The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
59
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structure length |
59
|
Chain Sequence |
GPLGSVVRAKFNFQQTNEDELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTHNGRTGWFPSNYVREI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of the SH3 Domain of betaPIX in Complex with a High Affinity Peptide from PAK2
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Rho guanine nucleotide exchange factor 7
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| molecule tags |
Signaling protein
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| source organism |
Rattus norvegicus
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| total genus |
11
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-02-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| X | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KXC A; 3EG1 A; 2HBW A; 1I0C A; 3NHN A; 1PNJ A; 3QWX X; 2CUB A; 3I9Q A; 2YUO A; 2PTK A; 1X27 A; 2CUD A; 3REB B; 4F14 A; 4LN2 A; 2JS2 A; 3VS3 A; 2HDA A; 3M0R A; 2FG0 A; 2K6D A; 1T3S A; 2YUQ A; 1YP5 A; 1XOV A; 2ED0 A; 2VKN A; 4KRT A; 4ZNX A; 1U06 A; 2XMF A; 2JMA A; 1J3T A; 3EHQ A; 2ED1 A; 2CH4 A; 4RTW A; 1TUC A; 1LCK A; 4J9D A; 1NEG A; 2KE9 A; 2X3W D; 2KR3 A; 4JZ4 A; 1KJW A; 2KRS A; 4LE9 A; 3PE0 A; 3VS1 A; 3RBB B; 2FRW A; 1E6G A; 2YUN A; 1QKX A; 2DL7 A; 1RLP C; 5GJV B; 2DBK A; 2A28 A; 2DF6 A; 2EKH A; 4IIO A; 5FWC A; 2JM9 A; 3M0Q A; 4J9I A; 1CKA A; 1SHF A; 1GRI A; 4HCK A; 1JQQ A; 2O88 A; 2EGC A; 4RTU A; 4D8K A; 1BBZ A; 4F17 A; 1A0N B; 2JW4 A; 4Z8A A; 4JPB W; 3M0T A; 3I35 A; 2L0A A; 2VWF A; 2LQW A; 2EQI A; 2GTJ A; 2JM8 A; 2ROL A; 2J06 A; 2CT3 A; 2J6O A; 2D8J A; 3LH5 A; 1MV3 A; 2FEI A; 4K11 A; 4RTX A; 1HJD A; 1NYF A; 2H8H A; 4Z88 A; 2KBT A; 3I5S A; 1M30 A; 2KEA A; 2NUZ A; 4M4Z A; 4HVW A; 1W1F A; 2AKK A; 2M51 A; 5IHN A; 2LNH B; 2K9G A; 1BK2 A; 4Y92 A; 1WDX A; 1CSK A; 4AFQ C; 5IXB A; 2YT6 A; 1UJ0 A; 1W6X A; 3QWY A; 2L3S A; 3RNJ A; 4AG2 C; 2LJ1 A; 2J6K A; 4A63 B; 2ABL A; 1JO8 A; 1K0X A; 1GCQ A; 1WYX A; 1MV0 B; 2DX1 A; 2DRK A; 1UE9 A; 3EGU A; 4E6R A; 1B3Q A; 1ZSG A; 2V1Q A; 2DL8 A; 1X43 A; 2GTO A; 4IIM A; 1UDL A; 4J9B A; 3KFV A; 1UHF A; 3CQT A; 2BZY A; 3M0U A; 4HXJ A; 1WIE A; 2CH4 W; 1UEC A; 1V1C A; 1BB9 A; 2ROT A; 1NLP C; 4J9F A; 1UUE A; 2MIO A; 5IXF A; 2P4R A; 1M3C A; 3H0H A; 2O31 A; 1GBQ A; 2J6F A; 1K1Z A; 2W0Z A; 1TUD A; 4GBQ A; 1N5Z A; 2MCN A; 3PVL A; 1JXO A; 1K4U S; 4QT7 A; 4EIK A; 2GGR A; 1OV3 A; 3EG0 A; 4HVU A; 3H0F A; 3I5R A; 1GCP A; 4X1V A; 2DBM A; 1JU5 C; 2EPD A; 1E7O A; 2LJ3 A; 3UAT A; 2K7A A; 1JXM A; 3NGP A; 1G83 A; 1WFW A; 1EFN A; 1QLY A; 4RTV A; 2RMO A; 5HCK A; 2F2V A; 4J9C A; 2EW3 A; 2HEQ A; 2QDL A; 1SHG A; 3TVT A; 2HSP A; 3ZL7 C; 2L3P A; 2IIM A; 1B07 A; 2I0N A; 4ESR A; 2D8H A; 4CC4 B; 1SEM A; 4Z89 A; 1M27 C; 1UTI A; 4R0K A; 4OMP A; 4OMO A; 5IHI A; 2YUP A; 2DL4 A; 1U3O A; 5IHK A; 1H3H A; 2EGE A; 4JJB A; 5ECA A; 1PKS A; 2VVK A; 2DE0 X; 5I22 A; 2DJQ A; 2KXD A; 4LUE A; 2BZX A; 1BU1 A; 1M3A A; 2AZV A; 2CSI A; 2KT8 A; 3VS6 A; 1SSH A; 2BTT A; 1S1N A; 1ZUK A; 2EBP A; 2FPF A; 3PVQ A; 4CC7 A; 4DEY A; 2EYZ A; 1SRL A; 2ESW A; 1YWO A; 1UG1 A; 3VS2 A; 1ZX6 A; 3H41 A; 4JJD A; 2J7I A; 1KSW A; 2AZS A; 2DLP A; 3VRY A; 1H92 A; 1WXB A; 4RTZ A; 5I11 A; 1HD3 A; 2BZ8 A; 1YNZ A; 2FRY A; 1OEB A; 4FSS A; 1AOJ A; 3VS0 A; 1SRM A; 1M8M A; 1IO6 A; 2C0I A; 5EC7 A; 1QKW A; 1ZBJ A; 1NLO C; 4AFZ C; 2RQT A; 1K0S A; 1JEG A; 1UFF A; 2DL3 A; 3A98 A; 2W10 A; 3M0S A; 1T0H A; 1SPK A; 1K9A A; 1QWE A; 1AWO A; 2YDL A; 2CSQ A; 2LX7 A; 4AG1 C; 3NPF A; 1X6B A; 1X6G A; 1RLQ C; 1HSQ A; 3R6N A; 2CT4 A; 1T0J A; 2C0T A; 5FWB A; 1I07 A; 2RQR A; 3TSZ A; 1UJY A; 2OAW A; 2LMJ A; 3VRZ A; 1AWX A; 1Z9Q A; 1Z9Z A; 3GBQ A; 5FW9 A; 1X2Q A; 2JS0 A; 2O9S A; 3VS4 A; 2KRM A; 1M3B A; 3EG3 A; 4J9G A; 3U23 A; 2JMC A; 3VS7 A; 3UA7 A; 2RN8 A; 1GBR A; 1QCF A; 3JV3 A; 1AWJ A; 1U5S A; 2M0Y A; 1OPL A; 2ECZ A; 5IH2 A; 1YN8 A; 2A36 A; 2L2P A; 1T3L A; 1GFC A; 1NG2 A; 2RQU A; 2LCS A; 1ARK A; 5GJW B; 1OOT A; 1WXT A; 2ENM A; 4LUD A; 1G2B A; 2LQN A; 2D0N A; 2B86 A; 1VYT A; 1Y57 A; 2LJ0 A; 4OMM A; 3IQL A; 1NYG A; 1WXU A; 1KFZ A; 1CKB A; 4AFS C; 4OMQ A; 1OPK A; 2RF0 A; 1H8K A; 4GLM A; 1VYU A; 2G6F X; 1WI7 A; 2DMO A; 2KRN A; 4HVV A; 3SHW A; 2LZ6 B; 2OJ2 A; 4OMN A; 1K76 A; 2OI3 A; 3ULR B; 3M0P A; 4D8D A; 1MUZ A; 1PHT A; 4DEX A; 4RUG A; 2J05 A; 2EYX A; 1Y0M A; 2DNU A; 2E5K A; 1ZLM A; 2GBQ A; 2JXB A; 2KYM A; 2RNA A; 2EYW A; 1AD5 A; 2DL5 A; 2V1R A; 2K3B A; 3UA6 A; 4LNP A; 2L3Q A; 1NM7 A; 4F16 A; 2X3X D; 2RQW A; 3EHR A; 4J9E A; 1VA7 A; 2JTE A; 3H0I A; 1GL5 A; 2K79 A; 3EG2 A; 2O2O A; 2KNB B; 2CDT A; 2RQV A; 2GNC A; 4CC3 A; 1PRM C; 2EYY A; 2EGA A; 2DM1 A; 1ABO A; 2FO0 A; 1GCQ C; 2PZ1 A; 1PWT A; 1PKT A; 2PNI A; 1I1J A; 2DRM A; 1FYN A; 2HCK A; 3SEM A; 1WA7 A; 1X2K A; 4RTY A; 4J9H A; 1X69 A; 1GFD A; 1WX6 A; 4RTT A; 3TSW A; 3UF4 A; 2D1X A; 2FPE A; 2SEM A; 4CC2 A; 2GQI A; 2A37 A; 1PRL C; 2DA9 A; 1NEB A; 2A08 A; 2F2X A; 1AZE A; 1AVZ C; 1W70 A; 1UGV A; 2CRE A; 1YCS B; 2FPD A; 3C0C A; 1QWF A; 2LP5 A; 3FJ5 A; 1AEY A; 2AKL A; 4JJC A; 3REA B; 4JZ3 A; 1E6H A; 1VYV A; 1ZUU A; 4OML A; 4ORZ A; 2NWM A; 1YWP A; 2KGT A; 1ABQ A; 2DIL A; 2DYB A; 3VS5 A; 3NMZ C; 3O5Z A; 1ZUY A; 2C0O A; 1TG0 A; 2YSQ A; 4WCI A; 1AZG B; 1RI9 A; 1RUW A; 2RPN A; 4AFU C; 2O9V A; 2KRO A; 1WLP B; 1UHC A; 2F2W A; 1AWW A; 1FMK A; 2KYB A; 2EVR A; 2AK5 A; 2DVJ A; 1KIK A; 2MOX A; 2SRC A; 2K2M A; 3THK A; 2JT4 A; 2KT1 A; 5L23 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1I0C A; 5KCH A; 1XJW B; 4IUV A; 1PNJ A; 3CCQ Q; 3QWX X; 4J7F A; 1VQ9 A; 5GAN f; 5GAN g; 1WHM A; 2PTK A; 4XU3 A; 4PJL A; 5DLO A; 3QBY A; 4F14 A; 3V7C A; 5GAN 8; 4PLI A; 5GMK j; 3JB9 D; 3EFO B; 1B34 A; 2K6D A; 5A0G A; 1BIB A; 1XOV A; 4XU1 A; 2ED0 A; 2VKN A; 4KRT A; 3CCE A; 2WAC A; 1ACM B; 3D7S B; 3RKY A; 3OS1 A; 1U06 A; 2CP0 A; 5CKF A; 2R58 A; 2ZPH B; 1OZ3 A; 2E3I A; 4E7J A; 2CH4 A; 3KBG A; 4RTW A; 2RK2 A; 2X4X A; 4J9D A; 5GMK h; 3CC2 T; 4M7D A; 5GAN 5; 3A5Z B; 1QVF S; 2GQV A; 4ZGE B; 4OGE A; 3A8M B; 2YUN A; 2DL7 A; 3CC7 Q; 1UGR B; 2A28 A; 5FRO A; 2DF6 A; 4ELY C; 4IIO A; 2RM4 A; 5FWC A; 2ZPB B; 2PQW A; 1ZSZ A; 2CKK A; 2K5I A; 1QVF A; 4MDX A; 2DZ9 A; 2QG9 B; 4RTU A; 1VQM A; 3OYY A; 3EFS A; 4JUV A; 4Z8A A; 3I56 A; 2QXF A; 2LQW A; 2CYZ B; 1YHQ Q; 3CC4 T; 2EQI A; 5KYY B; 3G4S T; 3CCU Q; 2OX7 A; 1TOV A; 4C92 B; 1R8O B; 4K11 A; 2M0O A; 1B34 B; 2QQ9 A; 4FL6 A; 2AIR B; 1I4K 1; 5CKB A; 2RHU A; 3I5S A; 2A7Y A; 4PFO A; 4HVW A; 1YFN A; 1LPL A; 2CP2 A; 3E2U A; 2IPO B; 1WDX A; 3EG9 A; 5I2S A; 5A2Q E; 2LC4 A; 5GAN e; 3GP8 A; 1VQ5 T; 2PUO B; 5CKD A; 4RMO A; 5GAN h; 4AG2 C; 2RI3 A; 2C06 A; 3M54 A; 1JJ2 S; 2J6K A; 1JO8 A; 3RDV A; 3JSC A; 5AYF A; 1MV0 B; 2DX1 A; 2DRK A; 3GF5 A; 5FU7 B; 1M90 U; 3EGU A; 4BI8 B; 1U1T A; 2V1Q A; 4KUI A; 4J6W A; 1W2B P; 1RAD B; 2GTO A; 5LJ5 g; 3LGL A; 2NUP B; 2XU8 A; 1UHF A; 3KFV A; 1JJ2 A; 5GAO p; 4M75 D; 1VQN Q; 1WJR A; 3M0U A; 4C0Z A; 2EQU A; 1VIE A; 1V1C A; 4PFZ A; 4QQG A; 2MIO A; 5A0D A; 5GMK l; 2MF2 A; 3S3N A; 3MP8 A; 2RJC A; 2MCN A; 1H64 1; 2XDB A; 1JXO A; 2GGR A; 1ZA1 B; 1OV3 A; 5I21 A; 3H0F A; 4PKC C; 4EMK A; 3CCQ T; 1GCP A; 3M55 A; 3EG9 B; 4X1V A; 2NLU A; 3HRT A; 4FT2 A; 4JRQ A; 3X20 B; 3UAT A; 1R77 A; 8ATC B; 1EX4 A; 1HXD A; 2CP7 A; 2MPX C; 4RTV A; 5HCK A; 4YTL A; 2F2V A; 1YJN T; 2XD0 A; 1IXD A; 4IUT A; 1BI2 A; 2HSP A; 2RJE A; 2L3P A; 2I0N A; 4XTZ A; 4O6J A; 1M27 C; 1VQO Q; 1UTI A; 2FZC B; 5LL6 S; 4J5Y A; 2COW A; 2DXC A; 1F1B B; 5ECA A; 2CZ7 B; 1WHG A; 3Q1J A; 4N4H A; 2CSI A; 4M78 D; 4XK8 E; 1SSH A; 4XTV A; 5GAN 2; 1S1N A; 3A8O B; 1I5O B; 4CC7 A; 1NPR A; 3HKS A; 2ESW A; 1YWO A; 9ATC B; 5LJ5 e; 1ZX6 A; 5EG2 A; 3H41 A; 4JJD A; 2F5T X; 4EMK B; 1KSW A; 3VRY A; 4QVD A; 5LJ5 h; 3RES A; 3QDF A; 4RTZ A; 5I11 A; 1SG5 A; 5HK3 A; 3OYN A; 1C6V X; 1OEB A; 4WTO B; 4FSS A; 1AOJ A; 3CCU T; 4D6W A; 1WNL A; 2O01 E; 5EC7 A; 1QKW A; 3QO3 A; 1Q7Y U; 3OB9 A; 2QQR A; 3MHX A; 4DQ2 A; 4BDZ A; 2DL3 A; 5GAM d; 4DOV A; 3M0S A; 1K9A A; 1AWO A; 1FMW A; 1MGQ A; 4F7U A; 2D6F A; 2OTL Q; 1X01 A; 1OUL A; 1UGP B; 4LDY A; 1X6G A; 4MML A; 2RI5 A; 3GNG A; 1YCY A; 1WHH A; 3OYM A; 2EKO A; 1UJY A; 2OAW A; 2MAM A; 4KH0 B; 1M90 R; 3GBQ A; 1G3W A; 1OI1 A; 1X2Q A; 1IB8 A; 2HKQ B; 2OAU A; 1TH7 A; 4C92 D; 3CBO A; 4OVA A; 4J9G A; 1N9S A; 4M77 A; 3U23 A; 4ZN1 A; 4A4H A; 4C0D C; 1R0C B; 1AWJ A; 5IH2 A; 2A36 A; 3HPW A; 1T3L A; 4M78 G; 1NG2 A; 2LCS A; 3RUX A; 3CC4 A; 1JB0 E; 4LDV A; 3G4S A; 1BIA A; 1G2B A; 2XDP A; 5D6X A; 1S72 A; 4PL6 A; 1W4S A; 3MEA A; 4OMM A; 3IQL A; 5KH6 A; 3P8H A; 1WXU A; 3V7R A; 1N8R U; 2ZPF B; 2HL3 A; 5KCO A; 1VUB A; 2RF0 A; 4N4G A; 1WI7 A; 2QGG A; 1YJW Q; 4OB0 B; 3CCL Q; 2OJ2 A; 1VQ5 A; 1G8X A; 2O4X A; 2OI3 A; 3M53 A; 2PVG B; 4DEX A; 4J6X A; 4KH1 B; 1QVG P; 1YI2 A; 3ME9 A; 4DOW A; 2EIF A; 2LCL A; 1MND A; 1VQO T; 2F1L A; 3FLG A; 1AD5 A; 3L2R A; 2V1R A; 3UA6 A; 2OTJ A; 3JCM b; 2RQW A; 4M78 C; 1VA7 A; 1D1C A; 1YIT Q; 2K79 A; 4JLI A; 3PFS A; 2O2O A; 1C0M A; 3QZ9 B; 2RQV A; 4M7D G; 1NBE B; 1ABO A; 1TTH B; 2PZ1 A; 5KYX A; 2XIC A; 4XTY A; 5KYU A; 3CCQ A; 5DM7 R; 1VQ9 T; 2PVO B; 3RKW A; 1I1J A; 3OS5 A; 1Q7Y R; 2DRM A; 3OBW A; 1WA7 A; 3CBP A; 3OS2 A; 1X69 A; 3OYJ A; 3ASK A; 1VQL Q; 1WX6 A; 4RTT A; 2H3E B; 2EYQ A; 4ZTJ A; 1IGU A; 2LVM A; 5CK9 A; 2A08 A; 1AZE A; 1SSF A; 2X4W A; 1K8A C; 2OTL T; 4JLG A; 1I5L A; 3QYG B; 3V7S A; 2FPD A; 3BDL A; 1NJI C; 2LP5 A; 4FW1 A; 4JZ3 A; 1E6H A; 1VYV A; 3CC7 A; 2KGT A; 2DYB A; 1VQP Q; 3DLM A; 2X4J A; 4A54 A; 1TG0 A; 1AZG B; 3CCM Q; 2E41 A; 2DPP B; 2KRO A; 1M5Q 1; 1UHC A; 3G6E Q; 3J7A F; 2JZ2 A; 2DFU A; 2EVR A; 5KYX B; 4M7D C; 2AK5 A; 4Z02 A; 3I56 T; 2COZ A; 1KIK A; 2DK3 A; 2GCX A; 1YHQ A; 3THK A; 3RR6 A; 3NFC A; 5L23 A; 3EG1 A; 5GAO l; 4Q5W A; 1KC8 U; 1H3Z A; 3OYA A; 3CCU A; 1MMD A; 1RAE B; 3P8D A; 3VUB A; 2HKN A; 3I9Q A; 1ZSZ C; 4XAX B; 2Y4X A; 1X27 A; 4PLL A; 4LN2 A; 3LYI A; 2EQM A; 1YJW T; 3OA6 A; 2YUQ A; 1YP5 A; 4F7U E; 3DLL A; 3N5B B; 2HMA A; 1D3B A; 1QCN A; 1GXI E; 3WXM B; 2KR3 A; 2AHJ B; 1KJW A; 3E9G A; 4LE9 A; 2FRW A; 2VGN A; 3MEU A; 2DKG A; 1QKX A; 3X25 B; 1O75 A; 2KQW A; 4M77 E; 2DEU A; 5LJ3 g; 2DBK A; 2EKH A; 5GAN 3; 1AT1 B; 3HRS A; 1VOM A; 3PGG A; 1VQN A; 4GLK A; 4BE1 A; 1ZQ1 A; 1QVF P; 1GRI A; 3R6O A; 3LH0 A; 2O88 A; 3ZFJ A; 2MK5 A; 2FL7 A; 2DEQ A; 2RO0 A; 1M2V A; 4JPB W; 3M0T A; 3I35 A; 4C5E A; 1YIT T; 4NOY A; 5D6W A; 1D0Y A; 4KUL A; 5IN1 A; 2FEI A; 3JCM Q; 1TS9 A; 1HJD A; 2H8H A; 4C0D B; 2DIG A; 1M30 A; 2KEA A; 3UT1 A; 1W1F A; 2AKK A; 3QUI A; 2LNH B; 2K9G A; 2MI6 A; 1VQL T; 1CSK A; 4AFQ C; 2YT6 A; 4C0G A; 5D7U A; 4EMH A; 3NTH A; 1W6X A; 3QWY A; 3RER A; 3JCM W; 2L3S A; 5FRM A; 2L89 A; 2AT1 B; 1UGS B; 1YJ9 Q; 1VQO A; 4OF1 A; 2KDS A; 1WYX A; 4IKF A; 4XTX A; 2DTH A; 4E6R A; 1B3Q A; 3H6Z A; 2DL8 A; 2QQB A; 3H9N A; 3VKI A; 4C8Q E; 2ZAE A; 2QQA A; 4E7Z A; 1VQP T; 1PSF A; 3BDU A; 4F7U G; 3CCM T; 2ROT A; 1XQH A; 4J9F A; 1UUE A; 3JCM J; 1M3C A; 3H0H A; 1GBQ A; 2J6F A; 5LJ3 h; 3MEW A; 1KC8 R; 3I55 Q; 3PVL A; 3J81 E; 3H8Z A; 2GF7 A; 1KC8 C; 2YWW A; 3EG0 A; 4HVU A; 4M78 B; 2XK0 A; 3I5R A; 4M77 G; 2YXY A; 3RMS A; 1RAI B; 3CMA Q; 3LWI A; 3MCA B; 1E7O A; 4UC4 A; 6AT1 B; 1WFW A; 1OX9 A; 1EFN A; 1K9M U; 5HY6 A; 2OTL A; 3M57 A; 3QDR B; 2QDL A; 1B07 A; 4CC4 B; 1SEM A; 4Z89 A; 1VIF A; 4TVR A; 2BE7 D; 4OMO A; 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