The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
3
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sequence length |
78
|
structure length |
78
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Chain Sequence |
GAMGSGVILRQEEAEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYRPASASVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis for the transforming activity of human cancer-related signaling adaptor protein CRK.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog isoform a
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
3
|
| structure length |
78
|
| sequence length |
78
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-11-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K2M A; 2HCK A; 1K1Z A; 1W1F A; 1ZX6 A; 1I1J A; 3JV3 A; 3REA B; 4J9I A; 2RN8 A; 1AVZ C; 1UEC A; 1WYX A; 2J6O A; 2D8H A; 4RTZ A; 3ULR B; 1WXB A; 2J7I A; 2DF6 A; 3KFV A; 2JTE A; 2EQI A; 4RTV A; 1K4U S; 2D1X A; 2H8H A; 4HVW A; 5FWC A; 2VWF A; 3VS0 A; 2G6F X; 3IQL A; 2EYY A; 2M51 A; 2DL3 A; 3VRZ A; 3LH5 A; 1WDX A; 4HCK A; 1WLP B; 1G83 A; 2BTT A; 1BBZ A; 2VKN A; 1K0X A; 2KNB B; 2O2O A; 2A28 A; 2EYX A; 2AKL A; 4JJC A; 2O9V A; 3EHR A; 1YCS B; 2M0Y A; 2PNI A; 3CQT A; 1JEG A; 2P4R A; 2MCN A; 1KJW A; 2LMJ A; 3I35 A; 1CKB A; 4GBQ A; 1ZSG A; 1JO8 A; 2KXC A; 4IIO A; 2L3P A; 4F16 A; 1UHF A; 2ROL A; 2JM8 A; 1CSK A; 2CUB A; 1B3Q A; 4CC3 A; 1T0H A; 5I11 A; 3EG0 A; 4LN2 A; 3REB B; 1QWE A; 5GJW B; 2RF0 A; 4J9B A; 5IHK A; 1GBQ A; 2NUZ A; 2KR3 A; 1ZLM A; 2DBK A; 3I5R A; 5L23 A; 3A98 A; 2LJ0 A; 4LNP A; 4D8D A; 2C0I A; 1SHG A; 2CT3 A; 1UUE A; 2F2V A; 2DL8 A; 1GFD A; 4KRT A; 4D8K A; 4DEY A; 1SRM A; 2YUP A; 2X3W D; 3TSZ A; 1X6B A; 1X69 A; 2MIO A; 3THK A; 3UA6 A; 2ROT A; 2CSI A; 1G2B A; 2CSQ A; 2YUN A; 5IXF A; 1UJ0 A; 3U23 A; 5EC7 A; 2KRM A; 4IIM A; 4CC2 A; 2DE0 X; 4Z88 A; 2NWM A; 3TSW A; 3ZL7 C; 1M3C A; 1CKA A; 2DRM A; 3C0C A; 2RQU A; 3H41 A; 2EGE A; 5I22 A; 2RMO A; 1YWP A; 1Y0M A; 1UTI A; 2CT4 A; 2LJ3 A; 2EYZ A; 1QKX A; 2K6D A; 1GRI A; 2YDL A; 2PTK A; 4OMN A; 2HBW A; 4AFS C; 2FO0 A; 2JM9 A; 2FRW A; 1OPK A; 2DYB A; 2IIM A; 4ORZ A; 2DVJ A; 2KRN A; 1N5Z A; 1VA7 A; 4R0K A; 1H8K A; 2J6F A; 1NYF A; 1E7O A; 1T3S A; 1AZE A; 2EKH A; 2LZ6 B; 4JJD A; 2LX7 A; 2VVK A; 2C0T A; 1SHF A; 2LQW A; 4HXJ A; 1UGV A; 2CDT A; 4A63 B; 1PWT A; 1SPK A; 3QWX X; 4AG2 C; 2DBM A; 1NLO C; 4Y92 A; 2DA9 A; 1WXU A; 2RQV A; 4Z89 A; 1H92 A; 4F14 A; 4GLM A; 3EGU A; 1BU1 A; 1WA7 A; 2DJQ A; 4OML A; 4J9F A; 1AWW A; 5ECA A; 3VS4 A; 1JQQ A; 2K7A A; 2LQN A; 2OI3 A; 3EG3 A; 4OMQ A; 2EVR A; 2HSP A; 1OV3 A; 2DL5 A; 2HDA A; 4LE9 A; 1U3O A; 2KXD A; 2KE9 A; 2BZ8 A; 4WCI A; 3H0I A; 3VS2 A; 4LUD A; 2FEI A; 3NMZ C; 1NG2 A; 1WXT A; 2CH4 W; 2FPD A; 2JS0 A; 4JZ3 A; 2DLP A; 3VS1 A; 1BB9 A; 2EGC A; 1HJD A; 1PNJ A; 2DMO A; 3RBB B; 2W0Z A; 3UF4 A; 1MUZ A; 2JT4 A; 2YSQ A; 1AWJ A; 1QCF A; 2K3B A; 2EYW A; 3NPF A; 4ZNX A; 1UE9 A; 2AZS A; 1FMK A; 4J9C A; 4J9E A; 1UJY A; 1WX6 A; 2O9S A; 2QDL A; 2V1R A; 2DX1 A; 1XOV A; 4X1V A; 3UA7 A; 4J9H A; 1ZBJ A; 4QT7 A; 1SRL A; 2JW4 A; 1FYN A; 4J9G A; 2ABL A; 1WFW A; 2RQT A; 3SEM A; 3EHQ A; 2SEM A; 4LUE A; 1W70 A; 2CUD A; 2FG0 A; 2EBP A; 1J3T A; 1M3B A; 2GGR A; 2KT1 A; 4FSS A; 3VS5 A; 4RUG A; 1VYU A; 4M4Z A; 1HSQ A; 3VS7 A; 1GCQ A; 2L3S A; 2KEA A; 1ZUK A; 4K11 A; 4RTY A; 1B07 A; 4E6R A; 3UAT A; 2C0O A; 2EGA A; 2KBT A; 4AFU C; 1X43 A; 2LP5 A; 3PVQ A; 1EFN A; 5HCK A; 1W6X A; 1AWX A; 1GCP A; 5FW9 A; 3H0F A; 2ENM A; 5IHN A; 4OMM A; 2RNA A; 2MOX A; 2RPN A; 1RUW A; 2X3X D; 1A0N B; 1M8M A; 1MV3 A; 2PZ1 A; 4CC4 B; 1PHT A; 4RTU A; 2ESW A; 1YNZ A; 2A36 A; 1Y57 A; 1OEB A; 2KYB A; 1MV0 B; 2A08 A; 1AD5 A; 1PRM C; 2A37 A; 2ECZ A; 2EPD A; 1K76 A; 2EW3 A; 4JPB W; 2OAW A; 2BZY A; 2LCS A; 2SRC A; 5IXB A; 2D0N A; 5FWB A; 1WI7 A; 2RQR A; 1JU5 C; 4RTT A; 2KGT A; 1NEG A; 2JMA A; 1NM7 A; 2KYM A; 1BK2 A; 1K9A A; 2DM1 A; 3TVT A; 3R6N A; 2JXB A; 1SEM A; 2I0N A; 2K9G A; 1ARK A; 2DL7 A; 1ABO A; 1QWF A; 1GFC A; 2JS2 A; 5GJV B; 4RTW A; 1K0S A; 3H0H A; 1T0J A; 1GL5 A; 1PKT A; 2FPE A; 2KRS A; 1U5S A; 2DNU A; 2GQI A; 2OJ2 A; 3I9Q A; 4CC7 A; 3EG1 A; 2YUO A; 1NLP C; 1KFZ A; 2DRK A; 2L0A A; 2LJ1 A; 1QLY A; 2DIL A; 1AZG B; 1ZUU A; 2HEQ A; 1AEY A; 1WIE A; 1RLP C; 1QKW A; 1TUC A; 2GTJ A; 1ZUY A; 2J6K A; 3NHN A; 1RLQ C; 2AKK A; 1I0C A; 4JJB A; 1UDL A; 2J05 A; 4F17 A; 1LCK A; 2GBQ A; 1Z9Q A; 1UHC A; 2AZV A; 1TG0 A; 1YWO A; 2L3Q A; 2J06 A; 2F2W A; 5IH2 A; 3M0S A; 3GBQ A; 1AOJ A; 2D8J A; 2KT8 A; 2JMC A; 4HVU A; 1GCQ C; 2YT6 A; 2ED1 A; 2BZX A; 3O5Z A; 3M0R A; 4ESR A; 4OMP A; 3VS6 A; 1KIK A; 2O31 A; 1SSH A; 1OOT A; 2K79 A; 3SHW A; 2L2P A; 3EG2 A; 2CRE A; 1VYV A; 1NEB A; 1T3L A; 1OPL A; 1X6G A; 2V1Q A; 4J9D A; 4AG1 C; 1M30 A; 1TUD A; 2AK5 A; 1V1C A; 3I5S A; 1ABQ A; 3NGP A; 3RNJ A; 2GTO A; 2XMF A; 2GNC A; 1YN8 A; 4OMO A; 1M27 C; 2RQW A; 1E6G A; 1JXO A; 4AFQ C; 1AWO A; 2ED0 A; 4Z8A A; 1U06 A; 3M0P A; 2KRO A; 1I07 A; 1UFF A; 2B86 A; 2CH4 A; 1HD3 A; 1GBR A; 1IO6 A; 1VYT A; 2FRY A; 1JXM A; 3M0Q A; 3FJ5 A; 4HVV A; 4EIK A; 1YP5 A; 3VS3 A; 1PKS A; 2W10 A; 2LNH B; 3PE0 A; 2E5K A; 4AFZ C; 3VRY A; 1UG1 A; 1H3H A; 5IHI A; 3M0T A; 1KSW A; 3M0U A; 2FPF A; 1NYG A; 3QWY A; 1E6H A; 4DEX A; 4JZ4 A; 1RI9 A; 1X2Q A; 1PRL C; 1S1N A; 3PVL A; 1M3A A; 1X27 A; 2F2X A; 4RTX A; 1X2K A; 2DL4 A; 2YUQ A; 1Z9Z A; 2O88 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2K2M A; 2MK5 A; 1ZX6 A; 5GMK i; 2DJZ A; 4ZN1 A; 4J9I A; 3RUX A; 3CC2 A; 3CD6 Q; 4M78 D; 1Q86 U; 3CCV T; 3HFN A; 1UEC A; 3L2W A; 2FYK A; 4LD6 A; 2NUP A; 1JBM A; 4X9D A; 4PFO A; 1VQO A; 2D1X A; 1B34 B; 4HVW A; 1ZA2 B; 3VS0 A; 4E2F B; 1IXD A; 1B7T A; 3CC4 A; 2DL3 A; 4IUR A; 1VQ8 A; 5LJ3 g; 3OYB A; 1D09 B; 3OA6 A; 5CIU A; 4OVA A; 1YIJ A; 3OW2 S; 4LDX A; 2AKL A; 4C92 A; 4JJC A; 3CCQ Q; 1YCS B; 8ATC B; 2M0Y A; 1ZBX A; 1VQP T; 1JEG A; 2LMJ A; 4F7U A; 2K5I A; 2KVQ G; 3ZEH A; 1JO8 A; 5IT9 E; 2L3P A; 3RES A; 2ROL A; 4AT1 B; 5CKD A; 5I11 A; 2QAZ A; 3T9N A; 4J9B A; 1RAC B; 1RAE B; 3EH1 A; 4ZGD B; 3CCJ A; 2LQK A; 3GLX A; 2XDB A; 2C0I A; 4KGX B; 2DVE A; 2DL8 A; 3ZFJ A; 1QVP A; 4DEY A; 3CCS T; 3MKD A; 2X3W D; 1X6B A; 1X69 A; 1Q81 C; 3UA6 A; 5LJ5 j; 1VQN Q; 2CSI A; 3WVE B; 1G2B A; 3RKX A; 2YUN A; 1UJ0 A; 3U23 A; 5EC7 A; 4IIM A; 4CC2 A; 3ZL7 C; 1VQ6 A; 1M3C A; 1CKA A; 4M77 A; 2RQU A; 3H41 A; 5I22 A; 3RKW A; 3UWN A; 2LCC A; 1UTI A; 5KE3 A; 2LJ3 A; 2BKD N; 2K6D A; 2PTK A; 1KC8 R; 2KRN A; 1QW1 A; 1NYF A; 1TTH B; 3QO3 A; 1YJW T; 1S72 A; 1TUG B; 3MP6 A; 1E7O A; 1Y71 A; 2X4Y A; 4JJD A; 2OTL Q; 3VV0 A; 4E7I A; 4MZP A; 3CD6 A; 2OTJ A; 1FMW A; 2HQX A; 4HXJ A; 1QP3 A; 1TWB A; 1SPK A; 1WJR A; 1RAB B; 1VOM A; 1XQH A; 2NYS A; 3C94 A; 3QWX X; 5KH6 A; 3M57 A; 3OYH A; 5CKB A; 1NLO C; 1WXU A; 4Z89 A; 2EJF A; 1BU1 A; 4OML A; 1AWW A; 2WSF E; 4EMK A; 3M4G A; 2KDS A; 4BDZ A; 3HKS A; 2HSP A; 1YIJ T; 4BB7 A; 3S3M A; 3GF5 A; 3PMI A; 1W4S A; 2E3H A; 3F70 A; 2KXD A; 3ER0 A; 5J3B A; 1I81 A; 3OSV A; 5KYN A; 3CCQ A; 2FEI A; 2K5F A; 1NG2 A; 4C8Q G; 4J7I A; 4JZ3 A; 2DLP A; 4QQG A; 4EDU A; 4GY5 A; 3KBG A; 5I21 A; 2VGN A; 1KQS S; 1MUZ A; 4LXC A; 1K9M U; 4OB0 B; 2C06 A; 1AWJ A; 1NZ9 A; 1YIT Q; 4TVR A; 2Y90 A; 1YHQ T; 4RG2 A; 1UE9 A; 2AZS A; 1FMK A; 4J9E A; 1UJY A; 2O9S A; 2P84 A; 2DXU A; 2QDL A; 3QXE B; 2RHU A; 4J9H A; 2EAY A; 2CKK A; 2BIV A; 2M9U A; 4JS4 A; 1FYN A; 4J9G A; 2ABL A; 1WFW A; 1M4Z A; 2RQT A; 2FG0 A; 4XTU A; 1VQN A; 1J3T A; 1M3B A; 4M75 F; 2KT1 A; 2XID A; 4NL3 A; 2DET A; 4M7D A; 4PJL A; 5CKH A; 4FYY B; 2GF7 A; 1LJO A; 2DIG A; 5FU7 C; 3J7A F; 2NUT A; 2QQA A; 1VYU A; 4B6M A; 3KXT A; 3VS7 A; 2KEA A; 1KD1 U; 1U8R A; 2QQS A; 4DBR A; 2C0O A; 2KBT A; 3MPU B; 3PVQ A; 2QEX T; 1MMN A; 1W6X A; 8AT1 B; 4M78 F; 3H0F A; 1WHL A; 2LNV A; 4OMM A; 4II1 A; 1VQM Q; 1SG5 A; 3OBW A; 2X3X D; 1PHT A; 4RTU A; 3C12 A; 3EGX A; 2ZPB B; 3JB9 J; 2OTL A; 2LCL A; 1OEB A; 2VAS A; 3G71 Q; 4MZM A; 3KUF A; 1IGU A; 3L2R A; 1PRM C; 4FW1 A; 4M75 E; 1K76 A; 1ZQ1 A; 4JPB W; 1PSF A; 2OAW A; 2QK0 A; 2LCS A; 4C0Z A; 1XJW B; 3QZ9 B; 4CRI A; 5IXB A; 2D0N A; 1NEG A; 1NM7 A; 3RER A; 1BK2 A; 2DM1 A; 2BUD A; 3CCV Q; 2JXB A; 3INZ A; 2I0N A; 1Q81 U; 1ARK A; 4ZGE B; 3A8L B; 2JS2 A; 4F04 B; 3H0H A; 2DAQ A; 4IUT A; 2FPE A; 4RCB A; 1U5S A; 2DNU A; 2OJ2 A; 4CC7 A; 2LT1 A; 4IUQ A; 1RLP C; 2OAU A; 1D1C A; 2GTJ A; 3RR6 A; 4DA4 A; 3LLR A; 2GFA A; 2J05 A; 2E70 A; 4F17 A; 4M7D B; 4M7D C; 4IUP A; 3DB3 A; 1Z9Q A; 3JAM E; 1UHC A; 1AT1 B; 1TG0 A; 1YWO A; 2RM4 A; 3P8B B; 1YIT A; 1EX4 A; 1IGQ A; 4HCC A; 2EKO A; 5GAN d; 2JMC A; 3V8L A; 1VQP Q; 3LW5 E; 4AMC A; 2BZX A; 3M0R A; 4OMP A; 2FL7 A; 1SSH A; 1OOT A; 2K5L A; 2LVM A; 2L2P A; 2CRE A; 2HQH A; 4J9D A; 1KQ1 A; 1TH7 A; 3QSU A; 2AK5 A; 3BY7 A; 2BE7 D; 1F1B B; 5KYU B; 3I5S A; 3NGP A; 1ABQ A; 2GTO A; 2XMF A; 4PKC C; 2GNC A; 2CP7 A; 2QA4 T; 4OMO A; 1U1S A; 3BFM A; 4A54 A; 2RQW A; 5KYW A; 1JXO A; 2DPP B; 3EGX B; 1VIE A; 2RHX A; 4PLI A; 3JB9 H; 3OS0 A; 2KRO A; 1I07 A; 2HKQ B; 1UFF A; 3CBO A; 2RHY A; 3CCS Q; 5CK9 A; 1IO6 A; 1MGQ A; 2K4Y A; 3A1P A; 4LDU A; 2DXT A; 3OMC A; 2ATC B; 3FJ5 A; 4HVV A; 4EIK A; 3VS3 A; 3QZ5 B; 4FIB A; 4M7D D; 4MML A; 1Q7Y U; 1IHV A; 4DBF A; 2LNH B; 3PE0 A; 1YI2 T; 1ZSZ A; 4FM4 B; 1UG1 A; 4ZGJ B; 1H3H A; 2ZAE A; 3JB9 I; 2OTL T; 2FPF A; 1M8V A; 4M78 A; 1K73 C; 1E6H A; 1WHG A; 4JZ4 A; 4RCC A; 1WQ7 A; 2MYS A; 3X28 B; 1M5Q 1; 3PVL A; 1M1F A; 4BDY A; 3OYI A; 3G71 A; 4RTX A; 2EJG A; 5I2S A; 5A0L A; 4LDW A; 4QVD A; 1YFN A; 4WF2 A; 2HCK A; 1K1Z A; 1YJW Q; 3JV3 A; 2XG8 D; 2HKN A; 1RL2 A; 1WXB A; 1UB4 A; 2VXF A; 4OF1 A; 2DZC A; 2DF6 A; 3CCV A; 2JOY A; 3EFO A; 3DB4 A; 4OB2 B; 4RTV A; 1SSF A; 5DY9 A; 1FWZ A; 1UEB A; 5GAO p; 3IQL A; 3OS1 A; 4PJN A; 3A5Z B; 3AT1 B; 2RHZ A; 1G83 A; 2BTT A; 2CGH A; 5CQY A; 4C5H A; 3CPW S; 1BBZ A; 3WVD B; 5DLQ E; 2VKN A; 1FMV A; 4Y28 E; 2KNB B; 1VQ4 Q; 2O2O A; 3UPU A; 2EYX A; 5I2M A; 3E9F A; 4D6W A; 3OYM A; 3M5A A; 4KT0 E; 3O8V A; 4BUG A; 2MCN A; 3I35 A; 2VUB A; 4DBH A; 3V8K A; 4HCZ A; 4QW2 A; 3P8H A; 2KXC A; 1B34 A; 3M54 A; 4F16 A; 1MNE A; 2V8I A; 1VQP A; 3A8M B; 4N0A C; 1B3Q A; 1K73 R; 3EG0 A; 4PJM A; 4V2S A; 4FT2 A; 4LN2 A; 1QCN A; 3HRS A; 2EQK A; 2KR3 A; 1VIF A; 1ZLM A; 5L23 A; 3I5R A; 3A98 A; 2LJ0 A; 1X75 C; 5GMK l; 4LNP A; 3BW1 A; 2CT3 A; 2QDY B; 1UUE A; 3CME T; 3DKM A; 1YHQ Q; 1GFD A; 4KRT A; 2F5K A; 4A4K A; 4D8K A; 3NTH A; 2YUP A; 3E1S A; 4IUU A; 3THK A; 4PJJ A; 2ROT A; 4NL2 A; 1KK7 A; 4L59 A; 3CCS A; 4C92 E; 4C0D B; 4C0D C; 5GAN e; 3MHX A; 1X6O A; 4PL6 A; 1JB0 E; 2P0Q A; 3CPF A; 2V26 A; 5GMK j; 1VQM T; 1XTD A; 3HPW A; 2NWM A; 3RKY A; 3RMS A; 3C0C A; 3MET A; 2M02 A; 2DZ9 A; 1Y0M A; 2D0Q B; 3TQ7 P; 2EIF A; 2E64 A; 2EYZ A; 1R0C B; 1QKX A; 1GRI A; 2YDL A; 4P5N A; 1JJ2 P; 4OMN A; 3CXC S; 4J6X A; 3EFR A; 1RAI B; 4FYW B; 2FO0 A; 2QEX Q; 1OPK A; 3R6O A; 1N5Z A; 1M2V A; 4R0K A; 3EG9 A; 2KQW A; 3QDF A; 2FZG B; 2COZ A; 3H9N A; 2L5Q A; 4BE1 A; 1N8R U; 1YJW A; 1MMA A; 1N27 A; 3MEU A; 1SHF A; 4CI0 C; 4JLG A; 4C0G A; 3L1A A; 1UGV A; 2DTO A; 2CDT A; 4A63 B; 3M59 A; 1NBE B; 1K8A C; 5GAN f; 3CPW P; 2DA9 A; 3MEA A; 4BY6 B; 2HBP A; 4BY6 C; 1RI0 A; 4FYX B; 4J9F A; 3VKI A; 3VS4 A; 4M77 E; 2K7A A; 4OMQ A; 2OI3 A; 2CP2 A; 3EG3 A; 1OV3 A; 2XI9 A; 5GAM d; 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