The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
75
|
structure length |
75
|
Chain Sequence |
GSSGSSGKIMIAALDYDPGDGQMGGQGKGRLALRAGDVVMVYGPMDDQGFYYGELGGHRGLVPAHLLDHMSLHGH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the third SH3 domain from human KIAA1666 protein
rcsb |
| molecule keywords |
Uncharacterized protein KIAA1666
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| total genus |
5
|
| structure length |
75
|
| sequence length |
75
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-02-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JMC A; 3VS1 A; 1K1Z A; 1ABO A; 2RNA A; 2W10 A; 1M27 C; 1S1N A; 2A08 A; 2LCS A; 1JXO A; 3I35 A; 5IHI A; 3VS5 A; 1W70 A; 2DRM A; 1ZUK A; 2SEM A; 1SHF A; 3ULR B; 1CKA A; 2G6F X; 1ARK A; 2YDL A; 1OOT A; 1J3T A; 2K9G A; 2AKK A; 2EQI A; 1H3H A; 3M0T A; 1YWO A; 2B86 A; 2YUQ A; 2LQW A; 5GJV B; 1I0C A; 1WXU A; 1U06 A; 4AFZ C; 4J9I A; 2AZV A; 2DBM A; 1NYG A; 2DVJ A; 5HCK A; 3A98 A; 3M0P A; 1QWF A; 3H0I A; 3C0C A; 4AFS C; 4J9F A; 3EG0 A; 1GFD A; 3EG1 A; 2YSQ A; 1OPL A; 1X6G A; 2RQT A; 4EIK A; 2EBP A; 2EYW A; 2A36 A; 2EW3 A; 2MOX A; 2CSQ A; 2JS2 A; 2CT4 A; 4IIM A; 1X6B A; 3ZL7 C; 2CUD A; 2MIO A; 2DJQ A; 2LJ3 A; 2GGR A; 2JW4 A; 1PKT A; 1SRL A; 2RQV A; 2VWF A; 1K0S A; 2F2V A; 3VS6 A; 2JM8 A; 1RUW A; 4CC4 B; 2F2X A; 2C0I A; 1NM7 A; 4Z89 A; 2NUZ A; 2J7I A; 1WIE A; 4GLM A; 4HCK A; 2AK5 A; 1E6G A; 2LMJ A; 2DL8 A; 2KT8 A; 2XMF A; 1ZUU A; 3EGU A; 1WA7 A; 1BU1 A; 1PNJ A; 2DL7 A; 4LN2 A; 4CC3 A; 1AWO A; 2K2M A; 4RTY A; 1JQQ A; 2RPN A; 2HSP A; 2C0O A; 2CRE A; 3VRZ A; 2KXC A; 1X43 A; 3NPF A; 1TG0 A; 1UE9 A; 5FWB A; 3TSZ A; 4HVV A; 1H92 A; 2YUO A; 1CSK A; 3I5R A; 4WCI A; 3H41 A; 1WXB A; 3UA7 A; 4F16 A; 2DL3 A; 2RMO A; 2K79 A; 3VRY A; 3EG2 A; 2C0T A; 3M0R A; 1UEC A; 3VS4 A; 2JTE A; 5L23 A; 4OMM A; 2DL4 A; 1I1J A; 1AZE A; 3O5Z A; 2AKL A; 2LX7 A; 3EHR A; 4ZNX A; 1M8M A; 1ZBJ A; 4CC2 A; 1GFC A; 1UHF A; 2DE0 X; 2KYM A; 4CC7 A; 2HCK A; 2LJ1 A; 1KJW A; 5FWC A; 1JO8 A; 2BZ8 A; 2PZ1 A; 3EHQ A; 4DEY A; 4KRT A; 4OMP A; 3I9Q A; 2EYX A; 3LH5 A; 4RTX A; 2FO0 A; 1NLO C; 3VS0 A; 2OJ2 A; 1OV3 A; 2I0N A; 2L3Q A; 4J9H A; 2ECZ A; 1BB9 A; 1WX6 A; 4Y92 A; 3REA B; 4AG2 C; 2GTJ A; 2ROT A; 1I07 A; 3VS3 A; 2KT1 A; 2DRK A; 2J6K A; 3VS7 A; 2K6D A; 1QCF A; 1ABQ A; 1WFW A; 2JT4 A; 4IIO A; 1PRM C; 2KYB A; 2EYZ A; 1QWE A; 2CSI A; 5FW9 A; 1AOJ A; 2CH4 A; 1SPK A; 1Z9Z A; 2W0Z A; 2O2O A; 2KRO A; 3TVT A; 4A63 B; 2KRN A; 1K76 A; 1VYT A; 2O9V A; 2VKN A; 2OI3 A; 5IHK A; 3NMZ C; 2D8J A; 2M51 A; 2RF0 A; 2J6O A; 2KNB B; 4HVU A; 1NEG A; 1AVZ C; 2P4R A; 2A28 A; 2L3P A; 4AFU C; 2IIM A; 2EGA A; 1M3A A; 3M0Q A; 1M3C A; 1WXT A; 4HVW A; 2O88 A; 1X69 A; 2EGC A; 3NHN A; 1OPK A; 1UG1 A; 1IO6 A; 2HBW A; 1SSH A; 2DYB A; 4X1V A; 4J9C A; 2EKH A; 4RTZ A; 3PE0 A; 3SEM A; 1XOV A; 1PWT A; 2DNU A; 3NGP A; 1ZX6 A; 1B3Q A; 2J6F A; 1YWP A; 2FPD A; 1TUD A; 2ENM A; 3VS2 A; 1UJ0 A; 2D0N A; 1X2Q A; 3IQL A; 4J9E A; 1E7O A; 1ZSG A; 1BK2 A; 4OMO A; 1QKX A; 1KSW A; 5I11 A; 2KRM A; 2BZY A; 3QWY A; 3M0U A; 1AWX A; 4QT7 A; 1NG2 A; 1M3B A; 2DBK A; 2RQR A; 1SHG A; 1ZUY A; 1WDX A; 3GBQ A; 1E6H A; 2GQI A; 2DL5 A; 1N5Z A; 2V1R A; 4JJC A; 2OAW A; 1Y57 A; 1SRM A; 1UHC A; 3I5S A; 1NYF A; 2A37 A; 4OML A; 1YN8 A; 2JXB A; 2LQN A; 1FYN A; 2FRY A; 2K7A A; 4OMQ A; 4Z88 A; 2GTO A; 1AZG B; 2AZS A; 1JEG A; 1K9A A; 2ABL A; 1RLQ C; 1G2B A; 1QLY A; 4JPB W; 2HEQ A; 1PHT A; 2E5K A; 4LNP A; 2JMA A; 4AG1 C; 4J9G A; 4RTU A; 4J9B A; 1T3L A; 1PRL C; 3RNJ A; 1G83 A; 2DIL A; 2FG0 A; 4LE9 A; 1T0H A; 2K3B A; 2KRS A; 1TUC A; 3REB B; 4E6R A; 3UF4 A; 4LUD A; 4OMN A; 5IH2 A; 3KFV A; 1VA7 A; 3QWX X; 1UTI A; 4JZ4 A; 2V1Q A; 4JJD A; 5I22 A; 1ZLM A; 2QDL A; 1AWJ A; 2DMO A; 2ESW A; 1RI9 A; 2D1X A; 1RLP C; 2BZX A; 5IHN A; 1MV0 B; 1UFF A; 1FMK A; 1PKS A; 5GJW B; 4K11 A; 2KE9 A; 2FPF A; 1QKW A; 4DEX A; 1AD5 A; 1JU5 C; 2NWM A; 1LCK A; 1X27 A; 2ED0 A; 1KIK A; 3EG3 A; 3UAT A; 2X3X D; 2CUB A; 4HXJ A; 1VYU A; 2CDT A; 1GCQ A; 1GCP A; 2JM9 A; 2KR3 A; 4RTT A; 1Y0M A; 1BBZ A; 4J9D A; 2X3W D; 1UUE A; 2PNI A; 2DLP A; 1GL5 A; 4R0K A; 2FRW A; 2J06 A; 2EVR A; 1UGV A; 4AFQ C; 2YUP A; 2RN8 A; 3SHW A; 1SEM A; 5EC7 A; 2YT6 A; 1U3O A; 2KXD A; 4M4Z A; 1CKB A; 2BTT A; 2YUN A; 1B07 A; 3CQT A; 3TSW A; 3M0S A; 4D8D A; 1YCS B; 3UA6 A; 2L2P A; 3H0H A; 2KGT A; 1MUZ A; 1JXM A; 1HSQ A; 1GBQ A; 4ESR A; 1U5S A; 4GBQ A; 4RTW A; 1T0J A; 1WLP B; 5ECA A; 2CT3 A; 5IXB A; 1MV3 A; 2EPD A; 2O31 A; 1V1C A; 2D8H A; 2DM1 A; 2DX1 A; 2VVK A; 1M30 A; 2L3S A; 1UDL A; 1GCQ C; 2DF6 A; 3RBB B; 1K4U S; 1GBR A; 2SRC A; 1NEB A; 2GNC A; 3JV3 A; 4RUG A; 2HDA A; 2PTK A; 2RQW A; 2FEI A; 2MCN A; 4Z8A A; 2LNH B; 1X2K A; 2O9S A; 2ROL A; 1YP5 A; 3PVQ A; 1OEB A; 1KFZ A; 1HD3 A; 2JS0 A; 4JJB A; 2LJ0 A; 2L0A A; 3FJ5 A; 1H8K A; 1W1F A; 2LP5 A; 3PVL A; 1AEY A; 1T3S A; 2DA9 A; 2EYY A; 2KEA A; 2GBQ A; 2LZ6 B; 1NLP C; 4LUE A; 1GRI A; 2KBT A; 4D8K A; 2ED1 A; 2F2W A; 2CH4 W; 1Z9Q A; 2EGE A; 1K0X A; 3U23 A; 1WYX A; 2M0Y A; 1EFN A; 4F14 A; 1HJD A; 4JZ3 A; 2RQU A; 2H8H A; 4F17 A; 2J05 A; 4FSS A; 4ORZ A; 1YNZ A; 1VYV A; 1AWW A; 1W6X A; 3THK A; 4RTV A; 1UJY A; 5IXF A; 3H0F A; 1A0N B; 2FPE A; 1WI7 A; 3R6N A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1BI1 A; 3UDC A; 4BY6 C; 1K1Z A; 2QAS A; 1RAF B; 3VKI A; 1PM3 A; 2LCS A; 2IG0 A; 1IHW A; 3VS5 A; 2XU8 A; 1ZUK A; 2PUK B; 2KI7 A; 3V8K A; 3OW2 A; 3HSB A; 2B8A A; 2D6F A; 2F5T X; 1G3S A; 4EMK A; 3JCM d; 1PCX A; 1J3T A; 2XID A; 3X25 B; 4PK4 A; 1V29 B; 2GF7 A; 4EMH A; 1H3H A; 1B34 B; 3MHX A; 2YUQ A; 2CP2 A; 3SWN B; 4C5H A; 2OTL T; 1AHJ B; 1WXU A; 3F70 A; 5LJ3 e; 1U06 A; 4HA8 A; 2DEU A; 5GAN e; 1Q7Y R; 4PKC C; 2ZPF B; 1W2B S; 2DBM A; 1KHI A; 1NYG A; 5KYY B; 3JB9 J; 3PIO A; 2C06 A; 3EG0 A; 2NYS A; 3CC7 Q; 2YSQ A; 1X6G A; 4BDY A; 2EYW A; 1N8R U; 2JS2 A; 2JTM A; 2CT4 A; 1WHG A; 4FL6 A; 4X9D A; 2VWF A; 1K0S A; 2RI3 A; 2RK2 A; 3NFC A; 2DD5 A; 3OYL A; 3PTA A; 3RMS A; 4AMC A; 4CC4 B; 4M77 E; 1VQ6 T; 3RES A; 1NM7 A; 3ME9 A; 4IUQ A; 2NUZ A; 2NUP B; 1K73 C; 2MYS A; 4HCK A; 1E6G A; 1RAB B; 3CCS A; 2DL8 A; 2X4Y A; 5GMK i; 2RJE A; 4Y91 A; 1ZUU A; 3EGU A; 1W2B P; 1WA7 A; 5LJ5 f; 2DET A; 4PFO A; 2EFI A; 4BD3 A; 5KYW A; 2K3X A; 2C0O A; 1D3B B; 4PFZ A; 3E19 A; 1F1B B; 3EGX A; 2K2V A; 2LCC A; 4XTZ A; 3S3M A; 3I56 A; 3TSZ A; 1M2O A; 3RKY A; 1H92 A; 4DQ2 A; 3I5R A; 3MCA B; 1WXB A; 2DL3 A; 1ZSZ A; 2K79 A; 2LX9 A; 1TOV A; 3EG2 A; 2KK4 A; 1X01 A; 3VS4 A; 5A2Q E; 1W2B A; 1VQ5 Q; 2CP6 A; 2DXC A; 4OMM A; 2D0Q B; 3BDL A; 1AZE A; 2VUB A; 1HXD A; 4KUD K; 2QQ9 A; 1K8A R; 2MWP A; 1UGS B; 3CC2 Q; 2G3R A; 4M7D B; 5FWC A; 1JO8 A; 3L1A A; 1YIJ Q; 3CCM T; 3M58 A; 1VQN Q; 3VJP A; 3SFM A; 2QQA A; 3WXM B; 4L5G A; 2FO0 A; 3VS0 A; 1Q81 U; 1OV3 A; 2I0N A; 1Q86 R; 1PC0 A; 2XD0 A; 2PQW A; 1MMN A; 3OYD A; 5FU7 C; 3TRE A; 3H9N A; 2CZ0 B; 4ZTF A; 4OVA A; 5GAM d; 1ABQ A; 4IIO A; 4BAC A; 3EG9 A; 1NJI R; 5FW9 A; 4M77 D; 2OTJ Q; 2H3J A; 3JRZ A; 1JB0 E; 4A63 B; 2KRN A; 3CCU Q; 1ZQ1 A; 3A1P A; 4YTL A; 2JZ2 A; 2M51 A; 2RF0 A; 2E41 A; 4M7A G; 4C92 B; 2J6O A; 1NEG A; 1AVZ C; 3CCR T; 1N27 A; 4AFU C; 2DTI A; 2IIM A; 3BY7 A; 3M0Q A; 3V8J A; 1M3C A; 2EGC A; 3TQ7 P; 3OBY A; 4XK8 E; 1KD1 C; 4FYW B; 4M7D E; 5IAY A; 1OU9 A; 1TU0 B; 1OYX A; 1LNX A; 4JS5 A; 4X1V A; 2YLC A; 4MZM A; 1D1B A; 4DBF A; 3SEM A; 4QVZ A; 2RJC A; 4PLI A; 3GLX A; 2DNU A; 1B3Q A; 4WF2 A; 4BE1 A; 5LJ3 f; 2FPD A; 1BIB A; 1UJ0 A; 5GAN f; 4J9E A; 1WPY A; 4M77 C; 2E12 A; 3MEA A; 2DEQ A; 3CC4 A; 5C6S A; 5I11 A; 5GAM j; 4E7K A; 1PD0 A; 1NG2 A; 1M3B A; 2COY A; 2DBK A; 3CCE Q; 3GBQ A; 3FLG A; 3EH1 A; 2DL5 A; 2V1R A; 4XTX A; 2OAW A; 1XTD A; 3QZ5 B; 1MGQ A; 2ZPI B; 4OML A; 4JRK A; 2LQN A; 3SWN C; 1FYN A; 4EMK B; 2K7A A; 2VGN A; 4C8Q F; 2DIG A; 2RJF A; 2CP7 A; 2RH2 A; 2NLU A; 1IRE B; 3MJX A; 1KQS S; 2JMA A; 4J9G A; 1PRL C; 5D6Y A; 1R0C B; 3OB9 A; 1G83 A; 4PFP A; 5I2S A; 1T0H A; 2K3B A; 5LJ5 d; 4EDU A; 1VQ9 T; 4OB2 B; 1YJN T; 2PVG B; 2BUD A; 4E6R A; 4QKU A; 4PJO F; 2YWW A; 4FYX B; 4LUD A; 4MMK A; 3QWX X; 1UTI A; 4M7D D; 1VQM T; 3JCM h; 2GFA A; 2QDL A; 3G4S A; 5CO7 A; 1RI9 A; 5HK0 A; 1RLP C; 1YHQ T; 2E1H A; 4IUU A; 3CCS Q; 3CCQ A; 4C8Q G; 1ZHI A; 4DEX A; 1RAI B; 2NWM A; 3DLM A; 2P0K A; 4E7Z A; 1KIK A; 4J8O A; 3EG3 A; 3QJY A; 3DB3 A; 1D09 B; 4HXJ A; 1KQS P; 2O01 E; 1GCQ A; 5GAM e; 4ANJ A; 1WQW A; 3PNW C; 3J80 E; 4RTT A; 1V76 A; 4J9D A; 1D0X A; 4FT4 A; 1K73 U; 4MML A; 4R0K A; 4C8Q A; 3JAM E; 2COZ A; 3SHW A; 3CC7 T; 2PUO B; 2YT6 A; 4M4Z A; 2EIF A; 4KT0 E; 2BTT A; 2CP0 A; 1SKU B; 3TSW A; 4FT2 A; 2XK0 A; 3MP6 A; 1KQS A; 4M78 B; 4ESR A; 1U5S A; 1ZSZ B; 4GBQ A; 1KHC A; 4M7D C; 1T0J A; 2YRC A; 1WLP B; 5ECA A; 1K9M R; 3OSV A; 1O9S A; 2O31 A; 5LJ5 j; 4DBQ A; 2WSE E; 2DM1 A; 3LLR A; 3X28 B; 4PJO A; 1YIT T; 4IUP A; 2QAZ A; 1WJQ A; 2L3S A; 2EKO A; 2DF6 A; 1RAD B; 2K4Y A; 5GAN 7; 2EYQ A; 4WTO B; 2MCN A; 4N0A C; 2PU9 B; 1M8V A; 2JJ9 A; 2WAC A; 2O9S A; 3PVQ A; 1M90 R; 3FC3 A; 1KFZ A; 2LTO A; 4JJB A; 1QVG S; 5HK3 A; 3QYH B; 4C5G A; 3CME A; 1AEY A; 3OYC A; 4J6X A; 2DA9 A; 3EGD A; 1NLP C; 4LUE A; 1GRI A; 3FDR A; 3CCJ T; 3JCM b; 2QK0 A; 4HCB A; 1OX9 A; 1TH7 A; 3EG9 B; 3OYB A; 4LDU A; 1RAH B; 3A8M B; 2XIC A; 1VQ5 T; 4OB0 B; 4F17 A; 5GAO p; 3H6Z A; 2VC8 A; 1PSE A; 3BE3 A; 3THK A; 4RTV A; 3CC2 T; 1UJY A; 3P8B B; 3HKS A; 4M78 E; 2DVE A; 5GAN d; 2W10 A; 2V8J A; 3VYH B; 1VQ8 A; 4RMO A; 1VQN T; 4F7U F; 2M0O A; 3BW1 A; 2A08 A; 1ZA1 B; 1Q82 R; 1W70 A; 1LJO A; 2DRM A; 4JLI A; 1YJ9 Q; 1SHF A; 5GAM h; 3OMG A; 2YDL A; 1OOT A; 3UPU A; 3QDF A; 2L89 A; 2EQI A; 1VQL Q; 4XTV A; 2B86 A; 5LJ5 e; 2RM4 A; 3KXT A; 2YLB A; 4AFZ C; 3RUX A; 4J9I A; 3CMA Q; 2FYK A; 4M75 F; 4E7S A; 3L2R A; 5HCK A; 3CC4 Q; 2OTJ T; 3H0I A; 2QQB A; 4FSX A; 4AFS C; 2M16 A; 4J9F A; 2E4H A; 1GFD A; 1QVG A; 2RQT A; 3CCU T; 2EBP A; 2HAX A; 2YRD A; 2L3R A; 4IUT A; 2MOX A; 3CBP A; 4IIM A; 2X4W A; 4F7U G; 2CP3 A; 3ZL7 C; 2MAM A; 2DJQ A; 3VUB A; 2GGR A; 4EMK C; 3OYJ A; 2LT1 A; 2F2X A; 5GAO n; 4A4K A; 4Z89 A; 4R56 A; 2CP5 A; 5KYU A; 2AK5 A; 5GAN j; 5KYX A; 2MF2 A; 4F7U A; 2R58 A; 1VQ7 T; 5KCH A; 2K5L A; 2LDM A; 4J6W A; 5CAI A; 1PNJ A; 2RD1 A; 1QVP A; 3OYK A; 1AWO A; 3WVD B; 3MEU A; 2K2M A; 4A4E A; 1JQQ A; 2HSP A; 5A0D A; 2CRE A; 4CRI A; 4M78 D; 4PL6 A; 1BI0 A; 1I4K 1; 3JB9 F; 3RKX A; 1TG0 A; 3G1J A; 3JCM P; 1C0M A; 2YUO A; 1IZ6 A; 1CSK A; 2FHD A; 3G4S Q; 3H41 A; 4M75 A; 2RMO A; 4OGE A; 3CCE T; 3VRY A; 2C0T A; 1ACM B; 2FZK B; 1X75 C; 3X26 B; 3RIR A; 2JTE A; 4J5Y A; 3QDR B; 2ATC B; 4ZNX A; 3S6W A; 2LJ1 A; 3M4G A; 1KJW A; 3EFS A; 1TWB A; 2PZ1 A; 1M9S A; 1C1A A; 4KRT A; 1WQ7 A; 2HSE B; 4RTX A; 2QI2 A; 2L3Q A; 3JCM g; 5LJ5 h; 3CPW P; 4RKU E; 3CCL Q; 3M5A A; 2COW A; 2GTJ A; 2JOY A; 3LYI A; 2ROT A; 3JB9 G; 2OX7 A; 2KT1 A; 4E2F B; 4C8Q B; 2DRK A; 5CKF A; 3VS7 A; 3L2Q A; 4JUV A; 4M78 C; 2JT4 A; 1ZSZ C; 2BE7 D; 2EYZ A; 2MK5 A; 1VQO Q; 3FJP A; 2VAS A; 2R5A A; 1AOJ A; 2CH4 A; 1Z9Z A; 1B7T A; 1KG1 A; 1VYT A; 5CVI A; 3I55 A; 2NUT A; 4O5V A; 3CCS T; 2QEX A; 3T9N A; 4HVU A; 2KNB B; 4QQD A; 2E6N A; 4PJO B; 2DZC A; 2L3P A; 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