2F36A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer with glutamate at 2.1 angstroms resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
TLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Crystal structures of the kainate receptor GluR5 ligand binding core dimer with novel GluR5-selective antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
total genus 85
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f36A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f36A02
2O1MA 3MVXA 2XXIA 2A5TA 3LSWA 3MQ9A 3KJ7A 3PPPA 5CM6A 3SERA 1MH4A 2ZNTA 5DVIA 2YPNA 2AL5A 3RPWA 1EZOA 1SI1A 1UTBA 2Y7IA 2G29A 2Q2CA 4IY6A 1MXXA 1ZIUA 1N3WA 1ZBMA 2AIXA 4NF6B 4C0RA 4XIGQ 3TKDA 2B3FA 1B58A 3G3GA 1MM7A 1LLSA 3PPQA 4OXVA 3FJGA 4NF4A 1B3LA 3EN3A 3TDJA 4YU0A 2O69A 2REGA 1UIVA 4F3SA 2OJTA 2VD2A 1B3GA 3Q26A 5I57A 1KWHA 4DCYA 4K3FA 3EHSA 1N0TA 4YMBA 1MPBA 3G7WA 4HCWA 3DELB 2QS2A 3O6IA 2UYFA 3FVOA 3KSXA 3SEYA 1UIUA 3FATA 1ZU0A 1SW5A 3SEXA 2I4BA 1GV8A 1ZKBA 4ZDMA 1ATGA 5H8NA 2RCAA 4LP2B 2F7AA 2HXWA 5I2NB 1SYHA 4YKPA 4TQUQ 3RT6B 3MW0A 1IXCA 1ZLQA 4O3AA 4ELRA 1QUKA 3N26A 2XXTA 4F2OA 4YZZA 3O6GA 3ODBA 3TYHA 3FXQA 4ZEBA 1OVTA 1IXHA 3LSFB 2DWJA 3THIA 1JNFA 4N13A 3KBRA 2G93A 5M2VA 1GVCA 3RGYA 4GD5A 3IOWA 3R7XA 4TOZA 1ZJLA 5IAIA 3T22A 3RN8A 1GTKA 1BIYA 4OFOA 3TEPA 4P0GA 2Z22A 3UA8A 4R2BA 3MJNA 3HCQA 4ELPA 4HW8A 2V25A 4H8IA 4JSDA 1GR2A 1OVBA 4ZEFA 3U94A 4JWXA 2RINA 4MH5A 4Q0CA 4BDMA 1XS5A 1D9YA 4QRZA 1EH3A 1AH5A 2ANJA 3VXCA 4R2FA 4R6YA 3QUJA 1FQEA 4TLLB 5FHOA 4F3BA 5DT6A 5L8DA 4GF8A 1TFDA 3CG1A 1Z7NE 1LBBA 3CR9A 1AOVA 1HSLA 3M8UA 2HZLA 3IK6B 2O1LA 2H9BA 2UVGA 1Y1MA 2DS9A 1A7LA 5HBCA 3OOAA 1SW1A 3UP9A 2H98A 1IXGA 5H8QA 1AL3A 1XVYA 5CI5A 1JVYA 2RCBA 2FYIA 3ONMA 1YAEA 3TTNA 2B65A 4G2ZA 1JEUA 3K2DA 1IQ7A 4F29A 2FNCA 5I84A 3N6UA 3GLBA 1N84A 4P11A 5JTYB 2LAOA 1TXFA 1XHYA 1B0LA 3L6HA 2QL3A 1IIWA 3IR1A 2O6AA 4E0XA 3SETA 3SEWA 4R9FA 1XC1A 1LFHA 3K6XA 3R26A 4F3GA 3QXMA 1B0HA 2F78A 3SESA 3VFJA 1J1NA 1MXUA 2Q89A 3IJOB 3H7MA 4ND9A 4FEDA 2OZZA 2I58A 3TTMA 4QF9A 2OBGA 3MAMA 4EXLA 5F7VA 4UA8A 2DXRA 1MS7A 3HO7A 4GRKA 3VVFA 5FTIA 1LCFA 1I6QA 5EHMA 1FQCA 2V3UA 2F8DA 1USYE 2I6EA 1MY3A 3UORA 5KCJB 3PMWA 3H6TA 1L5TA 2R6GE 1NKXA 4R6HA 4X1BA 1H43A 3T9XB 3CFLA 3LUYA 1A40A 1T0KA 4EDPA 2F6PA 5DVFA 3IOVA 5DVJA 4X9TA 2P1SA 4UACA 4TLMB 4JWYA 5H8HB 4YMAA 2ZXTA 4RYAA 5DEXA 3JZJA 1USYH 4U1OA 3VVEA 3Q27A 4QFNA 3RTWB 3T9UA 4DIGA 3OSRA 3TCHA 3I5OA 3S2VA 1LAFE 4R6KA 5ISUA 1BTJA 2I3VA 1H44A 4OMBA 3FXUA 4KCCA 1DPPA 3FD3A 4LATA 1QKBA 3HN0A 2A5TB 2H5YA 1WDNA 3I3VA 4U23A 4OVJA 1LAXA 1B3HA 5L9SA 3E13X 4MLVA 5K2YA 4QHQA 4RK2A 2X7QA 1R6ZA 1B46A 1JQFA 3D4CA 3U1OA 1UTBB 2VGQA 1LAGE 3MPKA 1I6BA 2GHAA 3UGWA 3GBBA 4EQ9A 4XTCQ 1N04A 1QW0A 3K6WA 3IORA 4ESXA 2NXOA 4FJPA 1JW1A 3C36A 3OD7A 2XXYA 1A54A 2VD3A 4NF4B 2YLNA 4HCYA 3IL1B 1B51A 1FQFA 4FEBA 3FJ7A 2UVHA 1H76A 3WAFA 5EYFA 2H99A 4X48A 4RA1A 5I57B 1Y3QA 1LB9A 4PFWA 4R72A 4IGRA 4OESA 1CB6A 3PPRA 4O3CA 5CMBA 1WVJA 3CFXA 5ELVA 1VFDA 3K4UA 4XKQA 4PQJA 2DOJA 2DQVA 3FZVA 5I2KA 1OIBA 1Q1KA 3TAJA 2QS1A 4NF8A 3TPAA 4BDNA 4NWCA 2QMWA 4KYSA 1LCTA 3DP8A 2UVJA 5H8NB 2E0SA 4OHNA 2Z23A 3TODA 4OZ9A 1GGGA 4IB2A 3U72A 5H8FA 2DWHA 1BKAA 3N5LA 1EU8A 4XKNA 4PFYA 5CRYA 3FUZA 3H06B 1XT8A 4DCXA 3N94A 3LC8A 2VHAA 1PB8A 5EHSA 3UIFA 3OO6A 4EF2A 3TQWA 2X7PA 4C1UA 5TPAA 5J1DA 3V83A 5B70A 4EQBA 3PMVA 4Q5TA 1POTA 4GIZA 1B4HA 2I49A 3B6WA 2HAUA 1YPNA 2XX9A 3M3LA 4FATA 3VDFA 1URDA 3I6VA 1JETA 3U92A 3O66A 4RPNA 3DP6A 1R9QA 3MVZA 4OERA 4H6DA 5DTBA 4F1VA 3IAZA 2NOOA 3U8QA 1US4A 4OENA 4YKKA 4ELOA 3K00A 1HSEA 2HEUA 4U22A 4OWDA 4WEDA 3K6VA 1P1NA 1DMBA 3GBAA 2FA7A 4XKPA 3LR1A 3MZ9A 5ICQA 1S50A 3LBSA 3H4ZA 3HPIA 1B6HA 5I58A 3MC2A 4QSCA 2F35A 3FVGA 2Y84A 4KYEA 1B7ZA 1ZTYA 2RC7A 1B2HA 3EPEA 3KJTA 4RNSA 1N76A 2V84A 2ONSA 4AB5A 4PE5B 5H8QB 1Z7ME 3MP1A 3KOSA 1NNPA 4F18A 1LSTA 4LA9A 3PMXA 5L9MA 2QPQA 5FTHA 5CMKA 2BJJX 4FORA 4F22A 5BUUA 2V93A 1LBCA 2THIA 3K6UA 1JW5A 3QYTA 4PFTA 2PMSA 3TTKA 1B5HA 2XXUA 1MQIA 1LB8A 1MXWA 2RC9A 3KZGA 1N7WA 3O9PA 1FQDA 4NE4A 2ESNA 1O64A 1QKAA 2PT1A 1EZ9A 3M3FA 1OQGA 4EUOA 1N3XA 4G8MA 4EF1A 3MPLA 1IZ1A 3S9EA 2UXAA 3C31A 3TCGA 5KDTA 4E0WA 4ECFA 2ONRA 3H03A 1PC3A 4KYDA 3SKPA 3C9HA 1P1WA 3GXAA 1PB7A 2M8CA 3ZS6A 3BKIB 3QSLA 2Q88A 2X26A 2AL4A 3W15C 3B6TA 4DXCA 2O7UA 1UTHA 3Q25A 1B4ZA 2P2AA 5A5XA 1POY1 4F1UA 3C32A 4F31B 2DYXA 3FV2A 4ZE8A 4YKIA 1MXYA 2W7YA 3IOTA 3IOUA 2XX7A 3S9MC 1PDAA 1ANFA 2ZYMA 1B1XA 2GFEA 4I9DA 1B1HA 5DEXB 3K0VA 3D4GA 1M5CA 4RPOA 3KG2A 2KLFA 1PBPA 3T9VA 3JV9A 3PD8A 2I0BA 4H5FA 2Z8EA 4JBZA 4EQ7A 3TMGA 4QFKA 2HAVA 4H5GA 1SW4A 3FGSA 3W9WA 1XVXA 2XXXA 5AA3A 4F2QA 1I6AA 1QUIA 1IEJA 4L17A 3TTLA 5FHMA 3O2AA 2CZLA 3OENA 2H25A 2NUVA 3OELA 3TTRA 3S4UA 5CBRA 4NF5A 4IO3A 4O3BA 3A3UA 4U2RA 4IO2A 2XXVA 3FV1A 4GOTA 1SDXA 2O51A 3H6UA 3UN6A 3MZBA 4G77A 1IITA 3OO9A 3P7IA 3O28A 3PV0E 1PB9A 3KSJA 3OSQA 1OQHA 4P0IA 3OXNA 4ZECA 3K01A 4BLAA 5CMCA 1NMUA 3RLFE 3C35A 2D21A 2DE4A 4QSDA 1OLCA 5AA2D 3LSXA 4F39A 3HHGA 4F3PA 3IB0A 2XD3A 3PGFA 3MVYA 5AA4A 5I2KB 3G3KA 4Q8RA 3KGCA 2YJPA 3T96B 4NF8B 4QFPA 2ONKE 1US5A 3L6GA 3VLWA 4ONYA 2CMOA 3LSLA 3KN3A 3MWBA 4LVQA 4OFJA 5H8FB 4OEVA 3UK4A 3TZAA 3BBRA 1QVSA 1FTOA 3QAXA 1LGBC 2OWTA 3K1NA 5AA2A 1O7TA 2HFBA 3FVNA 1MDP1 3KEIA 5CC2A 3H3GA 3VLVA 2PBWA 1JEVA 1EZPA 1XOCA 4OYVA 3TUSA 3G3HA 3KOTA 5ITPA 4PFUA 2XXRA 2QMXA 4QSEA 1P99A 3CI8A 5IKBA 4JSOA 3RNNA 5TPAB 4DXBA 1M5FA 4AB6A 1NNKA 1SVXB 3A09A 3RY3A 4GL8A 3JYRA 4NMYA 4DLDA 3O6HA 2UVIA 4ZE9A 5TP9A 4YKJA 4C1TA 2PVUA 5JEIA 4LQ2A 4IO4A 1DSNA 1NH8A 2V3TA 3FXRA 3O97A 1DOTA 1YTVA 2ABHA 1MY1A 3QIMA 1IXIA 1A8FA 1ELJA 2XHDA 4OQOA 5I59A 3TCFA 5FHNA 4YB6A 3IJXB 3K1MA 4LZ5A 3SEVA 4KPTA 1RKMA 4OTEA 3T66A 1RYXA 1P1QA 4H65A 3R6UA 1FCKA 1UQWA 1Y1ZA 3ZSFA 2GH9A 3USDA 4G68A 2OLBA 5I58B 4U4XA 2IEEA 5I56A 3QK6A 1MDQA 1FTKA 4ESWA 4ZEDA 3CRBA 2I0CA 1MY4A 4MLQA 4G8HA 3Q28A 1MPDA 2Y7KA 4N07A 1R9LA 1MM6A 2F7BA 2O7IA 2H4IA 1MQDA 4GXAA 3S9NC 4YAHX 3FIRA 4LQ5A 5HPQA 1FW0A 3GZGA 2QS3A 4R75A 3DM0A 1B05A 4BDLA 3G3IA 4PP0A 1FQBA 4RY1A 2XXHA 4XXUA 4H0WA 5F1QA 1NNFA 2Z8DA 3IB2A 2I48A 3DP4A 3RTFB 4I8CA 2D5WA 2I4CA 4MF3A 2DXYA 1MH3A 2OK2A 1PEBA 4Z0IA 1Y3PA 5KZTA 4F19A 4GWOA 1URGA 2DE2A 1H45A 1ZMGA 2ZYOA 1B9JA 2D3IA 5KDTB 2P0SA 3QUFA 1JVXA 4IO6A 2ZNUA 1RYOA 3PPOA 4WEPA 4JB7A 2DVZA 3WAEA 4NTLA 3PUZE 1AMFA 5L9OA 4THIA 4QFOA 1VSOA 2IA4A 3TELA 4FE8A 4F1YA 1UTHB 5ICTA 2NWJA 1DTGA 1H3DA 5A5XB 1A55A 4LONB 4PETA 2QSXA 2DP8A 5TU0A 4H1XA 2DE3A 3TFLA 1TWYA 3SDFA 3PUWE 4GXSB 1D3KA 1B5IA 2F5XA 1B5JA 3ILUB 1HSJA 1M5BA 4MBPA 1B7HA 4LZ8A 3E9XA 2R71A 2QJEA 2I3WA 2UYEA 2O84X 1PBQA 3V8XB 1LFIA 3E4RA 3PD9A 2ZNSA 2PT2A 4G68C 4YICA 1SD3A 2O68A 1VFEA 3AXFA 4Z7EA 2DWAA 3PPNA 5JK4A 2PX1A 3RQTA 4RXLA 4JXIA 4H67A 3E3KA 4LUBA 3VXBA 3RUMA 4NWDA 3B6QA 2F34A 3OO7A 5LOMA 4XKRA 1SI0A 1D9VA 2Q8JA 4NF6A 1Y4CA 2F7CA 4KD5A 2XXPA 3RT8A 1CE2A 1P1UA 2GRVA 3VV5A 4AQ4A 4WXJA 3U93A 1FTMA 4NF5B 1LFGA 3F11A 4OETA 2DSFA 1MPCA 2Y7RA 1FTJA 4G4PA 4HTGA 3T93B 4U21A 4ISUA 4KQPA 2E1SA 4G8NA 5CBSA 4FIMA 3CFZA 4QFLA 1YCJA 3MP6A 2A5SA 3ZKLA 4OFLA 4HS7A 1MY0A 1FQAA 1N7XA 3IX1A 2ZYKA 1TFAA 4IO7A 4GL0A 2RF1A 4KFQA 4RK9A 2F36A 1A99A 2AYSA 2RC8A 2DVCA 3PU5A 5AA4B 4DDDA 5I2NA 2R9JA 1FTLA 3V5AA 2OCUA 4BDRA 3OEKA 3EHTA 1MRPA 2Q9TA 4POXA 3IO4A 2XXQA 1QUJA 1I69A 2Z8FA 3PUXE 2ZYNA 5AA2B 1AIVA 3MBPA 1MXVA 4R9GA 1BLFA 5DYHA 1VR5A 3OMBA 3Q29A 1MXZA 4FAJA 3V89B 3HSTA 1NFTA 2XD2A 5CMMA 1OMPA 4R74A 1B7UA 3O29A 4GLIA 3W9VA 3CSGA 4GQOA 4JDFA 4I1DA 4M1VA 3VVDA 5AA1A 1OLAA 4I62A 3KFMA 1S7YA 3CIJA 1URSA 5TP9B 4ZEKA 4GVOA 3MZ1A 3B7DA 2F6GA 3MP8A 3TQLA 3ILTB 1Q35A 1II5A 4JWOA 2DWIA 4EXKA 1Y3NA 3PUYE 1MQHA 2HZKA 4YB7A 1R1NA 4N6PA 4IY5A 4OEUA 5ITOA 2XX8A 1B32A 4DE8A 1SBPA 3T9HB 5I59B 4IGTA 1MQJA 3HV1A 2HQ0A 2V3QA 2RKMA 2VOZA 3BFUA 3KN8A 3MVWA 2NVUB 1M5EA 1JW4A 3CVGA 4IO5A 2HCAA 4R73A 4ZZEA 4ZS9A 1O63A 4G68B 4YB5A 3EQ1A 1B3EA 1MY2A 1B52A 3EHUA 2OWSA 5I56B 4KCDA 2PYYA 1BP5A 1DPEA 3C34A 1QJMA 2GHBA 3VLUA 1B3FA 5AE4A 3IB1A 4U1ZA 4POWA 3MUQA 3A3CA 4MFIA 2F97A 4Q30B 3H6VA 1WODA 4NEDA 3M3KA 1QULA 3KN7A 1Y20A 1A8EA 5JTYA 4WKMA 4H8JA 3SEUA 3G3JA 2XXWA 4KI0E 4BDOA 2Q2AA 3G3FA 2ALUA 1M5DA 1DTZA 1LAHE 3K02A 3HHFA 3OEMA 3H6WA 4ZZAA 3DLNA 3EF7A 3C4MA 5BWJA 1D4NA 5B7DA 1P1OA 1Y9UA 3CSBA 1NL5A 1TT1A 3C33A 4M4GA 5H8SA 3PUVE 1MQGA 4BDQA 1VE4A 4X1DA 5K2XA 5KCJA 4DXUA 3VE1B 1SYIA 1IUDA 3K1PA 2REJA 3FASA 1Y4TA 2WKYA 3OO8A 5HM4B 4ZEIA 2VP1A 1MG1A 3CG3A 4ELQA 2QS4A 2ZMBA 3N6TA 2B3BA 3ZKKA 1F9BA 3FVKA 5H8HA 4KR5A 4LZ7A 2QRYA 4RJZA 1NH7A 2Y7WA 4KHZE 3FJMA 4U4SA 3ECRA 3S9LC 1SW2A 2Y7PA 3IO6A 1B40A 1S9TA 4FECA 3BFTA 1NNTA 1SQYA 4GFRA 4DZ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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