2FCHA

Crystal structure of thioredoxin mutant g74s
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRSIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S
rcsb
molecule keywords Thioredoxin 1
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 32
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fchA00
3DRNA 2XHFA 2CVBA 1ILOA 1AQXA 3LWAA 2YWOA 5HFGA 1O8XA 2AYTA 3VWVA 5IMDA 2KP1A 5A5KA 1W89A 3A2XA 4ACSA 2EIRA 2R6KA 1OE7A 3FW2A 3CSHA 4GSTA 2C3QA 1S3AA 5D73A 4MF7A 1G0TA 3H4KA 4BL7A 3SWLA 4BA7A 1TU7A 2LJRA 4PX1A 3HJMA 5F06A 3LFLA 1XWGA 1NSWA 3HJPA 2GZPA 1XWKA 3FZ4A 2O89A 1ON4A 3GL3A 1X5EA 2HRFA 2VL9A 5HFIA 5B7CA 3J7Yb 1R4WA 1PX6A 4IQAA 4ECCA 3KM6A 1YJ6A 3CTFA 1XOAA 2R2JA 4OFTA 3VI5A 4JU5A 4KNDA 1GRXA 4WETA 4RQRA 2DJ3A 2G2QA 5IQYA 4TR0A 2CQ9A 4OFNA 1SYXA 1EGOA 2ZNMA 3GX0A 2OBKA 4ML1A 3CRUA 16GSA 1GL8A 5L71A 2DIYA 3ZTLA 2ZUPA 1I5GA 2B6MA 2Z9SA 1TOFA 5G1LA 3IC4A 1SD8A 3EINA 2F51A 2ES7A 2VL2A 1G7EA 2NPBA 4JBBA 3SBCA 4PQ1A 1U88A 5ID2A 1AC1A 1KEBA 4BWSA 3FZAA 2FUG2 1G6YA 1NHYA 3QOUA 5DJLA 1DSBA 4E8HA 2CAQA 2F9SA 2GLRA 4NAXA 4Q5RA 3HZ8A 3CSIA 1MDIA 5J5NA 4MJAA 1SK2A 1B9XC 2GQMA 2GVPA 2GT6A 5E59A 3Q19A 22GSA 1VF1A 5CAXA 1F3AA 3GV1A 2V41A 2NVLA 1TJDA 2L5LA 1PN9A 1URMA 4OCFA 3TJKA 5G5EA 1DE2A 1Q4JA 1SKWB 3ISOA 3Q74A 3KH9A 2WJUA 4EKZA 3FR6A 5JWQB 1TI3A 3EC3A 3FZ9A 5GSTA 3F6DA 5ELGA 1CQHA 4F03A 4V1Ag 1R26A 3ZIJA 2IPAA 4GCIA 4EVMA 2GSTA 3RPNA 11GSA 2IIYA 3HY2A 1PQNA 3L4NA 1YY7A 1UN2A 5LD0A 1Y6EA 5ECLB 3M1GA 3IV4A 2XPDA 3RPPA 1O81A 1DUGA 1M2BA 5IMCA 2HI7A 1CQGA 3V1WA 2DJJA 1X5CA 2H0IA 4KW6A 3IK7A 1YQ1A 3IAM2 4L5OA 3FZ5A 1M0UA 3C73A 4OCEA 1AXDA 1X9MB 3D22A 1XW6A 3KZQA 1HNCA 2MMOA 2BJXA 2YZHA 1EGRA 4N11A 3UVTA 3GIXA 3EU4A 4OWYA 1JLVA 1TW9A 3GNJA 2VCQA 2LNTA 1A0RP 3DIEA 2L59A 1ZYQB 4KCEA 4I5QA 2N5BA 4JRRA 3KEBA 5JWOB 5LCZA 4F82A 3HVXA 5ENUA 1HNAA 1QK8A 1GTUA 2HSHA 1GWCA 4OMVA 4K0GA 1PL2A 4BPYA 4TKYA 1IYIA 2D2ZA 2FHEA 3IHQA 2WB9A 2QC7A 2VCTA 3TRXA 2WULA 2VCXA 2QKEA 3GSTA 5E4WA 3TKSA 2X99A 2YZUA 2H0GA 2K8SA 5ECRB 2PN8A 1AIUA 4FIWA 5GZZB 5DBQA 2VCZA 1XVWA 2LV3A 3HCZA 1GSDA 2YV9A 2QSIA 4MZBA 1OC8A 1SJZA 4LL4B 1SL0B 4QL9A 2FA4A 2GQLA 4JR4A 4TW5A 3PGTA 5A4UA 1M7TA 1AQWA 4RUVA 4I6XA 2VM1A 2I3YA 1MD4A 3MAKA 3G7YA 1G6WA 4MPGA 4LMVA 2LS5A 2IN3A 1PSQA 4DEJA 5JCWA 1EEMA 4KSMA 1GUMA 6GSUA 3LXTA 2DSAA 2FY6A 3QFBC 6GSYA 3P7XA 3EURA 4I2TA 4WBRD 2LQOA 2H0HA 3D4TA 4FYCA 1QXHA 4ML6A 3LG6A 6GSVA 1GSSA 4V2LA 4K9ZA 5CRWA 5D96A 2B3SA 5IPHA 1M2AA 1G7OA 4OO5A 1K3OA 5ECOB 5C00A 1PKZA 2HYXA 5IMFA 4IP1A 2YJHA 1TKDB 1V40A 2YP6A 4KAEA 3F4SA 5AIXA 3KIJA 1OE8A 2CVKA 3FKFA 3F3RA 1OC3A 2FGXA 1W4VA 3PR8A 4PNFA 4OFMA 4GQFA 3D21A 2C1YA 2BTOT 2B7KA 3F4TA 1F3BA 1TTZA 1U87A 1ST9A 1R7HA 2CVDA 2H66A 5DJMA 2O8VB 1YDKA 3RBTA 3Q6OA 3F6FA 3HD5A 2VM2A 3GTUB 1SYRA 2H71A 4KUNA 1WP0A 2FD3A 3QD9A 2OJLA 4L0UA 4FO5A 5AISA 4CDOA 1XXUA 5IPGA 4FYBA 1BJXA 1QUWA 2VL3A 1RQMA 4TXOB 3APSA 2B5XA 1F6MC 2O7KA 4K7OA 4O32A 2YN1A 2AJQB 1BQ7A 4HI7A 1U3IA 4ZL7A 3UMAA 1ERVA 3QDNA 4Q5NA 2HXKA 3F3QA 5GAND 3VLNA 18GSA 2P31A 4EXJA 4MZCA 1Z6NA 1K3YA 4NV5A 3M0FA 4PURA 3DYRA 2H01A 4RI6A 3TCOA 5DAKB 1AQVA 2DJ0A 1E2YA 1QQ2A 1Z7RA 3GKXA 3G7JA 3UOMA 1B4PA 3ZREA 2DJKA 2R4VA 3O76A 3CXGA 4TXOA 3W6GA 1T3BA 2E2MA 3BJ5A 3QAWA 4F9ZA 4V2MA 1EEJA 3A5WA 1WJKA 2FNOA 3U6VA 1WMJA 2LUSA 2IL3A 4HJ2A 3ZFLA 3TKQA 1PX7A 1S3DA 14GSA 2N5AA 1VF2A 3GX8A 1TI1A 2CT6A 1U3AA 4Q5QA 1GSEA 2IMDA 3UIWA 4KE3A 2AAWA 1JZWA 1EOGA 3EYTA 1ZCPA 2B1LA 1SK0A 1Z9HA 2DMMA 2FCHA 4EDZA 4LL1B 5ECHB 4K2DA 4WR5A 1FB6A 5HR2A 2C4JA 2MYGA 2LTKA 4POLA 1F37A 2AHEA 5IOWA 4X43A 3EVIA 4YAPA 1SK1A 2VIMA 3LQ7A 4J57E 4D73A 1TRWA 4AGSA 2JZTA 5COHA 3TRQA 2TRXA 5IMZA 3HZ4A 2IWTA 5A4VA 2IMIA 4MLYA 3TJGA 2KHPA 2R3XA 3KD0A 2WRTA 3ZVJA 1OC9A 5KN3A 4XS1A 3HA9A 3DEXA 3E3EA 4LA1A 2MBTA 4NMUA 4TR1A 3BCKA 2TRCP 5G2ZA 1GP1A 4GLTA 1XCCA 2H75A 4AJ8A 1XW5A 2C0DA 4EE0A 4MZWA 3RDWA 2H6YA 2PPTA 2OA7A 3F0IA 1YKCA 2JSZA 2G0FA 3DVXA 4K0NA 5ID2B 3WGXA 3TOUA 3P2AA 5D9VA 5J4UA 2IFQB 4TN8A 3C8EA 4J2FA 4MPFA 1H75A 1GUKA 3RAZA 3ZRDA 3DMLA 5JWRB 1U6TA 2PERA 4PQIA 1OVNA 2H1AA 5J41A 4NHZA 1THOA 3EMXA 3GH6A 1XW9A 1AAZA 4BVXA 1FB0A 3IXRA 1JZRA 3FK8A 2GSSA 5CRDA 2JADA 1M2DA 4K7IA 1T8EB 1YZXA 2N5FA 1SENA 2GGTA 3WYWA 2H30A 3LEFA 1K0BA 3KP8A 2IFQA 3F4RA 4IKHA 2PUKC 5JCUA 5F05A 1T00A 4MMMA 1R5AA 1FOVA 3WT2A 1AUCA 1GNWA 3CBUA 1TU8A 4TVEA 1Q98A 1X9WB 4H86A 2LRNA 5D9WA 1EV4A 5GAPD 4EO3A 2O87A 4N0ZA 2B5YA 3G7IA 4XS4A 4HEA2 2YWNA 3DGQA 5CRHA 2GDRA 2K18A 3BOAA 2AV4A 4QL7A 2H19A 1B4QA 2GQKA 3I6AA 1GSUA 1OAZA 5G5FA 1K3LA 1V98A 5DCHA 5ECPB 2E0QA 2YCDA 4I8BA 2XC2A 5CREA 3QFAC 1X0RA 4IN0A 4K7NA 5DDLA 2RM5A 4HJMA 4F0BA 3IDVA 5IIZA 1FHEA 1V9WA 1O6JA 2WGRA 3VPQA 3GKMA 1IYHA 1A8YA 2LSTA 1Z5YE 4V1Ap 5GSSA 5KN2A 2H73A 3A3TA 4ZB9A 2C8UA 1KTEA 1WIKA 3EWLA 1O7UA 3DVWA 2GSQA 2P5RA 1GSQA 2JZSA 1GULA 3I9V2 4NWYA 2HE3A 2VCWA 1GTIA 1OYJA 3MNGA 4YQUA 5H5SA 3LXZA 1K0CA 3GL5A 3C1RA 3PINA 1XIYA 3EU3A 3TUEA 2OE3A 5H5QA 4K6XA 6GSSA 13GSA 3O3TA 3UBLA 4JZQA 3GHAA 3VWUA 4WF4A 1WWJA 3U5RE 1UC7A 4GQCA 1SJ6A 4BWQA 4ECJA 3KH7A 3H93A 3IBHA 1SJIA 3HJOA 3NZNA 1A8LA 1PGTA 2L4QA 3L9SA 3D6IA 4L5LA 3IE3A 1WRYA 2YWMA 6GSTA 2V6OA 4G9HA 5HQPA 1BAYA 4PXOA 2R5GA 3QPMA 5IO0A 4X1UA 2DIZA 4DVCA 2KLXA 3F8UA 4IHUA 4MF6A 4WR4A 3QCPA 4KB3A 4P3YB 3RHBA 4N0VA 1HD2A 1QFNA 2CA8A 2WFCA 5AN1A 4TXVA 2LRCA 4KSOA 3F63A 2L5OA 4IELA 1USBA 5IMVA 2K8VA 2MMZA 3UL3A 3ERGA 3L9UA 4KA0A 2XBIA 2H76A 1EZKA 1J9BA 2B5EA 2JSYA 5DQYA 4DSQA 2HNLA 2VO4A 1OKTA 3N9JA 3QR6A 5D9XA 5D93A 3ZZXA 4IS0A 1ZL9A 3ED3A 3H79A 1BYEA 3VFIA 3KXOA 2VD1A 3KTLA 5LNKe 1E6BA 1XVQA 2B1KA 5ECQB 4G10A 4PUAA 2FLSA 2ALBA 2E7PA 3H8QA 2KOKA 3C71A 2LRTA 2QGVA 2PVQA 2L57A 3GH9A 2R37A 1BEDA 3LJRA 3APQA 3ERFA 2VL2C 3LSZA 3DXBA 4MCUA 2IMEA 2FWGA 4NPBA 3FHKA 3UARA 4KDUA 1HNBA 2DBCA 1C72A 4KDYA 3ZMKA 1ZMAA 4JEDA 4XCSA 2C3TA 3GSSA 2IJYA 2PMTA 4XIHA 1NM3A 2ZCTA 3FR3A 4MABA 5CYYA 2A4VA 4EC0A 4GRFA 5DALA 2AUVA 2LJAA 5HR1A 1JZDA 1KBNA 4WKWA 1T1VA 1LBKA 4XS6A 7GSSA 2EIQA 3TGZA 1PMTA 3M8NA 4FYUA 3KTBA 4MH3A 2VUPA 3APOA 1T4YA 5H5RA 1TRSA 4EL1A 3VPTA 3CTGA 3I69A 1K0AA 3KCMA 2MMAA 3K8NA 1MTCA 3M3MA 3NIVA 2HT9A 4EDYA 1GUHA 2P0GA 8GSSA 3TKSE 3ERWA 2LJKA 1ACVA 1BG5A 1SL2B 3TB2A 1J0FA 4ZIJA 1XWBA 3LYPA 3P90A 5F8BA 4NV2A 5DQSA 4PQHA 3TJJA 5FHIA 3IRAA 4CHSA 3BBYA 3C7MA 3IA1A 1R5PA 4XHMA 1K0NA 1RW1A 1XWCA 4ZBBA 2BMXA 4Q5FA 2YOIA 1A23A 1H4OA 1BX9A 3FR9A 3TOTA 3G9BA 5EY6A 1TK0B 3HHVA 3LGCA 4PGTA 2F8AA 3IPZA 5FWGA 1FVJA 2EC4A 1FG4A 2PU9C 1O73A 1ZZYA 4O7HA 5D8IA 4ZILA 3GUSA 4X0XA 4HS1A 2ON5A 3WD6A 4D73B 2IMKA 1O8WA 2EIOA 3IR4A 3KP9A 5CP1A 3ZVJD 5AGYA 4KX4A 3CRTA 3ME7A 1SL1B 1RK4A 2VLUA 4YH2A 4IP6A 4ZL8A 1WE0A 2C0EA 1OC9B 2AB6A 4OO4A 2LNSA 2B7JA 3CMIA 2H74A 3NOFA 4ID0A 4G19A 2DMLA 5ELAA 2X64A 4GSSA 4LLRA 4TR1B 3N5OA 2DC5A 5G30A 3O6TA 1V57A 1A0FA 5AIVA 5EVOA 3GKKA 2VD0A 2J23A 2X8HA 3P8WA 2DJ2A 3HVVA 1EP8A 5IO2A 1FW1A 4MJCA 1TRVA 2H6XA 1M99A 1ERWA 1NW2A 2DLXA 3A2WA 1I9DA 5B6NA 10GSA 4HUAA 4ZL9A 1EWXA 2V32A 4I97A 2HZFA 2HZEB 12GSA 4WBJA 1XZOA 3KGKA 2VOCA 3UVHA 4DSRA 4N30A 1S3CA 4POBA 3ZITA 3Q18A 1TXXA 2YPMA 2HFDA 2C0FA 3HXSA 3FRCA 4G2EA 2JZRA 4ECBA 1A2LA 3QAGA 1FAAA 4AJ6A 2ON7A 1JLWA 1OKDA 3ZMLA 1Z7PA 3GRXA 4F2IA 4JE1A 4KDXA 2V2GA 2H1BA 5KN0A 3VI7A 3FYGA 1XFLA 1V2AA 1B48A 2IMFA 4NXIA 3HDCA 1THXA 4K8MA 5CO3A 1GLPA 3E0UA 4TRXA 2HSYA 3CSJA 4HQSA 3BCIA 2HZEA 1M9AA 5F07A 9GSSA 2YNXA 4IJ3A 2RLIA 1LJRA 4XS4B 1Z3EA 2H72A 1LU4A 1WPIA 5ABRA 1T7PB 1GSYA 3US3A 3S9FA 1YEXA 4OD7A 5KN1A 3KMNA 1PRXA 5ECMB 1SKRB 3LYKA 4TOPA 2YWIA 3FEUA 2MZCA 5ECIB 1TK8B 2VCVA 4MDCA 3TDGA 2OKAA 2NBSA 2YANA 3GKNA 3W8JA 3EMPA 3M9JA 1N8JA 4RQXA 2FWFA 2LKUA 4YQMA 2OE1A 3GA4A 2CZ3A 1MDJA 3GFKA 4JR6A 4EF0A 4HU7A 5FT3A 3FY7A 1SKSB 3ZL5A 4HZ4A 2GSRA 2LQQA 4DSSB 1MDKA 2VLTA 3WT1A 1ML6A 1ERTA 4KGIA 2CX4A 3M9KA 5B8AA 5C04A 1YEPA 4MJBA 4PUFC 4LMWA 5D9TA 1A2JA 5CRGA 4XRAA 2M80A 1ZYEA 2M46A 2FWEA 4F0CA 3AY8A 2P5QA 1SU9A 2PBJA 4POKA 5J9BA 4ECIA 2L6DA 2F3MA 3TRPA 5HFKA 3IOSA 3D4MA 2NTOA 2MBSA 2A2RA 4O5RA 3HYPA 3H1NA 3I43A 1AW9A 2XPEA 1TP9A 5IOXA 1YF1A 1A2MA 4DSSA 1GLQA 2H1DA 1JHBA 2I1UA 5EL8A 1ZOFA 3TJFA 3ZYWA 2A2SA 2WCIA 5JCGA 3KMOA 5HR3A 3C1SA 5HR0A 4ZBDA 5EPFA 5B8BA 2I9HA 4ZXGA 2DJ1A 1TDIA 1EOHA 4CW9A 3GN3A 4MH2A 1M9BA 5F0GA 2FA8A 1JFUA 2YV7A 4GTUA 1ERUA 2LEGA 2C0GA 4QQ7A 3HVSA 1ABAA 2F8FA 2TIRA 4WXTA 5G1KA 1HQOA 2GS3A 1UA5A 1Z6MA 2JL4A 4XTSA 2O85A 2RIIA 20GSA 2HRNA 3GYKA 1HYUA 1XBSA 4EUYA 1Y25A 1V58A 1DE1A 4KCAA 3W8SA 1PL1A 1A24A 1T4ZA 2PGTA 1F2EA 2VLVA 2KP2A 1NHOA 4RI7A 3ZIVA 3UBKA 1X5DA 4O92A 1K0OA 4WF5A 3TJBA 1JZOA 4L8EA 4ZBAA 1XPVA 2VAFA 2J9HA 3LORA 3GMFA 4I2UA 1QMVA 2WDUA 1PA3A 3VK9A 1O85A 3L0HA 1MEKA 2C3NA 3TKRA 3R2QA 1PKWA 4TR4A 1B8XA 2JU5A 3MSZA 3GURA 3DWVA 2E2GA 2X8CA 5DALB 2I81A 2NDOA 2GT5A 4POMA 1TK5B 2GZZA 3A2VA 5DVBA 2M72A 2RM6A 3L9VA 2REMA 1GH2A 3J7Yk 2L4CA 4GF0A 2HLSA 1KNGA 5G31A 3VWXA 3PH9A 5DCGA 3D0ZA 4TR3A 1QGVA 4J56E 4YQVA 1TRUA 2WS2A 3VWWA 4IBPA 1ZGNA 4ZB8A 4HOJA 2GZYA 2I4AA 1VGLA 4Z7XA 1VRSD 4N10A 3ME8A 5ECKB 4MJEA 3MWHA 2WZ9A 1WOUA 4E8EA 4AJ7A 2K9FA 3TKPA 2MMNA 2H8LA 2L6CA 1VF4A 1GSFA 4IVFA 3KJYA 1EP7A 4XRDA 5ECSA 4NHWA 1K0DA 4IQ1A 4MK3A 4PNGA 6GSWA 2PWJA 2PVOC 2H6ZA 3UJ1A 3UEMA 3D5JA 3DKSA 4MP4A 2CZ2A 1XOBA 3OR5A 19GSA 3EE2A 2H70A 2CX3A 5KEJA 2KUCA 4HQZA 4KH7A 5J3RA 2RUEA 2X8GA 2K6VA 3QAVA 3F9UA 1F9MA 3VURA 2RUFA 2OBIA 2YJ7A 4GXZA 4YAVA 4IW9A 3L78A 3IK9A 4GSNA 3ZFBA 4WEYA 2OADA 5CNWA 4MA9A 3MDKA 4HDEA 5A4WA 1YF0A 4HZ2A 2V1MA 1GTAA 2GTUA 3WGDA 2C80A 1FVKA 1PD21 4HU9A 3WGEA 1FO5A 3RHCA 1XWAA 4V2NA 4ISDA 3HKRA 4BVYA 3GTUA 1GTBA 2FWHA 2OE0A 4IGJA 4L0WA 1B9YC 2V6KA 1GNEA 4ZB6A 1X9SB 5B6MA 3JCML 3QMXA 4ILFA 3IAS2 3ZLPA 4IJIA 1UVZA 3E9JB 5ECNB 5IM9A 2JACA 2CV4A 2H1GA 3TKSC 4ULXA 1DBYA 1MD3A 6GSXA 2OACA 2CAIA 1J08A 4GWRA 1YKAA 3BD2A 1EV9A 3CYNA 5IMAA 3DD3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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