2FBVA

Wrn exonuclease, mn complex
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
194
structure length
194
Chain Sequence
b'HSVFEDDLPFLEFTGSIVYSYDASDCSFLSEDISMSLSDGDVVGFDMEWPPLYNRGKLGKVALIQLCVSESKCYLFHVSSMSVFPQGLKMLLENKAVKKAGVGIEGDQWKLLRDFDIKLKNFVELTDVANKKLKCTETWSLNSLVKHLLGKQLLKDKSIRCSNWSKFPLTEDQKLYAATDAYAGFIIYRNLEIL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title WRN exonuclease structure and molecular mechanism imply an editing role in DNA end processing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Werner syndrome helicase
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 63
structure length 194
sequence length 194
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2005-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2fbvA00
3LDSA 2G8UA 1S1XA 3V9SA 3LWLA 4B9NA 4DS5A 2YNIA 4NCAA 3NGYA 3RR8A 1BQNA 4LSNA 2EX3A 2E6MA 3VQ6A 1BQMA 1NK7A 2Z1JA 1O1WA 1ZBHA 1NOZA 2HNZA 3IS9A 3QEPA 4B9MA 3DRRA 4LY7A 1C1AA 2BE2A 4CFBA 3V9ZA 2HB5A 4AILC 2P1JA 4Z4EA 1NJYA 4FJXA 1QSSA 1I3AA 3V9UA 4CJSA 1ASWA 3NH0A 4DTSA 3E01A 4DFJA 4PWDA 1SL1A 3KJVA 4OGEA 3ZT3A 4CF9A 3MEDA 4MQ3A 3QNOA 2DFFA 4CJ5A 4DTMA 3TI0A 4EZ6A 3KK1A 4DWIA 2DTUA 4ZTJA 1ZYQA 4ELUA 1YVUA 3KLFA 2A1RA 1MU2A 4FJ5A 3CFRA 4FK2A 1L3VA 2QK9A 3LP2A 1JKHA 2D0AA 4BE2A 4E7LA 3L2UA 3HVRA 4DSEA 1S1WA 1RILA 2DY4A 5J1EA 3LP3A 3SZ2A 5J2NA 3THVA 3QO9A 1CXUA 1KFDA 3SUOA 3VQ5A 4N47A 4RW8A 4CHNA 4BDPA 4I9LA 4J2EA 3VQAA 3HVTA 3OYDA 4FLXA 1U45A 2VG7A 3VQ7A 3NCIA 3QEWA 1GOAA 1XWLA 3TAEA 1JLCA 3G0ZA 4DQSA 3QERA 4KO0A 3DOKA 1GOBA 2VG5A 1NJWA 1TV6A 4FJJA 1YT3A 1REVA 3V1OA 3QETA 3DLGA 4ELVA 4DFMA 3RMBA 2RPIA 2I5JA 3SQ0A 2G8KA 4J2AA 2IS3A 3VN5A 1TKXA 3KKRA 1WLJA 4Z4FA 3MXIA 2B6AA 3WNEA 3VQ8A 2EHGA 3OYKA 3NGZA 3V1QA 3LANA 4F2SA 1JLAA 3S3OA 1RT2A 5HRRA 4CF8A 2RN2A 1NK8A 1GOCA 4KHUA 1KLNA 2NUBA 3O3FA 4IBNA 3I8DA 1BIUA 4NYFA 3JYTA 4N5SA 5FRMA 1RT4A 2F8TA 3M8QA 3OS1A 4DSIA 2X6NA 4DF4A 1UAXA 1C1BA 3HL8A 4OJRA 1S1VA 4KTQA 4E89A 4QAGA 1S6PA 5HRSA 1TL1A 3KKSA 4B8AB 3TABA 2FBVA 1HNIA 4O0JA 2GV9A 4HUFA 3K2PA 4H4OA 4AHSA 4W5TA 1J53A 4F3TA 1ITGA 3MXJA 4O5BA 4CJRA 2R7YA 1WSFA 3AA2A 1J9AA 1WSJA 1BL3A 3DYAA 1C0MA 3HPGA 1BHLA 4AHRA 4B8CA 3U6FA 3HK2A 5CYQA 4OPJA 5CYMA 3O4NA 4CJ3A 3T1AA 2YNFA 3F9KA 1WAFA 4GVMA 3K5NA 4CJUA 3DRSA 2WOMA 4KHNA 3V1RA 3KK3A 3AVHA 1L3SA 4KB0A 3NH1A 3P5JA 1X9WA 2X74A 4IDKA 2ITGA 3ZSYA 1IKVA 1L5UA 2OPSA 3HPHA 2D0BA 3IG1A 1EXQA 1VSLA 3OYBA 1FK9A 2XY6A 2HHTA 3ASMA 3TAMA 1IH7A 3SPYA 2LSNA 1J54A 4OVLA 2HVHA 5SWMA 1RT7A 4FJ7A 3C94A 3QIOA 3TAPA 1S5JA 1I39A 2E4LA 4KTZA 3ZSOA 4DTRA 1TVRA 4B9SA 1NK4A 1WNSA 4DTPA 4O44A 3ITHA 4RW6A 1SV5A 3ZSXA 4CEZA 4FZZA 3AV9A 1A5VA 3SUQA 4N76A 3CFPA 1RBRA 3SQ4A 4FJKA 2F96A 3VA3A 1TKTA 1S6QA 3OYLA 1RCHA 3LPUA 4CJKA 5K14A 1NKCA 4AHUA 4DQIA 5JS2A 3QESA 1VSIA 4PA1A 3KLIA 1Q8IA 1SKRA 4H4MA 3L2WA 5HLFA 1IG9A 2HHWA 3NF6A 5EU7A 1FKOA 3RRGA 4NCBA 1W0HA 4ID5A 4K8ZA 4IFVA 4W5QA 4DSKA 1RTJA 2RKIA 1LW0A 4OKKA 5E41A 5FDLA 4Q0BA 2B5JA 1HQUA 4DTNA 4KPYA 3OYAA 2O4IA 1NOYA 4KAZA 1HPZA 3ISNC 4CFAA 5FROA 4F8RA 4CEFA 1BI4B 3JSMA 1Q9YA 1BI4A 4CJTA 4KI6A 2E6LA 5JS1A 3AVNA 4OKJA 1EKEA 4I2QA 3C95A 3O3GA 3C6TA 3ZT2A 4M3XA 4JS4A 3OYIA 2GUIA 4Q5VA 4O4GA 3OYGA 4W5NA 2FBTA 4CEQA 3VA0A 2ZD1A 3P1GA 1WN7A 4CJPA 4DFPA 4FJMA 1VSKA 1IKWA 4XIUA 4NYNA 2QKBA 3NAEA 1KSPA 2YKNA 4E7JA 4CJFA 1NJZA 3V81A 1TKZA 1L3TA 1RBUA 5D3GA 4KHWA 2HHXA 2PY5A 1CXQA 3AVIA 1Q9XA 1VSFA 1RT5A 1WSGA 2G8WA 2VWJA 1VSEA 5HRPA 4JLHA 1DLOA 3HPOA 3RMDA 3SUPA 1J5OA 1JL2A 1D5AA 2Z1HA 4CHOA 3AVCA 1HRHA 2QXFA 1JLFA 5J2PA 4E0DA 4M3WA 4CGGA 4O55A 1C0TA 1DTTA 2G8IA 2HHVA 1LWFA 1K6YA 1RNHA 3OVNA 4DQQA 4E7HA 2Y1IA 4HUEA 3VQPA 4FK4A 1UWBA 4UQGA 3PO4A 1IKXA 1JXEA 1TGOA 1ZBUA 4DS4A 4BDYA 1HYSA 4HTUA 1L3UA 4KRFA 3DM2A 3I0SA 4E1NA 5KRSA 3OYEA 1LWCA 2XY5A 3TWHA 4KB1A 3QEIA 3L8BA 3RWUA 1NK5A 5C25A 4WE1A 1RDBA 4CEAA 4KFBA 4IKFA 5KGWA 2PZSA 2YHAA 3CM5A 4JS5A 2Q3SA 4BE0A 1D9DA 1B92A 4B9UA 1BISA 4ZHRA 1FXXA 2KW4A 3NE6A 3NFAA 3MXMA 2BANA 4GW6A 4M42A 3ZCMA 1ASVA 1S9EA 3VQ9A 3IAYA 3KLHA 4N41A 3G10A 3HO1A 1JLGA 4E1MA 3LZJA 2XY8A 3CFOA 2AJQA 4FCYA 3QNNA 1RTDA 3ZT0A 1BIZA 1RDDA 1WSHA 2YNHA 3EZ5A 5CY4A 4EZ9A 3AA4A 3KIOA 5HROA 4MFBA 3DLEA 5HP1A 3SI6A 2PYLA 4DSJA 3MEEA 1X1PA 2KFNA 3AVMA 3NGIA 4CEEA 3LZIA 1U48A 4FJNA 3LWMA 4B9LA 1F21A 4EP5A 3TANA 4KKOA 5DMRA 1LAVA 1D8YA 3K5LA 1RT6A 3AVJA 1JLBA 4AH9A 4CJ4A 2OPPA 4FJLA 3NF9A 4DTOA 1TAQA 4CGDA 3OYFA 4KHYA 3KK2A 2IGIA 2FC0A 1NKBA 2HNYA 3SCXA 4LSLA 4G1QA 4ID1A 3SJJA 4BWMA 3B6OA 1WSEA 4FW1A 4CIEA 3AO2A 3H08A 1SL0A 3KD1E 1B9FA 3SV4A 2XRIA 3QEVA 3IRXA 3OS0A 1VRUA 3WNHA 1FKPA 1TK0A 3OYJA 4BE1A 1SKWA 4FLUA 3OS2A 3A2FA 2DFHA 4OKEA 3OJSA 2BGGA 3C6UA 1HNVA 4R5PA 4Y1CA 4E7KA 3SQ1A 4CHQA 1XHZA 4DTUA 1N6QA 2IC3A 1BCMA 2OYQA 2HW3A 4PUOA 3HP6A 3FFIA 2GBZA 2VG6A 3ZSVA 3DLRA 3WNFA 3RR7A 3BDPA 4AHVA 1EP4A 3NF8A 4FW2A 2OPQA 4IFYA 4KREA 1QQCA 4ZTFA 4AHCA 1QSYA 1B9DA 3L2RA 2IDOA 1ZBIA 3MEGA 1YTUA 4QCLA 4JRPA 1LV5A 4Z4GA 1HJRA 4OGCA 5T7BA 4KHSA 1ASUA 3NF7A 4ELTA 4K8XA 2DFEA 4OLBA 1VSDA 2X6SA 2WONA 1NK0A 4CGFA 4HHTA 1UA1A 4DLEA 3RTVA 4DTJA 1N5YA 1D9FA 1R0AA 1KRPA 1LW2A 1SL2A 3NDKA 1SKSA 3VQ4A 3AO1A 4C8KA 2Y1JA 3LP1A 3SUNA 3M8RA 2KTQA 1KVBA 4YNQA 4J2DA 4Z4HA 2FBXA 2B4JA 3AVFA 5C42A 1S9GA 3CM6A 4E7IA 4KHQA 4PY5A 2ATQA 2HVIA 5I3UA 3EY1A 1QSLA 4FK0A 4FJHA 2IAJA 1RT1A 4CK2A 3AVKA 5DK5A 4CFCA 5C24A 3KLGA 1T05A 2F8SA 4JRQA 2YHBA 2QKKA 5KI6A 1XC9A 4RW4A 3ALYA 2IOCA 2XY7A 4CE9A 5KGXA 4CHYA 2XO7A 3EYZA 3SPZA 3AVLA 1RDAA 5CZ2A 4E19A 2HHQA 1RBVA 1SUQA 2W42A 3SV3A 1NK6A 2OA8A 3AA5X 4F3OA 1CZ9A 2RF2A 3DLHA 1KVCA 4M3RA 2YNGA 1ZBLA 4I2PA 3TAQA 3NBPA 1DTQA 3HYFA 3CQ8A 4FJ8A 4Z0UA 2P5GA 4M3ZA 1ZBFA 4M3TA 1TKDA 2HHSA 4CFDA 3NHGA 4RG8A 3VQDA 3HP9A 4C8OA 1HYVA 3S9HA 4E3SA 4B9TA 3DI6A 3ZSRA 3RMAA 4C8LA 1HYZA 2KQ2A 4KV8A 1TK8A 4DQRA 2VWKA 3D45A 4NCGA 1RDCA 1TAUA 1KFSA 4CIGA 5HBMA 4CCHA 1RTIA 4KI4A 3L2QA 3RRHA 2PYJA 1TL3A 4I7FA 3ZT4A 4CF1A 3SNNA 3ZSWA 1X9MA 3HXMA 4J2BA 4CHZA 1VK0A 4FLVA 3OY9A 4CJWA 1T7PA 3DLBA 4HCCA 1X9SA 2ETJA 2YV0X 4LD0A 4CJQA 4CJVA 4ICLA 2G8VA 2KZZA 4CECA 2JLEA 4H8KA 2KFZA 4L8RB 1G15A 2KZMA 1JXBA 3TR8A 3MAQA 3SYZA 1WAJA 4F4KA 4DU1A 4CERA 1VSHA 4QOZB 1A5WA 3HJFA 1RTHA 1TK5A 4FYDA 1BCOA 3PO5A 3AVAA 2Z1GA 4RW7A 3K59A 3L2VA 3PX0A 1JL1A 3AVBA 1KCFA 1HMVA 4AHTA 4O0IA 2BDPA 3KTQA 3AO5A 3OYNA 1UOCA 1XHXA 4FVMA 3WNGA 1U49A 2ZQBA 2X78A 3MECA 4BDZA 1T8EA 4DG1A 4F2RA 4M3YA 3K5OA 3M8SA 3AO4A 1XI1A 3VQQA 4FM1A 2D5RA 4DU3A 3K58A 3CG7A 4FLYA 3QEXA 3U3YA 3RMCA 4LH4A 3K57A 4DMNA 3LAMA 4CJEA 2OPRA 3DOLA 1C6VA 3PUFA 1HQEA 4CIFA 4IG0A 3OYMA 1QS4A 3CYMA 3VQEA 4CHPA 4CEDA 4FLTA 2G8FA 3ZT1A 4DF8A 4N56A 5CZ1A 3OYHA 3KLEA 2D0CA 4BACA 1NKEA 1NJXA 4FZYA 4I9QA 2P5OA 3DMJA 4B08A 4HCBA 4GMJB 4CGHA 5J2MA 3ZSZA 3KD5E 2HHUA 1VSMA 4FJ9A 3TAFA 2JGUA 3AVGA 1EX4A 4CF0A 3ZSQA 3V6DA 1QTMA 3D0PA 1VRTA 4CESA 3V4IA 4Z4IA 4FLWA 3S3MA 1EETA 4DQPA 1JLEA 3OYCA 4C8NA 1NK9A 3QLHA 5KTQA 2A1SA 3ULDA 1KLMA 3I0RA 4Y1DA 4LH5A 3F73A 3T19A 4B3OA 3QINA 4B9VA 1QE1A 3PV8A 4W5RA 5J2QA 4CEOA 2G8HA 4YFUA 3AA3A 4CF2A 3BGRA 4CJLA 1Z25A 4OPKA 3QIPA 3M8PA 4KTWA 5SZTA 3TARA 3V9WA 4C8MA 1KTQA 4DSLA 2HNDA 3DRPA 1A5XA 3OJUA 1BGXT 3S3NA 2Z1IA 3U3GA 4Z4CA 4PQUA 2P51A 3HT3A 3HM9A 1WSIA 1QHTA 2XHBA 4FZXC 3L3UA 3HSTB 4FM0A 1LAWA 4M41A 4FJIA 1RBSA 3O4QA 4FM2A 1CLQA 5FRNA 4CGJA 2OZMA 4FLZA 3K5MA 4M3UA 3DLKA 1CZBA 1T03A 1VSJA 1YTAA 2ZE2A 3PX6A 3LP0A 2OZSA 1KVAA 1Z26A 5HRNA 4DU4A 4CEBA 4DSFA 3PX4A 4CGIA 1U47A 1Y97A 4M45A 3V9XA 2FBYA 3AO3A 4CK3A 5I42A 4FJGA 2O4GA 3PY8A 3B6PA 1W9HA 3UIQA 1U4BA 4RW9A 3TAGA 1UA0A 3T3FA 4FXDA 4EP4A 1RBTA 1RT3A 1S1UA 4HVJA 1JLQA 3L3VA 3VQBA 3LALA 4TSXA 3VQCA 4HUGA 4DLGA 2HMIA 3O3HA 4DFKA 4BWJA 3LAKA 4DTXA 4OLAA 4W5OA 1IKYA 1C0UA 1LWEA 4CK1A 1C1CA 3NH2A 3SQ2A 3P83D 3LPTA 5KRTA 1IO2A 1S1TA 2YKMA 1U04A 4IG3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AF1A 3LDSA 5DM6L 3LWLA 4B9NA 4DS5A 4NCAA 3D2EA 3NGYA 2O8FB 5GINA 1TYQB 2EX3A 3NVMA 1ZBHA 1NOZA 3QEPA 3DRRA 3V9ZA 2BE2A 3HSCA 2HB5A 1NJYA 2ZJRL 4FJXA 5AFUH 3V9UA 3NH0A 4PWDA 4OGEA 3VERA 3ZT3A 3GDQA 3VGLA 2DFFA 4JKGA 4PKGA 4PL7A 4CJ5A 1E4GT 4DWIA 4ZTJA 3C7NA 1YVUA 2A1RA 2P9PB 4FJ5A 2QK9A 4CW7B 1L3VA 1JKHA 4DSEA 3CCVN 4ISGA 3SUOA 4N47A 4RW8A 3ATUA 4BDPA 4J2EA 3VQAA 1XUPO 4WQ5C 4FLXA 2VG7A 2ASMA 1XWLA 1JLCA 3G0ZA 5A2QO 3QERA 5C15A 1GOBA 2VG5A 3ZX3A 3V1OA 4DFMA 2I5JA 2G8KA 3H45C 4Z4FA 3MXIA 3MN9A 2B6AA 2EHGA 5BN8A 3LANA 4X66K 1JLAA 4CF8A 3GG4A 4JKCA 3O3FA 3I8DA 3JYTA 1RT4A 4BQLA 4XEIA 3MN7A 4K0KK 2ZWHA 1NG9A 4KTQA 4E89A 3O9SA 5HRSA 1TL1A 1HNIA 2GV9A 1QHAA 4AHSA 5AQSA 3E9LA 2R7YA 1WSFA 1WSJA 2E1ZA 2HHXA 4RTFD 1BHLA 1HJOA 4OPJA 4IOAL 3F9KA 1WAFA 1NLVA 4CJUA 3HTVA 3I55N 3SK3A 3P5JA 2X74A 1IBMK 3ZSYA 1IKVA 2OPSA 3IG1A 3EN9A 3ASMA 3AGKA 1IH7A 1J54A 2LSNA 4OVLA 2HVHA 3WXIA 1S5JA 1I39A 3AY9A 4KTZA 4FZZA 2I7PA 4CZIA 3K9JA 3SUQA 2OCEA 3CFPA 3SQ4A 4BRKA 2ZJQL 3CJBA 3THWA 5E26A 5K14A 5KPZA 3QESA 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 1XMQ K;  2NLX A;  1GLJ O;  2J4R A;  2UXB K;  1EET A;  4IEE A;  4C8N A;  3OYC A;  3B8A X;  4CZK A;  3ULD A;  3I0R A;  5F1X A;  3F73 A;  3T19 A;  2E8A A;  1QE1 A;  4B1W B;  4W5R A;  4O8U A;  4CEO A;  5C0Y A;  4YFU A;  1ATN A;  4PL8 A;  4BQZ A;  1DEJ A;  4WFB L;  2PAV A;  3QFU A;  4M63 C;  4DV4 K;  2HND A;  1A5X A;  2HBK A;  5GIP A;  5EX5 A;  3TTC A;  2Z1I A;  4Z4C A;  3UKR B;  4PQU A;  1T6C A;  4BRQ A;  3RSE B;  1QHT A;  2ZF5 O;  3QML A;  3L3U A;  1LAW A;  5M1F A;  1RBS A;  3O4Q A;  4FM2 A;  1CLQ A;  2JWK A;  3CCM N;  4IJA A;  2OZM A;  2W41 A;  3LM9 A;  3K5M A;  2WFB A;  1YTA A;  4YHH K;  3BF1 A;  1Z26 A;  5HRN A;  4DSF A;  2JWL A;  4M45 A;  2O4G A;  1HNZ K;  1U4B A;  4RW9 A;  3TAG A;  4FXD A;  2O8E A;  3QBW A;  3H1Q A;  3O3H A;  4ILG B;  2UYT A;  4LF4 K;  3VGK A;  1LWE A;  5JIC A;  1GLE G;  1D4X A;  4B1U B;  4CBU A;  3EE8 A;  1IO2 A;  1S1T A;  3M1F A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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