2E8AA

Crystal structure of the human hsp70 atpase domain in complex with amp-pnp
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70kDa protein 1A
publication title Direct inter-subdomain interactions switch between the closed and open forms of the Hsp70 nucleotide-binding domain in the nucleotide-free state.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 127
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2e8aA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e8aA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e8aA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2e8aA04
1HPMA 4CZMA 2AP1A 4H0OA 4DCHA 4K42A 2YHYA 1ATSA 2I7PA 4B9QA 5BPLA 3I8BA 1QHAA 2A42A 3M1FA 1YAGA 2OANA 2E20A 4BRKA 2P9IB 1T6CA 3DXKA 5AQOA 3MN9A 3ZX0A 3R8EA 5BN8A 2CH5A 3MMVA 1QQNA 5EOYA 2YJFA 3GOIA 3HTVA 3R9PA 5AZJA 3QB0A 5AQQA 5EX5A 1YXQA 2P9PA 1MA9B 2YCHA 2P9KA 1NWKA 1XQSC 2P9LA 4JD2A 1WOQA 3H6EA 1NM1A 4RTFD 1GLDG 2GUPA 2Q0UA 4BRIA 4BVPA 2F9TA 1KAXA 2PBDA 5EXWA 3U8XA 3FLCO 3FZMA 2GWKA 1NGFA 5ADXH 3MN7A 1J6ZA 3DAWA 3HZ6A 4B1ZA 3FZFA 3UKRB 3CERA 4K41A 3VF2A 3VEWA 2D0OA 3A0IX 1SQKA 3CI5A 3VGKA 2A40A 2FSJA 3ATUA 3S41A 5TKYA 3UE5A 1GLLO 1BUPA 5BPMA 4A62A 1RGIA 3VESA 3RSEB 4I6MB 3JXUA 3DJCA 1E4FT 3H45C 5CE3A 5KQDA 4HTLA 4BC3A 2ASPA 3UKUB 3SK3A 3A5OC 2P9IA 2GELA 4F9OA 4BC4A 4BQZA 2V52B 1ZXOA 1X3NA 1C0GA 3QDKA 3ZEUB 4BRCA 2A41A 1TYQB 5JLFA 2E8AA 2ASMA 3O08A 4WQ5A 3FR0A 3O4WA 3H3OB 1JCEA 1ESVA 3VPZA 4WYBA 5EY4A 1MWKA 4XH1A 3C0BA 1YVNA 4FSVA 3I33A 1P8ZA 1NGJA 5AQMA 4DHYA 1U6ZA 4FO0A 5AQFA 3C7NB 4FPBA 3LDOA 3EN9A 3TU5A 3VEYA 3HI0A 1U2VB 2E2PA 4QS9A 4Y0WA 2E88A 2E2QA 5BREA 4CJ7A 2FLOA 4JHDB 2A3ZA 3KHYA 1BO5O 5BRHA 4WQ4C 3SLCA 3WXLA 2W40A 1S3XA 2QWQA 1GLEG 3O1WA 4EAHD 3RSEA 4I6MA 4RCHA 4BRQA 5ADXA 2E1ZA 4BC5A 4QS7A 3UKUA 3LDPA 2ZGYA 1HKCA 4JN4A 3ZX3A 3B8AX 3BUZB 4EHUA 3M3ZA 1G99A 2V7ZA 3L0QA 3BF1A 1TYQA 3L6QA 4BC2A 1WUAA 1GLAG 2CGLA 3VOVA 4BR0A 1QZ6A 1KXPA 4CZHA 4YDUC 3CQYA 5AQIA 1BG3A 3WEEB 1ZBSA 4BRLA 5BRFA 2W41A 4EHTA 1DKGD 3CJ1A 1NGAA 4CD3A 5LJVA 4CBXA 1MDUB 4MO4A 3SJHA 2YJEA 4K43A 2FSKA 4K25A 4MLHA 3DXMB 4J8FA 4FOEA 1U2VA 1MWMA 4BVOA 5AZIB 5AQJA 3F9MA 1ATNA 1OKJA 5KPZA 2E1YA 1C0FA 4JHDA 4PL7A 1EQYA 1TUYA 1JCGA 2YI1A 1D4XA 4B1UB 3HSCA 5F1XA 3CJ9A 4M63C 3G25A 2QWOA 4BRGA 5AQYA 1HX1A 3IMXA 1HKBA 2QWNA 4L3QA 4C23A 4FWKA 1NLVA 4FWOA 2Q97A 1GLBG 4BROA 4O5FA 4BR7A 5F2RA 4FWRA 1V4SA 3WT0A 4BR2A 4CBWA 3O1BA 2BTFA 4NO7A 1IG8A 2NLXA 1TUUA 3VEXA 4FWQA 1YUWA 3FE1A 2VWBA 4PKIA 3EZWA 1NGCA 2P9NB 2GWJA 3BP8A 3UB5A 5FPMA 4HWIA 2WUSA 4MLEA 3CJ7A 3CIPA 4CZGA 2Q36A 4E1JA 3BF3A 3EL2A 3GE1A 4XEIA 1KAZA 2QXLA 2V51B 3OHRA 4JNEA 1BA1A 4A2BA 5LJWA 4FWNA 3AAQA 4WQ4A 2PAVA 3ULEB 5AQKA 3IFRA 3WEEA 4BRPA 1GLJO 2D1KA 1T6DA 4H5RA 5AR0A 4B1YB 3CHWA 4IXCA 4BR4A 1T44A 3HM8A 5B8HA 3CJCA 1V4TA 3QBWA 4B1XB 2Q0RA 2ZF5O 4MO5A 4A2AA 2FF6A 4M7XA 3ZX2A 4PL8A 4RWTA 1HKGA 1HUXA 3MK6A 4H5VA 3EKSA 3LL3A 1QZ5A 5BR9A 4CZFA 2P9SB 4H03B 3WQTA 4QS8A 3ENOA 3GG4A 3GL1A 1NGBA 3CQXA 3H46O 2UYTA 5AQPA 3EO3A 3QBXA 3A5MC 3L4IA 2E2NA 3FFKB 2I7NA 3U4LA 4YDUA 1IJJA 1CZAN 3W3DA 2QWMA 2GEMA 2FF3B 2EWSA 4H5WA 5KPTA 3WXKA 3UKRA 4DQ8A 4ISGA 4BGAA 3AY9A 1JCFA 4XH4A 1K8KB 1DEJA 3FZHA 4AM6A 2V7YA 1BDGA 4Z94A 3O80A 3A5NC 5AFUA 4CZIA 3QMLA 4BQLA 1RFQA 3CETA 5AQNA 1NGIA 2HMPA 3ULEA 4XH5A 3VENA 3HBTA 3CJAA 4H0VB 4LC9B 3AAPA 4CBUA 4IJNA 5E26A 3ZEUA 3P4IA 5AQZA 4PKGA 1RDWX 3QICA 3SMSA 3KZBA 5FPDA 2YHXA 4ISFA 4FWPA 2QM1A 3LDLA 3IUCA 3TPQA 3VEZA 1BWFO 2CGKA 4WQ5C 3ATVA 4FPAA 5BPNA 4EIAA 3QFPA 3C7NA 2F9WA 3GBTA 1QQOA 4H0XB 3VEOA 4O8KA 1QQMA 3VEVA 1GLFO 3D2FB 4IJAA 2J4RA 1NMDA 4CZLA 4IWVA 3O8MA 3VGMA 1NGHA 5I9EB 4H0YB 4H0TB 5AQXA 4BG9A 1H1VA 3D2EB 2DPNA 4BRHA 1K8KA 2YHWA 2D0PA 1Y64A 4GNIA 2A6AA 2HF3A 3LDQA 2HF4A 2IIRA 5AFUH 1X3MA 3IDHA 1SAZA 2FSNA 2BUPA 3D7EO 1Q18A 2P9UB 2QWLA 3ZETB 3WQUA 5F0XA 5LY3A 1SZ2A 3FGUA 1LOTB 2ITMA 5FPEA 3ENHA 4A61A 2GTDA 2NRHA 4BRDA 5AQGA 4B1WB 4NB4A 4H5TA 3J8AA 4FWMA 2VYPA 3BEXA 5KPRA 3O5BA 2CGJA 5AQUA 5BN9A 1ZC6A 4ISEA 1BOTO 3H1VX 5FPNA 1Z05A 3M6GA 3SMPA 2ZGZA 3FZKA 4FOIA 1XC3A 4H5NA 2IVOA 4BRNA 1BA0A 2VCPA 5AQSA 1XUPO 3H3NO 5EVZA 1ATRA 3O6WA 4CZEA 4DB3A 3DWLA 2NZTA 4M7YA 5AQWA 3DXMA 4B1VA 3FZLA 5JMVA 3JS6A 2IVNA 3U9ZA 3WXIA 5AZIA 4BREA 3CJBA 3D2FA 1LCUA 3ID8A 4FWSA 1NGDA 5JICA 3D2EA 4JAXA 5AQHA 3WUHA 3QFUA 2IVPA 5BRDA 2QWPA 1GLCG 4BRFA 4GY2B 4PKHA 3VF6A 4KBOA 2Q1NA 3MN5A 3LDNA 3VGLA 4CD1A 5AQVA 2D4WA 2P9UA 3ZETA 4AM7A 1X9JA 1NBWA 4FL9A 4CZKA 5AQTA 4IO8A 2AA4A 2QWRA 3DXKB 2P9NA 5JLHA 1S22A 3R6MA 3VF4A 3MDQA 2CH6A 2E2OA 4BRMA 1HJOA 5AZJB 1E4GT 2P9PB 4EFHA 3U9DA 2HOEA 2P9KB 3W0LA 2A5XA 2ZWHA 4FWLA 4H0PA 3EKUA 2P9LB 3MCPA 2KHOA 3LM2A 4JD2B 1KAYA 2Q2RA 2FXUA 3LM9A 3A8YA 1BU6O 3KVGA 1NGEA 3AARA 3VERA 2Q31A 3MN6A 5AQLA 2H3GX 1NGGA 4BGBA 5KQ8A 4BR9A 3H1QA 2P9SA 4BR5A 2ASOA 3VETA 1DGKN 4CI6A 1HLUA 4BRAA 4CZJA 5ELZA 3WXJA 5E84A 4IZ9A 1Z6RA 4BG8A 1R59O 5AQRA 3A5LC 3GDQA 2QW9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1J54A 2E6MA 1N32K 4Z0UA 4OKJA 3S5TA 2YHYA 3VA3A 4B9QA 4KHSA 2BE2A 3OW2M 3M1FA 1YAGA 3TTCA 2OTLN 5AQOA 1JL1A 3K9KA 3NH1A 5C42A 3OYGA 2YNGA 3MMVA 2RPIA 1T05A 3TSUA 1NK0A 4DTJA 1QQNA 4KI6A 1HNIA 3KLHA 1LW0A 3GOIA 4CJLA 5AZJA 3E7RL 4GV3A 2O8CB 2P9PA 1KFDA 3V6DA 4ELUA 4R79A 2C1GA 1RTIA 3ZSWA 1WMTA 4DSIA 1XQSC 4N76A 1DT9A 4CESA 3SV3A 1RBTA 1KVCA 4E3SA 1RBUA 1NK9A 1UOCA 1NM1A 4RTFD 1GLDG 4IDHA 4FJ5A 1HYZA 3NF8A 4BVPA 4DG1A 1WB9A 2HNZA 3U8XA 4DSFA 1RT4A 3NBPA 3SCXA 3MN7A 1J6ZA 1ZBLA 2YKNA 4CVNE 3UKRB 3NH2A 3OYFA 2NRTA 3A0IX 4KB0A 1O13A 2NY8X 2NRXA 1Q9YA 5HRSA 3S41A 4CF8A 1BQNA 4I6MB 1S9GA 1LAVA 1WWNA 1RT5A 3KOYA 1BCOA 4BC3A 3L8BA 2P9IA 2A1SA 2WBNA 2GELA 2V52B 4CJFA 1L5UA 1X3NA 2KBJA 1TYQB 5JLFA 3AVAA 3C6TA 1VSKA 4JS4A 4KAZA 3DM2A 4CFAA 4WQ5A 1J5EK 3THWB 5CY0A 3KP1A 3H3OB 4PUOA 2NNWA 3THYA 4JKGB 5EY4A 4XH1A 4JI2K 3QEPA 4FSVA 1T7PA 4FJHA 1XC9A 5CZ2A 2N69A 1SL1A 5M1NA 2P1JA 1ZUTA 3R1XA 4CJRA 4GVMA 1CXQA 4I9LA 3HI0A 3N4PA 1ZYWA 1SS6A 4DV3K 3DOLA 4N56A 4KTZA 1VQ5N 4LH5A 5E41A 1RBSA 5BRHA 4WQ4C 3SLCA 4BE1A 1S3XA 2QWQA 1WLJA 4B9SA 4CIGA 4C8MA 1JLBA 1DTTA 3RSEA 3ZSYA 2P5GA 4FLYA 4FXDA 4LFAK 4WFAL 4BRQA 5ADXA 2F4VK 2E1ZA 4QOZB 3HK2A 3BUZB 4DSJA 1G99A 4N5SA 2V7ZA 2QKBA 4OGEA 4GKKK 1ZVEA 1RDAA 3EY1A 2KSKA 4W5OA 4B9TA 3THXB 4DR6K 1B9FA 1JL2A 1JLFA 1U49A 4DLEA 1BG3A 3ZSXA 4CHQA 1S1WA 4BRLA 4DV6K 5BRFA 3IG1A 3L3UA 1DKGD 5LJVA 3ZT2A 1RBVA 3C95A 1BCMA 4K43A 2FSKA 4FOEA 3I0RA 5H1SQ 5AQJA 3IRXA 1XMQK 4FYDA 1Q7YO 3DLEA 4H4OA 4CK2A 1IV0A 4LSLA 1EQYA 4IFVA 4CERA 2YI1A 1JKHA 1DLOA 5F1XA 1TKXA 3J81O 3NAEA 1T8EA 2QWOA 1NKCA 4AH9A 3F5TA 4FWOA 2Q97A 1U45A 2PYLA 1T3VA 1V4SA 3HXMA 4DR1K 4MFBA 3O1BA 1D8YA 4BWJA 3QINA 4NO7A 3C6UA 4CF0A 2NLXA 2B6AA 3BZCA 4RW8A 2NUBA 1POIA 4FWQA 3SZ2A 3EZWA 1RBRA 1TGOA 2GWJA 3O3HA 3E7UX 3MXMA 3CIPA 4E1JA 2Q36A 3BF3A 3EL2A 3GE1A 3L2VA 4M41A 5LJWA 1BA1A 1IO2A 4FWNA 3ZSRA 4WQ4A 4AHTA 5AQKA 2NRWA 2YILA 1T6DA 4KH4A 5CYMA 1RCHA 4IXCA 1T44A 4AF1A 4DUYK 4MO5A 1Y97A 2FF6A 4R5PA 4M7XA 3ZX2A 3KK1A 4CJ3A 3KC6A 3I8DA 3E9PA 2HW3A 1QZ5A 5KI6A 4CZFA 3DLLL 2P9SB 4H03B 4QS8A 4BECA 3ZLJA 4DSKA 1L4VA 2UYTA 3TAFA 4U67L 2E3GA 3PX0A 5SWMA 3CCUN 3AVHA 4IBNA 3KLEA 3NCIA 3T69A 1IJJA 1CZAN 1RNHA 1Q9XA 2QWMA 3RVCA 2G2KA 5GIPA 1T7BA 2EWSA 3DI6A 4KH5A 5KPTA 4KYPA 4BGAA 3DLGA 1XMOK 1FK9A 4MDBA 5JS2A 1K8KB 2X6SA 4GKJK 4DFKA 3F73A 3VQ9A 3FFIA 4WFBL 4CZIA 1SNBA 1P90A 3AA5X 3PO5A 1RFQA 3SUOA 3CETA 3WNGA 3AVGA 3CCQN 3PUFA 1YI2N 3AAPA 3P39A 4PY5A 2O8EB 3HM9A 3SPYA 3P4IA 2KPYA 3CW4A 3HPHA 5AQZA 1VNAA 2ATBA 4CGJA 2E3FA 3KZBA 4CECA 1S1TA 4ID1A 4DF4A 4FZYA 4ISFA 3V1QA 4FZXC 4FWPA 2IGIA 5KK4A 3IUCA 1UAXA 2DFFA 3VEZA 2PZSA 3AO2A 4RW9A 4W5QA 4E7HA 4Z4HA 5BPNA 4CE9A 4EIAA 5HL7L 3C7NA 1T7AA 4BDPA 3CMEN 4DSEA 3KWIA 4H0XB 3P31A 4LY7A 3D2FB 1EX4A 4IJAA 1NMDA 2N2RA 1XWLA 4CZLA 4CF2A 3VGMA 4CHPA 1SV5A 5I9EB 4DQQA 4C1NI 4BG9A 3OYMA 2YHWA 2D0PA 5GAGP 2XY7A 3UIQA 3TANA 1NOZA 4WF9L 3E1YA 5HP1A 2HF4A 3C6HA 1RDBA 1X3MA 1HJRA 3IS9A 2FSNA 2KKZA 2XY8A 1QSSA 4AILC 5EU7A 3HPOA 3VQAA 2A1RA 4RW7A 2QWLA 3BZKA 1ITGA 1SZ2A 2ITMA 4X66K 4HHFA 3LWLA 2GTDA 3I56N 2NRHA 3ULDA 5DM6L 1B3CA 4H5TA 1RILA 4FWMA 4FVMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1J54 A;  2E6M A;  1N32 K;  4Z0U A;  4OKJ A;  3S5T A;  2YHY A;  3VA3 A;  4B9Q A;  4KHS A;  2BE2 A;  3OW2 M;  3M1F A;  1YAG A;  3TTC A;  2OTL N;  5AQO A;  1JL1 A;  3K9K A;  3NH1 A;  5C42 A;  3OYG A;  2YNG A;  3MMV A;  2RPI A;  1T05 A;  3TSU A;  1NK0 A;  4DTJ A;  1QQN A;  4KI6 A;  1HNI A;  3KLH A;  1LW0 A;  3GOI A;  4CJL A;  5AZJ A;  3E7R L;  4GV3 A;  2O8C B;  2P9P A;  1KFD A;  3V6D A;  4ELU A;  4R79 A;  2C1G A;  1RTI A;  3ZSW A;  1WMT A;  4DSI A;  1XQS C;  4N76 A;  1DT9 A;  4CES A;  3SV3 A;  1RBT A;  1KVC A;  4E3S A;  1RBU A;  1NK9 A;  1UOC A;  1NM1 A;  4RTF D;  1GLD G;  4IDH A;  4FJ5 A;  1HYZ A;  3NF8 A;  4BVP A;  4DG1 A;  1WB9 A;  2HNZ A;  3U8X A;  4DSF A;  1RT4 A;  3NBP A;  3SCX A;  3MN7 A;  1J6Z A;  1ZBL A;  2YKN A;  4CVN E;  3UKR B;  3NH2 A;  3OYF A;  2NRT A;  3A0I X;  4KB0 A;  1O13 A;  2NY8 X;  2NRX A;  1Q9Y A;  5HRS A;  3S41 A;  4CF8 A;  1BQN A;  4I6M B;  1S9G A;  1LAV A;  1WWN A;  1RT5 A;  3KOY A;  1BCO A;  4BC3 A;  3L8B A;  2P9I A;  2A1S A;  2WBN A;  2GEL A;  2V52 B;  4CJF A;  1L5U A; 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