2FXUA

X-ray structure of bistramide a- actin complex at 1.35 a resolution.
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
368
structure length
360
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structure of bistramide a-actin complex at a 1.35 A resolution
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 121
structure length 360
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fxuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fxuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2fxuA03
1HJOA 3HI0A 5EXWA 2HF4A 4WQ5A 3ULEA 5AQLA 4NB4A 1C0FA 3MDQA 3CIPA 4IZ9A 4GY2B 3RSEA 4B1ZA 2P9IB 2P9LB 5JLHA 3HZ6A 3P4IA 2ZGYA 3C7NB 5AQIA 3WEEB 2NLXA 3KZBA 3VETA 2A3ZA 4ISGA 2EWSA 2NRHA 4FWNA 4BGBA 4YDUC 2F9WA 4Y0WA 4BRPA 1S3XA 1V4SA 3JS6A 1Y64A 1ESVA 3VPZA 3R6MA 3BEXA 2P9NB 4BRIA 3H46O 2GWKA 4QS7A 4H0TB 2P9IA 3AAQA 4HTLA 2P9LA 2QXLA 4EIAA 3UKRB 2KHOA 3H3OB 4BROA 1BO5O 3SMSA 4FOIA 4BR2A 1NGAA 2IVNA 1RGIA 2V52B 2W40A 2ASPA 2A5XA 3DWLA 3GOIA 4F9OA 5BPMA 3MK6A 3O4WA 3C0BA 1MWKA 3I33A 4FWPA 3CJBA 5AR0A 5I9EB 1NM1A 2CGJA 1KAYA 1HX1A 2P9NA 3GBTA 5BRFA 2YHXA 2FLOA 2FXUA 2NZTA 4BC5A 2P9UA 3SK3A 2GELA 3O8MA 3A0IX 1GLFO 3MN5A 3UE5A 4H0YB 5ADXH 1GLJO 1YXQA 3OHRA 2ZF5O 4PKIA 3D2FA 1ATRA 4MLEA 3QBWA 2E8AA 4H03B 3VGMA 3S41A 4NO7A 1P8ZA 2VWBA 1BOTO 3WQUA 5TKYA 3ZX0A 1CZAN 2CH6A 4DCHA 4E1JA 3MMVA 4B1YB 1TUUA 5EX5A 3CQYA 3H1VX 1ATNA 3HTVA 1HKGA 5ADXA 1U6ZA 3A8YA 3O08A 2A41A 4CJ7A 3LM2A 1TYQB 2VCPA 3UB5A 4JN4A 3KHYA 2Q0RA 4DQ8A 3FZMA 4EHUA 3EN9A 2AP1A 5FPNA 4BRLA 4FL9A 3ATVA 1OKJA 4JHDB 2FSJA 1YVNA 4IXCA 3LDQA 5AQOA 1Z05A 5AQRA 5AQUA 3O6WA 4BC2A 3DXMB 1HUXA 4AM6A 4FPBA 3ZX2A 1BDGA 3D2EB 5LY3A 3QMLA 1SAZA 4WQ4A 2OANA 3VEYA 1GLLO 4XEIA 1BG3A 4A62A 3BUZB 1KAZA 2E2QA 2E88A 3QDKA 3WXIA 2GTDA 3MN9A 4FWSA 1QQNA 4B1VA 5AZIA 5BRHA 3IDHA 4MO4A 3FFKB 2GWJA 3ENHA 2D1KA 2W41A 3VEWA 2QWLA 3ENOA 2P9PB 1NGIA 2D4WA 3DXMA 4BGAA 1T44A 3D2EA 1Q18A 3ZEUA 1SZ2A 1D4XA 1GLEG 2V51B 3L6QA 4B1XB 1X3NA 4CZLA 2E2OA 2QWMA 2Q0UA 2A6AA 2YI1A 3I8BA 4ISFA 4BQLA 1NGDA 4GNIA 4IO8A 3ZETB 5E84A 4JNEA 5BREA 4BRGA 3HBTA 4XH1A 5BPNA 4BRMA 5BN9A 4EAHD 2V7YA 5AQPA 4IJAA 4YDUA 4CZMA 3GDQA 3QFUA 1ZBSA 1ZXOA 3VEXA 2D0OA 1JCEA 1WUAA 1BA0A 3CERA 4LC9B 2YJFA 3U4LA 2E1YA 2ZWHA 1MDUB 4RCHA 4CZFA 1Z6RA 2P9SB 2QWQA 3VGLA 4H5VA 3AAPA 4H5TA 2E2PA 5AQVA 2QWPA 4CZEA 5AQGA 3ATUA 4FWLA 4L3QA 2YHWA 3O5BA 3C7NA 5F1XA 5LJVA 3UKUB 3WEEA 1J6ZA 5AQSA 5KQDA 4PKHA 3EZWA 4H0PA 3LDOA 4MLHA 3VERA 3CJAA 3A5MC 3EKUA 4KBOA 3VF6A 1MA9B 1E4FT 5LJWA 2F9TA 3DAWA 3J8AA 2P9SA 2Q1NA 1NLVA 4BREA 2ITMA 4CD1A 4EHTA 4FO0A 5AFUH 3QBXA 1WOQA 3M6GA 2D0PA 2PBDA 2I7PA 4BRNA 3UKRA 1ATSA 5KQ8A 3W3DA 1NGGA 1NGEA 1JCFA 2QWOA 4BG8A 2H3GX 5AQZA 3IUCA 5AQXA 3EKSA 3CJ9A 1IJJA 2QM1A 5EOYA 5AFUA 3IFRA 4BR4A 4BC3A 1TUYA 4DHYA 4K43A 2GEMA 4I6MB 2GUPA 4FWQA 1RDWX 1DGKN 3R8EA 4CZHA 3BF3A 3IMXA 2ASOA 4JD2B 1C0GA 1HKCA 2CGLA 4CZJA 3G25A 2I7NA 1QQOA 5AQWA 4H5NA 5ELZA 3SLCA 2E20A 4BRFA 4IJNA 2UYTA 2QW9A 4HWIA 3LDNA 4ISEA 4K42A 4M7YA 4IWVA 4K25A 2FF3B 2P9KB 1U2VB 2BUPA 5AQMA 1TYQA 3FE1A 3MN6A 4DB3A 3WXJA 4BR0A 4FPAA 4CZIA 3VEOA 4BRAA 4JHDA 2FSNA 3FGUA 3CHWA 4BR7A 4RWTA 1QZ5A 3AY9A 3FZHA 2IVPA 1GLCG 3O1BA 3H1QA 2HMPA 1NMDA 3H6EA 3VF2A 3LDPA 4MO5A 2P9KA 2Q31A 1U2VA 4AM7A 2V7ZA 3DXKB 2QWNA 3VOVA 3A5LC 4BRHA 3EL2A 1XC3A 4B1WB 1RFQA 4O5FA 5F2RA 3CJ7A 5KPTA 3O1WA 3ULEB 5F0XA 2P9PA 3CETA 5BR9A 2QWRA 3M3ZA 2Q2RA 3O80A 1XQSC 1QHAA 3MCPA 3RSEB 1GLDG 2WUSA 2YCHA 4PKGA 3VGKA 5AQYA 1R59O 4A2AA 4M63C 4FWKA 2YJEA 4CZKA 4FWMA 3A5NC 4RTFD 1S22A 5EY4A 3TPQA 4BRDA 2VYPA 4JAXA 3ZETA 3QB0A 1YAGA 3GL1A 3B8AX 3BF1A 4K41A 3VENA 1X9JA 2Q97A 1E4GT 1BU6O 5JICA 3TU5A 5AQJA 5E26A 4WQ5C 5FPEA 4A61A 3WXKA 3A5OC 2E1ZA 1BA1A 5AZJB 3VEVA 3WUHA 4QS9A 5B8HA 2CH5A 4PL8A 3M1FA 3FR0A 4QS8A 1GLBG 5BPLA 3AARA 3LM9A 2E2NA 2P9UB 3GG4A 3LDLA 5JLFA 3U9DA 1HLUA 4CZGA 4XH5A 5CE3A 3UKUA 2A40A 2IIRA 3D2FB 5AZJA 5AQNA 4B9QA 4BQZA 3SJHA 3QICA 4CD3A 3CI5A 1KXPA 4BRQA 3MN7A 5AQFA 4J8FA 2PAVA 4H5WA 4FSVA 2HF3A 1NBWA 1HKBA 1QZ6A 3CJ1A 5KPZA 3VF4A 2BTFA 2CGKA 1NGCA 4BG9A 1BUPA 3WXLA 1LOTB 3BP8A 3FZKA 5BRDA 3DJCA 2HOEA 3HM8A 1NWKA 2AA4A 4B1UB 4BC4A 3CJCA 5JMVA 3W0LA 5EVZA 1K8KB 1GLAG 4H0XB 3R9PA 1IG8A 4I6MA 2DPNA 5BN8A 3CQXA 4FOEA 3FZLA 3FZFA 1NGJA 1QQMA 4JD2A 2FSKA 3VEZA 5AQKA 2A42A 3ZX3A 5KPRA 4Z94A 1SQKA 4H0OA 4BRCA 4PL7A 4H0VB 3ID8A 4CBWA 1JCGA 1NGBA 4C23A 5AZIB 1K8KA 1LCUA 2ZGZA 1NGFA 2J4RA 2IVOA 1G99A 4BR5A 4CBXA 4EFHA 3GE1A 4H5RA 3WQTA 4BR9A 4A2BA 3QFPA 3LL3A 1KAXA 4WYBA 3D7EO 3JXUA 3ZEUB 2FF6A 2YHYA 4BVOA 4O8KA 3WT0A 1EQYA 1X3MA 3SMPA 1NGHA 3VESA 1T6DA 4CI6A 4BVPA 1DEJA 4CBUA 3H45C 4WQ4C 3L0QA 3U9ZA 4M7XA 4FWRA 3HSCA 3FLCO 1MWMA 1T6CA 2Q36A 3H3NO 1BWFO 3F9MA 5AQHA 3U8XA 3L4IA 4XH4A 3KVGA 4FWOA 1DKGD 5AQQA 1H1VA 3DXKA 1HPMA 1ZC6A 1XUPO 1V4TA 2ASMA 5AQTA 5FPDA 3EO3A 5FPMA 4BRKA 1YUWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1F21A 4CIFA 4DR3K 1C0FA 3MDQA 4B9LA 3VTIA 3CFPA 5JLHA 3HZ6A 3P4IA 4M3RA 4DTPA 3KZBA 3PIPL 3LALA 2HBJA 2F9WA 4HHTA 1A5XA 4BRPA 2KZMA 3LP3A 1ESVA 3VPZA 3R6MA 4FJGA 4K8ZA 3H46O 4KPYA 3CYGA 4H0TB 2P9LA 1KSPA 1RBSA 4CHYA 4BROA 3SMSA 4CERA 3NVMA 1S1TA 2A5XA 1MWKA 3P38A 4CF0A 4PA1A 5A2QO 1LWFA 4RG8A 1N34K 1S5JA 5JS1A 2P9NA 3C6UA 5BRFA 2QKBA 2FLOA 1FKOA 4FLTA 1ITGA 2FXUA 4KHWA 1EXQA 4RW6A 4YOYA 3O8MA 4JK7A 1OVQA 1ZBFA 1JXBA 4FJ8A 3MN5A 4H0YB 4YOXA 4PKIA 4ZTFA 1VSIA 4DU3A 4MLEA 4YFUA 1VAZA 2VWBA 3VTHA 1BOTO 2E5LK 5EX5A 4CHOA 4LF9K 2JWLA 3AO3A 3H1VX 4H4OA 3MX2A 5ADXA 3A8YA 4CJ7A 4GVMA 2VCPA 3OY9A 4GKJK 3KHYA 2Q0RA 3EN9A 2AP1A 3QIOA 4FL9A 1Y97A 1N5YA 2Z1IA 2FBYA 4LFBK 2W6KA 2FSJA 4CGHA 4IXCA 1KTQA 2NRXA 1Z05A 1NKCA 2XO7A 3WNFA 3P5JA 2W6LA 1NG9A 1BDGA 3TAPA 2OZSA 5LY3A 1W7AA 4JKGB 2HHTA 1GLLO 3TAQA 3OBWA 2NRWA 3OYMA 3WXIA 3SPZA 2WTUA 3M5RA 1XMOK 2GWJA 3ENHA 2D1KA 4DTSA 1HYSA 3ENOA 1IV0A 4B9SA 2D4WA 2OPPA 2VGMA 1SKSA 1QVFM 1T44A 3D2EA 4CEEA 1Q18A 3VQCA 2BH1A 4DFKA 3N4PA 1GLEG 1X3NA 2KZZA 4FLVA 1SV5A 2YI1A 2ZJPL 4BQLA 4HUFA 2DFEA 4CJVA 3AA3A 5E84A 4JNEA 3AVLA 5MLCQ 1I39A 4CGDA 5BPNA 3OYCA 5BN9A 4IO9L 1HYVA 4EAHD 2V7YA 4YDUA 4CK3A 4JRPA 4CIEA 4CZMA 3K2PA 3LP1A 2X6SA 2NUBA 1ZXOA 3TSPA 3VEXA 4CFBA 1WUAA 2YJFA 1B92A 3KLIA 5HLFA 1XNRK 2HMIA 4KAZA 1HYZA 4LF4K 4MQ3A 4Y1CA 3DLHA 1HR0K 3AA5X 1XMQK 3OYKA 3CMEN 2QI2A 3CFOA 1WSFA 4JKFA 3HOSA 3VQAA 1CXQA 4AHRA 4C8LA 2WBNA 3CF5L 4HVJA 1VQ8N 2YKMA 2XY7A 2O8EB 3LDOA 4MLHA 3VERA 3S3NA 1RTIA 3EKUA 4KBOA 2KW4A 5KTQA 3MX5A 4U7BA 3J8AA 2P9SA 3ZLJA 1NLVA 3NH0A 4BREA 4DV6K 4CD1A 1NOZA 3DM2A 2IAJA 1WOQA 3VQ8A 4ELVA 5IWAK 4BRNA 4E89A 1N8RO 1ATSA 3MEGA 3W3DA 2O4IA 4BECA 1FK9A 3BZCA 1NGEA 4CJEA 3OVNA 1SL2A 3SUQA 4CJLA 3HYFA 3IUCA 3OYBA 4BR4A 3D0PA 1EX4A 3VQ6A 5C24A 4DHYA 3T19A 1LAWA 4K43A 1N32K 3TWHA 3BDPA 1X9WA 1RDWX 1RILA 1C0TA 2ASOA 1T8EA 1L3SA 2Q3SA 4KH5A 3L2RA 2YNIA 4OGEA 4OX9K 2WC9A 4DTUA 1QQOA 5AQWA 4H5NA 5ELZA 1YJNN 3WXMB 4BRFA 2QW9A 1RBUA 3LDNA 4U67L 2VWJA 2OPQA 4ID1A 4PY5A 2P9KB 1U2VB 1VQ7N 1RT7A 3VEOA 2RPIA 2HHVA 4IFVA 3CHWA 1C0MA 1QZ5A 3AY9A 3CCSN 3L2QA 2IVPA 1GLCG 3ZSYA 1NMDA 3VF2A 2IS3A 1T03A 4MO5A 2Q31A 1IO2A 3HK2A 4FM2A 3D6RA 4OPHA 2QWNA 3A5LC 1YIJN 2OTJN 4DG1A 1B9FA 4C8OA 1XC3A 4B1WB 3T1YK 1Q82O 2E6MA 4IG3A 4B3TK 5F2RA 2O8DA 4DMNA 3BZKA 3ULEB 3CETA 1HNVA 3PUFA 4AH9A 5BR9A 3K58A 1GLDG 3CMAN 4CJWA 1KFSA 4Z4HA 4FWKA 2YJEA 3TANA 4FWMA 1FJGK 4O0IA 5SWMA 4DTXA 1SL1A 3IRXA 3TPQA 4BRDA 1RDDA 4FJMA 1YAGA 2C1IA 1VRUA 2FBXA 2HHXA 4CJQA 3BF1A 3TTFA 1XC9A 5GIPA 2Q97A 1E4GT 1VQLN 2PFUA 5JICA 3P83D 1RDBA 3ZCMA 4AF1A 1HNXK 3C65A 5E26A 4CEAA 1IG9A 3A5OC 2E1ZA 1BA1A 4E0DA 4KHSA 2WFBA 4E7JA 3CCQN 3E9LA 2HBKA 5T7BA 4QS8A 4J2AA 2WONA 1GLBG 2D0AA 5BPLA 3JYTA 3CFRA 2E2NA 2P9UB 3U9DA 4CGFA 1WNSA 5CE3A 3UKUA 3SV4A 4FK2A 2E4LA 4NXMK 3D2FB 5AZJA 4B9NA 1WN7A 3SJHA 4ZHRA 3F2KA 5TKWA 3AGKA 4CD3A 4DFJA 4WFAL 1S1WA 4QCLA 4FSVA 4EP5A 4GV6A 4W5OA 1QZ6A 3MXMA 5KPZA 1YI2N 2XHBA 2CGKA 2LSNA 2BANA 3C95A 2VQFK 1BUPA 4IEEA 4O5BA 1LOTB 2FBTA 2PYJA 3F73A 3HM8A 1KRPA 3V9WA 4ELUA 1QSSA 3CJCA 2UUAK 3ZT3A 4O44A 5EVZA 1IBLK 4FCYA 1YJWN 4DQRA 5BN8A 3ZSXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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