2G4NA

Anomalous substructure of alpha-lactalbumin
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
122
structure length
122
Chain Sequence
EQLTKCEVFRELKDLKGYGGVSLPEWVCTTFHTSGYDTQAIVQNNDSTEYGLFQINNKIWCKDDQNPHSSNICNISCDKFLDDDLTDDIMCVKKILDKVGINYWLAHKALCSEKLDQWLCEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Allergen
molecule keywords Alpha-lactalbumin
publication title On the routine use of soft X-rays in macromolecular crystallography. Part IV. Efficient determination of anomalous substructures in biomacromolecules using longer X-ray wavelengths.
pubmed doi rcsb
total genus 41
structure length 122
sequence length 122
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2g4nA00
2D6BA 1GHLA 4DD3A 4IASA 3WXUA 2BQJA 1B7NA 1FKQA 1JTOL 3CSRA 4G4HA 1G7IC 5A3ZA 1JKCA 1HMLA 3BKVA 4IATA 2RSCA 4H9AA 1VAUA 1LJ4A 3GXKA 1LSEA 3MGWA 1G7HC 1LSCA 1LZ5A 208LA 2DQEY 1B7SA 2G4PA 2ZYPA 1CJ6A 1JEFA 1D9UA 3P68A 3QE8A 4GCDA 1UACY 4WL6A 3W3EA 5L3HA 4W96A 4MSTA 4WM3A 3AGGG 2DQJY 3P65A 3TMWA 1OP9B 3A92A 1KXYA 1KIRC 1NBZC 5KXNA 3AB6A 3A91A 4EMNA 1LZ1A 5EBHA 1QTKA 4DD1A 1NWGA 3LYTA 1LMPA 4XJIA 2BQDA 1JIYA 1HEQA 2VB1A 3AYQA 4NGZA 1VDSA 4XYYA 5I4WA 1B2KA 4ET8A 2BQLA 5L3IA 1IP7A 4M4OA 2C8PA 5L9JA 1GPQC 5I54A 4QY9A 4LZTA 3WW6A 4B4IA 4P2EA 1LKSA 2I26L 3CT0A 1GBOA 3IJVA 1IP4A 1GAZA 4XJFA 3WW5A 2ZYCA 1GE4A 4H8ZA 3AGHA 5LIOA 3TMUA 5B59A 1IR9A 1XFPL 2XTHA 4WLDA 1LZNA 5LVIA 5KXXA 5APEA 1BB3A 5LYTA 1J1OY 5E4PA 5KXWA 5B05A 1UIEA 2ZIJA 1IR7A 1FKVA 1LJIA 1LJKA 1D0LA 3EMSA 4CFOA 1LHMA 1WQRA 5KY1A 4OOOA 4PHIA 1LHIA 4WM5A 1GAYA 3SP3A 4ZEEA 1IC7Y 2HU3A 1AZFA 1GBWA 1LZGA 2BQKA 3HBDA 4LT0A 4N8ZA 1GEVA 4ETBA 3ATOA 1LHHA 4GN4A 5LVKA 5F81A 4HJZA 4HV2A 1RFPA 4EOFA 4LFXA 1NDMC 1IWWA 1FN5A 2HU1A 3AZ4A 5LAGA 4YEOA 4H93A 4XJBA 5HQ1A 1LSNA 1YAOA 4LYTA 4PJ2C 5FELA 4Z41A 1JITA 3LYMA 1LHLA 4NHPA 1VDTA 4R6CA 1IWXA 1YKXX 1BQLY 2DBTA 1KXWA 3WVXA 1FLUA 1XEKA 2GV0A 2H9JA 3B72A 1XEJA 3AJNA 1IP2A 1JJ1A 5KXZA 1IWYA 4CGEA 1WQOA 1CKGA 2DKVA 5LINA 1WQPA 1GB9A 1OUAA 1IP3A 1GFUA 1HEWA 3BKHA 1J1PY 4NGVA 1G7LC 2A7FA 3TXFA 4GCBA 1WQMA 2LYMA 1BGIA 1LYYA 2FBBA 2W1MA 3WU9A 1XGUC 2Y8PA 2F2NA 1XEIA 1DQJC 5HNLA 1VDQA 1HEPA 4LYCA 1YQVY 4PPOA 1JSEA 1JJ3A 3LHMA 4NHTA 1ZVHL 4Z98A 1I20A 4NSIA 2F30A 4XN6A 1JSFA 1LJFA 2N5ZA 4DD2A 1XGTC 4GCCA 1IC5Y 4WLYA 1B5ZA 4ZIXA 1O23A 3LYZA 2Z2EA 1LZAA 1HENA 4ETAA 1H87A 2MEIA 4OWCA 1FBIX 4ET9A 1LKRA 1HERA 2BLXA 4LT3A 3TMXA 1GBZA 1JUGA 3LZTA 1KIQC 3TXHA 2BQFA 5I4XA 5KXMA 3VWOA 1HFYA 3A94A 1LMOA 1LCNA 1REYA 1GDWA 1HSXA 3N9AA 1LZRA 4ETCA 1LSYA 5HMJA 1LZTA 1B5UA 4NWHA 132LA 4DD0A 2HEFA 4OWEA 4PRUA 2HEEA 2YBJA 1LYZA 4PGJB 1LJNA 1UIBA 4HTNA 1EQ4A 3HBHA 1UIDA 1QSAA 1DPWA 5HMVA 3A3RX 1IOTA 4NSJA 4XENA 5LXWA 1HFXA 1LJEA 1XSFA 4NHSA 1YAMA 2MEBA 1V7SA 1HEMA 1QSWA 1IWUA 1LJGA 3A8ZA 5KKJA 1ALCA 1GEZA 3K3TA 5LVJA 3TXBA 5KJ9A 1D6QA 4UWVA 4BADA 1IOSA 4B0DA 5APCA 4W94A 4WM1A 5KXLA 2MEFA 1IWTA 3P66A 3KAMA 3WPKA 2DQFC 3WPJA 2Z37A 1ZV5L 1TBYA 4H9IA 1T6VL 4H9EA 1B0DA 1IY4A 1UC0A 3WULA 2LZTA 4YF2A 1LOZA 1GF9A 1FLQA 1OUEA 5I5QA 1I1ZA 1E8LA 4NSGA 4QDNA 3WMKA 5JENB 1G7MC 2EPEA 5FEKA 3W6DA 2YSSC 3J4GA 133LA 1GB8A 1UBZA 4RW1A 1A2YC 4H1PA 1A4VA 5KXSA 1LZ8A 1DXJA 2BQEA 4LYOA 4LT1A 1LSMA 3ZVQA 2FBDA 3B0IA 1UICA 5ILFA 4G4BA 2HUBA 2ZQ4A 3WUAA 1AM7A 1SLYA 1DI3A 3TXIA 1LMQA 1OUHA 5APDA 5IDDA 1IR8A 1B7OA 1QIOA 4N9RA 5D5FA 1GWDA 2BQHA 3QNGA 1LSGA 3WUMA 5T3FA 1HHLA 4L41A 4DDCA 1C7PA 1B7PA 1IEEA 1LPIA 1LSDA 1WTNA 4H91A 4RLMA 3EXDA 1UIFA 4J1AA 1JPOA 3EBAB 1YL1X 4R0FA 2XBRA 1BVXA 4BS7A 1GBSA 4RW2A 1LAAA 2DQCY 1GF8A 4KL7A 1NF5A 3OJPA 5KKIA 1AT5A 4NSHA 1TEWA 3IWRA 1REZA 5LVHA 1DZBX 5KXPA 1HSWA 4ZFPA 1CJ8A 4WM4A 1BB4A 4LFPA 1C46A 4FDYA 1QDRA 3AW7A 4ML7A 4H9FA 1HMKA 1DI4A 3HBEX 3LN2A 4LYBA 1UA6Y 5KXRA 1D0MA 4H94A 1LYOA 1D0KA 4H92A 1GF6A 3WH1A 1YIKA 1FLYA 5B06A 3ZEKA 4J0LA 1IO5A 4G4CA 4RLNA 3W6FA 1B7QA 1YAPA 3WXTA 2ZILA 4DYGA 1CKDA 4NGJA 4GLAA 2BAAA 1INUA 4HJYA 3T6UA 2HEAA 1LMNA 1UCOA 1QUTA 3G3AB 1TDYA 4J1BA 5FHWA 4C5FA 2H5ZA 1IOQA 3J6KA 4DD7A 5HNCA 2AUBA 3CQLA 1LJ3A 3W6BA 2WARA 1LTMA 3AGIA 1CJ9A 5LYMA 2DQGY 1BB6A 1GE0A 2HEBA 1HEOA 2YVBA 2BQCA 2ZNXY 3CSQA 5AMYA 207LA 1OUDA 3AZ6A 2ZWBA 4TWSA 4CHXA 3HFMY 1BHZA 4KXIA 5KXOA 1B5VA 2YBIA 1LYSA 1LMTA 1XGPC 1YL0X 1GE1A 1GBYA 3IJUA 3OK0A 2D91A 1LHJA 1VFBC 1B7MA 1JJ0A 2Z12A 1NHEA 1DI5A 2MEEA 1B7LA 3LZ2A 3CT1A 1GXXA 2EIZC 4LGKA 193LA 3D9AC 2Z18A 2X0AA 1GF4A 1GB3A 4YENA 2D4IA 5FCPA 3E3DA 2HEDA 1LJJA 1VATA 2BQGA 1OUIA 5D5CA 1REMA 2Q0MX 4YEMA 1IP6A 1LZEA 1GE3A 4X3BA 1LZBA 4UWUA 3RU5A 4YM8A 1BB7A 1C45A 1IX0A 1DKKA 1GFAA 4HTKA 4OOTA 4HP0A 4NFVA 5F9UA 4NHQA 4WG7A 2W1LA 5B07A 2DQAA 3A6CY 4TSBA 4NY5A 1JISA 1T3PA 4LT2A 5DN4A 5FSTA 5I53A 1WQNA 4TSCA 1JKDA 1LMAA 2Z2FA 1N4FA 2DQDY 5LYZA 4AGAA 2BLYA 5K7OA 4O34A 3G3BB 1YKZX 1AT6A 1BB5A 1NDGC 5B1GA 4NGLA 1DKJA 2CJLA 3FE0A 1EQEA 4TUNA 6LYZA 1F6SA 2BQMA 1CKHA 4H90A 2W1XA 1FLWA 1NBYC 1HFZA 1VEDA 3WVYA 1LHKA 1KXXA 1LSBA 2PC2A 4HJVA 5J7CA 5ILCA 1GF3A 2MEGA 1LMCA 1VDPA 4NEBA 4QGZA 1GF7A 4CFPA 5F14A 2YBNA 135LA 2MECA 4B4JA 1TCYA 2BQAA 3A90A 5FDJA 2YDGA 1ZMYL 1JWRA 4II8A 1GFJA 1YILA 1WVVA 3M18B 2D4KA 2B5ZA 4GCEA 4NWEA 4WL7A 2LHMA 5M1YA 4WO6A 4KT3A 4NGYA 5DM9A 5F16A 1JKAA 1GB0A 1IVMA 1QDTA 1IWZA 2Z38A 3A34A 1IC4Y 1LZ9A 2A7DA 1GE2A 4N0JA 1BWJA 1GBXA 154LA 3TXKA 5KXKA 1W08A 4WLTA 4DT3A 1C10A 4OWBA 4DDAA 1OUGA 4A7DA 4NGOA 4XADA 1B9OA 1BWHA 1NKHA 194LA 1GB5A 4BAFA 1NQIA 2YBMA 3TMVA 5F9XA 1F6RA 4Z3MA 2BQIA 2MEDA 3T36A 1LSFA 4NIJA 1GB2A 3CSZA 4Z46A 1D6PA 5C6LA 1C43A 1I56A 3GXRA 4YOPA 1IY3A 3WYHA 1IOCA 4HV1A 3RNXA 1LZYA 4OWHA 4QEQA 1GF5A 2Z19A 1EL1A 1H6MA 3TXEA 3W6AA 4GN5C 4N1CC 1JTPL 3FI7A 3P4ZA 1PS5A 1WTMA 1LSPA 4XJGA 1RJCB 5LAFA 3WU8A 4M6DA 1B5YA 1GFGA 1OUBA 1QTEA 1XGRC 1XGQC 2DQIY 3LYOA 4HPIA 1LSZA 1HF4A 2ZIKA 5APFA 1IIZA 1RI8B 4I0CA 3WU7A 1JKBA 4NGKA 3B6LA 1CKCA 1GFHA 3QY4A 4WO9A 1GFEA 4RDSA 2ZNWY 4WG1A 4XJDA 5DN5A 1GFKA 1IORA 4IJ4A 4HPEA 4B1AA 2G4QA 3WUNA 2LYZA 2HECA 3A96A 3ULRA 4ETEA 4H8YA 2D4JA 1GD6A 2CGIA 4LYMA 5LVGA 1B7RA 1WQQA 1YKYX 1V7TA 3A6BY 2CWIA 4C3WA 4NHIA 5C6IA 1LZDA 4I8SA 2BQNA 1B5XA 3D3DA 8LYZA 4OWAA 3F6ZA 4WMGA 2MEHA 2I6ZA 1AKIA 2IFFY 1OUCA 3TXGA 1YROA 2DQHY 3EO5A 2FYDA 4TX7A 3A95A 1CNSA 4WM6A 2H9KA 3AW6A 2FYCA 4LYZA 3A93A 134LA 3A67Y 3AZ5A 4H9BA 5LA5A 4H9CA 4B49A 1UIHA 2BPUA 5DL9A 4G9SA 1C08C 5LA8A 3RT5X 4G49A 4ETDA 2XBSA 2EKSC 4H9HA 1Z55A 2C8OA 4GN3A 4HSFA 4TTDA 4UWNA 1W6ZA 4DC4A 4WOAA 2BQBA 1LZ6A 1GB7A 2I25L 4J7VA 3ATNA 1ZVYB 1RE2A 2F4GA 3N9EA 5IELA 1HNLA 1OUFA 1LZCA 2F4AA 1HELA 4U3XB 3N9CA 1UIGA 3A3QA 153LA 3WPLA 2NWDX 2MEAA 3WL2A 1F10A 1YANA 5A3EA 1CJ7A 1GDXA 1HC0A 1LZ4A 4N5RA 4PRQA 4DD9A 2CDSA 4GLVA 5I4YA 1IP5A 3AZ7A 1JTTL 1SQ2L 5B1FA 1GF0A 1QQYA 4AXTA 2YBHA 1GB6A 3RZ4A 4HTQA 1REXA 3W6EA 4ANRA 5E9RA 2IHLA 2Z39A 1IP1A 4GCFA 1JHLA 4WM2A 3W6CA 4KPMA 1OQMA 1PZYA 1GFRA 1CKFA 1J1XY 4MCKA 1F0WA 2YBLA 1LSAA 3TXDA 3P64A 4B4EA 2XJWA 5II3A 1IWVA 1QUSA 1BVKC 1RCMA 5KXYA 4XJHA 6LYTA 4E3UA 1GFVA 5HLLA 3CB7A 3CT5A 4D9ZA 5C6JA 1MLCE 1DPXA 4NGWA 1EQ5A 1GXV2 3M3UA 1BWIA 1FDLY 2ZQ3A 1UIAA 1LJHA 4H8XA 3RW8A 1GFTA 4NG8A 4BAPA 5IHGA 9LYZA 5KXTA 1UUZC 4FJRA 4DDBA 1KIPC 4MR1A 2LYOA 1YAQA 2HTXA 4OW1A 7LYZA 1G7JC 3TXJA 1OUJA 2W1YA 1P2CC 3B0OA 4WLXA 1NMMA 5DLAA 2BQOA 2EQLA 4NGIA 3B0KA 1TAYA 1B5WA 1MELL 2LZ2A 1LZSA 1WVUA 4NG1A 4CJ2A 3ZVQB 4DWXA 4N1EI 2G4NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D6BA 251LA 4IASA 3CSRA 4G4HA 1CV5A 1LJ4A 1L20A 2RBPA 1CJ6A 1JEFA 1D9UA 3P68A 3QE8A 2B6WA 1UACY 2B72A 4WM3A 3P65A 3TMWA 1QSQA 1KIRC 1CX7A 4EMNA 4OO9A 3G3XA 187LA 1QTKA 1NWGA 1G0LA 1LMPA 3LYTA 4XYYA 5I4WA 109LA 2BQLA 5L3IA 3C7YA 114LA 217LA 4B4IA 1L72A 4E97A 4ARQA 4XJFA 4I7PA 1L56A 3HU8A 2F2QA 1LZNA 3HDFA 2ZIJA 1LJKA 1D0LA 3EMSA 3DNAA 3HTBA 1LHIA 3SP3A 1GAYA 4DQJA 1LZGA 1GBWA 4N8ZA 3ATOA 4EOFA 1PQOA 4W54A 1IWWA 2OU0X 1L39A 3LYMA 1LHLA 4NHPA 4R6CA 1YKXX 1KNIA 1XEKA 2O7AA 3B72A 1XEJA 3AJNA 4CGEA 3C82A 2DKVA 1C6TA 150LA 2Q9EA 1J1PY 1L71A 1L54A 1L29A 1L31A 2W1MA 1C6BA 1VDQA 1CU5A 3LHMA 1JJ3A 4Z98A 1G0GA 2F30A 1L77A 4I7TA 1JSFA 2B73A 1LJFA 2N5ZA 177LA 4DD2A 1XGTC 239LA 1B5ZA 1HENA 3TMXA 5I4XA 2RAZX 3VWOA 1SWZA 2RB2X 132LA 1OV5A 2B74A 2HEEA 1EQ4A 3HBHA 1UIDA 5LXWA 5HMVA 1LJEA 175LA 1LYEA 2MEBA 1ALCA 1P6YA 4EXMA 1C65A 4B0DA 5APCA 1L10A 1L07A 1LGXA 1G0MA 1TBYA 1L14A 1IY4A 3WULA 1GF9A 1I1ZA 3WMKA 2OE7X 5JENB 2EPEA 1L26A 2YSSC 4EPFA 133LA 1GB8A 1UBZA 1LZ8A 1DXJA 2BQEA 4LT1A 1LSMA 2NTHA 5ILFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2D6B A;  1GHL A;  4DD3 A;  4IAS A;  3WXU A;  2BQJ A;  1B7N A;  1FKQ A;  1JTO L;  3CSR A;  4G4H A;  1G7I C;  5A3Z A;  1JKC A;  1HML A;  3BKV A;  4IAT A;  2RSC A;  4H9A A;  1VAU A;  1LJ4 A;  3GXK A;  1LSE A;  3MGW A;  1G7H C;  1LSC A;  1LZ5 A;  208L A;  2DQE Y;  1B7S A;  2G4P A;  2ZYP A;  1CJ6 A;  1JEF A;  1D9U A;  3P68 A;  3QE8 A;  4GCD A;  1UAC Y;  4WL6 A;  3W3E A;  5L3H A;  4W96 A;  4MST A;  4WM3 A;  3AGG G;  2DQJ Y;  3P65 A;  3TMW A;  1OP9 B;  3A92 A;  1KXY A;  1KIR C;  1NBZ C;  5KXN A;  3AB6 A;  3A91 A;  4EMN A;  1LZ1 A;  5EBH A;  1QTK A;  4DD1 A;  1NWG A;  3LYT A;  1LMP A;  4XJI A;  2BQD A;  1JIY A;  1HEQ A;  2VB1 A;  3AYQ A;  4NGZ A;  1VDS A;  4XYY A;  5I4W A;  1B2K A;  4ET8 A;  2BQL A;  5L3I A;  1IP7 A;  4M4O A;  2C8P A;  5L9J A;  1GPQ C;  5I54 A;  4QY9 A;  4LZT A;  3WW6 A;  4B4I A;  4P2E A;  1LKS A;  2I26 L;  3CT0 A;  1GBO A;  3IJV A;  1IP4 A;  1GAZ A;  4XJF A;  3WW5 A;  2ZYC A;  1GE4 A;  4H8Z A;  3AGH A;  5LIO A;  3TMU A;  5B59 A;  1IR9 A;  1XFP L;  2XTH A;  4WLD A;  1LZN A;  5LVI A; 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 4UWN A;  1W6Z A;  4DC4 A;  4WOA A;  2BQB A;  1LZ6 A;  1GB7 A;  2I25 L;  4J7V A;  3ATN A;  1ZVY B;  1RE2 A;  2F4G A;  3N9E A;  5IEL A;  1HNL A;  1OUF A;  1LZC A;  2F4A A;  1HEL A;  4U3X B;  3N9C A;  1UIG A;  3A3Q A;  153L A;  3WPL A;  2NWD X;  2MEA A;  3WL2 A;  1F10 A;  1YAN A;  5A3E A;  1CJ7 A;  1GDX A;  1HC0 A;  1LZ4 A;  4N5R A;  4PRQ A;  4DD9 A;  2CDS A;  4GLV A;  5I4Y A;  1IP5 A;  3AZ7 A;  1JTT L;  1SQ2 L;  5B1F A;  1GF0 A;  1QQY A;  4AXT A;  2YBH A;  1GB6 A;  3RZ4 A;  4HTQ A;  1REX A;  3W6E A;  4ANR A;  5E9R A;  2IHL A;  2Z39 A;  1IP1 A;  4GCF A;  1JHL A;  4WM2 A;  3W6C A;  4KPM A;  1OQM A;  1PZY A;  1GFR A;  1CKF A;  1J1X Y;  4MCK A;  1F0W A;  2YBL A;  1LSA A;  3TXD A;  3P64 A;  4B4E A;  2XJW A;  5II3 A;  1IWV A;  1QUS A;  1BVK C;  1RCM A;  5KXY A;  4XJH A;  6LYT A;  4E3U A;  1GFV A;  5HLL A;  3CB7 A;  3CT5 A;  4D9Z A;  5C6J A;  1MLC E;  1DPX A;  4NGW A;  1EQ5 A;  1GXV 2;  3M3U A;  1BWI A;  1FDL Y;  2ZQ3 A;  1UIA A;  1LJH A;  4H8X A;  3RW8 A;  1GFT A;  4NG8 A;  4BAP A;  5IHG A;  9LYZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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