2E8AA

Crystal structure of the human hsp70 atpase domain in complex with amp-pnp
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
b'KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Direct inter-subdomain interactions switch between the closed and open forms of the Hsp70 nucleotide-binding domain in the nucleotide-free state.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 1A
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 127
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2e8aA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e8aA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e8aA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2e8aA04
4QS8A 3D2EA 1ESVA 2E1ZA 5AQXA 4CJ7A 4PL8A 4Z94A 4WQ5A 3QDKA 3AY9A 4CZLA 3CJBA 2YJEA 4K43A 5FPDA 2IIRA 3EKUA 3I8BA 1GLEG 1NGHA 3UB5A 1MWKA 4BR7A 4CZGA 1NGCA 5JICA 3GL1A 3H1QA 4BC5A 1QQOA 1E4GT 4B1UB 4J8FA 4H5WA 4WQ4A 2HOEA 3BUZB 1LCUA 5AQOA 3VEOA 3IUCA 3L0QA 1D4XA 4B9QA 2HF3A 3LL3A 4BREA 5KPRA 4BR9A 1GLFO 3VEVA 3AAQA 4BROA 1T6DA 1NGAA 2Q2RA 4IJNA 3VGKA 2IVPA 1QHAA 3C7NB 2Q0RA 1Y64A 3A5NC 4B1VA 4IO8A 1DKGD 2Q31A 4ISEA 2PAVA 3W3DA 4RWTA 2V7YA 3UE5A 3LDLA 4H0OA 2ZGYA 3JXUA 1GLDG 2YHYA 1X9JA 2P9SA 2PBDA 3A5MC 4BVPA 3FZMA 1IG8A 3O80A 4RTFD 3UKRB 2E2OA 3BF3A 1G99A 2F9WA 2I7NA 1QQMA 5BRFA 3EO3A 1SZ2A 2YHXA 3HZ6A 3M1FA 2GEMA 3DWLA 1HUXA 2QWRA 2QWLA 2NZTA 2FLOA 3LDNA 1NLVA 4H0TB 1HKCA 1NMDA 2V52B 3DJCA 4YDUC 3VEZA 3ZX0A 3DXMA 3EL2A 4CZMA 2Q97A 1HJOA 2WUSA 2A6AA 4FL9A 3ULEB 5AQWA 3HM8A 4CBUA 4PL7A 4WYBA 2YI1A 4AM6A 2YJFA 3BP8A 5AQUA 3EZWA 3L6QA 1OKJA 2P9UB 2EWSA 2E20A 4BR4A 2ASOA 2F9TA 1X3MA 1YAGA 3LDQA 5BPMA 3CJ1A 3UKUB 3BF1A 5AQGA 4ISGA 3CQXA 3QB0A 4E1JA 2QW9A 3GE1A 2I7PA 3HBTA 3MN9A 4IXCA 3ZETA 4BRHA 5BRDA 1NGEA 3A8YA 3QFUA 3GOIA 3MN6A 3F9MA 4JD2B 3HSCA 3WXIA 5AQFA 4H0YB 2A42A 4EIAA 5KPTA 3U4LA 2A5XA 4FSVA 4XH5A 3MN5A 5AQQA 3VEXA 3O4WA 3VENA 3TU5A 1BG3A 4CZJA 4BRKA 4B1WB 4BRAA 2V7ZA 4BGAA 3RSEB 1E4FT 3MK6A 4H5RA 3A0IX 3AARA 5AQMA 1QZ5A 4BRPA 4O5FA 5AQNA 4BR0A 3CJ9A 4FPBA 3FZFA 5B8HA 4AM7A 4A2AA 5FPMA 4IZ9A 5BPLA 4CZHA 2E2NA 1U2VA 3DXKB 1K8KB 2D1KA 1Z05A 4QS9A 2BUPA 4PKIA 4FWQA 1HLUA 3FGUA 1DGKN 1JCFA 3O1WA 4XH1A 4CD1A 4EHTA 2QM1A 3R9PA 2P9NB 5JMVA 3GG4A 1RDWX 3OHRA 3C7NA 2HF4A 1C0FA 3FZHA 1YVNA 1TUUA 3FFKB 1ATRA 4BC2A 4XH4A 2P9KB 4M7YA 3W0LA 4JHDA 5AQVA 5TKYA 1T6CA 5E84A 1XC3A 3I33A 3VERA 3UKRA 3VGMA 5JLHA 1ATNA 2ZF5O 3GBTA 3U9DA 3D7EO 4YDUA 2P9LB 1NGBA 1QQNA 2A41A 3IDHA 2Q0UA 1MDUB 2QWOA 5ELZA 4BG8A 3D2EB 3FZKA 1JCEA 2E1YA 3U9ZA 4CI6A 4JNEA 3S41A 3ULEA 3CJAA 2FF6A 3LDPA 5BRHA 2ZWHA 2AA4A 2HMPA 2CH6A 2QWQA 3CQYA 4CD3A 2FSNA 3WXKA 4BRCA 5ADXH 5LJVA 1Z6RA 3H6EA 3D2FB 4MLEA 3VOVA 4BR2A 4BG9A 2P9UA 2FSKA 2P9PA 3KZBA 1NGFA 3SK3A 5EX5A 2D0OA 1KXPA 4JAXA 1P8ZA 4FWRA 1V4SA 1SQKA 3MCPA 1HX1A 3WEEB 2E2QA 3M6GA 1KAYA 3FE1A 3CERA 3ATUA 3GDQA 4JD2A 2IVOA 4K25A 1QZ6A 2W40A 1HKGA 3WXJA 3WUHA 5EOYA 4B1XB 4H5VA 2V51B 5EY4A 2KHOA 1Q18A 1RGIA 2E2PA 4K41A 1CZAN 1U6ZA 2E88A 5BPNA 1LOTB 3HTVA 3O5BA 4QS7A 3LDOA 3H3OB 2UYTA 4H0PA 2Q1NA 3RSEA 4FOIA 3C0BA 4H03B 2DPNA 4A61A 4NO7A 4DB3A 2FXUA 5F1XA 2NRHA 3IMXA 5FPNA 1TYQB 3WXLA 4A62A 2FSJA 3FR0A 1XQSC 2QXLA 1ZXOA 5AQRA 4EHUA 2GUPA 3DAWA 3MDQA 3DXKA 3VF2A 2ASMA 3ZX2A 4ISFA 4M7XA 5AQLA 1NBWA 4MO4A 2GWKA 2VYPA 5AR0A 2GWJA 4FOEA 3WT0A 2P9NA 5KQ8A 4M63C 3O1BA 2AP1A 3ZEUB 4KBOA 3VF6A 5F0XA 4DCHA 5LY3A 2P9KA 3VETA 1C0GA 5AZIB 4LC9B 1KAXA 4BQZA 1YUWA 4BRMA 3EN9A 3QICA 4A2BA 2Q36A 2ITMA 5I9EB 4CZKA 3VPZA 1BU6O 3VEYA 4PKGA 3MN7A 1BUPA 4BC4A 4FWLA 3CIPA 1BOTO 3ENOA 3JS6A 4C23A 4H5NA 4EFHA 3ZETB 2P9LA 4FO0A 2P9IB 4I6MB 4BR5A 3HI0A 5AQKA 3KVGA 4BQLA 2J4RA 5CE3A 3ENHA 4BVOA 3MMVA 2QWMA 4CZFA 2A40A 4MO5A 4H0XB 3U8XA 4NB4A 3O6WA 5AFUA 4DHYA 5AQSA 4DQ8A 2D0PA 3R8EA 2CGJA 4JN4A 3EKSA 2E8AA 3VGLA 4FWOA 3R6MA 4RCHA 3D2FA 3WQTA 4BRLA 3P4IA 4H0VB 1HKBA 4BRQA 5EVZA 1TUYA 5BREA 1SAZA 3CI5A 5AZJB 1NGIA 2QWPA 3SJHA 4CBXA 4BGBA 4CZIA 4GY2B 5BR9A 4B1YB 5KPZA 5AQIA 5AQPA 5E26A 3WEEA 3M3ZA 2H3GX 1DEJA 1U2VB 4EAHD 4BC3A 2ASPA 4FWKA 1WOQA 4WQ5C 2CGKA 5EXWA 3H3NO 1V4TA 3J8AA 1T44A 4FWSA 1NWKA 1H1VA 3FLCO 4BRIA 2CGLA 1HPMA 4L3QA 4XEIA 3H1VX 3IFRA 4JHDB 3UKUA 1NGJA 2CH5A 3ZX3A 2W41A 4WQ4C 3H46O 3B8AX 3O08A 4BRGA 5F2RA 2A3ZA 5AQHA 4H5TA 1TYQA 1GLBG 3TPQA 3VF4A 4B1ZA 3G25A 2D4WA 5KQDA 1ZC6A 3ID8A 5ADXA 4O8KA 1WUAA 1MWMA 1BA1A 3QFPA 5AQYA 1ATSA 4K42A 2BTFA 2YCHA 3ZEUA 3LM9A 1GLCG 2P9SB 1R59O 3H45C 1YXQA 3A5LC 3ATVA 1MA9B 4CZEA 1BDGA 4GNIA 5AZIA 2QWNA 4IJAA 4FWNA 2VWBA 3SMPA 3QMLA 3AAPA 1GLAG 1XUPO 4MLHA 3SLCA 3O8MA 3A5OC 5LJWA 3QBXA 2P9PB 3VESA 1K8KA 2FF3B 2VCPA 3CJCA 5BN9A 1J6ZA 5AQJA 1BA0A 1EQYA 4HTLA 3WQUA 1S22A 5BN8A 1RFQA 3DXMB 1GLJO 4PKHA 4Y0WA 1NM1A 3CHWA 3KHYA 2P9IA 4I6MA 4HWIA 3LM2A 4FWPA 1ZBSA 3CJ7A 4CBWA 5AQZA 1NGGA 1S3XA 1BO5O 1KAZA 1NGDA 3L4IA 2GTDA 1BWFO 1JCGA 2GELA 2NLXA 4BRNA 4BRFA 5FPEA 3CETA 2OANA 4F9OA 4FPAA 5JLFA 2IVNA 2ZGZA 5AQTA 1X3NA 4IWVA 3VEWA 4BRDA 3QBWA 3FZLA 4FWMA 3SMSA 1GLLO 3BEXA 5AZJA 1IJJA 2YHWA 5AFUH
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OTOK 1RTIA 3OYCA 3PSMA 5AQXA 3L2UA 2B5JA 2LI7A 4WQ5A 4DV5K 2OZSA 4CZLA 1D9FA 1EX4A 4Q5VA 3T19A 4UY8O 2IIRA 1OMYA 1UA0A 3TAGA 1LQHA 1MWKA 4BR7A 1SKSA 4X62K 3B6OA 1BK8A 3DLBA 3GL1A 3NHGA 1QQOA 1E4GT 5KRTA 5HROA 3BUZB 2EX3A 4DSKA 1LCUA 2KSKA 3VEOA 4Y1CA 2E4LA 4N76A 4CGIA 4XIUA 2KQ2A 5H1SQ 3LP3A 4BR9A 4HTUA 1T6DA 3BZKA 1RBTA 2Q2RA 2VG5A 3DLRA 5C0YA 4IJNA 1ASUA 3VGKA 2WFBA 1U49A 1DKGD 3KP0A 4ISEA 1KRPA 4CJEA 3UE5A 4DS4A 5TKWA 1BL3A 1TKXA 1LAVA 4IFVA 1QS4A 2ZGYA 1GLDG 3KD1E 2YHYA 2P9SA 2KW4A 3A5MC 3FZMA 3AVCA 3AA3A 3ZSXA 2KZMA 4RTFD 3M8SA 1QQMA 3HZ6A 4GVEA 3M1FA 4ILGB 3ISNC 3DWLA 4CJTA 3V9SA 2NZTA 2FLOA 4DR3K 3L2WA 3LDNA 1NLVA 1XNRK 1XI1A 4YDUC 3ZX0A 3DXMA 3J7AP 4CZMA 4JI3K 2A6AA 4J2AA 3ULEB 4CEZA 5AQWA 3KOYA 4WYBA 4PWDA 3MX5A 1KVBA 3K5NA 4KHYA 4J2DA 3OA9A 1VQ8N 2N66A 3L8BA 2EWSA 2E20A 1RT6A 2X6SA 4C8MA 3LAKA 3CJ1A 2OYQA 3BF1A 5AQGA 1KD1O 2KZZA 3ZETA 5M1PA 5BRDA 2B4JA 3A8YA 5T7BA 1VQ4N 1JZBA 1ZUTA 1VSMA 4JI0K 3MN6A 5KI6A 2UUCK 4L8RB 4JD2B 1R0AA 2HHIA 5KPTA 3KD5E 2A5XA 1NOYA 2HNZA 3AVAA 1N32K 3MN5A 3O4WA 4DU1A 4CZJA 4BRKA 3M8RA 2QI2A 4YOYA 4BRAA 4JKGA 4CJLA 1E4FT 3AV9A 5CR4A 2E6LA 4CFCA 5HOOA 1HNVA 2G8UA 2JLEA 5CY4A 3HP9A 4PUOA 4AM7A 4X66K 4A2AA 4IZ9A 4CZHA 2E2NA 4IFEA 3OYNA 4DR7K 2D1KA 2FBYA 3SBTA 1HLUA 3FGUA 1DGKN 1JCFA 2UXBK 4NXMK 3O1WA 2QM1A 3R9PA 3L2QA 3NH0A 3G10A 1K8AO 4ELUA 2HF4A 1S1UA 1SL1A 3FZHA 5JENA 4LH4A 3HVRA 2P9KB 5MLCQ 4JHDA 3QNNA 3VN5A 4CGFA 4IOCL 1D9DA 4YOVA 2ZJRL 1VSHA 4Z4EA 3MEDA 2HBLA 1XC3A 5CY0A 1C1BA 1REVA 3O3GA 3HOTA 3VGMA 4DR2K 5JLHA 1NK4A 5I3UA 3O9TA 1VQPN 1QQNA 2A41A 1ZYVA 2IS3A 1ASWA 2QWOA 4KH6A 4PHTX 2M8BB 4C8NA 2YILA 3S41A 2A1SA 3T7ZA 3TTDA 1FKOA 1KQSM 4YHHK 3AA2A 2HMPA 2CH6A 3C6TA 1WSJA 3AVKA 4EP4A 3KLHA 3IS9A 3S3NA 3H6EA 2PYLA 2ATBA 3VOVA 4X64K 4FJGA 2XY5A 1K6YA 2P9UA 1YHQN 3PSFA 3T69A 4DV6K 1S6PA 4HHTA 5C12A 1VQ5N 3O4QA 2NRRA 3L2VA 3M6GA 3AVBA 1JKZA 4CF0A 3G0ZA 1NK8A 4K25A 4CJ4A 3T1YK 3SUNA 2WONA 1HKGA 4O0IA 3WUHA 4B1XB 1NK7A 1NOZA 2Z1IA 3SPZA 3VQ9A 5EY4A 4DTPA 1DLOA 3OYGA 1RGIA 4K41A 5CHIA 4LD0A 4BY9C 4BDYA 1U04A 4B3TK 4H0PA 4DKWA 2MZ0A 3RSEA 3ZSZA 4OKJA 4H03B 1WSEA 4Z4CA 1G15A 4YNQA 1YTUA 2NRHA 2P51A 4M3XA 2FSJA 4FM1A 4LFBK 3JYTA 3AGRA 3DXKA 3CMEN 3VMFB 1NBWA 4MO4A 5C42A 2GWKA 3OVNA 1VSKA 3O4NA 1J5EK 4FOEA 3OYBA 4CHOA 4C1NK 3O1BA 1WAFA 5HRSA 4CK1A 5F0XA 3CD6N 3DOLA 4KHSA 5HRNA 4IOAL 1YJ9N 3DLEA 4A2BA 3NVKA 2I5JA 4FJNA 1BUPA 3CM5A 1T03A 2QXFA 3CIPA 5LL6Z 2XRIA 1EP4A 1ZYQA 3JS6A 4B08A 2P5OA 2NY8X 3BZCA 3OBWA 4H5NA 2HHHK 4KPYA 3ZETB 1UWBA 2P9IB 2HNDA 3CFRA 4XJXA 2WTUA 5AQKA 3KVGA 2PFUA 3CM6A 4BQLA 4W5TA 3QEWA 4Y1DA 5CE3A 3CF5L 4CJFA 3K58A 3U8XA 2DFHA 4DQPA 3KKRA 3O9QA 2W6LA 4KYPA 2D0PA 2RKIA 3CW4A 3EKSA 2E8AA 4MFBA 1X9WA 3R6MA 4RCHA 3WQTA 4DTRA 3V4IA 3U6FA 1TUYA 1SAZA 2RHKA 3CI5A 5AZJB 1NGIA 2C1IA 4N47A 4BE0A 2G2KA 3S3OA 4A59A 1VQKN 3WNHA 1HYZA 1XMOK 2O8EB 2BANA 2GV9A 2QKBA 3R2VA 1LW0A 4JKCA 2ASPA 4EP5A 5JVGL 1WOQA 3O9SA 4WQ5C 4FJJA 5EXWA 3J8AA 1WNSA 2YIOA 1NWKA 3CXCM 3FLCO 4BRIA 4LFAK 2KBJA 1U4BA 4JHDB 3UKUA 4PA1A 3VQAA 4RW7A 1TKDA 2CH5A 4M41A 3CCVN 1E3MA 1CXQA 3PUFA 2W41A 4M3UA 4BRGA 1HNXK 1J9AA 3AO2A 3TR8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3OTO K;  1RTI A;  3OYC A;  3PSM A;  5AQX A;  3L2U A;  2B5J A;  2LI7 A;  4WQ5 A;  4DV5 K;  2OZS A;  4CZL A;  1D9F A;  1EX4 A;  4Q5V A;  3T19 A;  4UY8 O;  2IIR A;  1OMY A;  1UA0 A;  3TAG A;  1LQH A;  1MWK A;  4BR7 A;  1SKS A;  4X62 K;  3B6O A;  1BK8 A;  3DLB A;  3GL1 A;  3NHG A;  1QQO A;  1E4G T;  5KRT A;  5HRO A;  3BUZ B;  2EX3 A;  4DSK A;  1LCU A;  2KSK A;  3VEO A;  4Y1C A;  2E4L A;  4N76 A;  4CGI A;  4XIU A;  2KQ2 A;  5H1S Q;  3LP3 A;  4BR9 A;  4HTU A;  1T6D A;  3BZK A;  1RBT A;  2Q2R A;  2VG5 A;  3DLR A;  5C0Y A;  4IJN A;  1ASU A;  3VGK A;  2WFB A;  1U49 A;  1DKG D;  3KP0 A;  4ISE A;  1KRP A;  4CJE A;  3UE5 A;  4DS4 A;  5TKW A;  1BL3 A;  1TKX A;  1LAV A;  4IFV A;  1QS4 A;  2ZGY A;  1GLD G;  3KD1 E;  2YHY A;  2P9S A;  2KW4 A;  3A5M C;  3FZM A;  3AVC A;  3AA3 A;  3ZSX A;  2KZM A;  4RTF D;  3M8S A;  1QQM A;  3HZ6 A;  4GVE A;  3M1F A;  4ILG B;  3ISN C;  3DWL A;  4CJT A;  3V9S A;  2NZT A;  2FLO A;  4DR3 K;  3L2W A;  3LDN A;  1NLV A;  1XNR K;  1XI1 A;  4YDU C;  3ZX0 A;  3DXM A;  3J7A P;  4CZM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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