2GD8A

Crystal structure analysis of the human carbonic anhydrase ii in complex with a 2-substituted estradiol bis-sulfamate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title 2-substituted estradiol bis-sulfamates, multitargeted antitumor agents: synthesis, in vitro SAR, protein crystallography, and in vivo activity.
pubmed doi rcsb
total genus 80
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-03-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2gd8A00
3DCCA 3M2ZA 3DD0A 1FQLA 3TVOX 3MNJA 4WUQA 4Q06A 2Q1BA 3S72B 1TEUX 5JDVB 5L6KA 4QTLA 4QIYA 2ZNCA 1J9WA 4QK1A 3P5LA 4E5QA 5JEGB 4E3GA 1CCUA 1CNXA 5FLTA 2GD8A 4Q7WA 4JS6A 5FNLA 3IBUA 2FMZA 3V3GB 4Z1EA 4FL7A 2POUA 4LHIA 5E28A 3B1BA 3GZ0A 4ZX0A 5FDCA 5FNIA 4YGKA 2CABA 3M67A 3KS3A 3M98A 4MO8A 4E3DA 3K7KA 3PJJA 4R5BA 2NNOA 5DSLA 2VVAX 3RZ8A 1HEBA 2EU2A 2NNSA 1I9MA 4TWMA 3U47A 2FMGA 1OKLA 1CZMA 1BNWA 5E2MA 1TH9A 5A6HA 1UGGA 3RZ7A 1UGAA 5CJFA 3M2XA 1IF5A 5EHEA 4Q90A 1CAHA 3K2FA 2NXRA 1UGDA 4YYTA 4L5VA 3RG3A 3S78B 4IWZA 5BNLA 4Q08A 5EH8A 3T84A 3U7CA 1G0EA 3KNEA 5CA2A 4Z1NA 3S9TA 1BNUA 1URTA 1XEVA 3LXEA 4Z1KA 1BNMA 4MLXA 4RUZA 1BZMA 3U45X 1XQ0A 3MDZA 3F7UA 3MNUA 5BYIA 5FLRA 3DC9A 3M14A 1FR4A 3M96A 3MNAA 2EU3A 1F2WA 5FDIA 3T5UA 2CBCA 2O4ZA 3V3JA 3P4VA 5E2SA 4K0ZA 1YDCA 2HL4A 4FPTA 2OSMA 1I9QA 4KNIA 4ZWYA 1RZBA 1ZSAA 4Q6EA 2H15A 1RJ5A 2CBBA 1V9EA 2X7UA 1A42A 3DVBA 4K1QA 5J8ZA 1CVAA 1CCSA 1AVNA 1JCZA 1IF7A 1DMYA 1CNBA 4CA2A 3SBIA 5E5UA 3S75B 2HKKA 4FVNA 5G0CA 4JSWA 1YDDA 2F14A 5EH7A 1RAZA 1HECA 3N0NA 1ZGEA 3TVNX 1XEGA 1KWQA 2HFWA 1DCBA 3BL0A 3S71B 1TBTX 2NWOA 3OKUA 3DVCA 1TG9A 1I8ZA 4Q83A 4HEYA 1Z97A 4HT2A 1CINA 7CA2A 4K0TA 4MTYA 4Q7VA 5DSNA 3Q31A 4HF3A 4PZHA 5SZ5A 5FLSA 3NB5A 1CNGA 3V3IB 4ITOA 4MDLA 1YO2A 3M1WA 3EFTA 3F8EA 4ILXA 3HLJA 3TMJA 3IBIA 5EZTX 3ZP9A 4ZX1A 1RZAA 1CNHA 4YHAA 3MNKA 1OKMA 2NN7A 3BL1A 3CA2A 3KIGA 2H4NA 1BNNA 3M04A 3MHLA 3RYXB 3M3XA 1ZGFA 1BCDA 3M2NA 4WUPA 3ZNCA 1H4NA 4CACA 5SZ4A 3HKQA 4Q99A 4CQ0A 1CNWA 3M2YA 4WW8A 4YGJA 9CA2A 3PYKA 4PXXA 1CRAA 4ZAOA 3T82A 3RG4A 3N4BA 3P5AA 3DD8A 4Q8ZA 3KOKA 1CILA 4RN4A 1OKNA 4ETQC 4YXOA 4ITPA 1CNIA 4Q87A 2HOCA 5IPZA 4WR7A 4BF6A 1HEAA 3HKTA 8CA2A 1AM6A 1TB0X 2HD6A 1RZDA 3IBLA 5FNHA 1CIMA 3NI5A 3KKXA 1UGEA 1G48A 1IF6A 1KOPA 5FLQA 1FSQA 4L5WA 1G46A 1CVHA 3S77B 4R59A 4Z1JA 3NJ9A 4DZ7A 1LG6A 3DCWA 3JXFA 1CALA 1CVEA 5G03A 4KV0A 1ZE8A 3T5ZA 1HVAA 1BNTA 1FSRA 4HEZA 3MZCA 4RUXA 4N16A 5FNMA 5FL6A 1G3ZA 3HS4A 5SZ0A 1DMXA 1I9LA 1FSNA 6CA2A 3OIMA 3DCSA 3T85A 3OILA 1EOUA 3N2PA 2X7SA 4KP5A 5JQTA 1G1DA 2Q1QA 5DOHA 3L14A 3FW3A 4YX4A 1G45A 4N0XB 3DA2A 1CAIA 5FLOA 3C7PA 4C3TA 4KNNA 4QK3A 1CVDA 1MUAA 3N3JA 4QY3A 5JGTB 4Q6DA 5FL4A 4Q7SA 4XE1A 2WEGA 4YGLA 4E3HA 1CAZA 2QO8A 5EH5A 3KWAA 1TEQX 1V9IC 1ZH9A 5DSPA 1JV0A 5E2KA 1KEQA 4MLTA 1FQNA 4QJ0A 3V5GA 1CNJA 4YXIA 4Q7PA 1JD0A 4TWLA 2POWA 3K34A 4FVOA 2FOUA 5E2NA 4Q49A 4ZWZA 4ZWIA 5JQ0A 1I90A 3D93A 2HNCA 1RAYA 1I9NA 3S74B 4QSIA 2Q38A 3IAIA 4MDGA 3MNIA 1TE3X 1CA2A 1CNYA 1Z93A 2NWYA 3RYYA 4XFWA 1ZSCA 3OIKA 3EFIA 4JSAA 4QK2A 4E3FA 2QOAA 1IF9A 1IF8A 4Q8YA 5CLUA 1CAMA 3FFPX 1KWRA 1CVFA 4M2WA 4YGFA 4X5SA 4XIXA 2CBAA 4QSJA 3DVDA 4YXUA 3D0NA 3RGEA 4KNMA 1TG3A 3D92A 3MYQA 4HBAA 5BRUA 3CZVA 5AMDA 1CVCA 4HU1A 3DV7A 2W2JA 1HUGA 2NWPA 5FNGA 2NXSA 5EOIA 5DSQA 1BV3A 3D8WA 4Q09A 5DSMA 1IF4A 1LZVA 4JSZA 4UOVA 1CRMA 3V3HB 4MDMA 2CBDA 1UGFA 2NN1A 4RFDA 3S8XA 4CNWA 1ZNCA 3RZ1B 4Q8XA 1YDAA 3MHCA 3U3AX 5JG5B 2FNNA 4WL4A 4Q78A 4BF1A 1CNKA 4Q9YA 3RYVB 2FOVA 2FOSA 3P3JA 1HUHA 5G01A 1UGCA 4QJOA 5EKHA 1I91A 1LG5A 4KUYA 5FLPA 5JEPB 2X7TA 1CA3A 3OY0A 2ILIA 3HKUA 3HKNA 1CAOA 1XPZA 4QJXA 2WD2A 3P55A 4R5AA 4KNJA 5JESB 3JXHC 1BNQA 1RZEA 1OQ5A 5SZ2A 3RZ0B 5DRSA 4RH2A 5DSRA 4QSBA 2WEJA 2ABEA 4YGNA 4E4AA 12CAA 3M1JA 3P58A 4L5UA 5FNKA 3RZ5A 3IEOA 3UYQA 5DSKA 1BNVA 1YO1A 5G0BA 2GEHA 4COQA 5C8IA 1I9PA 3SBHA 3S73B 3OYSA 4CNXA 4E49A 1YDBA 5EHVA 5DSJA 5L3OA 1CAJA 2POVA 3T83A 2NNVA 5A25A 4XIWA 1AZMA 1I9OA 4FU5A 2FW4A 4QIZA 2QP6A 1G54A 4Q81A 1FLJA 4PQ7A 1FQMA 3MWOA 4XZ5A 5EKMA 4M2VA 3KOIA 1Y7WA 4CNRA 4HT0A 4E9OX 2WD3A 4K13A 5DOGA 3S76A 4FIKA 2NMXA 5SZ3A 3BETA 4DZ9A 1BN4A 4RFCA 1RZCA 5BRVA 1G4OA 3MMFA 3KONA 3F7BA 3OKVA 3V3FA 3W6IA 4QJMA 3R16A 4HEWA 3ML5A 4KUVA 4KUWA 4K0SA 1HCAA 2AW1A 5SZ7A 1LGDA 3JXGA 4JSSA 1BICA 4RUYA 3V2MA 1DCAA 2EZ7A 3IGPA 3M1QA 5JG3B 5JGSB 4CNVA 4GL1X 4FRCA 2VVBX 3M40A 2NWZA 1ZSBA 4M2RA 1CVBA 3M5TA 3B4FA 4YWPA 4YVYA 1CCTA 3QYKA 4LU3A 3M1KA 3SAPA 1CANA 4Z0QA 1ZFKA 4QJPA 1T9NA 5EHWA 1Z9YA 2FNMA 5DVXA 3DC3A 1CAYA 5E5RA 3V7XA 4G0CA 1H9QA 3RJ7A 5CACA 1HEDA 5E2RA 3D9ZA 3SAXA 1G4JA 4QSAA 3MHMA 2IT4A 1HCBA 2WEHA 3DAZA 2NXTA 3M5SA 1THKA 1CAKA 4KP8A 4WW6A 3W6HA 4QJWA 1MOOA 4RIVA 4QEFA 5SZ1A 5DSIA 1ZFQA 1TTMA 1G53A 5LMDA 4IDRX 3P44A 3V2JA 3CAJA 3ML2A 3DBUA 1LUGA 3KLDB 4Q07A 4LP6A 4BCWA 2NNGA 2CA2A 4KAPA 1G0FA 3S97A 3CYUA 4PYYA 3R17B 5AMLA 2AX2A 1BN3A 2FNKA 4G7AA 1KOQA 1CNCA 3IBNA 1BN1A 5SZ6A 3MNHA 1G52A 5HPJA 5EIJA 3RLDA 5DSOA 5BRWA 1H9NA 3P3HA 3PO6A 5FNJA 5JEHB 2CBEA 3MHOA 4PYXA 2FOYA 4RIUA 2OSFA 5EKJA 5FL5A 3VBDA 1YO0A 5AMGA 3OYQA 1UGBA 3MHIA 3UYNA 2FOQA 3FE4A 1FQRA 1G6VA 3HFPA 3RYZA 4Y0JA 1FR7A 2WEOA 4ZWXA 3RYJB 4M2UA 3F4XA 3M5EA 4Q0LA 1RJ6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DCC A;  3M2Z A;  3DD0 A;  1FQL A;  3TVO X;  3MNJ A;  4WUQ A;  4Q06 A;  2Q1B A;  3S72 B;  1TEU X;  5JDV B;  5L6K A;  4QTL A;  4QIY A;  2ZNC A;  1J9W A;  4QK1 A;  3P5L A;  4E5Q A;  5JEG B;  4E3G A;  1CCU A;  1CNX A;  5FLT A;  2GD8 A;  4Q7W A;  4JS6 A;  5FNL A;  3IBU A;  2FMZ A;  3V3G B;  4Z1E A;  4FL7 A;  2POU A;  4LHI A;  5E28 A;  3B1B A;  3GZ0 A;  4ZX0 A;  5FDC A;  5FNI A;  4YGK A;  2CAB A;  3M67 A;  3KS3 A;  3M98 A;  4MO8 A;  4E3D A;  3K7K A;  3PJJ A;  4R5B A;  2NNO A;  5DSL A;  2VVA X;  3RZ8 A;  1HEB A;  2EU2 A;  2NNS A;  1I9M A;  4TWM A;  3U47 A;  2FMG A;  1OKL A;  1CZM A;  1BNW A;  5E2M A;  1TH9 A;  5A6H A;  1UGG A;  3RZ7 A;  1UGA A;  5CJF A;  3M2X A;  1IF5 A;  5EHE A;  4Q90 A;  1CAH A;  3K2F A;  2NXR A;  1UGD A;  4YYT A;  4L5V A;  3RG3 A;  3S78 B;  4IWZ A;  5BNL A;  4Q08 A;  5EH8 A;  3T84 A;  3U7C A;  1G0E A;  3KNE A;  5CA2 A;  4Z1N A;  3S9T A;  1BNU A;  1URT A;  1XEV A;  3LXE A;  4Z1K A;  1BNM A;  4MLX A;  4RUZ A;  1BZM A;  3U45 X;  1XQ0 A;  3MDZ A;  3F7U A;  3MNU A;  5BYI A;  5FLR A; 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