2F8GA

Hiv-1 protease mutant i50v complexed with inhibitor tmc114
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
99
structure length
99
Chain Sequence
PQITLWKRPLVTIKIGGQLKEALLDTGADDTVIEEMSLPGRWKPKMIGGVGGFIKVRQYDQIIIEIAGHKAIGTVLVGPTPVNIIGRNLLTQIGATLNF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords POL POLYPROTEIN
publication title Effectiveness of Nonpeptide Clinical Inhibitor TMC-114 on HIV-1 Protease with Highly Drug Resistant Mutations D30N, I50V, and L90M.
pubmed doi rcsb
source organism Human immunodeficiency virus 1
total genus 19
structure length 99
sequence length 99
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2005-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00077 RVP Retroviral aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2f8gA00
5P26A 3FV3A 1MTBA 1IVPA 2ZHVA 4Y36A 3T3CA 1BXOA 5P1RA 4FSEA 1HTFA 2JE4A 2PK6A 3K4VA 5OZQA 5HE7A 1Z1RA 4Q1WA 5P4WA 1HTGA 5IVRA 1K1TA 3HBOA 1HVLA 3KFNA 5P1BA 2QD8A 4J0VA 4DJRA 4HVPA 2J9JA 4Y3QA 1LYAA 5P8EA 2R9BA 1MVPA 5P1HA 4ZSRA 2IKOA 1DP5A 2QNQA 1OEXA 3SM1A 1MEUA 6APRE 3OGQA 1BILA 5DR7A 4LHHA 1BBSA 1EEDP 1AAQA 4I0ZA 5P4EA 2VA6A 1Z1HA 4FL8A 3UQWA 3KDBA 5P0JA 3DCKA 3ZMGA 3SM2A 5P5MA 3INEA 4HZTA 4TRYA 1HVRA 3PEPA 5P7KA 3O9EA 5HDZA 2CEMA 1EPPE 5P55A 2I4VA 3NUJA 2OHMA 3OAGA 1MSNA 1HPXA 4K4QA 3FNUA 3KT2A 1SP5A 5P2IA 4EXHA 2ZHTA 5P12A 5OZKA 3OUCA 4DJXA 4MC2A 3UDYA 1BVGA 5IS4A 2OHQA 2ZYEA 4GIDA 3GGVA 5P77A 4Y3SA 1GNOA 1BXQA 3FNTA 4FGXA 3R4BA 4J1KA 4LXKA 1KJHA 1K2BA 5HCOA 2G26A 3L5CA 2NNPA 4UPJA 2ASIA 5P5RA 3UDKA 1TQFA 3D1YA 3GGXA 5P56A 5P06A 2AQUA 4DV9A 2QCIA 5OZHA 1SGZA 5P4DA 1HPVA 3ZKMA 3SO9A 4EXGA 4YOAA 3NU5A 5P60A 5IVSA 2CEJA 5P6WA 1SGUA 5P3GA 1GVTA 4B1DA 5P2OA 3B7VA 3QN8A 1BDRA 1FMUA 4ACUA 5P0GA 3HDKA 1HRNA 4HEGA 5P6VA 5P8LA 4EQJA 5P66A 5JFPA 3LPJA 2OHKA 5P32A 5P5LA 5P8CA 2Q11A 5P7LA 2A4FA 2QK5A 3PVKA 1C6YA 2NMYA 4Y35A 4COEA 4ZPEA 2ZJKA 3M9FA 3R1GB 5P31A 5P29A 1OD1A 4Y38A 2Q5KA 2FXDA 1MIQA 4PZXA 4DPFA 3QAAA 3OXWA 2PSVA 4EYRA 4YHQA 5AH9A 3OUDB 5P3DA 1PSAA 2MIPA 2VNMA 5P6XA 3SA5A 7HVPA 2Q55A 1B6PA 4Y4TA 1EC0A 5P4VA 4Z4XA 3GI4A 3ER3E 3NWQA 2RSPA 2QMGA 4Y6MA 1BDLA 5COKA 2UY0A 3DUYA 5BWYA 2UPJA 4B0QA 2OAHA 2FGUA 1RPIA 2O4SA 2IRZA 3GGUA 3S45A 4F73A 4Y3EA 5P6UA 1XS7D 3APPA 3UHLA 2WF1A 5EZZA 4Y4ZA 4FM8A 4KE0A 5P3AA 4CMSA 2J9KA 5P1PA 2WEBA 1A8KA 3SA3A 1BV7A 5C9FA 4XX4A 5P0NA 1GNMA 1FB7A 5P27A 5P40A 5I70A 3PLDA 1NPWA 3SA4A 4B00A 4B1CA 2QI0A 5COPA 3OU1B 2H6SA 1HIVA 3TPPA 1W6IA 3O9DA 2QI6A 1HVKA 3PWMA 4EJKA 4WY1A 5P8AA 5P76A 3L38A 9HVPA 3RVIA 5P0TA 3INFA 4RROA 4J0TA 1XDHA 4EWOA 2AZBA 3BXSA 3OQAA 5P7BA 3HAUA 4FAFA 1XE5A 3KYRA 4YCKA 1QBTA 1G0VA 3NU4A 6FIVA 4I0FA 5P6PA 3LNKA 3HAWA 3LIQA 5P5QA 2O40A 1FEJC 5P8BA 5P8NA 4GJDA 4GMIA 1CPIA 2PWRA 4Y4UA 1ODWA 5OZ7A 5SY3A 1MPPA 4YDFA 3UQUA 2I4WA 1A8GA 5DGWA 5P5BA 5OZSA 4OBGA 4Y5PA 4KB9A 5P5JA 3IXJA 2NPHA 3HVPA 1K1UA 4U8WA 5AGZA 1MRXA 4K8SA 5OZ9A 5P3SA 5P83A 5P48A 5I3XA 5P87A 1FLHA 2A1EA 1RQ9A 4HDFA 4L6BA 5P4AA 5P47A 5P0EA 1MTRA 2VKMA 2O4PA 2WECA 5P2SA 1FQ4A 4Y3WA 2G1RA 3GW5A 4MC6A 2JJJA 1KZKA 5KQYA 3LPIA 3NDXA 3N3IA 4TVGA 4BEKA 4Y3LA 2NNKA 5DR0A 3TOGA 1MSMA 5UPJA 5OZRA 2BKTA 1K6TA 3PWWA 4MC9A 4J1FA 1D4LA 2PH8A 5OZPA 1T6GA 3QP0A 5P1DA 2QHCA 5P3FA 4HDPA 5OZ8A 3SA9A 2UXZA 5F01A 3ZKXA 4CPRA 1LV1A 3IVHA 3VV7A 1EC1A 2Q63A 2J9JB 1LYAB 1KJFA 3RTNA 4HE9A 4Y58A 2ZHUA 4L1AA 5P0HA 3VF7A 1BV9A 3UQPA 1SMEA 1HHPA 2G69A 3O9CA 5P0MA 1UH7A 5KR1A 2XFKA 4ZEAA 3QBHA 3U7SA 5P5TA 5P6HA 3VUCA 2HC0A 4DJQA 4FCOA 2OF0A 3QIHA 1SIPA 2ZGAA 3JW2A 3LIVA 5P4SA 2F3EA 5P6SA 1YTGA 3OY4A 5P1KA 1SH9A 5P78A 1C6XA 5PEPA 3IGBA 2Q54A 2G22A 3OAGB 3TOFA 5P84A 5P2CA 4ER4E 5OZTA 5I3WA 2IENA 3KMXA 4D83A 4DQGA 5P3KA 1BWAA 4RYGA 3T6IA 1MT7A 2VA5A 1HOSA 5P3JA 2RKFA 2P3CA 4QJAA 4Y39A 4DI2A 4FS4A 5P7FA 5ISKA 2VS2A 2PYMA 3KFSA 4Y43A 1K6VA 5P0VA 3WB5A 3I2LA 2G21A 5HDUA 5P4GA 1HWRA 3VF5A 3EM3A 3B80A 5JFUA 3NUOA 5P30A 3SA6A 3L58A 2RENA 3S43A 2G1OA 1LYBA 2WEAA 3K1WA 5HTZA 2PH6A 5KR0A 1EPQE 4Q5MA 4YBFA 1LEEA 1SDVA 4KE1A 5P2AA 3TPRA 4QJ6A 5P35A 3LPKA 3BGBA 3MXDA 3I7EA 4I11A 5P67A 5P8UA 3QRVA 3PJ6A 1HEFE 2P4JA 5ENMA 5P8PA 1PPKE 1MESA 3BHEA 3UQXA 1FQ8A 4I0JA 5P4FA 5P38A 5DQCA 4X2LA 3U6AA 5P4IA 4H3JA 1VIJA 1CMSA 5P7WA 1QBSA 1BIMA 4Y5AA 3URIA 1HPSA 4LC7A 1META 4F74A 1FQ7A 4WTUA 3IA9A 2JXRA 2VIYA 4QLHA 5P5PA 4Y3ZA 2ZHSA 1E81E 5P6LA 5P8RA 1LYWB 3LIZA 1NH0A 3CICA 2EWYA 4Y47A 5P6YA 4GYEA 2B7FA 4DH6A 5TOLA 3CKTA 1WKRA 1MUIA 2OHPA 4RCFA 3NDUA 1G2KA 3NU9A 3VLBA 5BRYA 4NKKA 1YM4A 1HVIA 4RCDA 1GNNA 1EBWA 5P03A 1ZSFA 5P3YA 4GJ5A 5P5HA 2OHLA 3WZ8A 8HVPA 4Y3RA 2FDEA 4RVJA 1HIHA 4Y5BA 3T7XA 5P19A 5P50A 5P3PA 2VJ6A 3DOXA 5P25A 4A6BA 4EHCA 1K6PA 4K9HA 1GVVA 2WF0A 4ZPGA 4NJSA 3IXOA 5P3ZA 5P5OA 4LAPA 3TKGA 2ANLA 4YD4A 2R3TA 3ZPUA 4Y4WA 5P7OA 1ZTZA 4DQCA 4ZIPA 1D4HA 3LZSA 5P8TA 5P4LA 1YTHA 3EKVA 2P83A 5P43A 2ER9E 4GB2A 5P4MA 3MWSA 1EBZA 1ZBGA 4BFBA 5P6MA 2AIDA 1F7AA 3UTLA 4PPHA 5P4TA 1LF3A 3SA7A 2V0ZC 3EKWA 4RRNA 3EL1A 3EM4A 2XYEA 3QVCA 4Y5NA 2PYNA 5P81A 1UH9A 5P4BA 1FQ5A 5OYTA 1KJ7A 2I1AA 1HTRB 5P42A 1HXWA 5OZNA 5P4UA 5OZYA 3GI6A 5P0SA 5P2QA 3RTMA 4J1CA 5EZXA 5IVTA 2AVSA 5P8IA 3SKFA 3ER5E 5P51A 1C70A 3OHFA 7UPJA 5OZDA 4Z22A 4LL3A 4R91A 5P46A 3S53A 3UDPA 1EPRE 1BWBA 1GVWA 4J0YA 5OZFA 2BB9A 4DQBA 5P0IA 4Y4DA 3GGAA 4RRSA 1FFFC 2V12C 5COOA 5P4XA 5P86A 5KOSA 3Q6YA 4ER1E 1XL5A 4LP9A 3K5GA 5AHCA 5P3BA 1HVSA 1CZIE 1D4KA 5OYUA 3AIDA 5P8FA 5P2WA 4D8CA 3PSUA 5P3OA 3ZLQA 5HE4A 5P2YA 5OZLA 3F9QA 1U8GA 4AZYA 3EMYA 1FFIC 1W5WA 2IGYA 5P0OA 3WSJA 3HVGA 4I8ZA 5HU0A 4EQ0A 3NDTA 4I10A 2WJOA 5KR2A 3S8IA 2AOHA 5P8SA 4CKUA 1PSNA 5OYSA 5P3RA 5P15A 1APTE 3SLZA 5P45A 4A6CA 1ZJ7A 5P89A 1RV7A 3NXNA 5P7IA 3L5EA 2ZJMA 2QU3A 4ZE6A 5ER2E 2WEDA 3CIBA 3QBFA 2BPYA 5AH7A 5HU1A 1AJXA 5P5UA 5ISJA 1FG6C 3Q70A 5P1YA 2ZHRA 2QI3A 5P88A 3CYWA 5P7JA 5OZAA 3KFRA 4OD9B 1ME6A 3ST5A 3EKQA 5P16A 3S2OA 5P1OA 3D1ZA 5OZ0A 4PHVA 2XFJA 1DMPA 3LITA 2Z4OA 1PROA 1Q9PA 4L1AB 1FIVA 5P3IA 4DJOA 3WB4A 1T6EX 5P8QA 3HW1A 5P6QA 2Q3KA 5P3XA 4DJUA 5P6AA 3ZOVA 3O9LA 4NJVA 5SZ9A 3IN3A 1YX9A 2FNSA 3TPLA 3VV8A 2QI5A 5P1WA 1BDQA 1N49A 4FSLA 5OZ5A 4FM6A 4DJVA 4I0GA 1RNEA 4Y41A 5OZWA 2VIJA 3DV5A 2WF3A 4R5NA 2R5QA 1QDMA 4LXMA 3ZPSA 5P49A 2G94A 3URLA 5P5KA 5P7XA 2AVMA 2QD6A 1IVQA 5OYWA 2BPVA 4WY6A 2JJIA 2VIEA 2NXLA 3HLOA 3D20A 1MRWA 1Z8CA 2ZJIA 1PFZA 4CP7A 5P2FA 2B8VA 5P2GA 3SKGA 2AODA 1AJVA 5P3UA 3KM4A 3OADA 3LZUA 5P3QA 3UDNA 3OOZA 3UF3A 5HDXA 2HPFA 2NTRA 3S43B 1LYBB 3OU4A 2HB3A 2JYSA 3WZ7A 1XN2A 2HB4A 5I3VA 4Y3HA 1EC2A 2QI1A 3VV6A 4CPTA 2R3WA 2WKZA 3R0YA 4J1IA 4R8YA 3SA8A 1B11A 5P33A 3D3TA 3G70A 1YT9A 3FKTA 2QI4A 5P70A 4Y5EA 3BVBA 1NPVA 3ZKNA 3SFCA 3T7QA 5CONA 2SAMA 4OBHA 1ODYA 2FDDA 3U71A 2BPZA 4J0PA 3OXXA 5P64A 2F8GA 5FIVA 1MT9A 2P8HA 4Y4JA 5P7DA 3S54A 5P8KA 1HIIA 5OZZA 3DJKA 4Y9WA 5P34A 1K2CA 1KJGA 4RLDA 5P13A 3ECGA 3TNEA 5P4HA 1FMXA 1OHRA 1YM2A 2FNTA 3WZ6A 5OZ4A 2VJ9A 5P4YA 5P63A 3PHVA 3K5CA 5ER1E 5I3YA 5P23A 3CIDA 2PQZA 2QP8A 5OZIA 4DQEA 3EL5A 3QRMA 4B78A 3GI0A 3H0BA 5OYRA 4OC6B 5DQ5A 1K6CA 3QRSA 5OYXA 5P5NA 2I4XA 2OHRA 2V13A 3K5FA 5P5GA 5P39A 1EPLE 4JPEA 1FQXA 5HE5A 4B05A 5P2JA 5OZ1A 3TTPA 3NU3A 2NR6A 5P8MA 4APRE 2PK5A 2P3AA 4EPJA 2QZWA 5AH6A 1IDBA 3Q4BA 5P0BA 4RVIA 2ZJNA 4JP9A 5P7ZA 2P3BA 5P6RA 1LF2A 1WBKA 1D4JA 5P2VA 2XFIA 1MT8A 5P7EA 4Y54A 5P3LA 4FE6A 1G35A 1ZPKA 4Y3NA 3OTYA 4Q1XA 5P57A 3UDHA 5DR3A 3O9GA 1EPOE 5P4OA 3PI0A 2G20A 4NPUA 4OBJA 1W5VA 2HS2A 3S85A 1F34A 2HAHA 4XXSA 5P1QA 5OZUA 5P8VA 5P02A 5P52A 1HVHA 2FLEA 1SIVA 1TCWA 3BXRA 5P2DA 5OZ2A 1AIDA 2F81A 1SDUA 5P07A 5P2ZA 4N00A 3OHHA 4Y5LA 1SDTA 4FRIA 3T7PA 1AVFA 2V11C 5P5EA 5P0AA 5P1AA 3S56A 1EPNE 2ER0E 4U7QA 1AXAA 3T11A 5OYZA 3UDMA 1TCXA 3APRE 3KN0A 4JECA 4GJAA 5P8JA 3VEUA 4AA9A 5P6GA 1D4YA 4L7JA 3UFLA 3UPJA 3EKYA 4ZPFA 5P0RA 3NDWA 3KDDA 5P09A 5P01A 4PYVA 4YDGA 5P5FA 5P85A 4Y53A 2R8NA 2RMPA 4ZSQA 1QS8A 5P6TA 3O99A 2B8LA 4FRJA 2HPEA 2OHUA 2I0AA 3O9AA 4YD5A 2OHSA 2G24A 4Y5KA 5IVQA 5P5DA 1FF0C 2HIZA 3VYFA 2PSUA 3EBZA 5P1NA 4DQHA 3RSXA 5J25A 5P2KA 3VYEA 1UH8A 5P2TA 5P2LA 3OUBA 2VIZA 3OWNA 4ZSMA 4TRWA 3VSXA 1IBQA 5DR1A 3TOHA 3Q3TA 3OU1A 3OQKA 1B6KA 3NWXA 5P80A 1ENTE 1HPOA 5P0QA 3O9LB 3UDQA 4CPUA 2IQGA 5P05A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P26 A;  3FV3 A;  1MTB A;  1IVP A;  2ZHV A;  4Y36 A;  3T3C A;  1BXO A;  5P1R A;  4FSE A;  1HTF A;  2JE4 A;  2PK6 A;  3K4V A;  5OZQ A;  5HE7 A;  1Z1R A;  4Q1W A;  5P4W A;  1HTG A;  5IVR A;  1K1T A;  3HBO A;  1HVL A;  3KFN A;  5P1B A;  2QD8 A;  4J0V A;  4DJR A;  4HVP A;  2J9J A;  4Y3Q A;  1LYA A;  5P8E A;  2R9B A;  1MVP A;  5P1H A;  4ZSR A;  2IKO A;  1DP5 A;  2QNQ A;  1OEX A;  3SM1 A;  1MEU A;  6APR E;  3OGQ A;  1BIL A;  5DR7 A;  4LHH A;  1BBS A;  1EED P;  1AAQ A;  4I0Z A;  5P4E A;  2VA6 A;  1Z1H A;  4FL8 A;  3UQW A;  3KDB A;  5P0J A;  3DCK A;  3ZMG A;  3SM2 A;  5P5M A;  3INE A;  4HZT A;  4TRY A;  1HVR A;  3PEP A;  5P7K A;  3O9E A;  5HDZ A;  2CEM A;  1EPP E;  5P55 A;  2I4V A;  3NUJ A;  2OHM A;  3OAG A;  1MSN A;  1HPX A;  4K4Q A;  3FNU A;  3KT2 A;  1SP5 A;  5P2I A;  4EXH A;  2ZHT A;  5P12 A;  5OZK A;  3OUC A;  4DJX A;  4MC2 A;  3UDY A;  1BVG A;  5IS4 A;  2OHQ A;  2ZYE A;  4GID A;  3GGV A;  5P77 A;  4Y3S A;  1GNO A;  1BXQ A;  3FNT A;  4FGX A;  3R4B A;  4J1K A;  4LXK A;  1KJH A;  1K2B A;  5HCO A;  2G26 A;  3L5C A;  2NNP A;  4UPJ A;  2ASI A;  5P5R A;  3UDK A;  1TQF A;  3D1Y A;  3GGX A;  5P56 A;  5P06 A;  2AQU A;  4DV9 A;  2QCI A;  5OZH A;  1SGZ A;  5P4D A;  1HPV A;  3ZKM A;  3SO9 A;  4EXG A;  4YOA A;  3NU5 A;  5P60 A;  5IVS A;  2CEJ A;  5P6W A;  1SGU A;  5P3G A;  1GVT A;  4B1D A;  5P2O A;  3B7V A;  3QN8 A;  1BDR A;  1FMU A;  4ACU A;  5P0G A;  3HDK A;  1HRN A;  4HEG A;  5P6V A;  5P8L A;  4EQJ A;  5P66 A;  5JFP A;  3LPJ A;  2OHK A;  5P32 A;  5P5L A;  5P8C A;  2Q11 A;  5P7L A;  2A4F A;  2QK5 A;  3PVK A;  1C6Y A;  2NMY A;  4Y35 A;  4COE A;  4ZPE A;  2ZJK A;  3M9F A;  3R1G B;  5P31 A;  5P29 A;  1OD1 A;  4Y38 A;  2Q5K A;  2FXD A;  1MIQ A;  4PZX A;  4DPF A;  3QAA A;  3OXW A;  2PSV A;  4EYR A;  4YHQ A;  5AH9 A;  3OUD B;  5P3D A;  1PSA A;  2MIP A;  2VNM A;  5P6X A;  3SA5 A;  7HVP A;  2Q55 A;  1B6P A;  4Y4T A;  1EC0 A;  5P4V A;  4Z4X A;  3GI4 A;  3ER3 E;  3NWQ A;  2RSP A;  2QMG A;  4Y6M A;  1BDL A;  5COK A;  2UY0 A;  3DUY A;  5BWY A;  2UPJ A;  4B0Q A;  2OAH A;  2FGU A;  1RPI A;  2O4S A;  2IRZ A;  3GGU A;  3S45 A;  4F73 A;  4Y3E A;  5P6U A;  1XS7 D;  3APP A;  3UHL A;  2WF1 A;  5EZZ A;  4Y4Z A;  4FM8 A;  4KE0 A;  5P3A A;  4CMS A;  2J9K A;  5P1P A;  2WEB A;  1A8K A;  3SA3 A;  1BV7 A;  5C9F A;  4XX4 A;  5P0N A;  1GNM A;  1FB7 A;  5P27 A;  5P40 A;  5I70 A;  3PLD A;  1NPW A;  3SA4 A;  4B00 A;  4B1C A;  2QI0 A;  5COP A;  3OU1 B;  2H6S A;  1HIV A;  3TPP A;  1W6I A;  3O9D A;  2QI6 A;  1HVK A;  3PWM A;  4EJK A;  4WY1 A;  5P8A A;  5P76 A;  3L38 A;  9HVP A;  3RVI A;  5P0T A;  3INF A;  4RRO A;  4J0T A;  1XDH A;  4EWO A;  2AZB A;  3BXS A;  3OQA A;  5P7B A;  3HAU A;  4FAF A;  1XE5 A;  3KYR A;  4YCK A;  1QBT A;  1G0V A;  3NU4 A;  6FIV A;  4I0F A;  5P6P A;  3LNK A;  3HAW A;  3LIQ A;  5P5Q A;  2O40 A;  1FEJ C;  5P8B A;  5P8N A;  4GJD A;  4GMI A;  1CPI A;  2PWR A;  4Y4U A;  1ODW A;  5OZ7 A;  5SY3 A;  1MPP A;  4YDF A;  3UQU A;  2I4W A;  1A8G A;  5DGW A;  5P5B A;  5OZS A;  4OBG A;  4Y5P A;  4KB9 A;  5P5J A;  3IXJ A;  2NPH A;  3HVP A;  1K1U A;  4U8W A;  5AGZ A;  1MRX A;  4K8S A;  5OZ9 A;  5P3S A;  5P83 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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