2EIQA

Design of disulfide-linked thioredoxin dimers and multimers through analysis of crystal contacts
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAACKVGALSKGQLKEFLDANL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin 1
source organism Escherichia coli
molecule tags Electron transport
total genus 31
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2eiqA00
1IYIA 3BCIA 2H1AA 1AW9A 2X99A 2YNXA 1U88A 4MK3A 2OE0A 4XCSA 3PH9A 2B1LA 2DJ1A 5IO0A 4FIWA 4G9HA 3S9FA 4GF0A 4IBPA 4X43A 6GSXA 3W8JA 2PVOC 5AGYA 1PKZA 2C80A 1GSDA 5IMAA 5DQYA 2OBIA 3KTBA 2GTUA 4OFMA 3FR6A 2CT6A 3CSHA 3CRTA 5IQYA 4Q5NA 1WPIA 1QXHA 3M3MA 5IIZA 1MDJA 13GSA 3FHKA 3UBLA 4EDZA 3VPTA 2H71A 3MSZA 1M2BA 4XS4A 4XS4B 20GSA 2B3SA 2L5LA 2LEGA 3RHBA 1FVKA 2H6XA 1Z9HA 2H75A 5ABRA 1ILOA 4GQCA 2GSTA 3ZMKA 3IC4A 2BJXA 5ECQB 1QQ2A 3F4TA 2YWNA 4MH3A 1DE2A 4F2IA 3RAZA 1C72A 3GSTA 2IIYA 3ZYWA 3P8WA 2E2MA 3NOFA 2MZCA 1TRSA 4TR4A 3VURA 4J56E 5KEJA 5DVBA 2K8SA 1WJKA 2LS5A 3EWLA 4ZB8A 2VL2C 5DJLA 22GSA 4KDXA 4NV5A 4RQXA 3PINA 3G7JA 5ECHB 4JEDA 4GSNA 1G6YA 2Z9SA 2HLSA 10GSA 5L71A 1EWXA 4O32A 2EC4A 2X8GA 3CXGA 1GLQA 1OYJA 5HFGA 5GZZB 5D9TA 1A8LA 2PERA 3HA9A 4MJAA 1R4WA 2OE1A 4GTUA 1EOGA 4ZXGA 2WB9A 2GDRA 3MNGA 2GZZA 2PUKC 1BQ7A 3HY2A 4HEA2 3TKRA 2B6MA 2WCIA 5B8AA 5F07A 2C0DA 3LORA 4LL1B 2L5OA 4NHZA 1R26A 2PU9C 3V1WA 3TJKA 4ZBDA 1SL0B 3N9JA 3A3TA 1FAAA 1XW9A 3APOA 2LUSA 1PA3A 1GH2A 3HXSA 2VLTA 1XWCA 2MYGA 4K0NA 2YJ7A 3C1SA 5IM9A 3KH9A 2L4QA 4O92A 1XXUA 4RUVA 4NAXA 4AGSA 3O76A 4MH2A 2K18A 1T3BA 2LJAA 3FY7A 4LMWA 5GAND 2LNTA 2JZRA 2X64A 2C3TA 2HRFA 4YH2A 4ID0A 1KNGA 1MD4A 2VM1A 5JWOB 5ECLB 1RW1A 2TRXA 2ZCTA 3BCKA 3O3TA 5B7CA 3KP9A 3H8QA 3I43A 2XHFA 3RPNA 2GLRA 1PKWA 2PVQA 5ECKB 5ECMB 4GSTA 3TKQA 2JZTA 2CZ2A 4PQHA 2FD3A 2OADA 3EU3A 2KOKA 3VWWA 2E7PA 4WF4A 4AJ7A 1ERUA 4HJ2A 1TDIA 2KP2A 3IDVA 3UBKA 11GSA 4V1Ap 1IYHA 1YZXA 3C71A 3IK7A 5E59A 1THXA 1WOUA 3GN3A 5J4UA 1J9BA 4EF0A 2OKAA 3LYPA 4KCEA 1PL1A 1TKDB 2FA8A 4E8EA 1MEKA 3D4MA 5D93A 3GL5A 4J2FA 1XWAA 2IJYA 3KXOA 1M7TA 2I4AA 4MZCA 2JU5A 4TXVA 1FW1A 3A2VA 2LQOA 1JFUA 3IBHA 3C73A 12GSA 5AIXA 1PN9A 3ME7A 4GSSA 1A23A 1ON4A 3FW2A 2JL4A 2FUG2 3F0IA 4I6XA 5HR2A 1TTZA 1XFLA 1T4ZA 3J7Yk 1V57A 1K0BA 1KEBA 3IRAA 2VL2A 4XRDA 4PQ1A 1G7EA 4TRXA 3RHCA 3HJMA 4Q5RA 9GSSA 2IMKA 4ML1A 2HI7A 3KH7A 5JCGA 2N5FA 3GSSA 4ZL8A 1YF1A 1DUGA 1SL2B 4X1UA 4MPFA 1XWGA 1EP8A 1TRWA 1TI1A 5D96A 5COHA 4GWRA 2CVBA 2B1KA 4RI7A 5DALA 2H1DA 3UJ1A 2B5EA 5DALB 2LQQA 2V6OA 5IMFA 2FWGA 2CV4A 5A4WA 5GSSA 1SU9A 2YWMA 3EYTA 1K0DA 3Q74A 1U6TA 4MABA 1RQMA 2PBJA 1UVZA 2LKUA 5ECRB 2FY6A 5HR3A 4IP6A 3IPZA 3SWLA 2C0FA 3US3A 1WMJA 4OFTA 1U3IA 4I8BA 4OCEA 5KN1A 4POBA 3EINA 2YJHA 2AHEA 4AF2A 4MA9A 2HFDA 4ZBBA 3DVWA 3M9KA 5JCUA 2YWIA 3H4KA 4KDUA 1BYEA 2YCDA 5KN3A 3LGCA 4TN8A 4RI6A 1TP9A 4FYUA 1K0AA 5IO2A 1OC3A 1XOAA 3F4RA 5DAKA 3L0HA 5GSTA 4MZBA 1K0OA 5G1KA 3FRCA 3P2AA 1X5CA 5B6MA 1GTBA 3L9VA 1U87A 5JCWA 3GRXA 2L6DA 1Z7PA 2DBCA 2FWFA 1X5EA 3HDCA 1XW5A 1ZGNA 4G2EA 2H1GA 1BEDA 1XVQA 1EEJA 2IWTA 1CQHA 3M8NA 4ECJA 5KN0A 3KJYA 2MBTA 1M2DA 4MDCA 2CA8A 1A8YA 3HKRA 4HZ2A 1FB0A 3FEUA 5F0GA 1MDKA 2P5RA 2DJJA 3FZAA 4KAEA 1GSFA 4IW9A 6GSYA 4HJMA 1NHOA 3Q18A 3FK8A 4KNDA 4JZQA 2IMFA 4F9ZA 5F06A 1S3DA 3DYRA 4F82A 2YOIA 3ZIVA 1SJZA 4QL7A 4JBBA 3KMOA 5HR0A 3VWVA 3GUSA 1YKAA 1GULA 2QKEA 1WE0A 4WEYA 3GURA 1GTAA 4CW9A 5A4VA 4EDYA 2DC5A 2VD1A 2C0GA 2IN3A 2LRNA 3WT1A 2FNOA 1V40A 4PNGA 2P0GA 2CQ9A 3JCML 5IOXA 1YF0A 3D4TA 4KA0A 2OJLA 5JWRB 3CMIA 3GKMA 4ULXA 2F8FA 1A2LA 3VPQA 2WRTA 1ERVA 5G2ZA 4JU5A 4KUNA 2VCWA 3UAPA 2RIIA 2GSSA 1EZKA 3L9SA 1TI3A 2YZUA 1AQVA 5INYA 1O8WA 4FH8A 1M2AA 2HT9A 4K1FA 1ZMAA 1GSQA 2DSAA 5H5RA 1J08A 3GNJA 3FKFA 4WR5A 2A4VA 2AB6A 3UEMA 2H8LA 3TKSA 5G5EA 3TJGA 1ST9A 4BVYA 4OWYA 1YJ6A 2H74A 6GSUA 4N10A 3C7MA 3IR4A 3LEFA 2A2SA 2AV4A 2R3XA 3D0ZA 4HQSA 4IKHA 1YY7A 1FVJA 2CX4A 4ZL7A 2AYTA 3ED3A 1SK2A 3DMLA 3QD9A 3MDKA 4FO5A 2L6CA 5ECIB 2DMLA 3WD6A 1CQGA 1XVWA 1G6WA 2H76A 4ISDA 1GSSA 4IN0A 3IHQA 3F4SA 1ML6A 1F9MA 2LJKA 5GAPD 1AC1A 4V2NA 2YWOA 5D9XA 5J9CA 1YQ1A 1TU7A 3KCMA 2NTOA 1K3OA 4MJCA 2O89A 2FHEA 2M80A 1TK8B 4V2LA 3DKSA 4WBJA 5CNWA 3DD3A 5F8BA 2BTOT 4HQZA 5EY6A 2ON7A 4EL1A 2HE3A 4TXOA 1TU8A 4TXOB 4MPGA 4GXZA 1LJRA 2YN1A 3ZFBA 3LSZA 1Q98A 3EVIA 4O5RA 3IAM2 3ZTLA 4N0ZA 4ZB6A 2F51A 2MMNA 5FHIA 1BG5A 3ZRDA 1T7PB 4MJBA 2V41A 4NXIA 3HHVA 2VCTA 2GSQA 3RDWA 3VI7A 1KTEA 4EVMA 1Z7RA 1OKDA 1I5GA 5B8BA 3VI5A 4KSMA 2VLUA 3CSIA 3HJPA 1MTCA 2OA7A 1S3AA 1DE1A 2DIZA 1K0CA 2MMAA 3GA4A 4MZWA 1F2EA 1OAZA 5G31A 3GMFA 2LRTA 3UVHA 3ZZXA 1PL2A 4L8EA 2ALBA 2J9HA 3FZ5A 2REMA 1GUHA 3QFBC 4RQRA 1ZZYA 2WZ9A 1GSEA 5CO3A 1JZRA 1Z5YE 2VAFA 5G30A 3GH9A 2RLIA 1HD2A 3HCZA 3LQ7A 1PX7A 1E6BA 4TOPA 2O85A 2V6KA 1XIYA 2E0QA 3QMXA 2FWHA 2LRCA 5CRHA 4HUAA 4GCIA 5CP1A 3DRNA 4K9ZA 1I9DA 1LU4A 3I69A 3CTGA 1LBKA 3DGQA 1WIKA 2ES7A 3KP8A 3F8UA 1TRUA 4ILFA 2K8VA 3C8EA 5ENUA 4EKZA 3K8NA 2LV3A 4MJEA 1UN2A 2CAIA 1A2JA 1XCCA 3QPMA 2GQMA 3UARA 3QCPA 4EO3A 2PPTA 16GSA 4MF7A 4OMVA 4KSOA 3BJ5A 1XOBA 3LXTA 1QGVA 4TR1A 4TR1B 4HS1A 3R2QA 4V1Ag 1SJ6A 1GL8A 4KB3A 3WGEA 2K6VA 3FZ4A 2KLXA 4YQMA 1B4QA 4XTSA 3IE3A 4KDYA 2V2GA 5IOWA 2DJ2A 4D73A 4D73B 3LFLA 4Q5QA 3UL3A 5B6NA 3QAVA 3J7Yb 1WRYA 5AIVA 3TGZA 2H19A 4GLTA 1TK5B 3LJRA 4P3YB 1RK4A 4YAVA 2EIOA 4ML6A 3TOTA 4IHUA 1VF3A 1WWJA 1X0RA 2IL3A 4EE0A 2GGTA 1ZYEA 4K2DA 1ZCPA 1B4PA 1M9AA 2HYXA 4AJ8A 4PX1A 2H73A 1SYRA 3GKXA 2H30A 1H4OA 1T00A 1Y25A 2FCHA 2O8VB 5ID2A 5ID2B 4XRAA 4OCFA 4ZBAA 1V2AA 4L5LA 2JSYA 4HDEA 5DQSA 5AISA 3L78A 1GLPA 2H66A 3CYNA 1TRVA 1URMA 5IPHA 1Z6MA 2LNSA 4L0WA 2CVDA 3KGKA 3QAGA 2F9SA 5DBQA 3PR8A 2XBIA 1B48A 3APSA 3TKSC 3TDGA 1QFNA 3U5RE 1X9WB 3KTLA 1W89A 1H75A 3BOAA 3FR9A 1BJXA 3W6GA 1A0FA 1TW9A 1SL1B 1YEPA 4I2TA 1SKWB 1B8XA 3GIXA 3HVXA 4ZB9A 2GQKA 1FB6A 3G7IA 4HU9A 6GSVA 1OE8A 1ERTA 2GS3A 2HNLA 2NBSA 2YZHA 1ABAA 3ZREA 2GQLA 4ECBA 2B5XA 4F03A 3M1GA 1THOA 1GUMA 3FR3A 3GH6A 2N5AA 2V32A 1V9WA 1MDIA 3IAS2 4HZ4A 1JHBA 1AQWA 1T8EB 3CBUA 3HVVA 3EURA 1OE7A 1SKSB 4LA1A 4XS6A 4NV2A 5LNKe 2YV9A 1OVNA 1E2YA 3HZ4A 1EOHA 4WF5A 3ERFA 3G7YA 3PGTA 3LG6A 1VF4A 4ACSA 1AIUA 3GHAA 2L59A 1PQNA 5F05A 1SJIA 2D2ZA 5IMDA 4PUFC 3HJOA 3QOUA 3TJJA 1ACVA 1F6MC 2CAQA 2GT6A 2VIMA 3KIJA 5FWGA 4WR4A 1ZYQB 2ON5A 3VWXA 1BAYA 2RUEA 1ZOFA 1JLWA 5IMCA 4AJ6A 4NMUA 4IJ3A 3GX8A 3U6VA 4BVXA 4E8HA 2AJQB 4OFNA 3GV1A 2ZUPA 3M0FA 4LMVA 4JRRA 2I3YA 4TR0A 4IP1A 4YAPA 3VWUA 2FWEA 2OE3A 3ZIJA 5LCZA 2VL9A 2VD0A 1OC8A 3IK9A 3TOUA 1A2MA 4PXOA 3TRPA 6GSTA 2VLVA 5FT3A 1PSQA 3BD2A 2G2QA 2BMXA 3G9BA 3FZ9A 1HQOA 3ISOA 4PURA 5HR1A 5CAXA 4JR6A 1PX6A 2H01A 1GRXA 4IQAA 1OKTA 4IQ1A 4X0XA 3TKSE 2JSZA 1USBA 3DVXA 3A5WA 2XC2A 3RBTA 2KHPA 4HOJA 4LL4B 1KBNA 2M46A 3EU4A 6GSSA 4KGIA 5E4WA 1A24A 3VK9A 4NPBA 3D21A 2TIRA 4K7IA 3HVSA 4POKA 3KZQA 5C00A 2YANA 5ECPB 4YQUA 2VOCA 5D8IA 3Q19A 1O8XA 3GKKA 1UC7A 5J9BA 4DSSA 1EGRA 1M99A 5JWQB 4DSSB 4POLA 3EMXA 2C0EA 1JLVA 1PRXA 2IMDA 2AUVA 2HRNA 1PD21 3F9UA 4G19A 4F0CA 3DXBA 1MD3A 5G5FA 4BL7A 1UA5A 2DJKA 5A4UA 3E3EA 1VGLA 4K7NA 3MWHA 3CRUA 3ZVJA 1OC9A 1OC9B 5IMZA 2DMMA 2QC7A 4MP4A 17GSA 2XPEA 2GZPA 1JZOA 4OD7A 2H1BA 2VUPA 2IPAA 1B9XC 3F3RA 3HZ8A 2G0FA 4PGTA 1VF1A 2QGVA 2P5QA 4WKWA 4K0GA 3E0UA 2L57A 3HYPA 5HFKA 2J23A 4JR4A 1GNEA 1FG4A 5G1LA 1AXDA 4IGJA 18GSA 4CDOA 4IVFA 4I5QA 2JADA 4XIHA 4BWSA 4H86A 3TRXA 1O73A 2VM2A 5J3RA 3ZFLA 1SKRB 5IMVA 1EV9A 3BBYA 5D9VA 1GUKA 4HI7A 4KCAA 3ZVJD 3TUEA 3IXRA 1EV4A 3H1NA 4K7OA 3KM6A 2PGTA 3P7XA 4QL9A 2E2GA 1O6JA 2FLSA 4PNFA 3GYKA 1Q4JA 1PMTA 3UIWA 1K0MA 3GX0A 3LWAA 1HNAA 3GL3A 4Q5FA 1TJDA 4MLYA 1Z3EA 2WFCA 3OR5A 2KUCA 5IPGA 5KN2A 1O81A 2H0GA 5C04A 3ME8A 1XPVA 1ERWA 4JE1A 5HFIA 1A0RP 2AAWA 1Z6NA 1FHEA 3ZITA 2TRCP 2CX3A 4OO5A 4NHWA 2ZNMA 1NSWA 4BPYA 1M9BA 1F3AA 1EGOA 4KX4A 1AAZA 2N5BA 4KW6A 1SK0A 2M72A 2GSRA 3N5OA 1N8JA 2B7KA 2H70A 4OO4A 3QFAC 3D5JA 3TCOA 2RM5A 2IMIA 4V2MA 2QSIA 1NW2A 2YV7A 4HU7A 2C8UA 4DVCA 4KH7A 4ZILA 2FGXA 1TXXA 2VCVA 5EVOA 3H93A 1XZOA 1NM3A 4IS0A 4ECCA 4EUYA 2WJUA 2I9HA 5J5NA 4G10A 5A5KA 4CHSA 1YKCA 2FA4A 2H0IA 1DBYA 2NDOA 8GSSA 1FO5A 1Y6EA 2VO4A 1HNCA 5CRGA 2DJ3A 2RUFA 1EP7A 4DSQA 3GFKA 5H5SA 3APQA 5ELAA 1R7HA 2WDUA 2C4JA 3GKNA 4XS1A 1SD9A 1BX9A 2PWJA 5CYYA 2F3MA 2F8AA 3IA1A 5LD0A 1VRSD 4N11A 1ZL9A 3VFIA 1VF2A 1O7UA 2DJ0A 5DJMA 3L9UA 4NWYA 4YQVA 3F63A 4GQFA 5EL8A 2NVLA 1WP0A 2HSHA 1T4YA 3CTFA 2C1YA 3A2WA 4DSRA 5D9WA 3C1RA 3KD0A 3QR6A 2X8CA 4LLRA 2C3NA 1R5PA 1PGTA 3IV4A 4XHMA 1XWKA 1GTUA 1GWCA 2VCQA 1AQXA 5DDLA 1G7OA 5DCHA 2OACA 5ECSA 4L5OA 5CRWA 1N2AA 1V58A 1X9SB 2LTKA 2IMEA 3I6AA 2CVKA 2I1UA 4ZL9A 4IELA 3F6FA 1GP1A 4I97A 4EC0A 4L0UA 4PUAA 1AUCA 4J57E 5DCGA 2VL3A 2DIYA 3WGXA 19GSA 3VLNA 14GSA 2IFQA 4TR3A 2IFQB 3SBCA 3TB2A 2WULA 4O7HA 2VCZA 3D6IA 2B7JA 4GRFA 5HQPA 2C3QA 4TW5A 1FOVA 2DLXA 1J0FA 2WS2A 3W8SA 1GNWA 3TJFA 4MMMA 3WT2A 1B9YC 2H6YA 3AY8A 3EMPA 1HYUA 5AN1A 3KEBA 1YEXA 2H6ZA 1K0NA 3HD5A 2WGRA 2YP6A 2XPDA 4BWQA 1QMVA 4WBRD 1JZDA 3E9JB 1DSBA 2R4VA 2EIQA 4KE3A 5ELGA 4K6XA 3WYWA 3ZLPA 3P90A 3GTUA 3ZL5A 2CZ3A 3GTUB 6GSWA 2B5YA 3NZNA 2PMTA 1X5DA 2O87A 1XBSA 2HSYA 4F0BA 3Q6OA 1SENA 2OBKA 2GT5A 2K9FA 1SK1A 2NPBA 3WGDA 1GSYA 1SD8A 2EIRA 3TJBA 5CRDA 3FYGA 1K3YA 3EE2A 3EC3A 3DEXA 1NHYA 2JZSA 2XBQA 3DIEA 1TK0B 3D22A 3A2XA 4FYBA 1G0TA 3IOSA 2JACA 2I81A 2LSTA 2HZEA 2MMOA 2HZEB 4N0VA 5CREA 2R5GA 4MF5A 4BA7A 3UVTA 1U3AA 3H79A 2YPMA 1S3CA 3RPPA 2MMZA 4WETA 3I9V2 1SYXA 2VCXA 2O7KA 5J41A 1QK8A 3UMAA 4ZIJA 3ERGA 3M9JA 4TKYA 5D73A 3F3QA 5H5QA 1YDKA 1K3LA 2R6KA 1X9MB 1HNBA 1TOFA 3MAKA 3DWVA 2KP1A 5ECNB 3QAWA 4IJIA 2HZFA 3TRQA 2MBSA 3ZMLA 3UOMA 4DEJA 1V98A 3TKPA 5DAKB 3L4NA 2X8HA 1F37A 5EPFA 2LJRA 4N30A 4Z7XA 3ERWA 2L4CA 1JZWA 3LXZA 1W4VA 1XW6A 3F6DA 1O85A 7GSSA 2GZYA 3LYKA 5ECOB 4MF6A 1M0UA 4POMA 1R5AA 2RM6A 4MCUA 2A2RA 3CSJA 1GTIA 4ECIA 3NIVA 2V1MA 2H0HA 4K8MA 2HXKA 1EEMA 2GVPA 2H72A 3QDNA 2PN8A 4WXTA 3KMNA 4TVEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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