2FXUA

X-ray structure of bistramide a- actin complex at 1.35 a resolution.
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
368
structure length
360
Chain Sequence
b'ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structure of bistramide a-actin complex at a 1.35 A resolution
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 121
structure length 360
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fxuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fxuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2fxuA03
1Z05A 1U6ZA 2Q2RA 4CZMA 4CZIA 1SQKA 3ULEA 3VENA 2YHYA 1YUWA 2E1ZA 1X3NA 4O8KA 4BVOA 2CGJA 4WQ5C 3CJBA 2VWBA 3FZLA 1RFQA 4BR4A 2BUPA 1ESVA 2P9IB 2NZTA 4ISFA 1E4GT 4BRQA 1Z6RA 2P9KA 2ZWHA 3CIPA 3EKSA 3HSCA 3SLCA 2P9NB 4WQ4C 1OKJA 2PBDA 4RTFD 4BR5A 2E8AA 3A5MC 3G25A 4BQLA 2Q36A 3C7NB 3CQXA 3J8AA 2W40A 5AZJA 4IZ9A 3QB0A 3FFKB 1X9JA 4CD3A 3D2FA 1GLDG 2YJFA 3QFPA 3EN9A 4BREA 4CJ7A 1R59O 4BC3A 2CGLA 4MO5A 2FSKA 4QS7A 4I6MA 3GBTA 3ZETB 4FOIA 4A2BA 2ASPA 2QXLA 3D2EB 5AFUH 1ZC6A 3H6EA 5KQ8A 3VEOA 3VGMA 3ZEUB 4IXCA 2ZGZA 5AZIA 1XC3A 3LM2A 4FWKA 4FWNA 1NGAA 5BRDA 2UYTA 2OANA 4CD1A 3H45C 3KZBA 3ZX0A 3MN7A 1J6ZA 2IVPA 1K8KA 2DPNA 2F9TA 3DXKB 4IJNA 5AQWA 4BRDA 4A2AA 1S3XA 3O5BA 5BPNA 4YDUC 1NGDA 2IIRA 3A5OC 3EKUA 3MCPA 4O5FA 4FOEA 3CJAA 3S41A 4BG9A 4CZLA 5EVZA 2E2QA 4FWPA 1QZ5A 3HBTA 4H0OA 2P9IA 5KPZA 2FSNA 5AR0A 3VESA 1NGEA 2PAVA 4M7XA 1DGKN 3P4IA 2V7ZA 3VETA 5LJWA 2FXUA 2P9NA 3L4IA 1V4SA 5KPTA 1DEJA 1HLUA 3M6GA 3MK6A 1NGGA 1BO5O 2E2NA 3C7NA 4AM7A 4BGAA 2QWPA 3QICA 3QFUA 3VF4A 2I7PA 3U9DA 4BQZA 4BROA 1LOTB 5AQVA 3MMVA 3ZX3A 4YDUA 1ZXOA 1QZ6A 5FPEA 2ASMA 2QWNA 3FR0A 1SAZA 4BRIA 3AAPA 3ZX2A 3VGLA 2YHWA 5TKYA 4FPBA 4BRNA 4XEIA 3D2EA 1ATRA 5E26A 5KQDA 4CI6A 4GNIA 3ZEUA 3O6WA 1HJOA 5AZIB 5EY4A 4PKIA 1NGFA 4PL7A 3CJCA 2GEMA 3BEXA 1QQNA 4B9QA 1D4XA 2P9LB 5BN9A 3VEWA 4EIAA 3R6MA 2I7NA 2D0PA 3CJ1A 1MDUB 1K8KB 3D7EO 3JS6A 1YVNA 1MWMA 1EQYA 1NLVA 4MLEA 1NGJA 1TYQB 3EZWA 2KHOA 3FZKA 3QBXA 4BRLA 4BRGA 4H5RA 3AY9A 3QBWA 1KXPA 1T44A 3WQTA 4QS8A 4XH1A 5BN8A 2QWMA 3KHYA 3UE5A 2QWQA 5AQHA 4QS9A 4H0VB 4BR0A 1Y64A 3GL1A 5AQZA 4JHDA 4B1WB 3SK3A 3FZHA 5ADXA 5F1XA 2YCHA 3HI0A 4BRMA 4EHUA 1S22A 3LDLA 1CZAN 5AQOA 5AQQA 1BA0A 1GLAG 2FF3B 3ATVA 5AQJA 3HZ6A 4FWQA 4IO8A 3MN9A 2A3ZA 3CJ7A 3VF2A 1HUXA 1YXQA 5AQNA 2ZF5O 3FGUA 4BRPA 1KAZA 4BC2A 4L3QA 4B1YB 4CZKA 3ID8A 3EO3A 2V7YA 4H5WA 5AQGA 3O08A 1BDGA 4MLHA 2QWOA 1BWFO 3BF3A 4PKGA 1HX1A 3DJCA 5LY3A 2YHXA 5BPLA 5AQRA 4CZFA 3VOVA 5AQXA 4K41A 3WXKA 2W41A 3IFRA 4BR9A 3MN6A 2P9LA 3U8XA 3A0IX 4ISEA 3BF1A 5AQUA 3LL3A 3O8MA 3GDQA 2Q97A 3L6QA 3GE1A 2H3GX 3DXMB 1TYQA 4B1VA 4Z94A 5AQTA 1LCUA 2E1YA 4IWVA 4BRHA 3LDPA 3WQUA 1XQSC 4BR2A 1HKBA 2V51B 4RWTA 1KAYA 3ENOA 1C0FA 3VEXA 5FPDA 3AARA 3VERA 5AQYA 4K42A 4H5NA 3O4WA 5E84A 4EHTA 3VEVA 2AA4A 3MN5A 4JHDB 3FZMA 2A41A 3AAQA 3M3ZA 5FPNA 4JNEA 1NM1A 3JXUA 3GG4A 4IJAA 4FWMA 4DHYA 3SMPA 2D1KA 5EXWA 2YJEA 2HF4A 4XH5A 3WXIA 4EAHD 4WYBA 3CETA 1NGBA 1QQOA 1P8ZA 4H03B 3B8AX 4FWLA 2A42A 2ZGYA 4A61A 4CBUA 1NWKA 1ATSA 3UKRA 5AQIA 2QWLA 3A5NC 3VEYA 3H3OB 3I8BA 2GELA 3I33A 4H0PA 1GLLO 3TPQA 2F9WA 5ELZA 4K25A 1C0GA 2V52B 2WUSA 4NO7A 5EX5A 5BPMA 1SZ2A 2NRHA 3A8YA 3CERA 1NGIA 3ENHA 3TU5A 3OHRA 3WEEA 3CJ9A 3HTVA 3H46O 5AQPA 2P9SB 2CGKA 4BGBA 3F9MA 5AQFA 1JCEA 4FWOA 4FO0A 2FLOA 2VYPA 3DXMA 4DB3A 2VCPA 2E88A 4JAXA 5BR9A 4MO4A 1GLFO 1GLBG 5AQKA 2YI1A 4JD2B 3WUHA 2J4RA 1WUAA 2HMPA 3LM9A 1IJJA 1TUUA 4CZJA 2IVNA 3WT0A 4BRKA 5F0XA 3IMXA 1GLJO 2AP1A 2P9PA 4CZGA 1BU6O 4K43A 1QQMA 1MA9B 5ADXH 5B8HA 1T6DA 3QDKA 4B1XB 4XH4A 3U9ZA 5BREA 1BUPA 1NGHA 3ATUA 2P9UA 4NB4A 5JLHA 1V4TA 1HKGA 3CHWA 3UKRB 4M63C 2ITMA 3WXJA 3WXLA 4B1UB 2HF3A 5JICA 3VGKA 1E4FT 3UKUA 1GLCG 1BOTO 5LJVA 3KVGA 3IDHA 1BG3A 4GY2B 4BC4A 4BRCA 2Q1NA 5JMVA 1NBWA 1JCGA 2E2OA 3WEEB 1QHAA 2A40A 2Q0RA 2P9SA 5AQSA 5F2RA 4DCHA 1DKGD 3SMSA 3FZFA 1ZBSA 1NGCA 2CH5A 3H1QA 5AFUA 4BC5A 4ISGA 4E1JA 4WQ5A 4C23A 3CI5A 4AM6A 4H0TB 2A6AA 4H5TA 4LC9B 1MWKA 4H5VA 1U2VB 2EWSA 4FWSA 4JD2A 1Q18A 3VPZA 4WQ4A 2FF6A 5I9EB 1HKCA 3RSEB 4CZEA 1G99A 3DAWA 2Q31A 2HOEA 3VF6A 4HTLA 2Q0UA 5EOYA 4KBOA 1RGIA 3O1WA 2P9PB 2ASOA 3IUCA 4FWRA 2QM1A 2IVOA 5BRFA 1BA1A 3ULEB 4FL9A 1JCFA 4JN4A 4F9OA 3HM8A 3LDOA 2GUPA 3H3NO 5FPMA 1X3MA 2E20A 3UB5A 3FE1A 1TUYA 3CQYA 3O1BA 3QMLA 1NMDA 2BTFA 4H0YB 2P9UB 1GLEG 3MDQA 1H1VA 4B1ZA 5CE3A 4BVPA 3R8EA 2P9KB 1IG8A 1KAXA 1YAGA 1RDWX 2D4WA 2NLXA 5AQLA 3DWLA 4H0XB 5AQMA 3R9PA 4CBWA 5KPRA 1HPMA 4Y0WA 4DQ8A 4PL8A 2GWKA 3C0BA 3UKUB 2GTDA 4A62A 4PKHA 3GOIA 4FSVA 1ATNA 4HWIA 5AZJB 1T6CA 4CBXA 3D2FB 5BRHA 2D0OA 4BRFA 4CZHA 1WOQA 1XUPO 4J8FA 2QW9A 3VEZA 3W3DA 3O80A 4M7YA 3ZETA 3FLCO 4I6MB 3A5LC 4BR7A 3M1FA 3BP8A 4RCHA 3LDQA 2GWJA 2CH6A 2E2PA 3EL2A 4EFHA 3L0QA 1U2VA 3W0LA 2FSJA 5JLFA 4BRAA 3LDNA 4FPAA 2QWRA 3RSEA 3SJHA 2A5XA 3BUZB 3H1VX 3DXKA 4BG8A 3U4LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1U6ZA 2Q2RA 4CZIA 2ZM6K 3QEPA 1YUWA 3AVCA 1CZ9A 3V9UA 4JI5K 3CJBA 2BUPA 4ISFA 3NFAA 4PA1A 3VQ5A 3CIPA 3HSCA 3VQAA 3CPWM 2P9NB 4WQ4C 3K9JA 4BR5A 4M3TA 3G25A 3VA0A 4IBNA 4YNQA 3DLRA 2Q36A 1IKVA 3HYFA 2RPIA 3J8AA 5C10A 3L3VA 4OPAA 4CHYA 4BE7B 4CGDA 4IZ9A 1IKYA 1TKDA 4DTMA 3O9UA 4DLEA 2HHTA 2YJFA 3EN9A 3F73A 3BDPA 3RR7A 2W42A 4IFVA 2FSKA 2JWKA 4QS7A 5IWAK 1LW0A 3LALA 3GBTA 1W2BM 1VRTA 4A2BA 2UXDK 3ZSYA 3DOKA 5H1SQ 2O8CB 3H6EA 5HROA 2KZZA 5GIPA 3LM2A 4E89A 1NGAA 2UYTA 3PLAA 1J5OA 3M8PA 3ZSZA 4IJNA 1J6ZA 2DPNA 5AQWA 2IVPA 2F9TA 1HYVA 1NMNA 1REVA 2E6LA 1RT7A 2VG7A 4A2AA 4BRDA 5BPNA 3HXMA 3SPZA 1N6QA 1BL3A 1HNVA 4YDUC 2W6KA 3K5LA 1NGDA 2Z1HA 3HOSA 3MCPA 3CCRN 4QOZB 4YORA 3QLHA 2HBLA 3HBTA 3SNNA 1SL1A 4BY9C 3V9ZA 4CHPA 3DLBA 4CJRA 4LF7K 3VESA 4CECA 1TKTA 3SBTA 1VQ9N 2OYQA 3VETA 2FXUA 1J53A 2HW3A 4CGJA 1N32K 1VHXA 3EE9A 2XY7A 1HLUA 3T69A 3PY8A 1Q81O 3AVHA 1TAQA 1NGGA 1BO5O 2OCEA 3QICA 4G1QA 3U9DA 3G4SN 4BROA 3LPTA 4E7JA 2A1SA 4YDUA 3I8DA 1QZ6A 5M1FA 4K8ZA 4IKFA 3NGYA 1SAZA 3AAPA 4KB0A 1VSDA 1DTTA 4FPBA 3AVJA 3PV8A 3J80O 2W00A 5E26A 1K8AO 3F5TA 3ZEUA 4JRQA 5GINA 5EY4A 1LAWA 3CCEN 4Z4FA 4DTXA 1U47A 1SL2A 2HHWA 1RDAA 3I0SA 2F4VK 1KC8O 4FJJA 4DTOA 2BANA 3E9OA 3CJ1A 3P31A 1B9FA 1YVNA 3CQ8A 4WF9L 1MWMA 1L3TA 1NGJA 4NCAA 3EE8A 4YOXA 2QI2A 3T1AA 1RT6A 2UXCK 3CCUN 1WB9A 4BG8A 4JKHA 1N8RO 4BE0A 1D9DA 4B1WB 3FZHA 1QSLA 1S22A 4ELVA 3PIPL 1Q8IA 3K58A 3C95A 1XMQK 3ATVA 5AQJA 4KH5A 4LH4A 1TL1A 2HB5A 3MN9A 1HUXA 2OPQA 4LY7A 2UUAK 4EP4A 4AILC 3FGUA 4LSLA 3TAQA 2OTLN 2O8EB 3ID8A 3EO3A 2V7YA 5M1QA 1RILA 4X62K 3ZT2A 3BF3A 4FVUA 1QSSA 4CZFA 3IFRA 3OYCA 3MN6A 2P9LA 2W6LA 3U8XA 4ISEA 3OY9A 1S9GA 3ITHA 3HJFA 3O8MA 4I2QA 3PX6A 3GDQA 1TYQA 4Z94A 3K0SA 5KI6A 4GVEA 1OH8A 5KTQA 3OYMA 4C1NI 2WOMA 4FJXA 3J7ZO 1KAYA 3ENOA 4CJVA 4N47A 4DSJA 3CD6N 2JLEA 5E84A 3ZSWA 4MFBA 3AO5A 4IFYA 3T19A 4C8MA 2KFZA 2A41A 3M3ZA 2O8FA 4JNEA 1NM1A 4M41A 4DTPA 4B3RK 4IJAA 3SMPA 2D1KA 2YJEA 3WXIA 4PWDA 4EAHD 3SQ4A 3CETA 1NGBA 1P8ZA 2A42A 2XY8A 4AHCA 1VQKN 4CVNE 1NWKA 5M1OA 3UKRA 5AQIA 3U3YA 3VEYA 1BCMA 3H3OB 1S6QA 3HM9A 3I8BA 3MX5A 4E7KA 2HHHK 1MU2A 3TPQA 4K25A 2WUSA 4NLBA 1RTDA 4I9LA 3OVNA 3N4PA 1SKRA 4F3OA 1JXBA 4IDKA 3OHRA 2P9SB 2QKBA 4BE2A 2CGKA 1A5WA 1I94K 3VQ9A 3F9MA 5AQFA 1FW6A 4FWOA 4CK3A 3U6FA 1VQLN 3KK3A 4ELTA 3PUFA 3CFOA 3E9LA 1HYSA 2JGUA 4JAXA 2FC0A 3QEWA 4CK2A 3VMFB 5AQKA 4JD2B 1UA1A 4GMJB 3BY5A 4R5PA 1WUAA 2IVNA 5HRSA 2C1GA 3WT0A 5T7BA 3D0PA 2OZSA 4BRKA 2O8DA 3OYGA 1GLJO 2P9PA 2IC3A 1BU6O 2KW4A 4JK8A 4NLCA 5JVGL 3NF8A 4BE1A 3OYIA 5ADXH 5BR8K 1L3SA 3V9WA 4XH4A 3SJJA 4CE9A 4CEAA 4OPHA 5C12A 1SKWA 3ATUA 2P9UA 4XJXA 3AO3A 3C6TA 3ENBA 4LF4K 2G8FA 4O44A 4CJ3A 3QEVA 2HF3A 4B9SA 3VGKA 5AJ3K 3UKUA 1GLCG 4JKGA 5CR4A 5LJVA 4O5BA 4C8NA 4Q0BA 3TAPA 4Z0UA 1BG3A 1N33K 4DUYK 1CXUA 3HPOA 4N76A 1BCOA 2A40A 4DCHA 3CC2N 3F9KA 3FZFA 1JXEA 3H1QA 2DFFA 4DV2K 3S9HA 4DQPA 4WQ5A 2YNIA 2DY4A 4DUZK 1IH7A 3CI5A 4OKKA 3HRGA 4CEEA 3VQBA 3TAMA 1QTMA 4FW2A 3RRGA 1BIZA 1MWKA 1U2VB 3DLLL 4CJSA 1Z25A 2G8VA 4JYAK 3VQ6A 1HKCA 4CZEA 3DAWA 2IDOA 3JYTA 3WNFA 2Q31A 1NG9A 4FZXC 3ZSXA 4XIUA 3L2VA 3EYZA 3QO9A 2ASOA 2D0AA 4RW7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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