2FXUA

X-ray structure of bistramide a- actin complex at 1.35 a resolution.
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
368
structure length
360
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of bistramide a-actin complex at a 1.35 A resolution
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 121
structure length 360
sequence length 368
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fxuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2fxuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2fxuA03
2Q1NA 5CE3A 3L4IA 4IJNA 4B1WB 3RSEA 3H3NO 3CETA 3VESA 5BRFA 3UE5A 5JMVA 1NGGA 4FPBA 3VEOA 4ISEA 1IJJA 4CZEA 3UKUB 3SMPA 4ISFA 1HPMA 3ENOA 2BUPA 1BA0A 2P9NA 3O80A 3QB0A 3GBTA 1NGCA 1BU6O 2VYPA 4BRHA 3A5OC 5FPMA 4A2AA 3C7NB 4MO5A 4KBOA 2ZGZA 5KQ8A 2P9PA 2P9LA 4FWPA 3QFPA 2AP1A 3MK6A 3WEEB 3VOVA 5AZIB 2HF3A 3D2EB 5F1XA 2P9UB 4DCHA 3TPQA 2W40A 5AZJB 3CI5A 1T44A 1T6DA 1SAZA 1KAZA 4C23A 3I33A 3OHRA 2W41A 4K43A 3D2FA 1NGAA 5F0XA 3AARA 3EN9A 3M3ZA 3VF4A 4BRIA 1WUAA 3L6QA 3VGMA 3MCPA 3FLCO 3IMXA 3HBTA 2A42A 2P9IB 3O6WA 5AQHA 2PAVA 3FZMA 3H45C 3ZX2A 4FWNA 4B1UB 2Q2RA 3VEXA 3WQUA 3J8AA 2GELA 5EX5A 3B8AX 4CZIA 2YHXA 1S3XA 1BOTO 1X3NA 3LDLA 1YAGA 3VF6A 2Q97A 4I6MA 2BTFA 1X9JA 2FSNA 1NGDA 4BRKA 1BDGA 3CJAA 2Q0RA 3CIPA 3CJBA 1HLUA 4BQLA 2YJEA 4BC2A 5EXWA 2QXLA 2YCHA 3ZEUB 4CZJA 3O08A 5AQYA 4JHDA 4FSVA 4H03B 4XH4A 4Y0WA 4IJAA 2ASPA 3QBWA 3SLCA 2P9KA 3LDOA 1S22A 4BRMA 5BPLA 2D4WA 1DGKN 1XUPO 3JS6A 5F2RA 1YXQA 2P9SB 4H5VA 4FO0A 4CZLA 1U2VB 3VPZA 1KAYA 1RDWX 1EQYA 2ASOA 2DPNA 3VERA 2CH6A 3SK3A 3ZETB 4CBWA 4CJ7A 4FPAA 2E2OA 3QICA 4YDUC 1SQKA 1KAXA 1R59O 2A6AA 1HX1A 2P9PB 1G99A 3U4LA 1XC3A 4M63C 5JICA 1QQNA 4B1XB 1LOTB 2I7NA 4WQ4A 5KQDA 1BWFO 3ATUA 4BQZA 1HKBA 4BR4A 2QWQA 3FZLA 4J8FA 1MA9B 4B9QA 1BA1A 2FSKA 3G25A 1MWMA 4RCHA 3O1WA 3BUZB 3FGUA 4BC3A 2QWRA 4MLHA 4WQ4C 5BPMA 3HZ6A 2QWNA 4H0XB 2VCPA 3MN9A 4QS9A 3GE1A 3U9DA 4JN4A 3LM2A 2NLXA 4BRAA 2H3GX 4FOEA 2ZWHA 3M6GA 2E2PA 4EAHD 3IDHA 4AM6A 3VEVA 5ADXA 1GLFO 1C0FA 2FXUA 2QWPA 5BPNA 2E8AA 4CZKA 4CZMA 2KHOA 1Q18A 2FF3B 2E1ZA 5AQWA 1OKJA 3FR0A 3JXUA 3LDPA 4B1ZA 1RGIA 1V4TA 4BRLA 5I9EB 1WOQA 1ATSA 1C0GA 5KPRA 2P9KB 3LL3A 4NB4A 4GNIA 5BRDA 3WQTA 3BF3A 4CZHA 1T6CA 2P9SA 5KPTA 4BC5A 1D4XA 1U2VA 5AQRA 3QMLA 4FWRA 2E2NA 2QWMA 5BN8A 2FSJA 4DQ8A 5AQSA 2CGKA 4BGBA 2A3ZA 3MN5A 4M7XA 4HWIA 2V52B 3ZETA 3QDKA 4WQ5C 2IVNA 4CZFA 5BN9A 4MLEA 2Q36A 3EL2A 3MN6A 3VGLA 2ZGYA 3VEWA 5JLHA 2YHYA 3HTVA 4BR7A 5LJWA 3EZWA 2A5XA 4BG9A 3CJ9A 2YI1A 3LM9A 1U6ZA 4WQ5A 3WXLA 4CI6A 4BR0A 2E20A 4EIAA 4O5FA 3VETA 4RWTA 1HKGA 5BRHA 4FWSA 1MDUB 3DXKA 4A61A 4PKHA 4PKIA 3D2EA 1GLAG 4H0PA 4B1YB 4JD2A 1NGJA 1P8ZA 1ZBSA 3SJHA 2GUPA 3IUCA 2E1YA 3H46O 2CGLA 1GLLO 3TU5A 3CQXA 4PL7A 2OANA 3A0IX 1LCUA 4IXCA 5LY3A 4H5WA 3VEYA 4CD3A 3WXJA 4BRCA 1DEJA 1QQOA 3U9ZA 3WXIA 3FZFA 3HM8A 2ZF5O 3DXMB 4EHTA 1J6ZA 3M1FA 3UKRB 3BEXA 2NRHA 3DAWA 1Z05A 3ENHA 4BVOA 3LDQA 4IWVA 1NGHA 3ZX3A 2HF4A 4B1VA 3H6EA 1TYQA 3KHYA 5AQPA 3SMSA 4JNEA 1Z6RA 2Q31A 2I7PA 2WUSA 3AAQA 3CHWA 2V7YA 3A5LC 3RSEB 1GLJO 3GOIA 5AQUA 1QHAA 5FPNA 1MWKA 1ATNA 1X3MA 4HTLA 3H3OB 3ID8A 5TKYA 4A62A 3ATVA 3O4WA 3VENA 2AA4A 1NWKA 2HOEA 5AQKA 4F9OA 2GTDA 4FWLA 3C7NA 3HSCA 4K25A 3FE1A 3VF2A 4BR9A 4XH5A 2P9LB 5AFUA 1JCFA 4FL9A 2P9UA 4BRDA 1V4SA 4K42A 5AQTA 3O5BA 5JLFA 5AZJA 4BREA 2QWLA 3FZHA 4BGAA 4IO8A 1YVNA 5AQLA 3AY9A 4DHYA 4E1JA 4IZ9A 3S41A 4BRFA 4BR5A 3A5MC 5AQVA 2QWOA 4MO4A 4BROA 2EWSA 1QZ5A 3L0QA 2J4RA 4PKGA 2A40A 3DWLA 3DJCA 5E84A 4PL8A 1NGFA 4A2BA 1IG8A 3GG4A 1GLBG 4FOIA 1NLVA 3UB5A 3EKUA 5ELZA 2IVPA 4JAXA 3ULEB 2GEMA 2NZTA 4I6MB 3F9MA 1TUUA 2CGJA 2UYTA 5AQOA 4WYBA 1QZ6A 5AQJA 2E88A 3WXKA 2D1KA 3ZEUA 5KPZA 4AM7A 1DKGD 3W3DA 1NMDA 1TYQB 4JHDB 4L3QA 2YJFA 4H0VB 5EY4A 1E4GT 2F9TA 3A8YA 3ZX0A 4YDUA 3R9PA 4H5TA 4BRNA 4BRGA 1K8KA 5AR0A 1GLDG 3AAPA 4EHUA 4H0YB 2CH5A 1ATRA 3O8MA 4CBXA 5BREA 1ZC6A 2ASMA 4BG8A 1GLCG 5B8HA 3EO3A 5AQGA 4O8KA 4M7YA 3GL1A 2GWJA 2HMPA 3R8EA 1Y64A 2GWKA 3QFUA 3D7EO 4BC4A 3VEZA 4FWKA 2IIRA 3FZKA 4H5RA 1TUYA 3UKUA 1HKCA 5EOYA 2P9NB 1SZ2A 3WT0A 2V7ZA 1NM1A 5BR9A 3CJ1A 1JCEA 2PBDA 4FWMA 2V51B 4H0OA 3KZBA 4XH1A 3EKSA 4NO7A 1GLEG 3IFRA 3C0BA 4RTFD 2A41A 1NGEA 4Z94A 3WEEA 1BG3A 3HI0A 2FLOA 5AZIA 5AQQA 3A5NC 4K41A 2IVOA 3BF1A 1BO5O 3P4IA 2D0OA 1H1VA 3CJ7A 4GY2B 2ITMA 3VGKA 3H1VX 4LC9B 4BR2A 4CBUA 3CJCA 5AQMA 3D2FB 1NBWA 3KVGA 1NGBA 1RFQA 3DXKB 5AQFA 5FPDA 3FFKB 1ESVA 3ULEA 5LJVA 4QS8A 2P9IA 5AQIA 4JD2B 4BRQA 2D0PA 5FPEA 5E26A 1JCGA 2QW9A 1NGIA 4H0TB 3U8XA 2E2QA 1QQMA 3MN7A 5AFUH 1XQSC 5AQZA 3CERA 5ADXH 1YUWA 3I8BA 3CQYA 3MDQA 3R6MA 4H5NA 4FWQA 2F9WA 1HJOA 1KXPA 4CD1A 1E4FT 4ISGA 2YHWA 1ZXOA 4XEIA 3DXMA 4QS7A 1CZAN 3BP8A 4BRPA 1HUXA 1K8KB 4EFHA 3UKRA 4CZGA 5AQXA 5EVZA 1BUPA 3WUHA 3MMVA 3GDQA 2Q0UA 3H1QA 3LDNA 2QM1A 3O1BA 5AQNA 2FF6A 4DB3A 4FWOA 3W0LA 4BVPA 2VWBA 3QBXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L4IA 2IGIA 5BRFA 3RSEA 1BIZA 3ISNC 4BACA 1REVA 4FM0A 1IJJA 4LF8K 3SAFA 3CYMA 1HPMA 4E7HA 1ITGA 4Z0UA 3QB0A 1X9WA 3HPHA 3F2KA 3S3OA 1U4BA 2VYPA 3ZSQA 5DMRA 4FK2A 5KQ8A 2XO7A 1SL1A 2AP1A 2KZMA 2OA8A 5AZIB 5F1XA 3D2EB 4DCHA 3DOKA 4AHRA 1QHTA 1IBMK 3CI5A 1U04A 4C23A 1WNSA 3CCQN 1HYVA 3OHRA 2W41A 4CJUA 1RILA 3MAQA 3M3ZA 1VSFA 3OTOK 3VGMA 3L3VA 2A42A 4CGIA 3H45C 2QA4N 3VEXA 1B9DA 3J8AA 3ZT4A 5EX5A 3B8AX 4IOCL 4LF4K 3LDLA 1YAGA 3VF6A 2YHBA 2WONA 2FSNA 4WFAL 4BRKA 1EX4A 1VSIA 4FLZA 3ENBA 1HLUA 3PSIA 1NNEA 3K2PA 3MEEA 1L5UA 2QXLA 2YCHA 3ZEUB 3CG7A 4E7KA 1KRPA 4CGJA 3HK2A 1NJYA 4FJKA 3V9SA 4KHYA 3O9RA 3R1XA 2B4JA 4JHDA 3S9HA 1J5OA 3HOTA 4XH4A 3VQ4A 3SLCA 3QBWA 2P9KA 3LDOA 1S22A 3AO3A 5F2RA 2HHIA 4EP5A 4QOZB 1VSLA 1U2VB 1OVQA 3SYZA 1EQYA 4OPKA 4FJNA 3SK3A 4DR4K 3ZETB 1EWRA 2E2OA 3AVCA 3HVRA 4DU3A 1N34K 4CHPA 3TARA 3KK1A 3CPWM 3E9LA 3S3MA 5FRNA 3NCIA 4DS4A 2I7NA 3OA9A 4WQ4A 1X9SA 3KTQA 2QWQA 3VQEA 4B9QA 3KKSA 3OW2M 4AHSA 3NVKA 3CQ8A 4CJLA 1DLOA 3M8QA 4CEZA 4BC3A 2QWRA 3CFPA 4V19S 4WQ4C 1ASVA 5HLFA 1HYZA 3HZ6A 4FVMA 2UU9K 5SZTA 3THWA 4WCEL 2RE2A 4JKHA 4EAHD 3QETA 3M5RA 2KKZA 3WXMB 4DWIA 3EE8A 1GLFO 2NRWA 4F2RA 1KSPA 4ELUA 3S3NA 4B8CA 5BPNA 1YIJN 5GAGP 2KHOA 2BE2A 3KLEA 2FF3B 1VQ7N 4NXNK 2E1ZA 4DMNA 1OKJA 3NF6A 3JXUA 3IG1A 4O44A 4B1ZA 1YJWN 1RGIA 5I9EB 3LL3A 3J80O 3NF7A 1TGOA 5AQRA 1IKVA 3LZIA 1TL3A 1RT7A 2DTUA 3AVFA 4LSNA 2FSJA 4MDBA 4BGBA 5CY4A 3SNNA 4M7XA 1RBRA 3QNNA 3O4QA 1RT6A 2HHQA 2IVNA 1ILYA 4MLEA 5KGXA 2ZGYA 3I8DA 3HTVA 1IV0A 3EZWA 3VTIA 1EWQA 3CJ9A 4C1NK 5FROA 3WXLA 1IKWA 1RNHA 4W5NA 3Q7CA 5HL7L 1VQPN 4PWDA 5BRHA 3AGKA 4JI7K 3CD6N 4DFPA 2C1GA 3F5TA 3HXMA 3OYEA 3KK3A 1HQUA 4Z4EA 3CQXA 1CLQA 3SQ2A 1LCUA 3DRSA 2ZM6K 4N76A 4CJFA 3L2WA 1KCFA 1DEJA 1QQOA 5I3UA 3NF9A 1NK4A 4EHTA 4DUZK 2OPPA 1A5WA 3UIQA 1M90O 3AA4A 4LD0A 4M3YA 3LDQA 3ZX3A 4Z4CA 2HF4A 1Q9XA 1TYQA 4JK7A 1VSDA 3SMSA 3V1QA 5FRMA 4IDHA 4CK3A 1B9FA 2Q31A 2HVIA 3CHWA 3RSEB 3BZCA 2C1IA 4DF8A 3OYKA 1J9AA 2PZSA 2P1JA 3ID8A 5TKYA 3ATVA 3O4WA 3RMBA 3VENA 2AA4A 3ZSWA 1ZBLA 4FJ8A 2GTDA 3VQ9A 4K25A 3FE1A 5H1SQ 3NH2A 4DV6K 1OH5A 1JCFA 4FL9A 1V4SA 4DV4K 3O5BA 1BIUA 4DTPA 1JJ2M 4WFNL 2NRXA 3O9UA 3PIOL 3AA5X 3TSUA 3SAHA 3DLHA 3LP0A 3OBWA 1HNIA 1TK8A 4E1JA 4DR5K 1UA0A 2E6MA 3KLFA 1RTIA 5AQVA 2HHXA 2EWSA 3NGYA 3TR8A 1MU2A 3LP2A 3DWLA 1XMOK 4CF9A 3HRGA 3LAKA 1FKOA 4KTZA 2PY5A 4PL8A 4JI5K 5C2DA 4CJ3A 3K0SA 4A2BA 4CIFA 3GG4A 1GLBG 2WFBA 4JAXA 3L2QA 1TUUA 1QVGM 2UYTA 4WYBA 1WBBA 5AQJA 1LAWA 1WSEA 2B6AA 2OPQA 2D1KA 1UOCA 5KPZA 3NH1A 1VQ9N 4R79A 1S5JA 4PHTX 1DKGD 3V81A 3ZLJA 1VAZA 3CM6A 1RDUA 1NMDA 4JHDB 1YI2N 4H0VB 2UXDK 4JYAK 3R9PA 4H8KA 4BRNA 3OS1A 2Z1IA 1K8KA 2HHWA 1HR0K 4EHUA 3AAPA 4H0YB 4CJVA 1ATRA 2HNZA 4AHCA 2VGMA 1HPZA 2HMPA 3SV4A 4G9ZA 5C10A 1VQON 4DKWA 4HCCA 3T1YK 1TUYA 4OO1J 3HO1A 1SZ2A 5JVHL 1NJIO 1NM1A 4FLVA 4B3OA 1WB9A 3CJ1A 2YV0X 4JI2K 3C6AA 5EU7A 4FWMA 4XH1A 3QINA 3AVIA 4NO7A 4RTFD 2A41A 4Z94A 4DR2K 1RT5A 1C1CA 3HI0A 3AVAA 5AQQA 3A5NC 4A5AA 5KTQA 4B9UA 2IVOA 3B6PA 3BF1A 3CJ7A 3ID6A 3H1VX 5AQMA 4DFKA 3D2FB 2HBJA 1NBWA 3WNGA 4M3WA 3THWB 1RFQA 5LJVA 4QS8A 2AJQA 1L3SA 5E26A 1JCGA 1K73O 3M8RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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