2FBVA

Wrn exonuclease, mn complex
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
194
structure length
194
Chain Sequence
HSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
molecule keywords Werner syndrome helicase
total genus 63
structure length 194
sequence length 194
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbvA00
3VQ4A 4CHYA 1YT3A 4FJ5A 3E01A 3ISNC 3VQ8A 3LP0A 4DS4A 1BI4B 1FK9A 4J2EA 3U3GA 3L3VA 4Z4IA 4CJEA 1Z26A 4O44A 3C6TA 1RBVA 4I2QA 1B9DA 4HUGA 4DFJA 1RT2A 3SNNA 4EP5A 4LSLA 3AVNA 5FRNA 2HNDA 1C0TA 3RTVA 3ZCMA 4KHUA 1KCFA 1NOZA 4FVMA 4DLEA 2IC3A 1HJRA 3NF6A 1VSDA 4OKJA 4FJ9A 3H08A 4DTJA 1JLEA 3QESA 4RW7A 5T7BA 2EX3A 3PX6A 5DMRA 3LP1A 1FKPA 3D0PA 3CFOA 5HP1A 2FC0A 4CIGA 3QINA 3SYZA 4E7IA 3AVKA 4DU3A 4W5QA 3C95A 2Y1IA 3KLIA 4E7HA 3QETA 3O4QA 3SI6A 1RTDA 4F2RA 4M3XA 4FM1A 4CGFA 4FJHA 4E89A 1NK5A 2G8FA 3ZSVA 4W5RA 1JLAA 3QNNA 1NK9A 4DTSA 3HPOA 4FLXA 3SV4A 1RDAA 1BHLA 3LPTA 1RBSA 4HHTA 1XHZA 1NJWA 4OJRA 2IAJA 2PY5A 3DOLA 3HXMA 1RBUA 3K5MA 3SZ2A 3S3NA 3RRGA 4DWIA 3I8DA 2IS3A 1RT5A 4QAGA 1EX4A 4RW6A 2Z1HA 4B9SA 1WAFA 4IG3A 4FJLA 4RW8A 4CCHA 4IDKA 2E4LA 5KGWA 1RT4A 3ZT0A 4OGEA 2X74A 2KFZA 1ASWA 3TWHA 4FZZA 4CF9A 4ELUA 1UOCA 3OYGA 4FJ8A 1B9FA 1VSJA 3V9UA 1O1WA 4BDPA 3KD1E 4M3WA 2DFFA 4PQUA 4Q0BA 5C25A 3OYAA 3SUPA 1IKVA 3ZT3A 1J5OA 3S3MA 4JRPA 3DRSA 4AHVA 1WN7A 2OPPA 3L2UA 4G1QA 3PX4A 1JL2A 3D45A 3TANA 3CFRA 3V6DA 5FDLA 4AH9A 4DU4A 4AHUA 3OS0A 3NHGA 4CHNA 4XIUA 3DOKA 2D0CA 4Y1DA 4FLWA 1HYZA 1S1TA 3HL8A 4E7KA 4FJKA 3I0SA 4ID1A 3MECA 5CYQA 3L8BA 2BDPA 1RT6A 3CM6A 3NGYA 3NGIA 4FK4A 2D0BA 2YNFA 2HVHA 4MFBA 3LAMA 1Z25A 1NK6A 1BL3A 3V1QA 5KRSA 1HNVA 1QE1A 5I42A 3OYEA 2O4GA 1SKRA 3ZT4A 3AVCA 2P1JA 2G8KA 3KLEA 1LAWA 1IKWA 5HBMA 4EP4A 3OYNA 3EY1A 4FJNA 2VWKA 3WNEA 2FBTA 4BE2A 4DSFA 4PY5A 4CHQA 4N76A 3L2QA 2KZMA 3DI6A 1HQEA 1TKZA 4Y1CA 4KO0A 4DTRA 3DLBA 4KHWA 3KKRA 3CFPA 1CLQA 5HLFA 1RNHA 1KVCA 3KLGA 4HUFA 4E3SA 4FCYA 3PV8A 1CZBA 1SUQA 3SCXA 3EYZA 2KTQA 4K8ZA 4CEAA 4CEEA 1ZBHA 4QOZB 4H4MA 3BGRA 3QEPA 3TAPA 5I3UA 1WNSA 1DTTA 4BDZA 1ZYQA 1T8EA 4CIFA 1U47A 2ETJA 4CJKA 4M3RA 3AVFA 4Q5VA 1D5AA 1L3SA 4DSKA 4Z4GA 1EP4A 1I3AA 4KV8A 4ZTFA 1Q9YA 3OYKA 1DLOA 3VQ9A 4AILC 3P1GA 1CXUA 3HJFA 1L5UA 2XO7A 4DLGA 1NKBA 4FJXA 4DTUA 4FK0A 4CEOA 3L2VA 4KFBA 1S1WA 1RCHA 3C94A 3DRPA 5HRNA 3OYJA 3RMAA 3S3OA 3AVIA 2KFNA 4DG1A 4BE0A 2QXFA 1HQUA 1L3UA 4E1NA 1HNIA 4FJMA 3O3HA 4CGJA 4CJ3A 4DSEA 3MXIA 5KGXA 1JLGA 1DTQA 1T05A 1ZBLA 3QO9A 4LSNA 3HP6A 4DSJA 3OYFA 2HHXA 4OKKA 3K2PA 4F2SA 1BCOA 4FLVA 5SWMA 4FW1A 3MXMA 1U4BA 3KLFA 4CF8A 1TK8A 4CEZA 2G8HA 2JLEA 3ZSYA 1LWFA 5CZ2A 3KJVA 3LZJA 3AVLA 1LAVA 4JS4A 3BDPA 3KK1A 4ELVA 1RBTA 1KVBA 1RTJA 1N5YA 4IFVA 1KRPA 3VQDA 1X9WA 3AA2A 2Z1IA 4LH4A 4FZYA 1VSEA 3T19A 3KK3A 4FM2A 1LWEA 1ZBFA 4IG0A 4KHSA 2D0AA 1WSHA 1S1XA 4CJSA 3V81A 5J2QA 3DM2A 4HCBA 4KI4A 3TI0A 5JS1A 2A1SA 2D5RA 4FLYA 2Y1JA 3DRRA 4AHCA 3U3YA 3U6FA 3NH2A 4O55A 3M8QA 1YTAA 4BWMA 4FJGA 2B6AA 4CJTA 2E6MA 3HVRA 1TK5A 3LDSA 2OYQA 4KAZA 4B8AB 1D9FA 3LZIA 3ZSZA 3T1AA 1S1VA 3ZSOA 4FK2A 3QERA 1QQCA 3HPGA 3V9ZA 2I5JA 1NJYA 1MU2A 3A2FA 4FYDA 1TK0A 2X6SA 2IGIA 2Q3SA 3DLGA 3JSMA 1BGXT 1Q9XA 3KD5E 4W5OA 1HRHA 3SUQA 4B9MA 2DFEA 3TAQA 2PYLA 1BIZA 4O0JA 3LP2A 5DK5A 2WONA 1EXQA 2DFHA 4DTXA 4CK2A 1WSJA 4DU1A 1LWCA 1TV6A 1ASUA 2QKKA 3QEIA 4B9TA 2OPQA 5D3GA 4CEQA 2XY8A 2GBZA 3V9SA 2RF2A 2XY6A 3OJUA 2WOMA 2HVIA 3THVA 5FRMA 4TSXA 1C1BA 1KVAA 5KRTA 5E41A 1NK8A 3T3FA 1NKCA 2VWJA 1GOCA 1RDDA 1IKXA 2ZQBA 1JLCA 3AA4A 3S9HA 3NAEA 4F3OA 4DFMA 3ASMA 4CF2A 3QLHA 1EETA 3VQBA 3AV9A 2OPRA 4N47A 3KLHA 4F3TA 3LAKA 2JGUA 2FBYA 3OYIA 3QIOA 1BIUA 4W5NA 2HB5A 3TR8A 4CEFA 2O4IA 2Z1GA 4M45A 1VSFA 1SL0A 2G8UA 4OLBA 1KFDA 2P51A 4GW6A 4B9UA 3HK2A 4DTNA 2OA8A 3HP9A 3NH0A 5HRPA 3K59A 4PA1A 1UAXA 2XY7A 4B8CA 1NJXA 3PO5A 4E0DA 1TVRA 1FXXA 1ASVA 2RKIA 4JRQA 3MEDA 1UA1A 3PY8A 4KHNA 3TAMA 4R5PA 3QEXA 4CEBA 3TARA 2ZD1A 4DQIA 4M3ZA 4CJUA 1TKDA 4C8KA 3TABA 1VRTA 2HHVA 1C0UA 2BGGA 4CESA 3HSTB 4N41A 4DS5A 4E7LA 3QEWA 4CF1A 3OYMA 4LY7A 4AHTA 4M42A 2DY4A 1YVUA 1U48A 1QSSA 1ZBUA 1EKEA 2VG7A 5J2MA 3IRXA 5J1EA 3NH1A 1TKXA 4BWJA 3NF9A 4Z0UA 5KTQA 3DYAA 4ELTA 3LPUA 4KHYA 1BCMA 2B5JA 3ZSWA 3F73A 2HNYA 1WAJA 2ITGA 1NOYA 4J2AA 1HPZA 1KTQA 2P5GA 3NE6A 1S1UA 3MAQA 4DSLA 4CE9A 1JXBA 3SUNA 3AVAA 3CM5A 3LWLA 2HW3A 3LANA 4FZXC 2RN2A 2YNIA 4CK1A 5SZTA 3SV3A 1NK4A 1D8YA 4J2DA 4FLZA 3G0ZA 2DTUA 1A5VA 2YNGA 2QK9A 2HHWA 4B9VA 2IDOA 4M3YA 4B08A 2G8VA 4H8KA 3SQ2A 4CJRA 1L3VA 1C6VA 4W5TA 1SL1A 3SPZA 4CGHA 1RT3A 3F9KA 1D9DA 1RT1A 1IG9A 3AA5X 5C42A 3NGZA 3PO4A 2F96A 3NDKA 1KLNA 4DQSA 3VQAA 2FBXA 1X9SA 3SPYA 1LW0A 4JLHA 2IOCA 4C8MA 1G15A 4CHOA 4FJJA 1A5XA 4FLUA 5HRRA 3M8SA 4DF8A 2HHQA 2B4JA 1B92A 3AVHA 1VK0A 3ZSRA 1S9GA 4CK3A 1HMVA 4AHRA 4O0IA 3DLRA 2G8WA 1SV5A 3RR7A 2YKNA 3QNOA 4KB1A 3VN5A 1NK0A 3NCIA 5J2NA 3RMBA 3MEEA 1R0AA 2YV0X 1HYSA 3PUFA 4ID5A 5FROA 4YNQA 5CZ1A 2HNZA 1Y97A 4N5SA 3AVMA 3I0RA 1S9EA 3P5JA 1JLFA 3B6PA 3RR8A 4M3TA 1VSHA 4NCAA 4NYNA 3VQ5A 4CGDA 4DTMA 4ZHRA 1SKSA 1SKWA 1QHTA 3HPHA 3OJSA 3RMDA 4WE1A 3RWUA 2HHUA 3WNHA 2G8IA 4Z4EA 3SJJA 3VQ6A 1I39A 1LW2A 3M8PA 3ULDA 1WSIA 4HCCA 1JL1A 3VQ7A 3OYCA 1C0MA 1W0HA 4H4OA 4IBNA 3KKSA 2GV9A 4FM0A 1S6PA 2OZSA 1ZBIA 1S6QA 2KQ2A 4CGIA 3DLHA 4EZ9A 1TL1A 4IFYA 4GVMA 5HRSA 4K8XA 1KLMA 3ITHA 4N56A 4CJQA 3OY9A 1JKHA 4DQRA 1NJZA 4B3OA 4CHZA 1NKEA 1GOAA 2HHSA 4OLAA 3HT3A 1N6QA 4Z4CA 4B9LA 2PZSA 4RW9A 1FKOA 4CJ4A 4L8RB 3V9WA 3AO1A 3CYMA 2F8TA 1KSPA 4CGGA 1C1AA 4KPYA 1QS4A 1BI4A 4O5BA 3P83D 4YFUA 3AVGA 1LV5A 1GOBA 4OPJA 1RBRA 3DMJA 3AVBA 4CJFA 3JYTA 4C8OA 4CFAA 3OYHA 1KFSA 1VSLA 4NCGA 5HROA 2X6NA 5J2PA 1TAUA 1RTIA 2BE2A 3QIPA 3AO3A 1U49A 3TAGA 4M3UA 1IO2A 3KK2A 4DTPA 4HTUA 3DLEA 2HMIA 4KREA 1JXEA 1ITGA 3NF8A 3OYLA 3K57A 4I2PA 1J53A 2VG5A 3AO5A 5JS2A 3K5NA 1WSEA 4CEDA 3RMCA 1BQNA 1F21A 1IKYA 1RDCA 3AO2A 4NYFA 3LP3A 1QSYA 4GMJB 1T7PA 4CERA 1REVA 4OKEA 3AO4A 3LALA 4KTZA 3CG7A 3PX0A 2LSNA 2F8SA 3L2RA 4Z4FA 3AA3A 2QKBA 4CHPA 3KTQA 4OVLA 1XI1A 4NCBA 4CECA 3DLKA 1TGOA 4OPKA 1QSLA 4RG8A 1K6YA 5KI6A 4E1MA 4PUOA 3ZSXA 1XWLA 4EZ6A 3V1OA 3CQ8A 4KHQA 2R7YA 3M8RA 2XHBA 3SQ4A 4MQ3A 3VA3A 4KB0A 3K58A 4O4GA 2P5OA 1CZ9A 3TAFA 1XC9A 1UA0A 5CY4A 2PYJA 3O4NA 3LWMA 4BACA 2XY5A 2ATQA 2AJQA 4BE1A 3SQ0A 1U45A 4FXDA 3L3UA 2VG6A 1RILA 1VSIA 1WSGA 2FBVA 4DQQA 5K14A 3TAEA 4DFKA 4OGCA 3ZT2A 4KI6A 4KTWA 4LH5A 1T03A 5EU7A 3QEVA 1JLBA 4PWDA 1W9HA 4DMNA 3OS2A 2A1RA 2KZZA 1HYVA 3C6UA 3FFIA 4J2BA 1CXQA 2EHGA 2X78A 1IH7A 3ALYA 4C8LA 1S5JA 1VRUA 4CFBA 4C8NA 4KKOA 4UQGA 1J9AA 3MXJA 1Q8IA 1SL2A 1X1PA 1XHXA 4QCLA 4DFPA 4Z4HA 3K5OA 3AVJA 3HYFA 3NF7A 4M41A 3ZT1A 4CJPA 1U04A 3VQPA 3VQEA 2W42A 3G10A 4E7JA 1J54A 4JS5A 3NFAA 1BISA 3VA0A 1L3TA 3MEGA 3SUOA 2YHAA 3OS1A 3HVTA 4KRFA 4KTQA 3IG1A 3IS9A 4LD0A 2BANA 4CJWA 5C24A 3OYBA 1JLQA 3RRHA 4FJIA 4F4KA 1QTMA 4E19A 3V4IA 4FJ7A 2GUIA 2E6LA 4CJLA 4IKFA 2RPIA 4ZTJA 4CIEA 2OPSA 1YTUA 2OZMA 4FW2A 1RTHA 3WNFA 4DTOA 3UIQA 5CYMA 3KIOA 2YKMA 1TKTA 2HHTA 4FLTA 4RW4A 3IAYA 4CFCA 4HVJA 3NBPA 4DQPA 4I7FA 1WLJA 2Z1JA 2KW4A 3OVNA 1VSKA 1TL3A 4CF0A 4CFDA 3V1RA 3ZSQA 1BQMA 3B6OA 3OYDA 1NK7A 4AHSA 4DSIA 4DF4A 3SQ1A 4I9LA 3VQQA 3L2WA 3O3GA 3EZ5A 4I9QA 3HO1A 1C1CA 1WSFA 3O3FA 1RDBA 4B9NA 2XRIA 3V9XA 1TAQA 1UWBA 4ICLA 3WNGA 1VSMA 2NUBA 2YNHA 4CJ5A 3HM9A 3K5LA 1A5WA 2YHBA 4BDYA 1X9MA 4CJVA 3VQCA 4HUEA 4F8RA 1RT7A 2ZE2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CHYA 1YT3A 4M63C 4PKIA 5GAGP 4CJEA 1Z26A 4O44A 1RBVA 4I2QA 4HUGA 4DFJA 3SNNA 1DGKN 1S22A 4EP5A 4MLEA 1M1KO 3NF6A 1ZBSA 1NGBA 4RW7A 5T7BA 1TYQB 5DMRA 1FKPA 1C0FA 3CFOA 4BC2A 5HP1A 2V51B 4WCEL 3QINA 5AQRA 3KVGA 4OPHA 2Y1IA 1RTDA 4PKHA 4ILGB 2QW9A 4E89A 4LF5K 3SV4A 5AQPA 3ZX0A 1NJWA 2CH5A 3ENBA 4OJRA 5JMVA 2PY5A 3DOLA 1RBUA 3U9ZA 3RRGA 3E9OA 5A2QO 2Z1HA 4B9SA 4JI7K 2IVPA 4EIAA 4IDKA 3EKUA 2P9KA 1TUYA 1GLBG 3OYGA 1VSJA 3KD1E 4PQUA 4GV3A 3SUPA 4A2BA 1NJIO 5FPNA 4YOWA 4JRPA 3CQXA 1EWQA 2OPPA 3D45A 3HRGA 3C7NB 5GINA 3V6DA 4DU4A 3OS0A 3N4PA 3CD6N 4Y1DA 1HYZA 1RT6A 3CCQN 3NGYA 1LOTB 2D0BA 2HVHA 3VEXA 3LAMA 3CI5A 1BL3A 5KRSA 1Z6RA 3ZT4A 5HBMA 1IKWA 4EP4A 3EY1A 5BRHA 3KKRA 5KQ8A 3KLGA 2JWLA 4FCYA 3M1FA 1CZBA 3H3NO 1SUQA 5JLHA 4RTFD 4V19S 1GLJO 3VF6A 2PBDA 3BGRA 2H3GX 5CR4A 1SS6A 3CCEN 1T8EA 3NMUA 4O8UA 3EZWA 3AVFA 1VQLN 1D5AA 3BUZB 1MDUB 1Q9YA 4GKKK 4EFHA 3CHWA 4FJXA 2HF4A 4CEOA 1S1WA 2QWOA 2PAVA 4DG1A 4DR7K 5DM6L 1Q81O 3TSQA 4E1NA 1HNIA 4FJMA 4CJ3A 4JI8K 5AQMA 1JLGA 1BG3A 3HZ6A 1T05A 1QVGM 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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