2EIQA

Design of disulfide-linked thioredoxin dimers and multimers through analysis of crystal contacts
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAACKVGALSKGQLKEFLDANL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin 1
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 31
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2eiqA00
1TU7A 3AY8A 1EP8A 2OADA 4WEYA 2QC7A 2VM1A 4IP1A 4IHUA 6GSSA 1WPIA 1ERWA 8GSSA 3QFAC 4YAVA 3P2AA 2HLSA 3C1RA 4LA1A 2IJYA 3HZ8A 5FHIA 2B5EA 3APQA 4JR4A 3GUSA 2HT9A 2F8FA 3ZIVA 2XC2A 10GSA 3EC3A 2HSHA 3KGKA 2D2ZA 1QK8A 2OACA 4KCAA 3QAVA 2H8LA 4JZQA 3TKQA 1EGOA 3CRTA 4MMMA 5J4UA 2LJKA 2C1YA 11GSA 3ZYWA 3GTUA 1Z9HA 2B5XA 2G0FA 4KDYA 1CQGA 2YANA 1E2YA 1TK0B 1K0AA 1F9MA 3F63A 4KDXA 3G7YA 3N5OA 2DJ1A 4I2UA 2I9HA 1PD21 4IVFA 1THOA 1MTCA 3MSZA 4MPGA 3F6FA 3LG6A 4MJEA 1DBYA 1AAZA 1OC3A 1GTIA 4RQRA 3HHVA 2H19A 5FWGA 1M7TA 1SENA 2VOCA 1OC8A 2M72A 4TR4A 1QXHA 4OFMA 5INYA 1FHEA 2L57A 1NW2A 3IPZA 1X0RA 20GSA 5DDLA 3TRXA 1JFUA 5H5RA 4AF2A 2DJJA 2YWMA 2ES7A 3TJBA 4AJ6A 1V2AA 2GVPA 1W4VA 4OO4A 2CZ2A 1U6TA 5LNKe 4HUAA 3K8NA 3UVTA 4FH8A 1XXUA 4WR5A 2VL3A 5ENUA 3LYKA 5ECSA 2H6YA 4NAXA 1EP7A 4CHSA 3D0ZA 3PH9A 4MA9A 4POBA 2JZRA 2LJAA 4K2DA 4DEJA 3P90A 5KN3A 5ID2A 4LMVA 1S3AA 2H0GA 3LQ7A 4K7IA 1ON4A 1SK0A 3W6GA 1TRSA 2L5OA 5IIZA 3HKRA 5JWQB 4WXTA 3ZL5A 5GSSA 1ILOA 3VI5A 2CV4A 3Q74A 5DALA 2QGVA 2VCVA 5E4WA 4KSOA 1QQ2A 4PGTA 4KCEA 4XIHA 2JSYA 4HJMA 3SWLA 1FO5A 4TR1B 2QSIA 2GT6A 4K7NA 3GYKA 2XPDA 2G2QA 2R5GA 1R4WA 5KN1A 3D5JA 3Q19A 5F8BA 4Q5NA 3VWWA 2VAFA 4YQUA 1SKRB 3A5WA 1PMTA 2LNTA 3BJ5A 1EV9A 2HRFA 1XPVA 22GSA 4IS0A 1KTEA 2WULA 1Z6NA 3RPPA 4AJ7A 1TP9A 3F8UA 3IE3A 1SL2B 3HA9A 2MBTA 2ZUPA 1U3IA 1ST9A 5B6MA 1UVZA 2JACA 3KP8A 2LRTA 5J41A 2YJ7A 3EMXA 2YV9A 3W8SA 5CRGA 2IFQB 3GIXA 4J2FA 3VURA 3GKXA 3HVXA 1U3AA 1CQHA 2X8GA 3H4KA 4QQ7A 2P0GA 5D9TA 4EC0A 1TRWA 3TKSA 2LJRA 4GCIA 1FB0A 5IOXA 5ECOB 2H66A 4KH7A 1RW1A 1PQNA 5HFGA 1DE2A 5ECRB 2RIIA 1LBKA 5KEJA 3L78A 4V2MA 6GSYA 1UC7A 4NWYA 1G0TA 3GFKA 3G9BA 2VLVA 4N0ZA 4HJ2A 4F0BA 2B7KA 2FWEA 5HR0A 1VF3A 4EE0A 2WCIA 1USBA 3DIEA 3DKSA 2E2MA 1S3CA 2YPMA 1C72A 5CAXA 3ERWA 3F9UA 1WJKA 4PURA 1WWJA 4PUAA 3GL5A 1M0UA 2F51A 2H0HA 2GSSA 13GSA 1J9BA 2O7KA 3VWUA 3WGEA 2PN8A 3FZ5A 4KX4A 2DJKA 5IMVA 4FYCA 1B48A 3C71A 4WBJA 5ECMB 2KHPA 4ECCA 4IELA 4MF7A 5ECLB 4TVEA 1IYIA 4K0GA 4F9ZA 5G1LA 4KW6A 5HR2A 1XW5A 1XZOA 1XWGA 2V6OA 3O6TA 1B8XA 4ZXGA 4JE1A 5C04A 3FR9A 2CQ9A 5IO2A 3RAZA 4HZ2A 1XFLA 1HNBA 4I97A 2GTUA 5IOWA 1M9BA 1Y6EA 2IMKA 1EEJA 5ECPB 4HU7A 1EOHA 4K9ZA 2DMMA 4F0CA 4F03A 5CYYA 3I9V2 1EOGA 3F6DA 1OE7A 4TKYA 4L0UA 4O32A 2CA8A 4Q5FA 5H5QA 3CBUA 5DJLA 1M2BA 1K3YA 1GNEA 2H1DA 2JSZA 1B9XC 1B4PA 1XBSA 2YN1A 2C80A 2M80A 3DMLA 4HI7A 5KN0A 1K0CA 5EY6A 1URMA 1BAYA 1H4OA 2VL2A 2DJ2A 4ECIA 1PL2A 4GWRA 2FLSA 2KUCA 4IQ1A 2HI7A 2LUSA 3Q6OA 5DALB 2LNSA 4X1UA 3RHBA 2A4VA 3US3A 4ZB6A 3M9KA 3W8JA 4G19A 2IMIA 1PKWA 3KJYA 1MEKA 5DCGA 2N5FA 2OE1A 1PSQA 4MJBA 1ZYQB 1GSUA 1Q98A 3ZRDA 4MP4A 5A5KA 1YDKA 2H73A 2HRNA 3GKKA 3FYGA 3ISOA 1N8JA 4EVMA 4G2EA 16GSA 1V9WA 4I8BA 1G7OA 4JU5A 4TR1A 1HNCA 1WMJA 3HY2A 4NHWA 1R5AA 1YEPA 2AHEA 3D6IA 3SBCA 4OMVA 1ZYEA 1BYEA 2A2RA 19GSA 5ELAA 2H74A 3KXOA 5JCWA 3QAGA 1A0FA 4H86A 2O8VB 2V6KA 4DSQA 4EXJA 3LYPA 5FT3A 2HZEB 3FZ9A 4POLA 4GF0A 1X5EA 1YKAA 2CVKA 4RI7A 2VD1A 4BVXA 4EF0A 4IJ3A 1A8LA 2LS5A 2C8UA 2FHEA 2L6DA 2IFQA 5F06A 1Z5YE 5AN1A 4PUFC 4ZB9A 5JCUA 1DE1A 1O8XA 1T7PB 3TJGA 3V1WA 2LV3A 4GQFA 1F2EA 4TOPA 1OC9B 2E0QA 3I69A 4V2LA 4TW5A 4L8EA 3JCML 4V1Ap 2GDRA 3ME7A 4N10A 5GAPD 2PWJA 2IPAA 3APOA 1MDJA 1OKTA 2B5YA 4IGJA 1G6WA 1XOBA 2YJHA 4WBRD 2JADA 2H0IA 1OE8A 1AUCA 3KM6A 4GQCA 3IA1A 4WF4A 6GSUA 1K0NA 3HYPA 5H5SA 3IDVA 2YOIA 2BTOT 4BWSA 2IWTA 5IPHA 2NBSA 5ECIB 2B1LA 2GSRA 2FA4A 4XS4B 3TB2A 1O8WA 5F0GA 2E7PA 2RLIA 1QMVA 4BL7A 4D73B 1FB6A 1SKSB 4LLRA 1T4ZA 1A2MA 3WD6A 1JLWA 5G31A 1JLVA 3UBKA 5JWOB 1YZXA 3GA4A 3GMFA 1DUGA 3EINA 4QL9A 2EC4A 1YJ6A 1VF1A 2H1AA 2WJUA 2X64A 4J57E 2FA8A 2HNLA 4MH2A 3WGDA 2AAWA 1K3OA 1VF4A 3IXRA 1WIKA 3ZREA 3U5RE 2DJ3A 1TW9A 4NV5A 4L0WA 3M8NA 1GULA 2NDOA 3TJKA 3FZ4A 2M46A 4POKA 4X0XA 1Z3EA 3VI7A 3C8EA 3RBTA 2AB6A 1IYHA 3QAWA 4IBPA 3D4TA 5LCZA 4AGSA 2WRTA 2CT6A 4JR6A 3CSJA 4KAEA 4NHZA 5IMCA 2DBCA 2ALBA 3ZMKA 7GSSA 4YQMA 3MWHA 2PGTA 2YNXA 2I1UA 2E2GA 1SYXA 2R4VA 5CRHA 5DJMA 1F37A 2VCQA 1XVQA 3KZQA 3UIWA 3ERFA 3HVVA 1FOVA 3DVXA 3UAPA 3GX0A 4Z7XA 5ECKB 3KD0A 2RUEA 1TXXA 4L5OA 2PPTA 5D93A 4NV2A 3GNJA 4JEDA 6GSXA 4X43A 4GSTA 4TXOB 1ML6A 1YKCA 2LEGA 2XBIA 1GSFA 5DAKB 3ZVJD 4J56E 2H75A 3U6VA 5F07A 1GL8A 3H8QA 5IMDA 1GSEA 1PL1A 2MYGA 2C3TA 3MDKA 2VM2A 4LMWA 1EGRA 4G9HA 4V2NA 3IRAA 3KCMA 2DC5A 3ME8A 1B4QA 1HQOA 4MLYA 3ZFBA 5IQYA 1N2AA 3GKMA 3TJJA 4ZL8A 1GP1A 1SL0B 1FG4A 1R26A 4MJAA 2GSTA 2C4JA 4FYBA 4FYUA 4KE3A 1EEMA 2K18A 3GRXA 4XCSA 5D9WA 3NZNA 3J7Yb 3TRQA 4L5LA 2FGXA 2P5RA 4K1FA 9GSSA 4IJIA 2PVQA 3FRCA 4POMA 2CVDA 3LXTA 2J23A 2CAIA 1X9SB 1GUMA 5AIVA 2O87A 1XWBA 2KOKA 3O76A 3LJRA 2FY6A 5JCGA 2ZCTA 4WETA 2HZEA 1ZCPA 2OBIA 4ZIJA 3ZITA 4N0VA 3UVHA 2H6ZA 1JHBA 4JBBA 2I3YA 4TR0A 5CNWA 2IIYA 3EMPA 2O89A 4OO5A 2GGTA 4RUVA 4DSSB 5HFKA 1A24A 3IAS2 4TRXA 4KDUA 4GLTA 3DRNA 2AV4A 1WE0A 3F0IA 1OC9A 2JZTA 2GZZA 1PKZA 1RK4A 2K6VA 4CW9A 1XWCA 3TJFA 1XCCA 1BX9A 5D73A 1AQWA 1AXDA 4YQVA 3TOTA 1TJDA 1GLQA 3DVWA 2OJLA 3LORA 3IAM2 2K9FA 5EPFA 2FD3A 2YP6A 4Q5RA 3GN3A 5DCHA 3F3QA 2GQLA 3VPQA 3LFLA 4HU9A 3VWVA 3VWXA 2VL9A 2HXKA 2H1GA 2EIQA 5ABRA 4HDEA 4IQAA 2X8CA 1FVJA 3M3MA 3ZZXA 3EU4A 4MZBA 3IR4A 1M9AA 4KA0A 3ERGA 1XVWA 2CVBA 3RPNA 4XS4A 2OKAA 3ED3A 3CTGA 4DSRA 4ZBBA 1F3AA 3MAKA 4D73A 3UOMA 3ZIJA 2VCWA 4ID0A 1I9DA 1QGVA 3ZLPA 4ZBDA 2OBKA 4MCUA 3UJ1A 4XS1A 4ZL9A 2AYTA 2BMXA 4CDOA 3CSIA 2C0EA 3KMOA 3H79A 5CP1A 3IK9A 3GX8A 4E8HA 1BEDA 2B7JA 1T3BA 5J3RA 1OAZA 4GXZA 1AW9A 3M1GA 3KTBA 4GRFA 1M99A 3FZAA 3MNGA 2ON5A 4GSNA 2X99A 3WT1A 1SK1A 3QR6A 4PXOA 1PX6A 1SJIA 1UA5A 3WYWA 1SK2A 17GSA 1GUHA 4ZB8A 2F9SA 3IV4A 2CZ3A 4QL7A 4OCFA 3H1NA 3HCZA 2NTOA 1DSBA 2LQOA 1VRSD 2B3SA 1GTAA 4XRAA 3F4TA 3DEXA 3L9UA 1U88A 4MK3A 3CTFA 3D21A 3BCIA 3WT2A 3KH7A 2K8SA 4TR3A 3PR8A 3BOAA 3E3EA 4HQSA 4OCEA 1TI1A 1ERTA 2N5AA 5CREA 1T00A 3R2QA 1A2LA 3GL3A 5IMAA 3CRUA 4K6XA 1ERUA 2WB9A 1ZGNA 4HZ4A 4LL4B 3P8WA 4TXOA 2IN3A 3DD3A 2FWFA 3L0HA 3UARA 5G30A 5DAKA 5J5NA 4KNDA 4PQ1A 3UBLA 3DXBA 1G7EA 1S3DA 3A2WA 2HE3A 1FVKA 2MMAA 2MZCA 2L59A 3I43A 2OE3A 1YY7A 4ACSA 1Y25A 1KBNA 4HOJA 1X9MB 4KUNA 3EWLA 3FR3A 5IO0A 5B8AA 3BCKA 2GZPA 3ZFLA 2R3XA 1SJZA 4PX1A 1M2AA 4WKWA 3TUEA 1QUWA 5HFIA 1ERVA 1A2JA 4F82A 2IMFA 5J9BA 1V98A 2R2JA 1PRXA 2XHFA 2B1KA 1TOFA 5DBQA 4FIWA 1PN9A 3CMIA 2EIRA 5J9CA 1GUKA 2R6KA 4MF6A 3KIJA 1OKDA 1MD4A 1NM3A 1KEBA 4PNGA 4GSSA 2GT5A 5CO3A 4BPYA 4PQHA 2REMA 1AC1A 2XBQA 4MZCA 5IPGA 2K8VA 2LTKA 2VUPA 2OE0A 1V57A 1EWXA 2XPEA 4DSSA 1G6YA 2EIOA 4MJCA 2YWIA 3FR6A 2IMEA 4XTSA 5EL8A 2L4CA 2C0FA 1LJRA 3L9SA 1UN2A 2FCHA 1WRYA 1YF1A 2VLUA 1NHYA 5AISA 5JWRB 1GNWA 6GSWA 3IHQA 3GKNA 3UMAA 2PBJA 5G5EA 3DYRA 2PU9C 1X9WB 1XOAA 2H72A 4ZILA 2VIMA 4N30A 1PGTA 3EE2A 1F6MC 3HXSA 2P5QA 3KP9A 2LRNA 1O81A 1GRXA 2JU5A 5CRWA 3EU3A 2H6XA 4O7HA 1TK5B 1XWKA 3M9JA 1ZOFA 4V1Ag 2FWGA 2N5BA 2KP2A 3PINA 4I5QA 4AJ8A 3TRPA 3ZMLA 3P7XA 1SYRA 2WFCA 2H30A 4O5RA 3TDGA 1JZWA 2VCZA 1TDIA 3E0UA 2PUKC 2C3QA 2F8AA 2DLXA 1M2DA 5D96A 1RQMA 5LD0A 1ABAA 3A3TA 4HEA2 2HZFA 1X5CA 5HR1A 3D4MA 2I4AA 2GQMA 4KGIA 4HQZA 1B9YC 2H76A 4TN8A 2CX4A 1R5PA 3IC4A 1THXA 3HJPA 1R7HA 3TKSC 2V32A 3G7IA 2RM5A 2PERA 3G7JA 2L5LA 4K7OA 2L6CA 1U87A 1XW6A 4ULXA 2AJQB 2L4QA 1GWCA 4JRRA 2H1BA 1K3LA 2A2SA 2DMLA 2YWNA 1GH2A 2FUG2 3GURA 5IMFA 2H70A 5GSTA 12GSA 5G1KA 2C0DA 2DIZA 1JZRA 2GSQA 3QPMA 3VPTA 5G2ZA 5GAND 1MD3A 2JZSA 5GZZB 2HFDA 1T8EB 1VF2A 2LRCA 3KH9A 3NOFA 4EDZA 5A4UA 1GTBA 6GSVA 3IBHA 3KTLA 2C3NA 3ZTLA 3BBYA 4ECJA 5IM9A 2DSAA 1Q4JA 1HD2A 1O73A 1NHOA 1SD9A 1XWAA 2V2GA 4XS6A 4ISDA 6GSTA 3FK8A 5HR3A 1PA3A 1V58A 3C7MA 3H93A 2ON7A 3C1SA 1FAAA 1BJXA 3VFIA 3GH6A 1T4YA 2P31A 3QCPA 1OYJA 3F4SA 2VO4A 5C00A 2H01A 1WOUA 3CXGA 3QDNA 1MDKA 3APSA 2NVLA 4MABA 2MMNA 1YQ1A 1GSQA 1GSSA 3VLNA 1H75A 5HQPA 4OFNA 3A2XA 3LSZA 2VCTA 2HSYA 2LQQA 1QFNA 3OR5A 1ZMAA 2Z9SA 3CYNA 4K0NA 3F3RA 4EUYA 4NPBA 2C0GA 4Q5QA 1AQVA 4ZL7A 2GS3A 5DQSA 3L4NA 3KEBA 2F3MA 4GTUA 2YV7A 4NXIA 2J9HA 3F4RA 1HNAA 1GTUA 3FEUA 4N11A 3TGZA 1X5DA 1K0MA 3VK9A 3HJOA 3KMNA 3RHCA 4DVCA 4LL1B 5G5FA 4IN0A 1TK8B 2V1MA 1AIUA 3FY7A 5COHA 3HZ4A 4ML1A 2VL2C 5F05A 3UEMA 1SL1B 3C73A 1GLPA 2AUVA 2IMDA 5CRDA 5D8IA 2NPBA 1SJ6A 1BQ7A 3GTUB 18GSA 4F2IA 5A4WA 1GSDA 4ECBA 3E9JB 1KNGA 1XW9A 1TU8A 1TTZA 4HS1A 4MF5A 4IW9A 4EKZA 2IL3A 3N9JA 1A0RP 1WP0A 4YH2A 1JZOA 3GSTA 2ZNMA 4OWYA 2B6MA 2OA7A 4P3YB 3I6AA 1MDIA 4KB3A 5D9XA 3NIVA 5A4VA 1ZL9A 2X8HA 3M0FA 3RDWA 2YCDA 2QKEA 4XRDA 3QMXA 2VLTA 4MDCA 2DJ0A 1J0FA 1K0DA 2H71A 4O92A 2TRCP 4OD7A 2PMTA 5ECNB 1BG5A 4YAPA 3Q18A 2BJXA 1W89A 2WGRA 1O6JA 2JL4A 4BVYA 5DVBA 2YWOA 2RM6A 4ZBAA 4TXVA 1VGLA 1FW1A 2MMOA 2O85A 1EV4A 3LEFA 5B8BA 3TKPA 2GLRA 5DQYA 3LGCA 1TI3A 1TRUA 4PQIA 3TKSE 3HDCA 1ACVA 4XHMA 1Z6MA 1Z7PA 5B6NA 4I6XA 1TKDB 4IKHA 3IOSA 5KN2A 1K0OA 2GZYA 3CSHA 1O85A 5ECQB 1JZDA 3QD9A 1TRVA 3GV1A 5ELGA 2V41A 5ID2B 1GSYA 1Z7RA 3EURA 3D22A 2TIRA 1YEXA 4K8MA 1SU9A 1NSWA 1HYUA 2RUFA 3UL3A 2GQKA 3QOUA 2FWHA 2FNOA 2I81A 2HYXA 2WZ9A 4PNFA 1EZKA 2VCXA 1SD8A 5ECHB 2WS2A 2YZHA 1T1VA 3GHAA 3EVIA 2MMZA 1I5GA 5L71A 3GSSA 4WR4A 1K0BA 5B7CA 3FW2A 4WF5A 3EYTA 4MPFA 1PX7A 2PVOC 3HVSA 4ILFA 1XIYA 4BWQA 2CAQA 3LWAA 4OFTA 1E6BA 1O7UA 3WGXA 1J08A 5E59A 3PGTA 3J7Yk 2VD0A 2WDUA 3A2VA 3DGQA 1YF0A 4IP6A 4FO5A 2KP1A 3ZVJA 2DIYA 1F3BA 2CX3A 3QFBC 1SKWB 4MH3A 1ZZYA 1A23A 4I2TA 14GSA 1LU4A 3HD5A 5IMZA 3GH9A 4MZWA 5AIXA 3IK7A 2LSTA 4BA7A 3FKFA 2YZUA 4G10A 3L9VA 4RI6A 3HJMA 3S9FA 4EDYA 3DWVA 3TKRA 5AGYA 4EL1A 3BD2A 4RQXA 5EVOA 1A8YA 2TRXA 3LXZA 2KLXA 1V40A 4E8EA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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