2FBVA

Wrn exonuclease, mn complex
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
194
structure length
194
Chain Sequence
HSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Werner syndrome helicase
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 63
structure length 194
sequence length 194
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbvA00
4FJMA 5DK5A 5C25A 3EYZA 5C24A 2XY5A 3O4NA 3TAPA 2IOCA 3CYMA 2G8WA 4CJTA 3LWLA 1NK4A 1B9FA 1KLMA 3MXJA 1RBSA 2D0BA 3QNOA 3OYIA 4Q0BA 2OZSA 2O4GA 2QK9A 5J2PA 1EETA 1ZBFA 2OPPA 3DOKA 2VWJA 1LW0A 3KK1A 1RDBA 3LAMA 1SL1A 4CEZA 3VA3A 3SCXA 5CYQA 2YKNA 4OKKA 4DMNA 3DYAA 4F8RA 3KD1E 3AO1A 4PUOA 3NH0A 2IAJA 3KKSA 2G8KA 4J2BA 3NF9A 4M3WA 1HNVA 1QSYA 1J5OA 1Y97A 3DLBA 5HRNA 1RT4A 3PUFA 4QCLA 3AA5X 1KLNA 1S6QA 4OLAA 3S3OA 2ZQBA 4B3OA 4ID5A 2G8IA 1BL3A 1TL1A 3DOLA 4W5NA 4N5SA 4DG1A 1LWEA 4HUGA 3LZJA 3JSMA 2HB5A 4RG8A 3ZSQA 2D0CA 3O3FA 1TKTA 4TSXA 4JLHA 3AO4A 4FLZA 1NOZA 1TV6A 3NBPA 4KB1A 3PO5A 4N56A 2FBXA 4CF1A 4KI4A 2YNGA 1WSJA 2E6MA 2PYJA 5KGWA 3OY9A 1EKEA 3S3MA 2ETJA 1LAWA 4FLYA 4C8OA 3SQ2A 1XC9A 4E89A 3OJUA 1JLFA 4E0DA 4FJ7A 1SKWA 1ZBHA 1QQCA 4H4MA 4RW8A 1ITGA 3HPHA 2HHVA 1RT5A 3DM2A 3RR8A 4B9NA 1J54A 2OPQA 1BIZA 4CHPA 3RMBA 3SPYA 4E1NA 2YHAA 3SPZA 3IAYA 4CJKA 2BDPA 5I42A 4J2EA 1NJZA 1IKVA 1SL2A 4LH4A 4O44A 1JL1A 2BGGA 1JLCA 5SZTA 3OYKA 3KLEA 3HYFA 4W5QA 4EZ9A 1ASWA 2GUIA 2NUBA 1S6PA 3ZCMA 2HMIA 3ZSZA 3P83D 3EY1A 5HBMA 4CFDA 4NYFA 5D3GA 1KTQA 1LW2A 3NCIA 1A5XA 1B92A 4CEFA 4CGFA 4FJHA 1RILA 1VSEA 3DRRA 5I3UA 4DTSA 1YTAA 2HHXA 1VSHA 2EHGA 4DTUA 4CJ3A 4FM0A 4DFJA 1RBTA 2P51A 4MQ3A 3CFOA 2DY4A 1A5VA 1C1BA 1NK0A 4FW1A 3TR8A 3V1OA 4E7LA 3KKRA 1SUQA 4YNQA 2XY7A 3TI0A 1RDCA 2G8VA 1L3TA 3HO1A 3OJSA 4OLBA 4AHUA 5KRTA 4AH9A 4FLTA 4DU1A 4JS4A 2GBZA 4BDPA 3D0PA 3M8QA 1C0MA 2OPRA 1VSMA 4B9MA 1O1WA 1C0UA 4KHQA 3OVNA 3MEGA 4M41A 4Z4CA 3NDKA 3C6TA 1HPZA 3OYMA 4DLGA 4KREA 3AVJA 3D45A 4KRFA 3VQEA 5K14A 4KHWA 1TAQA 4DQQA 1SKSA 1F21A 4LD0A 3L2RA 3ASMA 3PX4A 1WSFA 1TK5A 4AHTA 3KLGA 1NKBA 3K2PA 3F9KA 4WE1A 4I9QA 1BGXT 1ASUA 4CEEA 1X9WA 3HXMA 3K5MA 4CJ5A 2PY5A 4CK3A 3NHGA 3DLEA 4FK0A 1CXQA 3QEWA 1U4BA 1HJRA 1Q8IA 3RMDA 1RTIA 1LV5A 3AVAA 1LWFA 3VQCA 4PA1A 1VSKA 2KTQA 1UWBA 2HVHA 1WSHA 4Y1CA 3V6DA 3L2UA 3OYJA 3RMAA 3QLHA 4FK2A 3PO4A 4DSFA 4BE0A 4DF8A 4KPYA 1RT2A 4H4OA 3SYZA 3CM6A 3AVKA 3P1GA 1EP4A 4QAGA 4CEOA 3QESA 1K6YA 3ALYA 1NK9A 3CFRA 4M45A 3K59A 1CLQA 2IS3A 1JXBA 3AVLA 4IKFA 3OYNA 1WSGA 1L5UA 1ZYQA 1JKHA 4I7FA 3TAMA 4W5TA 1NKEA 1T7PA 4FJ5A 3AA3A 3V9SA 3V9XA 4H8KA 4CJSA 3OYGA 4FJKA 2F8TA 1NJYA 3NH2A 4B9VA 3KLIA 1TKDA 1BCMA 4CE9A 4DQPA 3MEDA 2YV0X 4CEDA 1RNHA 4CJUA 4N47A 3DI6A 4DFKA 2QKKA 2YHBA 1VSIA 3VQDA 4F3TA 4KHNA 4IFVA 4CIGA 4PY5A 4RW7A 3ZT2A 3IRXA 3OYDA 3LWMA 3U6FA 1G15A 2FBVA 3SJJA 4IFYA 3NE6A 4AHVA 2RF2A 3TARA 4ZTFA 2JLEA 4DU4A 1C0TA 2IDOA 1BIUA 1UOCA 3TAQA 4FXDA 5CZ2A 1CXUA 3AO3A 3B6OA 1C1AA 3WNGA 2VWKA 2OA8A 4CFAA 2Y1IA 1GOCA 1TVRA 1S9EA 4KTZA 3L2QA 3MXIA 2PYLA 3VQ9A 1I3AA 4E7IA 1NK6A 4K8XA 1REVA 1RBRA 3NFAA 3VQQA 1NOYA 1HQEA 3MEEA 3T19A 4CEAA 3QEXA 4B08A 1T05A 1TGOA 5FROA 4W5RA 1QSSA 4KFBA 4OKJA 4CGDA 2OPSA 2ZE2A 1HQUA 3OYBA 3K5NA 4DSLA 4FJIA 3VQAA 4FZXC 4EZ6A 2O4IA 3BGRA 4CFCA 2F8SA 3S3NA 4KAZA 3PV8A 3NF7A 4AHSA 4CHZA 3HT3A 1KSPA 3LANA 3NGIA 2KZMA 2HNYA 1KRPA 5JS1A 1FK9A 1S1VA 2VG7A 3HPOA 2FC0A 3HVTA 4NCGA 3T3FA 3NGZA 4CF0A 3ZT1A 3CG7A 3K5OA 1FKOA 5HRRA 5E41A 3PX6A 3AVIA 4J2DA 4BDYA 4G1QA 3SUOA 4KB0A 4C8LA 4RW9A 1WSEA 3LZIA 3C6UA 1RDDA 3HPGA 3V4IA 1WAFA 5KTQA 3HM9A 3M8PA 4E19A 3KTQA 2YNIA 3AVCA 4OGCA 1B9DA 3PX0A 2RN2A 3VQ8A 3V81A 4CJ4A 3OYFA 5HP1A 4HVJA 1NK7A 1RT1A 1QSLA 1VK0A 2ZD1A 1HYVA 4CGIA 5KRSA 1MU2A 4DTJA 3VQ4A 1IKYA 1QHTA 2WONA 3AVNA 4LSNA 5C42A 4FM2A 3LP1A 1YVUA 4BACA 1JLBA 4DTPA 1Z26A 2A1SA 1RBUA 3OYLA 4CEQA 2KFNA 3ZSVA 3DRSA 4Z4FA 4FYDA 1WNSA 2HHSA 1HRHA 3ZT0A 2X78A 4F4KA 4KKOA 3UIQA 3LPTA 4JRPA 3VQ6A 3KLHA 1VSFA 2DFHA 4FLUA 2VG6A 5FDLA 3K5LA 1C6VA 2BANA 2YNHA 4GVMA 4CF9A 3M8SA 2LSNA 4DFMA 1D9DA 1N6QA 4Z4IA 3SUPA 4AHRA 4CGGA 3WNHA 3AVBA 2B4JA 3L3UA 2YKMA 4Y1DA 3E01A 4CJLA 1UA0A 1D9FA 4B9LA 2F96A 3TAGA 3HSTB 1TKXA 4DLEA 2OZMA 2XRIA 4CHOA 2QXFA 3OYEA 2AJQA 4FJ9A 3SQ0A 4Z0UA 3KD5E 4FJGA 1X9MA 2FBTA 4DQRA 3AA2A 4FLWA 4L8RB 3U3YA 4FJJA 4C8MA 1KVCA 2I5JA 4DWIA 3ZT4A 3MAQA 2Y1JA 2DTUA 4ZHRA 1IO2A 4B9SA 3LALA 1BQMA 1DTQA 1RT6A 2B5JA 3U3GA 4E7HA 4ELUA 4ELVA 4F2RA 1X1PA 3NAEA 3RMCA 2XO7A 4HHTA 4FVMA 5HRSA 3VQPA 4KV8A 4XIUA 4HUEA 5J2QA 4DSEA 4DFPA 2HHQA 1ZBUA 3VQ7A 1UA1A 2YNFA 4FK4A 3AA4A 1BI4A 2HNZA 1NK5A 2D0AA 4OKEA 3ZSOA 1KFSA 3O4QA 4OGEA 3ZSXA 4E7KA 5DMRA 3TANA 5FRNA 4JS5A 3V9WA 4Z4GA 3K57A 4FJNA 3WNEA 3F73A 1D8YA 2P5GA 3LPUA 3NF6A 2HHTA 3SV4A 1WLJA 3QEVA 1IKXA 1JLEA 1EXQA 1WAJA 1JLAA 1VRTA 4M3RA 4B9UA 2DFFA 4EP5A 2G8HA 2Z1HA 3C95A 4BWJA 3AVMA 1RTDA 4CHYA 2KZZA 4FCYA 3A2FA 4JRQA 2HHUA 1KVAA 1HYSA 3ZSWA 4IDKA 4N76A 1KVBA 3QETA 2XY6A 2KW4A 5CZ1A 1RT3A 3SI6A 1J9AA 3SV3A 5HLFA 3RR7A 3ULDA 2HW3A 1XWLA 2JGUA 4GMJB 1S1TA 4M3UA 1U48A 3RTVA 4HCBA 1ZBIA 1CZ9A 3BDPA 5CY4A 2FBYA 4CIFA 2G8FA 3RRGA 2OYQA 2Q3SA 1TK0A 4CJQA 3EZ5A 1VRUA 4ICLA 1BHLA 1WSIA 3DRPA 4Z4HA 4NCAA 4I2QA 1HNIA 4E3SA 4CF8A 3TAFA 4CJEA 2Z1IA 1JLGA 1LAVA 2W42A 3KIOA 4CHNA 4OJRA 3QINA 3KJVA 1NJXA 4Z4EA 1YTUA 3KK3A 4KO0A 1DLOA 3DLRA 4ID1A 3PY8A 4N41A 1IKWA 1RTJA 3ZT3A 4FZZA 4PWDA 2A1RA 4E1MA 3AV9A 3S9HA 2ATQA 5KI6A 3CFPA 4BDZA 1QE1A 1LWCA 2P5OA 4OPKA 1VSLA 3I8DA 2XHBA 1JL2A 4F3OA 3V1RA 1U45A 1U04A 4DQSA 4HCCA 3FFIA 1FXXA 4FLXA 4RW6A 1U49A 4M42A 4KHYA 4O55A 4NCBA 1RT7A 1QS4A 4ZTJA 2RPIA 3I0SA 3QO9A 2X6NA 4FW2A 1I39A 4CCHA 1RCHA 2E6LA 1IH7A 1XI1A 4FJLA 4Q5VA 1XHZA 3V9UA 2B6AA 4DTMA 2G8UA 3DLKA 4M3ZA 2EX3A 4BE2A 4CF2A 1RDAA 3HP9A 1TKZA 3LP2A 4QOZB 4PQUA 1BCOA 3KK2A 3LP0A 1N5YA 4M3TA 4J2AA 4HUFA 1W0HA 4R5PA 1VSDA 4BE1A 5EU7A 1XHXA 2XY8A 3OYCA 4IBNA 3TABA 3QERA 4F2SA 3VQBA 1NKCA 3LDSA 3CM5A 3MECA 2BE2A 3HL8A 1S1XA 4I9LA 3QEPA 4W5OA 3SUNA 4K8ZA 4CESA 1RBVA 4LY7A 3HP6A 1X9SA 3QEIA 3IS9A 4CHQA 1C1CA 2IGIA 3H08A 1DTTA 3C94A 3SNNA 3KLFA 1YT3A 4C8KA 1D5AA 4CGHA 1RTHA 1U47A 4B8AB 1L3UA 3OS1A 4O0JA 1S5JA 3SQ1A 5SWMA 1SKRA 1BI4B 4FJ8A 1JXEA 1KCFA 3RRHA 3SZ2A 5J2NA 1ASVA 4AHCA 5KGXA 4CJWA 1CZBA 2HNDA 2Z1GA 3P5JA 3LP3A 4DS5A 2KQ2A 1A5WA 5J2MA 4DTNA 1L3SA 4OVLA 4BWMA 4CFBA 2Z1JA 1JLQA 3NGYA 1NJWA 3B6PA 4O5BA 1GOBA 1R0AA 1SL0A 1S9GA 1EX4A 3AO5A 3AO2A 1TK8A 1QTMA 3LAKA 2ITGA 4NYNA 4IG3A 3K58A 4EP4A 1SV5A 3TWHA 3VA0A 4DU3A 4KHSA 1BQNA 4I2PA 1GOAA 4LSLA 4DTOA 5HRPA 2GV9A 3OS2A 3L2WA 4CECA 3OYHA 1WN7A 5HROA 1HMVA 3IG1A 4DTRA 1VSJA 4KTQA 4CERA 3HJFA 4M3XA 4IG0A 4LH5A 1BISA 4CJPA 1NK8A 3T1AA 3TAEA 2WOMA 3JYTA 3G0ZA 2X6SA 3M8RA 3RWUA 3VN5A 1T8EA 3ZSRA 4CJFA 3QIOA 4KTWA 2D5RA 4DF4A 4O0IA 1TAUA 4OPJA 4UQGA 3NF8A 1Z25A 3OS0A 4YFUA 3THVA 3MXMA 3NH1A 1Q9YA 4CIEA 4E7JA 1L3VA 1IG9A 1T03A 4ELTA 3VQ5A 3DLGA 3AVGA 1TL3A 3L3VA 4CK2A 1KFDA 5CYMA 4DSJA 2KFZA 3QIPA 4DTXA 2DFEA 3L2VA 4DSIA 3G10A 1ZBLA 3ISNC 2IC3A 4HTUA 4FZYA 5J1EA 2QKBA 4FM1A 4MFBA 3QNNA 3SUQA 2HVIA 5FRMA 1HYZA 1FKPA 2VG5A 4CK1A 4CGJA 3O3HA 4FLVA 2X74A 3V1QA 4DS4A 3SQ4A 4B9TA 3L8BA 4CEBA 1J53A 3DLHA 4GW6A 1Q9XA 4AILC 1S1WA 5T7BA 4RW4A 2R7YA 2HHWA 2PZSA 3OYAA 1UAXA 3I0RA 3WNFA 3ITHA 4CJVA 3DMJA 3AVFA 3ZSYA 3V9ZA 4M3YA 3HK2A 5JS2A 1W9HA 1S1UA 4B8CA 4CJRA 4C8NA 2RKIA 3CQ8A 4KI6A 3O3GA 4DSKA 4DQIA 4O4GA 4FJXA 3AVHA 4KHUA 3HVRA 2E4LA 2P1JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJMA 3T1HK 2IOCA 3TAPA 4CJTA 4YOTA 3LWLA 3VEOA 1NK4A 3O1BA 5AQMA 1JCEA 2QK9A 1EETA 4BRLA 2VWJA 3KK1A 2WTUA 1RDBA 2WBNA 3D2EA 1ZXOA 3FLCO 3I56N 5F0XA 4F8RA 3KD1E 3O9SA 4RWTA 4DV2K 4M3WA 1HNVA 3DLBA 1Y97A 5BRHA 4QCLA 2FLOA 1S6QA 3S3OA 2ZQBA 4B3OA 1BL3A 2ITMA 1LWEA 4DR7K 4ILJA 3AO4A 1Q86O 1TV6A 3DXMA 1VQKN 1SQKA 4CF1A 3P38A 3THWB 1WSJA 3S3MA 3ENHA 4C8OA 3HBTA 3MDQA 3LDNA 1ZBHA 5AQKA 1QQCA 2UXBK 4O8KA 3OBYA 3A5LC 2GUPA 1BIZA 4FOIA 3RMBA 4E1NA 3SPZA 3VTHA 4CJKA 2BDPA 1NJZA 4BQLA 3JAMO 1JLCA 3O1WA 3OYKA 2P9IB 3HYFA 4EZ9A 3ZSZA 2VQFK 5HBMA 2QI2A 4NYFA 2UUBK 3CPWM 4CEFA 1QVFM 5I3UA 4DTSA 2W6LA 1VSHA 4DTUA 4LFAK 4CJ3A 5AQXA 4JNEA 2P51A 4JD2B 3VPZA 2O8BB 4JHDB 1M1KO 3V1OA 4BY9C 3TSQA 3EO3A 3E9OA 3KKRA 3TI0A 2DPNA 3CXCM 4DR6K 2GBZA 4BDPA 1T3VA 2EWSA 2OPRA 1O1WA 4Z4CA 3OYMA 4DLGA 4KREA 5C10A 3G71N 5LMUK 3D45A 3CJAA 3ZETB 4KRFA 3KK7A 4KHWA 4LD0A 1TK5A 4AHTA 4WE1A 2AA4A 3HTVA 1ASUA 4OPHA 1X9WA 1J5EK 3K5MA 4CJ5A 1S3XA 3DLEA 1CXQA 1RTIA 1LV5A 3D2EB 4PA1A 1VSKA 1ZC6A 3V6DA 3BEXA 4A57A 4KPYA 4H4OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FJM A;  3T1H K;  2IOC A;  3TAP A;  4CJT A;  4YOT A;  3LWL A;  3VEO A;  1NK4 A;  3O1B A;  5AQM A;  1JCE A;  2QK9 A;  1EET A;  4BRL A;  2VWJ A;  3KK1 A;  2WTU A;  1RDB A;  2WBN A;  3D2E A;  1ZXO A;  3FLC O;  3I56 N;  5F0X A;  4F8R A;  3KD1 E;  3O9S A;  4RWT A;  4DV2 K;  4M3W A;  1HNV A;  3DLB A;  1Y97 A;  5BRH A;  4QCL A;  2FLO A;  1S6Q A;  3S3O A;  2ZQB A;  4B3O A;  1BL3 A;  2ITM A;  1LWE A;  4DR7 K;  4ILJ A;  3AO4 A;  1Q86 O;  1TV6 A;  3DXM A;  1VQK N;  1SQK A;  4CF1 A;  3P38 A;  3THW B;  1WSJ A;  3S3M A;  3ENH A;  4C8O A;  3HBT A;  3MDQ A;  3LDN A;  1ZBH A;  5AQK A;  1QQC A;  2UXB K;  4O8K A;  3OBY A;  3A5L C;  2GUP A;  1BIZ A;  4FOI A;  3RMB A;  4E1N A;  3SPZ A;  3VTH A;  4CJK A;  2BDP A;  1NJZ A;  4BQL A;  3JAM O;  1JLC A;  3O1W A;  3OYK A;  2P9I B;  3HYF A;  4EZ9 A;  3ZSZ A;  2VQF K;  5HBM A;  2QI2 A;  4NYF A;  2UUB K;  3CPW M;  4CEF A;  1QVF M;  5I3U A;  4DTS A;  2W6L A;  1VSH A;  4DTU A;  4LFA K;  4CJ3 A;  5AQX A;  4JNE A;  2P51 A;  4JD2 B;  3VPZ A;  2O8B B;  4JHD B;  1M1K O;  3V1O A; 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 3BGR A;  3CCS N;  2F8S A;  1SAZ A;  3S3N A;  3DAW A;  4KAZ A;  3HT3 A;  1KSP A;  3LAN A;  3FZF A;  3NGI A;  4M63 C;  5JS1 A;  3EKS A;  4X62 K;  4H0X B;  5E41 A;  4CZF A;  3R8E A;  4C8L A;  3LZI A;  1RDD A;  3QFP A;  3EE9 A;  3V4I A;  3HM9 A;  3EE8 A;  4C1N I;  5CHI A;  2YNI A;  2BTF A;  3ZX2 A;  3PX0 A;  2A41 A;  5AQQ A;  4FPB A;  4CJ4 A;  3OYF A;  4HVJ A;  1NK7 A;  1QSL A;  1VK0 A;  2ZD1 A;  5KRS A;  1OH7 A;  1IKY A;  5C42 A;  3LP1 A;  1YVU A;  4BAC A;  3DRS A;  4FYD A;  2QA4 N;  1HRH A;  1ATN A;  3UIQ A;  1VSF A;  2YNH A;  4CF9 A;  3LM2 A;  3SUP A;  4H0O A;  4Z4I A;  4CD3 A;  4A2B A;  3L3U A;  1D9F A;  2YKM A;  4CJL A;  3TAG A;  3HST B;  2GWJ A;  2E5L K;  3VGM A;  4FSV A;  2OZM A;  2XRI A;  1EO1 A;  2QXF A;  5BRD A;  3SBG A;  5AQY A;  3ENO A;  4Z0U A;  4BR2 A;  3KD5 E;  4FJG A;  3AA2 A;  4L8R B;  3U3Y A;  4FJJ A;  3VEW A;  3ZT4 A;  3MAQ A;  5JIC A;  3SAG A;  1BA1 A;  3CQX A;  4H0P A;  3FGU A;  2Q0U A;  3BUZ B;  1DTQ A;  3U3G A;  3QML A;  4K43 A;  4NLC A;  2XO7 A;  2NRT A;  5HRS A;  4HUE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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