The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
62
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structure length |
62
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Chain Sequence |
MDETGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAGYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, brain
|
| publication title |
Cooperative propagation of local stability changes from low-stability and high-stability regions in a SH3 domain
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule tags |
Signaling protein
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| total genus |
12
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| structure length |
62
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| sequence length |
62
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-11-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3H0H A; 1AWO A; 2PZ1 A; 4RTV A; 1K0S A; 2RF0 A; 2DA9 A; 1E7O A; 3GBQ A; 2FPF A; 1AOJ A; 3QWY A; 2EQI A; 2RPN A; 5I22 A; 4OML A; 1OEB A; 1G83 A; 1NEG A; 2EGA A; 2YUO A; 5IH2 A; 3UF4 A; 4J9C A; 1AEY A; 3TSW A; 3H41 A; 1GFC A; 2AZS A; 1N5Z A; 3A98 A; 2VVK A; 3M0T A; 3VS4 A; 1LCK A; 2OJ2 A; 3VS1 A; 3VRZ A; 4LNP A; 5L23 A; 2CUB A; 2NWM A; 1ZUK A; 1UDL A; 1AZG B; 2D8H A; 2JS0 A; 1QKX A; 1WI7 A; 1AD5 A; 2DRM A; 2XMF A; 1G2B A; 2EPD A; 2AKL A; 2DX1 A; 2KXD A; 2KR3 A; 3H0F A; 1GCQ C; 3C0C A; 2DVJ A; 3O5Z A; 1UGV A; 4JJD A; 1UTI A; 2LJ3 A; 2F2X A; 1X6B A; 1CSK A; 1K76 A; 2E5K A; 3FJ5 A; 4JJB A; 1A0N B; 4JZ3 A; 2ECZ A; 4M4Z A; 2J7I A; 2PNI A; 2FG0 A; 2O88 A; 1AVZ C; 1GCQ A; 2ABL A; 2CUD A; 4OMQ A; 2HEQ A; 4QT7 A; 1VYV A; 1T0H A; 1T3S A; 1YNZ A; 4ORZ A; 5IHN A; 3THK A; 2CRE A; 1KIK A; 2DL3 A; 1H3H A; 2K2M A; 2L3Q A; 2EGC A; 1WLP B; 3I5R A; 2RNA A; 3LH5 A; 2GQI A; 2ESW A; 4RTU A; 2YT6 A; 2YDL A; 2A28 A; 5GJV B; 1CKB A; 1H92 A; 1UHC A; 4HVV A; 4LN2 A; 3PVL A; 1CKA A; 3VRY A; 5IHI A; 2F2V A; 4J9I A; 2DL5 A; 1JXO A; 1NG2 A; 1SPK A; 4Z88 A; 2DF6 A; 2EYZ A; 1WA7 A; 1ZSG A; 1SSH A; 1PRM C; 2RQU A; 5FWB A; 1TUD A; 2O2O A; 1JXM A; 1ZUU A; 2CSQ A; 1QCF A; 3VS6 A; 2EGE A; 4Z8A A; 2FPE A; 2RQR A; 1TUC A; 1UG1 A; 1I07 A; 4CC3 A; 3EHR A; 1ARK A; 2DL8 A; 1ABO A; 1U5S A; 1X43 A; 2JS2 A; 2LP5 A; 1AWJ A; 1V1C A; 2QDL A; 1RI9 A; 1X6G A; 1FMK A; 1HJD A; 3ZL7 C; 2LJ0 A; 3EG2 A; 4DEX A; 3TSZ A; 2M51 A; 2CT3 A; 1JU5 C; 2DIL A; 2HCK A; 2J06 A; 3EG3 A; 3H0I A; 4RTT A; 2KT8 A; 2A37 A; 4J9H A; 1K9A A; 1K1Z A; 2KRO A; 2DYB A; 2ED1 A; 3EGU A; 2RQT A; 4AFU C; 1IO6 A; 2J6F A; 1Z9Z A; 1B07 A; 1MUZ A; 2JT4 A; 4F17 A; 2JMA A; 1W70 A; 1T0J A; 1JO8 A; 1X2K A; 2D0N A; 2KXC A; 1PRL C; 1E6G A; 4HVW A; 2K7A A; 1M3B A; 1UHF A; 1S1N A; 4OMM A; 1HSQ A; 1M30 A; 1YWO A; 1NYG A; 2G6F X; 3TVT A; 2J6O A; 2IIM A; 2JW4 A; 2SRC A; 1SRM A; 1RLP C; 4GBQ A; 5EC7 A; 3UA7 A; 1JQQ A; 2O9V A; 3QWX X; 2EKH A; 2EW3 A; 2DLP A; 5I11 A; 1BB9 A; 1BBZ A; 2OAW A; 2FRW A; 5FW9 A; 2KT1 A; 1I1J A; 4X1V A; 2FEI A; 1VYU A; 2CH4 A; 1UJ0 A; 3VS7 A; 1K4U S; 1J3T A; 1JEG A; 4AFQ C; 2YUP A; 1OPK A; 1W6X A; 3EHQ A; 2BZX A; 2OI3 A; 2FPD A; 2HBW A; 2A36 A; 1OOT A; 1YN8 A; 3CQT A; 2W10 A; 2MOX A; 3RNJ A; 2ED0 A; 2JMC A; 2RN8 A; 3M0Q A; 2A08 A; 4AG1 C; 1ABQ A; 2L0A A; 2KRS A; 1PKS A; 1OPL A; 4GLM A; 4F16 A; 2NUZ A; 2AKK A; 1WYX A; 4D8D A; 3REA B; 4CC2 A; 2O9S A; 1GFD A; 1NLO C; 3EG1 A; 1HD3 A; 4J9B A; 4ESR A; 1T3L A; 4R0K A; 1TG0 A; 1WDX A; 2AZV A; 2KYB A; 2DL7 A; 4OMO A; 3M0S A; 2VWF A; 2M0Y A; 3VS2 A; 1E6H A; 2HDA A; 2ROT A; 3NGP A; 2MCN A; 2LJ1 A; 2DBK A; 4KRT A; 4JJC A; 4K11 A; 1PNJ A; 2DJQ A; 2MIO A; 4FSS A; 1W1F A; 2DBM A; 2EVR A; 1RLQ C; 4LUE A; 4RTX A; 3U23 A; 2RMO A; 2D1X A; 4RTW A; 5FWC A; 2L2P A; 2JXB A; 1WFW A; 2K79 A; 4WCI A; 1RUW A; 1ZX6 A; 3M0U A; 1WIE A; 2DNU A; 2LNH B; 4AFS C; 4DEY A; 2DL4 A; 2L3P A; 2YSQ A; 2CT4 A; 2RQW A; 1UJY A; 2LQW A; 2H8H A; 2CDT A; 1SHF A; 2BZY A; 4CC7 A; 4LUD A; 1GL5 A; 2JTE A; 1WXB A; 3REB B; 1KFZ A; 3I9Q A; 3I5S A; 2LMJ A; 1M27 C; 3VS0 A; 1UE9 A; 2GTO A; 1X27 A; 2GGR A; 5IXF A; 2DMO A; 1YCS B; 1NLP C; 3RBB B; 4HCK A; 1AWW A; 2JM8 A; 4Z89 A; 2P4R A; 1NYF A; 2DM1 A; 4RTY A; 4OMP A; 1QWF A; 2GTJ A; 5IHK A; 2HSP A; 2LQN A; 2V1R A; 4Y92 A; 4J9G A; 3R6N A; 1UEC A; 5ECA A; 2J6K A; 4IIO A; 4RUG A; 2AK5 A; 2ROL A; 1U3O A; 1QLY A; 1AWX A; 2SEM A; 2ENM A; 1NEB A; 1M3C A; 1WXT A; 3UAT A; 3I35 A; 1B3Q A; 2CH4 W; 3IQL A; 2X3X D; 2PTK A; 2BTT A; 2EBP A; 3ULR B; 1WX6 A; 2FO0 A; 3VS5 A; 2YUQ A; 1SHG A; 3NHN A; 4CC4 B; 1BK2 A; 2DRK A; 4J9E A; 1MV0 B; 4D8K A; 2KE9 A; 1X69 A; 1U06 A; 4EIK A; 1H8K A; 3PVQ A; 3JV3 A; 1WXU A; 1MV3 A; 2KEA A; 2L3S A; 1GBR A; 3VS3 A; 2B86 A; 4E6R A; 3SEM A; 4HVU A; 2LX7 A; 3KFV A; 3PE0 A; 1PWT A; 4JZ4 A; 2C0I A; 1NM7 A; 1EFN A; 2EYX A; 4RTZ A; 4ZNX A; 1UFF A; 1PKT A; 1Y57 A; 2K3B A; 2LZ6 B; 2GBQ A; 1GBQ A; 2KYM A; 1VA7 A; 1KJW A; 1YP5 A; 1ZLM A; 4HXJ A; 4J9F A; 4LE9 A; 2F2W A; 2LCS A; 1M3A A; 2JM9 A; 2KRN A; 5IXB A; 1PHT A; 1VYT A; 1AZE A; 1GCP A; 2KNB B; 3UA6 A; 2KBT A; 1OV3 A; 4AFZ C; 2C0T A; 4A63 B; 2X3W D; 2D8J A; 2V1Q A; 3M0R A; 2C0O A; 3EG0 A; 2GNC A; 3NMZ C; 2I0N A; 2YUN A; 1FYN A; 2KRM A; 1UUE A; 3M0P A; 1X2Q A; 1QKW A; 3SHW A; 3NPF A; 2EYW A; 2K6D A; 2CSI A; 2DE0 X; 1BU1 A; 1Z9Q A; 4IIM A; 4F14 A; 1Y0M A; 2W0Z A; 1ZBJ A; 1YWP A; 4OMN A; 1QWE A; 2K9G A; 5HCK A; 4AG2 C; 5GJW B; 1K0X A; 1M8M A; 1SEM A; 2O31 A; 2BZ8 A; 2KGT A; 2VKN A; 1KSW A; 1I0C A; 1ZUY A; 2FRY A; 2RQV A; 1XOV A; 4J9D A; 2EYY A; 1GRI A; 1SRL A; 4JPB W; 2J05 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1QCN A; 1MMN A; 4PJO B; 4RTV A; 1K0S A; 2RI2 A; 4C92 C; 1E7O A; 3GBQ A; 3OS5 A; 5DM7 R; 2LX9 A; 4XAX B; 2P0K A; 3HRU A; 5GMK i; 3PIP A; 1IRX A; 2WSF E; 4J9C A; 4PJO G; 3H41 A; 2AZS A; 3V7S A; 1RAB B; 4OMF B; 3A98 A; 4FL6 A; 3VS4 A; 2MF2 A; 2QAZ A; 2DEQ A; 4J8O A; 5LJ5 e; 3CME T; 1N8R C; 4NL3 A; 2XMF A; 1G2B A; 3CCJ A; 2HL3 A; 4XQ3 A; 3MEV A; 1TUG B; 1VQP A; 4PNO A; 1PSE A; 1EZZ B; 3NFC A; 2QDY B; 3OS1 A; 3JCM d; 2LJ3 A; 5GAO p; 4C8Q D; 3SWN A; 2QTV A; 1VQ8 A; 3HFN A; 2ECZ A; 2K5I A; 2FG0 A; 4E7Z A; 2BE9 B; 1WHG A; 1GCQ A; 4M78 E; 4OMQ A; 1WHH A; 3E1S A; 3CCL Q; 3I56 A; 1VYV A; 4PJM A; 1T3S A; 4ORZ A; 1OUL A; 3RES A; 1VQ6 T; 1VQ9 Q; 2EGC A; 1SG5 A; 5GJV B; 3MP1 A; 3CCQ A; 5D6W A; 2YWW A; 4FYV B; 2FVU A; 3JCM W; 4J9I A; 4MML A; 2MPX C; 4F7U F; 3HP9 A; 1SPK A; 5DLO A; 1RAC B; 2DF6 A; 1WA7 A; 3BY7 A; 1SSH A; 3CCR T; 1TUD A; 1HXD A; 1JXM A; 2XK0 A; 2CSQ A; 1OX9 A; 4ANJ A; 2EGE A; 1D09 B; 2R57 A; 2FPE A; 3CCV Q; 5KE3 A; 5IT9 E; 3OYK A; 5J39 A; 1UGR B; 5GAM j; 1I07 A; 4C8Q G; 2RK2 A; 2LTO A; 1VQM A; 1Q7Y C; 5GAN e; 5KYX B; 2JS2 A; 4Z02 A; 4EMK B; 1BI2 A; 2O01 E; 1HJD A; 2CP7 A; 5GAN d; 3OYC A; 2DD5 A; 3H0I A; 1B34 B; 3GPL A; 2KT8 A; 2A37 A; 4J9H A; 2KRO A; 3G4S T; 2ED1 A; 5LJ3 h; 2QQB A; 2IVW A; 3VUB A; 1MUZ A; 2JT4 A; 4F17 A; 2JUF A; 4B9X A; 2O4X B; 5GAO n; 7AT1 B; 1PRL C; 3CC4 Q; 3RMQ A; 4C92 A; 2QTX A; 5KCO A; 1M9S A; 1UHF A; 4OMM A; 5CCA A; 3TVT A; 4A53 A; 3CCM T; 4A4K A; 4M77 C; 1ZSZ B; 1LVK A; 3CCU Q; 5DY9 A; 3I55 Q; 1XJW B; 4BB7 A; 1VUB A; 2GCX A; 2QQS A; 1NPR A; 3JB9 J; 5D7U A; 5GAM f; 1M2O A; 1RLP C; 4PK4 A; 2FL7 A; 3UA7 A; 3P8D A; 1OZ2 A; 4E7S A; 4BY6 B; 1V29 B; 2EJG A; 2LT1 A; 1VQK T; 1I1J A; 2FEI A; 3SD4 A; 4C5E A; 4RCC A; 4ZTJ A; 4FSX A; 1JEG A; 4FIB A; 1KC8 R; 3UPU A; 3H6Z A; 3OS0 A; 2HAX A; 4JRI A; 5GAN 2; 3M57 A; 3CQT A; 5A0G A; 2MOX A; 3RNJ A; 3G6E T; 2Y4X A; 2YRC A; 2YXY A; 1Q7Y R; 1Q81 U; 4M7A F; 2D6F A; 4E7J A; 2OX7 A; 2JZ2 A; 2X4W A; 1PD1 A; 3VV0 A; 1TOV A; 1VQO T; 4II1 A; 3EGX A; 2CZ7 B; 4HCZ A; 1N9R A; 3CBM A; 3LX7 A; 2K5F A; 1BI3 A; 4FT4 A; 2AZV A; 3OYA A; 1QVF S; 3OMG A; 1FXX A; 3A8G B; 2HQE A; 2HDA A; 5C0M A; 2HNI A; 3JCM V; 3NTK A; 3CME Q; 1WNL A; 2WAC A; 5HY6 A; 4RTX A; 1XTD A; 3BW1 A; 4X9D A; 4KBM B; 4EPC A; 2K79 A; 1RUW A; 1ZX6 A; 3M0U A; 3CC7 A; 1YJW T; 4KUI A; 2DIG A; 2HSE B; 2RHX A; 2LCC A; 2RQW A; 1UJY A; 4DBQ A; 4LDW A; 4B9W A; 4F7U B; 2LDM A; 4PJJ A; 4AMC A; 3JAM E; 2JTE A; 1QVG S; 3H8Z A; 1K9M U; 2QAS A; 2LMJ A; 1VQ6 Q; 4HT9 A; 4D6W A; 3JB9 F; 5IXF A; 2KI7 A; 3S3M A; 2QQ9 A; 4F7U G; 3QKJ A; 5LJ5 f; 1ZQ1 A; 3WVE B; 4M7D B; 4N0A A; 5IHK A; 2EWN A; 1R0B G; 3R6N A; 3RMS A; 3BFM A; 1UEC A; 4ZGD B; 2E64 A; 5CKE A; 4IIO A; 2PUO B; 4M78 C; 4M77 A; 4RKU E; 4RG8 A; 3CPF A; 2L89 A; 1RAE B; 4BDY A; 1I4K 1; 1MNE A; 4V2S A; 4KH1 B; 3CCR Q; 3IQL A; 3CXC S; 3QXE B; 1K9M R; 4QKU A; 2FO0 A; 2HQH A; 3A8H B; 3PMI A; 1BCO A; 1M1F A; 1BK2 A; 2HL5 C; 2ZZD A; 3MP6 A; 5GAO r; 3VJP A; 1MV0 B; 1YIT T; 1H8K A; 4PLI A; 1WXU A; 1MV3 A; 3CCE T; 1GXI E; 2DET A; 3L2V A; 2VAS A; 3CC2 T; 4C5I A; 4YTL A; 3KFV A; 4JZ4 A; 2XDD A; 1NM7 A; 2RJF A; 1RAH B; 1OU8 A; 5CKF A; 4JRP A; 4J7I A; 2EYX A; 4ZNX A; 3FLG A; 5GAM g; 3V7R A; 1GBQ A; 1YP5 A; 4J9F A; 4JJN K; 3G4S Q; 4M78 D; 5IXB A; 2CKK A; 1VYT A; 1GCP A; 2KNB B; 2A0F B; 3CCL A; 3UA6 A; 2NUT A; 5GMK j; 4KH0 B; 4IUU A; 2C0T A; 2D8J A; 5GAN 8; 2V1Q A; 3M0R A; 2C0O A; 4M75 A; 4AT1 B; 4OGE A; 2YUN A; 3HL8 A; 1C0M A; 4JDS A; 1UUE A; 3SHW A; 4LD6 A; 4GLK A; 2K6D A; 1W2B S; 3RKY A; 3CCM Q; 5HK0 A; 3PTA A; 3HPW A; 1BU1 A; 2QGG A; 1VOM A; 5GAN f; 3EFO A; 1D1C A; 3OB9 A; 5M9O A; 1U1T A; 1YHQ T; 4J6Y A; 3DLM A; 3H9N A; 4MDX A; 2BZ8 A; 3A8L B; 4ELZ C; 4OVA A; 2PUK B; 3ZEH A; 4IUP A; 4M7A B; 4FYX B; 1SRL A; 1VQK Q; 2RI3 A; 2EQJ A; 2CP0 A; 1BI1 A; 3H0H A; 1RAG B; 3OA6 A; 4XTX A; 1X01 A; 2DAQ A; 2RB6 A; 3GLX A; 5I21 A; 3JB9 I; 2FPF A; 1AOJ A; 4QW2 A; 4UC4 A; 1VQ4 A; 5CKB A; 1YIJ T; 1I81 A; 5KH6 A; 5I22 A; 4FW1 A; 2EGA A; 4M7A G; 2YUO A; 1M90 U; 3TSW A; 1GFC A; 4B6M A; 1N5Z A; 2VVK A; 1LCK A; 3G6E Q; 4BI4 A; 4LNP A; 4QQ6 A; 2NWM A; 3MO8 A; 1IXD A; 2JS0 A; 3SWN C; 4C92 F; 3JB9 D; 1KQS S; 1WI7 A; 1AD5 A; 4LDV A; 2DRM A; 2OTJ A; 1VQO Q; 2DX1 A; 2QG9 B; 2KR3 A; 3H0F A; 1GCQ C; 4QVD A; 4FW2 A; 1TXQ A; 5FRN A; 3O5Z A; 4JJD A; 2E41 A; 2F2X A; 1X6B A; 4MZT A; 2E5K A; 3VKI A; 4JJB A; 1OI1 A; 4M4Z A; 3DLL A; 1M90 R; 1YI2 A; 3V8K A; 4XU2 A; 2JTM A; 1AVZ C; 4MDW A; 2DEU A; 4QT7 A; 2IG0 A; 5IHN A; 2CRE A; 1KIK A; 5LJ5 g; 1H3H A; 1HYO A; 2L3Q A; 1G3S A; 4N4G A; 3V8L A; 4KUL A; 3I5R A; 3OYH A; 1KG1 A; 2RNA A; 2ESW A; 5CKH A; 3OS2 A; 1UHC A; 1YJW Q; 1RAF B; 4LD9 K; 5KYY A; 2WSE E; 1MHN A; 1HK9 A; 4BUG A; 3JB9 G; 2EYZ A; 4LDX A; 3DB4 A; 3OSV A; 1YJ9 T; 1DJ7 B; 1M1G A; 2RQU A; 2DFU A; 4M75 E; 5FWB A; 5A0D A; 1SF9 A; 2K4Y A; 1QCF A; 2VGN A; 2NYS A; 3VS6 A; 5FU6 B; 2X4Y A; 5A0L A; 1BYM A; 1R77 A; 1TUC A; 2QA4 A; 2ZPI B; 3EHR A; 3CMA T; 3TEE A; 4M7D E; 2DL8 A; 2CS7 A; 1VQ7 A; 5FRM A; 2LP5 A; 2QDL A; 1V1C A; 2RM4 A; 5LJ3 e; 3V7C A; 1FMK A; 2LJ0 A; 1D0Z A; 1VQ5 T; 1W4S A; 3QYH B; 1OZ3 A; 1Q95 G; 2DIL A; 3EG3 A; 4XU3 A; 4XTV A; 2E3I A; 1YJN A; 3EGD A; 1K9A A; 5C6S A; 2M0O A; 3OYY A; 2LRQ A; 3M9Q A; 2RQT A; 3O8V A; 3MET A; 2CP2 A; 1IO6 A; 5KYU B; 1YIT Q; 2JMA A; 1K73 C; 1VIF A; 3CCE Q; 1E6G A; 1QVF P; 1X75 C; 4XTZ A; 2VB6 A; 4RMO A; 3CC2 Q; 3ZFJ A; 2K7A A; 5GAN g; 2EKO A; 3OBW A; 2J6O A; 2BE7 D; 3X24 B; 4PKC C; 5LJ5 d; 9ATC B; 4O6J A; 4JUV A; 1SRM A; 5CAI A; 4GBQ A; 3GP8 A; 5EC7 A; 1JQQ A; 4C92 D; 3EAE A; 2VXE A; 2QEX A; 4DA4 A; 1BB9 A; 4EMK C; 4XU1 A; 1N6A A; 2OAW A; 3OBY A; 5GAO m; 1VYU A; 1K8A C; 2CH4 A; 1UGS B; 2E12 A; 4IUQ A; 1K4U S; 1KQ2 A; 4M77 F; 1OYX A; 3NTI A; 2E5Q A; 2FZG B; 1QVG P; 5GAM h; 3LGL A; 1JJ2 S; 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