The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
69
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structure length |
69
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Chain Sequence |
GSSGSSGRTVKALYDYKAKRSDELTFCRGALIHNVSKEPGGWWKGDYGTRIQQYFPSNYVEDISGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain from Phospholipase C, gamma 2
rcsb |
| molecule keywords |
Phospholipase C, gamma 2
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| source organism |
Mus musculus
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| molecule tags |
Immune system, hydrolase
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| total genus |
7
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| structure length |
69
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| sequence length |
69
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| ec nomenclature |
ec
3.1.4.11: Phosphoinositide phospholipase C. |
| pdb deposition date | 2007-03-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3RBB B; 1NLP C; 1FYN A; 1SSH A; 2FPD A; 4AFU C; 4D8D A; 1K1Z A; 5GJW B; 1B07 A; 2LX7 A; 3EG1 A; 3U23 A; 2EPD A; 3PVQ A; 1X6G A; 2ECZ A; 5I22 A; 5FWC A; 1K9A A; 3M0T A; 3KFV A; 4IIM A; 1WX6 A; 1Z9Z A; 1U06 A; 1NM7 A; 2BZX A; 4RTX A; 4AFZ C; 1PRM C; 4CC3 A; 2DA9 A; 2JMC A; 5FW9 A; 1BU1 A; 2CH4 A; 1GL5 A; 3VS3 A; 1MV0 B; 3H0H A; 2DL5 A; 2YUP A; 3REB B; 2DM1 A; 2JMA A; 5IHI A; 4Z88 A; 1LCK A; 4LNP A; 4M4Z A; 5FWB A; 1NEG A; 3M0Q A; 1UHF A; 4OMM A; 1PNJ A; 1ZSG A; 2A08 A; 1WDX A; 2PNI A; 2AZV A; 2BZ8 A; 2JT4 A; 3VS5 A; 3UA6 A; 4RUG A; 1PRL C; 1YWO A; 2A28 A; 4RTY A; 4J9B A; 2ENM A; 2A37 A; 4JJD A; 1KSW A; 2VKN A; 1TG0 A; 1E6G A; 5IHN A; 1UE9 A; 1ZUK A; 2O9S A; 4J9G A; 2CRE A; 2EGA A; 2L3S A; 3M0S A; 1UEC A; 3M0R A; 2AZS A; 1GCQ C; 2JW4 A; 2M0Y A; 1OEB A; 2A36 A; 1M8M A; 4F14 A; 1WXT A; 4KRT A; 2DJQ A; 4FSS A; 2FEI A; 2FRW A; 1JQQ A; 2O88 A; 2OI3 A; 2EYZ A; 4J9E A; 1CSK A; 1J3T A; 2NWM A; 2DX1 A; 1PKT A; 2KRN A; 3IQL A; 1GFD A; 2LJ0 A; 3FJ5 A; 4AG1 C; 1T0H A; 1YN8 A; 2LCS A; 1W1F A; 2GBQ A; 3QWX X; 1H3H A; 2EKH A; 2PZ1 A; 4JPB W; 4RTW A; 1WA7 A; 4HVV A; 1B3Q A; 2FPE A; 2W10 A; 4RTT A; 2YT6 A; 2JS0 A; 1KFZ A; 1M27 C; 1FMK A; 1JEG A; 1S1N A; 2KT1 A; 2CUB A; 2LMJ A; 1I0C A; 2DYB A; 3SEM A; 3GBQ A; 1HJD A; 5IHK A; 1NLO C; 2C0T A; 2ROT A; 2L3Q A; 2EYW A; 4ESR A; 1ZX6 A; 1UJ0 A; 2LNH B; 1VYV A; 2DF6 A; 1GCP A; 1UDL A; 2DL8 A; 3UA7 A; 2NUZ A; 2B86 A; 1X69 A; 2DL3 A; 2FPF A; 4CC7 A; 2FO0 A; 4OML A; 2LZ6 B; 3NPF A; 4R0K A; 1AWW A; 4JJC A; 4JZ3 A; 2GGR A; 1AZE A; 2YDL A; 3H0I A; 1X2Q A; 2JXB A; 3VRY A; 2G6F X; 1AEY A; 1A0N B; 2HCK A; 1SRL A; 2JM8 A; 4J9H A; 1BB9 A; 3VS2 A; 2EGE A; 2HDA A; 4ZNX A; 2QDL A; 2CT4 A; 4OMN A; 2L2P A; 2RQW A; 2GNC A; 1CKA A; 2KBT A; 2HEQ A; 2F2X A; 2O9V A; 1KIK A; 2H8H A; 2V1Q A; 2KRM A; 2XMF A; 1X43 A; 2LJ3 A; 1X27 A; 2ESW A; 3ZL7 C; 1QWE A; 4AFQ C; 2K79 A; 3NHN A; 2J6K A; 3M0P A; 4RTV A; 2EYX A; 2HBW A; 2K9G A; 1UFF A; 2KR3 A; 2KNB B; 4OMO A; 4CC4 B; 4DEY A; 3EGU A; 1GRI A; 4HCK A; 2DRK A; 3SHW A; 1E6H A; 2C0O A; 1H92 A; 3I5R A; 2EYY A; 1EFN A; 3ULR B; 1E7O A; 4DEX A; 2KEA A; 2D8H A; 1NEB A; 2CSI A; 3C0C A; 1HSQ A; 1QKX A; 4ORZ A; 4CC2 A; 2O31 A; 4QT7 A; 1JXM A; 3REA B; 1WI7 A; 4X1V A; 5GJV B; 1SPK A; 2SEM A; 1UG1 A; 2KXC A; 1YCS B; 4AFS C; 1X2K A; 2DRM A; 1U5S A; 2C0I A; 4J9F A; 3VS7 A; 3LH5 A; 4LN2 A; 1OPL A; 2W0Z A; 3TSZ A; 3PE0 A; 2GTJ A; 2DIL A; 4F16 A; 2DLP A; 4RTU A; 1K76 A; 4J9D A; 3EHR A; 1SEM A; 4F17 A; 2KRO A; 5ECA A; 2YUQ A; 4J9C A; 1MUZ A; 2FRY A; 1PKS A; 1XOV A; 1YWP A; 2CSQ A; 3UAT A; 1SHG A; 4Y92 A; 1K4U S; 4Z89 A; 3NGP A; 2RQU A; 1IO6 A; 2K2M A; 2DMO A; 1QCF A; 2AK5 A; 2GTO A; 3TVT A; 2L3P A; 2KT8 A; 2KYB A; 2RPN A; 5L23 A; 1T0J A; 2DVJ A; 2KRS A; 1QLY A; 2DNU A; 2J05 A; 1UUE A; 2ROL A; 1K0S A; 2GQI A; 1NYG A; 2I0N A; 1M3A A; 1MV3 A; 3VS6 A; 4HXJ A; 4OMQ A; 2RMO A; 1X6B A; 2J6O A; 2KE9 A; 2EW3 A; 2SRC A; 4IIO A; 1AWX A; 1ZUY A; 1M3B A; 2VVK A; 1QKW A; 2LQW A; 3VS1 A; 2KYM A; 3THK A; 1AZG B; 2MOX A; 2MCN A; 1AD5 A; 2M51 A; 2K3B A; 2EVR A; 2YSQ A; 2LQN A; 2DBM A; 2DL7 A; 3H0F A; 2ABL A; 2O2O A; 1WFW A; 1YP5 A; 3A98 A; 3H41 A; 2E5K A; 2OJ2 A; 1I07 A; 2CDT A; 1KJW A; 1OV3 A; 1PWT A; 2X3X D; 4HVW A; 3I9Q A; 4LUD A; 2JTE A; 2HSP A; 2X3W D; 3O5Z A; 1AWJ A; 2KGT A; 5IXF A; 1UGV A; 1W70 A; 2AKL A; 1Z9Q A; 1UJY A; 4EIK A; 3PVL A; 4JZ4 A; 2CUD A; 2ED0 A; 4LUE A; 1BK2 A; 1ABO A; 4A63 B; 1WYX A; 1JO8 A; 1T3S A; 1UTI A; 1GBQ A; 2K6D A; 2RNA A; 3EG2 A; 2DBK A; 2CT3 A; 1QWF A; 3VRZ A; 2F2V A; 2RQT A; 5HCK A; 1V1C A; 2LJ1 A; 5IXB A; 1GFC A; 1K0X A; 3EG0 A; 2DE0 X; 1CKB A; 2RN8 A; 1OPK A; 1OOT A; 4J9I A; 1G2B A; 1W6X A; 2D1X A; 1RLP C; 3R6N A; 2ED1 A; 1ZUU A; 3M0U A; 1SRM A; 3UF4 A; 1ABQ A; 4JJB A; 3QWY A; 1ZBJ A; 1T3L A; 2D0N A; 1N5Z A; 2RQV A; 1NYF A; 3EHQ A; 2J6F A; 4WCI A; 3I35 A; 1WXU A; 2F2W A; 2RF0 A; 5IH2 A; 1ZLM A; 1ARK A; 2J06 A; 2EBP A; 2EGC A; 3TSW A; 1UHC A; 2J7I A; 1SHF A; 1PHT A; 1GCQ A; 1TUD A; 4GBQ A; 3NMZ C; 1M30 A; 4AG2 C; 1WLP B; 1AOJ A; 4GLM A; 2JS2 A; 2AKK A; 3VS4 A; 2P4R A; 1TUC A; 2OAW A; 1JU5 C; 3CQT A; 2BZY A; 1M3C A; 1GBR A; 2LP5 A; 2KXD A; 1G83 A; 2EQI A; 1WIE A; 2CH4 W; 1U3O A; 1JXO A; 2YUO A; 1BBZ A; 2RQR A; 4RTZ A; 2DL4 A; 2YUN A; 1I1J A; 1VYU A; 2FG0 A; 2D8J A; 2VWF A; 2V1R A; 1VA7 A; 1Y57 A; 3VS0 A; 2K7A A; 3I5S A; 1NG2 A; 1VYT A; 4D8K A; 2MIO A; 5I11 A; 1YNZ A; 2L0A A; 1RUW A; 2BTT A; 4Z8A A; 5EC7 A; 1HD3 A; 3JV3 A; 2JM9 A; 3EG3 A; 1H8K A; 1AWO A; 4OMP A; 1RI9 A; 2IIM A; 1WXB A; 4HVU A; 1RLQ C; 1Y0M A; 2PTK A; 4LE9 A; 4K11 A; 4E6R A; 1AVZ C; 3RNJ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QDY B; 2M0O A; 2VAS A; 5FU7 C; 3RER A; 4ZGD B; 1M90 U; 2AIR B; 1Q86 C; 3ASK A; 4OGC A; 2ECZ A; 5DLQ E; 5I22 A; 4MZM A; 4C5E A; 2PUK B; 4C5H A; 5CQX A; 1K9A A; 3KFV A; 3MO8 A; 1WX6 A; 3PMI A; 4C8Q A; 4IUV A; 5KE2 A; 2P0P A; 3OYC A; 4NL2 A; 2JMC A; 1TWB A; 1BU1 A; 1G3Y A; 1GL5 A; 1MV0 B; 2QYZ A; 4M77 F; 2DIG A; 2MF2 A; 3DB3 A; 3G71 T; 1JRI A; 4Y91 A; 4M4Z A; 1KQS P; 5FWB A; 4ZN1 A; 1NEG A; 3VUB A; 4OMM A; 1ZSG A; 3SDZ A; 1WDX A; 2AZV A; 1BIA A; 2BZ8 A; 2JT4 A; 3OS1 A; 1K8A U; 1JBM A; 4CI0 C; 4J9B A; 2OTL Q; 2V8J A; 5LJ5 d; 4XAX B; 1TSF A; 4PJO F; 2HKQ B; 3EAE A; 1K9M R; 1E6G A; 1VUB A; 2COW A; 1P92 A; 2PVD B; 1HYO A; 1RAI B; 1UEC A; 3RKX A; 1Y71 A; 3JCM d; 2HL3 A; 3CCQ Q; 2A36 A; 1VQN T; 4C8Q G; 1WXT A; 4XTZ A; 2FEI A; 2FRW A; 1TUG B; 1JQQ A; 2M16 A; 3TCJ A; 2OI3 A; 1OI1 A; 1MNE A; 2XIC A; 1CSK A; 3MEA A; 3V7R A; 2VUB A; 2EQK A; 4AG1 C; 1W1F A; 2GBQ A; 2RJF A; 1H3H A; 4JPB W; 3CPW S; 1I4K 1; 3VKI A; 4FYV B; 3HFN A; 3SD4 A; 4FYW B; 1VQ9 A; 1S72 Q; 1KFZ A; 4J83 A; 1FMK A; 2G3R A; 2LMJ A; 2DYB A; 4IUR A; 1FX7 A; 2Z0W A; 5IHK A; 2L3Q A; 1PM3 A; 1LNX A; 3UDC A; 3QPH A; 3QDF A; 4J7I A; 2DF6 A; 3G6E Q; 4GY5 A; 3EFR A; 3F70 A; 2JTM A; 1TTH B; 2GF7 A; 2E3I A; 4EMK A; 4ZGJ B; 2HD0 A; 5LJ5 h; 2DTI A; 2CZ6 B; 4B6M A; 1YJ9 A; 1MGQ A; 1YI2 A; 4FT4 A; 1UGS B; 3JCM h; 3V8L A; 3OY9 A; 3CCS A; 3PIP A; 1AEY A; 1A0N B; 3OYF A; 2HCK A; 4J5Y A; 4M77 B; 5GAN d; 4J9H A; 2EGE A; 3C12 A; 4PJM A; 3OYG A; 2QDL A; 4A4E A; 1JJ2 S; 2WSC E; 3CME A; 1KIK A; 3LH0 A; 5GMK j; 2JN0 A; 3M5A A; 2KY9 A; 2KRM A; 2XMF A; 1X43 A; 4IUT A; 4OMF B; 1X27 A; 5GAN 7; 3ZL7 C; 4XU0 A; 2XK0 A; 6AT1 B; 3M55 A; 1QVG S; 1QWE A; 3OA6 A; 5GAM j; 2J6K A; 2EJ9 A; 3M0P A; 4DBH A; 5LJ3 f; 2HBW A; 8ATC B; 2KNB B; 3EGU A; 4HCK A; 3L2Q A; 2C0O A; 4BI4 A; 5GAO r; 1SG5 A; 3I5R A; 2F1L A; 4M7D C; 4HKE A; 4MZT A; 3C0C A; 3CCR Q; 1WJQ A; 1ZHI A; 3MHX A; 1KD1 R; 2X51 A; 1N8R C; 4QT7 A; 3CC7 T; 2X4Y A; 1SF9 A; 5I21 A; 2KSS A; 3PTA A; 3VU3 C; 1MMG A; 1YCS B; 2DRM A; 4PFZ A; 3JB9 G; 5AYF A; 2FHD A; 4KGX B; 2BE7 D; 2W0Z A; 4LD6 A; 2LCL A; 1TOV A; 5GAN h; 2DLP A; 3CD6 A; 1K76 A; 1XJW B; 1VQO T; 1JJ2 P; 1I5L A; 4F17 A; 2XID A; 3L2Z A; 5IAY A; 1WPY A; 4M75 A; 1XOV A; 4M78 B; 1C6V X; 2A0F B; 2CSQ A; 3HHT B; 3CCE Q; 1SHG A; 1ZSZ C; 4Y92 A; 2P4T A; 1K4U S; 1QVG P; 1IZ6 A; 1Q86 U; 1KQ2 A; 1MMD A; 5LJ3 g; 2DMO A; 1QCF A; 1VQ9 Q; 3SFM A; 2D6F A; 1XQH A; 2DVJ A; 2DNU A; 3HTR A; 3CBM A; 2CZ7 B; 2GQI A; 3EFO A; 1MV3 A; 2ZCF B; 3H8Z A; 1X6B A; 2J6O A; 2KE9 A; 4PJN A; 4IIO A; 4C92 A; 1M3B A; 1QKW A; 3CC4 A; 4WF2 A; 2KYM A; 3THK A; 1VQL Q; 1KD1 U; 3CXC A; 2RA2 A; 2EVR A; 5CKE A; 4M75 G; 2DL7 A; 1G3S A; 2OTL T; 3EGD A; 3EH2 A; 3CCS Q; 4X34 A; 3H41 A; 1I07 A; 2CDT A; 4HVW A; 2K3X A; 3OYK A; 2YXY A; 3O5Z A; 5J39 A; 3CME Q; 3OW2 A; 3CCQ T; 2WAC A; 5CKD A; 1UJY A; 4ANJ A; 2DPP B; 2KQW A; 2R57 A; 4X9D A; 4M7A D; 2E41 A; 2QEX A; 1JO8 A; 3TQ7 P; 2K6D A; 3EG2 A; 2DBK A; 1QWF A; 2RHZ A; 2RQT A; 5HCK A; 2Y90 A; 2K3Y A; 3OMG A; 2LJ1 A; 3M53 A; 1KHI A; 3CEY A; 1GFC A; 1S72 T; 1VOM A; 3PMT A; 2RN8 A; 3JB9 I; 4J9I A; 1NPP A; 5GAO l; 2RD1 A; 3JCM b; 1UGP B; 4ZN3 A; 3LX7 A; 2COZ A; 1ZUU A; 1KG1 A; 1N8R R; 4KUD K; 1W2B A; 2VB6 A; 3G6E T; 4J6Y A; 2L3R A; 4EPC A; 1M1K C; 1VQ7 T; 1T3L A; 1N5Z A; 3P8B B; 1NYF A; 1PD0 A; 1ZBX A; 3NTK A; 4XU2 A; 3JB9 J; 2V8I A; 1WHM A; 2RH2 A; 4XK8 E; 5M9O A; 5CR2 A; 2V8K A; 2LC4 A; 2RF0 A; 2QQR A; 5IH2 A; 1ZLM A; 1ARK A; 2J06 A; 2YRC A; 4F7U F; 2EIF A; 4LDW A; 1TXQ A; 3QHS A; 1IGU A; 1Q82 R; 1SHF A; 3OQ5 A; 1M30 A; 4AG2 C; 4M7A C; 1YHQ A; 1WHK A; 3G71 Q; 4R55 A; 1R0C B; 2RHI A; 1JU5 C; 3CQT A; 3RR6 A; 2OAU A; 2BZY A; 1VQ5 A; 4M7D F; 4Q5W A; 1G83 A; 4F04 B; 2DTO A; 2DO3 A; 3MCA B; 1MHN A; 1H64 1; 4BY6 B; 3CC4 Q; 2HSE B; 2DET A; 3QG1 A; 2EYQ A; 3CPF A; 2V1R A; 1Y57 A; 2RI3 A; 2K7A A; 2VYT A; 3UT1 A; 1VQN Q; 2XKO C; 1VYT A; 4BE2 A; 1N8R U; 2MIO A; 3P8H A; 1YJN A; 2JUF A; 4PJL A; 4Z8A A; 5KCO A; 2DER A; 1EIF A; 1B34 B; 2ZPE B; 2JM9 A; 3EG3 A; 4M7A E; 4HVU A; 2ZPI B; 4M77 A; 1RLQ C; 3P8D A; 1VIF A; 2ZPH B; 1NJI C; 1NLP C; 1FYN A; 1SSH A; 2FPD A; 2YHT A; 3OYD A; 3FRN A; 3J7A F; 2MI6 A; 4AFU C; 3DB4 A; 3A8L B; 4CRI A; 4D8D A; 1K1Z A; 2H3E B; 2K57 A; 3SWN C; 3HL8 A; 4QQD A; 4PJO A; 1UEB A; 3M0T A; 4KGZ B; 1Z9Z A; 1U06 A; 2BZX A; 5D6X A; 2DA9 A; 1VQ9 T; 3A8O B; 2X4J A; 1YBY A; 4E7H A; 1NE8 A; 2YUP A; 3REB B; 1WJS A; 3VV0 A; 2CP3 A; 3KBG A; 1Q7Y R; 2PNI A; 1VQ4 A; 5GAN 8; 3VS5 A; 3UA6 A; 4JUV A; 3PFS A; 1PRL C; 4N4H A; 4RUG A; 4RTY A; 3QZ9 B; 1LPL A; 2A37 A; 1NPR A; 2HAX A; 1OZ2 A; 3L2W A; 1UE9 A; 1ZUK A; 1M1K R; 2CRE A; 2EGA A; 3OS0 A; 3OS2 A; 1GCQ C; 1I5O B; 1YJ9 T; 2RHY A; 2DXU A; 1KQS A; 3I56 A; 1YI2 T; 1M9S A; 3CCS T; 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