2G21A

Ketopiperazine-based renin inhibitors: optimization of the "c" ring
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
333
structure length
329
Chain Sequence
SSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSELGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Renin
publication title Ketopiperazine-Based Renin Inhibitors: Optimization of the "C" Ring
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 329
sequence length 333
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2006-02-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2g21A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2g21A01
2IGXA 4ZSRA 3EL4A 5P6MA 5P29A 4Y4UA 3GW5A 5P0GA 4ZSQA 5P8JA 2ER0E 1YM2A 3ZPUA 3R0YA 2I4UA 4D83A 4Y3ZA 3ZKSA 4Z22A 2QCIA 2VA7A 1TSUA 2PMAA 3EBZA 2VNMA 5P3BA 2VJ6A 5P0IA 4ER1E 3KMXA 5P22A 1EPLE 5P2ZA 5P8AA 5P08A 2Q54A 3OTSA 5HU0A 1LS5A 5BWYA 1SGUA 2QI7A 2Q5KA 3LPIA 5P89A 2VIJA 1IZEA 1M4HA 5P7VA 5P11A 4FM7A 1BVGA 2R8NA 5P3RA 4WY1A 5P8VA 4I10A 5OZFA 1RV7A 3FNSA 3EKPA 1QS8A 2QI6A 3RTHA 4Y4WA 1RQ9A 2CEJA 5P1UA 2UY0A 4Y4DA 2CEMA 1B6PA 3OXCA 3SA7A 9HVPA 3OUCA 4GB2A 2OHQA 3UF3A 3FKTA 5P42A 2QHYA 2RENA 5P7AA 3UQXA 2CENA 5SXNA 1IVQA 5P5MA 2WF0A 5P8LA 1QRPE 4K4QA 5P04A 3I25A 3OGPA 3SM1A 2WEDA 1T6EX 3K1WA 1EBKC 4LXKA 1Q9PA 2P8HA 1FGCC 5OZEA 2Z54A 4Z4XA 5P7YA 3OADA 5SY3A 5TOLA 3PGIA 5P3EA 5P8MA 2G1NA 3R4BA 5IVRA 1EC1A 1B5FA 5P5BA 1GVTA 3N4LA 4ACUA 5OZXA 4DVFA 3KFPA 5P5QA 4QLHA 4H1EA 2Q64A 5OZZA 1QBRA 5P3LA 2IS0A 4LC7A 4X7IA 4Y51A 5P6QA 5P3ZA 3LITA 5P07A 3NWXA 3OU1B 3PSUA 4Y3WA 4ZEAA 5APRE 4XKXA 3S56A 5P73A 5P1IA 5P6AA 3IVIA 3INDA 2ER9E 2QP8A 4E43A 3TOFA 5P3JA 5P6CA 4Y5GA 3VSWA 3OHFA 3L5CA 5P2LA 5ENMA 3B80A 3IN3A 1APVE 1EEDP 4GJDA 4J17A 4GJ9A 4WY6A 5P4QA 3OXVA 2AZCA 3UDMA 1XE6A 3TOHA 4RYGA 1META 1HTFA 2BQVA 4AA9A 5BRYA 3O9DA 5P37A 3JVWA 5P75A 4RYCA 3LIVA 5P5HA 3URLA 5HE4A 5P1SA 5P7LA 2Q15A 5CONA 3EM6A 5P2MA 2HC0A 1EBZA 1SDTA 3OWNA 4I0EA 4ER4E 3SQFA 3Q6YA 4J54A 1HVRA 5DR0A 2AOEA 4QJAA 3DV1A 4DUSA 3HBOA 4Y54A 4QJ2A 2WECA 2P3BA 2OHNA 5BS4A 1YTJA 4EQ0A 2V13A 1FB7A 3ZKNA 5KOSA 3SA6A 1K6VA 5P1HA 4Y48A 5P53A 5P6KA 4I8WA 5P40A 5P65A 3WSJA 3L38A 4Y3RA 5COOA 4FAFA 5P3NA 5F00A 2ZJHA 5ISKA 5F01A 5P2TA 3CIBA 3PCWA 3UDKA 3DV5A 3S45A 2O4SA 3CKPA 5P25A 4CKUA 2O4KA 5OZOA 5P6SA 3RSVA 5OZ9A 4S1GA 5DQ5A 2AVVA 3TPRA 1HPXA 4DJPA 5P7WA 3KFSA 3HDKA 4DI2A 4J0VA 1BDQA 4EJ8A 1XL2A 4H3FA 1GNOA 4Y37A 3PSGA 4Z2ZA 5EZXA 5P59A 5P82A 4GJ7A 2B8LA 1SBGA 2PSGA 5P5JA 2PH6A 5P8OA 5P0FA 4RCDA 5DR7A 4B05A 4Y6MA 2BPYA 5E5KA 1EAGA 2IL2A 1RL8A 5OYXA 5OZ3A 5P43A 3SO9A 4HDPA 5P1AA 1AIDA 4NJUA 2BKSA 5P5FA 5P5PA 1MT8A 2VKMA 5P85A 2QD8A 3MXDA 4ER2E 4KUPA 2PK6A 5P8BA 5P3WA 5P6OA 3VF5A 4OC6A 5JFPA 1YTIA 2NPHA 1HPVA 5P1FA 3BRAA 5P7PA 2V0ZC 3UTLA 2WKZA 3R1GB 5OZVA 5P1PA 5JODA 2VA6A 4FSEA 4OBKA 3GGVA 5P68A 1T7KA 5P57A 1OEXA 4APEA 3MSKA 2AODA 3OHHA 2B7ZA 1LYAA 4TRWA 4TRYA 1IIQA 4QJ9A 3BUFA 4YOAA 3OXWA 1LYWB 2ZJNA 3OTYA 3LPKA 3ZOVA 4Y4BA 4LP9A 5P4WA 5P7SA 1DMPA 5OYQA 2ZJJA 3IXJA 4DJVA 3U71A 1ODWA 2VIZA 1NSOA 4Y9WA 2HIZA 4K9HA 3SAAA 4DJOA 5FIVA 5KQFA 4YDFA 5P26A 1T7JA 5OZPA 5P2EA 5P0EA 5P33A 5P6YA 5P2XA 2G1RA 5P7KA 1XN2A 3VYDA 1MERA 3A2OA 3NDXA 1MT9A 2PQZA 5P6EA 5P4VA 5OYSA 4BFBA 5P8UA 5P0DA 3KT2A 2HB3A 2QI3A 5P2YA 4Y3TA 5P39A 1HEGE 1BILA 4Y3FA 3OU4A 5OZ4A 5P2CA 4DJQA 3VV7A 2APRA 1D4LA 1GNNA 1HHPA 2V12C 4Y3LA 1SGZA 1BDRA 4A6BA 3PSYA 4HEGA 2IENA 5P28A 5P5RA 1K6CA 4GJAA 2PSVA 1T3RA 2AOGA 1HRNA 5SY2A 3OOTA 4Y3MA 5E5JA 5P7JA 5P6BA 1ZSFA 2G1SA 4RCEA 4PYVA 1D4KA 4Y3SA 1HIHA 5P3YA 4Y4JA 2BB9A 3U6AA 5UPJA 4Y5CA 2AVQA 5P7OA 5P3KA 3OU3A 4OBZB 5DR3A 4FE6A 1HSIA 2QNNA 2QHZA 3GI4A 3D3TA 2XYFA 1E80E 4B77A 5DGWA 1OD1A 1HVIA 2WF4A 5COKA 4Z50A 3O9FA 5P34A 2XYEA 5P4PA 5P3HA 1FMUA 3S43B 1ME6A 3TH9A 1ZLFA 3QRSA 5ER2E 5P02A 1EBWA 4XX4A 3TL9A 2WL0A 1EPOE 5P8EA 4L7HA 2ANLA 5P7IA 3RVIA 3VV8A 1MSNA 2IEOA 3LIQA 2QI1A 3ZPSA 2G69A 4GZFA 5P2VA 4Y5LA 5P2BA 2IGYA 5P7GA 3KF0A 2I0AA 3R2FA 5P6VA 3WZ8A 1GVVA 4L1AA 5P5VA 4B1DA 5P71A 5P8DA 1OHRA 5P1WA 2B7FA 5P4TA 1EPRE 1SDVA 5OYZA 5P7RA 5P4BA 3AIDA 5OZNA 5P8NA 3UDYA 4Y4XA 3NSHA 5P0MA 5P6DA 4NPTA 5P3GA 4DQGA 1C6YA 3UPJA 2G27A 1KJHA 1PSOE 5P3VA 2ZHVA 2J9JB 4D88A 4OBJA 4Y35A 3L58A 1G0VA 3BVAA 3GGAA 5AH8A 5P46A 4JPCA 3PLDA 4ZSMA 2QI0A 4Y4AA 3EL9A 1AZ5A 5P20A 5P5WA 2P3DA 1J71A 4RZ1A 5AH7A 1W5WA 3QS1A 4DJRA 1W5VA 1PFZA 2ER6E 3O9CA 5P7DA 4D8CA 3Q3TA 3ZKMA 1RNEA 3CIDA 5KAOA 4DJUA 4CMSA 4Y5AA 1G35A 3O9LB 5P6ZA 3TLHA 1EPPE 3DCRA 4TVGA 3BUGA 4Y44A 4A4QA 4FRJA 4K4PA 3K5DA 2FNTA 4Y4EA 1FMBA 3FV3A 3SACA 5P4MA 1HTEA 5P4UA 3OXXA 5C9FA 2AOFA 4GYEA 3SM2A 2XFIA 3BHEA 5P7BA 5C9BA 3K5GA 2PYMA 5P13A 2I4VA 2ER7E 1DIFA 1EC2A 5P4XA 5P10A 3DOXA 3UQUA 4R5NA 5P16A 5P0OA 2AOHA 1NH0A 4Y56A 4J1HA 3RSXA 5OZMA 5JG1A 5P5KA 1TSQA 2RMPA 1SMEA 4ZPEA 4Y39A 3DJKA 3PB5A 3VCMA 1N49A 5P5CA 1EC0A 1SIPA 5IE1A 5P01A 3OAGA 1PSNA 4PZXA 1KJ4A 5P3PA 5P51A 1UH8A 1SH9A 3QI1A 3WB5A 5P3TA 2I4WA 2WF2A 1K1TA 5P24A 5P0QA 1B6KA 3APRE 5KQYA 4RVXA 5P4SA 5KQXA 1TW7A 2HM1A 3MSLA 1HXBA 1K6PA 4OBFA 5P47A 4YE3A 3PHVA 4U8WA 3APPA 5P31A 3QPJA 4PPHA 5P6JA 2H6SA 1U8GA 4JP9A 5P6UA 3MSJA 5OZJA 3CKRA 5P14A 5P2KA 5P5SA 3T7XA 3ZLQA 2R9BA 1XN3A 1JLDA 3SFCA 2NNKA 1GVUA 3UCBA 3NU4A 2OAHA 4Q1NA 3EKQA 4J5JA 4AA8A 2V10C 4F74A 2WEBA 2R3TA 5OZ2A 2ZYEA 1Z1RA 4CPQA 2PWRA 1EPQE 5OZIA 1W5XA 5P1ZA 3Q5HA 3KMYA 3K5CA 2NXMA 3I7EA 2FIVA 4MC6A 4HZTA 4DQBA 2UPJA 4I0HA 5P8TA 5HCOA 2NXDA 4ZIPA 5P06A 5DPZA 2F81A 5EZZA 5B18A 5OZ0A 3OY4A 5P1JA 3GGXA 2VNNA 1WKRA 2Q63A 3NUOA 5P3IA 4MC1A 3SA4A 4YDGA 1C6XA 4B0QA 3SLZA 3QRMA 4HLAA 1LZQA 5P2RA 2QD6A 5P0SA 5P45A 3EKWA 1BV7A 5P00A 4RROA 5OZ7A 1BDLA 1DP5A 3PMUA 5P2UA 6UPJA 2QZXA 2ZJLA 5DR1A 3SA5A 2FLEA 3OQDA 1HEFE 3QVCA 5OZBA 2P3CA 1SMRA 4NKKA 5P12A 1FMXA 4B1EA 4UPJA 5P3QA 5P1GA 3OQFA 2QZWA 3HAUA 2QAKA 2FDDA 5P3CA 3PEPA 2F3FA 5P17A 4I0JA 3WZ7A 1A94A 2QNQA 4U7QA 4J0ZA 3CKTA 3VLAA 2OHPA 2QNPA 2OF0A 5P4FA 2QZLA 4J0YA 1MSMA 1B6LA 1PROA 3OQKA 5P8GA 2NNPA 5P44A 5P0LA 5OZHA 7HVPA 2B42A 4XXSA 2FGVA 2P83A 3MXEA 1KJ7A 4YOBA 4X2LA 4HDFA 4OD9B 5P0YA 4FRKA 2PK5A 4B70A 1HIVA 3O9HA 4RRSA 2QZKA 1MPPA 4R93A 5P8CA 3CYWA 2VIEA 5P0WA 4B00A 5P7TA 5OZUA 1SIVA 5P4OA 3INFA 1ZP8A 4CPXA 2XFJA 1FQ7A 4F73A 4OBDA 4YD4A 5P4KA 3Q4BA 2NMZA 3ZKGA 1HVKA 5P35A 3EXOA 1IZIA 3T3CA 3OU1A 3IGBA 1HTGA 4QJ7A 4R91A 6FIVA 4TRZA 3URIA 2AVMA 3UQWA 2B60A 3UHLA 5P0CA 1PPME 4A6CA 4Y3QA 2G20A 4JECA 5P64A 2OHTA 2O4NA 2JJJA 3CMSA 5P52A 2ZHRA 1HSHA 5P6NA 3H0BA 3HAWA 2AOCA 2QHCA 5P60A 1AVFA 5P1DA 2FDEA 5OZ5A 5P3DA 5AH6A 4I0GA 3NDTA 5P2NA 1APWE 3OUAA 4JOOA 3FX5A 5P15A 3QN8A 4KE1A 2IKUA 3GGUA 5OYRA 3ZMGA 4Q1XA 5DGUA 1TQFA 4EP2A 4EJDA 3BXSA 2H6TA 3VLBA 5P48A 1FKNA 2V16C 4RGHA 5P0TA 5P1EA 5P5NA 5P4LA 3B7VA 3HLOA 3PVKA 1FLHA 1IDAA 4APRE 5P3MA 3EMYA 2FMBA 3PBDA 1TCWA 5P19A 5P7FA 5P0PA 4OBHA 2OHRA 1ZAPA 5KOQA 5HVPA 4GJ6A 1M0BA 1GNMA 3BUHA 3K5FA 2VJ9A 5P8IA 5KR2A 2AZ8A 4F75A 1XS7D 5P0XA 2IDWA 4FL8A 4GJ8A 1E81E 1A8GA 1K6TA 4PEPA 1BAIA 1SDUA 3LZUA 2MIPA 1ZSRA 4J1CA 4IVTA 2O4PA 1GKTA 4FIVA 1YG9A 2HB4A 4Q1YA 4Y4ZA 2NXLA 5OZCA 5P3SA 5DR4A 4YA8A 5J25A 4EQJA 2F3EA 5OZTA 1LYBB 4Y47A 2V00A 3OGQA 5OZLA 4ZPFA 5P5IA 5P6GA 5P88A 1HPOA 3I2LA 1MTBA 3UQPA 5P3XA 5HD0A 3URJA 2OHSA 3KDCA 5P7UA 2IKOA 1DW6C 2NR6A 2ZHTA 3WZ6A 2XFKA 4YD7A 5I70A 4DJYA 1ER8E 2FGUA 4Q5MA 5P5TA 2WF3A 4FRIA 5P2IA 3MWSA 5OYWA 2ASIA 4DH6A 1SP5A 1LEEA 5P70A 2Q55A 3D1YA 2QI5A 5P1VA 1K2BA 1HWRA 2V11C 3CICA 5HCTA 1BXOA 4Y5NA 3T7QA 4CPTA 4DPFA 3H5BA 3PM4A 1CPIA 4I12A 2QD7A 3ZL7A 3EC0A 4JPEA 3S2OA 5OZWA 2R43A 4QGIA 3S85A 5HU1A 3HZCA 3VV6A 3KT5A 4ZSPA 1HOSA 1HPSA 3RU1A 3D91A 4Y3NA 3OUDB 3UDJA 1CMSA 3KDDA 1A8KA 1BIMA 5ER1E 3KFNA 3O9IA 4K4RA 3EKTA 3HVPA 5IS4A 5P6IA 4CPWA 1LYWA 3D1ZA 5P56A 1FF0C 3TKWA 1A30A 4Y50A 5P5OA 5P63A 3VFBA 5PEPA 5P3AA 2FDPA 3EM4A 1HSGA 3NU9A 5P76A 4K8SA 3I6OA 5P58A 2HS1A 3U7SA 4EJLA 2R5QA 4GJCA 3SPKA 2WEZA 3L5DA 5T4SA 5P2OA 4YBFA 5OYTA 4PHVA 3INEA 1MT7A 2QU3A 3EKYA 4CP7A 5P86A 3C9XA 3NLSA 2NTRA 1IZHA 2FS4A 1KZKA 3UDQA 5HE5A 5DQ4A 5P36A 3DM6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2IGX A;  4ZSR A;  3EL4 A;  5P6M A;  5P29 A;  4Y4U A;  3GW5 A;  5P0G A;  4ZSQ A;  5P8J A;  2ER0 E;  1YM2 A;  3ZPU A;  3R0Y A;  2I4U A;  4D83 A;  4Y3Z A;  3ZKS A;  4Z22 A;  2QCI A;  2VA7 A;  1TSU A;  2PMA A;  3EBZ A;  2VNM A;  5P3B A;  2VJ6 A;  5P0I A;  4ER1 E;  3KMX A;  5P22 A;  1EPL E;  5P2Z A;  5P8A A;  5P08 A;  2Q54 A;  3OTS A;  5HU0 A;  1LS5 A;  5BWY A;  1SGU A;  2QI7 A;  2Q5K A;  3LPI A;  5P89 A;  2VIJ A;  1IZE A;  1M4H A;  5P7V A;  5P11 A;  4FM7 A;  1BVG A;  2R8N A;  5P3R A;  4WY1 A;  5P8V A;  4I10 A;  5OZF A;  1RV7 A;  3FNS A;  3EKP A;  1QS8 A;  2QI6 A;  3RTH A;  4Y4W A;  1RQ9 A;  2CEJ A;  5P1U A;  2UY0 A;  4Y4D A;  2CEM A;  1B6P A;  3OXC A;  3SA7 A;  9HVP A;  3OUC A;  4GB2 A;  2OHQ A;  3UF3 A;  3FKT A;  5P42 A;  2QHY A;  2REN A;  5P7A A;  3UQX A;  2CEN A;  5SXN A;  1IVQ A;  5P5M A;  2WF0 A;  5P8L A;  1QRP E;  4K4Q A;  5P04 A;  3I25 A;  3OGP A;  3SM1 A;  2WED A;  1T6E X;  3K1W A;  1EBK C;  4LXK A;  1Q9P A;  2P8H A;  1FGC C;  5OZE A;  2Z54 A;  4Z4X A;  5P7Y A;  3OAD A;  5SY3 A;  5TOL A;  3PGI A;  5P3E A;  5P8M A;  2G1N A;  3R4B A;  5IVR A;  1EC1 A;  1B5F A;  5P5B A;  1GVT A;  3N4L A;  4ACU A;  5OZX A;  4DVF A;  3KFP A;  5P5Q A;  4QLH A;  4H1E A;  2Q64 A;  5OZZ A;  1QBR A;  5P3L A;  2IS0 A;  4LC7 A;  4X7I A;  4Y51 A;  5P6Q A;  5P3Z A;  3LIT A;  5P07 A;  3NWX A;  3OU1 B;  3PSU A;  4Y3W A;  4ZEA A;  5APR E;  4XKX A;  3S56 A;  5P73 A;  5P1I A;  5P6A A;  3IVI A;  3IND A;  2ER9 E;  2QP8 A;  4E43 A;  3TOF A;  5P3J A;  5P6C A;  4Y5G A;  3VSW A;  3OHF A;  3L5C A;  5P2L A;  5ENM A;  3B80 A;  3IN3 A;  1APV E;  1EED P;  4GJD A;  4J17 A;  4GJ9 A;  4WY6 A;  5P4Q A;  3OXV A;  2AZC A;  3UDM A;  1XE6 A;  3TOH A;  4RYG A;  1MET A;  1HTF A;  2BQV A;  4AA9 A;  5BRY A;  3O9D A;  5P37 A;  3JVW A;  5P75 A;  4RYC A;  3LIV A;  5P5H A;  3URL A;  5HE4 A;  5P1S A;  5P7L A;  2Q15 A;  5CON A;  3EM6 A;  5P2M A;  2HC0 A;  1EBZ A;  1SDT A;  3OWN A;  4I0E A;  4ER4 E;  3SQF A;  3Q6Y A;  4J54 A;  1HVR A;  5DR0 A;  2AOE A;  4QJA A;  3DV1 A;  4DUS A;  3HBO A;  4Y54 A;  4QJ2 A;  2WEC A;  2P3B A;  2OHN A;  5BS4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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