2FS4A

Ketopiperazine-based renin inhibitors: optimization of the c ring
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
333
structure length
329
Chain Sequence
SSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSELGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Renin
publication title Ketopiperazine-Based Renin Inhibitors: Optimization of the "C" Ring
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 329
sequence length 333
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2006-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2fs4A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2fs4A01
1RNEA 2I1AA 3EC0A 5P6YA 5P5KA 3L5DA 1AAQA 1Q9PA 4K8SA 2J9KA 4K4RA 4X2LA 1DAZC 2O40A 1YTIA 2QNNA 5P6NA 3OU1B 3ZKSA 4CKUA 3OUBA 3DOXA 5OYYA 1EBZA 5P8DA 2CEJA 5OZEA 1IBQA 4Y4AA 5P35A 5P67A 5P8LA 3BHEA 5P26A 4I8ZA 5I3YA 4D89A 4F74A 1XN3A 4ZSQA 3RSXA 2AZBA 5OYUA 2R43A 1PPKE 3GW5A 4Y5BA 2WL0A 2V10C 5P46A 5I3WA 4Y41A 2G69A 4YA8A 1B6PA 3KM4A 2G21A 2ASIA 5KQFA 2HAHA 5P28A 3ZKNA 5P3VA 3INFA 3OADA 2QI1A 5P76A 4FRIA 1C70A 2QHZA 4OD9A 1HTFA 1MSMA 5P22A 2I4XA 5P1HA 5OZ4A 1K6CA 3O9IA 2A1EA 5P7KA 1FQ6A 2P3DA 2WF4A 3UHLA 2R5QA 5ENKA 4Y3ZA 1FIVA 2AZ9A 1NSOA 2WEAA 2WEBA 3UDMA 4QLHA 3EKWA 1HBVA 2BBBA 5COPA 5P8CA 4OBGA 5P1VA 2P3BA 2ZHSA 3SFCA 5P87A 3Q70A 5P6AA 4R8YA 3TOFA 4PYVA 5P7XA 3K5FA 5P6OA 5OYSA 3OOZA 2PMAA 1B5FA 5JG1A 4E43A 2O4NA 2NTRA 4Z4XA 3NDUA 3K5DA 3O9CA 4B00A 4J1FA 2AODA 5P84A 1W5VA 1IZEA 5P3LA 5P43A 4Y3RA 2BPVA 5P2CA 2VIZA 3OQDA 3DCKA 4JECA 4LC7A 3ZKIA 1DMPA 5P74A 3UPJA 2Q15A 3NU9A 5HCTA 2F8GA 5P8QA 5P2IA 5P8SA 5OZGA 3A2OA 3PB5A 1C6ZA 3SA8A 3O9EA 3OU3A 5P89A 4I0FA 3ECGA 5P3NA 2SAMA 1NPVA 5P8PA 5P83A 2WF0A 5P8HA 4ER1E 2QD6A 3HW1A 5P3CA 3ZKMA 1BV9A 4Y3MA 3NR6A 4J0VA 3BUGA 5P17A 5P06A 2QZXA 1FG6C 4PZXA 5OZSA 1K2BA 3BGBA 1PSNA 1QDMA 2BPZA 5P8VA 2HS2A 5P6FA 3LIZA 1BWAA 1HPSA 2R3TA 3SA3A 2QNPA 5P3JA 1YT9A 2WF3A 3PLDA 5HDUA 8HVPA 4ZPEA 4CPWA 3LIYA 1E82E 5P7CA 1C6YA 5SY3A 2QAKA 3EKQA 5P85A 2RKGA 2AVOA 3SKFA 5P3BA 2NNPA 5OZXA 5P6BA 3ZKXA 3VSWA 1SDTA 4TVGA 3PBDA 3D1XA 4YD4A 4Y51A 5P0FA 5P0PA 4AMTA 5ER2E 3ZPTA 2NMZA 4YBFA 3TPPA 4ACXA 4RVXA 5P16A 5P8RA 3EBZA 5KR0A 1IDAA 5P5VA 3QI1A 3G70A 3OGPA 3L3AA 3KDBA 2PK5A 2QI5A 5P33A 1PSOE 2BKTA 4NJVA 4ZSMA 5P79A 2V00A 1HOSA 5OYVA 5P49A 4GJ9A 1W6IA 5P4BA 4OC6A 1UPJA 5P18A 5P5BA 3NWXA 3EKPA 4Y6MA 4IVSA 3NU4A 5I70A 3SABA 5OZOA 3TLHA 3BGCA 3EL1A 3M9FA 1T7IA 3BXRA 1BWBA 1EPQE 6FIVA 5P86A 3O9DA 4B1DA 4R91A 2V16C 4EJDA 2P8HA 4D8CA 4I11A 1HVCA 5P4DA 1MT9A 1BBSA 5AH8A 1HVSA 5P3SA 2HPFA 4RVJA 4CMSA 4YOAA 1ZP8A 1PROA 4GJCA 4Y4DA 3L5EA 2OHQA 3OU4A 2I0DA 3MSJA 5HE5A 3HVGA 5OZ7A 4Y3XA 1SIPA 5P3TA 3QIHA 1T6EX 3H5BA 3OXCA 3UQPA 5P7HA 5P5YA 2BPYA 5OZ1A 3EM3A 4NPUA 3S43A 4RLDA 4XX3A 5P4XA 3QVCA 5P6DA 5P10A 3OAGB 3APPA 5P4OA 4B0QA 2AVSA 3H0BA 1YG9A 3SO9A 3DV5A 2NXLA 5E5JA 5P2DA 5P4YA 3PSYA 5P5HA 4Y3HA 4DQGA 3C9XA 3SLZA 2G24A 1NPAA 4EJLA 4L1AB 1ENTE 3CIBA 2FIVA 5AH9A 5OZKA 1EC3A 5P0IA 5OZ5A 4F73A 5JFPA 4AA8A 1HVKA 5C9BA 3GI5A 2XYFA 5P8AA 1A8KA 4Z22A 5JODA 1LYAB 5P2XA 5P5IA 1ZPAA 2VJ6A 3O9LA 5P6WA 3QRSA 1M0BA 1BVGA 1MTBA 3SM2A 4S1GA 3NDXA 1AJVA 3I25A 4NPTA 3PVKA 2AOEA 1TSUA 4ZIPA 4Q1NA 4Q1XA 5P40A 5P7AA 5P38A 5P5SA 5OZFA 2QI0A 3LPKA 1HXBA 4MC6A 5P0QA 5P4TA 4HDPA 1AZ5A 4KE1A 1SMRA 3OWNA 3R4BA 5P1IA 3RVIA 4K4QA 2A4FA 2H6TA 1MRWA 5P4CA 2AIDA 3VF7A 3VFAA 5P0VA 5P2EA 4Y48A 1GVXA 2B7FA 1G35A 1K1TA 1E80E 3UDNA 7UPJA 3JVYA 4RCDA 4DJXA 5ISJA 2HPEA 4EHCA 4J0TA 2Q64A 4Y3JA 4GMIA 2OHUA 3BUFA 2P3AA 1KJHA 5P81A 5SY2A 1BDRA 4OBKA 4DJUA 5P19A 3KFSA 5P6HA 1FEJC 2JXRA 5PEPA 4FAEA 2PQZA 5P6LA 2QMGA 4QJ6A 3VSXA 2WJOA 4DH6A 1T7KA 4YDFA 1WBKA 3O9LB 5P0KA 1DPJA 3VV8A 1G2KA 5DGWA 5P0AA 2ER9E 6APRE 3VF3A 1SGUA 4DV9A 5P7BA 2FGVA 5P44A 4I0GA 2G22A 5P6MA 5P3OA 1HVRA 2G1RA 1MVPA 4LXMA 4Y47A 2OAHA 4J1HA 4PZWA 5P4LA 3RTMA 3OK9A 1YTGA 4HZTA 5P0RA 2ER0E 1ODWA 5OZ8A 5P88A 3OQ7A 5P1YA 2VKMA 3QVIA 3KMYA 2IL2A 4K4PA 2NMYA 5IVQA 5OZHA 2RSPA 1UH8A 2IQGA 5P61A 5P7LA 1HIHA 1TCWA 1K2CA 5P1TA 5P65A 3OU1A 5DR4A 2ZJLA 1RL8A 3R2FA 1EPPE 4Y3EA 3WZ8A 1OHRA 2FNSA 4I10A 3PCWA 4YD7A 3S54A 1PPLE 1SGZA 4DJPA 2B7ZA 5P1BA 5EZXA 5KAOA 2FDPA 5P5LA 1EC1A 3OHFA 5P30A 5F01A 2R9BA 1D4YA 1EPRE 5P1DA 4DPFA 3T7XA 5DQ2A 3FIVA 1AXAA 4YD3A 2HB3A 2WKZA 2PSUA 4HDFA 1GVUA 4HA5A 5CONA 3IN4A 5P58A 1XE5A 5P8TA 3Q6YA 4EQJA 4FLGA 3HLOA 5OZMA 2PK6A 2AOFA 2Q11A 5KR1A 5ENMA 5P2HA 2O4KA 3T7PA 7HVPA 3T7QA 3LIVA 5P0ZA 5OYRA 5P27A 3O99A 3R1GB 2VS2A 3EKVA 3MSLA 5OZWA 1HEGE 4I0JA 3KFNA 2FLEA 3PLLA 5P2TA 5P2UA 5P72A 2QI4A 3QRVA 2ZHUA 4CP7A 3KT2A 3UFLA 3S2OA 3G6ZA 2Q5KA 2IRZA 4DQFA 5P6VA 1TSQA 3MXDA 2G1YA 3MSKA 4I12A 5P4AA 3PBZA 4Y3AA 5OZ6A 3L5BA 3O9BA 5P4PA 1HTRB 5P70A 3PCZA 1MT8A 4H3IA 2VIJA 5P1MA 5IVTA 5HDXA 3VF5A 4BFBA 5P1AA 1CPIA 3OXWA 5P5RA 5P1CA 3S8IA 3TOHA 2FDDA 2ZE1A 3SACA 4MC2A 4GJBA 4Y3SA 1DIFA 5P3HA 2FNTA 5P4KA 5P8KA 2OHPA 4Y5NA 2FXDA 2XFKA 5OZTA 5P6XA 4JOOA 5P52A 5P1OA 5P7WA 5AHBA 2BKSA 5P4MA 2VA7A 3QP0A 1K1UA 1HVHA 5AHAA 5P62A 3ER3E 2VJ7A 1C6XA 1FQXA 4RCFA 4Y3TA 4B77A 5P7QA 1EBYA 2IGXA 2F3KA 2QK5A 3BUHA 5P4RA 2BPWA 4J54A 1YM4A 4H3GA 2Q55A 5P2YA 4J1KA 4YD6A 3GI0A 3FNSA 2CENA 3L58A 5P6UA 4APRE 4DJWA 3OXXA 5P66A 3APRE 1HIVA 3IAWA 2G27A 3SA6A 3OHHA 4Y4EA 3RU1A 5P5TA 4Y4JA 5P51A 4RVIA 5DR3A 4I0IA 3WZ6A 2ZJJA 5P2OA 5KOQA 3OOTA 4ZSPA 4HEGA 3HDKA 4YDGA 5P7TA 4NJSA 4RRNA 1D4SA 5P0BA 5P6GA 5OZRA 3PWRA 4BFDA 4J5JA 3NUOA 2HS1A 3QROA 1KJFA 3MWSA 2WHHA 5T4SA 1A30A 4HVPA 1BDQA 1EBWA 2NXMA 2RKFA 4Y4TA 4JPEA 3F9QA 2WF2A 5P3PA 5ISKA 1T3RA 5OZZA 4DPIA 4U7VA 3SA7A 2ZJHA 4FCOA 2Z54A 4GJ5A 4Y9WA 5P2MA 1APWE 3MXEA 2BJUA 1EPNE 1SDUA 1KZKA 2AOIA 2Q54A 5P4VA 2ZJIA 1A9MA 1HRNA 4B78A 4Y45A 5P6CA 2AVVA 3D1ZA 5P3QA 1LYBB 5P7GA 5KQYA 5OZCA 2V12C 3RSVA 1W5XA 5P1WA 2ZHTA 3OUDB 5P8GA 3TOGA 3OY4A 2P4JA 1G6LA 2VIEA 1KJ4A 3TL9A 4ZPGA 3NSHA 5IS4A 3NLSA 4EYRA 3QBFA 2NXDA 1AJXA 1LS5A 1ODXA 3INEA 3S45A 3S7MA 5P7NA 4Y3YA 1ODYA 5P0HA 4TRWA 5OYQA 2PH6A 5HCOA 5BWYA 1EEDP 1MEUA 2ZHRA 5P2WA 3ST5A 4J17A 5P68A 1RQ9A 4MC1A 3VEUA 3U7SA 4GYEA 4EQ0A 4YCTA 4EPJA 5P53A 3VYEA 4KB9A 1K6VA 4I8WA 2G20A 1XDHA 3KDCA 5COOA 5P36A 1RPIA 4OBDA 4I0HA 4GJ6A 4IVTA 4DJOA 3PRSA 3SA5A 2XYEA 3LZVA 2NR6A 3S85A 5P02A 3ZOVA 1YM2A 1ZBGA 5P0NA 5P45A 3TPJA 4DUSA 3EL0A 3UTLA 1XN2A 2F81A 5KR8A 1K6TA 4ZLSA 3GGXA 5P4JA 2RENA 5HTZA 4TRZA 5P1QA 1T7JA 5P69A 3OAGA 1G0VA 3LHGA 3QS1A 3PSGA 3D20A 1YX9A 4JPCA 3PMUA 4D83A 5P2ZA 2F80A 4I0ZA 2VNNA 4J1IA 5P4GA 5P8NA 4FRSA 4PHVA 4A6CA 4L1AA 5P7FA 3WB4A 4Y4BA 3PI0A 5P77A 3CIDA 2V0ZC 3HAUA 4FSEA 4QJ2A 4DQCA 4Q1WA 4FS4A 1D4IA 4Y5AA 1UH9A 2WEZA 1VIJA 1SH9A 2ANLA 4Y3DA 1LYAA 1HPOA 4Y5PA 4DQHA 3TNEA 1M43A 5OZNA 5P5OA 5P59A 1FQ7A 3IXJA 5P54A 2Q63A 3SAAA 1LZQA 4HE9A 5E5KA 4LP9A 5B18A 4J1EA 3K1WA 2BB9A 3TPRA 3HBOA 3LZSA 5P82A 1EPOE 4QJ7A 4NJTA 3IA9A 3QN8A 2AOCA 5P60A 3I7EA 1VIKA 3BRAA 4LHHA 5P7OA 1QS8A 3UQRA 3EMYA 1ZTZA 3LITA 4H3JA 4LL3A 3B7VA 4A4QA 4CPRA 1EBKC 2JJJA 5OZJA 5OZ3A 4ZPFA 4Y37A 1MT7A 2JYSA 5P34A 5P3FA 3CYXA 4CPUA 3T3CA 5P00A 4GZFA 5P7DA 5P13A 3VLAA 4F75A 5P3AA 1HHPA 4Y58A 3CKRA 1DW6C 3O9GA 1DP5A 5P4WA 5DGUA 4BELA 2QHCA 5P4EA 3WB5A 5J25A 1MSNA 3LPIA 4OBHA 3D1YA 1SMEA 2B8VA 2B8LA 3T11A 5P5JA 1SDVA 3DK1A 1HSIA 1U8GA 5P41A 1D4HA 5OZQA 4JP9A 4Y3FA 5P5FA 1W5YA 4LXKA 1FB7A 5P08A 5P25A 5P42A 1APVE 2OHSA 5DQCA 5P75A 1HSHA 5P3DA 4OBZB 2IKUA 5HD0A 4K9HA 4Q5MA 1LV1A 5P0DA 1EPME 5P2FA 1T6GA 3UDJA 1Z8CA 3GGUA 5P80A 3I6OA 3LZUA 2APRA 5I3XA 1B6LA 2G1OA 5OYXA 1XS7D 1ER8E 1GNOA 3DV1A 4A6BA 2BQVA 2NNKA 1N49A 5P7JA 4DQEA 4RYGA 3SA4A 3B80A 5DPZA 5DR1A 2CEMA 1HPXA 5CLMA 5P5GA 4YOBA 1GVWA 2MIPA 5P5PA 5HDVA 5P48A 1LF3A 5P1UA 2OHNA 3LIXA 1BVEA 3NXNA 2QMDA 4Y54A 5P6KA 3Q5HA 3IXKA 1ZJ7A 4XXSA 3ZKQA 3GI4A 3ZL7A 4DJRA 5P8OA 4CPTA 4EP2A 4QJ8A 4AZYA 5P8EA 4WTUA 3TKWA 5SZ9A 1HTEA 4NKKA 3PM4A 1HIIA 2PYMA 5P0TA 1BV7A 1SIVA 2IEOA 4GJ7A 1UH7A 1ME6A 2HC0A 1YTJA 5OYWA 3IGBA 3UCBA 1IVPA 2H6SA 2B60A 1TQFA 5OZAA 3URLA 2Q3KA 1RV7A 2G94A 2QHYA 5P4FA 1QBUA 1IDBA 2QP8A 5P0WA 4EWOA 9HVPA 3UQUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1RNE A;  2I1A A;  3EC0 A;  5P6Y A;  5P5K A;  3L5D A;  1AAQ A;  1Q9P A;  4K8S A;  2J9K A;  4K4R A;  4X2L A;  1DAZ C;  2O40 A;  1YTI A;  2QNN A;  5P6N A;  3OU1 B;  3ZKS A;  4CKU A;  3OUB A;  3DOX A;  5OYY A;  1EBZ A;  5P8D A;  2CEJ A;  5OZE A;  1IBQ A;  4Y4A A;  5P35 A;  5P67 A;  5P8L A;  3BHE A;  5P26 A;  4I8Z A;  5I3Y A;  4D89 A;  4F74 A;  1XN3 A;  4ZSQ A;  3RSX A;  2AZB A;  5OYU A;  2R43 A;  1PPK E;  3GW5 A;  4Y5B A;  2WL0 A;  2V10 C;  5P46 A;  5I3W A;  4Y41 A;  2G69 A;  4YA8 A;  1B6P A;  3KM4 A;  2G21 A;  2ASI A;  5KQF A;  2HAH A;  5P28 A;  3ZKN A;  5P3V A;  3INF A;  3OAD A;  2QI1 A;  5P76 A;  4FRI A;  1C70 A;  2QHZ A;  4OD9 A;  1HTF A;  1MSM A;  5P22 A;  2I4X A;  5P1H A;  5OZ4 A;  1K6C A;  3O9I A;  2A1E A;  5P7K A;  1FQ6 A;  2P3D A;  2WF4 A;  3UHL A;  2R5Q A;  5ENK A;  4Y3Z A;  1FIV A;  2AZ9 A;  1NSO A;  2WEA A;  2WEB A;  3UDM A;  4QLH A;  3EKW A;  1HBV A;  2BBB A;  5COP A;  5P8C A;  4OBG A;  5P1V A;  2P3B A;  2ZHS A;  3SFC A;  5P87 A;  3Q70 A;  5P6A A;  4R8Y A;  3TOF A;  4PYV A;  5P7X A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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