2FWGA

High resolution crystal structure of the c-terminal domain of the electron transfer catalyst dsbd (photoreduced form)
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
125
structure length
122
Chain Sequence
b'THLNFTQIKTVDELNQALVEAKGKPVMLDLYADWCVACKEFEKYTFSDPQVQKALADTVLLQANVTANDAQDVALLKHLNVLGLPTILFFDGQGQEHPQARVTGFMDAETFSAHLRDHHHHH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title High-resolution structures of Escherichia coli cDsbD in different redox states: A combined crystallographic, biochemical and computational study
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbD
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase
total genus 42
structure length 122
sequence length 125
ec nomenclature ec 1.8.1.8: Protein-disulfide reductase.
pdb deposition date 2006-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fwgA00
5DAKA 1AC1A 2KOKA 3RHCA 5IO0A 2GQLA 3LEFA 2N5BA 3DYRA 3GTUA 2H1AA 1EZKA 3M9JA 3GKMA 5H5QA 1ZYEA 4EL1A 2N5FA 4FYUA 3E3EA 1OC8A 4PUAA 2I3YA 1TI1A 4CHSA 1GSSA 1ZCPA 3FR6A 1VF2A 3Q18A 3DIEA 4V2LA 4EO3A 1E2YA 2LEGA 2A4VA 2RM5A 2IL3A 2OE1A 1TRUA 2B7JA 1M9AA 4KE3A 5F06A 1DBYA 1SK1A 1G6WA 1U3IA 3VI7A 5A5KA 3HJMA 4H86A 1PL2A 3TKSE 1J9BA 1DSBA 5J5NA 3N5OA 4FYBA 4TW5A 4O32A 2XBQA 3IOSA 4X0XA 5AN1A 2R6KA 2M46A 3FEUA 4IQAA 5B6MA 2G0FA 1XW5A 3KM6A 5IOWA 2RM6A 1UC7A 5ENUA 4LL1B 12GSA 1PA3A 2HI7A 3ERWA 1FW1A 3F3QA 2CV4A 3HYPA 2P5RA 3J7Yb 3TJFA 1LBKA 5CAXA 1PMTA 2XC2A 4KDYA 3LYKA 1K0OA 2DMLA 3ZITA 1A8YA 2O85A 2NDOA 5JWQB 4POLA 2H0IA 5DQYA 3AY8A 4HS1A 4CW9A 3I43A 3EWLA 4NV5A 1F2EA 2Z9SA 1AXDA 5HQPA 1OC9B 2VOCA 4ZBDA 4XS1A 4OO5A 4WXTA 5GSSA 5KN0A 5C04A 3G7YA 2VLUA 3CBUA 1XVWA 1K0CA 3GKXA 2LJAA 2L5LA 2YP6A 1T8EB 2LJRA 2FGXA 1TK5B 1IYHA 2XPEA 1M99A 1F37A 2HNLA 1GTIA 2IWTA 4GQCA 2JSZA 4HI7A 1ZGNA 3GN3A 2H19A 2GSQA 1XWGA 1C72A 3GURA 1EWXA 1Y25A 2LQQA 2XPDA 4JR4A 5ID2A 2WZ9A 4JR6A 1MTCA 5IIZA 1TKDB 1SD9A 5ECIB 1R5AA 4IW9A 2O8VB 3DD3A 5CRGA 1HNCA 2JU5A 1UN2A 1A24A 5LNKe 1QXHA 1XWBA 3LXZA 2DJ0A 1M9BA 4MPFA 2ZUPA 3LQ7A 2VLTA 3FYGA 1YKCA 3ZREA 5IMCA 1Z9HA 2H73A 2FHEA 2H01A 1XXUA 4HOJA 5D9TA 1GSDA 4MF7A 4CDOA 3L9VA 2PVQA 4LL4B 3BJ5A 3MNGA 1X9MB 4XS6A 3Q19A 4K2DA 3W8JA 4N10A 3D4TA 1SD8A 5KEJA 2VL9A 1TRVA 4BPYA 1BYEA 2YANA 2FUG2 4YQVA 2VLVA 6GSVA 4OD7A 1BG5A 3G7IA 3QD9A 1GTBA 5FHIA 3I6AA 4ACSA 2H0HA 1LU4A 2V41A 4K0GA 2HRNA 2IIYA 3NZNA 5ECPB 1GSFA 4PX1A 2F3MA 2I1UA 5D73A 1UVZA 3KGKA 3S9FA 2FA4A 3UVHA 4TVEA 3UJ1A 3TRQA 3O3TA 3GIXA 3ZTLA 4EF0A 2CX3A 4PQHA 2C3NA 4IKHA 2FWEA 3IC4A 4LA1A 4ZB9A 3VLNA 4G19A 1YF0A 3IA1A 3RBTA 3FKFA 3APSA 2HLSA 2FLSA 4HQZA 2XHFA 1Z5YE 1MDIA 2IMDA 5B6NA 1MD3A 1PX7A 1NHYA 2C80A 1TK0B 3FZ9A 1ON4A 5DALA 4QL7A 1GTUA 4FH8A 2B5YA 1JFUA 2C3TA 5AISA 1USBA 1X5EA 5CRDA 1JZWA 4OCEA 2KUCA 5B7CA 4KCEA 1B8XA 3UEMA 1S3CA 3VI5A 14GSA 5ABRA 2FWHA 2NPBA 1NHOA 4IELA 2H71A 1GNEA 3CSJA 5HR2A 1M2BA 3F4TA 1ERVA 3HY2A 3FZAA 4I97A 5IPGA 4X1UA 4ILFA 4HJ2A 4L5LA 1GLPA 2PBJA 5DAKB 4AJ6A 2CT6A 4TKYA 1XPVA 2ON7A 2ES7A 3I69A 2QGVA 4GSNA 1QQ2A 3GTUB 3H8QA 1YEPA 2FWGA 1TJDA 4AJ8A 4N0ZA 2VCXA 2V6KA 13GSA 3IDVA 2DMMA 2C8UA 3IHQA 2GDRA 3L9SA 4GSSA 2HT9A 1SK0A 3KMOA 2VCVA 4BWSA 2RUFA 4EXJA 2HYXA 5HFIA 3HXSA 3EMXA 4QL9A 1B4QA 5D9WA 1EOHA 3KH7A 1GSUA 2J23A 3PR8A 2CAQA 1GUHA 3VFIA 4MLYA 2RIIA 2K8VA 2DJJA 3QOUA 1PD21 3VPQA 2PMTA 3IV4A 1JHBA 2FNOA 2VL2A 3HA9A 4HZ4A 1NSWA 4GWRA 2DIYA 3TKQA 19GSA 2GTUA 4NPBA 4K0NA 5KN2A 3CXGA 2H72A 1O8XA 6GSXA 4K9ZA 5KN1A 3QPMA 1Z6MA 1ML6A 3VWVA 1EV9A 4O92A 4RI7A 2IMEA 1ZOFA 2P5QA 3Q74A 5F07A 1SJ6A 3GNJA 4WEYA 4IJ3A 3FY7A 4KSOA 2AAWA 4EDZA 2PPTA 2YZHA 4ZB6A 2V2GA 3UIWA 4KA0A 3ZYWA 5LD0A 3L9UA 3D5JA 3TKPA 6GSUA 3A2XA 3D21A 1IYIA 3GKNA 1YJ6A 2VO4A 4MF5A 3GKKA 2REMA 4TOPA 3WGDA 1K3LA 1OKDA 1GTAA 1T1VA 2AV4A 4EUYA 3IAM2 1ZYQB 4ML1A 4TR1A 4ULXA 4F2IA 2IFQA 4OFNA 3GX0A 3ZLPA 2FWFA 4HJMA 2IN3A 3APOA 3LORA 1U6TA 4EKZA 5FWGA 4NHWA 1XCCA 2VCZA 3EINA 3I9V2 3HJOA 5ECLB 5DQSA 4XIHA 2CAIA 2WFCA 3NOFA 2BJXA 1M2DA 3LJRA 3EVIA 1DE1A 1XWAA 5ID2B 2X8HA 1V58A 3E9JB 5E59A 2OBKA 3FHKA 2NTOA 1MD4A 2IMIA 3RAZA 4IVFA 2O7KA 2YWMA 1S3DA 3RPNA 1V9WA 3U6VA 2YPMA 3UMAA 5IQYA 3FW2A 3TB2A 4BA7A 1A8LA 5J9CA 4J57E 4LLRA 2B5XA 4HQSA 3WGXA 1VF1A 2VM2A 4GLTA 3TKSA 3VWWA 3ED3A 1X0RA 3P90A 4BVXA 2WULA 2X8GA 1O8WA 5JWRB 1U88A 1EGOA 3HVSA 1WPIA 1WRYA 2TRXA 2CZ2A 3ISOA 2H1GA 3D22A 2ZNMA 5KN3A 4MCUA 3PGTA 3HDCA 2H70A 2H1DA 2EIRA 2C0EA 2AJQB 1TRWA 3DKSA 4X43A 4WR4A 1X9SB 2DBCA 1B9XC 5GSTA 3ERGA 2E2GA 2LSTA 4ML6A 4KX4A 2WJUA 3VK9A 1AQWA 6GSWA 3TRPA 1V2AA 3FK8A 4OMVA 3P8WA 1SK2A 2QC7A 5ELGA 1SU9A 5H5SA 3A2VA 4G9HA 1EP7A 1FVKA 3IPZA 1BJXA 3O76A 1SKSB 1QFNA 1QGVA 2X99A 4PGTA 4RQXA 2K9FA 2L6DA 2YJHA 1U3AA 1F3AA 1HNBA 1ERTA 5DJMA 1YY7A 1DUGA 2PERA 1NW2A 3NIVA 2VM1A 4MH2A 4NHZA 1YQ1A 2VCTA 4RQRA 1I5GA 3ME7A 5L71A 4MF6A 1G7OA 3BCIA 3F6DA 3VURA 2IJYA 1M7TA 2HSHA 1E6BA 3EU3A 3KIJA 5DALB 1PSQA 2PUKC 3BBYA 1OAZA 4JRRA 1YF1A 4MK3A 4TXVA 2VD1A 3KZQA 3LWAA 3DVXA 4RI6A 1WMJA 2R37A 5F0GA 3ZVJA 5ECSA 4TRXA 3IAS2 3TKRA 3SBCA 2VCWA 2PU9C 4N0VA 3LFLA 2H76A 2MZCA 1DE2A 4QQ7A 3D0ZA 1T7PB 3D4MA 3F4SA 1O6JA 1V57A 1HQOA 3JCML 3TGZA 3IR4A 3C71A 2LQOA 2KHPA 3U5RE 3A3TA 5CRHA 3RDWA 3HD5A 3HZ4A 5EPFA 2DJ1A 3L0HA 2IMFA 1GRXA 1VGLA 2I9HA 1M0UA 3KTBA 4DVCA 3HZ8A 2HRFA 2LNTA 3CTGA 1FVJA 3WT1A 1OYJA 4O5RA 4F03A 5DVBA 3D6IA 1N8JA 3H93A 2GLRA 1ZL9A 3V1WA 2OACA 3PH9A 3GL5A 1F3BA 1EOGA 1BX9A 1TI3A 2VCQA 2GQMA 4PQIA 2CX4A 2WS2A 1KNGA 4MMMA 1WP0A 4POBA 4K7IA 2J9HA 4YQUA 2YCDA 3ZL5A 4JU5A 1A0RP 3UAPA 1QUWA 4LMVA 3FZ4A 4IS0A 5AIXA 1RW1A 3HVXA 1H75A 2G2QA 1SYRA 2OE0A 4BL7A 1B48A 5ECKB 4F0CA 4ZB8A 1Z7RA 1A2MA 4L0UA 1EP8A 2EIOA 5DJLA 4XRDA 1ERUA 1Z7PA 1THOA 3FR3A 3US3A 5J3RA 1AAZA 5CP1A 5ELAA 1R7HA 4L0WA 4GSTA 1GP1A 2ALBA 2JADA 1O73A 4I2UA 1FHEA 1XIYA 1B4PA 5C00A 2MMNA 5F8BA 5G5FA 2R5GA 3KJYA 4MH3A 2YN1A 5J4UA 3M0FA 1XWKA 4TR1B 1PGTA 1X5DA 2IFQB 2O89A 3O6TA 1KEBA 4BVYA 2AUVA 1EEJA 4WETA 1R4WA 3UOMA 3QAGA 2B1LA 1SKWB 1O7UA 2LJKA 2YWOA 4I6XA 3QMXA 4ZILA 2EC4A 5HFKA 3W8SA 2CQ9A 4ECIA 2RLIA 2WDUA 1U87A 4XHMA 1AQVA 2F51A 2VAFA 3A2WA 2C0FA 4J2FA 1KBNA 4KDUA 1BQ7A 4GXZA 1AQXA 4MPGA 5D8IA 2C1YA 2AB6A 2E7PA 1VF4A 1V40A 2F9SA 1H4OA 1I9DA 3GRXA 2GVPA 3VWUA 2LRNA 1EGRA 1TXXA 5E4WA 4JBBA 4KB3A 3GUSA 1SJZA 5IPHA 4KSMA 1AIUA 2H75A 4OFMA 4NXIA 1AW9A 1MEKA 1URMA 3EURA 2DLXA 3C73A 2M72A 2CZ3A 3F6FA 4KUNA 3EU4A 1TOFA 1TP9A 3CMIA 2FD3A 1BEDA 2GSSA 3M3MA 1GLQA 4O7HA 1TK8B 4ECBA 3IK7A 2YV7A 2KLXA 4TR0A 5ECQB 3KEBA 5DBQA 4KCAA 1GSYA 3EC3A 4KW6A 5CYYA 2HZEA 4EE0A 1A0FA 3CTFA 2V6OA 3M8NA 5ECRB 1SKRB 3GMFA 5GAPD 2LKUA 4POMA 4FIWA 2XBIA 4PXOA 4HU7A 3MDKA 3C7MA 1EEMA 3UARA 1FOVA 1UA5A 3BD2A 5EVOA 5A4UA 4KGIA 4OO4A 2QKEA 2JZTA 2FA8A 5G1KA 3ZFLA 2X64A 3EYTA 4KAEA 1PRXA 7GSSA 3DVWA 2A2SA 4ZL8A 5B8BA 4NMUA 3QFAC 2NVLA 4XS4A 2L4CA 1JLWA 3G9BA 4E8EA 3M1GA 4PUFC 4OCFA 2GGTA 2YOIA 2H6YA 2E2MA 2VIMA 4IP1A 3TJJA 4IP6A 1HYUA 3LGCA 1WWJA 4OFTA 2ON5A 3IK9A 2DJ3A 6GSYA 2YWNA 1YZXA 16GSA 4HZ2A 1G6YA 2LS5A 4N30A 3QAWA 3LG6A 2QSIA 2C0DA 3KD0A 4ZL9A 2B5EA 1SYXA 5H5RA 4L5OA 2F8AA 2H6XA 2LUSA 2CVDA 2LV3A 4LMWA 2JZRA 2DJ2A 3F9UA 4MJEA 2WGRA 3CSHA 4PQ1A 1K0AA 1K0MA 3TJGA 2YWIA 10GSA 1JZDA 2V32A 3GSTA 3EMPA 3DGQA 2CVBA 4J56E 5IMZA 1GSQA 2BMXA 2OKAA 3DXBA 5INYA 4KNDA 3TJKA 2H6ZA 4JZQA 2GQKA 1OC3A 5IMVA 2LRCA 5ECNB 3A5WA 1PKWA 1GULA 4EC0A 3HHVA 2DSAA 2PVOC 1XOBA 4PNGA 4HEA2 3KP8A 3Q6OA 3MAKA 1WJKA 3DRNA 1A23A 4YAVA 4KDXA 1GL8A 1XW6A 4Z7XA 4ID0A 4TXOA 1K0BA 2YV9A 1OE8A 4IJIA 2L59A 3IRAA 2JZSA 1PKZA 3W6GA 3GSSA 2RUEA 2TRCP 1OVNA 4HUAA 2L57A 1FAAA 2OA7A 3FR9A 1TTZA 1V98A 3J7Yk 1OKTA 4V1Ag 1ACVA 1EV4A 2R2JA 2C4JA 3MSZA 2P31A 2OE3A 3EE2A 3QDNA 4F9ZA 3E0UA 1G7EA 4NV2A 1TU8A 2IMKA 1VRSD 4IGJA 1FO5A 3F3RA 2VD0A 5J41A 3L78A 4EVMA 1B9YC 4WBRD 1NM3A 2I81A 1FG4A 1JZOA 2K6VA 11GSA 1WE0A 4D73A 4DSRA 4IQ1A 2E0QA 1VF3A 1PX6A 1WIKA 1W4VA 1M2AA 20GSA 1R26A 2EIQA 3BCKA 1ST9A 4MDCA 3ERFA 3KH9A 2R4VA 3M9KA 2AYTA 4MABA 3N9JA 5CREA 2B6MA 5D96A 3GV1A 5JCUA 1O81A 4F0BA 3IXRA 3TOUA 4ECJA 1PN9A 3PINA 2PN8A 4K7OA 3F63A 1A2LA 1PL1A 3LYPA 3UBLA 2VUPA 3TCOA 2I4AA 2LTKA 5CO3A 2NBSA 5IO2A 5GAND 1YEXA 2GZYA 3K8NA 3G7JA 4DSSA 4MJCA 2V1MA 1KTEA 3WT2A 1MDJA 3KCMA 5G30A 3KMNA 4Q5QA 2VL3A 4AJ7A 1RK4A 1ABAA 5D93A 1X5CA 5DCHA 2HXKA 1QK8A 3C1SA 2YJ7A 1GUMA 2X8CA 4GRFA 2LNSA 3TRXA 4NWYA 2GZZA 1A2JA 6GSSA 3KXOA 1K3OA 1HD2A 1RQMA 1OE7A 4WF5A 2P0GA 1SJIA 3F8UA 3CRTA 2HZFA 1ZZYA 8GSSA 3ME8A 2HFDA 1K3YA 5HR1A 1JZRA 1HNAA 3C8EA 2MYGA 4BWQA 3QR6A 17GSA 4MZCA 4XRAA 1T4YA 2H30A 5HR3A 3DWVA 3CRUA 3H79A 2HZEB 2DIZA 2FY6A 2GT6A 4WF4A 5D9XA 3SWLA 4DSQA 1JLVA 5CRWA 1J08A 5G2ZA 1GWCA 1K0NA 5IM9A 1SL1B 2HSYA 1T00A 2GZPA 2L4QA 4G10A 4ZIJA 1XOAA 1Y6EA 1GH2A 1J0FA 2BTOT 5A4WA 5IMAA 5EL8A 2VL2C 3ZVJD 1G0TA 2OADA 1F9MA 4Q5FA 3RHBA 4XS4B 22GSA 4F82A 3KP9A 2B7KA 1X9WB 9GSSA 2PWJA 2H8LA 3GA4A 4K1FA 6GSTA 1FB0A 3GFKA 1XBSA 2B1KA 3BOAA 2WCIA 4Q5NA 5FT3A 3TJBA 1WOUA 4MZWA 2H0GA 4TR3A 5F05A 4I5QA 4ZBAA 1FB6A 3FZ5A 4XTSA 1XVQA 2L5OA 3GH9A 4Q5RA 2YNXA 3CSIA 5HR0A 3ZIJA 2ZCTA 5JWOB 3GL3A 3TUEA 3ZMLA 5J9BA 1S3AA 1TDIA 1ZMAA 1O85A 5ECOB 5G5EA 3P7XA 2AHEA 3ZFBA 4GQFA 4TR4A 3ZMKA 3CYNA 4L8EA 4N11A 2R3XA 2M80A 4ECCA 3APQA 1R5PA 3OR5A 1BAYA 5JCWA 2JACA 1TU7A 1XFLA 2KP2A 1OC9A 18GSA 2C3QA 1PQNA 1YKAA 5ECHB 4TXOB 3H1NA 4HU9A 5EY6A 2N5AA 3MWHA 2F8FA 3IBHA 4ZL7A 2OJLA 4RUVA 2KP1A 3QFBC 2K8SA 3F0IA 2WB9A 5AIVA 5G31A 3TKSC 2MMAA 3HVVA 1SL2B 4GTUA 3TDGA 4V2MA 4MA9A 4JEDA 3DMLA 1THXA 3C1RA 3DEXA 3WGEA 2DC5A 4G2EA 4GF0A 5LCZA 3FRCA 2H1BA 4FYCA 1T4ZA 1XW9A 2PGTA 1ERWA 1ILOA 4YH2A 4MP4A 4K6XA 3WD6A 5A4VA 3GX8A 4I2TA 3HJPA 1Q98A 2HE3A 4OWYA 2FCHA 4D73B 4DEJA 3RPPA 1TRSA 4GCIA 2MBTA 2GS3A 2MBSA 4HDEA 3ZIVA 4PNFA 5IMDA 1Z3EA 5GZZB 2GSTA 4K7NA 1Q4JA 1W89A 2A2RA 2CVKA 3GYKA 3UVTA 4E8HA 1F6MC 5IOXA 2C0GA 2MMOA 5D9VA 1K0DA 1SL0B 3P2AA 2K18A 1LJRA 4WR5A 1YDKA 1AUCA 1GNWA 4MJBA 4DSSB 5CNWA 2IPAA 1N2AA 3F4RA 1XZOA 4I8BA 3L4NA 3H4KA 5COHA 2JSYA 4ISDA 2MMZA 3KTLA 1GSEA 5ECMB 4AGSA 3IE3A 4IN0A 2WRTA 4ZXGA 3WYWA 4MJAA 4NAXA 2LRTA 3QCPA 5JCGA 2JL4A 5B8AA 4ZBBA 2GSRA 2TIRA 2H74A 4IHUA 2GT5A 4WKWA 2O87A 3LSZA 2L6CA 3UL3A 3TOTA 4P3YB 4FO5A 4EDYA 3HKRA 2CA8A 4WBJA 3ZRDA 1Z6NA 4YAPA 5AGYA 1CQGA 1T3BA 4TN8A 1MDKA 2D2ZA 3GH6A 4K8MA 5G1LA 3VWXA 4XCSA 5DCGA 3UBKA 4KH7A 1XWCA 1CQHA 2OBIA 3HCZA 3LXTA 1GUKA 2H66A 2YZUA 5DDLA 4MZBA 4V1Ap 4PURA 4AF2A 1SENA 4IBPA 1TW9A 3VPTA 3QAVA 5HFGA 2B3SA 4YQMA 3R2QA 5IMFA 1QMVA 3ZZXA 4JE1A 3GHAA 2DJKA 4V2NA 4POKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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