The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
MRQCKVLFEYIPQNEDELELKVGDIIDINEEVEEGWWSGTLNNKLGLFPSNFVKELELEH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the second SH3 domain of human CMS and a newly identified binding site at the C-terminus of c-Cbl
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
CD2-associated protein
|
| total genus |
6
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-12-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4J9E A; 1B07 A; 1M30 A; 4HXJ A; 2LQN A; 4CC7 A; 3H0F A; 1H92 A; 5EC7 A; 1JXM A; 1GBQ A; 1VYT A; 2KXD A; 4Y92 A; 1EFN A; 3VS5 A; 4AG1 C; 1AZE A; 2FG0 A; 1BB9 A; 2D8H A; 1W70 A; 3IQL A; 1PRL C; 2HEQ A; 5GJV B; 1UE9 A; 2NWM A; 3ZL7 C; 4AG2 C; 1JEG A; 1JU5 C; 1X69 A; 1WXT A; 2RQW A; 4ZNX A; 1KFZ A; 1VYV A; 4AFU C; 2O88 A; 2X3W D; 2MCN A; 1UTI A; 1T0J A; 2AZV A; 2VWF A; 4J9G A; 3M0P A; 2L0A A; 1U3O A; 1V1C A; 3I5S A; 1YCS B; 3ULR B; 2W10 A; 1UFF A; 3RBB B; 2DLP A; 2FPD A; 2FO0 A; 2CSQ A; 2K9G A; 1E7O A; 1UUE A; 2F2V A; 2DYB A; 2H8H A; 1QCF A; 4Z8A A; 1UHF A; 1H3H A; 4AFQ C; 1HD3 A; 2HBW A; 4HCK A; 2DJQ A; 1ZUK A; 1AWW A; 1M3C A; 1K4U S; 2DL3 A; 5I11 A; 2K3B A; 2KT1 A; 1MV3 A; 1WX6 A; 3I35 A; 1GL5 A; 1UGV A; 2CH4 W; 2GQI A; 2DF6 A; 2EQI A; 4ORZ A; 2JXB A; 2OAW A; 2GGR A; 4E6R A; 1UJY A; 2JS0 A; 3EG0 A; 2RF0 A; 2DL4 A; 1U5S A; 2KRN A; 5I22 A; 2J7I A; 3EG1 A; 5IXB A; 2C0T A; 5L23 A; 2KRS A; 2AKK A; 3GBQ A; 3VS3 A; 1NLP C; 1K0X A; 2KT8 A; 2O9S A; 3EHQ A; 4J9F A; 5IH2 A; 3EHR A; 2RQR A; 2PTK A; 1I1J A; 1ARK A; 2L3P A; 3RNJ A; 1KIK A; 2GTO A; 2J6K A; 2DNU A; 3M0Q A; 3QWX X; 1NYG A; 1NLO C; 3LH5 A; 1A0N B; 1E6G A; 3EG3 A; 1H8K A; 2HDA A; 2CT3 A; 4FSS A; 2ESW A; 3REB B; 2M0Y A; 3M0S A; 4RTT A; 2LJ3 A; 4JPB W; 2AKL A; 2EW3 A; 2BZ8 A; 3UA7 A; 5IHI A; 2ED1 A; 4RTU A; 1G2B A; 2J06 A; 3H0H A; 1SSH A; 1NEB A; 1WLP B; 3I5R A; 2O31 A; 4ESR A; 2KRO A; 1FMK A; 1ZBJ A; 2F2W A; 2EGA A; 4Z89 A; 4WCI A; 3NPF A; 3NHN A; 2M51 A; 1SPK A; 4R0K A; 4J9I A; 3VRZ A; 2A28 A; 4A63 B; 4RTY A; 1M27 C; 1AOJ A; 2O9V A; 1PRM C; 3CQT A; 2YT6 A; 2ECZ A; 4M4Z A; 4LNP A; 2AK5 A; 3PE0 A; 1X2K A; 2EYX A; 1J3T A; 1E6H A; 1Y57 A; 2EYZ A; 2GBQ A; 1AZG B; 2L3S A; 3REA B; 2EYY A; 2SEM A; 4OMP A; 2J6F A; 2D0N A; 2DMO A; 2O2O A; 2LNH B; 1GFC A; 2BZX A; 1KSW A; 1PWT A; 2JMA A; 1PNJ A; 2ENM A; 2A08 A; 3I9Q A; 1YWO A; 1GBR A; 3TSW A; 3EG2 A; 4QT7 A; 1QLY A; 2A36 A; 1AEY A; 2KEA A; 2KYM A; 2RQU A; 2RQV A; 1AD5 A; 5FWB A; 4J9C A; 1X2Q A; 3VRY A; 2KRM A; 2DE0 X; 2CUD A; 2DBM A; 2JS2 A; 2K79 A; 2CDT A; 1WIE A; 1PKS A; 2RMO A; 1FYN A; 2BTT A; 2ROT A; 1AWO A; 2ROL A; 2LCS A; 2CUB A; 1WFW A; 2LJ1 A; 2DL7 A; 1ZSG A; 1WYX A; 2MIO A; 1BBZ A; 2JMC A; 4RTV A; 1TUC A; 3NGP A; 1AWX A; 2D8J A; 1ZUU A; 2CSI A; 2I0N A; 1YWP A; 4JJC A; 3VS4 A; 2YUO A; 2E5K A; 4LE9 A; 1X6B A; 4LN2 A; 2KGT A; 5ECA A; 4X1V A; 2DVJ A; 2K2M A; 2KXC A; 4F17 A; 1BK2 A; 4AFS C; 1TUD A; 2DIL A; 1I0C A; 3SHW A; 1K76 A; 2FPF A; 4RTW A; 1WXB A; 4IIO A; 1NG2 A; 1SEM A; 1UHC A; 1QWF A; 1OOT A; 4HVV A; 2W0Z A; 3M0T A; 2YUQ A; 4J9H A; 2HSP A; 3TVT A; 1K9A A; 2DRM A; 1CKA A; 1QKW A; 1GRI A; 1WA7 A; 4LUD A; 2AZS A; 2OJ2 A; 3TSZ A; 3M0R A; 4D8K A; 4OMQ A; 1BU1 A; 2F2X A; 4K11 A; 1M3A A; 1HSQ A; 2EBP A; 4AFZ C; 2MOX A; 3VS2 A; 2YUP A; 2A37 A; 1OPL A; 2HCK A; 1ABQ A; 5GJW B; 2J6O A; 2JTE A; 3UF4 A; 2FRW A; 1NEG A; 5IHK A; 1M3B A; 1UG1 A; 1XOV A; 5HCK A; 4JZ4 A; 1OEB A; 2QDL A; 4Z88 A; 4RUG A; 1RUW A; 2JT4 A; 4RTX A; 3NMZ C; 1GCP A; 2V1Q A; 2CRE A; 2C0O A; 2EGC A; 2OI3 A; 2C0I A; 2RQT A; 2KYB A; 2LX7 A; 2PNI A; 2GNC A; 1ZUY A; 5FWC A; 2EVR A; 3R6N A; 1QKX A; 4IIM A; 1MUZ A; 2IIM A; 2V1R A; 1ZLM A; 2KNB B; 1K1Z A; 4J9D A; 4JZ3 A; 1AVZ C; 2YSQ A; 1OV3 A; 1SHG A; 1GCQ A; 4OMN A; 1U06 A; 1RLQ C; 2EGE A; 1SRL A; 3SEM A; 1RI9 A; 4J9B A; 2GTJ A; 1IO6 A; 1QWE A; 1LCK A; 2RN8 A; 4EIK A; 3O5Z A; 1WI7 A; 1I07 A; 3VS0 A; 1UJ0 A; 3H0I A; 1JO8 A; 1SRM A; 2DA9 A; 2PZ1 A; 2FRY A; 4JJD A; 1SHF A; 2JM8 A; 2J05 A; 2EYW A; 3M0U A; 2NUZ A; 2LP5 A; 2G6F X; 2YDL A; 2VKN A; 4CC4 B; 2EPD A; 2ED0 A; 2JW4 A; 1MV0 B; 2DX1 A; 2LJ0 A; 4CC2 A; 1T3L A; 1KJW A; 4OMO A; 4CC3 A; 1JXO A; 2CH4 A; 1W6X A; 1NM7 A; 2L3Q A; 1GCQ C; 2DL5 A; 2DBK A; 1AWJ A; 2DL8 A; 4OMM A; 3UA6 A; 2KE9 A; 2YUN A; 1Y0M A; 3QWY A; 1HJD A; 3H41 A; 2D1X A; 4LUE A; 4DEY A; 1GFD A; 1W1F A; 2P4R A; 3FJ5 A; 1ZX6 A; 2ABL A; 3EGU A; 2K6D A; 4JJB A; 3UAT A; 4GBQ A; 1N5Z A; 4GLM A; 3VS6 A; 2FPE A; 3THK A; 4HVW A; 1UDL A; 5IXF A; 2L2P A; 2RNA A; 1RLP C; 2KR3 A; 1S1N A; 1X27 A; 2CT4 A; 1T3S A; 3PVQ A; 2BZY A; 2KBT A; 1UEC A; 1Z9Z A; 2EKH A; 4HVU A; 2X3X D; 3VS1 A; 2FEI A; 1ABO A; 1B3Q A; 3VS7 A; 4F14 A; 1YNZ A; 2RPN A; 1T0H A; 1WXU A; 4DEX A; 2LQW A; 3A98 A; 5FW9 A; 3U23 A; 4D8D A; 3C0C A; 5IHN A; 1CKB A; 3PVL A; 4OML A; 1CSK A; 1X43 A; 1YN8 A; 2LMJ A; 2VVK A; 3JV3 A; 1PHT A; 1WDX A; 2K7A A; 1PKT A; 1YP5 A; 1Z9Q A; 4RTZ A; 2JM9 A; 1G83 A; 1VYU A; 4F16 A; 2B86 A; 2DRK A; 1OPK A; 1K0S A; 1TG0 A; 1JQQ A; 2XMF A; 1M8M A; 4KRT A; 2SRC A; 1VA7 A; 1X6G A; 3KFV A; 1NYF A; 2LZ6 B; 2DM1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RKW A; 4OMF B; 4J9E A; 1YFN A; 1M30 A; 4N0A C; 3QZ9 B; 4BUG A; 4FYW B; 4F7U F; 3CPW A; 2D9T A; 1BB9 A; 2FG0 A; 3GIB A; 3MHX A; 4PLI A; 2HEQ A; 4X9C A; 2FZK B; 2NWM A; 3PMT A; 3L2R A; 4BI3 A; 2RQW A; 4ZNX A; 1KFZ A; 2LC4 A; 3G71 A; 5CR2 A; 1WNL A; 3I5S A; 2BE9 B; 2BUD A; 5GMK l; 3ULR B; 3CCE T; 2W10 A; 3M54 A; 4PJO D; 2F2V A; 2DYB A; 1PSE A; 1Y7X A; 2H8H A; 1H64 1; 2DFU A; 4PJO F; 4MZM A; 1UHF A; 2XDD A; 1KD1 U; 2OAU A; 1OYX A; 4M7D E; 1G3T A; 3X28 B; 1HD3 A; 2HBW A; 2DJQ A; 3MEW A; 5AYF A; 3A8L B; 1PCX A; 2X4W A; 1AWW A; 5GAN e; 5GAN 8; 4XTZ A; 3HFN A; 2KT1 A; 1WX6 A; 3I35 A; 2Y4Y A; 5I2S A; 2JZ2 A; 5M9O A; 2GGR A; 4E6R A; 1UJY A; 3FB9 A; 2F5K A; 4BY6 B; 5GAN d; 1EX4 A; 2VXF A; 2DVE A; 2J7I A; 3EG1 A; 4XQ3 A; 2O4X B; 3LW5 E; 3G1J A; 5L23 A; 4C8Q A; 2KRS A; 2AKK A; 3VS3 A; 4FT2 A; 2L5Q A; 1M1K U; 2CP7 A; 2HKN A; 4NOY A; 1HYO A; 4R56 A; 4J6X A; 3LYI A; 1ZSZ C; 2CGH A; 3EHR A; 2RQR A; 3WVD B; 4E7J A; 3V7C A; 5GAN 2; 1D3B A; 1YIJ Q; 3M0Q A; 3WVE B; 5KCH A; 1H8K A; 3OYI A; 1XJW B; 3RUX A; 2X35 A; 3M0S A; 4RTT A; 3ZBD A; 4IUT A; 2AKL A; 1Q7Y R; 7AT1 B; 3OYN A; 4C5G A; 5I21 A; 1VQ5 A; 3CBP A; 4ZN1 A; 3PIO A; 3OS1 A; 1VQN A; 2X9H A; 1SSH A; 3RER A; 1K73 C; 4LDY A; 2O31 A; 2EJG A; 2JVV A; 1ZBJ A; 1YJW Q; 1O75 A; 4Z89 A; 3OYA A; 1M90 U; 5CIU A; 4R0K A; 3JCM X; 1D0Y A; 5GAO r; 2A0F B; 2QQ9 A; 1SSF A; 2KVQ G; 2O9V A; 2CP0 A; 2E3H A; 1YJN Q; 4RKU E; 1RAD B; 3A1P A; 2LDM A; 1E6H A; 1EIF A; 2HMA A; 2DER A; 3PFS A; 3REA B; 1FXX A; 2SEM A; 1WHG A; 3TCJ A; 1LVK A; 2O2O A; 2RJC A; 3MPU B; 2LNH B; 1KC8 C; 2MAM A; 1PWT A; 4XTU A; 2HQH A; 2A08 A; 4IUP A; 1GBR A; 3C95 A; 3VJP A; 2OTJ Q; 3OYK A; 4C92 G; 2KYM A; 2M0O A; 1VIE A; 3I55 T; 2KMT A; 3OW2 A; 5LJ5 g; 2HSE B; 2KRM A; 4EDU A; 2E6Z A; 1HXD A; 1MGQ A; 2DE0 X; 1OQK A; 4PK4 A; 2CUD A; 4C8Q E; 1VQO Q; 1K8A R; 2DBM A; 4FW2 A; 2P0K A; 4BE0 A; 3EGD B; 4PJO A; 1WIE A; 2BTT A; 3CCL Q; 2PVG B; 5KH6 A; 2CUB A; 3RKX A; 5GAN 5; 5GMK j; 1QQJ A; 4FYV B; 2O4X A; 4RTV A; 5GMK h; 3LWI A; 1N9S A; 2MWP A; 2D8J A; 2CSI A; 4FL6 A; 3VS4 A; 3E9G A; 1X6B A; 5CK9 A; 4E7H A; 4X1V A; 5LJ5 f; 4E7I A; 2DET A; 2KXC A; 3OSV A; 1BK2 A; 4AFS C; 3CCJ T; 1TUD A; 1I0C A; 3OBW A; 5FRM A; 2EQK A; 4RG8 A; 5HY6 A; 1SF9 A; 2MK5 A; 1UHC A; 1OOT A; 3CCE Q; 2I2L A; 1YIJ A; 2YUQ A; 2HSP A; 2MWO A; 2QGF B; 3ASK A; 2DRM A; 3L1A A; 3TQ7 P; 4LUD A; 2LX9 A; 3TSZ A; 3OA6 A; 3E19 A; 2QGG A; 1BU1 A; 1LPL A; 1M3A A; 2PUK B; 3E2U A; 1KHC A; 2EBP A; 4QVC A; 2OTL A; 5GAO l; 3NTK A; 1SG5 A; 2ZAE A; 3A8H B; 3MP8 A; 5GAN 3; 1OPL A; 1ABQ A; 5GJW B; 5IHK A; 3UF4 A; 4QVD A; 1NEG A; 4M7D C; 1M3B A; 5HCK A; 1OEB A; 2E12 A; 3QZ5 B; 3CCQ T; 5KCO A; 2RI3 A; 2QQS A; 3D7S B; 4B9W A; 9ATC B; 1GCP A; 4XU2 A; 3M58 A; 1IZ6 A; 2C0O A; 1YJW A; 3QUI A; 2EGC A; 5D6X A; 1O9S A; 3M55 A; 2PNI A; 4F7U E; 4CI0 C; 4TVR A; 4IIM A; 1S72 T; 1C0M A; 1MUZ A; 5I2M A; 2E10 A; 2COY A; 2KDS A; 2F5T X; 3DLL A; 2KNB B; 1M5Q 1; 4C0Z A; 2DD5 A; 2RB6 A; 1OV3 A; 1YJN A; 4WTO B; 3M9Q A; 2ZPG B; 3CXC P; 1QVF S; 1RLQ C; 4A4E A; 1SRL A; 4M77 D; 3SEM A; 1ZHI A; 4KH1 B; 3EG9 B; 4J9B A; 4M77 F; 1ZQ1 A; 3ZEH A; 1TSF A; 2EQU A; 2NUT B; 1WI7 A; 2E4H A; 2L8D A; 1UJ0 A; 1N8R U; 4PJO E; 2A7Y A; 2OTJ A; 3M0U A; 1WHJ A; 2NUP A; 2NUZ A; 3HPW A; 4M7A D; 1U1S A; 1OU9 A; 2EPD A; 4EMK B; 1ZBX A; 4M7A F; 2JUF A; 2LJ0 A; 2PQW A; 3QJY A; 1T3L A; 3SD4 A; 3EGD A; 4J7I A; 1W6X A; 1VQO A; 5IN1 A; 1Q81 R; 3MEA A; 2QQA A; 3CCL A; 3UA6 A; 3JB9 H; 2YUN A; 2WSC E; 3H41 A; 4DOV A; 4M7D B; 1JJ2 P; 1VQ7 Q; 3QKJ A; 1Q86 R; 2DZ9 A; 2HKQ B; 2CKK A; 4JJB A; 3UAT A; 4M78 D; 3QJ6 A; 4GLM A; 4M78 F; 3THK A; 1UDL A; 2L2P A; 2RNA A; 2PU9 B; 3FJP A; 4DBQ A; 2BZY A; 2KBT A; 4HVU A; 2XU8 A; 2KSS A; 1Y96 A; 3J7A F; 3VS7 A; 4F14 A; 2ATC B; 1X75 C; 3OYD A; 1YBY A; 5FW9 A; 3CCE A; 2IVW A; 3C0C A; 3ER0 A; 4A4G A; 1QVP A; 4VUB A; 4QW2 A; 4HA8 A; 3FEO A; 2QK0 A; 1X43 A; 2HNI A; 3GOX A; 3JV3 A; 1IRE B; 3I55 Q; 4E2F B; 1YP5 A; 1WPY A; 4F16 A; 3C94 A; 3RR6 A; 2QI2 A; 1TG0 A; 3MJX A; 2WAC A; 3KFV A; 4R55 A; 5KE3 A; 5DLO A; 1G3Y A; 5GAM e; 4M75 D; 1B07 A; 2BKD N; 4HXJ A; 2LQN A; 4M75 F; 5A0L A; 3TEE A; 4CC7 A; 1YJ9 T; 1H92 A; 1VYT A; 2KXD A; 1AZE A; 5GAM d; 2XDB A; 2K5I A; 3CCS T; 5A0D A; 2M02 A; 3PTA A; 1UE9 A; 1MMA A; 1JU5 C; 2MPX C; 4X9D A; 4XTX A; 2NUT A; 2O01 E; 2X3W D; 3CCJ Q; 3JB9 G; 2MCN A; 1T0J A; 3JCM P; 2LT4 A; 4J9G A; 1UGQ B; 3QXE B; 1U3O A; 1V1C A; 1YCS B; 2EQM A; 2L3R A; 2FPD A; 4FW1 A; 1UUE A; 2EJF A; 4C0D C; 4OB1 B; 5LJ5 h; 3E1S A; 5FU7 C; 4M77 A; 4MML A; 4EMK A; 3UT1 A; 1H3H A; 3ME9 A; 3QBY A; 4RCC A; 4AFQ C; 2RJF A; 2Y4X A; 4KT0 E; 3HFO A; 3MCA B; 5FU6 C; 1UGP B; 2LCL A; 1QVG A; 1KC8 R; 1D0Z A; 4XU3 A; 2K3B A; 4MDX A; 4J6W A; 2R58 A; 1W2B P; 1RAC B; 1GL5 A; 2CH4 W; 2GQI A; 2DF6 A; 1NZ9 A; 2EQI A; 5GAN f; 3CCQ Q; 4MDW A; 3EG0 A; 4DBR A; 1S72 Q; 1NE8 A; 1U5S A; 4N4I A; 1VQ7 A; 4HT9 A; 2P84 A; 4CRI A; 1VQ6 A; 2VGM A; 2P4T A; 1NPR A; 4C8Q B; 2EYQ A; 5J3B A; 4LDX A; 3G4S T; 3OYM A; 4C92 D; 4A4F A; 2ZPF B; 4HCB A; 2QEX T; 2KT8 A; 2O9S A; 3X24 B; 3V8L A; 2IG0 A; 2ZPH B; 3VYG A; 2X4X A; 5IAY A; 3NFC A; 5IH2 A; 2VC8 A; 3CXC S; 4Y28 E; 2E5Q A; 3DLM A; 1D3B B; 2VB6 A; 4M78 A; 2DNU A; 3JCM c; 3CCV T; 5A0G A; 2K5L A; 1A0N B; 1E6G A; 2HDA A; 2ESW A; 2RJD A; 3SWN B; 4PJO C; 4E7S A; 2LJ3 A; 4BY6 C; 2XHC A; 2V8I A; 1KD1 C; 3I55 A; 1KG1 A; 4C0D B; 5IHI A; 8ATC B; 1WQW A; 5FU7 B; 2J06 A; 1WLP B; 4EMH A; 4ESR A; 2F2W A; 2RHY A; 5FU6 B; 4WCI A; 2KAF A; 2DEQ A; 3NPF A; 4PJJ A; 3NHN A; 4OF1 A; 2XID A; 2A28 A; 1KQ2 A; 4NL2 A; 1VQL T; 3EFO B; 1JJ2 S; 2YT6 A; 3I56 T; 4LNP A; 4Q5W A; 4M7D G; 3PE0 A; 1X2K A; 4M77 E; 4BE1 A; 2EYX A; 3VYH B; 5KYU B; 2HD0 A; 2DTI A; 2GBQ A; 1AZG B; 3M56 A; 2EYY A; 2J6F A; 4F7U B; 1BI3 A; 3CCJ A; 1BYM A; 5D6Y A; 3CC4 T; 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