2F32A

Xray crystal structure of lysozyme mutant l20/r63a liganded to ethylguanidinium
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
175
structure length
175
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSINAAKSELDKAINAAKSELDKAIGANTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Guanidinium derivatives bind preferentially and trigger long-distance conformational changes in an engineered T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 64
structure length 175
sequence length 175
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2f32A00
1L62A 3L64A 216LA 4ARPA 1L05A 2F47A 4ARMA 6LZMA 196LA 1C6CA 1C6MA 3DN4A 4I7LA 201LA 1L19A 3CDVA 1L35A 1LYJA 3HDEA 1DYBA 2B73A 1CUPA 255LA 4W57A 1CU6A 1L34A 244LA 3HUAA 1QT3A 2ANXA 1P56A 1QT7A 1G0JA 142LA 1CX7A 1L03A 3HH3A 178LA 3HT7A 1PQOA 1C6LA 1L70A 2RBSA 1QSQA 107LA 1LWKA 150LA 3C7YA 1P7SA 1QT8A 3NY8A 1L08A 1L76A 3C8QA 3GUMA 4LZMA 1QTBA 180LA 127LA 1L79A 1KW7A 191LA 1QTVA 4YXAC 1QUGA 1L65A 253LA 1L53A 3HWLA 3QAKA 1CVKA 1L96A 1XJTA 3GUKA 1NHBA 186LA 159LA 1L93A 169LA 158LA 1L18A 1C6HA 2O79A 241LA 211LA 156LA 146LA 1C6GA 1DYAA 3SB6A 1P64A 3CDRA 137LA 2RH1A 4LDOA 2B6YA 245LA 1L51A 4W52A 173LA 1G0PA 1C66A 1L14A 119LA 1L55A 3C8RA 1C6TA 1C6KA 3G3XA 3V2WA 1LYDA 2B72A 1D3FA 104LA 1L67A 3HH4A 4E97A 4ARMB 240LA 3CDOA 3DN1A 1LYEA 3K2RA 3GUIA 4AQNA 1D9WA 2HUKA 1XEPA 2RB1X 1PQMA 128LA 1CV0A 1L41A 218LA 231LA 1L42A 215LA 1L16A 3C80A 1OWZA 155LA 2CUUA 3C82A 149LA 252LA 4GBRB 1LYGA 1XJUA 212LA 3PDSA 1L23A 1T8GA 229LA 3LZMA 1L30A 170LA 1L68A 220LA 3C7ZA 3DN0A 1C64A 188LA 1T8FA 1P2RA 4PK0A 1CU2A 152LA 1DYFA 1P36A 1L31A 3HUQA 3HU9A 256LA 1C65A 2B7XA 118LA 1L82A 166LA 112LA 1QUOA 1L56A 3L2XA 1LW9A 1L99A 1C6DA 144LA 1P3NA 182LA 1L91A 206LA 1LWGA 1L48A 4EXMA 2LCBA 3C7WA 187LA 1L13A 1QS5A 1CU3A 1SX7A 258LA 1L95A 1G07A 1OV7A 148LE 1QT4A 1CU0A 190LA 1L38A 1OWYA 260LA 4I7TA 111LA 3GUPA 1KS3A 1L25A 1C6JA 1L12A 239LA 1L21A 1L45A 1L57A 2Q9EA 2RBPA 2IGCA 1C62A 2OU8A 3DN2A 1D3JA 3DMXA 1OVHA 1L32A 1KNIA 1LGUA 2B6ZA 1G0GA 1L37A 3RUNA 1PQJA 1TLAA 1L10A 1KY1A 1L94A 2Q9DA 1P6YA 1CV1A 2Z6BA 4I7KA 171LA 1LI2A 1L85A 1C63A 1OYUA 2B6WA 3VW7A 4I7OA 4YX7C 3SBBC 1L39A 114LA 162LA 1C6BA 102LA 2B74A 1T6HA 2B6TA 1L17A 3GUOA 165LA 167LA 1L22A 247LA 3HTBA 2O7AA 2RB2X 3C8SA 129LA 1L06A 3HT8A 1CV4A 4DAJA 1L97A 4EJ4A 3F8VA 3HUKA 2B6XA 3G3VA 2OE7X 259LA 1ZYTA 262LA 141LA 1L90A 199LA 2ANVA 1L86A 3JR6A 1SSYA 1L43A 3SB9A 3D4SA 1L01A 4ARQA 1LLHA 3DN6A 3HH6A 2RB0X 1PQIA 1D3MA 115LA 1P2LA 168LA 1L54A 1QSBA 1DYCA 4I7JA 3HTGA 225LA 3PBLA 4I7PA 3GUNA 1LYHA 3DMZA 3HT9A 1K28A 1L27A 1L47A 126LA 1CV6A 1L92A 4I7SA 1SWYA 1L04A 232LA 4DJHA 1G1WA 1OVJA 237LA 2RBQA 1OV5A 2RBOA 3RZEA 2OU0X 1L24A 210LA 1L84A 176LA 1JQUA 2OTZX 1DYGA 189LA 184LA 1LGXA 257LA 1L02A 3DN8A 2HUMA 1L72A 1KW5A 192LA 2OU9A 4I7NA 2B75A 1SX2A 1L29A 1L60A 4W58A 4YXCA 222LA 213LA 1L98A 1OVKA 2O4WA 1L20A 3EMLA 138LA 1L64A 1ZWNA 251LA 2L78A 1C61A 1L0KA 4I7RA 3SB8A 1C68A 3FADA 4LDLA 226LA 3DMVA 2OTYX 3OE9A 1G0MA 1L63A 1QTZA 3ODUA 140LA 1QTHA 1CX6A 1L15A 224LA 221LA 1L58A 246LA 4W53A 4ARJA 5LZMA 3G3WA 1I6SA 145LA 3NY9A 1LGWA 214LA 4EPFA 177LA 1L46A 2HULA 123LA 1LI3A 1JTNA 4DKLA 1L40A 238LA 1C6PA 198LA 4S0WA 1L75A 2OE9X 4W51A 2NTGA 4ARQB 1L61A 3CDTA 2RAYX 1CTWA 7LZMA 217LA 113LA 1QT5A 1C6NA 2RAZX 1L50A 2B70A 1L0JA 3C83A 195LA 2QB0B 5I14A 1CUQA 1L26A 181LA 1C6IA 4W55A 1C6FA 1L87A 4GRVA 131LA 110LA 1CV3A 1L09A 1PQDA 1QTDA 1L59A 200LA 139LA 2OEAX 3HU8A 1DYEA 3GULA 205LA 4OO9A 1L73A 1L36A 1L77A 1LYFA 1L33A 209LA 1EPYA 2NTHA 108LA 1L80A 3HTDA 1L49A 125LA 1PQKA 1L00A 2OE4X 1L89A 3GUJA 4PJZA 151LA 1L28A 3OE6A 1G06A 1L07A 3CDQA 3OE0A 1LYIA 4W59A 4EKSA 261LA 172LA 1QUDA 1JTMA 1ZURA 2A4TA 1L74A 175LA 1L44A 1T8AA 2LC9A 4I7QA 1C6QA 2RBNA 1L81A 4ARLA 1L52A 3SB5A 157LA 1QT6A 2F32A 174LA 3HDFA 250LA 1SWZA 236LA 4EKRA 1P46A 183LA 147LA 4EPIA 1G1VA 3SN6R 235LA 164LA 228LA 4K5YA 1L71A 1L83A 3DNAA 2QARC 3HTFA 1QUHA 3HH5A 1C60A 130LA 1P5CA 1QS9A 3NYAA 3HT6A 248LA 3C81A 3FI5A 4I7MA 185LA 1C67A 223LA 3OE8A 197LA 242LA 1KY0A 1WTHA 254LA 1G0KA 234LA 120LA 1C69A 1L69A 1T97A 1L66A 2F2QA 233LA 2RBRA 1CV5A 1DYDA 3UONA 4EKQA 3DN3A 4ZPUA 1G0QA 161LA 143LA 2LZMA 4LDEA 227LA 219LA 122LA 1CU5A 1B6IA 3V2YA 163LA 1C6EA 103LA 109LA 3F9LA 4IAPA 4EKPA 1L11A 1L88A 249LA 1P37A 1G0LA 243LA 160LA 1SSWA 1LI6A 3DKEX 3SBAA 3SB7A 1D3NA 1D2WA 3FA0A 1LPYA 4W56A 1D2YA 230LA 1QTCA 1C6AA 4W54A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ARPA 1IOTA 4H9HA 1GHLA 196LA 4NWHA 1C6MA 1LPIA 1L19A 5DN5A 1BWJA 1WTMA 244LA 1QT3A 3TXIA 2ANXA 2CJLA 3VWOA 4DYGA 4B4EA 1WQNA 1C6LA 2ZYPA 1VEDA 5IELA 1BWHA 3WUAA 3C7YA 4YM8A 2DQEY 3F6ZA 4OWHA 1FLQA 1MELL 4M4OA 5LVHA 1QTBA 1CKHA 4Z41A 4NHPA 5LINA 1BVXA 2MECA 191LA 1BB5A 4YXAC 1L65A 4XJDA 1CVKA 1L93A 4DD7A 2BQGA 169LA 2BPUA 2O79A 1P64A 3CDRA 3K3TA 2LZ2A 173LA 1F10A 1IORA 4QEQA 2A7DA 3LYTA 4HJVA 1QUSA 4PRUA 104LA 1L67A 3HH4A 5LA5A 4ARMB 4RDSA 1B5ZA 3RU5A 3GUIA 1D9WA 5HNCA 3CQLA 1BGIA 1LJ3A 1L16A 1GXXA 155LA 3C82A 8LYZA 1LYGA 2YBNA 212LA 1L23A 170LA 1T8FA 1QSAA 1P2RA 4XYYA 1CU2A 2MEBA 152LA 5KXNA 1C65A 1IY3A 3L2XA 1KXXA 4WO9A 5I4XA 1L48A 5T3FA 3W3EA 4EXMA 3AZ6A 2LCBA 1QS5A 3TXEA 258LA 1HC0A 148LE 1LJ4A 1HNLA 1LSZA 4H8XA 190LA 2MEIA 3TXKA 1JTOL 1GF7A 2HEFA 111LA 3GUPA 1PZYA 2Q9EA 4TSBA 2RBPA 1C62A 4WLDA 1NDMC 3DMXA 4ET8A 4G49A 3B72A 1LSFA 1GB3A 132LA 2B6ZA 4II8A 1L10A 4GCCA 1GBZA 3IWRA 3T6UA 2Z39A 1L94A 4H92A 1LZ1A 3TMWA 5B06A 1C63A 2I6ZA 1XSFA 4ETCA 1A2YC 1D6QA 114LA 162LA 1CKDA 2B6TA 5DM9A 4NIJA 4LGKA 1TAYA 3ATOA 2RB2X 3C8SA 2ZIJA 4HV1A 129LA 5HQ1A 1L97A 1LZGA 3WW6A 2F4AA 5FDJA 1F6RA 3G3VA 2OE7X 259LA 262LA 3CB7A 4OWEA 3CT0A 5LYZA 1LMQA 1JTTL 1SSYA 1YKYX 4WG7A 1GF0A 1JISA 3HH6A 4ANRA 3WVXA 193LA 1UC0A 4DQJA 4J0LA 1QSBA 1C08C 1HERA 4I7JA 2EIZC 1GXV2 4ETEA 3WU8A 2LYZA 1LYHA 4LT1A 1L27A 4DT3A 2LYOA 3CSQA 2D91A 1SWYA 4DJHA 1HFYA 1G1WA 4ZFPA 1OVJA 1HEPA 1HEOA 1IP5A 1LSNA 1P2CC 1VATA 4EMNA 1L24A 2Z2FA 1L84A 176LA 1PS5A 4DQ7A 4R6CA 5E4PA 1DYGA 1LGXA 1GF4A 1GBYA 1SX2A 1L60A 3B0OA 4W58A 134LA 1DKJA 2O4WA 3EMSA 3EMLA 1ZWNA 1MLCE 4LT3A 1AT5A 1QTKA 3SB8A 3FADA 4LZTA 4LDLA 226LA 3OE9A 3CT1A 1CX6A 2YBLA 5EBHA 1GEVA 4ARJA 1GF8A 1WQQA 5LZMA 5KXLA 145LA 1LHHA 214LA 177LA 1KIRC 1IP4A 3A3QA 2DQAA 1LZNA 1L40A 238LA 3A6BY 3EBAB 1YKXX 2OE9X 4W51A 3D9AC 1IWVA 1L61A 3CT5A 1O23A 2RAZX 2B70A 3C83A 3OJPA 3LZ2A 1CUQA 1L26A 4NGJA 1C6FA 4GRVA 131LA 110LA 3WXUA 4DD1A 2I26L 4NHIA 1L73A 2FYDA 1BB6A 1IC4Y 3HTDA 1LSYA 1TDYA 1L89A 3GUJA 1G06A 3HBEX 1BB4A 2RSCA 3B0KA 4N0JA 4DDAA 2A4TA 5APDA 2LC9A 4FDYA 1L52A 1UIFA 1ZV5L 3A34A 157LA 5LVGA 4I8SA 1G7MC 3HDFA 4HTNA 1P46A 3A91A 1BHZA 147LA 1N4FA 1GB2A 1B7QA 3LYOA 1LZ5A 1H87A 1L71A 2HEDA 3DNAA 1TCYA 4O34A 3HTFA 3IJVA 4H9CA 1QUHA 1AZFA 3HH5A 4XN6A 1QS9A 5B59A 1FKVA 4NGOA 4OOTA 1C67A 1UIBA 1GEZA 2LHMA 1HF4A 1IOCA 1WTHA 1HFXA 1C69A 3AZ4A 2F2QA 1DYDA 2YVBA 1IY4A 161LA 1LZBA 4LDEA 1UBZA 1DZBX 227LA 219LA 122LA 1IWTA 4DD3A 4IAPA 103LA 109LA 1HFZA 1JSEA 1VDQA 3P64A 1KIPC 1P37A 1QDTA 3DKEX 4RW1A 4NGYA 1REYA 1GAZA 1QTCA 3L64A 4ETDA 216LA 2F47A 1NDGC 3WU7A 2B5ZA 3A3RX 1LKSA 2D4KA 3HDEA 255LA 1CU6A 1L34A 2XJWA 3HUAA 1JUGA 3EO5A 142LA 1CX7A 1DPXA 178LA 3AB6A 1PQOA 4C3WA 1XEKA 107LA 4H93A 4AXTA 5LYMA 3NY8A 2WARA 3GUMA 4LZMA 4H8ZA 1DI4A 1FN5A 1WQOA 1OUBA 1HEMA 1F0WA 1GE0A 4NEBA 1QTVA 4YENA 3WUNA 4RW2A 1LSDA 4GCFA 1XJTA 3GUKA 4WM6A 158LA 1C6HA 211LA 156LA 1DYAA 2W1XA 4LDOA 2B6YA 245LA 1HMKA 2BQNA 1OUAA 1C66A 2H5ZA 4NG1A 119LA 1C6KA 3G3XA 4LYBA 2B72A 1LMOA 1UIHA 240LA 3CDOA 1D0MA 3W6BA 2EKSC 1GPQC 1VDSA 2HUKA 128LA 1CV0A 1HEWA 218LA 1LYOA 231LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4ARP A;  1IOT A;  4H9H A;  1GHL A;  196L A;  4NWH A;  1C6M A;  1LPI A;  1L19 A;  5DN5 A;  1BWJ A;  1WTM A;  244L A;  1QT3 A;  3TXI A;  2ANX A;  2CJL A;  3VWO A;  4DYG A;  4B4E A;  1WQN A;  1C6L A;  2ZYP A;  1VED A;  5IEL A;  1BWH A;  3WUA A;  3C7Y A;  4YM8 A;  2DQE Y;  3F6Z A;  4OWH A;  1FLQ A;  1MEL L;  4M4O A;  5LVH A;  1QTB A;  1CKH A;  4Z41 A;  4NHP A;  5LIN A;  1BVX A;  2MEC A;  191L A;  1BB5 A;  4YXA C;  1L65 A;  4XJD A;  1CVK A;  1L93 A;  4DD7 A;  2BQG A;  169L A;  2BPU A;  2O79 A;  1P64 A;  3CDR A;  3K3T A;  2LZ2 A;  173L A;  1F10 A;  1IOR A;  4QEQ A;  2A7D A;  3LYT A;  4HJV A;  1QUS A;  4PRU A;  104L A;  1L67 A;  3HH4 A;  5LA5 A;  4ARM B;  4RDS A;  1B5Z A;  3RU5 A;  3GUI A;  1D9W A;  5HNC A;  3CQL A;  1BGI A;  1LJ3 A;  1L16 A;  1GXX A;  155L A;  3C82 A;  8LYZ A;  1LYG A;  2YBN A;  212L A;  1L23 A;  170L A;  1T8F A;  1QSA A;  1P2R A;  4XYY A;  1CU2 A;  2MEB A;  152L A;  5KXN A;  1C65 A;  1IY3 A;  3L2X A;  1KXX A;  4WO9 A;  5I4X A;  1L48 A;  5T3F A;  3W3E A;  4EXM A;  3AZ6 A;  2LCB A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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