2G1SA

Ketopiperazine-based renin inhibitors: optimization of the c ring
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
SSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Renin
publication title Ketopiperazine-Based Renin Inhibitors: Optimization of the "C" Ring
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2006-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2g1sA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2g1sA01
1MEUA 3CYWA 1DW6C 5P3KA 2AOCA 1K6PA 5P41A 4J1KA 4Y45A 4DJQA 5KOSA 4Y4JA 5P0FA 4NKKA 5OZUA 3KDDA 2ZJLA 3B7VA 4LXKA 5P1ZA 1IDAA 5IVSA 3ZMGA 1ODYA 3L38A 1MRXA 4YE3A 5DR0A 5OZHA 1SH9A 3OK9A 4Y4DA 4HEGA 5P6ZA 4Y3FA 5DQCA 5P2NA 3EKWA 4Y37A 1UH9A 2PSVA 4YD4A 5B18A 3EKPA 5P8NA 3CIBA 5P4TA 3UDRA 3CIDA 3ZKGA 1FQ4A 1W6IA 3VFAA 4J1HA 3ZKMA 4Y53A 1MIQA 1XS7D 4Y4BA 5P4QA 3O9EA 2VKMA 1CPIA 2F8GA 3ZLQA 2WF0A 2ZHUA 5P3DA 4YDGA 5P5BA 4Z50A 1DP5A 3PEPA 3HDKA 3L59A 2NNPA 3HW1A 3RSVA 5P8JA 5P0AA 4DI2A 3S43B 1OD1A 4ER1E 5P56A 2R3TA 3PCWA 2AQUA 3UDMA 4KUPA 2I0AA 3VYDA 3OTSA 5P15A 2UY0A 4Y5CA 2P3BB 1SMRA 4A4QA 4PZWA 1HIVA 3WZ8A 5JFUA 1HXBA 2FS4A 3I2LA 4LHHA 1TCXA 4FRKA 3KT5A 2AOFA 3O9CA 1T7IA 3VYFA 2PYMA 4Z4XA 5P4JA 2VJ9A 4FCOA 5F00A 5P4AA 4AA8A 2P3DA 4WY6A 5OZNA 3KFPA 3CKRA 1TW7A 5APRE 5P26A 3S45A 3ER3E 2P3AA 4ZPEA 3PSUA 1YG9A 1ME6A 1GVUA 2G20A 3TPRA 3NDWA 4NPUA 5P33A 3NDTA 1EPRE 3SACA 2QU2A 4OD9A 2XFJA 4YD3A 5P30A 4J1CA 5P2KA 3OHFA 1ZLFA 4DJPA 3KF0A 2FNTA 3LZUA 5P13A 1B11A 3UDQA 3TOHA 4FGXA 1BDRA 3S2OA 4YD7A 5KQFA 3FKTA 5P6OA 5P4PA 3AUPA 4Y39A 2QP8A 4FS4A 1C6ZA 1TZSA 3OY4A 3SLZA 4OBDA 5P1VA 4FSLA 3OUBA 4BEKA 1IZIA 5P4ZA 4EPJA 1UH7A 4GJCA 1C70A 4Y51A 1BV9A 4B72A 4Y36A 5P19A 1FG8C 5P45A 3RTNA 4ZSRA 1B6LA 4UPJA 4LP9A 4ZIPA 4GIDA 5OZRA 2B60A 2I4UA 4R8YA 5P8RA 2AOJA 5P7UA 3BHEA 3LZYA 3EL0A 5COPA 3OU4B 2WEBA 4J1FA 5P69A 3R2FA 5P8HA 1BWAA 4Y3RA 3SABA 3VV6A 5COOA 5KAOA 4AA9A 5DR8A 3KYRA 5HE4A 2QHYA 4DJOA 3QBFA 5P0GA 5AGZA 5P22A 1PSNA 2J9JB 3K5FA 1FFIC 5I3WA 3H5BA 1ZTZA 2G1RA 1FIVA 2FDPA 4NJSA 3GGXA 2CEMA 1XL5A 4COEA 4FAFA 3PHVA 2ZJHA 3VF3A 1BWBA 4H3JA 4OBKA 5P80A 1YTHA 3OADA 4EP2A 4MC2A 4Z2ZA 5OZLA 2ASIA 4F74A 3LIYA 1A9MA 3CMSA 4Y5LA 2AOHA 3URIA 5P6XA 4U7QA 1FQ7A 3UQUA 5P07A 4FRSA 5P84A 4QJAA 4B77A 5P7QA 3UFNA 2HC0A 2I4VA 2PQZA 4NPTA 5P5MA 5P6GA 3RSXA 2OHTA 4CMSA 5P7XA 5P7YA 1W51A 5DR3A 4CPSA 1EBWA 3G70A 2A1EA 3FV3A 3NU5A 4K4RA 3LITA 5PEPA 2PC0A 4L1AB 4QJ9A 5P3IA 5P8TA 4GJ7A 5P2OA 4Y9WA 4X7IA 2G69A 2FDDA 3D91A 3KMYA 2PH6A 5ISKA 5P2WA 1HPOA 1LF2A 2JJIA 3SKFA 5P7CA 2FMBA 2ZHSA 4ZPGA 1BBSA 5P6IA 1K6TA 1QDMA 2R9BA 3PSYA 5IVTA 1Z1RA 5HDZA 1MT9A 5P24A 4HVPA 2O4KA 1HIIA 3TL9A 2NXDA 4B1DA 4EHCA 5P06A 5P0TA 1APVE 3UHLA 2OHLA 1PROA 2VIYA 4GJ8A 4J5JA 5P73A 1HTFA 1IVPA 5P5AA 1MERA 4B78A 3PM4A 5P0NA 3T7QA 1GVXA 5OYUA 4HZTA 4CP7A 4ER4E 5AH9A 4DV9A 2ZHTA 1K2BA 2WF4A 5P4OA 4AMTA 3SPKA 5OZYA 2HIZA 5P2EA 1LYWA 1YX9A 5P7BA 1HBVA 5P0KA 1HPXA 2Z4OA 4RGHA 1PSAA 4ZEAA 1FQXA 1FEJC 1AIDA 1PFZA 1MT8A 3GI4A 1IZHA 5BRYA 2VNMA 1M43A 2B7FA 5P53A 4TRWA 3O99A 2NNKA 2G26A 1NPAA 4YCTA 5P1NA 3TLHA 3MWSA 5P55A 5P1KA 5P4UA 2ZJNA 3ZPTA 3BVBA 1C6XA 3UDYA 4Y3EA 3CKPA 5P3CA 2G1SA 5P72A 5P5GA 1HIHA 3LIXA 4D88A 1E80E 3TNEA 5P6PA 2PWRA 1Z8CA 5P7FA 4MC1A 1IVQA 5P10A 5P7TA 2WJOA 2Q63A 3FNUA 4KE0A 5OZZA 3BC4A 2SAMA 1HVJA 4OC6A 5P6HA 5P3VA 2V12C 2PK6A 4Y54A 5P6WA 4Y38A 2Q64A 5OZFA 1MESA 2A4FA 5P7GA 4FE6A 1APUE 1ER8E 2ZJMA 3QP0A 4AUCA 5OYTA 5AHAA 3NXEA 5P3MA 2JE4A 3PCZA 4Q1XA 5P0RA 4K8SA 4L7JA 4MC6A 1OEXA 5HTZA 1AJXA 1SDVA 3LIVA 1LS5A 4YHQA 1AJVA 1LEEA 4NJTA 4B1CA 5P8FA 4TRYA 1BDLA 4Y3SA 4Y3ZA 5P1SA 2HS2A 1YTGA 4ACUA 2QZKA 5JG1A 5DQ1A 4OBZB 1ENTE 3KFNA 5P11A 3EKTA 5P14A 3UDNA 5P3XA 1HSIA 3LHGA 5P27A 2VNNA 5P0ZA 1EBZA 1EPME 3KDCA 4Y3WA 4FL8A 4YA8A 3SO9A 4Y3QA 2XYFA 5P8QA 5OZJA 5OZAA 3EKQA 4TVGA 4LC7A 1HEGE 5OZXA 4I1CA 3T7PA 4YBIA 4X2LA 5P0IA 1META 2ER9E 1KZKA 2IKOA 2QI3A 4E43A 3PI0A 3FNSA 2OHRA 5DR4A 1QBSA 3MXDA 5P1DA 4I0FA 1MSNA 1XN2A 1SBGA 4FRJA 5P6CA 4ZSQA 3NU9A 1G0VA 2APRA 3O9HA 5P2GA 5P3NA 1G35A 1MRWA 4Y43A 3UDJA 5P7SA 4DFGA 1MUIA 4RYGA 3QBHA 5P46A 3VEUA 3SA8A 1EPOE 4LXAA 5OYZA 3PWRA 3NLSA 3WB4A 3UDHA 3SQFA 3NU6A 1LZQA 5DQ4A 5P8LA 3ECGA 4R92A 3CKTA 3VG1A 4HE9A 4JOOA 2QD8A 2O40A 1LYAB 3EXOA 1F34A 2VA6A 3D3TA 5P8MA 2VIZA 4U7VA 5KR1A 3IGBA 3BGCA 3GW5A 2HB2A 5P1BA 3PWMA 3N4LA 1APWE 3UCBA 3FX5A 3L5CA 4DVFA 5P8KA 1B6JA 2AIDA 5P44A 2QCIA 3K5GA 5I3YA 1LYBB 2R5PA 3NWXA 4R95A 1DAZC 1UH8A 5OZSA 5DQ5A 4DQHA 4GB2A 2QHZA 4XKXA 5P31A 2QNPA 3OGPA 5P7PA 5P75A 4ACXA 3OXVA 4Y3GA 2RMPA 3TTPA 3ZKNA 4Y5NA 5P2LA 3DK1A 1NSOA 5P3JA 5P6FA 5OZPA 3PMYA 5P34A 5P3AA 4EXHA 5EZXA 4NJVA 4RLDA 4QJ8A 3BUFA 5P1EA 4HDFA 4J17A 1EPNE 5P82A 4ZSPA 3DCKA 1ODWA 3Q70A 3EKXA 5SZ9A 5OZ6A 2NMYA 4QGIA 3I25A 5P88A 4J0ZA 4GYEA 2H6SA 5KR0A 5JODA 4FRIA 4R93A 1DPJA 2QHCA 2Q55A 5AH6A 5P2JA 2QK5A 1HVRA 2BQVA 5P01A 3TKGA 4OBHA 4DUSA 3S43A 5P8PA 5P7NA 3MSLA 3OQDA 3HD8A 3SKGA 4DQFA 4HDBA 1XE6A 5P3FA 4Y5EA 4YOAA 3BXSA 4Y3XA 2P3BA 3GI0A 4LL3A 2G21A 5P09A 2BKSA 5P05A 5P48A 3FSMA 5OYXA 3DOXA 5P00A 3ZKIA 2QZXA 5P16A 3JVWA 5P3GA 1MVPA 3B80A 3UQWA 5HE5A 2FNSA 5P4EA 5P1QA 3WB5A 2VIEA 1LF4A 3KN0A 2HAHA 3MXEA 4QJ6A 3HVGA 3ZPSA 5P5TA 4IVTA 5OYQA 4RVIA 5P04A 3VSXA 2FXDA 4B70A 2VIJA 1AAQA 5P40A 2IS0A 1FLHA 5P5FA 3OXCA 2WEZA 3Q5HA 5P47A 5CONA 3OHHA 1KJGA 5P2XA 5ISJA 5P1WA 4Y4ZA 2CEJA 2FXEA 4K9HA 2ZGAA 3EL9A 2Q15A 5P4LA 1FKNA 1SIVA 5AHBA 2IKUA 2QMDA 5P49A 1ODXA 4H3IA 4WY1A 4EWOA 3GI6A 3UFLA 8HVPA 3QN8A 2RENA 3U71A 5HCOA 3LIZA 4FM6A 2OHSA 4XX4A 5P1TA 3PMUA 4Q5MA 3O9LB 1MTRA 4FM8A 3PLLA 1EC1A 2MIPA 1XDHA 4GJAA 2NTRA 1HRNA 3L5BA 3VV7A 3L58A 1K6VA 4Y5MA 5P5QA 2F81A 3QRMA 5P2VA 4DJVA 5P4CA 2OHNA 2G24A 3SA5A 1G6LA 4DJXA 2JJJA 3OU4A 4D83A 4L7GA 4XXSA 5OYWA 1W5YA 3IXJA 5J25A 3D1ZA 3OU1B 5P8DA 4DPFA 4GJ5A 5P0PA 2QU3A 2J9JA 2F3FA 3CYXA 4CPUA 1EPQE 3A2OA 5P7EA 2BPWA 4RZ1A 6FIVA 1XE5A 5P2SA 2UXZA 4CPQA 5P7WA 5P6QA 4DQCA 4ZSMA 1BIMA 2G1YA 4FSEA 5P7KA 5P6SA 5P2QA 3INEA 5P4HA 4BELA 3QVCA 5P0LA 3T7XA 3VLAA 1D4KA 2O4SA 3IAWA 3IVHA 4Y4WA 4TRZA 3TOGA 5P0JA 5P7AA 3EL5A 5P0XA 3INDA 5COKA 1A8GA 3QIHA 5FIVA 3PB5A 3OUAA 2AVMA 4I8ZA 2R3WA 2BPVA 5HU0A 4RCDA 3OOTA 5OYSA 1QS8A 5AHCA 4L1AA 1FMBA 2VS2A 5P2YA 2V10C 5P3UA 5P63A 5P2AA 5AH8A 1YTJA 5P7IA 3UPJA 4DJWA 4QJ2A 1DIFA 4Y5KA 4CPTA 5ENMA 2PMAA 2ZDZA 3QI1A 3SFCA 2JYSA 3KFRA 5I70A 5HVPA 5P1AA 4Y47A 3PBZA 4RRSA 2QMGA 1BVGA 1IZEA 5P8UA 4R5NA 1QRPE 1ZPAA 5P1CA 3BGBA 5P4KA 3R0YA 2HB3A 1Z1HA 2XYEA 1GNMA 2QI1A 2IDWA 3VSWA 1TQFA 4U8WA 3OGQA 4JECA 3HAWA 2I4QA 2P8HA 5P7DA 2EWYA 4Y3HA 3OXXA 5OZ2A 4Y4XA 5P32A 3NSHA 4B00A 3KM4A 3VV8A 1ZBGA 4I0ZA 2H6TA 3SA6A 3R0WA 2HB4A 5P1YA 5P68A 5P5UA 1IBQA 2FGVA 5IE1A 3ST5A 1HPSA 5P2UA 4Y4AA 5P1GA 4LXMA 2AVVA 5P0UA 2AZ9A 4Y57A 2PH8A 1W5WA 3EKYA 3BUGA 1B5FB 3PGIA 3QS1A 3OAGB 5HU1A 2OHKA 4WTUA 2HM1A 3HLOA 5P6AA 5SXNA 5OZMA 1OHRA 1HSGA 5P5SA 3EMYA 3U7SA 5P7MA 2ZYEA 1YTIA 5SY3A 5P1IA 1K2CA 1E5OE 1NPVA 5P36A 3VCMA 3O9AA 3I8WA 3WZ7A 3KT2A 3QAAA 4Z22A 4Y4EA 3OQKA 4YD6A 2VJ7A 5UPJA 5DGWA 3NU4A 5P86A 4F76A 5P0MA 2R8NA 3KMXA 5P85A 2I4XA 2QNQA 5IS4A 5P3BA 3PLDA 2ZHRA 5P3WA 3GGUA 4DQGA 1YT9A 1D4JA 4HLAA 1F7AA 3PWWA 3SAAA 5KQYA 5OZOA 5P70A 1DMPA 4RCEA 1SGUA 3NUOA 2NXLA 2WF2A 3K5CA 3SA9A 5P6UA 1HVCA 2ER6E 2AVQA 4B05A 3O9FA 4DPIA 1D4LA 3NDXA 1T6EX 3EM6A 2B8VA 3HVPA 5P5EA 1UPJA 1T7KA 3QROA 5DR1A 2WHHA 3SA3A 1HVHA 5P6JA 5P71A 4I0IA 3RVIA 5P1XA 1QBRA 3TH9A 3GGVA 2IENA 2OHQA 4OBZA 1GVTA 4H1EA 5P5OA 3H0BA 5HDVA 4Y3JA 5ER1E 5P4VA 5P0WA 2ER7E 1FMUA 4I0GA 3F9QA 1E81E 1HVKA 3WSJA 5P4RA 4NJUA 1D4IA 4HDPA 4B1EA 3PJ6A 4D89A 5P37A 1XN3A 4BFDA 5P2TA 3EM4A 2V16C 5P6TA 1LF3A 3INHA 5P1PA 3UDPA 2FIVA 2I1AA 5P2HA 1AM5A 3ZKSA 4L7HA 2P83A 2J9KA 5P2BA 5OZQA 3G72A 1W5VA 5HCTA 5P3ZA 3Q6YA 3PSGA 4KE1A 1RL8A 5P0DA 1FQ6A 3L5EA 3UDKA 5I3XA 5P5YA 3OUDB 4F73A 3SA7A 2BPYA 1KJFA 2WECA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1MEU A;  3CYW A;  1DW6 C;  5P3K A;  2AOC A;  1K6P A;  5P41 A;  4J1K A;  4Y45 A;  4DJQ A;  5KOS A;  4Y4J A;  5P0F A;  4NKK A;  5OZU A;  3KDD A;  2ZJL A;  3B7V A;  4LXK A;  5P1Z A;  1IDA A;  5IVS A;  3ZMG A;  1ODY A;  3L38 A;  1MRX A;  4YE3 A;  5DR0 A;  5OZH A;  1SH9 A;  3OK9 A;  4Y4D A;  4HEG A;  5P6Z A;  4Y3F A;  5DQC A;  5P2N A;  3EKW A;  4Y37 A;  1UH9 A;  2PSV A;  4YD4 A;  5B18 A;  3EKP A;  5P8N A;  3CIB A;  5P4T A;  3UDR A;  3CID A;  3ZKG A;  1FQ4 A;  1W6I A;  3VFA A;  4J1H A;  3ZKM A;  4Y53 A;  1MIQ A;  1XS7 D;  4Y4B A;  5P4Q A;  3O9E A;  2VKM A;  1CPI A;  2F8G A;  3ZLQ A;  2WF0 A;  2ZHU A;  5P3D A;  4YDG A;  5P5B A;  4Z50 A;  1DP5 A;  3PEP A;  3HDK A;  3L59 A;  2NNP A;  3HW1 A;  3RSV A;  5P8J A;  5P0A A;  4DI2 A;  3S43 B;  1OD1 A;  4ER1 E;  5P56 A;  2R3T A;  3PCW A;  2AQU A;  3UDM A;  4KUP A;  2I0A A;  3VYD A;  3OTS A;  5P15 A;  2UY0 A;  4Y5C A;  2P3B B;  1SMR A;  4A4Q A;  4PZW A;  1HIV A;  3WZ8 A;  5JFU A;  1HXB A;  2FS4 A;  3I2L A;  4LHH A;  1TCX A;  4FRK A;  3KT5 A;  2AOF A;  3O9C A;  1T7I A;  3VYF A;  2PYM A;  4Z4X A;  5P4J A;  2VJ9 A;  4FCO A;  5F00 A;  5P4A A;  4AA8 A;  2P3D A;  4WY6 A;  5OZN A;  3KFP A;  3CKR A;  1TW7 A;  5APR E;  5P26 A;  3S45 A;  3ER3 E;  2P3A A;  4ZPE A;  3PSU A;  1YG9 A;  1ME6 A;  1GVU A;  2G20 A;  3TPR A;  3NDW A;  4NPU A;  5P33 A;  3NDT A;  1EPR E;  3SAC A;  2QU2 A;  4OD9 A;  2XFJ A;  4YD3 A;  5P30 A;  4J1C A;  5P2K A;  3OHF A;  1ZLF A;  4DJP A;  3KF0 A;  2FNT A;  3LZU A;  5P13 A;  1B11 A;  3UDQ A;  3TOH A;  4FGX A;  1BDR A;  3S2O A;  4YD7 A;  5KQF A;  3FKT A;  5P6O A;  5P4P A;  3AUP A;  4Y39 A;  2QP8 A;  4FS4 A;  1C6Z A;  1TZS A;  3OY4 A;  3SLZ A;  4OBD A;  5P1V A;  4FSL A;  3OUB A;  4BEK A;  1IZI A;  5P4Z A;  4EPJ A;  1UH7 A;  4GJC A;  1C70 A;  4Y51 A;  1BV9 A;  4B72 A;  4Y36 A;  5P19 A;  1FG8 C;  5P45 A;  3RTN A;  4ZSR A;  1B6L A;  4UPJ A;  4LP9 A;  4ZIP A;  4GID A;  5OZR A;  2B60 A;  2I4U A;  4R8Y A;  5P8R A;  2AOJ A;  5P7U A;  3BHE A;  3LZY A;  3EL0 A;  5COP A;  3OU4 B;  2WEB A;  4J1F A;  5P69 A;  3R2F A;  5P8H A;  1BWA A;  4Y3R A;  3SAB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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