2FBVA

Wrn exonuclease, mn complex
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
194
structure length
194
Chain Sequence
HSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Werner syndrome helicase
total genus 63
structure length 194
sequence length 194
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbvA00
1IO2A 2F96A 4CJSA 3ASMA 2X6SA 2Q3SA 3OYLA 3V9WA 2E6LA 3AO4A 2HHVA 4DTRA 1RT4A 3L2VA 2LSNA 3QESA 4B9UA 4O4GA 5HLFA 3VQCA 1D5AA 1QTMA 1LWCA 1FK9A 3DLBA 3RTVA 1S1XA 2VWKA 3BGRA 3LALA 1JLEA 2OPSA 5FROA 3THVA 1JKHA 2DFHA 1TGOA 1XWLA 4M41A 4HUGA 3KKSA 5KRSA 4FJIA 2NUBA 1RBSA 1RILA 1KLMA 3K5NA 2O4GA 1ZBFA 3DRSA 2XY6A 1CZBA 3S3OA 4G1QA 3V1QA 3SQ2A 1BIUA 1KLNA 4CFBA 1S1TA 1VK0A 3VQAA 3K59A 3VA3A 3LPTA 4FW2A 1SL2A 1EXQA 2HNDA 4LH5A 3TWHA 1JXBA 4DS4A 4RW4A 3VQ5A 3L2QA 1U47A 3O4QA 1NKEA 1D9DA 4HCCA 3K5OA 4BWJA 3AVGA 1QHTA 3AVIA 3L3VA 4DSLA 4DTJA 1UWBA 3C94A 1C1AA 4CFCA 4CJTA 3QNOA 4M3WA 4DTPA 4O0IA 4CGGA 2QKBA 3U3GA 2W42A 2PY5A 4PQUA 4F8RA 5CYMA 1S1VA 4LH4A 4B9MA 4K8ZA 4J2AA 4FK0A 2FBYA 1SKWA 1BHLA 2XY8A 3JSMA 4FZYA 2BDPA 1EKEA 3AV9A 4RW8A 2HNYA 5HRNA 3PUFA 4CEAA 4B3OA 4CHZA 2WOMA 1BQMA 4KKOA 4FJJA 3PY8A 3G10A 3L3UA 4IFYA 4DQQA 4DQIA 3HPOA 1RDDA 3FFIA 1QSSA 5HRSA 3TAEA 3SJJA 4C8KA 4KHQA 3CG7A 4EZ6A 1RCHA 1RTJA 4FJHA 1EX4A 4E89A 1VSEA 4ZTFA 1YT3A 1X9SA 4NCGA 4W5QA 1Q9YA 4CJ3A 2YKMA 3T3FA 1NK8A 3SQ4A 4FJGA 2Y1IA 5JS2A 4CHNA 5J2NA 2Z1IA 4DLEA 2HHTA 3AO1A 1GOAA 4BE2A 2ZD1A 1QS4A 1RDAA 1U04A 3O3HA 3TANA 3SV4A 1S1WA 4CJFA 4CJPA 4DU1A 1IG9A 3LZIA 2ZE2A 2A1SA 3ZT3A 5J1EA 1LWFA 3AA3A 2B5JA 1QE1A 4YFUA 3KLEA 3P1GA 3ZSWA 3V9UA 5C24A 2IAJA 1J9AA 4OVLA 4CERA 1DLOA 4CCHA 3NF8A 1A5XA 1O1WA 2GUIA 4JRQA 5I3UA 3TAFA 1VSKA 3VQEA 5JS1A 4DG1A 5FRNA 3OJSA 4FW1A 3SNNA 5C25A 3MECA 3VQ4A 1MU2A 3QNNA 3AVBA 4FJ8A 1RTHA 3TAGA 4CF8A 3LAKA 3TAPA 1JL2A 2R7YA 1Z26A 4M3RA 4CJKA 1YTAA 2P1JA 1WLJA 1TK5A 3AO5A 4ZTJA 4NCBA 4JRPA 1KFDA 4JS5A 1UA0A 4IFVA 2KFNA 3V9SA 2DTUA 3QIOA 1RT7A 4Z4FA 4DFPA 2XY5A 4GMJB 3SUNA 4F2RA 3ITHA 4O0JA 1WN7A 2QKKA 4C8LA 4FLUA 3OJUA 4BE1A 3MXIA 3V1OA 1KVAA 4GVMA 1NK9A 4CJ5A 3SUPA 3OYHA 1NKBA 1T7PA 1WNSA 1TKXA 1TK8A 3NHGA 2D0CA 1RDCA 3L8BA 3ZT4A 3NGZA 2KZMA 1VRTA 1IKXA 1GOBA 2QXFA 3PO4A 4I2PA 3S9HA 4FJ7A 4HUFA 2YNFA 4FLVA 3I0SA 1TL1A 3ZT1A 4CJUA 4CE9A 4F3TA 4N76A 1HNVA 1HJRA 4IG3A 1JLFA 3KIOA 4AHUA 1WSGA 1ASVA 4H4OA 4CJLA 3NBPA 1C0UA 3V9ZA 3SPZA 3NGYA 1ZBIA 4OLBA 1WAJA 3OS0A 2GV9A 3JYTA 3KLIA 4L8RB 3HK2A 4PA1A 4BACA 4AILC 3OYGA 3MXJA 3OYNA 3DOLA 4CHPA 1LW2A 3CM6A 3ZCMA 4C8OA 4CEEA 2I5JA 2OPPA 3ZSYA 4CK1A 5E41A 2YKNA 1J5OA 1CXUA 4CECA 5SZTA 3KLFA 1X1PA 2HW3A 3V1RA 4CFDA 3TABA 4Q5VA 3AVAA 4M3TA 1KVCA 3HVTA 2XRIA 4I7FA 3QIPA 3B6OA 4KTWA 4ZHRA 3L2UA 4BDZA 3SPYA 2G8HA 3SI6A 3NF6A 4Z4HA 3V4IA 4CIEA 1NKCA 3HSTB 3AO2A 1LWEA 4W5RA 1KFSA 4E7IA 2E6MA 1L3VA 1NOYA 1S6QA 2Y1JA 4J2EA 4FLWA 4IBNA 4FJMA 3OYMA 1B9DA 2HHSA 3QEWA 4DTUA 4KPYA 1NK5A 1EP4A 1VSJA 3DRPA 1TKTA 3E01A 3OVNA 2OZSA 1YTUA 4Q0BA 3RMDA 4I9QA 1F21A 4B8AB 4CHYA 2IOCA 4TSXA 4F4KA 3T1AA 4CGIA 4R5PA 3QINA 4DFJA 5J2PA 3AVLA 1YVUA 3RMAA 4N56A 3OS1A 2KTQA 4CIGA 2WONA 3PX6A 1HYSA 2EHGA 3BDPA 4M3XA 3DLRA 2Z1JA 3VA0A 4KB0A 2BANA 4Z4IA 1RT6A 2D0AA 3I8DA 1Z25A 4Y1CA 3EZ5A 1ZBLA 3UIQA 1ZBHA 1VSMA 4CJVA 1CZ9A 3LP2A 4KTQA 3LP1A 3WNFA 3ZSVA 4AH9A 4OLAA 3K5MA 4BDPA 1UA1A 4Z4EA 4N47A 4CJRA 4B9SA 3ZSRA 5HP1A 4FK4A 4AHCA 3P5JA 3VN5A 4OKEA 3HYFA 5J2QA 3KLGA 4E7KA 1L3UA 1SL0A 1JLBA 4E0DA 1RNHA 1VSLA 4CFAA 3AVHA 2PZSA 1TL3A 5HBMA 3HXMA 3ULDA 4DQPA 1LW0A 2VWJA 2HMIA 1SL1A 3F73A 4AHSA 4CGJA 3AVFA 3MXMA 4RG8A 4E19A 5KTQA 3LWMA 1HYVA 4OJRA 3KTQA 4KHNA 1BL3A 2P5OA 1RTIA 4DSKA 4KFBA 4XIUA 4DU4A 1LAVA 3VQ9A 4I9LA 5I42A 2PYJA 2P5GA 1RBVA 2GBZA 1REVA 1RTDA 4FM2A 4OKJA 1D9FA 3DYAA 4FZZA 2BGGA 2G8VA 3O4NA 4CGFA 2IGIA 4RW6A 2P51A 3DLKA 3ISNC 4C8MA 1NK7A 1C1CA 4HUEA 3HO1A 3AVMA 3RMCA 1U4BA 5CZ1A 2PYLA 2HHUA 4N41A 4KHSA 4CJQA 4CF9A 4E3SA 1NJXA 1I39A 1DTTA 2D5RA 1JLAA 1JXEA 3OYKA 4W5TA 3WNHA 1BCMA 4RW9A 1IKYA 1XHZA 1JL1A 4LD0A 4F3OA 1WAFA 1JLQA 3PO5A 1NOZA 1JLCA 1SV5A 2ETJA 3DM2A 3HP6A 4E7HA 1NJWA 3AVJA 3QETA 1UAXA 2X74A 2Z1GA 1TAUA 4Z0UA 4CJWA 4KTZA 2G8FA 1TV6A 4OGCA 4FLYA 4DTMA 3IAYA 1EETA 4AHVA 4PUOA 3LWLA 3S3NA 1SKSA 1S6PA 4J2BA 3M8RA 1L3TA 3PV8A 5CY4A 3QEVA 3LANA 4CK2A 5KGXA 3RMBA 3SUOA 3NH2A 1NK6A 1ASUA 4DTXA 1WSEA 3D45A 1XHXA 3HPHA 4AHRA 5KI6A 4BDYA 3K57A 1RDBA 1TK0A 3VQDA 3ZSZA 3HT3A 2XY7A 4E1MA 4DWIA 4CK3A 4UQGA 1I3AA 1WSHA 3VQPA 1ZBUA 4FM1A 4HHTA 1A5WA 1X9WA 1NK0A 3VQ7A 4DSFA 4B08A 1TAQA 1JLGA 1T8EA 4FJNA 4MFBA 4CEQA 3OYDA 2B6AA 3MEGA 3SYZA 4IKFA 1TKDA 4BWMA 4HTUA 3NFAA 5SWMA 1XI1A 4FYDA 2G8IA 3KK2A 3LP3A 3DLEA 3T19A 5C42A 3L2RA 4ELTA 4B9LA 4NYFA 4O5BA 4CGHA 3HVRA 4DTOA 4B9TA 3IG1A 2KW4A 3HM9A 4EP4A 3S3MA 3VQ6A 3SV3A 2B4JA 1C6VA 3C95A 4ELVA 3V9XA 1SUQA 3HJFA 4FJ5A 2HNZA 3OYJA 4DU3A 4DF4A 4IDKA 4FJLA 3NF7A 5CZ2A 3K58A 4ELUA 1RT5A 3KKRA 4NYNA 4LY7A 3OYEA 3QEIA 4KAZA 4H4MA 3KJVA 3CFOA 2FBXA 4W5OA 3ZT2A 2FBVA 3C6TA 4W5NA 2KZZA 4CIFA 1NJYA 2JGUA 3WNEA 3QEXA 4KRFA 3RRHA 4DTSA 3RR8A 1ZYQA 1ASWA 2VG5A 1BI4A 4OGEA 3G0ZA 1HQEA 4CF1A 4OPJA 2XHBA 4Z4GA 5FRMA 1U45A 2F8SA 2G8UA 3NH0A 1Y97A 2DY4A 3DOKA 1HRHA 1DTQA 4ID5A 3KD1E 4O44A 2HB5A 3MAQA 3O3GA 1NK4A 5D3GA 4N5SA 5CYQA 2X6NA 3B6PA 2E4LA 3LPUA 1GOCA 4LSNA 3SZ2A 3H08A 1CXQA 4JLHA 1BCOA 1WSJA 4FLZA 2HVIA 3ZSQA 2G8KA 3AVNA 4KHUA 4FLTA 3MEDA 4QAGA 3TAMA 5FDLA 3LZJA 4CEZA 2OPQA 4F2SA 2EX3A 2QK9A 4ICLA 4CEBA 3KLHA 4CESA 3TARA 2YNHA 2JLEA 1RT1A 1BIZA 2DFFA 2FBTA 2HHQA 1QSYA 4B9NA 3ALYA 3VQBA 3OY9A 1BQNA 3OYAA 3U3YA 2IC3A 1QQCA 3K5LA 4M3ZA 3AA4A 4FM0A 5KRTA 3LDSA 1J54A 1XC9A 3KD5E 1C1BA 4J2DA 4KI6A 5DK5A 4AHTA 1HPZA 4DF8A 3EYZA 1K6YA 1IH7A 3L2WA 1TVRA 3M8PA 2RPIA 1NJZA 1KSPA 1J53A 4B8CA 4FCYA 4M3YA 5HRPA 1TKZA 3U6FA 2HHXA 1N6QA 3DLHA 4DSJA 4H8KA 5DMRA 4FVMA 3P83D 4BE0A 3RRGA 1B92A 4E7JA 1HMVA 4DSEA 4FXDA 3PX4A 1B9FA 2G8WA 2YHAA 2D0BA 3KK3A 1S1UA 3EY1A 3AVKA 4LSLA 4YNQA 1C0TA 1FKOA 4DQRA 2YNIA 1FXXA 1WSFA 4Y1DA 4KREA 1W9HA 1KVBA 1R0AA 3I0RA 2OA8A 3AA2A 3ZT0A 2HHWA 4PWDA 1N5YA 1BISA 2OZMA 4CJEA 2OPRA 2O4IA 3D0PA 4CGDA 3LP0A 3TAQA 4QOZB 1U49A 3M8SA 2IDOA 2HVHA 4FK2A 5EU7A 4KV8A 4RW7A 3SQ0A 4I2QA 3F9KA 1U48A 1BI4B 2VG7A 1QSLA 1KTQA 3OYCA 3NCIA 4CEFA 4KHYA 2AJQA 5K14A 3OYIA 4FJ9A 1KCFA 4FLXA 4OPKA 1HNIA 1L5UA 3DMJA 4O55A 1C0MA 1LAWA 4PY5A 3NE6A 3CM5A 1IKWA 4K8XA 1RT2A 4EP5A 2FC0A 4NCAA 3MEEA 3VQQA 3V6DA 3SUQA 3DLGA 1VSIA 4DMNA 3SQ1A 3OYBA 2RN2A 3HP9A 1S9EA 3AA5X 1ITGA 3O3FA 2RKIA 4M45A 4DSIA 1RBTA 3ZSXA 4E1NA 3OS2A 3NF9A 3OYFA 3RR7A 4KHWA 3VQ8A 4KO0A 4OKKA 4M42A 3V81A 3NDKA 2A1RA 1Q8IA 2VG6A 3NGIA 3ZSOA 3IS9A 1VRUA 4IG0A 4CJ4A 1KRPA 2YHBA 3C6UA 1RT3A 3NH1A 2X78A 4CEOA 1IKVA 4CF2A 4QCLA 3QEPA 5HRRA 4ID1A 4WE1A 4DLGA 4DFKA 3CYMA 3M8QA 2F8TA 1W0HA 3DRRA 3QO9A 3A2FA 3TR8A 1X9MA 4MQ3A 4KB1A 2DFEA 1VSDA 2RF2A 1RBRA 4DTNA 4CEDA 3CQ8A 1BGXT 3HL8A 4JS4A 4DS5A 1T05A 1D8YA 3DI6A 4KI4A 4HCBA 4C8NA 5HROA 3TI0A 2KQ2A 3NAEA 3AO3A 5J2MA 4E7LA 4FJXA 3LAMA 4EZ9A 1A5VA 4CHQA 2YV0X 1VSFA 3HPGA 4CHOA 1S9GA 1LV5A 4FJKA 4M3UA 1SKRA 3AVCA 1WSIA 2ITGA 2YNGA 1HQUA 2OYQA 1FKPA 4DQSA 4GW6A 4Z4CA 4B9VA 5T7BA 2BE2A 4FZXC 1HYZA 2Z1HA 2ZQBA 3CFRA 1Q9XA 1CLQA 3KK1A 3QERA 3WNGA 2IS3A 2XO7A 4DFMA 3PX0A 1T03A 1G15A 2ATQA 1VSHA 3IRXA 3K2PA 3QLHA 3RWUA 4HVJA 3CFPA 5KGWA 4CF0A 1S5JA 1UOCA 1L3SA 3SCXA 1RBUA 2KFZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OH7A 5AQYA 2F4VK 2LSNA 3MN9A 4O4GA 4FVUA 1D5AA 5MLCQ 1JLEA 2OPSA 3THVA 1JKHA 1ZC6A 5CHIA 1NGJA 1YVNA 1TGOA 4JI1K 4HUGA 2GX9A 4FJIA 3O9UA 4NLCA 1HKBA 3CERA 1FJGK 3V1QA 2QWQA 4CFBA 2ZF5O 3LPTA 4GNIA 1EXQA 4FWLA 4KHPK 5AQWA 4RW4A 5AQUA 4HCCA 3O4QA 4BWJA 2VCPA 3L3VA 4DSLA 4CFCA 3FZMA 4O0IA 2PY5A 1Z6RA 1S1VA 4B3TK 1MWKA 5TKYA 1BHLA 2XY8A 3L0QA 1K8KB 4FZYA 3AV9A 4RW8A 1QQMA 2WOMA 4B3RK 4IFYA 4BROA 2UUAK 3PLAA 1S72N 5HRSA 4KHQA 3SJJA 4JN4A 1OKJA 1DGKN 3SK3A 3J81O 2ZJRL 4NCGA 4W5QA 2Z1IA 3QFPA 4BE2A 2YJFA 3SV4A 1E3MA 4M7XA 3LZIA 1TYQB 5J1EA 1LWFA 2B5JA 4MDBA 3ZSWA 1WBDA 1S3XA 4OVLA 1DLOA 4JRQA 5I3UA 4H03B 5ADXA 3AVBA 3LAKA 1Z26A 3MN7A 2P1JA 1ATRA 2QM1A 4ZTJA 3CHWA 4FWSA 3OW2M 4LF5K 2DTUA 1RT7A 4RTFD 3ZETB 4DFPA 2XY5A 4GMJB 3GBTA 3ITHA 2GWJA 2QKKA 4C8LA 3G4SN 3OJUA 4BE1A 2Q31A 1KVAA 3WQUA 3QBXA 4JI3K 3L8BA 3ZT4A 3MN5A 3PSIA 4X62K 3C6HA 4BRDA 2QXFA 3PO4A 4FJ7A 3RSEB 3I0SA 3ZT1A 4N76A 4BC5A 4IXCA 1VQ9N 4CJLA 3NBPA 3SPZA 1ZBIA 2WUSA 3FE1A 4PA1A 4BACA 3F5TA 3IFRA 3OYGA 3OYNA 3GL1A 1N8RO 2OPPA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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