2ER6E

The structure of a synthetic pepsin inhibitor complexed with endothiapepsin.
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title The structure of a synthetic pepsin inhibitor complexed with endothiapepsin
pubmed doi rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 77
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1990-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2er6E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2er6E01
1RQ9A 5P11A 5P7DA 3EXOA 1XN3A 2VIEA 5P38A 3GGVA 5OZKA 1LF2A 3GGAA 3R0YA 4QJ7A 5P5OA 3NU4A 3O9AA 4EWOA 2OHSA 2AOHA 1IVPA 1EBYA 3MXDA 3OQKA 5OZ7A 3D91A 3OXWA 2JXRA 4EP2A 1YM4A 4Y5LA 5P7RA 3NDWA 2NXDA 4YD3A 4Y5MA 2H6TA 5P7OA 2P3AA 2VA6A 4L7GA 3PWMA 5P3PA 4EJLA 3S45A 1MERA 5P4OA 5P8CA 5KOSA 5OYXA 4A6CA 5ENKA 5P2VA 2ZE1A 5P34A 2FDDA 3OADA 4ZSRA 1EBZA 1FQ6A 5P68A 2VJ7A 7UPJA 5P5QA 4B77A 3K4VC 5P1XA 5E5JA 3JVWA 4Z4XA 5P3MA 3QPJA 1TQFA 3LHGA 1SH9A 4I0JA 1ODXA 5P5GA 3IGBA 1HHPA 2FGUA 1MT8A 1HOSA 1OD1A 4HLAA 5P16A 5P8KA 1HPVA 2VA7A 1YG9A 3CYXA 4H3FA 2QMPA 2ZDZA 5P25A 4F74A 5OYWA 5P89A 3ZKQA 5P08A 1IDAA 4OBJA 4HZTA 4Y5NA 3GI4A 1HSHA 4ZPFA 2VIZA 4J1KA 1HTRB 4AZYA 1UH8A 4FLGA 3G6ZA 2Z4OA 3ZKGA 2V00A 3T3CA 1HEFE 4YDFA 1A9MA 4HDPA 2FDPA 3ZL7A 4YE3A 3PMYA 2R43A 4GZFA 2OHUA 2B60A 2O40A 1HXBA 1LYWA 3FNTA 3S85A 3K5DA 4ZPGA 4Y3YA 3S43B 5P5ZA 3INHA 2G94A 4MC9A 3EM4A 5OZ6A 4HDBA 2V13A 3GI0A 5DR8A 1IZIA 5P8PA 3CIDA 1AAQA 2AOIA 3UDKA 2HPFA 3EKQA 4DJPA 3ER3E 2QMFA 1XDHA 5OZQA 3IVHA 2QU2A 1IZHA 3HVPA 4BFBA 4GJ5A 5ER2E 3GW5A 3O9FA 1A30A 5P7PA 4FSLA 5P3ZA 3RU1A 1NPAA 5P82A 3L59A 2P4JA 4GJ6A 4WY1A 5C9FA 4LBTA 5P2BA 4UPJA 4Y4DA 1SIVA 4B1CA 4B70A 1LYBB 5P7CA 5P5CA 4BELA 1HRNA 4DPIA 1HVRA 5P63A 3NDTA 3U71A 3QRVA 3KFSA 5CLMA 4DJRA 4FM6A 5P73A 4DVFA 5P33A 5OZWA 2G24A 3LITA 2I0DA 3EKYA 3Q4BA 5BRYA 4GJAA 3MXEA 4Q1YA 4EQJA 1W50A 4OD9A 5OZPA 3MWSA 5C9BA 4EXGA 3SA8A 1N49A 5KR8A 2WF3A 5P6EA 5P4VA 1EBKC 4QJAA 5P2RA 3URIA 2I4DA 3KM4A 4HE9A 4EQ0A 1SP5A 3D1XA 3PCWA 5P3DA 3RSVA 2VA5A 2BQVA 5P51A 5P6NA 4ZLSA 3KT5A 5P8JA 5P0KA 1QRPE 2ZHRA 3WZ7A 2AIDA 1SMEA 5P8OA 5P1KA 4Y48A 3N4LA 4YOBA 3IXOA 3QVCA 5P54A 5P4KA 5OZHA 5OZZA 3ER5E 1D4JA 1PFZA 5HTZA 2G69A 4I8WA 1FQ5A 3T6IA 3DOXA 5SXNA 1K6PA 1YT9A 4D8CA 1MIQA 4J0TA 5TOLA 5DR4A 1TZSA 4R93A 3PWWA 5OZGA 5HDZA 5IE1A 1PROA 5P5IA 2PC0A 5P8QA 2ER0E 4F76A 2FMBA 1ME6A 1FFIC 1MEUA 5P4WA 3EKTA 1K1UA 2ANLA 2WEZA 3OK9A 4Y45A 3T11A 4TVGA 1FMBA 5P7YA 5P4UA 5OZUA 4GJ9A 3SA7A 5P2YA 1RNEA 4PZXA 5P5XA 5P8BA 5P1TA 2RKGA 5P2CA 5OYSA 2AZCA 5OZRA 1W5YA 4JECA 1GVTA 2XFKA 5P5BA 1G2KA 3OUDA 5KR1A 5P5NA 4CKUA 2B8LA 1EC0A 3OXXA 3UDMA 4Q5MA 4HEGA 5P3CA 4X2LA 2Q63A 4OC6A 4QJ2A 1W6HA 2ER9E 2QD8A 4HVPA 9HVPA 3VV6A 1FKNA 1HSGA 1E81E 1IZDA 3R1GB 3ZKXA 1BDRA 5P61A 4K4QA 5P6KA 3L3AA 5P1WA 5EZZA 3KA2A 2ZJMA 1BWBA 5P5PA 3PBZA 3LZVA 4Y41A 3BUGA 1LS5A 4Y3WA 5P7XA 5P1OA 4J17A 1CZIE 5P1LA 4Y3PA 4K8SA 3ST5A 3S2OA 4J5JA 4OD9B 4PHVA 5P2HA 2AVQA 5P07A 1AXAA 4EHCA 5IVRA 4YHQA 5P5RA 5P0DA 5P05A 4R91A 4Y3ZA 5KQYA 1B6LA 3OTYA 5P0AA 4YD4A 5P2MA 4BFDA 1SDUA 5P3TA 3OOZA 2BPXA 1HIIA 3WB4A 2HM1A 4DUSA 1D4LA 2P3DA 2BJUA 5P87A 1B6MA 2NXMA 4FRKA 4Y51A 5P57A 2ZHSA 2AOEA 5P69A 4FRJA 2WF0A 3SM1A 1ZPAA 1Z1HA 3KFNA 5P8LA 4I1CA 5P7AA 2O4SA 2Q15A 3MSJA 5P8AA 4EJDA 3GI6A 5P42A 3SPKA 4EJKA 1NH0A 3O9DA 3D3TA 3DCKA 4FM7A 5P72A 3ZPUA 5P2GA 1SGUA 3OAGA 5P3SA 1OHRA 3QN8A 2QZKA 1FF0C 3LZYA 1C6YA 4DH6A 3TOFA 4ZE6A 1E82E 2JJJA 4GJCA 2J9KA 2Q64A 3QBHA 2WECA 2R5PA 5P7KA 2O4KA 4I0EA 1B6KA 2WEDA 4Y4BA 4Y3XA 5AHAA 2QAKA 4EP3A 3T7XA 1SDTA 3VF3A 4S1GA 5P5WA 3PLLA 5DQCA 2BBBA 3SA9A 1LF4A 1BDLA 2CEMA 1K2BA 3LNKA 4RCEA 4CPUA 5P6ZA 3BGBA 5P2AA 5P4NA 5P49A 3NXEA 3H0BA 3PWRA 5OZ1A 2UPJA 3NUJA 5OZXA 2NPHA 5OYRA 3IN4A 4FRIA 3EKWA 4U7VA 4RVXA 2AZ8A 5P0EA 1GVVA 4L7HA 1MT9A 5P0CA 5P0GA 3U7SA 3VF5A 4DQEA 4DJQA 3QVIA 5P7EA 5P0OA 5P5YA 5P27A 1KJ7A 3Q6YA 4H3JA 4F75A 5DQ2A 3VYFA 5P1AA 1D4IA 3CIBA 3OWNA 5FIVA 3IXKA 5OZYA 2IKOA 4OBDA 3DM6A 3NDXA 5P0LA 5P6DA 1PPME 5P7NA 4QJ6A 3NYGA 1K6TA 5P4MA 2HIZA 3OGQA 5OYYA 3UHLA 4L7JA 4Y3NA 4RYGA 5P78A 3GI5A 4B72A 1HPOA 4FIVA 3S43A 4CPWA 5OZ9A 2IS0A 2P83A 3PB5A 5P2SA 3LIYA 1T7KA 3OUCA 4AA9A 5P4ZA 3LIVA 3WZ6A 1IIQA 4I0IA 4CMSA 5KR2A 4EXHA 3S56A 1MVPA 5P2KA 1K1TA 3TNEA 5P0MA 5P3EA 4R92A 3VV8A 4FS4A 4YD5A 4OBHA 3LIXA 5KQFA 1EC1A 4PYVA 3F9QA 3VUCA 4OBKA 5P20A 4PEPA 5P6IA 5IVTA 1B11A 3SKFA 4NKKA 2QNNA 3OXVA 5P6OA 4DJWA 4I0HA 5UPJA 4Y3AA 2P3CA 3FIVA 3G72A 3LPKA 2FGVA 3UDYA 3VG1A 1ZAPA 5OZ4A 2G1OA 3OAGB 5OYTA 5P3NA 1TSQA 3UQUA 4LAPA 1LYBA 5HDUA 4R95A 2IRZA 5P0XA 3BVAA 1HIVA 5P2FA 3HVGA 2G20A 4Y3LA 5P31A 4B78A 5OZOA 1RPIA 1ZBGA 5P8SA 4NJSA 5HE7A 5P3FA 1DP5A 1IVQA 3KMYA 3NU9A 5P39A 5IVSA 5OZMA 1MTRA 2IGXA 4H3GA 5P2QA 3FNSA 4DQBA 5P6QA 4LXAA 3APPA 3VF7A 3EM6A 2P8HA 4GJBA 3RTNA 5P7HA 1GNMA 4Y5EA 5P7GA 5BS4A 3O9EA 5P3LA 2VNMA 1HIHA 2ZJHA 5P2LA 1W5WA 2VKMA 8HVPA 4QJ9A 3K5CA 2ZJLA 4Y4EA 5HE5A 5C9DA 3O9CA 4NJVA 3SM2A 4I11A 3EL5A 3SABA 3OGPA 5P85A 2PH6A 1BVGA 3L5BA 2WJOA 3SA4A 5P37A 1DMPA 5AGZA 3EL0A 5OZJA 1EBWA 5P7FA 2HB4A 3QRMA 1QBUA 4AMTA 1FG6C 3SACA 5P6AA 4J54A 5P6YA 2ER6E 1HVCA 5P6JA 4Y5BA 2Q11A 5APRE 4EYRA 1G0VA 3HAUA 1MRWA 4D88A 2NNKA 5P2WA 2PSVA 1PPLE 1D4SA 3L5FA 5JFPA 1KJ4A 5P65A 4NJUA 2OHTA 4YD6A 4NJTA 1EAGA 5P00A 3I2LA 4XX4A 5P3RA 5P0JA 3UQWA 4Y3EA 4J0VA 2QHYA 4M8XA 3ZKSA 3QI1A 5EZXA 1QS8A 3VYDA 4OBGA 1NPWA 3VYEA 3ECGA 5P74A 2QMGA 5P4XA 5P1EA 2XFJA 1LZQA 2AZ9A 2V10C 5P88A 5P4DA 4APEA 3RVIA 3URLA 2NMZA 5P1YA 1U8GA 3BRAA 5SY2A 1QDMA 3EKPA 3NU6A 4J0YA 5I3YA 3RTHA 3IA9A 1K6CA 4QGIA 5DGUA 1HPSA 2FXDA 4GMIA 1FFFC 5P6RA 5P8TA 3S7LA 3NU3A 4I0GA 4FCOA 5P67A 4CPQA 5P7WA 5P81A 1EPQE 2QHCA 5JODA 2EWYA 5ISJA 4Y4ZA 2I4XA 5P7ZA 4DI2A 1VIJA 2A4FA 2HS2A 5OZSA 5P0IA 3VFBA 3ZMGA 5P5AA 5P3QA 4OBFA 3OQAA 1AJXA 1ZTZA 3GGXA 1AM5A 2VIYA 5P6GA 4Q1WA 3NWXA 1GVXA 5P8IA 3DV1A 1W5VA 2OHRA 1TCWA 5HCOA 2PMAA 3UDQA 4MC1A 4M8YA 5P41A 2OF0A 2R8NA 3SA6A 5P6SA 3QRSA 4KB9A 2RSPA 1ZSFA 4Y56A 4ER1E 4FSEA 2I4QA 1GNNA 2ASIA 4Y36A 3FV3A 3OU4B 2VJ6A 3PVKA 3FKTA 4B05A 3SAAA 5P4IA 1A8KA 3VV7A 1ZPKA 2OHKA 3BVBA 3PSYA 4I0ZA 2OHQA 1KJGA 4ZSQA 5P6VA 1B5FA 3D1ZA 5P6MA 5P75A 3L5DA 4H1EA 3PMUA 1EC3A 5OYZA 5P1NA 5OZAA 3ZPTA 2P3BB 3CICA 3O9LB 5P7TA 3EMYA 5OZEA 3DJKA 4DJOA 2RMPA 1T7IA 3TPPA 5P32A 5HU1A 5P3WA 5P52A 2HPEA 3KF0A 2G1YA 3L38A 1HEGE 3BUHA 1BWAA 2F8GA 4Y3TA 4LP9A 3TPRA 1FQXA 5AH8A 4PZWA 3QS1A 5DQ1A 3NDUA 4NPTA 4DFGA 2IENA 1QBSA 4EPJA 1EPNE 4JOOA 1BILA 6UPJA 1FB7A 5P5HA 4Y58A 5P18A 5AH7A 4Y3GA 4FRSA 5P1ZA 1WKRA 4J1IA 4TRWA 3EM3A 3KMXA 4DQHA 2I1AA 5P4AA 4Y6MA 3NUOA 4APRE 3NLSA 5P23A 2O4LA 3TLHA 5P59A 5PEPA 2NNPA 3TKGA 3URJA 2G21A 5AHCA 2OHPA 3TTPA 1ODYA 5P1BA 2Q5KA 1IDBA 5DQ5A 5P0UA 4LXKA 2HB2A 5KR0A 1GKTA 2QI7A 1META 5P0FA 2QI5A 4Y35A 2AVSA 3B80A 1MRXA 3R4BA 5P62A 5P29A 4Y5PA 4FL8A 3S7MA 3JVYA 3I6OA 2NTRA 5OZFA 1BDQA 2AZBA 2PQZA 3PSUA 5I3WA 3U6AA 3S53A 4YBFA 1FQ8A 2VIJA 4R5NA 5P26A 4D85A 3AIDA 3PBDA 5P4CA 5P3YA 5JG1A 3IAWA 4ZSPA 2ZYEA 1FMUA 4NPUA 2BKSA 3INDA 5COOA 3IVIA 3PSGA 4B1DA 4Z50A 3QBFA 1ZLFA 1XL2A 4Y9WA 3INFA 2AOJA 3HZCA 4AA8A 4CPRA 1D4YA 4Y39A 1QBTA 2AVVA 3ZPSA 2G27A 2WEAA 1W5XA 3I25A 1TW7A 5HDXA 2FNSA 2R3WA 4QLHA 3SFCA 2BB9A 1MSMA 2FXEA 3OOTA 5P0NA 2PH8A 2HC0A 5P80A 5P1RA 3UFLA 2IEOA 2WF4A 1B5FB 2IQGA 4DV9A 4WTUA 1BAIA 5P2EA 5P3BA 2NR6A 3DUYA 1MESA 5P2ZA 5F00A 4J1EA 5P8VA 4DJYA 5P4LA 2XYEA 4GJDA 1W6IA 2QK5A 2JJIA 2ZGAA 3D1YA 5P60A 1GVWA 2QCIA 1BBSA 5P5MA 5P06A 3ZOVA 5CONA 2VS2A 3MSLA 1FQ7A 5P5JA 4RRNA 4ZPEA 4D89A 4Y5CA 5HVPA 3VCMA 4U7QA 1Z1RA 2HS1A 3OHFA 5DGWA 5P1FA 5P83A 4LXMA 2APRA 3RTMA 5ISKA 5P1QA 3APRE 5P30A 3Q5HA 3DV5A 1EPME 5B18A 5AH6A 4I8ZA 2NXLA 2ZJNA 4I10A 4FAFA 3H5BA 2PSGA 5P3OA 2Z54A 5P01A 5P7VA 5P7JA 2MIPA 1YTJA 3VSXA 3TPLA 3CKPA 1F34A 3TOHA 2F81A 5P64A 1HBVA 5P8HA 4Y4GA 3KN0A 5P3JA 3ZLQA 2FLEA 2R9BA 3PHVA 1C6XA 3LPJA 5P1IA 4ZSMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1RQ9 A;  5P11 A;  5P7D A;  3EXO A;  1XN3 A;  2VIE A;  5P38 A;  3GGV A;  5OZK A;  1LF2 A;  3GGA A;  3R0Y A;  4QJ7 A;  5P5O A;  3NU4 A;  3O9A A;  4EWO A;  2OHS A;  2AOH A;  1IVP A;  1EBY A;  3MXD A;  3OQK A;  5OZ7 A;  3D91 A;  3OXW A;  2JXR A;  4EP2 A;  1YM4 A;  4Y5L A;  5P7R A;  3NDW A;  2NXD A;  4YD3 A;  4Y5M A;  2H6T A;  5P7O A;  2P3A A;  2VA6 A;  4L7G A;  3PWM A;  5P3P A;  4EJL A;  3S45 A;  1MER A;  5P4O A;  5P8C A;  5KOS A;  5OYX A;  4A6C A;  5ENK A;  5P2V A;  2ZE1 A;  5P34 A;  2FDD A;  3OAD A;  4ZSR A;  1EBZ A;  1FQ6 A;  5P68 A;  2VJ7 A;  7UPJ A;  5P5Q A;  4B77 A;  3K4V C;  5P1X A;  5E5J A;  3JVW A;  4Z4X A;  5P3M A;  3QPJ A;  1TQF A;  3LHG A;  1SH9 A;  4I0J A;  1ODX A;  5P5G A;  3IGB A;  1HHP A;  2FGU A;  1MT8 A;  1HOS A;  1OD1 A;  4HLA A;  5P16 A;  5P8K A;  1HPV A;  2VA7 A;  1YG9 A;  3CYX A;  4H3F A;  2QMP A;  2ZDZ A;  5P25 A;  4F74 A;  5OYW A;  5P89 A;  3ZKQ A;  5P08 A;  1IDA A;  4OBJ A;  4HZT A;  4Y5N A;  3GI4 A;  1HSH A;  4ZPF A;  2VIZ A;  4J1K A;  1HTR B;  4AZY A;  1UH8 A;  4FLG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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