3K59A 5KRSA 3CFRA 1YUWA 1Z05A 5M1QA 2HNZA 4NCBA 2P9NA 3NF8A 3L8BA 3SUNA 1BQMA 4LFCK 4JI7K 1KVBA 3SPZA 1WBDA 3OYDA 2KKZA 3OYFA 1IV0A 4DTSA 4GNIA 2CH5A 2HBMA 4XJXA 3BDPA 3EZ5A 4FW2A 5AZIA 3OTOK 2ETJA 4HUFA 1RDBA 4CFDA 4A62A 5AQWA 1Q8IA 4GV9A 2YHBA 2O8DB 1HUXA 3D2FB 5CR4A 1B9DA 3OYEA 1NLVA 3EYZA 4PUOA 3TAGA 4H5TA 1MU2A 4JKGA 4DUZK 3K5LA 3G25A 4CJVA 4AHCA 3P31A 3KJVA 1L5UA 4IOAL 3SF4D 3VQPA 3N4PA 1JL2A 3OYKA 4CE9A 3DAWA 4KTQA 3PX4A 3AVIA 2D5RA 2N2QA 1KVAA 4FJ7A 2D4WA 4FM1A 1KLMA 3KP1A 3HL8A 3VTHA 3LDLA 1ZYQA 1LW0A 4IJNA 5FRNA 3NDKA 3LPTA 5HLFA 3AVFA 2YX6A 4B3OA 3KTQA 2QKKA 4FJ9A 1I2VA 3RRHA 2E0HA 4CHOA 1F21A 1VSEA 4BG9A 5BREA 3TAQA 3TSQA 4KHSA 3KOZA 2KBKA 1ZBLA 4WFNL 2G8VA 4K0KK 2LT8A 3GOIA 3M6GA 3VQ4A 4YOWA 3BP8A 4E0DA 3D6RA 2BE2A 1VSJA 1WUAA 2IS3A 2NUBA 4CJWA 4M3WA 1WSIA 4WCEL 3SQ0A 3LDQA 1BIUA 3ZSQA 3KLFA 2FBTA 1JLQA 1JL1A 1QQNA 3CD6N 2LN8A 4FYDA 4WQ5C 3ZT3A 3L3VA 1HYZA 2NRRA 3ITHA 4N5SA 2KJAA 2A42A 4DR5K 4JI3K 5M1NA 4CFAA 5BR9A 2PYLA 1DLOA 5CYMA 3CI5A 1HPMA 3EZWA 4B9UA 2E5LK 1E3MA 4WE1A 4NXMK 4DR4K 2FBVA 1WT7A 4IEEA 5JS1A 3CCMN 3R3LA 4Y1CA 3CJ1A 4BR9A 2YV0X 3VQAA 3ZYYX 2A3ZA 3FGUA 2GELA 4JHDB 2X6NA 2ZE2A 4OPHA 2B6AA 3J7YP 3KKSA 1A5WA 4YOXA 1B92A 2R7YA 5AJ3K 3J7ZO 4DQQA 4FLVA 4FWMA 4BQZA 4W5OA 5C2DA 4PA1A 4X66K 2D0OA 3HJFA 3CYMA 4CEOA 1C0UA 2K35A 1HX1A 1VHXA 4W5RA 3VERA 3AAQA 3VQQA 1VSIA 3LZJA 4PHTX 1B9FA 1JJ2M 4LSLA 4CESA 3SJHA 4WQ5A 2UXDK 4PKHA 5B8HA 1T05A 3DOLA 1KFDA 3OYCA 2YKNA 1C1BA 3S9HA 3ZSVA 1OZZA 3T1YK 1HNIA 4B8AB 3PUFA 4YOTA 4O8KA 4DQSA 4XH5A 4KI4A 3VEZA 1NJXA 1NBWA 4AHRA 1IKXA 1ASVA 3K5OA 4LF7K 4MLHA 2LY6A 2NY9X 1XWLA 2X78A 3A5OC 5J2MA 5IT9O 1YAGA 4R79A 1NMDA 1VNBA 3K5NA 3DLRA 3OYAA 4FJ5A 2LSNA 3LDOA 2NRVA 1NGBA 4KO0A 3VGKA 2P9PA 3IFRA 3V4IA 4DR6K 3N4QA 4LH5A 4CJ7A 3SPYA 4BE2A 4IFVA 1HLUA 1HNVA 4OO1J 4CJ4A 4CEEA 1DTQA 2VWBA 4JD2A 5KPTA 5BPMA 4B1WB 1PTXA 2RF2A 2C1GA 2YHAA 4QAGA 1GLFO 2F7TA 4KB0A 3TANA 3HP9A 2NRWA 1O13A 3CCLN 3ZX2A 4N41A 4DV6K 4NCGA 3HXMA 4N47A 4FJIA 4DV4K 4MFBA 5JVHL 2NRTA 4E7KA 4F9OA 4RW7A 3E01A 4B3SK 4DTUA 2VG7A 4ELVA 1KRPA 2KFZA 4DV0K 3VGLA 4FM2A 4OKJA 1Q9XA 4FSVA 4FXDA 2WC9A 5HP1A 4H8KA 3SZ2A 3HK2A 3O9TA 3ENOA 3I0SA 5C2FA 3NH1A 1D4XA 1XRSB 2XO7A 4DTPA 4FLWA 3O5BA 3AY9A 2W6LA 1JLEA 3KC6A 2OPQA 1BCOA 3MXMA 1NJIO 4E1MA 4UAEF 4KRFA 3VA3A 3A5NC 3DLBA 2O8FA 2EX3A 1N34K 1HRHA 1JLAA 1OVYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RT3 A;  2FC0 A;  3V1R A;  3GDQ A;  3L2W A;  1ZYW A;  3C65 A;  3ZSO A;  3ZT1 A;  2WFB A;  3H46 O;  2IOC A;  5H1S Q;  1EWQ A;  4JNE A;  3GBT A;  3TTC A;  4I7F A;  4IKF A;  4AH9 A;  5SWM A;  3K5M A;  4CGG A;  4B3T K;  3M8Q A;  1YTU A;  3G6E N;  1J5O A;  3P39 A;  1WWN A;  2SN3 A;  4O44 A;  5KTQ A;  1VSD A;  3GL1 A;  1B3C A;  4FVM A;  4FWO A;  1Y97 A;  1EP4 A;  3KWG A;  2OTJ N;  3QEP A;  3M8S A;  2F9T A;  4CJS A;  4DSL A;  1TV6 A;  2KSK A;  5BR8 K;  4OPK A;  4PKG A;  4C8M A;  1WSG A;  2V52 B;  1VQM N;  1CZ9 A;  5E84 A;  2DPN A;  5CY4 A;  1VQL N;  5AQT A;  1Q81 O;  3FZM A;  3L4Q A;  3TWH A;  5LL6 Z;  3OBY A;  1CHZ A;  1TYQ A;  4K8Z A;  3IS9 A;  3DXK B;  3O9Q A;  4DF4 A;  2B4J A;  1FK9 A;  4H0P A;  3TAE A;  2YHW A;  1MA9 B;  1TUU A;  1CN2 A;  4FWR A;  2E2Q A;  4KFB A;  1EET A;  2E88 A;  4M42 A;  1TI5 A;  3O9R A;  4NLC A;  1PE4 A;  1FJG K;  5KGX A;  1WSF A;  2HND A;  1TK5 A;  1E4F T;  4AQY K;  3U8X A;  5SZT A;  4FLY A;  2UXC K;  2HHT A;  3MWP A;  2E1Z A;  1K8K B;  3ZT4 A;  2HHQ A;  3THX A;  5GAH P; 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