2FNCA

Thermotoga maritima maltotriose binding protein bound with maltotriose.
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
KLTIWCSEKQVDILQKLGEEFKAKYGIPVEVQYVDFGSIKSKFLTAAPQGQGADIIVGAHDWVGELAVNGLIEPIPNFSDLKNFYDTALKAFSYGGKLYGVPYAMEAVALIYNKDYVDSVPKTMDELIEKAKQIDEEYGGEVRGFIYDVANFYFSAPFILGYGGYVFKETPQGLDVTDIGLANEGAVKGAKLIKRMIDEGVLTPGDNYGTMDSMFKEGLAAMIINGLWAIKSYKDAGINYGVAPIPELEPGVPAKPFVGVQGFMINAKSPNKVIAMEFLTNFIARKETMYKIYLADPRLPARKDVLELVKDNPDVVAFTQSASMGTPMPNVPEMAPVWSAMGDALSIIINGQASVEDALKEAVEKIKAQIEKGSHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of redundant maltotriose binding proteins from the thermophile Thermotoga maritima
rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Thermotoga maritima
molecule keywords maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein
total genus 124
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2fncA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2fncA01
1FTJA 4JXIA 2OCUA 2ZXTA 3G3IA 3PMVA 3QK6A 4GRKA 3V5AA 1SVXB 1GR2A 5AA1A 3IAZA 3S2VA 1XVYA 4JWYA 3OD7A 4NTLA 1AL3A 1QUJA 3FZVA 3CSBA 3H6UA 3TKDA 2M8CA 3M3LA 5I58A 4YB7A 3TAJA 4ELRA 1ZBMA 2XXIA 2DWAA 2AYSA 1MQDA 1WVJA 3PD8A 3SDFA 3IX1A 3RUMA 3H06B 4R6KA 1IXHA 1SYHA 3KSXA 4OYVA 2F78A 5I2NB 2B3BA 2F6PA 3KZGA 3RNNA 1QVSA 3G3FA 3OSRA 4G8NA 3B6TA 5HM4B 1IZ1A 1MY4A 3MBPA 4ONYA 3PUWE 3OEKA 1BLFA 2DWJA 3CI8A 3N26A 4P11A 3V89B 3A3CA 5JEIA 1UIUA 4GXAA 3TQLA 4C0RA 5ICTA 1BKAA 4QFLA 4RXLA 3EN3A 1MXVA 1A8EA 1VFDA 3FXRA 3U1OA 2ZNUA 3HV1A 2NWJA 2UVHA 3TELA 5CMBA 4WKMA 5FTIA 1MM7A 1NNFA 2PT1A 3UN6A 4QF9A 3KSJA 4LONB 1DPPA 4PFYA 2AIXA 2ZYOA 2G29A 1ANFA 1UQWA 1MDP1 2DOJA 1MY2A 3HCQA 5CRYA 4AB6A 2QMWA 5L9OA 4JSDA 3S9MC 1B3EA 2OWTA 1UTHB 3FVKA 1LLSA 4Q8RA 2XXPA 5KZTA 1M5DA 3KG2A 5L9MA 3RY3A 2PX1A 3DELB 4KPTA 1LB9A 1MY0A 4OQOA 4R73A 1YPNA 2XHDA 1EZOA 5LOMA 1KWHA 2RC9A 3E9XA 3DM0A 5KCJA 1Y1ZA 1LFIA 4QFKA 3TTLA 4F31B 1SW2A 1FQCA 5I2KA 1USYH 5AA4B 4GVOA 1RYXA 4FJPA 1S9TA 4G68B 4H0WA 1PB9A 3QUFA 3VXCA 3H03A 4X9TA 2VGQA 4FEBA 2V93A 3IO4A 2AL5A 3BBRA 2VHAA 1B46A 1UTHA 1VR5A 1UIVA 4I1DA 5TPAB 3T9UA 4HCWA 3TCGA 4ZZAA 1Z7NE 3MZ9A 4POXA 2OBGA 4F1YA 3MVYA 3OO6A 1A99A 4TQUQ 2O1LA 1LCTA 2QS2A 3ZKKA 3VLUA 2X7PA 1MG1A 1LBCA 4IY6A 3VVFA 4H65A 3Q28A 4R6HA 1R1NA 1UTBB 4TOZA 4YKKA 5AA4A 3UK4A 1DTGA 3PUXE 4NF6A 3TEPA 2PBWA 4ND9A 4EQ9A 4IB2A 4Q30B 5TP9B 4ZEFA 2W7YA 1AOVA 5IAIA 3K1NA 2DSFA 3EF7A 1XVXA 4KCCA 4ELPA 3F11A 4JB7A 4FATA 4RK9A 4R9GA 1RKMA 1MH3A 3C9HA 1R6ZA 4O3BA 2D21A 5K2XA 3PU5A 4EXLA 2WKYA 3K6WA 3OXNA 1VE4A 3ILTB 3ZKLA 5L9SA 4OTEA 3VV5A 3PPRA 3FD3A 1MXUA 2G93A 1POTA 3PPQA 3RN8A 3MP8A 4NF8A 4HTGA 4BDRA 4OERA 3EPEA 2DYXA 1LCFA 3MWBA 1URDA 3QSLA 1QKAA 1TXFA 4H1XA 2H98A 4N13A 2REJA 4MH5A 2DE3A 4OESA 5DT6A 1NNKA 1OMPA 1OQGA 1AIVA 1PBQA 4ZS9A 1GGGA 3QIMA 3K02A 4F3GA 3TZAA 3HN0A 1B5HA 1FQEA 3MVZA 4ZECA 4BDLA 2YJPA 1JW5A 3MAMA 3VLWA 3T93B 2I3WA 1MY1A 3G3HA 3V8XB 3KJ7A 1AMFA 5I84A 1MS7A 3TMGA 4GD5A 1ATGA 3SEYA 3T66A 2DVCA 1JVYA 2ONRA 3S4UA 4X1BA 2F7BA 1ZU0A 3O2AA 4HW8A 1N0TA 3PUZE 4FORA 1MPBA 1P1QA 4XKQA 3FVOA 1GVCA 3D4GA 3U94A 3QAXA 3PMXA 4FE8A 4N07A 4IGRA 4QFOA 5ELVA 2ZNSA 4Q5TA 1TFAA 1VSOA 2I0BA 3TCHA 3VFJA 1MPCA 1NH7A 1EU8A 3SEUA 4NWDA 4JWOA 3UP9A 2P1SA 3IB0A 1HSLA 2Q9TA 1BP5A 1II5A 3PD9A 5AA2D 2AL4A 3O66A 3DP6A 1ZTYA 2RCAA 1EH3A 3CSGA 3T22A 3O28A 1OIBA 2REGA 1D9YA 3N6TA 5TU0A 2A5TB 2V3TA 4U22A 1SD3A 1MY3A 3C31A 3TUSA 3W9WA 3FASA 1B52A 4WXJA 2UYFA 3VE1B 5JTYA 1NH8A 4KI0E 3C33A 3IOUA 4PP0A 3K6VA 4C1TA 2GH9A 1ELJA 3H4ZA 2QMXA 2O69A 2QRYA 3CRBA 2XD2A 3LSLA 2H25A 3OO9A 5AA2B 3MP6A 5DVJA 3WAFA 4ELOA 3PMWA 4LQ5A 5HBCA 4MF3A 4FAJA 2Y7WA 4OFOA 2YPNA 3IO6A 5L8DA 4R72A 2Y7KA 5JK4A 2A5TA 5DTBA 3V83A 1YTVA 1MXYA 1DSNA 1EZ9A 3S9NC 5DEXA 3TYHA 2I0CA 3FXQA 1IQ7A 1PBPA 4C1UA 4POWA 4XTCQ 1MRPA 3R26A 2Q89A 3FUZA 2GHAA 4MLQA 1DOTA 2UVJA 2OZZA 4ZDMA 3UA8A 1DTZA 2HZLA 1AH5A 3O6HA 3JV9A 1A40A 2I48A 2RF1A 4MBPA 4H67A 2ESNA 1B6HA 2VD2A 5ICQA 2DP8A 1NKXA 2XX7A 4PQJA 1DPEA 4RPOA 4XKNA 5KDTB 3LC8A 3KN7A 3ODBA 2HAUA 3VLVA 4BDMA 1Q35A 2Q2CA 2F34A 3KEIA 2OLBA 1BIYA 1IEJA 2DWHA 1N84A 1JVXA 4LVQA 4H6DA 1IXIA 4XIGQ 4EF2A 4GOTA 3K6UA 2HEUA 3QXMA 1M5BA 4KYEA 4YB5A 4HCYA 3I6VA 1LB8A 1O63A 3G3GA 1JEUA 3K1PA 2RKMA 2DXYA 1B3LA 4RNSA 2F6GA 5DVFA 3LSFB 2P0SA 1I6QA 4F39A 1GV8A 4DXUA 3MVWA 5I59B 2O1MA 1FW0A 4ZEIA 4N6PA 3OEMA 2O51A 4M1VA 3T9XB 3O6IA 4LQ2A 3RLFE 3GBBA 5I2NA 2QS1A 3CIJA 3A09A 4GQOA 1IIWA 1DMBA 2XX8A 3U92A 2V3UA 1MXXA 4O3AA 1Y3QA 3I3VA 2XXHA 1J1NA 4I62A 1VFEA 4PFWA 1B1HA 4F3SA 3LR1A 4L17A 4R2FA 3VVDA 5F7VA 1R9QA 3P7IA 3H7MA 3K4UA 3RT8A 4F1UA 1O64A 3K2DA 3MPLA 5J1DA 3K01A 4EQBA 5ISUA 1R9LA 5I59A 2RINA 4TLLB 4K3FA 3N6UA 2QSXA 5H8HB 1SDXA 1URGA 4BDNA 5K2YA 1B32A 1NL5A 1XHYA 2Z8FA 1IITA 1SYIA 1H44A 3SKPA 1B9JA 4RYAA 4ECFA 2H5YA 3MZBA 3Q26A 1PEBA 1Q1KA 3MJNA 2UYEA 3KOTA 4QSDA 2GFEA 1B7ZA 1Y20A 5EHMA 3IL1B 3W15C 3HHFA 2DVZA 3UGWA 2R9JA 2B65A 4U23A 1ZLQA 2A5SA 4R75A 2ZYMA 4G8HA 1N3XA 2QJEA 1TT1A 4F3BA 3HPIA 3LBSA 1N7XA 4PFUA 3O29A 4IO2A 2VD3A 2DS9A 4QSEA 2Y84A 4IY5A 4OWDA 3CG1A 2F8DA 4Z0IA 4G68A 1LFHA 4U1ZA 1OQHA 1NNPA 3MQ9A 2IEEA 3DP8A 3LUYA 4I8CA 3K6XA 2XXVA 1BTJA 2Z22A 3N94A 2QL3A 4F19A 1XOCA 4U21A 3ONMA 5EHSA 5TPAA 2ONSA 3TTRA 2RC8A 1TFDA 2OWSA 2I49A 2UXAA 3B6QA 2HFBA 3PV0E 1FQFA 1M5EA 3IOWA 3IB1A 3MC2A 1JQFA 1QJMA 1B05A 1PB8A 2Q2AA 2HQ0A 4G77A 1UTBA 1RYOA 4NEDA 4F29A 1MXZA 1B5JA 2BJJX 4QSCA 3L6GA 1QW0A 5EYFA 2NVUB 3GZGA 4LUBA 1LAGE 2GRVA 2DE2A 3KN8A 5TP9A 1YCJA 3TTMA 5H8SA 1B1XA 1SW4A 4DIGA 1D3KA 2Y7PA 4P0IA 1JNFA 1TWYA 2O7UA 3Q25A 3SESA 5B7DA 4ZEDA 4GL0A 3SEVA 1USYE 2I4BA 3USDA 4G8MA 1SW1A 5IKBA 1FCKA 1ZJLA 2R71A 3O97A 2FNCA 3CFXA 3MW0A 4U2RA 1QUKA 1A8FA 3G7WA 5CMKA 2ALUA 1JW4A 1MQGA 1MDQA 4IO5A 5ITPA 1FQDA 4O3CA 3FJGA 3ILUB 1H43A 1OVBA 4AB5A 1MM6A 4YKJA 3DP4A 4GFRA 3H6TA 4RJZA 1ZIUA 4F18A 2DQVA 2F36A 3DLNA 3PGFA 2I58A 1QUIA 1IUDA 3H6VA 4LP2B 3IJXB 4BLAA 2XXTA 3U8QA 3RGYA 3R6UA 1D9VA 3PUYE 3FATA 4KCDA 1QKBA 4YU0A 3MZ1A 3K0VA 3RTFB 4PE5B 4U1OA 1POY1 5I56B 2HXWA 1S7YA 2FYIA 4LZ7A 4KR5A 1NNTA 3D4CA 3EHTA 1B58A 3M3FA 3TTNA 3HSTA 4JBZA 3M8UA 1GTKA 4X48A 2E1SA 5ITOA 2V3QA 5DYHA 2Z8DA 3BKIB 4FIMA 5M2VA 4ESXA 3Q27A 4IO4A 4DXBA 5A5XB 1N76A 1IXCA 1MQJA 4GIZA 2E0SA 3T9HB 1H76A 2H9BA 3FVGA 3MUQA 3RQTA 1QULA 1T0KA 1MPDA 3CR9A 1WODA 4DCYA 1ZMGA 5FHOA 4H5GA 5I56A 4MLVA 2PT2A 5FTHA 3SERA 4ZEBA 1B51A 4YAHX 4JSOA 4YICA 1SQYA 4DZ1A 2V84A 5AA3A 2X26A 1MH4A 2HCAA 5F1QA 2OK2A 3BFUA 3KOSA 2RC7A 3KBRA 3Q29A 2DXRA 4LA9A 4OMBA 1I6BA 1OVTA 2XXQA 3CFZA 3KJTA 1LBBA 3OO8A 5A5XA 5AA2A 3KGCA 4OENA 2ZYNA 3U93A 1FTOA 1FQAA 4FECA 4KFQA 3IR1A 2X7QA 4THIA 2F7AA 2ABHA 1XT8A 3EHUA 3FVNA 3H6WA 1P1UA 4P0GA 3S9EA 1Y3NA 1O7TA 1B0LA 2F7CA 2ONKE 1P1WA 4OETA 3FV2A 4UACA 1CE2A 2XXRA 3JYRA 4R2BA 2QPQA 1L5TA 2D3IA 4E0XA 1XC1A 4I9DA 4ZEKA 4DE8A 3IB2A 4XKPA 4LZ8A 4HS7A 5CBSA 2NXOA 4PETA 1B3FA 4YKIA 1PDAA 3VDFA 4QFPA 2O84X 1B3GA 4KYSA 5KDTA 1LFGA 3T96B 2RCBA 1Y4CA 3IK6B 4UA8A 1LGBC 3PUVE 3EHSA 4RPNA 2LAOA 3TCFA 3KFMA 5CI5A 1N3WA 3N5LA 3TTKA 1M5FA 4EF1A 1FQBA 3CVGA 3OO7A 2F35A 1YAEA 5KCJB 2PMSA 1I69A 1B7UA 4H5FA 1LSTA 4ELQA 2NOOA 1PB7A 4GWOA 4E0WA 1XS5A 3TFLA 5CC2A 3C32A 5I2KB 2NUVA 3E13X 3K00A 3JZJA 2OJTA 2O68A 4XKRA 3C4MA 1I6AA 2THIA 1MXWA 4NF4B 3O9PA 3QUJA 1JW1A 3PPOA 4GF8A 4QRZA 1F9BA 4F3PA 3AXFA 2ZYKA 1NFTA 4F2OA 3I5OA 5FHMA 3GLBA 5BWJA 1Y4TA 3T9VA 1US4A 4U4SA 4AQ4A 2QS4A 1PC3A 4F22A 2CZLA 1A55A 2V25A 1H45A 4OXVA 4GL8A 1A54A 4RK2A 3LSXA 3IOTA 4Z7EA 4NMYA 2F5XA 3UORA 4XXUA 4GLIA 3SEWA 4YMBA 4KYDA 1M5CA 4WEPA 4NF6B 2Z23A 4KQPA 3ZSFA 3KN3A 3FGSA 4NF5B 4QHQA 4NF4A 3IOVA 5H8HA 4R74A 1NMUA 3WAEA 1SI1A 3TPAA 3IJOB 4YKPA 1ZKBA 4BDOA 4RY1A 3S9LC 4FEDA 3FXUA 1P1NA 1FTKA 5AE4A 5BUUA 2O7IA 4R9FA 2UVIA 2R6GE 4G4PA 5I57B 3EQ1A 5FHNA 4LZ5A 3L6HA 4OEUA 4MFIA 3FV1A 4U4XA 2I6EA 4NF8B 4TLMB 3G3JA 3RT6B 1JEVA 3FJMA 4F1VA 4M4GA 2YLNA 5CMMA 1LAXA 1OLCA 4NF5A 2HZKA 5H8FB 3C35A 4NE4A 1FTMA 1P99A 2XD3A 3QYTA 3C34A 3HHGA 3W9VA 2D5WA 2Q88A 4OEVA 3B7DA 3B6WA 3U72A 2XXYA 4EDPA 1US5A 3MP1A 4OFJA 3ZS6A 5I57A 2PYYA 3BFTA 3SETA 3M3KA 1N7WA 1H3DA 3VVEA 4G68C 4R6YA 2B3FA 3H3GA 3E4RA 1MQIA 2ANJA 4DCXA 2H4IA 4H8IA 4IO7A 4ZE9A 4YZZA 4QFNA 1SI0A 1P1OA 5CBRA 5H8FA 4DLDA 4NWCA 3OELA 3CG3A 2CMOA 2ZNTA 5DVIA 4DDDA 1B4ZA 3E3KA 4OZ9A 1S50A 4OHNA 4Q0CA 3RTWB 4WEDA 4IGTA 1B3HA 4GXSB 3OOAA 3THIA 4KHZE 4IO3A 1B0HA 5CMCA 4EXKA 2I3VA 4OVJA 2O6AA 3OENA 2GHBA 3O6GA 2Z8EA 3ECRA 2P2AA 5HPQA 4JDFA 1URSA 3SEXA 2XX9A 2Y7IA 4ISUA 2Q8JA 1B4HA 1B5IA 2Y7RA 4F2QA 3GXAA 2KLFA 1HSEA 4YB6A 4H8JA 2H99A 3FJ7A 2XXUA 5JTYB 3VXBA 1CB6A 3CFLA 4DXCA 4KD5A 1EZPA 5CM6A 1LAHE 3FIRA 4ZE8A 4OFLA 1N04A 4G2ZA 4IO6A 2DE4A 2XXWA 1JETA 1B7HA 3HO7A 3R7XA 5H8NB 4ESWA 4YMAA 1Y1MA 5H8QB 4BDQA 1Z7ME 1MQHA 4EQ7A 4LATA 1D4NA 1OLAA 3LSWA 3TODA 1SBPA 3UIFA 2VP1A 1Y9UA 3GBAA 5DEXB 3PPPA 2PVUA 1WDNA 2QS3A 2F97A 4X1DA 1IXGA 1HSJA 1B2HA 1Y3PA 5B70A 2HAVA 3IORA 3K1MA 3C36A 4RA1A 1FTLA 3PPNA 3G3KA 2DWIA 4EUOA 3TDJA 2UVGA 5I58B 4JWXA 3TQWA 3RPWA 4PFTA 3MPKA 3OMBA 4ZZEA 3OSQA 1LAFE 2ZMBA 1B40A 1SW5A 5H8NA 3MVXA 5H8QA 2FA7A 2VOZA 3A3UA 1A7LA 2I4CA 2XXXA 2IA4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N8YA 4JVDA 3HFUA 1FTJA 4JXIA 5EQAA 4I3YA 2OCUA 2ZXTA 3G3IA 3PMVA 3QK6A 4GRKA 3V5AA 1SVXB 1GR2A 5AA1A 3IAZA 3S2VA 1XVYA 4JWYA 3OD7A 4NTLA 2QFLA 1AL3A 1QUJA 3IFAA 3FZVA 3CSBA 3H6UA 3TKDA 2M8CA 3M3LA 5I58A 4YB7A 3TAJA 4ELRA 1ZBMA 4P1EA 2XXIA 2DWAA 2AYSA 1MQDA 1WVJA 3PD8A 3SDFA 3IX1A 4PBQA 3RUMA 4GWZA 4OVSA 2FIEA 3H06B 5LDZA 4N8GA 4R6KA 1IXHA 1SYHA 3KSXA 4OYVA 2F78A 5I2NB 4GWXA 2B3BA 2F6PA 3KZGA 3RNNA 1QVSA 3G3FA 3OSRA 4G8NA 3B6TA 5HM4B 1IZ1A 1MY4A 3MBPA 4ONYA 3PUWE 3OEKA 4MNIA 1BLFA 2DWJA 3CI8A 3N26A 4P11A 3V89B 3A3CA 4XF5A 1JP4A 5JEIA 1UIUA 4GXAA 3TQLA 4C0RA 5ICTA 1BKAA 1G0IA 4N6KA 4QFLA 1FSAA 4RXLA 3EN3A 4QXDA 1MXVA 1A8EA 1VFDA 3FXRA 3U1OA 3E78A 2ZNUA 3HV1A 2NWJA 2UVHA 3TELA 2CZIA 5CMBA 4WKMA 5FTIA 1MM7A 1NNFA 2PT1A 3UN6A 4QF9A 3KSJA 4LONB 1DPPA 4PFYA 2AIXA 2ZYOA 2G29A 1ANFA 1UQWA 1MDP1 2DOJA 3U65A 3MSTA 1MY2A 3HCQA 4NF0A 5CRYA 4AB6A 2QMWA 5L9OA 4JSDA 3S9MC 1B3EA 1DK4A 5LTCA 2OWTA 1UTHB 3FVKA 1LLSA 4Q8RA 2XXPA 5KZTA 1M5DA 3KG2A 5L9MA 3RY3A 4AS4A 2PX1A 2P3VA 2KQZA 3DELB 4O94A 4MEVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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