2EWYA

Crystal structure of human bace2 in complex with a hydroxyethylenamine transition-state inhibitor
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
383
structure length
374
Chain Sequence
LAMVDNLQGDSGRGYYLEMLIGTPPQKLQILVDTGSSNFAVAGTPHSYIDTYFDTERSSTYRSKGFDVTVKYTQGSWTGFVGEDLVTIPKGFNTSFLVNIATIFESENFFLPGIKWNGILGLAYATLAKPSSSLETFFDSLVTQANIPNVFSMQMCGANGGSLVLGGIEPSLYKGDIWYTPIKEEWYYQIEILKLEIGGQSLNLDCREYNADKAIVDSGTTLLRLPQKVFDAVVEAVARASLIPEFSDGFWTGSQLACWTNSETPWSYFPKISIYLRDENSSRSFRITILPQLYIQPMMGAGLNYECYRFGISPSTNALVIGATVMEGFYVIFDRAQKRVGFAASPCAEIAGAAVSEISGPFSTEDVASNCVPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-secretase 2
publication title Crystal structure of human BACE2 in complex with a hydroxyethylamine transition state inhibitor
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 374
sequence length 383
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.4.23.45: Memapsin 1.
pdb deposition date 2005-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2ewyA01
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2ewyA02
1HBVA 4ZSQA 5P4DA 5P16A 3T7XA 5EZXA 2G22A 4F73A 1HPXA 5P2VA 1K6PA 1KJFA 5P8VA 3LZSA 5SY3A 4Y4EA 4CPUA 3T11A 2FNSA 5P6IA 4PEPA 4PZXA 3BVAA 4HEGA 5C9BA 2VNNA 5P17A 3PB5A 5OZ1A 5P36A 4TVGA 1IBQA 2J9JA 3I8WA 4YD6A 3KT2A 5P3SA 2I4XA 3Q4BA 5P4ZA 1PSOE 2PSVA 2BB9A 3ZPTA 1PSNA 1GNOA 3CIBA 3HVPA 3TPJA 4EP2A 2FDDA 1APVE 1HIIA 5ISKA 1KZKA 2O4NA 5P7UA 5OZPA 1CZIE 1FF0C 5OZ5A 2XYEA 3NDUA 3S54A 3IGBA 5P8SA 4Y3LA 3QVIA 5P5OA 5P6BA 1F7AA 1BVEA 1W6IA 1Z1RA 4CPRA 2OHSA 1HTEA 2F3KA 5IS4A 2R38A 5IE1A 4Y5KA 3K4VC 4GYEA 5P26A 3PSYA 2I0DA 2HPEA 5HDXA 4Y6MA 4K4QA 5P22A 3BVBA 3CKRA 3CKPA 3L38A 4Q1WA 5P6LA 3UDNA 2P3CA 1B5FA 2HC0A 5OYXA 5OZCA 2OHQA 3GI0A 2Q64A 5P3GA 3OY4A 2PC0A 4S1GA 1ZLFA 3SA7A 1AJXA 2P3DA 3BGCA 4LXAA 1MVPA 5HCOA 3BHEA 2WF3A 2V11C 1YTHA 5P0YA 5P42A 1ZBGA 2AQUA 4J1FA 1PPME 1EEDP 5JG1A 3JVWA 5P04A 3APRE 4RCDA 3KN0A 5OYSA 5P1KA 4H3JA 2SAMA 5OZOA 1GNNA 1HPOA 5KQYA 5P3IA 3SKFA 5P1ZA 1EBWA 5P8LA 4Y4DA 5P2YA 4RRSA 1IVQA 1NSOA 1EC3A 3S85A 1C70A 5P8QA 4R91A 3NU5A 5P39A 3LIQA 2AOJA 2V16C 4Y3PA 4Y5NA 4YCKA 2AOIA 4Y5BA 5P6SA 3VV6A 2BKTA 5P4NA 1Z8CA 4NJUA 4Y4TA 2FMBA 1TZSA 3MXEA 3VSWA 5P6VA 1VIJA 4A6CA 5P40A 3DV5A 4FGXA 1HWRA 3SLZA 4L7HA 5OZAA 4J54A 4HDFA 5OYUA 2ZHTA 4XX3A 5P8RA 3EKTA 5P3XA 5P0RA 2PSGA 5P8JA 1ZPKA 1SDUA 3PBDA 5P3VA 4Y3JA 2HAHA 4DJWA 1WBMA 3OHFA 1J71A 2QI4A 5P4JA 1Q9PA 1GVXA 1OHRA 4UPJA 5P7TA 5P8TA 2AZCA 1G35A 4B77A 5CLMA 4EPJA 4DJYA 4HDBA 4I12A 3IVHA 3NR6A 3SA5A 1A8KA 1IZDA 3RVIA 4Q1YA 5DR4A 1ODXA 1YM4A 5P60A 1FB7A 5P1FA 4Y44A 7UPJA 3NU9A 4AUCA 1QBTA 4KE0A 2XFIA 3OUDB 4J5JA 1GVVA 2J9KA 5P5FA 2AIDA 5P4XA 3BXSA 4HDPA 4PYVA 2I0AA 5OZVA 4I8WA 2BBBA 2WHHA 4I0DA 4I10A 2R5PA 3LPJA 4COEA 2AOGA 3OADA 1EC2A 4GB2A 5C9DA 3HD8A 5P3KA 1HIVA 1IVPA 2G21A 1YM2A 3Q3TA 4RVJA 2R5QA 5P55A 1F34A 3O9FA 5OZEA 4AMTA 5SZ9A 2B7FA 5P5GA 2R9BA 1MRXA 4YHQA 4J1EA 4U7QA 1E82E 1HTGA 1HRNA 5ER2E 5KR8A 2ZHSA 5P64A 1TW7A 2BQVA 4OBZA 4LXMA 5P4LA 4QLHA 2RENA 1LYWA 5BRYA 2P4JA 1G2KA 5P57A 4EJKA 5P7IA 3TKWA 5DQ4A 3SM2A 3KF0A 3FX5A 3N4LA 2QMDA 3EBZA 5IVTA 2XFJA 3IXJA 5P73A 5P5WA 4B72A 3RTNA 2V13A 3VCMA 1KJ7A 3L59A 4B1EA 3OUBA 4Y37A 2WECA 1FMXA 3OXCA 5P1GA 5OZHA 5KOSA 5P0PA 1ZPAA 2P3BB 5P2LA 1W5VA 3NLSA 1SMRA 5JFUA 5OZLA 5P03A 3TH9A 1EBZA 5P25A 2ZJLA 5P78A 4I0EA 1WKRA 2I4WA 1APTE 3EM4A 1ZTZA 3CYWA 4GJ9A 1TCWA 3TTPA 3PRSA 5P7GA 5HU0A 2I1AA 4B0QA 5P3OA 2BPYA 3SQFA 5P6TA 1W5YA 5I3WA 5P8AA 3WSJA 3ER3E 5P5XA 1PFZA 2O4KA 2PWRA 3O9IA 5P01A 1C6XA 5OZNA 4DQCA 1ER8E 4GJ6A 5P0SA 4OBGA 2IKOA 3INEA 5P48A 3FNSA 5P8MA 4L7JA 2AZ8A 1MTBA 3K5FA 3CKTA 3VYDA 4GIDA 4NPTA 5BS4A 5AH9A 2BJUA 3QS1A 3K5DA 5P47A 5OZYA 2IGYA 3D91A 3GW5A 5P11A 5P2XA 2RKFA 4HE9A 3ZL7A 3ZKQA 2PH8A 4QJ9A 3VLBA 1LF4A 1UH8A 4Y5CA 1MESA 3VEUA 5P7CA 3EL0A 3VG1A 4F74A 1BWAA 5P7BA 3R0WA 4LAPA 4EJ8A 5P62A 4ZPEA 4QGIA 5P44A 2F81A 2F8GA 2P3AA 4H3FA 5P5KA 3U71A 4RYCA 1APWE 5P1XA 4QJ2A 3UDJA 1HSHA 5P0IA 5P33A 5P05A 5P7HA 1IZEA 3EKYA 1FQ8A 4NJTA 2QNPA 5P18A 4DQEA 5P3WA 2VKMA 4B05A 4LHHA 3EL9A 3IAWA 4PHVA 5P8CA 2ZE1A 4DV9A 5P88A 2FGVA 5P12A 4LBTA 3B80A 4RZ1A 3OXVA 5P0OA 3PI5A 2I4DA 1SBGA 4DJXA 4GJ5A 5TOLA 3GI4A 1FLHA 5OYTA 5P86A 3MXDA 2WEBA 3UFNA 5P3ZA 1DIFA 3EC0A 4Y3DA 5P0FA 2VS2A 1SIVA 1PROA 5P29A 3EKQA 3PJ6A 3LIYA 5P5HA 5P1WA 1EPQE 4NPUA 2HB2A 5AH8A 4X2LA 5P0LA 5P27A 5DGUA 3BUHA 1A30A 2WKZA 2ANLA 5P6DA 5P4KA 2IL2A 3LZUA 1DMPA 4FM6A 3BGBA 5P2IA 3PBZA 3VV7A 1TSQA 3F9QA 3OQKA 4Y4WA 2Q15A 3AUPA 5P7JA 5EZZA 1NPVA 2VIEA 4ER1E 5IVQA 5P0DA 2HS2A 4B78A 1BV7A 1YT9A 5AHBA 4AA9A 3QIHA 3GI5A 3O9DA 4I11A 4DJQA 3S53A 4Y3GA 2P83A 3SM1A 1G0VA 4RLDA 4D89A 5P13A 3GGUA 5P3EA 9HVPA 5P4CA 4U7VA 1FQXA 1RQ9A 4K4RA 3K5GA 1IZIA 3UDYA 1BDRA 3INDA 4OBFA 4DPFA 5OZGA 2ZYEA 2PK6A 3OUDA 2WF1A 6APRE 5COKA 2QAKA 3UQWA 3HBOA 2IGXA 2NXDA 3I6OA 2QHZA 5P75A 1XS7D 3FSMA 4N00A 1MTRA 4R92A 1BDQA 3IN4A 5P19A 3VUCA 1G6LA 4RRNA 4M8YA 3OHHA 4J0ZA 2QHYA 5APRE 1QBRA 2G1NA 5P4TA 4RGHA 5P1NA 3ZKXA 2QZWA 2PYMA 2CENA 4J17A 5KR2A 3S8IA 2QNQA 1RV7A 2VA7A 4AA8A 2UY0A 5P7MA 3EKWA 5P5LA 1M43A 3S45A 5DQ5A 5DQ1A 1SGZA 5P14A 3R0YA 3KDDA 5P1TA 1K6TA 4GMIA 3OU4A 4NJSA 5P7QA 1BXOA 1T6GA 1XL5A 1YG9A 5OZKA 5HE7A 5P38A 5HVPA 4J1KA 3QAAA 5P7RA 5P2AA 1E81E 5P41A 5P77A 4Z2ZA 4Q1XA 3PSUA 4EJLA 5KQZA 4ZPFA 3NYGA 2ZJNA 3VYFA 5P2DA 5P5RA 4DQFA 4FSEA 4Z22A 3OTYA 3T7PA 1CPIA 3O9BA 2ZGAA 5P1VA 3L5FA 4EXHA 2B8LA 3CIDA 4OC6A 5AGZA 2UXZA 4APRE 4JOOA 2OHMA 5HDZA 5AHAA 4DQHA 3UFLA 3HDKA 3S2OA 2F80A 2P3BA 5P63A 5T4SA 1LYBB 1FGCC 2V10C 1BBSA 3KYRA 4E43A 2ZHUA 1OEXA 2G69A 3ZOVA 2VIZA 1QDMA 2FDPA 2QZXA 5KR1A 1W51A 5P2EA 5AH6A 5P1HA 1HVSA 2HS1A 4EJDA 1YX9A 2WEAA 4JP9A 1LYAB 4KE1A 3Q5HA 4DUSA 5DR1A 5JFPA 3PCWA 5IVRA 1NH0A 5DR0A 4JPCA 3O9CA 3SA6A 3UQPA 2VIYA 5P7EA 3KM4A 5OZSA 4R95A 4Y51A 4I0GA 1XN2A 2H6SA 4Y45A 3D20A 5P2HA 4Y4GA 2G1YA 2JJIA 3LHGA 2QZLA 5P7XA 4CPTA 1HEFE 2H6TA 1FQ7A 5P7VA 3EL1A 5P1DA 4YCYA 3TKGA 4DPIA 3UQRA 4B1CA 3OAGB 3I2LA 3LIVA 5P3DA 2JJJA 1EPPE 3QVCA 2O4SA 4Y4UA 3IA9A 5KQXA 3URJA 3DV1A 1UPJA 5P1MA 2WF0A 5P51A 1GVWA 1ODYA 1RPIA 5P1LA 2EWYA 3SKGA 5P4RA 5P80A 1LEEA 2QD6A 5P65A 3LIXA 4Y5LA 4Y5PA 5P59A 5OZ8A 1D4JA 5COPA 5OZRA 5HDVA 1SIPA 1ENTE 4HLAA 5P7PA 4Y4ZA 4FAFA 4LP9A 5P1SA 4ER2E 5P0EA 5P6YA 4IVSA 5P0MA 1BV9A 4YDFA 1FQ5A 5P2BA 3T3CA 2NXLA 3KFNA 2WEZA 2OHKA 5P5DA 5P76A 3SPKA 4J55A 1EAGA 3PGIA 4DQGA 3DK1A 3HLOA 1B11A 4Y4BA 1EPRE 1PPKE 2QI5A 3K5CA 5P82A 5OZXA 1BIMA 3D1YA 4DFGA 3UQXA 3UTLA 3IXOA 4PZWA 5P50A 5P4YA 2AVMA 4EYRA 4KB9A 4F76A 4CMSA 5P69A 4YDGA 5P5VA 5P8KA 4I8ZA 3TOFA 3DJKA 4LC7A 1HSIA 4YBIA 4D8CA 2G26A 4FL8A 1EC1A 5B18A 5P61A 1EPLE 5P2GA 3NXEA 4FM8A 5P0JA 2OHLA 5P1EA 3VV8A 2ER0E 1D4YA 1HSGA 1KJ4A 3O9LA 3M9FA 2AZ9A 2HPFA 2IEOA 2B8VA 3S7MA 1BVGA 1MPPA 1LF2A 5AHCA 5P4EA 4EP3A 1K2BA 1META 5P06A 1APUE 2A4FA 3ZKNA 1YTGA 5P7LA 4CKUA 3LITA 2R3WA 2V00A 1HVKA 4A6BA 1RL8A 3GGVA 5P08A 3OU1B 2QK5A 1EBKC 3GGXA 5F00A 3DOXA 5OYWA 5P2NA 4Q5MA 5P7DA 2ASIA 3PLDA 3NXNA 1FQ4A 1IZHA 3NWQA 4ZIPA 1XL2A 2XFKA 1MT7A 1DP5A 3R1GB 5P2QA 3UF3A 3NDWA 1UH7A 4Y39A 3Q70A 5P54A 4Y5MA 2AODA 4FE6A 1D4HA 5P5PA 5P6CA 5OZBA 4JPEA 5P0GA 3T7QA 1MSNA 5P8GA 1QBUA 3OQ7A 3TLHA 4K9HA 4I0ZA 1B5FB 3URLA 5P5CA 3PI0A 4L1AB 5P6ZA 4KUPA 4APEA 3TPRA 2FDEA 2I4VA 4Y35A 3OXXA 1ZSFA 4CP7A 1HIHA 3PCZA 5P6OA 2QZKA 3OGQA 3KMXA 3QBHA 5P31A 4Z4XA 2QMFA 2RMPA 4A4QA 1XE5A 5OZDA 3RU1A 3BUFA 4FRSA 5I3XA 2QI7A 4ACUA 4CPWA 2O4PA 1FIVA 2ZJHA 4Y3TA 5OYYA 2BPXA 3NUJA 3S7LA 1HOSA 5P6EA 2NPHA 5P5YA 2ZHRA 3CICA 4YA8A 2NR6A 3O9GA 4QJAA 1AXAA 2QHCA 1FFIC 2VJ9A 1HVRA 2PWCA 1K6CA 1K1UA 3CMSA 5P2KA 2OAHA 2AVOA 1FMBA 5DR3A 5P87A 1GKTA 5HDUA 5P4BA 3VSXA 4Y36A 2QMPA 4EQ0A 4GZFA 4FAEA 5P7FA 2Z54A 5P2JA 3ZLQA 5P6JA 3UDKA 2B60A 3QRMA 1SDTA 1IIQA 5P5MA 5P8PA 1DAZC 4QJ7A 2G94A 1MEUA 3IVIA 5P4VA 4U8WA 5OYZA 5P5UA 1AAQA 5OZ7A 2Z4OA 4Y3YA 2MIPA 4BFBA 2RKGA 4QJ8A 1B6MA 1T7KA 1FEJC 2PK5A 3BUGA 3OXWA 4DJVA 5AH7A 2P8HA 2F3EA 3PWWA 3KFSA 1LYBA 1SH9A 3FNTA 4J1CA 5P68A 3SAAA 2FIVA 3SFCA 5I3VA 3VYEA 2QI6A 5OZMA 4D88A 1LS5A 5P0NA 3Q6YA 4OBDA 3NWXA 2PQZA 3L5DA 5P1CA 4HA5A 4TRWA 5P1BA 2FXDA 3ZKIA 3SACA 5P4MA 3TL9A 3LPIA 2JXRA 5P1AA 5P43A 4Y56A 2IENA 5P0UA 2IDWA 2BKSA 3PMYA 3SO9A 4Y47A 1T7IA 1OEWA 2PMAA 3OADB 3SA9A 2QCIA 3KA2A 5OZIA 3INHA 3MSKA 3NU4A 4WY1A 1QRPE 1NPWA 4F75A 3QBFA 1HVLA 3EM3A 4M8XA 3KMYA 4I0FA 4Y3MA 5P1JA 4FRIA 1BWBA 2ZJJA 2IS0A 4I0HA 3ZKSA 2OF0A 4PPHA 5P7SA 3S43B 5P07A 1GVUA 3K4VA 4TVHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HBV A;  4ZSQ A;  5P4D A;  5P16 A;  3T7X A;  5EZX A;  2G22 A;  4F73 A;  1HPX A;  5P2V A;  1K6P A;  1KJF A;  5P8V A;  3LZS A;  5SY3 A;  4Y4E A;  4CPU A;  3T11 A;  2FNS A;  5P6I A;  4PEP A;  4PZX A;  3BVA A;  4HEG A;  5C9B A;  2VNN A;  5P17 A;  3PB5 A;  5OZ1 A;  5P36 A;  4TVG A;  1IBQ A;  2J9J A;  3I8W A;  4YD6 A;  3KT2 A;  5P3S A;  2I4X A;  3Q4B A;  5P4Z A;  1PSO E;  2PSV A;  2BB9 A;  3ZPT A;  1PSN A;  1GNO A;  3CIB A;  3HVP A;  3TPJ A;  4EP2 A;  2FDD A;  1APV E;  1HII A;  5ISK A;  1KZK A;  2O4N A;  5P7U A;  5OZP A;  1CZI E;  1FF0 C;  5OZ5 A;  2XYE A;  3NDU A;  3S54 A;  3IGB A;  5P8S A;  4Y3L A;  3QVI A;  5P5O A;  5P6B A;  1F7A A;  1BVE A;  1W6I A;  1Z1R A;  4CPR A;  2OHS A;  1HTE A;  2F3K A;  5IS4 A;  2R38 A;  5IE1 A;  4Y5K A;  3K4V C;  4GYE A;  5P26 A;  3PSY A;  2I0D A;  2HPE A;  5HDX A;  4Y6M A;  4K4Q A;  5P22 A;  3BVB A;  3CKR A;  3CKP A;  3L38 A;  4Q1W A;  5P6L A;  3UDN A;  2P3C A;  1B5F A;  2HC0 A;  5OYX A;  5OZC A;  2OHQ A;  3GI0 A;  2Q64 A;  5P3G A;  3OY4 A;  2PC0 A;  4S1G A;  1ZLF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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