2EIZC

Crystal structure of humanized hyhel-10 fv mutant(hw47y)-hen lysozyme complex
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Immune system/hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Critical contribution of VH-VL interaction to reshaping of an antibody: the case of humanization of anti-lysozyme antibody, HyHEL-10
pubmed doi rcsb
molecule keywords ANTI-LYSOZYME ANTIBODY FV REGION
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2007-03-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2eizC00
4OWBA 1LAAA 1JHLA 2YBIA 1QSWA 2DQCY 4ETBA 5KXLA 3LYZA 1I56A 4OW1A 3WPKA 5FHWA 1B7PA 1LZCA 2ZNXY 1GB9A 1LHLA 1IOSA 1IWZA 2ZIKA 1QUSA 4RDSA 3RT5X 3GXRA 4N1EI 4NGVA 1TBYA 1GD6A 4D9ZA 5KXKA 3RZ4A 1TAYA 2BQOA 1GFKA 1QUTA 3ZVQA 1IWVA 4E3UA 3TXGA 4KXIA 1UIDA 3AGGG 5E9RA 2BAAA 1GDWA 1D6QA 5KXNA 3WU8A 1VDPA 4H94A 3QY4A 1UCOA 4H8YA 1NBZC 4WM6A 1JJ0A 2DQJY 1ZMYL 3ZEKA 1B7LA 1VDQA 1GF0A 1H87A 4AXTA 4WLDA 5FCPA 1LMPA 3FE0A 5JENB 4QEQA 4ET8A 5KXWA 1AZFA 2XTHA 2Z12A 4P2EA 1GEZA 1IP2A 1LZGA 2BQNA 3W6CA 1YQVY 3TMWA 4HJZA 3MGWA 2I26L 4DDBA 1OUAA 4NFVA 2EPEA 4Z46A 1GBYA 3SP3A 1IY3A 4DD0A 3B0IA 1BB5A 1WQMA 4WM5A 2BQHA 1UUZC 4DYGA 4EMNA 2W1XA 3OJPA 4GCDA 4PJ2C 2G4QA 1LYOA 4TX7A 5APCA 2EQLA 3A91A 5KKIA 1GE0A 4GN5C 5LVGA 1BVXA 5FDJA 1GFTA 1JJ3A 4NGJA 1F0WA 2BLXA 1IP3A 1ZV5L 4H9CA 4LT0A 4IASA 154LA 1G7IC 4QY9A 4M6DA 4LFPA 1GB7A 5C6JA 1JISA 1HEWA 2A7DA 5HMVA 2BQDA 4WG7A 5KKJA 4BAFA 3B0KA 4KPMA 4N9RA 3CB7A 2BQBA 1GF6A 4HTKA 1UIEA 5F9XA 3B0OA 2HEBA 4NGZA 4PRUA 5B07A 1WQPA 1GFJA 1CNSA 1LSCA 5APEA 2F2NA 1GE3A 4DDAA 2MEBA 2W1MA 1EQ5A 3A34A 5C6IA 4ML7A 2G4NA 1MELL 1CJ6A 5HMJA 2DQDY 3A8ZA 5LVHA 2W1LA 1P2CC 4WL7A 1F6SA 3AZ6A 1I1ZA 2DKVA 4W96A 4M4OA 3LZTA 1LJ4A 1ZVHL 1IWXA 1GB3A 2N5ZA 1J1PY 4H93A 1HEQA 1YROA 1BQLY 4I0CA 4R0FA 1QQYA 4H9HA 4J7VA 1HSWA 5I54A 2LZ2A 1HEPA 1HEMA 4WO6A 1QDRA 5I53A 1VATA 3AGIA 1LPIA 1B0DA 4G49A 3TMXA 1UC0A 4RW2A 3P4ZA 1LSAA 1JTOL 5D5FA 1B7SA 1HMLA 2ZQ3A 1BB4A 1GB6A 4TWSA 4RLNA 5F9UA 1OUIA 4ZEEA 3IWRA 1TEWA 4CFOA 9LYZA 1GFRA 5KXSA 3FI7A 2XJWA 4Z41A 1BHZA 1GBSA 1VAUA 1GXV2 4ANRA 1HELA 1QIOA 1LJIA 1HFYA 1LHKA 2HU3A 3AW6A 4UWUA 4AGAA 5LYMA 1DZBX 3J4GA 4HV1A 4LYMA 2F30A 2Z2FA 1GB0A 3LZ2A 1NBYC 2EIZC 1LSYA 3WXUA 1IR9A 4HSFA 1C46A 1HFXA 1YANA 2VB1A 5KXXA 2HUBA 1IP5A 1YL0X 1IOTA 3W6AA 2DQGY 1C43A 4TSCA 4HJVA 4HP0A 1W6ZA 4NIJA 1UBZA 1OUEA 1IR8A 3RU5A 1VEDA 1JEFA 4J1BA 4OWAA 3B72A 1QTEA 3BKVA 4QGZA 4B0DA 4YEMA 1CKHA 1O23A 1RI8B 4BS7A 1VDSA 1OUHA 2YBJA 1T3PA 3W6FA 4XENA 4LT1A 4NSGA 5I5QA 4NSJA 1YKXX 1IOCA 1IP7A 2BQCA 3D9AC 4B49A 1B5WA 1IC5Y 1XEIA 2DQAA 1DQJC 3AYQA 5A3EA 2HEEA 1BGIA 1LMQA 1UICA 4B4JA 1XEJA 1OUCA 2GV0A 4HJYA 4OWCA 1DI3A 1H6MA 2B5ZA 1JKDA 3TXEA 2BQFA 4DDCA 1JITA 4NHQA 1HENA 2BQLA 4H9AA 4PGJB 2Z38A 1LZSA 5I4XA 1W08A 3TXJA 1YAMA 3LYMA 2X0AA 1LZ8A 1WTMA 2HEAA 3P65A 3W3EA 4NSHA 3K3TA 1INUA 1HC0A 133LA 5LVKA 1RCMA 4Z3MA 5J7CA 1JIYA 3WYHA 1HNLA 2Z18A 2ZYCA 2MEEA 4N0JA 4NGYA 1JKCA 1WTNA 3WULA 1G7LC 4WM1A 4LT2A 4HTQA 4RLMA 3AB6A 1OUJA 1XGUC 2CGIA 1LHMA 2Z2EA 3HBHA 1IY4A 2F4GA 5ILFA 2YBLA 1LZTA 3EBAB 2MEHA 4NGOA 1GB8A 3AZ4A 1B5XA 2IFFY 4CJ2A 1LMOA 1D6PA 1GF3A 4H92A 4H9FA 1RJCB 1T6VL 3BKHA 1WQOA 3CSRA 4NEBA 4PRQA 3TXKA 1JUGA 5I4YA 1B7QA 1D0LA 4ZFPA 5DLAA 3RNXA 1IOQA 4IJ4A 4B4EA 4BAPA 3EMSA 5B1FA 1DI4A 5KXZA 4XADA 1NHEA 3TXFA 4DD3A 3WU7A 2BQKA 4DT3A 1LTMA 1JJ1A 1FLQA 1G7JC 2FYDA 1IORA 1FKQA 2LYOA 3AZ5A 1ZVYB 1FDLY 4H8ZA 4B1AA 4GN4A 1GE1A 1LHIA 4I8SA 1IP1A 1OUBA 4H8XA 3A95A 2MEFA 1N4FA 4WL6A 1LZEA 3ZVQB 1LZDA 208LA 1LZ9A 3N9AA 1JWRA 4WM2A 3VWOA 3EO5A 3AW7A 4YEOA 1BB3A 2ZNWY 3A90A 1XGQC 3AGHA 4NY5A 1YIKA 5I4WA 1GBXA 4H1PA 4NGLA 1KIQC 1OP9B 3WW5A 1XGPC 3WU9A 4ETDA 3WW6A 2WARA 2YBNA 4DD2A 4ET9A 5II3A 3LYTA 3IJVA 5LAGA 1CJ7A 3TXHA 4HTNA 3N9EA 1LZ4A 1AT5A 1BWHA 3TXBA 5L9JA 2NWDX 2H9JA 3P68A 1C10A 1OQMA 1TCYA 5ILCA 3T6UA 1GEVA 1OUGA 4G9SA 4WLXA 1UIHA 3CT5A 1LZNA 2ZIJA 3WMKA 7LYZA 2YVBA 4FDYA 1HFZA 135LA 2BQEA 4TUNA 4XJDA 5DN5A 4H9BA 2G4PA 1IC4Y 5DL9A 3M3UA 1B2KA 2Z39A 4LYTA 1B5YA 4KT3A 1LZAA 1LJJA 1YKZX 1LMTA 2Y8PA 2HECA 3EXDA 1REYA 4HV2A 4NG8A 1LJHA 1GB5A 1LSGA 1LJKA 1LSPA 4NHPA 5APFA 5LVIA 1GFHA 1IR7A 1GWDA 1ALCA 1B7MA 4C5FA 1JSFA 1VFBC 4WO9A 5KXPA 1LMNA 3HBDA 1BB7A 1HHLA 1REZA 3J6KA 4NGKA 4OOTA 153LA 1RE2A 1YL1X 2D4IA 2LYZA 1GE4A 5T3FA 1DPXA 2HTXA 3LN2A 5HNLA 1VDTA 2IHLA 4U3XB 1LMCA 1LSBA 3P64A 1SQ2L 2A7FA 1UIBA 1F10A 1EQ4A 1PZYA 3IJUA 1HMKA 3GXKA 4XJHA 2LHMA 1DKKA 1LZ5A 1WQRA 4CGEA 4XJIA 5LYTA 3WXTA 2BQJA 4GCEA 4II8A 4GLAA 1WVUA 4LFXA 4PHIA 3WL2A 1LHHA 1LMAA 3AJNA 4WOAA 5F81A 5FSTA 5IDDA 3WPJA 3QE8A 3A6CY 1PS5A 1NQIA 1GF9A 5L3HA 3LHMA 1WQQA 3A94A 4NG1A 5LA8A 1IX0A 1J1OY 1UA6Y 2C8PA 3P66A 4NHTA 4GCBA 3D3DA 4W94A 4OOOA 1GFGA 1QTKA 2Q0MX 4NSIA 3LYOA 4KL7A 4DD7A 3TMUA 1JTPL 5LA5A 4YOPA 1JKAA 5F14A 5DN4A 134LA 3A3RX 4DD9A 1DKJA 2MEGA 5IELA 1QDTA 1FBIX 1GBOA 2W1YA 2DBTA 1YILA 5IHGA 4EOFA 1JSEA 2FBBA 2LZTA 4LYCA 3W6DA 4G4BA 1F6RA 1XSFA 2YSSC 1IEEA 4UWNA 4HPEA 5HQ1A 1XFPL 1LZ6A 2EKSC 3CSZA 5A3ZA 1WVVA 1BWJA 1QSAA 1TDYA 1G7HC 3ATOA 5KXTA 1IC7Y 2D4KA 5DM9A 1I20A 3ATNA 1IP4A 1AKIA 1LYSA 1IWWA 3OK0A 4QDNA 1D0KA 1YAPA 1JPOA 2Z37A 5EBHA 5L3IA 3B6LA 1GDXA 5F16A 1B9OA 1IP6A 1IO5A 1OUFA 1OUDA 1SLYA 1IIZA 4N8ZA 1D0MA 1LJEA 4NHIA 3WPLA 1XGRC 1LZ1A 2AUBA 3A93A 4WMGA 5M1YA 1LSEA 1BB6A 1CJ8A 1AM7A 1LKRA 1UACY 2MEAA 1G7MC 1KXWA 4HPIA 4NGIA 3ULRA 1GPQC 4ZIXA 1GF7A 1HEOA 1KIPC 3WVYA 1LKSA 4B4IA 2MEDA 5KXMA 4H90A 1FLYA 1DPWA 1YAOA 4H9EA 3WUAA 4LYBA 1GFEA 2I25L 1IWUA 4XYYA 4CFPA 3HBEX 2DQIY 4X3BA 4LT3A 1GF8A 1GF4A 2BQGA 5D5CA 3A92A 4H9IA 5KY1A 1E8LA 2D91A 1XGTC 4OWEA 1AT6A 5APDA 5LIOA 4IATA 3W6EA 1CKDA 1HSXA 1IWTA 2YBHA 2ZYPA 5E4PA 4YF2A 2ZILA 1IVMA 1HF4A 1NKHA 1RFPA 2CJLA 5FELA 207LA 3CSQA 4G4CA 2DQEY 4TSBA 3N9CA 5B59A 1A2YC 1GHLA 3HFMY 1CJ9A 1HERA 1CKFA 4GCCA 3WVXA 1B7OA 1BWIA 1KXYA 1C08C 4XJBA 3TXDA 2BLYA 4CHXA 4DWXA 5HNCA 3A96A 4DC4A 3WH1A 4H91A 1LSFA 1LHJA 2DQFC 5FEKA 3TXIA 4YENA 1XEKA 1LSDA 2DQHY 1GF5A 4O34A 1LSZA 2ZWBA 1EQEA 1REXA 2HU1A 2FBDA 1FN5A 2H5ZA 2RSCA 4G4HA 1J1XY 2BQIA 1LJFA 4N5RA 2CWIA 1NDMC 1LZYA 5LAFA 1GFUA 3A67Y 1LYZA 1UIAA 1LJNA 4ETAA 2CDSA 4NWEA 3W6BA 5HLLA 1MLCE 4ETCA 2Z19A 1LJ3A 3RW8A 4WLTA 2FYCA 4MCKA 3M18B 4LZTA 3KAMA 4WLYA 1A4VA 3G3AB 4OWHA 4N1CC 1Z55A 1LYYA 4Z98A 1B5ZA 5KXRA 1DI5A 1C45A 1GAZA 3QNGA 1JKBA 1LOZA 1UIGA 4WG1A 4DD1A 1UIFA 3A6BY 4MR1A 193LA 4GLVA 1GBWA 1GFAA 2ZQ4A 1REMA 2F4AA 3E3DA 1B7RA 2HEFA 4XN6A 5LYZA 5LXWA 2PC2A 2HEDA 6LYTA 4XJFA 1FLUA 3CQLA 4J0LA 1LCNA 4MSTA 1EL1A 1LSNA 1C7PA 4GN3A 194LA 1YKYX 2C8OA 4UWVA 1B5VA 5C6LA 3A3QA 6LYZA 5KJ9A 5KXOA 1NF5A 2BQAA 1GXXA 2MECA 4R6CA 2XBSA 2YDGA 3G3BB 1D9UA 3CT0A 1NDGC 2I6ZA 4WM3A 4C3WA 4XJGA 2D6BA 4LYZA 3WUNA 1KXXA 1V7TA 1GE2A 1GFVA 2H9KA 8LYZA 1GB2A 2XBRA 4NHSA 1YAQA 4J1AA 4TTDA 1LZBA 1DXJA 1CKCA 1BVKC 1WQNA 132LA 4GCFA 5K7OA 3TMVA 1B5UA 1GBZA 2MEIA 4A7DA 1LZRA 1FKVA 1V7SA 4PPOA 3F6ZA 4BADA 1IWYA 3WUMA 3T36A 2YBMA 2BQMA 4LGKA 3AZ7A 1B7NA 4NGWA 4FJRA 5AMYA 5B06A 1LJGA 1KIRC 4ETEA 1CKGA 4YM8A 5B05A 4L41A 5B1GA 1JTTL 3CT1A 1GAYA 1LSMA 4LYOA 4RW1A 5KXYA 1NMMA 5LINA 5LVJA 4NWHA 2D4JA 2LYMA 2BPUA 4WM4A 1FLWA 1NWGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QSWA 1I56A 3OE6A 1L01A 4RDSA 3OE8A 4NGVA 1L83A 5KXKA 1C66A 1L76A 1GFKA 1QUTA 4LDOA 1L77A 2OTZX 3WU8A 1JJ0A 2RBOA 1ZMYL 1B7LA 1VDQA 1L80A 3HT6A 5FCPA 1PQOA 1LMPA 1L66A 5JENB 1L06A 1IP2A 3W6CA 1L09A 1OUAA 4Z46A 1BB5A 3C81A 1UUZC 1G0PA 4EMNA 4GCDA 4PJ2C 3A91A 2G4QA 3JR6A 2EQLA 5KKIA 4ARQA 5FDJA 1F0WA 2BLXA 4LT0A 1G7IC 1HEWA 1P7SA 5HMVA 4WG7A 3B0KA 1L13A 4KPMA 1QT4A 2BQBA 4HTKA 1UIEA 1CNSA 5APEA 249LA 1GE3A 4DDAA 1EQ5A 3HUKA 2G4NA 1CJ6A 2OE7X 248LA 2DQDY 1CV0A 1P2CC 4WL7A 1P2RA 3AZ6A 3HUQA 1CTWA 1P6YA 1IWXA 1QQYA 141LA 3C7YA 1HEMA 2RH1A 1QDRA 1LPIA 1B0DA 1D9WA 1G0MA 3TMXA 1UC0A 3SBBC 1JTOL 5D5FA 1HMLA 2ZQ3A 4ZEEA 252LA 1GFRA 1L89A 3FI7A 2XJWA 4Z41A 1VAUA 1L93A 1DZBX 3L64A 2B6XA 256LA 160LA 214LA 4HSFA 4S0WA 1HFXA 1IP5A 4TSCA 1OUEA 157LA 1OV7A 1JEFA 4OWAA 185LA 4W52A 4YEMA 2YBJA 4NSGA 1IOCA 3C80A 4ARLA 1BGIA 1H6MA 4H9AA 1LZSA 1W08A 4DQ5A 196LA 3TXJA 3LYMA 3HUAA 2HUKA 3P65A 3W3EA 4NSHA 1L04A 3OE0A 5LVKA 1RCMA 4Z3MA 5J7CA 1JKCA 1CV5A 1WTNA 3WULA 1G7LC 3AB6A 1C6DA 1XGUC 1LHMA 2Z2EA 1IY4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4OWB A;  1LAA A;  1JHL A;  2YBI A;  1QSW A;  2DQC Y;  4ETB A;  5KXL A;  3LYZ A;  1I56 A;  4OW1 A;  3WPK A;  5FHW A;  1B7P A;  1LZC A;  2ZNX Y;  1GB9 A;  1LHL A;  1IOS A;  1IWZ A;  2ZIK A;  1QUS A;  4RDS A;  3RT5 X;  3GXR A;  4N1E I;  4NGV A;  1TBY A;  1GD6 A;  4D9Z A;  5KXK A;  3RZ4 A;  1TAY A;  2BQO A;  1GFK A;  1QUT A;  3ZVQ A;  1IWV A;  4E3U A;  3TXG A;  4KXI A;  1UID A;  3AGG G;  5E9R A;  2BAA A;  1GDW A;  1D6Q A;  5KXN A;  3WU8 A;  1VDP A;  4H94 A;  3QY4 A;  1UCO A;  4H8Y A;  1NBZ C;  4WM6 A;  1JJ0 A;  2DQJ Y;  1ZMY L;  3ZEK A;  1B7L A;  1VDQ A;  1GF0 A;  1H87 A;  4AXT A;  4WLD A;  5FCP A;  1LMP A;  3FE0 A;  5JEN B;  4QEQ A;  4ET8 A;  5KXW A;  1AZF A;  2XTH A;  2Z12 A;  4P2E A;  1GEZ A;  1IP2 A;  1LZG A;  2BQN A;  3W6C A;  1YQV Y;  3TMW A;  4HJZ A;  3MGW A;  2I26 L;  4DDB A;  1OUA A;  4NFV A;  2EPE A;  4Z46 A;  1GBY A;  3SP3 A;  1IY3 A;  4DD0 A;  3B0I A;  1BB5 A;  1WQM A;  4WM5 A;  2BQH A;  1UUZ C;  4DYG A;  4EMN A;  2W1X A;  3OJP A;  4GCD A;  4PJ2 C;  2G4Q A;  1LYO A;  4TX7 A;  5APC A; 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 4MCK A;  3M18 B;  4LZT A;  3KAM A;  4WLY A;  1A4V A;  3G3A B;  4OWH A;  4N1C C;  1Z55 A;  1LYY A;  4Z98 A;  1B5Z A;  5KXR A;  1DI5 A;  1C45 A;  1GAZ A;  3QNG A;  1JKB A;  1LOZ A;  1UIG A;  4WG1 A;  4DD1 A;  1UIF A;  3A6B Y;  4MR1 A;  193L A;  4GLV A;  1GBW A;  1GFA A;  2ZQ4 A;  1REM A;  2F4A A;  3E3D A;  1B7R A;  2HEF A;  4XN6 A;  5LYZ A;  5LXW A;  2PC2 A;  2HED A;  6LYT A;  4XJF A;  1FLU A;  3CQL A;  4J0L A;  1LCN A;  4MST A;  1EL1 A;  1LSN A;  1C7P A;  4GN3 A;  194L A;  1YKY X;  2C8O A;  4UWV A;  1B5V A;  5C6L A;  3A3Q A;  6LYZ A;  5KJ9 A;  5KXO A;  1NF5 A;  2BQA A;  1GXX A;  2MEC A;  4R6C A;  2XBS A;  2YDG A;  3G3B B;  1D9U A;  3CT0 A;  1NDG C;  2I6Z A;  4WM3 A;  4C3W A;  4XJG A;  2D6B A;  4LYZ A;  3WUN A;  1KXX A;  1V7T A;  1GE2 A;  1GFV A;  2H9K A;  8LYZ A;  1GB2 A;  2XBR A;  4NHS A;  1YAQ A;  4J1A A;  4TTD A;  1LZB A;  1DXJ A;  1CKC A;  1BVK C;  1WQN A;  132L A;  4GCF A;  5K7O A;  3TMV A;  1B5U A;  1GBZ A;  2MEI A;  4A7D A;  1LZR A;  1FKV A;  1V7S A;  4PPO A;  3F6Z A;  4BAD A;  1IWY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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