The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
69
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structure length |
69
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Chain Sequence |
GSSGSSGRTVKALYDYKAKRSDELTFCRGALIHNVSKEPGGWWKGDYGTRIQQYFPSNYVEDISGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system, hydrolase
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| source organism |
Mus musculus
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| publication title |
Solution structure of the SH3 domain from Phospholipase C, gamma 2
rcsb |
| molecule keywords |
Phospholipase C, gamma 2
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| total genus |
7
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| structure length |
69
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| sequence length |
69
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| ec nomenclature |
ec
3.1.4.11: Phosphoinositide phospholipase C. |
| pdb deposition date | 2007-03-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EGE A; 2J05 A; 2YSQ A; 4J9F A; 4RTZ A; 2K79 A; 2KYB A; 1UTI A; 1X2K A; 1FMK A; 1CKB A; 3I35 A; 2YT6 A; 2QDL A; 1H8K A; 1I1J A; 3M0P A; 1PRM C; 2F2X A; 3KFV A; 4GBQ A; 4F16 A; 4DEY A; 4J9G A; 2DYB A; 2J7I A; 4Y92 A; 2CH4 W; 2CDT A; 1QKW A; 1WXU A; 2LQW A; 3M0S A; 2FRW A; 1GCQ A; 2BZ8 A; 1OPK A; 3UA6 A; 1IO6 A; 3VS7 A; 1YWO A; 3NPF A; 4HCK A; 2FPE A; 3M0U A; 2H8H A; 5IH2 A; 1OPL A; 2RQT A; 2HCK A; 2KT8 A; 3TSZ A; 2RQV A; 2GQI A; 2SEM A; 4AG2 C; 3QWX X; 2K9G A; 2DBM A; 4X1V A; 2CT4 A; 1BK2 A; 5FWB A; 1WFW A; 2CSI A; 5I11 A; 3FJ5 A; 1M8M A; 1YN8 A; 2G6F X; 5FWC A; 1WXB A; 2HDA A; 2KBT A; 3O5Z A; 2FO0 A; 2D8H A; 3EG1 A; 1RLQ C; 2BZY A; 4D8D A; 3TSW A; 4JPB W; 3U23 A; 5L23 A; 2KGT A; 2LQN A; 1I0C A; 3H0H A; 1MV0 B; 2EYZ A; 2ROT A; 2AKK A; 4RTT A; 3REB B; 1KIK A; 1M30 A; 1NYG A; 1KSW A; 2FRY A; 1JXO A; 1K0S A; 1RLP C; 1AOJ A; 2EGA A; 1WYX A; 2DMO A; 4LUD A; 1YCS B; 2B86 A; 2D0N A; 3GBQ A; 4J9C A; 4RUG A; 5HCK A; 2DL5 A; 2FPF A; 2RF0 A; 5IHK A; 4F17 A; 1WLP B; 4AFQ C; 3I5S A; 3I5R A; 4OMN A; 4J9E A; 3EG0 A; 1AZE A; 2J06 A; 3M0R A; 1YP5 A; 2K6D A; 1UEC A; 3H0F A; 5ECA A; 1G2B A; 1JXM A; 1PRL C; 5FW9 A; 2FPD A; 4FSS A; 1ZSG A; 2RN8 A; 3C0C A; 1K4U S; 2DA9 A; 2OAW A; 1GL5 A; 2HSP A; 3CQT A; 1U5S A; 1X43 A; 2AZV A; 1B07 A; 2DLP A; 2JS0 A; 1ABO A; 1K76 A; 2DIL A; 1QWE A; 2LX7 A; 3LH5 A; 1WIE A; 4RTV A; 1PNJ A; 1QCF A; 2A37 A; 1M3C A; 1CKA A; 2M0Y A; 1ZBJ A; 3TVT A; 1T0H A; 1A0N B; 2RNA A; 4WCI A; 1B3Q A; 1M27 C; 1UHC A; 2EBP A; 1ZUU A; 2KYM A; 1NM7 A; 2W10 A; 2HBW A; 1SHG A; 1OOT A; 1N5Z A; 1VA7 A; 1JEG A; 1H3H A; 4J9B A; 1BBZ A; 2ROL A; 4RTW A; 2EKH A; 2GBQ A; 2C0I A; 3RBB B; 2DF6 A; 2EYW A; 1HSQ A; 2JMA A; 2LP5 A; 2L0A A; 1K9A A; 2ECZ A; 2V1Q A; 2CT3 A; 1UJ0 A; 1PWT A; 1SHF A; 4HVV A; 3H0I A; 1GCP A; 1X69 A; 2RQW A; 2CRE A; 1UGV A; 2O2O A; 1WXT A; 2MIO A; 2DX1 A; 2PZ1 A; 1TG0 A; 1UDL A; 1NYF A; 1UUE A; 1XOV A; 4CC2 A; 2LMJ A; 2D8J A; 2VVK A; 4JJC A; 1KJW A; 2EPD A; 2A28 A; 1RUW A; 4ESR A; 1S1N A; 1SEM A; 2RMO A; 1JO8 A; 2L2P A; 2X3W D; 4QT7 A; 2EGC A; 1U06 A; 5GJW B; 4JJB A; 2KR3 A; 1ZUY A; 4M4Z A; 1TUD A; 2MOX A; 2DVJ A; 2KXD A; 4HVW A; 2P4R A; 1X6G A; 2J6O A; 4IIO A; 2JT4 A; 2LJ3 A; 3EHR A; 1VYT A; 2ED0 A; 1M3A A; 3SEM A; 3VS1 A; 2LZ6 B; 3RNJ A; 1JQQ A; 1X6B A; 2A08 A; 2JW4 A; 3EG3 A; 1RI9 A; 5GJV B; 3JV3 A; 2KRN A; 1T0J A; 2OJ2 A; 3THK A; 2K7A A; 1GFD A; 1MUZ A; 4AFU C; 4DEX A; 1NEG A; 2DJQ A; 2BZX A; 2BTT A; 4RTU A; 4AFS C; 3VS2 A; 1E6G A; 2KRM A; 3PVL A; 4E6R A; 2AZS A; 2I0N A; 3IQL A; 1M3B A; 4A63 B; 1UG1 A; 2PNI A; 2DBK A; 2MCN A; 5IHI A; 5EC7 A; 4CC7 A; 4LNP A; 2HEQ A; 4LN2 A; 2L3Q A; 3PE0 A; 1AWO A; 2NWM A; 1V1C A; 1OEB A; 4OMQ A; 4AFZ C; 1Y57 A; 2ENM A; 3NGP A; 1K0X A; 2X3X D; 4JJD A; 2PTK A; 2GTO A; 2O31 A; 2EYX A; 2O9S A; 2JMC A; 1WX6 A; 4Z89 A; 3A98 A; 2DL7 A; 3ZL7 C; 2EVR A; 2EYY A; 1E6H A; 2VKN A; 4AG1 C; 2EQI A; 1NLO C; 3M0Q A; 2KRO A; 2RQR A; 3NHN A; 1BB9 A; 2J6F A; 3UF4 A; 1AD5 A; 1YNZ A; 2F2V A; 2KEA A; 1GBQ A; 2W0Z A; 4Z88 A; 3NMZ C; 3VRY A; 3VS6 A; 3UA7 A; 3VS3 A; 1KFZ A; 4HVU A; 1GCQ C; 4J9H A; 2FG0 A; 1QLY A; 2F2W A; 1AEY A; 1G83 A; 1GRI A; 3PVQ A; 2K3B A; 1VYU A; 2LJ1 A; 1PKS A; 1HD3 A; 4OMM A; 2DL3 A; 1Z9Q A; 2DM1 A; 5IXF A; 4IIM A; 2EW3 A; 2OI3 A; 4ORZ A; 1QWF A; 2C0T A; 1WI7 A; 2LCS A; 5IHN A; 4LE9 A; 4OMP A; 4D8K A; 1SRM A; 2GGR A; 4EIK A; 2XMF A; 2KE9 A; 1JU5 C; 1NLP C; 1SPK A; 1AWX A; 1UE9 A; 2DNU A; 2CH4 A; 3QWY A; 1Z9Z A; 3REA B; 1H92 A; 5I22 A; 1ZLM A; 1NEB A; 1AVZ C; 1ZUK A; 1CSK A; 1AZG B; 2ABL A; 3UAT A; 2JTE A; 3VS0 A; 1W1F A; 2DRM A; 1UHF A; 2CUD A; 2DL8 A; 4JZ3 A; 2YDL A; 2O88 A; 2YUN A; 3EG2 A; 4KRT A; 1FYN A; 2C0O A; 2K2M A; 3VS4 A; 1NG2 A; 2NUZ A; 2E5K A; 2JM9 A; 4R0K A; 1MV3 A; 1ABQ A; 2D1X A; 1W70 A; 2VWF A; 1LCK A; 2CSQ A; 4OML A; 2LNH B; 1UFF A; 2KRS A; 1SRL A; 2ED1 A; 1VYV A; 1ZX6 A; 1EFN A; 4CC4 B; 1X2Q A; 2KXC A; 2M51 A; 1Y0M A; 2YUP A; 2O9V A; 1K1Z A; 2AKL A; 3H41 A; 2GNC A; 2RQU A; 1ARK A; 5IXB A; 1W6X A; 1TUC A; 3VRZ A; 3I9Q A; 1PKT A; 1YWP A; 2JXB A; 2KNB B; 1BU1 A; 1X27 A; 2IIM A; 4LUE A; 4F14 A; 4HXJ A; 2LJ0 A; 1SSH A; 1QKX A; 4RTX A; 3VS5 A; 4ZNX A; 2JS2 A; 2KT1 A; 2V1R A; 4J9I A; 2GTJ A; 1PHT A; 2L3S A; 2J6K A; 1HJD A; 1UJY A; 2SRC A; 4OMO A; 2A36 A; 1WDX A; 2CUB A; 4K11 A; 1GFC A; 4GLM A; 4J9D A; 1E7O A; 2DE0 X; 1OV3 A; 2DRK A; 3ULR B; 1WA7 A; 2AK5 A; 1T3L A; 3R6N A; 2FEI A; 4Z8A A; 1GBR A; 1T3S A; 1U3O A; 2ESW A; 4RTY A; 2L3P A; 1AWJ A; 2DL4 A; 3EHQ A; 1J3T A; 1AWW A; 1I07 A; 4CC3 A; 3SHW A; 2YUO A; 3M0T A; 3EGU A; 2JM8 A; 2RPN A; 2YUQ A; 4JZ4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3P8D A; 1R0B G; 4J9F A; 1PC0 A; 4MZP A; 3OSV A; 4M7D B; 1FMK A; 2JJ9 A; 1D0X A; 1MMG A; 1VQP A; 1PRM C; 3GNF B; 4QVZ A; 3OS2 A; 1RAH B; 4GBQ A; 4F16 A; 3LLR A; 5GAN 3; 3MEU A; 2CDT A; 3CD6 A; 2BZ8 A; 4B9W A; 1Q82 U; 4EPC A; 4HCK A; 4M75 E; 2FPE A; 3V7C A; 3QDR B; 2DTO A; 3TSZ A; 2RQV A; 2LDM A; 2L3R A; 4X1V A; 2CT4 A; 2A7Y A; 5FWB A; 2RB6 A; 1WFW A; 1K8A U; 4C5I A; 5GAO m; 5I11 A; 4MDX A; 1M8M A; 5KYX A; 2RK2 A; 2G6F X; 5EG2 A; 1S72 Q; 3SWN B; 1PSE A; 3DB4 A; 1WXB A; 4MDW A; 4C0Z A; 4D8D A; 3TSW A; 2XK0 A; 4JPB W; 3M5A A; 3QII A; 4OVA A; 1YJW A; 2PVG B; 1WQ7 A; 1QVP A; 1KIK A; 2AKK A; 4RTT A; 2DXC A; 3J81 E; 4XU2 A; 1K9M U; 4O6J A; 5KYN A; 1IZ6 A; 1K0S A; 2E4H A; 1G3T A; 1Y96 A; 1KQ2 A; 1WYX A; 2DMO A; 2DJZ A; 4LUD A; 4E7Z A; 2B86 A; 2D0N A; 2DIG A; 2RF0 A; 8ATC B; 3A8M B; 3I5S A; 3L2V A; 3RDV A; 4OMN A; 3CCM T; 4A4F A; 1ZSZ A; 2V26 A; 3OYH A; 1YP5 A; 2K6D A; 2X51 A; 3GPL A; 4E7I A; 3VUB A; 1G2B A; 1I81 A; 1BI0 A; 3FEO A; 4ZGD B; 3S3O A; 2FPD A; 4XU1 A; 1ZSG A; 1UGQ B; 2FHD A; 3MPU B; 4FYX B; 4RKU E; 3C0C A; 4ATO A; 1GL5 A; 4F7U E; 1X43 A; 3FRN A; 2I2L A; 3QG1 A; 1RAG B; 5FLX E; 3TCJ A; 5A0D A; 2LX7 A; 2EQK A; 1PNJ A; 1VQP Q; 5LJ5 f; 1HXD A; 1OZ2 A; 4Z02 A; 1A0N B; 2H3J A; 1M27 C; 1VQK T; 3CD6 Q; 1BBZ A; 4N0A A; 2C0I A; 1M4Z A; 5LJ5 d; 1WNL A; 1Q81 R; 1UGS B; 1UJ0 A; 5GMK l; 1SKU B; 2RQW A; 4IUP A; 3OB9 A; 1F1B B; 5CKD A; 2XIC A; 4M7A E; 2F69 A; 3DLL A; 2GQV A; 4A4K A; 1TG0 A; 5A2Q E; 2V8I A; 1XOV A; 2LMJ A; 3OQ5 A; 4BY6 C; 2VVK A; 1YJW Q; 4IKF A; 4OB0 B; 2ZGW A; 1Q86 U; 1VQ9 A; 4LDU A; 2RM4 A; 1V29 B; 1YFN A; 4FYY B; 1NPP A; 2X3W D; 2K3Y A; 3G7Z A; 2WSF E; 3QYH B; 5FU6 B; 4Q5W A; 3RKX A; 1U06 A; 2EQM A; 4JJB A; 2DTH A; 3JB9 F; 2K5L A; 2DVJ A; 3QJ6 A; 2P4R A; 1YI2 A; 4M7D F; 1N27 A; 1TOV A; 2ED0 A; 2WAC A; 1I5L A; 2HNI A; 3VS1 A; 3CC7 T; 5I2S A; 2A08 A; 3RR6 A; 5GJV B; 1C6V X; 3QYG B; 5CQY A; 1KD1 U; 4KUI A; 1GFD A; 3MET A; 1ZBX A; 2GFA A; 2V8J A; 2DJQ A; 4BE0 A; 1M2V B; 4AFS C; 4PJO A; 4C8Q B; 3VS2 A; 5KCH A; 1IGU A; 2NUP B; 2I0N A; 4A63 B; 1M3B A; 3A8H B; 4X9C A; 3CCV A; 3JB9 G; 2BE9 B; 3E2U A; 3A8G B; 1M90 U; 1WHH A; 3HRS A; 4M7D G; 4LN2 A; 3S3N A; 1AWO A; 1V1C A; 2YRC A; 1Y57 A; 3VJP A; 1O9S A; 3PFS A; 3JCM h; 1Q81 U; 3M58 A; 1TS9 A; 2X3X D; 4JJD A; 4RMO A; 5LJ3 h; 2QA4 A; 2EYQ A; 2GTO A; 5DM7 R; 2BE7 D; 5KE3 A; 2A3L A; 5GAN 6; 3OYG A; 2DL7 A; 2G3R A; 5CCA A; 2EVR A; 3BFM A; 2P0Q A; 4AG1 C; 3DB3 A; 5CKH A; 2FZC B; 2AIR B; 1NLO C; 3CCQ T; 1VQ7 A; 4M77 B; 3NHN A; 5GAM d; 2J6F A; 3CCJ A; 2ZPB B; 2ATC B; 4JJN K; 3PTA A; 2R5A A; 5J39 A; 1LNX A; 3CC2 T; 1Q7Y R; 2DXT A; 1VQO Q; 4A54 A; 5A0L A; 3RER A; 2XU8 A; 4MMK A; 2OTL A; 1VQ6 A; 1GCQ C; 3LWI A; 1D0Z A; 2QK0 A; 4KT0 E; 4EMK A; 1TTH B; 4XTZ A; 5GAM h; 4PFP A; 1G83 A; 3PVQ A; 5LJ5 j; 3EGD A; 3MJX A; 2YLC A; 2LJ1 A; 1PKS A; 4OMM A; 1Z9Q A; 5IXF A; 3HRU A; 4IIM A; 1YIT T; 4JLG A; 5AT1 B; 3L2Q A; 4ORZ A; 1QWF A; 1X01 A; 2YWW A; 3PMI A; 1IRE B; 2GGR A; 2DTI A; 3CCL A; 1Z9Z A; 2CYZ B; 2OTJ A; 1ZLM A; 3ER0 A; 1ZUK A; 1VQN T; 4M7D C; 1CSK A; 1FMV A; 3UAT A; 4WTO B; 1YIJ T; 3HRT A; 2LNV A; 4KGV B; 2CUD A; 1QP2 A; 2LCL A; 4JZ3 A; 1BI2 A; 2YUN A; 3M54 A; 4BDZ A; 5GAN j; 4KRT A; 1Q82 C; 2RJE A; 3I56 T; 3CCV Q; 3V7S A; 2C0O A; 5GAN 7; 3NTH A; 1NG2 A; 4LXC A; 2NUZ A; 2QI2 A; 2E5K A; 2JM9 A; 4OP0 A; 2LCC A; 1ABQ A; 2VWF A; 2CSQ A; 2L89 A; 2KRS A; 3SDZ A; 1X2Q A; 1N8R R; 3G4S A; 3H41 A; 2GNC A; 4XAX B; 2FVU A; 2CZ7 B; 3I9Q A; 4PKC C; 5HK0 A; 3SWN C; 4AT1 B; 2QQA A; 4M75 A; 5CAI A; 4KH0 B; 2NUT A; 3OYB A; 1QKX A; 4ZNX A; 3L2U A; 2ZPH B; 4E7S A; 1K9M C; 2V1R A; 1VQ7 Q; 5DLO A; 1WDX A; 1G3Y A; 2O01 E; 3Q1J A; 3C95 A; 1E7O A; 2DE0 X; 2QEX T; 1T3L A; 2FEI A; 1PD1 A; 4Z8A A; 1VQ6 Q; 4BD3 A; 4QVC A; 2ESW A; 1YJ9 A; 1AWJ A; 2COY A; 2DL4 A; 4M78 C; 4C5E A; 3EHQ A; 1J3T A; 1KQ1 A; 4C8Q F; 5GAN g; 1I07 A; 4RCB A; 4C92 C; 2FB7 A; 1C0M A; 2LT4 A; 1X6O A; 2YSQ A; 2KYB A; 3A8O B; 2D0Q B; 3FB9 A; 4M78 A; 3HHT B; 1X2K A; 1CKB A; 2IPO B; 3I35 A; 1YHQ T; 2JNG A; 3FIF A; 1KK7 A; 2K57 A; 2VAS A; 1VQ4 T; 3CCS Q; 2FYK A; 3CMA T; 2X4X A; 1WXU A; 2DFU A; 1QP3 A; 4PNO A; 3JB9 H; 4F7U A; 1P92 A; 3D7S B; 1X75 C; 3NPF A; 1WHK A; 3M0U A; 5KYY B; 2H8H A; 4C8Q G; 5LJ5 e; 4AG2 C; 2GQI A; 2SEM A; 2LQ8 A; 4MML A; 3QWX X; 2K9G A; 2XKO C; 4F04 B; 3G6E A; 4DA4 A; 1BK2 A; 4DBR A; 4RCC A; 1N8R U; 2CSI A; 4M77 F; 5KYU A; 4OMF B; 4LD6 A; 5KCO A; 3O5Z A; 2KBT A; 3TU4 K; 3X25 B; 3CC4 A; 3EFO B; 3EG1 A; 1RL2 A; 4ME7 A; 1OU9 A; 3BDL A; 5GAN 8; 2KQW A; 2LQN A; 2O4X B; 1I0C A; 3H0H A; 3OYJ A; 3CCE Q; 1MV0 B; 4JLI A; 2ROT A; 3REB B; 3M4G A; 1NYG A; 1KSW A; 4HCC A; 2FRY A; 5GAN 4; 5CK9 A; 5GAN e; 1JXO A; 1WJQ A; 3OMG A; 4HKE A; 2DD5 A; 1YCS B; 5HCK A; 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