2FNCA

Thermotoga maritima maltotriose binding protein bound with maltotriose.
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
KLTIWCSEKQVDILQKLGEEFKAKYGIPVEVQYVDFGSIKSKFLTAAPQGQGADIIVGAHDWVGELAVNGLIEPIPNFSDLKNFYDTALKAFSYGGKLYGVPYAMEAVALIYNKDYVDSVPKTMDELIEKAKQIDEEYGGEVRGFIYDVANFYFSAPFILGYGGYVFKETPQGLDVTDIGLANEGAVKGAKLIKRMIDEGVLTPGDNYGTMDSMFKEGLAAMIINGLWAIKSYKDAGINYGVAPIPELEPGVPAKPFVGVQGFMINAKSPNKVIAMEFLTNFIARKETMYKIYLADPRLPARKDVLELVKDNPDVVAFTQSASMGTPMPNVPEMAPVWSAMGDALSIIINGQASVEDALKEAVEKIKAQIEKGSHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
source organism Thermotoga maritima
publication title The crystal structure of redundant maltotriose binding proteins from the thermophile Thermotoga maritima
rcsb
molecule keywords maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein
total genus 124
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2fncA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2fncA01
4HCWA 3PU5A 1POTA 4LATA 3G3IA 1O64A 4BDNA 3SEUA 2QS2A 4KQPA 1SYIA 1GGGA 2GRVA 3IR1A 1SW1A 4X9TA 4GIZA 3T96B 4H6DA 2KLFA 1MXVA 1IXHA 4R6HA 4NTLA 3K6WA 5KDTA 3V83A 3B6WA 4MF3A 3MQ9A 3B6QA 4Q0CA 1NNKA 1WODA 3KJ7A 4EQ9A 1XT8A 5AA2B 3KN7A 2CZLA 3K01A 1RYOA 1OVTA 1D3KA 2PYYA 3M8UA 3ZKKA 1FTLA 4HTGA 4FIMA 4OEUA 3FUZA 3S4UA 1QKAA 5JTYB 1JETA 1R9LA 5CM6A 4G2ZA 4IGRA 5CMKA 3K6UA 1UTHA 2HAUA 2I49A 1QULA 4E0WA 1Y20A 3KGCA 4OZ9A 4FECA 2Z23A 1UTHB 4ZS9A 1B0LA 2X7PA 4OFJA 1MS7A 3CG3A 1D4NA 4WKMA 2H9BA 3OENA 5TP9A 4KR5A 2O51A 2I0CA 4LP2B 3T9HB 4EQ7A 3G3HA 2F35A 3DP6A 2F78A 2B3FA 3CI8A 1LCTA 1AH5A 1S50A 3K6VA 4YB7A 1MXXA 1JNFA 1SW4A 1N7WA 4BDOA 2RC9A 3LC8A 1Z7NE 4BLAA 4C1UA 3UORA 3LSXA 3ODBA 2BJJX 2I4CA 1AOVA 3TTNA 2ZYOA 4LONB 4TLMB 2WKYA 4YKIA 4F2OA 1HSLA 2ONKE 1PB9A 3FXRA 4WEPA 1FQCA 4YB5A 5EHSA 2OZZA 4F2QA 1Q1KA 3FZVA 4QFOA 5H8FB 1DTZA 2X26A 4GL8A 2THIA 1LSTA 2F34A 4QSDA 4TOZA 4EDPA 1URDA 2F7BA 2UVIA 2IEEA 3HCQA 5H8HA 2DWJA 1LFIA 1A8FA 1B0HA 1MY4A 5TPAB 1O63A 4KCDA 1H76A 3CSBA 1IEJA 1FTMA 2ZMBA 1ZU0A 3EQ1A 3ILUB 2RCAA 1DSNA 2YJPA 2O68A 1MH3A 2UVJA 5H8HB 3MP8A 4GL0A 5A5XA 3LBSA 4R6YA 1NH8A 1FTOA 2W7YA 2NXOA 2E1SA 1M5EA 1ZIUA 2HCAA 1GV8A 3TKDA 1GTKA 3SKPA 3MP6A 5A5XB 1A54A 4BDQA 4H65A 3U93A 4O3BA 1QW0A 2GH9A 4RA1A 1P1QA 3IJOB 1MY1A 4P11A 4QFPA 3KN3A 4GWOA 4ND9A 4ELRA 3EPEA 1A8EA 2YPNA 3RPWA 2I58A 1IXGA 3CVGA 3T9XB 3I6VA 3RY3A 3SEYA 2DQVA 4G4PA 1I6AA 4F3GA 3UA8A 2PT1A 1IQ7A 4F19A 4RK2A 5JEIA 3EN3A 3D4GA 5CMMA 4BDLA 3LSLA 4F3PA 3IOVA 3OO9A 1QUJA 5AA3A 1RKMA 3GLBA 3H4ZA 3MW0A 3THIA 1ZLQA 1DMBA 4YMBA 3IOUA 5DVFA 1I6QA 2ABHA 3USDA 3U8QA 3T22A 3KOTA 4ONYA 4PFUA 1FCKA 1B51A 4THIA 2Y7WA 3UN6A 2H98A 4RK9A 3IO6A 4F3BA 3H03A 5CBSA 4H8JA 4M4GA 1ZJLA 1A7LA 3IB2A 2I48A 1B3FA 3HSTA 3EHUA 1DPPA 3C33A 4NF6B 4JWXA 1ZTYA 3O2AA 1Y3NA 2DE3A 1QUIA 1B3EA 1MXZA 3JV9A 1NFTA 2PX1A 2Q9TA 4QFKA 4F18A 2REGA 1MQDA 4F29A 2DWIA 3O6IA 4F39A 3TFLA 3C34A 1MM7A 4G8HA 4MLQA 3IORA 3R7XA 4KD5A 3QSLA 2RF1A 3HPIA 1LGBC 1JVYA 3W9VA 2OK2A 4F22A 3OSRA 5I58A 5I59A 3C32A 4TQUQ 1B40A 1LAXA 4U4XA 3T93B 1BLFA 4IGTA 1SI0A 4Q30B 3RGYA 3RTWB 3KSJA 3TZAA 5F7VA 3KZGA 3I5OA 3FJMA 3K1PA 4DLDA 4RXLA 3FV2A 1DOTA 4NF8B 2AL4A 4OWDA 1F9BA 3ECRA 4PE5B 5HPQA 1FW0A 4PFTA 4JWYA 1NKXA 2Z8FA 4YZZA 3MC2A 2DS9A 3PMWA 3LSFB 5HBCA 3C31A 1ELJA 2V93A 4H67A 4XIGQ 3PPOA 4LA9A 1S9TA 4OERA 2F97A 1R9QA 3C4MA 1B32A 1LAGE 1Y4CA 1N7XA 4XKQA 4EUOA 2NUVA 3OSQA 3RUMA 1MY3A 2O1MA 4L17A 4M1VA 4Q5TA 1ZBMA 3FJ7A 2HAVA 3HHFA 3N26A 4N13A 2CMOA 5L8DA 1B9JA 4POXA 1FQEA 1FTKA 3K1MA 3H6TA 2V3QA 5DT6A 3EHTA 3CFZA 3ONMA 4QF9A 2G93A 3CFLA 1R1NA 4U1OA 1UTBA 4DIGA 1EZPA 5TU0A 1Y3PA 3F11A 3TCGA 1US4A 4FATA 3IOWA 3TUSA 5FHNA 2Y7PA 1B5JA 1UIVA 3OO8A 4JBZA 5AE4A 1T0KA 4HW8A 1RYXA 4NEDA 4G77A 2XX8A 4YICA 3LSWA 4N6PA 4NWDA 4YKPA 4XKRA 2HXWA 3OOAA 1H43A 1XHYA 3GZGA 1NMUA 2Q2CA 2QRYA 1M5DA 4UACA 4OMBA 4FEDA 1MQHA 4DXCA 1JW1A 1MY2A 2UVHA 1LFGA 2A5TA 5BWJA 2F6PA 1ZMGA 4XKNA 4G68B 1MG1A 1TT1A 1MH4A 5AA2A 1UIUA 3PUZE 2A5TB 3CR9A 4DCYA 3WAFA 5ICQA 5EYFA 4R72A 1FQBA 3O28A 3TCHA 5K2XA 3UK4A 2B65A 5CI5A 4ESWA 4KYDA 5JTYA 1XC1A 1PB8A 2Q8JA 4Z7EA 2Z8DA 3FVOA 4ZEKA 1B1XA 4BDMA 2UYEA 1TFAA 1LB8A 1A99A 3KN8A 4GOTA 4FAJA 4ELPA 2UVGA 3VLWA 3MZ9A 4OVJA 4OEVA 3E3KA 4O3AA 3MAMA 5CRYA 5B7DA 5FHOA 3TODA 2H25A 2HEUA 5I56B 3TQWA 2V3UA 1J1NA 1IXCA 2ZYKA 1XVYA 1MQJA 4F31B 3VVFA 2RCBA 1OIBA 2V3TA 3A09A 4ZE8A 3VLVA 4LQ2A 2NVUB 3FASA 1N84A 3Q26A 3RT8A 3VV5A 3OMBA 2DWAA 4AB6A 1SI1A 4YKKA 5CBRA 4F1YA 4ZEBA 1Y9UA 4KI0E 4IO2A 4DXBA 4H1XA 2NWJA 3RNNA 3HO7A 4R9GA 2QPQA 4X1DA 1N04A 4HCYA 3SEWA 1SBPA 5KCJA 5H8FA 2P1SA 3TTRA 1B3HA 1FTJA 1Y3QA 2RKMA 3QAXA 1SW2A 4KCCA 2Q89A 4NF4A 2VD2A 4I1DA 5KCJB 3B7DA 4OESA 3TQLA 3HV1A 5TPAA 2XXQA 1MQGA 3PPQA 1ZKBA 4NF4B 3BKIB 4OYVA 4N07A 3IL1B 1Y1ZA 3IX1A 4NE4A 3FIRA 5CC2A 5EHMA 3E13X 1TXFA 5ITPA 4IO6A 3UGWA 3G3FA 2QS1A 2PBWA 2XXXA 4ZEIA 1LFHA 1LB9A 3O29A 2FYIA 1IUDA 3L6HA 1JW4A 4RNSA 3S9MC 4WXJA 1II5A 2QMWA 3HN0A 4O3CA 3U94A 3CSGA 2AYSA 1B4HA 1YAEA 3KEIA 3JZJA 4C0RA 5JK4A 2G29A 3KOSA 3K1NA 3K0VA 3E9XA 4DCXA 4PQJA 3T9VA 5H8NB 4C1TA 1EZ9A 1JEUA 1P1NA 4U22A 4HS7A 2I3VA 2F8DA 2QMXA 4DZ1A 4DDDA 2Y7IA 4KPTA 4IY6A 4ESXA 2PVUA 2ZYNA 2F36A 2P2AA 1BIYA 1XOCA 3LUYA 1FQDA 3GXAA 2XD2A 4R6KA 4JB7A 1YPNA 1IITA 3MZ1A 1B05A 1JQFA 5H8SA 3H6WA 1JEVA 3K4UA 3TPAA 4AQ4A 4NF6A 4U21A 3KBRA 2QSXA 3KJTA 1M5CA 3UIFA 3UP9A 3CRBA 2Y7RA 3K00A 4Q8RA 2QL3A 1FQFA 3QXMA 3FATA 1NNTA 2O1LA 1SVXB 1MPBA 3PMVA 1POY1 4IO5A 3G3KA 1B3GA 1QJMA 3MBPA 3MVZA 2VHAA 2ZXTA 3SESA 4KHZE 3IAZA 1LAFE 3FVKA 4KYEA 2H99A 4GXAA 2DP8A 3PMXA 3O97A 3U92A 4R9FA 1WVJA 3K2DA 4X48A 1BP5A 4UA8A 4IO7A 2XXVA 3RT6B 2Q88A 2VD3A 1GVCA 4E0XA 3RN8A 3QUFA 4BDRA 2I4BA 1Y4TA 1MXUA 4ZZEA 4OQOA 1B46A 3VXBA 1OLCA 5AA4B 3TTLA 3H3GA 3PD9A 4NF8A 5DVJA 5FTHA 2ESNA 1NL5A 2DVZA 3ZKLA 4R74A 1IIWA 2Y84A 4LVQA 3DELB 3MJNA 2O7UA 5FHMA 4XKPA 2I6EA 2VP1A 3OXNA 3IOTA 4EF1A 1DTGA 4U4SA 4NF5A 1B7ZA 2RINA 5B70A 5KZTA 3D4CA 4EQBA 1XS5A 3TYHA 4ECFA 2V84A 2DVCA 2GHAA 3PUYE 1B7HA 3IJXB 4NF5B 3W15C 3TDJA 3DP4A 4PFYA 4G68C 5AA2D 3OO6A 1Y1MA 4OETA 3IB1A 1KWHA 2DWHA 3VDFA 2DSFA 5AA1A 4DE8A 3VFJA 2QS4A 1A40A 3C36A 4P0IA 2FNCA 1LBCA 4H5FA 3Q27A 1P1OA 3RQTA 2OCUA 5I84A 4G8MA 1SYHA 3H06B 4IB2A 4RY1A 1OMPA 1MQIA 3M3KA 4F3SA 1MDP1 4JXIA 3FJGA 1N76A 3G7WA 5LOMA 1SDXA 2F5XA 5I2KB 4ZEDA 3SETA 1HSEA 4K3FA 1EH3A 4U2RA 4OTEA 3MPKA 1SW5A 3W9WA 5DVIA 2OJTA 2F7CA 4X1BA 5CMCA 3JYRA 2REJA 2GHBA 4I62A 1M5BA 4MH5A 4RJZA 4G68A 4POWA 3G3GA 3PV0E 2Z22A 2H4IA 3VVDA 1NNPA 3Q29A 5I57B 3FV1A 3A3CA 2O69A 5BUUA 1B6HA 3FXUA 3VXCA 1MDQA 4NWCA 1B7UA 2O7IA 4ZE9A 4RPNA 1IZ1A 5L9MA 4LZ5A 2IA4A 2I3WA 1URGA 5HM4B 3QYTA 3PD8A 4EF2A 4LQ5A 3VE1B 3K6XA 4GRKA 4ELQA 1B52A 2HQ0A 3OEMA 3O9PA 3N6UA 1MPDA 3T66A 3TTMA 2D21A 4XXUA 3RLFE 3BFTA 2DYXA 2ONSA 4I9DA 5KDTB 4ELOA 1AL3A 1OVBA 5I2NA 5I56A 4IY5A 4R2BA 3SEXA 1NNFA 2ZYMA 1QKBA 2PT2A 1VE4A 5I2NB 4R2FA 3R26A 5L9SA 3ILTB 3DLNA 3IB0A 3OD7A 1OQHA 3B6TA 1S7YA 3TMGA 1CB6A 5ICTA 3CG1A 1Q35A 3C35A 1N3XA 3N5LA 4IO3A 3CFXA 1H44A 3MVWA 2XX9A 3O66A 4YB6A 4OXVA 1AIVA 2R6GE 2D3IA 2XXTA 4KFQA 4EXKA 1PBQA 1PB7A 3V89B 3PPNA 3K02A 5IKBA 2DOJA 3DP8A 1R6ZA 2F6GA 2OWSA 5TP9B 4GFRA 2VOZA 3EHSA 3S9NC 1ANFA 4AB5A 1I6BA 1EZOA 3IO4A 3OEKA 2LAOA 4PETA 3PPRA 2XXIA 2B3BA 3EF7A 1PC3A 3TAJA 4LZ8A 4GLIA 3GBBA 4KYSA 1AMFA 1I69A 1USYH 4YMAA 1TWYA 4OENA 4FEBA 3QIMA 1O7TA 2XHDA 4I8CA 5FTIA 4IO4A 4OHNA 1L5TA 3TTKA 4GD5A 1Z7ME 2AIXA 1PBPA 4QRZA 4RYAA 2QS3A 3U1OA 1QUKA 3BFUA 4YKJA 2ZNSA 1DPEA 1H3DA 2Z8EA 5ISUA 2XXPA 4R75A 4ZZAA 2ALUA 5H8NA 1B58A 1MY0A 1US5A 2E0SA 1D9VA 3OELA 3MWBA 2HFBA 3LR1A 2VGQA 1LBBA 3SERA 4FORA 3VLUA 3O6GA 2XD3A 3ZS6A 1N0TA 3FD3A 5J1DA 1ATGA 4YAHX 4GQOA 2F7AA 2R9JA 1WDNA 1B3LA 3KG2A 1B1HA 4H8IA 4P0GA 3CIJA 4DXUA 3PGFA 5IAIA 2R71A 3MPLA 2XXYA 1NH7A 2NOOA 4GF8A 1D9YA 3N6TA 2M8CA 3TEPA 4JDFA 2RC8A 1GR2A 4NMYA 2A5SA 4U23A 1P1UA 1B5IA 5K2YA 4G8NA 1B4ZA 3QUJA 3S9EA 3TCFA 3U72A 1JW5A 2HZKA 1CE2A 2ZNUA 3ZSFA 4ZECA 2Q2AA 5ITOA 4H5GA 4Z0IA 2XXRA 1EU8A 3H7MA 2QJEA 2D5WA 3HHGA 3T9UA 5DTBA 3PUVE 3R6UA 3TELA 1OQGA 1MXYA 1OLAA 3FXQA 3SDFA 3H6UA 5AA4A 2UYFA 1BTJA 2UXAA 3GBAA 1UQWA 3RTFB 5F1QA 1URSA 1VSOA 2P0SA 1MM6A 4F1UA 2HZLA 3M3LA 3DM0A 4MFIA 1LLSA 1SD3A 4EXLA 4QSCA 2H5YA 5ELVA 3PUWE 1USYE 4YU0A 1YCJA 1VFEA 4ISUA 1P1WA 2OBGA 3MVYA 4MBPA 1YTVA 5I58B 5I59B 1PDAA 4PFWA 3WAEA 3MP1A 3OO7A 4JSOA 2I0BA 3FGSA 3M3FA 3O6HA 2ZNTA 3G3JA 2DXYA 5H8QA 1TFDA 3KSXA 3MZBA 4QHQA 3VVEA 3BBRA 3S2VA 1MPCA 1VFDA 2OLBA 1N3WA 4RPOA 2GFEA 2O84X 4LUBA 2DE2A 3V8XB 4QFLA 2AL5A 5H8QB 4OFOA 2O6AA 3MUQA 4OFLA 3FVNA 3N94A 2V25A 3L6GA 1H45A 2ONRA 3P7IA 4FE8A 1JVXA 1SQYA 4R73A 1MRPA 3Q28A 4JSDA 3Q25A 1PEBA 1M5FA 1LAHE 3MVXA 4GXSB 4ZEFA 3V5AA 4QSEA 2YLNA 3QK6A 2RC7A 3KFMA 1BKAA 2XXHA 2XXWA 3AXFA 5I2KA 4U1ZA 1P99A 3S9LC 1LCFA 3IK6B 3PPPA 3C9HA 1HSJA 3H6VA 3PUXE 1XVXA 3FVGA 2Y7KA 2XXUA 4LZ7A 3A3UA 4PP0A 1UTBB 2XX7A 1B2HA 5M2VA 2FA7A 4QFNA 3E4RA 1QVSA 2X7QA 4JWOA 5DEXA 5DYHA 4GVOA 3I3VA 2ANJA 2OWTA 4WEDA 1FQAA 1MXWA 2DXRA 5L9OA 5I57A 4XTCQ 4MLVA 4F1VA 4FJPA 4H0WA 3SEVA 5DEXB 1A55A 1IXIA 1B5HA 1VR5A 4TLLB 5CMBA 4ZDMA 2DE4A 2PMSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DCUA 2ZZWA 3T1BA 4HCWA 3PU5A 1POTA 4LATA 3G3IA 1O64A 4BDNA 3CHGA 3SEUA 2QS2A 4KQPA 1SYIA 1GGGA 2GRVA 1IMBA 3IR1A 1SW1A 4X9TA 4GIZA 3T96B 4H6DA 2KLFA 1MXVA 1IXHA 2XWKA 4R6HA 4PDHA 4NTLA 1FBGA 3K6WA 5KDTA 3V83A 3B6WA 4MF3A 3MQ9A 1RDZA 4MCOA 3B6QA 4Q0CA 1NNKA 1WODA 3KJ7A 4EQ9A 1XT8A 3ROJA 5AA2B 3KN7A 2DDKA 2CZLA 3K01A 1RYOA 1OVTA 1D3KA 2PYYA 2CZHA 3M8UA 3ZKKA 4DI4B 1FTLA 4HTGA 4FIMA 4OEUA 3FUZA 3S4UA 1QKAA 5JTYB 1JETA 1R9LA 5CM6A 4G2ZA 4IGRA 5CMKA 3K6UA 1UTHA 2HAUA 2I49A 1QULA 4E0WA 1Y20A 3KGCA 4OZ9A 4NQ8A 4FECA 1NV1A 2Z23A 1UTHB 4ZS9A 4OVSA 4P8BA 1B0LA 2X7PA 4OFJA 1MS7A 3CG3A 1D4NA 4WKMA 2H9BA 3OENA 5TP9A 4KR5A 2O51A 2I0CA 4LP2B 3T9HB 4H46A 4EQ7A 4PF6A 3G3HA 2F35A 3E79A 3DP6A 1FTAA 2F78A 2B3FA 3CI8A 1LCTA 1AH5A 1S50A 3K6VA 4YB7A 1MXXA 1JNFA 1SW4A 1N7WA 4BDOA 5EYGA 2RC9A 5IZ1A 3LC8A 1Z7NE 4PFIA 4BLAA 4C1UA 3UORA 3LSXA 3ODBA 2BJJX 2I4CA 1FBCA 1AOVA 3TTNA 2ZYOA 4LONB 4TLMB 2WKYA 4YKIA 4X04A 4F2OA 1HSLA 2ONKE 1PB9A 3FXRA 4WEPA 1FQCA 4YB5A 5EHSA 2OZZA 4NGUA 4F2QA 1Q1KA 3FZVA 4QFOA 5H8FB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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