2F7BA

Catm effector binding domain
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
QTLRIGYVSSLLYGLLPEIIYLFRQQNPEIHIELIECGTKDQINALKQGKIDLGFGRLKITDPAIRRIVLHKEQLKLAIHKHHHPNQFAATGVHLSQIIDEPMLLYPVSQKPNFATFIQSLFTELGLVPSKLTEIREIQLALGLVAAGEGVCIVPASAMDIGVKNLLYIPILDDDAYSPISLAVRNMDHSNYIPKILACVQEVFATHHIRPLIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Distinct Effector-binding Sites Enable Synergistic Transcriptional Activation by BenM, a LysR-type Regulator.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator catM
molecule tags Gene regulation
source organism Acinetobacter baylyi
total genus 66
structure length 214
sequence length 214
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f7bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f7bA02
3MVYA 3CSBA 3CIJA 5KCJB 5DEXB 1D9YA 3TTMA 2F34A 4KCDA 2ALUA 3DLNA 2OJTA 3H06B 4BLAA 3ONMA 4NEDA 5HM4B 1MDQA 5H8QB 3VDFA 3TZAA 5F7VA 3C4MA 1Z7ME 4H8IA 2UVJA 3OEKA 4OERA 4ZEFA 3DELB 1OVBA 2RCAA 2F7AA 3B6WA 5CMKA 4IY6A 3H7MA 1SW1A 2HXWA 4RNSA 3HV1A 4FIMA 3EHTA 3E3KA 1Y4CA 2XD3A 4TLMB 4ONYA 4LZ5A 2X26A 1BIYA 5FHOA 1LFGA 1XOCA 1URDA 1B2HA 3KOTA 4YAHX 2NXOA 3IORA 4OENA 3IJXB 3OELA 5KZTA 2UVHA 1I6QA 3WAFA 2Z23A 4I62A 1N7XA 1NNPA 4Z0IA 5CC2A 1RYXA 4XXUA 1JEUA 4G4PA 4F1UA 4EQ9A 4IB2A 5LOMA 1GR2A 1B1HA 3PV0E 1R6ZA 4LONB 3MC2A 2O1MA 5CMMA 2E1SA 1GTKA 5H8FB 4BDRA 3OO8A 3USDA 4NF6B 1JNFA 3OO9A 3TELA 2GHBA 1URSA 3O29A 2YLNA 1H76A 3FVGA 1F9BA 4KD5A 1IXIA 3LSLA 1NL5A 3KGCA 5I2KB 1MY2A 4QFKA 2QS1A 2UVGA 3A3UA 3K4UA 2HQ0A 5DYHA 1O63A 1YPNA 3OXNA 4GOTA 2KLFA 1MM7A 1PB7A 4PFYA 2R9JA 4DDDA 1A7LA 2DVCA 2QS3A 4OZ9A 2ONRA 1N3XA 1XS5A 4NWCA 3L6GA 4PE5B 4F3PA 4PFUA 3O6GA 2F7BA 1UTBA 4HTGA 2AL4A 4WEPA 4F3GA 1VE4A 3BKIB 3R26A 3QXMA 3PPRA 2ZNTA 3SEWA 1DTGA 2GH9A 4UACA 4KCCA 2VD2A 2OBGA 4GRKA 4C1UA 2QMXA 3MP6A 4TOZA 1B3GA 3CRBA 3GLBA 4ZEBA 5AA2A 2AL5A 4OEUA 1P1QA 4YMBA 2H25A 2DOJA 3K6VA 4R73A 2I6EA 4JWOA 1L5TA 2R6GE 1PB9A 4DCYA 5HBCA 1P1NA 3SESA 1FQBA 3IL1B 1N7WA 3PD8A 3G3IA 3RN8A 4NF4A 3FGSA 3UP9A 3IB1A 3V5AA 4OXVA 3O6IA 1QUKA 2A5TA 1B05A 3G3JA 3FUZA 5H8SA 1MG1A 4LZ7A 4IO4A 3I6VA 4OFJA 4NF5A 2V93A 4R74A 2XXVA 3M8UA 2HAVA 4NWDA 3EPEA 3CI8A 2M8CA 4U22A 1IZ1A 3IJOB 3TKDA 1QW0A 3T22A 4LVQA 4G8HA 5EHMA 3VLUA 3IB2A 3K6WA 4OEVA 3EF7A 2Y7RA 3D4GA 2XD2A 1MY3A 3QAXA 3DP8A 2RC7A 3C36A 4QHQA 1RYOA 1VFDA 1DMBA 2F8DA 1IXGA 5L9OA 4YB6A 4EF1A 3C35A 5JEIA 3QUFA 1SW2A 4F3SA 1OQGA 4H1XA 4KYDA 1JETA 3OENA 3ILTB 5H8HA 4YZZA 2DXYA 2H4IA 1UTBB 1SDXA 3IOTA 2OLBA 3Q25A 1TXFA 1MPCA 4G2ZA 3UGWA 4O3CA 2R71A 3V83A 4LQ2A 4U23A 3H6WA 3TTKA 1IXCA 4K3FA 3VVDA 4GD5A 1H44A 5B70A 5CBSA 4YKKA 1I6BA 4JSOA 2GHAA 4FORA 1FQFA 3MP1A 5AA2B 1A8FA 1N84A 3MVZA 1M5FA 3K6XA 3IO4A 1ANFA 1IEJA 4F1YA 3RUMA 4PFTA 4R9GA 1UIUA 1YCJA 4KYSA 1POY1 2O7UA 3MUQA 4POXA 4IO6A 2CMOA 4EDPA 3RNNA 5DEXA 4NF4B 4LATA 4RJZA 2PT1A 2HZLA 4OMBA 3E4RA 2F6PA 3BFUA 2HFBA 3PUXE 3E13X 4ZE9A 4HS7A 2FNCA 4ZZAA 4GIZA 5F1QA 1LFHA 1R9QA 2I58A 3MQ9A 1JVXA 1LAXA 5B7DA 1PDAA 2Q9TA 4BDMA 3VLWA 1URGA 1MY0A 3O9PA 1BKAA 1B51A 3CFZA 3N6UA 1PBPA 3S9LC 2PBWA 3HPIA 2Y84A 2XXQA 2V3QA 3IOVA 2CZLA 1I6AA 1IIWA 1PB8A 3K0VA 3U94A 1MY4A 3TUSA 1MXZA 1JW4A 1B9JA 1UTHB 1GGGA 1A99A 1Q1KA 2H98A 3QSLA 4LP2B 3ZS6A 3C31A 2Z8FA 4GQOA 4F31B 3OMBA 3MVXA 1LBBA 5H8HB 2W7YA 4BDNA 3MZ9A 1A54A 1YAEA 1ZIUA 5DTBA 2LAOA 3S9EA 3W9WA 3S9MC 3G3KA 5IKBA 5H8NA 1B0LA 4OESA 3ODBA 1B5JA 2O7IA 1TWYA 1ZJLA 4ZDMA 3FJ7A 1B4ZA 2ONSA 2NWJA 5L9SA 1XHYA 2XX7A 3A3CA 1Y20A 1WODA 1USYE 4Q5TA 1MXXA 3PUWE 4P11A 4X1DA 3MAMA 1FCKA 3DP4A 1FQEA 3UORA 1EZPA 4H67A 3PUVE 1D3KA 1ZKBA 1MQDA 4KHZE 3LSWA 2DP8A 4R6HA 2F78A 1MXYA 2ZNSA 2VP1A 3FATA 5AA1A 2RF1A 2ZYOA 2DE4A 1LAFE 1OVTA 1MXVA 4H5FA 3KN3A 2QS2A 3FV1A 4GFRA 4OYVA 4U21A 4IGTA 1N3WA 1BLFA 2XXTA 3FV2A 1P1OA 5KDTA 1MPDA 2P0SA 4DXUA 2H5YA 3PGFA 1SQYA 3FIRA 3EQ1A 3TCFA 5I56A 2UXAA 1NNFA 3G3FA 4XKNA 1SVXB 4FJPA 4FE8A 1ZMGA 4F3BA 1XVXA 3F11A 4H65A 3FJMA 4KR5A 3KJ7A 2I48A 2O6AA 1ZTYA 4GLIA 3OOAA 2XXIA 1OLAA 1QKAA 4RPNA 1B3HA 2BJJX 4KPTA 3CR9A 4KQPA 2B3BA 2V25A 3TDJA 3K02A 3H4ZA 1B7ZA 1Q35A 3FVNA 1EU8A 3M3LA 2ESNA 4YKIA 1VSOA 1B3FA 4MBPA 2DS9A 2I49A 5H8NB 4JXIA 3O6HA 4JDFA 5A5XA 1MM6A 3U1OA 4TQUQ 4OETA 2F36A 4QFLA 1TFDA 3ILUB 3HCQA 3PD9A 1MXUA 5FTHA 4PFWA 1BP5A 1NKXA 2DXRA 4N6PA 2DWHA 1QULA 4EQ7A 3CSGA 1DTZA 1B46A 3C33A 5BUUA 1MS7A 4Z7EA 4E0XA 4Q30B 2XHDA 2V84A 4XIGQ 3HSTA 1J1NA 1TT1A 3PPPA 3SEVA 4QFNA 3N94A 4N13A 3K01A 5ITPA 3KG2A 1H43A 4F1VA 1US4A 3FXRA 1SI1A 1Y9UA 3Q29A 4QSDA 1MXWA 3TTLA 2RINA 4L17A 5KDTB 1NNKA 3M3FA 4FEDA 3FZVA 5DVIA 2AIXA 3S2VA 3TTNA 5I56B 4XKQA 4FECA 5TP9A 1R9LA 1MH4A 1S50A 3PU5A 2HAUA 3VFJA 1Y3QA 3K2DA 3HN0A 5HPQA 4ELOA 4IGRA 3C9HA 2XXYA 3TYHA 3DP6A 2B3FA 3EN3A 1MQJA 4I9DA 3EHSA 3LSFB 2O1LA 4IY5A 1BTJA 3LSXA 2D3IA 5I59A 1OQHA 4MLQA 1MRPA 1SW5A 3V89B 1WVJA 2O84X 3TCGA 2Z8DA 4ZEIA 3N6TA 4QSEA 4DZ1A 3H6TA 1NH8A 1SBPA 2B65A 2QJEA 3HHGA 3Q28A 5CBRA 1ATGA 3W15C 1O64A 2ABHA 4WEDA 5FHNA 4WKMA 3GXAA 3RPWA 3RGYA 2XXPA 3TAJA 3IOUA 5A5XB 1US5A 2ZNUA 4RK9A 1IQ7A 1JW1A 1O7TA 4R6KA 3G7WA 1KWHA 3TCHA 4H0WA 4ELRA 4N07A 2YJPA 3FXUA 4AB6A 4RXLA 4LQ5A 3O2AA 3IK6B 3RLFE 3MZBA 4FATA 1GV8A 1UTHA 1PC3A 4G8NA 4G68A 3H6VA 4YB5A 1MQGA 2F35A 4I8CA 3V8XB 3T9UA 1D4NA 3S4UA 1A8EA 3RQTA 3LUYA 1P1WA 2Z22A 2YPNA 3OO6A 3Q26A 3T9HB 3QUJA 5DVFA 1FQAA 4OTEA 1A55A 2QSXA 2ZYKA 4U4XA 3KBRA 5EYFA 2F5XA 1Y1ZA 2Q2CA 4PETA 5L9MA 4GXAA 3O97A 3VXBA 2H9BA 2F97A 4JB7A 4O3AA 5TP9B 5AA4A 5K2XA 3VE1B 1DPEA 4G8MA 3RTWB 3OSRA 1QVSA 5ELVA 1OIBA 2DSFA 2ZYNA 5TPAB 5ITOA 5I59B 4YKJA 3PPOA 4M1VA 5CMCA 2DWAA 1QJMA 3K00A 3OEMA 1AMFA 3IB0A 5AA2D 3S9NC 4F29A 4HW8A 1IITA 1JW5A 4QF9A 3U72A 2PX1A 2XXWA 1XT8A 4YKPA 3G3HA 1JQFA 3N5LA 5BWJA 3O66A 3I3VA 4OFOA 1ZU0A 1S7YA 3B7DA 2AYSA 3LR1A 3U93A 1A40A 3AXFA 5AA3A 3PMXA 4QFOA 1DSNA 3TODA 1B3LA 3H3GA 3KFMA 1AIVA 4MLVA 2XXRA 1NNTA 4Q8RA 1DPPA 4GWOA 3WAEA 4Q0CA 2G29A 2NVUB 2QS4A 1T0KA 1EH3A 3LBSA 4GXSB 3KZGA 4G68B 2Q2AA 1USYH 3CVGA 4POWA 5EHSA 2VD3A 5JK4A 4JWYA 1ELJA 1FQDA 1LAGE 4ZS9A 1SD3A 4ESWA 3VXCA 2I3WA 1B5IA 4E0WA 3ZSFA 3SERA 2XX8A 1Y3PA 2I3VA 5I84A 2HCAA 3THIA 1UIVA 3TPAA 3T9VA 1B52A 2X7QA 1SW4A 3JYRA 1M5DA 4R2FA 5AA4B 1B6HA 3GBAA 3CFLA 4MFIA 3A09A 4GL0A 4I1DA 3SEYA 3VVEA 1XVYA 1VR5A 1WDNA 4O3BA 3T9XB 1QKBA 2F7CA 2P2AA 4DCXA 5AE4A 4ELQA 4G77A 4P0IA 1II5A 1Y1MA 1CB6A 3QK6A 4IO5A 3QIMA 3UIFA 4IO7A 2PMSA 2Y7KA 3HO7A 3BBRA 1FTOA 4JBZA 3KOSA 5JTYA 1B58A 1N76A 4RPOA 3MWBA 1ZLQA 3VVFA 5TU0A 5ICQA 3OSQA 3GBBA 2QRYA 1FTLA 2DE2A 4QFPA 3IO6A 3CFXA 3L6HA 4FAJA 5I57A 2P1SA 5DT6A 1LBCA 1FTKA 3TQLA 1Y3NA 2Q89A 2ZXTA 5K2YA 4ZEDA 5I58A 1QUJA 4QRZA 1IXHA 3MZ1A 3MP8A 2F6GA 4GVOA 3ECRA 1MQIA 4EUOA 2NUVA 2XXUA 3G3GA 1LCTA 2PVUA 4JSDA 5FHMA 3KSJA 3EHUA 2QL3A 1POTA 3IR1A 4DLDA 4XKPA 1B40A 3MW0A 3W9VA 1H3DA 2I0BA 5CRYA 1LB9A 1P99A 3TQWA 1XC1A 3TTRA 1S9TA 1TFAA 4RYAA 3M3KA 3U8QA 2Y7IA 4EXKA 2X7PA 1LB8A 2XXHA 5CMBA 1D9VA 4AB5A 3TFLA 4DXCA 1YTVA 4F22A 3SEUA 5CI5A 2DE3A 3BFTA 4F39A 2H99A 4C0RA 1MPBA 4OVJA 4EXLA 3PUZE 2PYYA 3FVOA 3FVKA 2OWSA 3UA8A 3KJTA 4NF8A 1PBQA 5JTYB 1AH5A 3TMGA 3JV9A 1VFEA 4THIA 3SETA 4TLLB 3K1PA 4GL8A 3PMVA 2ANJA 4F2QA 1SI0A 1EZOA 1OLCA 2Y7WA 2UYFA 4P0GA 1B3EA 2DYXA 1HSJA 4HCYA 2OCUA 2REGA 4FEBA 3MVWA 3MPLA 1FTMA 4U4SA 1OMPA 3RT8A 4WXJA 1FTJA 1AL3A 2ONKE 4OWDA 3KEIA 2O51A 3K1MA 1DOTA 5CM6A 2UYEA 5I57B 2XXXA 4KYEA 1B5HA 5TPAA 4GF8A 5L8DA 1B32A 2D5WA 3MJNA 2REJA 2WKYA 3FXQA 2D21A 5I58B 1LSTA 1UQWA 4YB7A 2ZYMA 4JWXA 1MH3A 1RKMA 4ZE8A 4ZECA 3TEPA 4OQOA 1FQCA 2E0SA 2I4CA 2ZMBA 5ICTA 2DWJA 3RY3A 2THIA 1NMUA 1AOVA 3U92A 4LUBA 2Z8EA 3QYTA 3SDFA 4X48A 4RY1A 3ZKLA 1LFIA 3UK4A 4LA9A 2I4BA 4NMYA 1B4HA 2O69A 4DXBA 2HEUA 3C34A 5M2VA 4BDLA 2A5SA 3D4CA 2GFEA 3K1NA 1JVYA 1SYIA 2OK2A 1ZBMA 2IEEA 1H45A 3P7IA 3PPNA 3T96B 3I5OA 2PT2A 4DIGA 2IA4A 3MPKA 4AQ4A 1SYHA 5I2NA 4H8JA 3VV5A 3CG3A 4ISUA 4PQJA 4DE8A 4ECFA 1B7HA 4KI0E 4R9FA 1LLSA 4U1ZA 2VOZA 4NF8B 4F18A 5FTIA 1FW0A 4QSCA 1B0HA 4PP0A 4RA1A 4X1BA 1EZ9A 4G68C 2Q88A 1B1XA 1B7UA 3Q27A 3SKPA 1IUDA 4NTLA 3R6UA 4XTCQ 3CG1A 1MQHA 4C1TA 4XKRA 1Z7NE 3IX1A 3GZGA 3FD3A 4LZ8A 2DVZA 3IAZA 4F2OA 5J1DA 1CE2A 1GVCA 5DVJA 2XX9A 3SEXA 2RKMA 5KCJA 4MF3A 4IO3A 3FJGA 1HSEA 5IAIA 4R6YA 2VGQA 2A5TB 3H03A 1M5CA 3T93B 2V3TA 3UN6A 5H8QA 4F19A 2UVIA 1M5EA 4R72A 4HCWA 3ZKKA 3H6UA 2QPQA 3RT6B 4NF5B 3C32A 1N0TA 2VHAA 4UA8A 4ZEKA 4ND9A 2RC8A 4YICA 4YMAA 2Q8JA 3IOWA 3FASA 4OFLA 3T66A 1N04A 4M4GA 2OZZA 1M5BA 2RCBA 3K6UA 4EQBA 2G93A 2RC9A 1Y4TA 1JEVA 1I69A 1LAHE 4H5GA 3KN8A 3KN7A 2DQVA 2QMWA 3O28A 3R7XA 2GRVA 3RTFB 4RK2A 1R1NA 3PPQA 3OO7A 3PUYE 4R75A 3B6TA 5ISUA 3OD7A 2HZKA 3JZJA 1NFTA 5I2NB 3DM0A 3MBPA 4H6DA 4YU0A 4EF2A 2Y7PA 4KFQA 4ELPA 2OWTA 3E9XA 1PEBA 4ESXA 3B6QA 1MDP1 2FYIA 3LC8A 4BDOA 4BDQA 4NE4A 4OHNA 2O68A 5H8FA 4NF6A 4U2RA 3KSXA 1P1UA 4U1OA 1QUIA 2NOOA 1LCFA 2V3UA 2FA7A 1LGBC 4X9TA 2DWIA 3HHFA 3PMWA 1HSLA 3N26A 4ZZEA 1NH7A 5I2KA 2I0CA 4MH5A 1MY1A 4R2BA 3VLVA 4IO2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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