2F36A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer with glutamate at 2.1 angstroms resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
b'TLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the kainate receptor GluR5 ligand binding core dimer with novel GluR5-selective antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f36A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f36A02
4R2BA 1BTJA 3T9XB 4DCYA 2AL5A 5I57A 2H9BA 3V5AA 3TTRA 3H6TA 3UIFA 4GL8A 4F2OA 3B6TA 3T93B 2DWHA 2QS2A 1MY0A 5L9SA 3KOSA 4G68B 1US5A 4FATA 2ABHA 1F9BA 1B3EA 2REGA 4IO5A 1CB6A 4LQ2A 4GWOA 3MVZA 1NNPA 4F39A 3S9LC 5EHSA 4IO2A 4F3SA 1MXXA 3VLWA 4F22A 2VD2A 1ZU0A 3FD3A 4H0WA 3EHUA 4Q30B 3C36A 4U4XA 2QS4A 1B40A 4HTGA 2ZNUA 3BBRA 3QIMA 2H99A 3QSLA 1EZOA 3S9NC 4FORA 3VDFA 1MQDA 3USDA 4ELQA 4DZ1A 5ICTA 4PETA 1PDAA 1RYOA 1EU8A 1ZKBA 1FQAA 1J1NA 4GRKA 4JSOA 3KEIA 3OENA 3OD7A 5L8DA 3KJ7A 2IEEA 2V3TA 2PYYA 3ILTB 2YLNA 1B3GA 1DMBA 2OBGA 4HW8A 2Q8JA 1SW2A 3TELA 5AE4A 3PUXE 2DQVA 2I49A 3QUJA 3CSBA 1Y4TA 4FJPA 3TFLA 1H3DA 2P1SA 2YPNA 3JV9A 1MPBA 1US4A 4YMAA 1MPDA 4M4GA 1LSTA 3H7MA 3AXFA 5HPQA 5I59B 3CG3A 3G3FA 5I56A 2ZMBA 3OXNA 1NH7A 3VV5A 4XKNA 1D9YA 4ZZAA 3CSGA 3IOWA 5HM4B 4NF4A 3TTMA 4NWDA 1B1XA 3C33A 1LLSA 3KFMA 5H8HB 4LONB 4QFNA 2Y84A 4ONYA 3MZ9A 3H6WA 5AA1A 4KCCA 1PEBA 4NF8A 2QPQA 5EYFA 5AA2A 1IXGA 4NTLA 4YKKA 2DP8A 2DOJA 3FVGA 1ATGA 3D4GA 2FA7A 4F31B 1DPEA 3MP6A 3GZGA 1MXWA 4MBPA 3V89B 4XTCQ 4PP0A 1HSJA 2ONKE 2AYSA 5CBSA 3BFTA 5AA2D 5AA4A 1S7YA 2F6PA 3I6VA 5JEIA 4R75A 3E3KA 3H6VA 2DXRA 2IA4A 4GLIA 2DS9A 3R6UA 2YJPA 2XXRA 2PVUA 4F18A 4OYVA 3SEUA 3T9HB 1IXIA 1LCFA 3U1OA 4JSDA 4H8IA 5I2KA 1SW1A 4QFPA 3PMVA 4ELOA 3VLUA 3EPEA 3FUZA 4TOZA 2PX1A 1Y3NA 4X48A 1NNKA 2ZNTA 4I9DA 1NNTA 2CMOA 4YB7A 2QSXA 1Y1ZA 3DP4A 1XS5A 4KFQA 4LUBA 3SEXA 1LFHA 2DWJA 3WAEA 2P2AA 3UK4A 1OQGA 4MF3A 1BKAA 2GRVA 2OWTA 1JW5A 3S4UA 1YAEA 1ZMGA 1B05A 3MPLA 3CG1A 1GGGA 4O3BA 3K1NA 5H8NA 4RNSA 4P11A 4GXAA 1IEJA 1A55A 3CI8A 1SI1A 2O7IA 1EZPA 1SBPA 4H8JA 2AL4A 3TDJA 1NL5A 2O84X 3WAFA 3V83A 2QMWA 2NXOA 1A7LA 4QFOA 4NF5B 1POY1 1L5TA 1OQHA 4ESXA 2XXPA 4KR5A 4GD5A 2ZYMA 4ELPA 5I2NA 3H03A 2QS1A 5I57B 1UTHA 4IY6A 1P1UA 4G8HA 4ZEDA 3O2AA 1ZTYA 3RN8A 3IB2A 3FZVA 2E1SA 2ESNA 2F7CA 3M3LA 3VE1B 2X7PA 3IAZA 4LP2B 3PPNA 3K1MA 3O6HA 1QUKA 2I3WA 4PFYA 3Q29A 2V3QA 3KN7A 4GQOA 4QFLA 4F19A 4OERA 1GVCA 3PPRA 3MBPA 4OHNA 4BDRA 4LVQA 3K01A 1NKXA 1B7ZA 4FE8A 4POXA 3DELB 3T96B 3FVOA 1SW5A 1SI0A 3B6WA 4QSDA 1PB9A 4TQUQ 3FASA 2HQ0A 3LSFB 3HHFA 1O7TA 1USYE 2F7AA 3T22A 4F1YA 1R1NA 1POTA 2RCBA 1P1WA 4QSEA 2V3UA 5TPAB 2O51A 4EQBA 1MY1A 4YU0A 4C1UA 2XX7A 3ODBA 1XVYA 3C9HA 1ANFA 1MY3A 3E4RA 4R6KA 4WXJA 1QULA 3JYRA 1JEUA 3FXUA 3N94A 4PQJA 3HPIA 2GH9A 3CVGA 4GF8A 1H76A 3RT6B 3MW0A 1RKMA 1MQHA 1T0KA 3IL1B 4OXVA 3VVDA 3OO8A 3CIJA 1I6AA 1WVJA 3LSXA 4G2ZA 4RK9A 3O9PA 4RJZA 3EHTA 4RY1A 5I56B 3A3CA 3IX1A 1LAXA 4KHZE 2ZYKA 1URSA 2XX9A 1M5DA 2OJTA 2THIA 1SW4A 2Q2AA 3PD9A 1XVXA 1JETA 1JQFA 4LZ7A 4TLLB 5DVIA 2DE4A 4RA1A 3S9MC 1O64A 4AQ4A 1LFIA 1PBPA 2F34A 1QW0A 4DE8A 4R6HA 4NF8B 3KSJA 2H98A 5AA2B 5FTIA 1VFEA 3C4MA 2F8DA 1MG1A 4ESWA 3I5OA 1N0TA 3MVWA 2ZYNA 2UVGA 3IORA 4EQ9A 1D9VA 4QRZA 3QAXA 3IB0A 1I69A 3HV1A 3OO7A 2HCAA 4G8MA 2PMSA 3UP9A 4KPTA 1B0LA 2I48A 4N6PA 1B51A 4GFRA 1A54A 2H4IA 5AA4B 3K00A 2LAOA 5CMCA 3TKDA 1XOCA 1SYIA 2XXHA 4YKIA 2GHAA 1I6BA 4BLAA 1QVSA 1SQYA 1LB8A 3K0VA 1N7WA 3KJTA 4IGTA 4OFLA 3RLFE 1CE2A 1SYHA 1GR2A 3K6VA 5KDTA 2VGQA 2Y7WA 4FEDA 1TFAA 3U94A 1XHYA 3U93A 1MY4A 2R6GE 2Q9TA 1UIUA 4KYSA 4YMBA 4RK2A 3RT8A 4YAHX 2DYXA 5BUUA 3SETA 3T9VA 3EN3A 1LGBC 4EXLA 4GXSB 3QUFA 1WDNA 4PFTA 1JW4A 3RUMA 5KZTA 4BDQA 3HO7A 1IZ1A 1FW0A 3IO6A 4OENA 1NMUA 2ONRA 4OVJA 2NWJA 3PUZE 1B5HA 3PD8A 1M5BA 4MLVA 2RKMA 2F7BA 3QYTA 4IB2A 2I3VA 2RCAA 4ZE9A 3W9VA 2A5TA 2QJEA 2XX8A 1Y20A 3C35A 4UA8A 4F29A 2HAUA 5A5XA 3U72A 5H8FA 2Y7KA 4ZEIA 4R2FA 5TP9A 4E0XA 4H5GA 4IO4A 4JWOA 2DWAA 2RINA 3IR1A 1OLAA 3G3HA 4N13A 2H25A 3MPKA 4H65A 1DTGA 1BLFA 4ND9A 3HSTA 5I2NB 4NF6A 2QMXA 1Y3PA 4ZEBA 1UTHB 3OELA 4U23A 2HEUA 4C0RA 4U4SA 3K6XA 3N26A 4EF1A 5ISUA 2DSFA 1SDXA 3L6HA 1KWHA 1LBBA 3G3IA 1B3LA 2I0BA 2P0SA 3O6GA 1R9QA 1JVXA 2PT1A 1VR5A 2KLFA 1PC3A 4EF2A 3DLNA 4ZE8A 4G68A 3CRBA 5IKBA 4MFIA 2Q89A 2A5SA 4GL0A 4ELRA 3KN3A 3W15C 2NOOA 5DT6A 3KGCA 2GFEA 1OMPA 1B52A 2UVIA 3LR1A 5ELVA 2O7UA 4F3BA 3FGSA 3RNNA 1VSOA 5ITPA 3PU5A 4FAJA 2PBWA 3KZGA 1PB8A 4AB6A 1MH3A 1QUJA 2UYFA 1QUIA 4NWCA 1XC1A 4GVOA 5L9MA 4DLDA 1LBCA 3PPPA 1MM7A 3MC2A 4GIZA 2ANJA 4UACA 1USYH 2F78A 3OO6A 4F1UA 3K6UA 3MP8A 3MZBA 1XT8A 5JTYA 1R6ZA 2VD3A 3EHSA 1YCJA 1RYXA 1Y9UA 3ZSFA 2D5WA 3M8UA 3C32A 4MLQA 3TTNA 1A99A 2OCUA 3SDFA 3HHGA 4G8NA 1FTOA 1O63A 2XD2A 4WEPA 4E0WA 5BWJA 1IXCA 2DWIA 3O29A 2X7QA 3N6UA 3IO4A 1MXZA 4NMYA 3THIA 4WKMA 4POWA 5DEXA 4DXBA 4IO3A 1FTMA 1BP5A 2F35A 1AIVA 4THIA 2X26A 2XXIA 1MQJA 3E9XA 4BDNA 3K6WA 4H5FA 2E0SA 2UYEA 4LQ5A 4K3FA 5B7DA 1B5IA 4MH5A 1MM6A 2QL3A 3CFZA 4U1ZA 2HAVA 1B4HA 4AB5A 3SEWA 3TODA 2W7YA 5H8HA 2NVUB 1MQGA 3CFXA 3SKPA 4PFWA 3MJNA 4YB5A 1ELJA 1DSNA 1AMFA 1LAFE 1WODA 5F1QA 4LZ5A 1FQDA 4ZEKA 4PE5B 1LAGE 4L17A 1NFTA 5KDTB 2O1LA 1UTBA 4JWYA 1B7HA 3G3JA 1TWYA 1UIVA 3FVKA 3IJXB 3OOAA 4QSCA 3FXRA 1A8EA 3MQ9A 2RC9A 3S2VA 1FQFA 3Q28A 3OMBA 1DPPA 1Q1KA 1MY2A 3FVNA 4OTEA 3RPWA 3VVFA 3PUWE 4KYDA 1LFGA 4YICA 1JEVA 3I3VA 3EQ1A 2FNCA 1B46A 3Q26A 3UA8A 4F3PA 3GBAA 5CC2A 3TTKA 3B6QA 3RTFB 2O69A 1P1QA 2F5XA 3UN6A 2D3IA 1URGA 3MAMA 1B5JA 4JWXA 4KQPA 4YKPA 5K2YA 3OSQA 3IK6B 5FHNA 4JDFA 2A5TB 5FHMA 5I58A 3MP1A 2UVJA 4OETA 3TCGA 2R9JA 2M8CA 4NEDA 3S9EA 4OZ9A 4OEUA 3OO9A 5A5XB 5H8FB 3TEPA 1I6QA 2XXVA 1B6HA 3A09A 4NF4B 4PFUA 3IB1A 2Y7IA 3JZJA 2OZZA 2BJJX 3PPOA 2FYIA 3L6GA 4BDLA 4BDOA 1PBQA 3FXQA 4P0IA 3IJOB 2OLBA 3FJGA 3MWBA 4R72A 2I6EA 2V25A 2HFBA 3TZAA 1JVYA 2HZLA 5F7VA 5H8SA 1B0HA 2B65A 4H1XA 5H8QA 1FQEA 3DP6A 2V93A 4QFKA 3RTWB 4Q5TA 1MXUA 2WKYA 1JW1A 1PB7A 5K2XA 1MQIA 3KBRA 3F11A 3W9WA 3D4CA 3KG2A 4ZECA 4G4PA 4DCXA 3U92A 4KCDA 3RQTA 1MDP1 1FQBA 2VOZA 2DE2A 5HBCA 2O68A 2D21A 3V8XB 2DE3A 4IGRA 2XXWA 2DXYA 4XKPA 2H5YA 1AH5A 5CMKA 1OIBA 3O97A 1ZLQA 1B1HA 2Z8DA 3FJMA 4OFJA 1BIYA 3ECRA 3CFLA 5I2KB 4TLMB 1A40A 1B7UA 4OWDA 1ZJLA 4YZZA 3N5LA 4F1VA 2PT2A 1B32A 4F3GA 4I62A 2HXWA 2F36A 4Z0IA 3P7IA 3MVYA 3SERA 5KCJA 1NNFA 4DXCA 4N07A 1Y3QA 1AOVA 5JTYB 5TPAA 1MXYA 2ZNSA 2REJA 3N6TA 1P1NA 1P1OA 4H6DA 3RGYA 2F6GA 2RC7A 4H67A 1IXHA 4X1BA 4NE4A 2ZYOA 4RPOA 2QRYA 4G68C 4LATA 3PV0E 5H8NB 2XHDA 2XD3A 3GLBA 1P99A 1SVXB 1YPNA 5DEXB 1JNFA 1LB9A 4XKRA 3FV2A 2G29A 3UORA 1M5EA 2Z23A 3TQLA 1S50A 4KD5A 5FTHA 4XIGQ 4EDPA 4O3CA 1MXVA 5AA3A 3LSLA 4DXUA 4ISUA 2XXUA 3VFJA 3TCHA 3SESA 1M5FA 3SEYA 1ZBMA 1MS7A 4ZDMA 3FV1A 1N76A 1GV8A 4YKJA 3PMXA 4X1DA 2NUVA 1IQ7A 2DVCA 1A8FA 4OEVA 2XXXA 2Q2CA 1N3WA 2B3FA 3VXBA 3TCFA 1B3FA 3LBSA 3EF7A 4I1DA 1AL3A 1B4ZA 3ZS6A 1LAHE 3VVEA 4R9FA 2XXTA 3R26A 3G3GA 3FIRA 2Z22A 1FQCA 1GTKA 1Q35A 3TYHA 3MZ1A 4IY5A 5DVFA 4HS7A 3T66A 5M2VA 3K02A 3T9UA 3LUYA 3GXAA 1UTBB 4FIMA 5CMMA 3VXCA 1FTJA 3QK6A 2HZKA 1FTKA 2UVHA 3TMGA 3O6IA 2VHAA 4Z7EA 4XKQA 1TXFA 5FHOA 2V84A 3C31A 5CRYA 4IO6A 2UXAA 1VFDA 2VP1A 3Q27A 5TU0A 4OQOA 3K1PA 1H45A 1Z7ME 3R7XA 4QHQA 1ZIUA 4ZEFA 4P0GA 1N84A 2Y7PA 1MPCA 2O1MA 2RF1A 1Y1MA 5I84A 4U21A 3FJ7A 1VE4A 2Q88A 1UQWA 4EXKA 1OVTA 3OEKA 2ALUA 1II5A 1TT1A 3IOTA 3PUVE 5EHMA 2QS3A 5I58B 2R71A 4GOTA 4WEDA 5DTBA 3G3KA 3C34A 4BDMA 4LZ8A 1IITA 5JK4A 2F97A 2XXYA 4Q8RA 4X9TA 5B70A 3E13X 1QJMA 4ZS9A 1EZ9A 5CMBA 4M1VA 1H44A 5DVJA 3M3FA 3U8QA 4EUOA 4ZZEA 3DM0A 5I59A 1MH4A 2Y7RA 5J1DA 1D3KA 3BKIB 3TAJA 4R73A 1N7XA 3KN8A 1NH8A 3TTLA 1D4NA 1FCKA 2OK2A 4RPNA 1EH3A 3ZKKA 2OWSA 1B9JA 5H8QB 4RXLA 4LA9A 5CM6A 4XXUA 3RY3A 1B58A 1HSEA 4Q0CA 3KOTA 3TPAA 4OESA 4ECFA 3PMWA 4KYEA 3Q25A 2XXQA 3O28A 2I4CA 1YTVA 1H43A 3SEVA 3K4UA 1OLCA 3ILUB 2I4BA 4KI0E 3H6UA 4R9GA 1FTLA 4R6YA 1Y4CA 4JBZA 2B3BA 5IAIA 4OFOA 3VLVA 1M5CA 4DIGA 1OVBA 4G77A 1MRPA 3TQWA 1N04A 3LSWA 2ONSA 1HSLA 2I58A 3IOUA 4I8CA 5ITOA 4F2QA 1IIWA 4EQ7A 3H4ZA 2I0CA 1N3XA 2GHBA 1Z7NE 1R9LA 1DTZA 2RC8A 3O66A 3PPQA 5L9OA 5KCJB 1MDQA 3H3GA 3K2DA 3OEMA 3PUYE 3HN0A 3A3UA 1S9TA 4R74A 1DOTA 3IOVA 4O3AA 3CR9A 4U22A 4JB7A 2G93A 3H06B 1QKAA 1SD3A 3ONMA 1B2HA 4OMBA 3M3KA 3BFUA 2Z8FA 3HCQA 3QXMA 1TFDA 3UGWA 3OSRA 3ZKLA 2O6AA 1LCTA 5TP9B 2DVZA 2CZLA 4YB6A 3TUSA 3GBBA 3KSXA 5CBRA 4FECA 3PGFA 3G7WA 1B3HA 2AIXA 4U2RA 4C1TA 4RYAA 4DDDA 4QF9A 3FATA 5LOMA 5CI5A 4HCYA 5ICQA 4NF6B 1IUDA 3MUQA 4FEBA 4IO7A 3LC8A 3MVXA 1URDA 4NF5A 1QKBA 2ZXTA 5DYHA 3DP8A 3B7DA 2Z8EA 4U1OA 4HCWA 4JXIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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