2F7BA

Catm effector binding domain
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
QTLRIGYVSSLLYGLLPEIIYLFRQQNPEIHIELIECGTKDQINALKQGKIDLGFGRLKITDPAIRRIVLHKEQLKLAIHKHHHPNQFAATGVHLSQIIDEPMLLYPVSQKPNFATFIQSLFTELGLVPSKLTEIREIQLALGLVAAGEGVCIVPASAMDIGVKNLLYIPILDDDAYSPISLAVRNMDHSNYIPKILACVQEVFATHHIRPLIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Distinct Effector-binding Sites Enable Synergistic Transcriptional Activation by BenM, a LysR-type Regulator.
pubmed doi rcsb
molecule tags Gene regulation
source organism Acinetobacter baylyi
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator catM
total genus 66
structure length 214
sequence length 214
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f7bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f7bA02
3QK6A 4DDDA 3H6WA 2V3UA 2YJPA 1LFHA 3SDFA 3IAZA 4OEVA 3ODBA 1GVCA 4F1UA 4IGTA 1XS5A 5AE4A 1LLSA 1ZTYA 3O28A 3TQLA 4KQPA 4IO7A 5DVIA 4OMBA 4E0WA 2FNCA 4IB2A 3RUMA 1IZ1A 3FGSA 1FTOA 5TP9A 3HHGA 2RINA 4P11A 3Q25A 4ZEKA 3U93A 3H03A 3TAJA 3RPWA 1Z7NE 1DTZA 3KOTA 3G3HA 1PC3A 5CBRA 4ZDMA 4ZZAA 4LQ2A 1NNPA 5TPAB 4DIGA 5ELVA 2F6GA 3U94A 4BDQA 3LSLA 5HPQA 3IL1B 2Z8FA 3EPEA 1YPNA 1TFAA 3R6UA 1US4A 1MH3A 2OCUA 4ND9A 4LATA 1Y20A 2NXOA 2AIXA 2O7UA 3M3KA 3VXBA 2DS9A 4O3BA 1MY4A 3TEPA 1FTKA 4LVQA 4F2QA 5KDTA 3PUWE 3VE1B 4NF5B 3SEVA 1LBCA 3VVEA 1URDA 2XX7A 2PT1A 4KYEA 4GRKA 4OXVA 5I56B 3KSJA 4OETA 3N6UA 1OQGA 2QSXA 1WODA 4UA8A 3BFUA 2REJA 1SD3A 5KCJB 1NL5A 1P1OA 4G8HA 2I4BA 3CSGA 1WDNA 2RCBA 4G68C 1FTMA 4TLMB 2FA7A 3E9XA 5H8HA 1MXVA 4XKNA 4LUBA 3OSQA 2OWSA 5B70A 2O6AA 1MXZA 4GXAA 2ZYOA 2XXYA 4Z0IA 4GXSB 2Y7RA 5ICTA 3H6VA 3S2VA 2M8CA 1SQYA 1NNTA 1HSEA 3N26A 3PPOA 1OQHA 4NF4A 3QUJA 3FATA 4NF8A 4F3BA 1URSA 5HBCA 5I57B 2F35A 2Q88A 2XXUA 3SEXA 3CFZA 3FIRA 2H25A 4PFYA 4ZEIA 4FE8A 5I2KA 1JW5A 2ZYMA 3VXCA 1B2HA 1Q35A 3TCGA 4OYVA 1DOTA 1NNKA 3ILTB 4RPNA 3C34A 3O97A 3EHSA 1B40A 1RKMA 1N04A 3FV1A 1FQAA 3IJOB 3JZJA 4YZZA 4R2FA 4KCDA 3OO9A 3IOWA 1ZBMA 3MVZA 5JK4A 4JWYA 2Z8EA 1AH5A 3HCQA 4IO4A 2O84X 4PETA 4F31B 5F7VA 3TTLA 3CI8A 2QS4A 1MDP1 5AA4B 3V83A 1I6QA 1XOCA 3USDA 2DXYA 1R9QA 4FECA 1SI1A 3TODA 4ZECA 1A40A 3S9LC 3D4GA 4LP2B 3TKDA 4OFJA 1GGGA 2ABHA 3S4UA 1MY3A 2AL5A 1QUJA 1ZIUA 1P1UA 1I69A 2XXTA 3A3CA 2O68A 1OLCA 3ZS6A 4YKPA 5AA2B 2HEUA 4H0WA 3WAFA 1TWYA 3O66A 3H6TA 5ICQA 4JSOA 5H8NA 1AIVA 5JTYB 3C35A 4G2ZA 3CRBA 3TTRA 2VP1A 3T93B 2AYSA 3FVNA 4NE4A 5I84A 4QSCA 1P1NA 3N6TA 5IKBA 1LAHE 4RK2A 3CG3A 4Q8RA 1KWHA 3O2AA 3IO6A 3IO4A 3E4RA 2I58A 3DP6A 3KFMA 1J1NA 5FTIA 1USYE 2DE2A 1LSTA 2DSFA 2ZXTA 2DP8A 4IO5A 5I2NA 2I3VA 1UTHB 1B4ZA 1P1QA 2PMSA 2Y7IA 1MQHA 5F1QA 4IO3A 4YMBA 1B6HA 4ELPA 2F6PA 5H8QB 2DOJA 3TTMA 4UACA 1MPDA 2Q89A 3DELB 3IJXB 4RJZA 4OVJA 1USYH 4YKIA 2HFBA 1UIVA 2OJTA 2XX9A 2YPNA 1XC1A 5H8SA 4BDMA 2PYYA 2RC8A 4QSDA 4X1BA 5TPAA 1S50A 4RXLA 3SEYA 2QJEA 1POY1 4DXUA 3SETA 4NTLA 3LSXA 3IB2A 4H67A 3IOUA 3RTFB 5L9SA 3H7MA 2A5TB 4BLAA 2H9BA 1B3HA 3SESA 2DWHA 4H8IA 4NF5A 1YAEA 1FQDA 1HSLA 4OERA 1N76A 1MM7A 4PQJA 4NWCA 2XX8A 1ANFA 2Y84A 4GIZA 1B7UA 3B6TA 4F3GA 3G3FA 1F9BA 3FVKA 4N07A 4EUOA 2AL4A 4JWXA 2ANJA 4OQOA 4LZ7A 2GFEA 2YLNA 4U22A 4ECFA 2DQVA 1US5A 4YB6A 5DEXB 3VLWA 5KCJA 1L5TA 2XXRA 4F39A 4R9GA 1B0HA 1EZPA 1T0KA 4FJPA 4PE5B 4EXKA 3RY3A 4XIGQ 1JEVA 4GOTA 2PBWA 3TTKA 3RLFE 4JBZA 5M2VA 4OHNA 1Y4TA 5BWJA 3FJGA 2OK2A 3BBRA 5I57A 1GV8A 3GLBA 1B5HA 3T9XB 1Y3NA 3K6WA 3T9VA 4ELOA 3RT6B 1LB9A 4OTEA 1B05A 1B5JA 1RYOA 4MLQA 3QUFA 4O3CA 1GTKA 2XXVA 2QL3A 2QMWA 5DTBA 1SI0A 1MRPA 3V89B 3ONMA 2RC9A 3K4UA 4RA1A 4QRZA 1BLFA 3GZGA 2X7PA 2H5YA 5ITPA 2UVHA 4ONYA 5L9MA 5KZTA 1WVJA 1LGBC 1PBPA 3K6XA 1ZMGA 1M5FA 3FD3A 1QUKA 1D9YA 2F78A 5ISUA 4LONB 2DWJA 5I58B 3OO7A 1IXGA 5CI5A 4ZEBA 3KGCA 4TQUQ 4KCCA 3UP9A 2R9JA 2ONKE 2REGA 3PUVE 1SW5A 4ISUA 3N94A 4JXIA 3ILUB 1XT8A 3FUZA 2DWIA 4FEBA 3SEWA 3C32A 4U1OA 3PUZE 4E0XA 1FQBA 3MPKA 3MAMA 4ZEFA 1IEJA 1O7TA 3VLVA 1ZJLA 4OWDA 3KOSA 3VFJA 4HCWA 4YMAA 5K2YA 3UA8A 3L6GA 3PPPA 4FAJA 3O6HA 2V93A 2XXXA 4WEPA 3TCFA 4OEUA 1QVSA 3DP4A 3MW0A 1JVYA 1R1NA 4K3FA 5AA2A 2H4IA 3TMGA 2RCAA 3RGYA 4R75A 1MXWA 4Z7EA 3TCHA 2DVZA 2RF1A 5JTYA 1PEBA 4R6YA 3EHUA 3KEIA 5EHMA 4DE8A 2Q2AA 4G4PA 3LC8A 4R74A 1DSNA 1H76A 3SERA 4G68B 3IB1A 2XXQA 4ZZEA 3G3KA 2UYFA 2O1LA 3MC2A 2F8DA 4YB5A 3S9NC 3K1NA 2UVJA 3TYHA 1UTHA 4BDLA 1N7XA 1MQGA 3O6GA 1OVTA 1IIWA 3LBSA 1EZOA 3ECRA 3RQTA 4LA9A 2HQ0A 5H8QA 2IEEA 1VFEA 3MZ1A 3G3JA 3HN0A 1Y9UA 1UIUA 4KYDA 1JNFA 3FXQA 1YTVA 3MP1A 1JETA 3PV0E 4JWOA 4GVOA 3A3UA 3JV9A 3CG1A 2ONSA 4F1YA 1MY1A 4MLVA 3IK6B 3LUYA 3D4CA 4QFKA 1LBBA 3U92A 2HAVA 3DLNA 4OESA 4LZ5A 5CMMA 2UVGA 2NVUB 3ZSFA 4AB5A 1FTJA 4XKQA 2ZMBA 3PMXA 1QKAA 3QYTA 1N3WA 2ESNA 4H6DA 1MY2A 3ZKKA 4XXUA 1JQFA 1DPPA 5I59A 4ESXA 3IR1A 3CSBA 2HZKA 1OIBA 2A5TA 2OBGA 4PFTA 1LB8A 3K2DA 4EQBA 2Y7WA 4N13A 2VHAA 4X48A 2XXWA 1XHYA 4ELRA 4EQ7A 5DYHA 3C36A 4IO6A 3PMWA 1NFTA 1LAGE 2V3QA 3W9WA 1ZLQA 4F29A 4F2OA 5DEXA 1LAXA 2E0SA 4JDFA 4GWOA 4G8MA 1SDXA 2GHBA 4GFRA 4H1XA 1IQ7A 4F19A 5AA2D 2O51A 2BJJX 1OVBA 1A55A 3WAEA 4R73A 3C9HA 2F7CA 1MG1A 3DM0A 4R9FA 2PX1A 4YICA 3U1OA 1FQFA 2OLBA 5J1DA 1BTJA 1OLAA 2V25A 3VVDA 2DWAA 3IORA 4U2RA 1TFDA 3OEMA 4U21A 2XD2A 4GQOA 3LSFB 2WKYA 2Z8DA 3K01A 3T9UA 3O9PA 1FQCA 3JYRA 1MH4A 3EF7A 3W15C 4XKPA 4POXA 3PPQA 4POWA 4ZE9A 1P1WA 4O3AA 2F5XA 3DP8A 1PB8A 4KYSA 1D3KA 4OFLA 3C31A 4BDNA 1Q1KA 3VLUA 1H43A 1VFDA 1XVXA 1JVXA 5CMCA 1RYXA 3Q27A 4PFUA 1IXCA 1B3LA 4GL8A 4KI0E 1SW2A 1D4NA 4RK9A 2O69A 2B3BA 2Q8JA 3MPLA 4FIMA 1M5DA 2DVCA 1MQDA 2F7AA 1B32A 2B65A 2P2AA 3KN7A 2XHDA 3P7IA 4DLDA 1YCJA 3FXRA 4BDOA 4MF3A 4C0RA 2B3FA 3MBPA 4ELQA 5I58A 2DE4A 3ZKLA 2I0BA 3MP6A 3TQWA 4F18A 1A8FA 3I6VA 3FV2A 4WKMA 1MPCA 1ATGA 3UORA 2P1SA 1Y1MA 1MY0A 5CMKA 4Q0CA 2D5WA 3KN3A 2I49A 5H8FB 2P0SA 3HPIA 1A8EA 3MZ9A 4I8CA 2QPQA 5I56A 1FTLA 3MVXA 1NMUA 4EDPA 2PVUA 3K6VA 3MVWA 2ZNUA 1TT1A 3PPRA 4WEDA 1PB9A 4YKKA 5B7DA 3K1MA 1Y3QA 1I6AA 1GR2A 3TDJA 3UN6A 3LR1A 1VR5A 3HV1A 5ITOA 2FYIA 3C4MA 3KG2A 1MXXA 1VSOA 1MDQA 1LFIA 2W7YA 2F7BA 2RC7A 3TELA 3K0VA 4HW8A 2LAOA 4OZ9A 3KJ7A 2ZYNA 3G7WA 3KZGA 1B52A 3PD9A 3QSLA 2G93A 1AOVA 3G3GA 4XKRA 2GH9A 4H8JA 1QKBA 4G68A 2F97A 1B5IA 2F34A 3KN8A 5FHOA 1URGA 3PMVA 1JW1A 1LAFE 1M5BA 1A7LA 4H5FA 2QS1A 2CMOA 4QF9A 4QHQA 1MXUA 1PBQA 1M5CA 4YKJA 5DT6A 2G29A 3QAXA 3Q29A 1Y1ZA 3LSWA 4DZ1A 3MP8A 3K00A 4EF2A 3B6WA 5EHSA 3HO7A 3PUYE 2D21A 4U4SA 2F36A 3GBBA 3B7DA 1B4HA 4DXCA 2Q2CA 2CZLA 3FJ7A 3KJTA 3G3IA 4PP0A 4KD5A 1MM6A 1ZU0A 2IA4A 2Z22A 3O6IA 2E1SA 1B51A 2ZNTA 5FHNA 2GRVA 4LQ5A 5TU0A 3OEKA 3A09A 2GHAA 1DTGA 4I1DA 5AA4A 1SBPA 5K2XA 5L8DA 1SYHA 4YAHX 5FTHA 3TZAA 1XVYA 3SKPA 3GXAA 2OWTA 2VGQA 2VD2A 3OELA 3CVGA 1B7HA 1H45A 3S9MC 2I6EA 4IY6A 5AA3A 3FXUA 3SEUA 4HTGA 4GF8A 4MFIA 3Q28A 2OZZA 4R6HA 3RT8A 5CBSA 3OMBA 5JEIA 2HXWA 4RYAA 3EN3A 3PD8A 4X9TA 3L6HA 1JW4A 3K6UA 4IO2A 1MPBA 4JB7A 3I5OA 1FW0A 1Y3PA 4ESWA 3H4ZA 2UVIA 3UIFA 4QSEA 4THIA 3R26A 5A5XB 3FVGA 3H06B 1CE2A 2NOOA 3OXNA 4GL0A 1NNFA 2R6GE 1UTBB 1LCFA 1R6ZA 2X26A 4EQ9A 3RN8A 3IOVA 3TFLA 4NF6B 2I3WA 3CR9A 1AMFA 1P99A 1MXYA 4DXBA 5FHMA 4QFPA 3V8XB 4G8NA 3PGFA 1B9JA 4RPOA 4F22A 2DE3A 1IITA 2O1MA 3BKIB 1BIYA 3EHTA 1SVXB 1DPEA 4R6KA 1D9VA 2H98A 4ZS9A 2XXIA 3HSTA 4NEDA 1N7WA 4NWDA 3MUQA 4P0GA 1FQEA 1NH7A 1Y4CA 4FEDA 3KBRA 2ZYKA 3MVYA 5AA1A 1POTA 4BDRA 4Q30B 1BKAA 3HHFA 4I62A 3TTNA 2PT2A 4L17A 3VV5A 1AL3A 3M3FA 4M4GA 1BP5A 1M5EA 5TP9B 4HCYA 2UYEA 1FCKA 4YB7A 4EF1A 3V5AA 1ZKBA 4F3SA 3FASA 3TPAA 5H8FA 3K1PA 1B3FA 2XD3A 4KPTA 1S9TA 4GLIA 3UGWA 1O63A 1A99A 1MS7A 3T9HB 2THIA 3CFLA 4RY1A 4Q5TA 1Z7ME 5CM6A 1II5A 5HM4B 1B0LA 1SYIA 2QMXA 1N0TA 2I0CA 1UQWA 5KDTB 2V3TA 4NMYA 4LZ8A 4XTCQ 4HS7A 4F3PA 2QRYA 3OD7A 2NWJA 5IAIA 3UK4A 1QULA 4N6PA 4AB6A 2VOZA 4ZE8A 4AQ4A 4R2BA 5CMBA 4IY5A 3RNNA 1TXFA 3H3GA 1A54A 3N5LA 3VDFA 1CB6A 4QFNA 1QJMA 3E3KA 1VE4A 3TUSA 2I48A 1SW1A 3OO6A 4KFQA 3OSRA 5LOMA 4JSDA 1PB7A 1B7ZA 2D3IA 2H99A 1EH3A 5H8HB 1B46A 1MQJA 4X1DA 4DCXA 1OMPA 2NUVA 2ZNSA 2VD3A 3E13X 3M8UA 3CFXA 1N3XA 1S7YA 1LFGA 1B58A 4U23A 1I6BA 4MBPA 4RNSA 2Q9TA 3AXFA 4M1VA 1LCTA 4NF4B 5L9OA 4PFWA 2UXAA 4NF8B 1H3DA 1QW0A 1QUIA 2V84A 1B1HA 2RKMA 4G77A 1B1XA 3MJNA 1DMBA 2QS2A 3F11A 3KSXA 5I2KB 2KLFA 3MWBA 2I4CA 1O64A 4TLLB 3B6QA 1R9LA 4OENA 3H6UA 2O7IA 4YU0A 1N84A 4OFOA 3M3LA 1HSJA 1B3EA 1PDAA 3C33A 1JEUA 4IGRA 4KHZE 3T22A 4C1UA 2HCAA 1IXIA 4P0IA 4EXLA 2QS3A 5EYFA 1SW4A 2R71A 2Y7PA 3CIJA 3I3VA 3FZVA 4KR5A 3THIA 4U1ZA 1NH8A 3PPNA 1ELJA 5I59B 4F1VA 5CC2A 2X7QA 2ALUA 5BUUA 2A5SA 2XXHA 1NKXA 2HAUA 3K02A 3OO8A 3QXMA 5DVJA 4C1TA 3RTWB 3EQ1A 1MQIA 1EU8A 4GD5A 2Z23A 1H44A 4I9DA 3PUXE 3Q26A 3OENA 5A5XA 2HZLA 1IUDA 4U4XA 3QIMA 3T66A 1UTBA 3BFTA 3MZBA 2Y7KA 4H65A 3U8QA 4ZEDA 4FORA 4NF6A 5DVFA 3IB0A 3R7XA 3S9EA 4TOZA 5H8NB 2XXPA 3IOTA 3T96B 3FVOA 1B3GA 2ONRA 5CRYA 3GBAA 4WXJA 4QFLA 4FATA 4MH5A 4H5GA 2DYXA 4DCYA 3O29A 3IX1A 3OOAA 3U72A 3MQ9A 3FJMA 1IXHA 1EZ9A 3W9VA 4QFOA 3PU5A 4R72A 5I2NB 2DXRA 3VVFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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