2F36A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer with glutamate at 2.1 angstroms resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
TLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the kainate receptor GluR5 ligand binding core dimer with novel GluR5-selective antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f36A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f36A02
1P1WA 3QSLA 4JBZA 4E0XA 1MDQA 2PT1A 3O2AA 3OSRA 4GOTA 1NL5A 1FTMA 4JWOA 2E1SA 1PC3A 3Q28A 2F34A 1MH3A 1Y20A 4C1TA 3EHSA 1B5HA 4F39A 2F7BA 3FV2A 2QSXA 5KDTB 3LSWA 4JWYA 3CVGA 3Q27A 2O7UA 1Y4CA 1II5A 4I8CA 3CG3A 5AA1A 4RK9A 4XKNA 1UTBA 4F3SA 4FE8A 5FTIA 3VLVA 3CIJA 1US5A 5ISUA 1N04A 2I6EA 4MLVA 3DP6A 4JWXA 3S9EA 3HHFA 1M5CA 4GL0A 1DPEA 1B5IA 2F8DA 5CMCA 4IY6A 4GD5A 3M8UA 3S4UA 4F29A 5JK4A 1USYE 3C9HA 2I58A 1Y3QA 3E13X 2FYIA 5H8FB 3E4RA 4QSEA 3GBAA 4FECA 4R6HA 1VSOA 1QVSA 5ITOA 3CSGA 2NUVA 2HQ0A 2OCUA 2XXYA 1JQFA 3N26A 1MY2A 2X7PA 2HZKA 4GF8A 4KI0E 4F1VA 3RN8A 5BUUA 2FNCA 3HCQA 5K2YA 4YMBA 4ZDMA 1DMBA 3PMXA 3SKPA 3LBSA 3K4UA 3TCFA 3DM0A 1AIVA 2HFBA 4KFQA 1MQGA 2DWAA 2ABHA 1ZMGA 2IA4A 3PV0E 2F97A 1GTKA 3PGFA 4H65A 3R6UA 5H8QA 2P1SA 1P1QA 3RT6B 1UQWA 3M3LA 2QS2A 4JDFA 4H5FA 3F11A 3VVFA 4GLIA 3KGCA 3UN6A 2Y7RA 5JTYA 3K6VA 3PUWE 1ZTYA 5I57B 2DWJA 3VXCA 3PD9A 1RKMA 1IUDA 1A54A 5IAIA 1MDP1 4OFLA 2VOZA 4TOZA 2QS3A 2DE4A 4IO3A 5IKBA 3C36A 3G7WA 1B40A 2G93A 4KYEA 2REJA 3ONMA 2Z8FA 3KG2A 1SI1A 2P2AA 3TEPA 3K1MA 4YAHX 4KR5A 3VLWA 5AA2D 1IXGA 3L6GA 3QK6A 3OEMA 4OEUA 1S7YA 1R1NA 3IL1B 5I59B 4ONYA 3MP1A 1JW4A 2VGQA 5BWJA 4IO5A 3MBPA 3U93A 2A5TB 4LA9A 4PFUA 1LBBA 1VFEA 2F35A 1WDNA 1HSEA 3LR1A 4L17A 3H4ZA 3S2VA 2KLFA 5I58B 1JW5A 1MY1A 4R9GA 4GXAA 5FHOA 2PMSA 3OD7A 1B46A 2NWJA 1OLAA 4GRKA 3PPOA 3FJGA 3H3GA 4F2OA 1ZLQA 3HV1A 4YKKA 1FQEA 3O6HA 4WEDA 3C34A 1I6AA 1MQDA 3O29A 1KWHA 1SDXA 2RC9A 5I2NB 4ELPA 4DXUA 4ZZEA 3C32A 1IXHA 2XXUA 2H4IA 1AOVA 2G29A 1LAFE 4FATA 3VV5A 5DVIA 2XXPA 3CG1A 5FHNA 1M5BA 2HZLA 2VHAA 5A5XA 3CFZA 3T96B 4U22A 3OMBA 4DCYA 3PUXE 3U1OA 4GXSB 4KPTA 4OENA 1XT8A 3E3KA 4I1DA 3MVWA 1NMUA 1TFDA 1UTHB 3PPNA 4PP0A 2H9BA 2RC7A 4ISUA 3RNNA 3UIFA 1QKBA 3QUJA 3K0VA 2I3VA 4ZS9A 4PETA 4X1DA 1QW0A 1ZBMA 1Y3PA 4R9FA 2XX8A 4PFTA 4NF4A 3FATA 4NF5A 4PQJA 3QYTA 3ODBA 4ZEBA 1XS5A 2YJPA 3W15C 2RINA 5EYFA 5H8HB 4PFYA 4ECFA 3A3UA 3ZKLA 2Z22A 3FVNA 4FJPA 1ANFA 1MXYA 3S9NC 3OO9A 3RT8A 4YB6A 2ANJA 4P11A 3MWBA 2I0CA 4YICA 2NVUB 4OERA 4GIZA 2RKMA 2PT2A 1B05A 3KSXA 3BFTA 5L9SA 4EF2A 3H6UA 3TTNA 4ESWA 3TCGA 4G8NA 3OOAA 1N3WA 5TP9B 1JETA 4ZEIA 3OO8A 1P99A 1MXWA 3H6WA 2OWTA 5H8NB 1M5DA 1OIBA 1POY1 1IEJA 3UORA 4X48A 2XX9A 1BLFA 1MPDA 3WAFA 1N84A 3QUFA 1XOCA 3T66A 2I3WA 4P0GA 1BKAA 2RCBA 1B5JA 3TKDA 3T9VA 4RPOA 2XHDA 2I4CA 4F2QA 3PUYE 1B1HA 4YZZA 1SYIA 3RTFB 1XC1A 2I4BA 3V8XB 3RUMA 3TCHA 5KCJB 5ICTA 3TTMA 1QUJA 3R26A 3MP6A 3Q25A 1ATGA 1OQHA 3I3VA 3KN8A 3KZGA 2BJJX 4OZ9A 4QFOA 4HCWA 4IO7A 4RJZA 4NTLA 4IY5A 4ZE9A 4UACA 2D3IA 1IZ1A 4KYSA 3KJ7A 4Z7EA 1A8FA 3T9HB 2M8CA 4POWA 4Z0IA 3UGWA 1A99A 4UA8A 1A7LA 1I6QA 1XVYA 1EZ9A 1B6HA 1TWYA 3EHUA 2AIXA 4DE8A 1JW1A 2REGA 4G4PA 1MQHA 2OJTA 1PB7A 5HM4B 2ZYKA 3RQTA 4FIMA 1ZIUA 3W9WA 4FORA 4BDOA 1B7UA 1F9BA 4R2FA 1WODA 5CM6A 3FVGA 4P0IA 4TQUQ 3MVZA 4GVOA 3CR9A 1LBCA 1B3LA 1OMPA 2WKYA 1FTKA 2B65A 4MLQA 4OFOA 3PU5A 3ZSFA 1TXFA 1O7TA 4R6YA 4YKJA 2W7YA 5DVFA 1N3XA 1MY4A 4OXVA 2ONSA 3T9UA 1MQIA 1D3KA 5KDTA 1FW0A 1QULA 2Y7WA 5DEXA 3G3FA 3TDJA 3KBRA 4O3AA 3VE1B 4PFWA 3MPKA 2O69A 2AYSA 4EDPA 3HHGA 2ZYMA 1UIVA 3KSJA 3TQLA 4F1UA 2YLNA 2OLBA 1JEVA 4DLDA 1FTJA 4RNSA 1R9QA 1HSLA 3VXBA 3DP8A 3K1PA 1MPCA 3KFMA 2ZYNA 4NWDA 3EHTA 5AA2A 1CE2A 4GQOA 1EZOA 3IO4A 4FEBA 3K1NA 4EXLA 4KCDA 3C4MA 3H06B 3IAZA 3O66A 1A40A 3PPPA 4MH5A 5CRYA 3T9XB 3N94A 5TPAB 3IB1A 4NF6B 1B3EA 1SQYA 3OO7A 2HCAA 5JTYB 3LSLA 4R72A 1H3DA 2V25A 3B6WA 3QXMA 1MPBA 1BIYA 1MXUA 4M4GA 3GXAA 4HS7A 4OMBA 3CFLA 2OBGA 1GR2A 1ELJA 4G68C 1LGBC 1Y1MA 4LATA 1IXCA 4RK2A 2F7CA 3DP4A 2Q2AA 2DVZA 3MP8A 2ZMBA 3VLUA 2F36A 3N5LA 3MZBA 1FTLA 1PDAA 2Z23A 2UYFA 1N7XA 2V3QA 2F5XA 5DT6A 4F3GA 3PMWA 1MXXA 4R75A 4QFNA 3MVXA 5ELVA 2UVJA 4H6DA 3CFXA 1NNPA 4H0WA 4BDLA 3C35A 3TELA 3KOSA 5I57A 3IR1A 5B7DA 4YKPA 3SEUA 5FTHA 1QUKA 3RY3A 1ZKBA 2O68A 1B51A 5K2XA 2QMWA 4U23A 2OK2A 5CI5A 5I56A 1LAGE 2I48A 2R9JA 4BDNA 3MW0A 1URGA 3TMGA 3PUVE 4OESA 4RPNA 3SDFA 4DXCA 5EHSA 1B52A 1B3GA 4DCXA 3LSXA 3OO6A 4G68A 1POTA 3Q29A 1B9JA 2H98A 1UIUA 1OLCA 4WEPA 1NNFA 3TTKA 4R6KA 2PYYA 3BFUA 3V89B 4QRZA 2Z8EA 1Q1KA 3RLFE 2A5TA 3T22A 3FD3A 1Y9UA 5CMBA 4LZ8A 4GL8A 2E0SA 2RCAA 4XKQA 1H76A 1SI0A 1OVBA 3KOTA 5I58A 1FQCA 3TODA 1LCTA 3IO6A 3U92A 4IB2A 3IX1A 4F31B 5I2KB 2ALUA 3EPEA 5HBCA 2I0BA 3VDFA 1DSNA 4MF3A 3RPWA 1MY3A 4LZ7A 2GH9A 2Q2CA 4HW8A 1AMFA 2GHAA 2Y7IA 3B6QA 1VR5A 3UA8A 3OENA 1N76A 2CZLA 3Q26A 3G3IA 3THIA 5F7VA 2B3BA 4QFKA 2DWHA 2H5YA 2X7QA 4ZEKA 4OYVA 2UVGA 1MXVA 2V93A 3IB0A 4EUOA 4NF5B 1FTOA 3FV1A 4K3FA 5CMMA 5F1QA 2OZZA 2Q89A 5J1DA 2XXVA 5CBSA 2DYXA 4NMYA 2XX7A 2ZNSA 4H8IA 1SBPA 2Y7PA 4DDDA 3D4CA 1A55A 1EH3A 4KQPA 3V5AA 2V3UA 4G8MA 1NKXA 1H45A 1UTHA 4QF9A 2XXIA 3QAXA 4G77A 1Z7ME 4OVJA 1IIWA 5CMKA 1MG1A 4EQBA 3SEXA 5AA4B 4NE4A 3IOTA 3M3KA 2LAOA 3IORA 3FXUA 1B58A 3OELA 4H8JA 2ZXTA 1SD3A 3U72A 4EF1A 1B4HA 2XXQA 3TQWA 1FQFA 3IJOB 1N7WA 2UXAA 4MBPA 3ILTB 1I69A 3FJ7A 3L6HA 2DSFA 3PD8A 1FQAA 5ITPA 4EQ7A 4OTEA 1TT1A 1B0LA 4C0RA 4ELRA 2IEEA 3TTRA 1H43A 2HAUA 1D9VA 4QSDA 1VFDA 4KD5A 3MZ1A 3H03A 1LSTA 3FASA 4R74A 3G3GA 3HSTA 3CI8A 1PBQA 1YAEA 4PE5B 4ZZAA 4XKRA 3R7XA 3D4GA 1B3HA 2X26A 4IO6A 1PB9A 3EN3A 4KHZE 4QSCA 1S50A 2F6PA 1JVXA 3IK6B 4NF8B 4BDQA 3MQ9A 2H99A 4R2BA 1JVYA 3OEKA 2OWSA 4RXLA 1YPNA 3TTLA 2Z8DA 4LVQA 2NXOA 3K2DA 5LOMA 4H1XA 2THIA 3H6VA 1NH7A 2DP8A 3SESA 3N6TA 1P1UA 4U1ZA 3C33A 3N6UA 4WKMA 4IO2A 3C31A 2Q9TA 2F7AA 2DS9A 3V83A 1I6BA 1JEUA 4HCYA 3MC2A 2NOOA 3LUYA 2UVIA 4M1VA 3O97A 1B0HA 3HPIA 4KCCA 1LLSA 3SERA 2XXRA 1UTBB 2ONKE 4E0WA 5DTBA 1Q35A 4F22A 3MZ9A 1PB8A 4KYDA 4ZECA 3JZJA 4F3PA 5H8SA 1LCFA 4N07A 1Y1ZA 2O1LA 1B32A 5DEXB 1DTZA 2A5SA 2R6GE 2VP1A 4ELOA 4BLAA 2B3FA 1FQBA 1ZU0A 4FEDA 1SW4A 3FVOA 2F78A 4I62A 1LB9A 3HO7A 3I6VA 2DVCA 2DWIA 4QHQA 4H67A 4Q0CA 5JEIA 4LQ2A 1DOTA 1NNTA 4R73A 3FIRA 4F3BA 2O1MA 2PBWA 3EQ1A 4F19A 2UYEA 3RGYA 3H7MA 1MXZA 4ND9A 5AA2B 4IO4A 2XXWA 3TZAA 4G2ZA 4QFLA 1NFTA 5DVJA 3ZS6A 5FHMA 3IJXB 1EU8A 4JXIA 3G3HA 1WVJA 1QJMA 1RYXA 3SETA 5KZTA 1YCJA 3OSQA 4U1OA 1FQDA 4Q30B 1US4A 2D5WA 4AQ4A 2QPQA 5H8FA 5H8QB 1JNFA 4ZE8A 1IXIA 3HN0A 4LUBA 1SYHA 3BKIB 2HXWA 2GFEA 1S9TA 2V84A 3GLBA 3LC8A 5DYHA 1LFGA 1GV8A 4XTCQ 4YMAA 3IOWA 4GWOA 3K00A 2Q8JA 2QRYA 3MVYA 4N6PA 4YB5A 2O51A 1OQGA 5HPQA 2O84X 2HAVA 3T93B 1O63A 2PX1A 4NWCA 1YTVA 3SEVA 4MFIA 1N0TA 2DE2A 5TPAA 4YB7A 4LQ5A 4OHNA 3ECRA 3SEWA 1B3FA 2GHBA 4NF6A 1ZJLA 4AB5A 1SW1A 3U8QA 3AXFA 3MUQA 1B7HA 3FVKA 3PPQA 2XXHA 1BP5A 3FGSA 3VVDA 5CC2A 2D21A 2QS4A 3WAEA 3CSBA 2O6AA 4OQOA 4OFJA 1SVXB 3ZKKA 1LAHE 1LB8A 2DXRA 1Y4TA 2RF1A 3MJNA 1PEBA 4F18A 3U94A 1MQJA 1TFAA 5CBRA 5I56B 4OEVA 4TLLB 1URDA 5B70A 1B7ZA 4U4SA 4X1BA 2DOJA 4JSDA 2H25A 2DE3A 3TPAA 1H44A 1EZPA 4JB7A 2YPNA 4F1YA 2PVUA 4G68B 1SW5A 2I49A 4OWDA 3FXQA 1MM7A 1P1OA 3K6WA 3W9VA 4RY1A 4U21A 5TU0A 4HTGA 2HEUA 2CMOA 1AH5A 3EF7A 1QUIA 3IB2A 3JV9A 4O3BA 2ONRA 1VE4A 4TLMB 2DXYA 5I59A 1J1NA 4IGTA 2ZYOA 1LFHA 1USYH 3PUZE 4JSOA 2VD3A 5L9OA 1AL3A 3G3JA 1Z7NE 1XHYA 1NH8A 4IGRA 4Q8RA 4I9DA 3MAMA 2Q88A 4N13A 4ELQA 1LFIA 3GBBA 2DQVA 1MRPA 1MY0A 4BDRA 1GVCA 5A5XB 2Y7KA 4AB6A 1FCKA 1B2HA 1OVTA 2ZNUA 3S9MC 4U2RA 1MM6A 4XIGQ 3UP9A 4RYAA 4ZEFA 4WXJA 3UK4A 4POXA 2XD2A 1R9LA 3USDA 3PPRA 4EQ9A 3JYRA 1O64A 1Y3NA 2GRVA 5ICQA 2RC8A 1BTJA 3SEYA 2XXTA 5I2NA 4YU0A 1HSJA 3KEIA 4NF4B 4U4XA 5I2KA 3K02A 1CB6A 3A09A 3CRBA 3KN3A 3M3FA 2V3TA 4NEDA 4YKIA 3O6GA 3TYHA 5EHMA 2ZNTA 3P7IA 2AL5A 3B6TA 3K01A 1D4NA 3K6UA 2R71A 3O28A 1MS7A 5L9MA 3IOVA 4ESXA 4OETA 4O3CA 1T0KA 3O9PA 4LP2B 4FAJA 1DPPA 2FA7A 1RYOA 5AE4A 3RTWB 3IOUA 1M5EA 3E9XA 5H8HA 4BDMA 4QFPA 2XD3A 5I84A 4DXBA 2UVHA 3LSFB 3BBRA 3S9LC 3O6IA 2VD2A 3KJTA 3I5OA 5AA4A 4LZ5A 3TUSA 1MH4A 3KN7A 3PMVA 4Q5TA 1QKAA 5M2VA 2O7IA 4XXUA 1D9YA 1URSA 3OXNA 1M5FA 5L8DA 3H6TA 3FJMA 1XVXA 3DELB 3K6XA 4EXKA 4C1UA 5TP9A 3VFJA 1B4ZA 2ESNA 4X9TA 1P1NA 4G8HA 4LONB 3G3KA 3B7DA 4RA1A 2Y84A 5H8NA 1A8EA 4ZEDA 3A3CA 2F6GA 4DIGA 2XXXA 1IQ7A 4GFRA 1LAXA 1L5TA 3FXRA 1IITA 3DLNA 1R6ZA 3ILUB 3FZVA 3TFLA 1DTGA 2QJEA 2QL3A 3MPLA 4H5GA 1SW2A 2P0SA 5KCJA 5AA3A 2AL4A 3FUZA 1NNKA 3QIMA 2QS1A 3VVEA 2QMXA 3TAJA 4DZ1A 4THIA 1GGGA 1PBPA 3GZGA 4NF8A 4XKPA 1B1XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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