2GH9A

Thermus thermophilus maltotriose binding protein bound with maltotriose
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
KITVWTHFGGPELEWLKEQARTFERTSGTKVEVVEVPFAEIKQKFILGAPQGQAADLVVTVPHDWVGEMAQAGVLEPVGKYVTQAYLADLQGVAVEAFTFGGRLMGLPAFAESVALIYNKKYVKEPPRTWEEFLALAQKLTTGATFGFLYNIGDPYFNFGFFKAFGAENVFAKDAKGNLDPTKLLIGGEVGEKALQFIKDLRFKYNLVPEGVDYGVADGAFKDGALAMILNGPWALGDYKKAKVDFGIAPFPVPPGAKNPWGPFLGVQGVVVNAYSKNKTQAVNFAKTLVTGRNLVAFNQAGGRIPVSKSAVKQLEKDPVVAGFSKVFPLGAPMPNIPEMGKVWGPWGNAISLAIQRPDSNVKKIVEDMVAEIKKAIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural adaptations that modulate monosaccharide, disaccharide, and trisaccharide specificities in periplasmic maltose-binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Thermus thermophilus
molecule keywords maltose/maltodextrin-binding protein
total genus 124
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2gh9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2gh9A02
3TMGA 1CB6A 4YB5A 3K02A 1R1NA 2DWHA 4F2QA 2I4BA 5I57B 5TP9B 2I4CA 3QAXA 5J1DA 2G29A 2I0CA 1N7WA 1IEJA 3RTFB 3KN8A 4BDLA 3VDFA 1FTOA 1YCJA 1IITA 3K1NA 2AYSA 3CFZA 1QJMA 1P1NA 1H43A 2GH9A 3OO8A 3PD9A 3PU5A 4F1UA 2D3IA 1AMFA 1OMPA 3JV9A 4OEVA 1SW1A 2ESNA 3RPWA 4IY5A 4YU0A 4MF3A 2PYYA 1TT1A 2HZKA 2Y84A 3KOSA 4JSDA 4F19A 3KG2A 2O1LA 2H98A 1B7ZA 3OSRA 2Q8JA 4G4PA 5B7DA 3Q27A 5K2YA 2DYXA 1B3HA 4FIMA 5BWJA 1YAEA 4H0WA 2F7BA 4OFLA 1Q1KA 3H6TA 3TEPA 5AA3A 4BDOA 3PUVE 1LSTA 4G8MA 1VE4A 2V25A 3KGCA 1LCFA 3RQTA 1BP5A 4PFUA 4R75A 4QRZA 4EUOA 1TFAA 1ZU0A 3TELA 1A8FA 3IAZA 4OVJA 1ZMGA 1HSEA 3D4GA 4FAJA 3TTNA 4Z0IA 2W7YA 5ITPA 4XIGQ 5H8HB 3ONMA 2B3BA 2HEUA 1Y9UA 4H5FA 1PB7A 2QMWA 3BKIB 3UN6A 1N7XA 1SD3A 3Q29A 4U4XA 1OQGA 2HCAA 1HSJA 3MPLA 4I62A 3TQWA 1Y4CA 3U8QA 4E0XA 1R9QA 4E0WA 2XXYA 1MM6A 3T66A 4DLDA 4YB6A 5A5XA 2QS4A 3CFLA 4R9FA 3TPAA 4ECFA 1NMUA 1DOTA 4HTGA 1OLAA 2F6GA 5ICTA 5KCJA 5I58B 3A3CA 3Q25A 5H8FB 5IKBA 1MXVA 5HM4B 3IB2A 2OWTA 2YJPA 1D3KA 3V8XB 5AA2A 3FXQA 1AOVA 3EF7A 3G3FA 4Q8RA 4IY6A 1TWYA 4ZDMA 3PV0E 3KFMA 4YKPA 4ESWA 5CMMA 2OK2A 4NF6B 4YKKA 5CI5A 2YPNA 2M8CA 3IK6B 3MZ1A 2I58A 1SQYA 2RINA 2NVUB 1DMBA 5LOMA 3M8UA 4KYEA 3GZGA 4KYSA 3HV1A 4AB5A 1B0LA 1MQJA 2H99A 5EHSA 2Z8FA 4ZS9A 3CR9A 4X9TA 3MVXA 1AIVA 2LAOA 2HAUA 2H4IA 4G8HA 2QS2A 1FQFA 4MFIA 5AA4B 4JBZA 4KQPA 3V83A 2Q2CA 4OMBA 4KR5A 3MWBA 4N13A 2DWJA 1RYOA 5DYHA 1B1XA 3R26A 1PBQA 2G93A 5CRYA 2HAVA 4PE5B 3M3KA 3HO7A 3G3GA 5I59B 1ZIUA 1JQFA 2ZMBA 3JYRA 2VHAA 1MY0A 5L9OA 1N3XA 1MXYA 3F11A 4DZ1A 3VLVA 4L17A 2XXHA 3ZKKA 4LA9A 4QSEA 1B7HA 3IX1A 2HXWA 3L6GA 4DE8A 3K6WA 1ZKBA 4ESXA 3T93B 1XHYA 3IR1A 4G68B 3OEMA 5JK4A 1GV8A 5AE4A 3FIRA 3VLUA 1EH3A 3G7WA 3U1OA 2F34A 1FQCA 1VFEA 4LATA 3SEYA 3TQLA 3C4MA 3EN3A 5CBSA 3EHSA 1MQIA 3KJTA 4C1TA 3B7DA 3B6TA 2Y7IA 4JXIA 4LQ2A 5K2XA 3IB0A 5DVFA 4M4GA 3FASA 4U4SA 1Z7NE 4NF4B 4Q30B 3S2VA 5I2KB 1PB8A 3C35A 3OMBA 1SDXA 4PFYA 3K1PA 2F6PA 2NXOA 3QK6A 4X1BA 2UXAA 3G3HA 2XD2A 1NNTA 3PD8A 3TAJA 1MQGA 1USYH 4MLVA 4JWOA 2Y7KA 1XVXA 3THIA 1IUDA 3KBRA 2AL4A 1IXIA 4R2BA 5CMKA 1OVTA 3H03A 1JW5A 3PUZE 4EXLA 1N84A 1M5EA 1MH3A 1M5CA 3DELB 4I9DA 5HPQA 4ZZEA 1Y4TA 2HZLA 3K01A 3TTLA 3E9XA 3H6VA 1B51A 1R9LA 1ZBMA 2D5WA 4H67A 4JSOA 3IB1A 3IL1B 2E0SA 3DLNA 4GL0A 1XS5A 5CMCA 4G68C 2P1SA 4HW8A 1IXGA 4GIZA 3T96B 1PB9A 3VLWA 1LCTA 2F97A 4NMYA 3HHGA 4FECA 2RCAA 2XXIA 2O7UA 2Q88A 1LB8A 2DP8A 3PPRA 2IEEA 4OENA 3M3LA 1N76A 3PUXE 4R2FA 3A3UA 5F7VA 4OFOA 1B3LA 3FVOA 1MDQA 5F1QA 2ZYOA 2XHDA 4JWXA 5TU0A 1MXUA 1EZPA 4LZ7A 1LFGA 2I49A 4F3SA 3GBBA 4U1OA 4MBPA 2ZYNA 3EHUA 3FVKA 2Z22A 3FGSA 2ANJA 3ILTB 4LVQA 1YTVA 4XXUA 1MS7A 5FHNA 3OELA 1OVBA 1I6QA 1H45A 4IGRA 3PPPA 2YLNA 3UIFA 5I57A 5TP9A 4ZEBA 1XOCA 3VXBA 3FATA 2REGA 3FXRA 1NKXA 2AL5A 1USYE 4PQJA 2ZNSA 4O3AA 4XKPA 1LAFE 3CSGA 2GHBA 5DEXB 4ZE8A 3TUSA 1EU8A 1WODA 3FUZA 1BIYA 3TKDA 4H8IA 3TTKA 4K3FA 3N6UA 4RY1A 1A55A 5I2NB 1S50A 2O69A 1ZLQA 4LZ8A 3RT8A 1QKAA 1Z7ME 1UQWA 3LSWA 4TOZA 3S9MC 1PC3A 4WEDA 4YKJA 4NWDA 1POTA 4DIGA 2FA7A 4RK9A 3PPNA 1NNPA 3OO7A 5CMBA 4IO2A 3TCGA 4OWDA 3SEVA 5ISUA 3RT6B 3I3VA 1O7TA 3CSBA 1B4HA 2F5XA 3CIJA 4ZEDA 2GHAA 4QFKA 4GVOA 1P99A 4ZZAA 3H06B 5DT6A 3IO6A 1A8EA 4YMBA 1FQAA 5H8SA 4RNSA 3LR1A 1B46A 1FTMA 5L9MA 4F2OA 3TTRA 1JNFA 3S9NC 4N6PA 3IORA 4KYDA 5H8HA 2DXYA 4R74A 3E3KA 4DCXA 3PMXA 1H76A 3IJXB 3MBPA 1US5A 5FTIA 3FV2A 3LBSA 5AA2D 4PP0A 1QW0A 2PVUA 2QS3A 3U93A 3V89B 2UVGA 5I58A 3MW0A 5H8FA 3ILUB 5IAIA 3OXNA 4H65A 1B58A 4FATA 2PBWA 3CFXA 1EZ9A 3MP1A 2B65A 4R73A 3LSXA 2Y7PA 4N07A 5AA1A 1SI1A 2RC7A 1SVXB 1ANFA 3D4CA 3G3JA 3H4ZA 1B5JA 2UVHA 3KZGA 1P1QA 2OCUA 4GL8A 2CZLA 5DVIA 4NE4A 1UTBB 3QIMA 2X26A 3WAEA 4H5GA 3MQ9A 4NF6A 2V84A 2R6GE 4GFRA 2ABHA 1II5A 4G8NA 2F35A 3VFJA 1POY1 3JZJA 5KDTB 4RPOA 1D9VA 3UA8A 3S9LC 5I84A 2Z8EA 4GOTA 1LAXA 1B32A 3U94A 2BJJX 1FTJA 3KJ7A 5JTYB 2D21A 4AQ4A 1LGBC 1URDA 5AA4A 3DP4A 2I0BA 3UK4A 2ONSA 2I6EA 1LBBA 5CM6A 3FVGA 5BUUA 4U23A 4TLLB 1BTJA 1B5HA 3RNNA 4H6DA 1WVJA 4IO4A 2NUVA 2QS1A 2VGQA 5I59A 4MH5A 4F31B 2Z8DA 1O64A 3Q28A 5TPAB 3PGFA 2OWSA 1SBPA 4KPTA 1GGGA 4FORA 4ISUA 4ZEIA 2ZYKA 3RUMA 1I6BA 1VR5A 2DQVA 1Y3PA 3N94A 4EXKA 3MJNA 4FJPA 1MY3A 2QRYA 3MUQA 1MY2A 3IO4A 4NTLA 3Q26A 4G68A 4ELOA 3C32A 1UTHB 5ICQA 5L8DA 3SDFA 1URGA 1SW4A 3IOVA 3B6WA 1UIVA 1P1OA 5I56B 1JETA 3KEIA 3O6IA 4O3CA 4R6HA 4Q5TA 3E4RA 4QSDA 1UIUA 4R6YA 4X48A 1J1NA 3R7XA 1FW0A 3FZVA 5EYFA 2DSFA 3I5OA 1MQHA 3VXCA 4NF4A 4YZZA 3FJ7A 1GR2A 5I2KA 1A40A 4F18A 3ZKLA 3UGWA 3K6XA 3VVDA 1P1WA 4GXAA 1NFTA 3TZAA 3O66A 2V3QA 2RKMA 1MPBA 2DWIA 3HPIA 1H3DA 2DE4A 3PUWE 4U2RA 4F3GA 4GF8A 4QFOA 3O6HA 2F36A 1M5DA 3T22A 2VOZA 2O6AA 2PT1A 4OTEA 2XX8A 5H8NB 3H7MA 3KOTA 3SKPA 1MPDA 1PEBA 5L9SA 2R9JA 2NOOA 3OO9A 3RGYA 3PUYE 3P7IA 1MH4A 3TODA 2I48A 4GWOA 4BDQA 2O7IA 3LSLA 1D4NA 2ONKE 3KN3A 1I6AA 4NF8B 3N5LA 3TCHA 2VP1A 4KFQA 4HCWA 1NH7A 4H1XA 3VV5A 2WKYA 3N6TA 3A09A 4NF5B 3TYHA 2ZYMA 1DPPA 4U1ZA 1B40A 3SEUA 4KCDA 3C34A 2HFBA 3SEWA 4R9GA 3MVZA 2NWJA 4G2ZA 1B6HA 3T9HB 3FJMA 4OXVA 1N0TA 1JVYA 2OZZA 5EHMA 3ECRA 3TFLA 2XXWA 1A99A 2ZXTA 3S9EA 2V93A 2Z23A 3MVYA 2XXQA 1B7UA 1MPCA 2PT2A 3AXFA 3MZ9A 3MAMA 4GRKA 2ZNUA 5DTBA 2IA4A 2ZNTA 1MY1A 1XC1A 2XXRA 2P0SA 1IIWA 1D9YA 3OO6A 4EQ7A 2RC8A 3T9VA 1YPNA 4IGTA 1XVYA 1T0KA 1VSOA 2DE2A 3FV1A 2GFEA 2A5TB 3TCFA 4IO7A 4NEDA 3C33A 3C31A 3LC8A 2ALUA 1S9TA 1LFIA 4OEUA 1FTLA 5DEXA 3N26A 4QFPA 1QUIA 1Y3NA 1ELJA 4LONB 3CI8A 5JEIA 1IQ7A 1S7YA 3RN8A 5H8QB 4F3BA 3OD7A 5I2NA 2I3WA 2DXRA 4LP2B 4TLMB 4HCYA 3ZSFA 3KSXA 3O28A 1QVSA 5FTHA 3K2DA 1KWHA 1VFDA 4POXA 5DVJA 4RK2A 1M5BA 4HS7A 4TQUQ 3QUFA 4KD5A 1GVCA 5KZTA 2QMXA 1SW2A 1LAGE 4P0GA 1ZTYA 3O97A 3K4UA 2DVCA 2QSXA 2XX7A 2O51A 3CG3A 4YMAA 3U92A 4M1VA 3H6UA 4GLIA 2QJEA 4DXUA 1FCKA 4XKRA 1MY4A 2GRVA 4QHQA 2UYFA 1SW5A 4OQOA 2I3VA 1GTKA 3BFUA 3OEKA 4PFWA 3GBAA 4OESA 4RYAA 1B0HA 1TXFA 4RA1A 2OBGA 1NL5A 3WAFA 3EHTA 2XX9A 2CMOA 4GD5A 1MXWA 4P11A 2F7AA 4PFTA 3L6HA 1MRPA 1H44A 1MXXA 1CE2A 3IOUA 1OLCA 4QF9A 4C1UA 1AH5A 1ZJLA 1A7LA 1FQBA 2UYEA 4EDPA 1LLSA 1O63A 2X7QA 2UVJA 4EF2A 1MM7A 2OLBA 3HSTA 3U72A 2H5YA 3BBRA 5M2VA 4ELPA 1OQHA 3ODBA 3RLFE 1NH8A 1I69A 3KSJA 4U22A 4RXLA 1EZOA 2Q9TA 1N04A 3S4UA 2H25A 3HHFA 3LSFB 4JWYA 4XKNA 3RTWB 1DSNA 2Q2AA 1SI0A 3DP6A 5ITOA 2XXTA 1R6ZA 3CRBA 4G77A 1UTBA 1Y3QA 4I1DA 3VVFA 4FE8A 4ZEKA 1MDP1 2XXVA 4F29A 3HCQA 3C36A 3KN7A 3UORA 2R71A 1RYXA 5A5XB 1JEVA 2Y7WA 2REJA 1B52A 3IJOB 1FTKA 4DXCA 5KCJB 1IXHA 4EQ9A 1DTZA 1QULA 2F8DA 3B6QA 2O84X 2F7CA 5KDTA 4JB7A 1B4ZA 1FQEA 5ELVA 4I8CA 4ZEFA 5AA2B 3VE1B 4LUBA 4RPNA 3FD3A 4GQOA 1NNFA 5JTYA 5CBRA 4BDRA 1JVXA 3T9XB 3MP8A 2AIXA 3TDJA 3GLBA 3CVGA 4IO5A 3K6VA 4ZE9A 4U21A 1JW4A 1MXZA 3I6VA 4OFJA 3GXAA 3UP9A 1IXCA 1PDAA 3O9PA 2THIA 4POWA 3PMWA 1B1HA 4OZ9A 3MC2A 3MP6A 4WXJA 3O6GA 3G3KA 1NNKA 3IOWA 2RCBA 4LQ5A 1B5IA 4LZ5A 1B05A 4KHZE 4OHNA 1Q35A 5TPAA 3SESA 2Y7RA 3V5AA 3QSLA 4BLAA 1B2HA 1QUJA 4JDFA 4XTCQ 4YICA 2DS9A 2O1MA 1A54A 2X7PA 4P0IA 1ATGA 1B3FA 1US4A 3LUYA 2FYIA 4AB6A 3RY3A 3EQ1A 3QUJA 2VD3A 4EQBA 4DCYA 1RKMA 1Y1MA 3K6UA 3H6WA 3O29A 1Y1ZA 4ND9A 1UTHA 4FEBA 3K00A 2PX1A 5HBCA 1BKAA 5CC2A 3FJGA 1JW1A 3T9UA 4PETA 2XXUA 4O3BA 1PBPA 4F1YA 5I56A 4ONYA 4UACA 4F3PA 3SEXA 4H8JA 1LB9A 3E13X 2FNCA 4Q0CA 3W9VA 3DP8A 1LAHE 4ZECA 4KCCA 1DTGA 4R72A 1URSA 3O2AA 3K0VA 2DWAA 3ZS6A 1DPEA 3OOAA 2OJTA 1M5FA 3HN0A 1LFHA 4KI0E 4WEPA 1MG1A 3M3FA 4YB7A 1B3EA 1B3GA 4RJZA 1QKBA 1XT8A 3C9HA 1Y20A 5B70A 2HQ0A 4R6KA 4X1DA 2DOJA 4QFNA 1JEUA 3VVEA 2F78A 4NWCA 5H8NA 1L5TA 1FQDA 3PPOA 3PPQA 3FXUA 2UVIA 2DE3A 1MQDA 1AL3A 2VD2A 4FEDA 3BFTA 2QL3A 1TFDA 4QFLA 4YKIA 3PMVA 3SETA 4NF8A 3IOTA 4IB2A 1SYIA 4NF5A 3R6UA 4DDDA 2Q89A 4OYVA 1IZ1A 1QUKA 2KLFA 2B3FA 3TTMA 2QPQA 1OIBA 1P1UA 3H3GA 4IO3A 1WDNA 4ELRA 2RC9A 2XD3A 4OERA 4F22A 4DXBA 2V3TA 1F9BA 4F39A 4MLQA 3QYTA 3EPEA 3OSQA 3SERA 3W15C 1HSLA 3FVNA 4BDNA 3W9WA 2RF1A 3MZBA 3CG1A 1N3WA 1B9JA 3DM0A 4UA8A 4QSCA 2PMSA 4ELQA 1LBCA 4WKMA 4YAHX 4EF1A 4XKQA 1SYHA 3OENA 4OETA 1BLFA 2A5TA 5FHMA 2H9BA 4GXSB 5FHOA 2ONRA 3K1MA 4F1VA 2XXXA 3QXMA 2O68A 3MPKA 2A5SA 4C0RA 4IO6A 4Z7EA 2XXPA 2P2AA 4THIA 5H8QA 4BDMA 2DVZA 2E1SA 3MVWA 2V3UA 3USDA 3G3IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TMGA 1CB6A 4YB5A 1FPKA 4N8YA 3K02A 1R1NA 1FBEA 2DWHA 4F2QA 2I4BA 5I57B 5TP9B 2I4CA 3QAXA 5J1DA 2G29A 2I0CA 1N7WA 4AS4A 1IEJA 3RTFB 3KN8A 4BDLA 3VDFA 1FTOA 1YCJA 1IITA 2Y5KA 3K1NA 2AYSA 3CFZA 1QJMA 1P1NA 1H43A 2GH9A 3OO8A 3PD9A 3PU5A 4F1UA 2D3IA 1AMFA 1OMPA 2F3DA 3JV9A 4OEVA 1SW1A 2ESNA 3RPWA 4IY5A 4YU0A 4MF3A 2PYYA 1TT1A 2HZKA 2Y84A 4GWSA 1NUXA 3KOSA 4JSDA 4F19A 4GWYA 3KG2A 2O1LA 2H98A 1B7ZA 3OSRA 2Q8JA 4G4PA 5B7DA 3Q27A 5K2YA 2DYXA 1B3HA 4FIMA 5BWJA 1YAEA 4H0WA 2F7BA 4OFLA 1Q1KA 3H6TA 3TEPA 5AA3A 4PFIA 4BDOA 3PUVE 2XWVA 1LSTA 3IFCA 4G8MA 1VE4A 2V25A 5LTCA 3KGCA 3KC0A 1LCFA 3RQTA 1BP5A 4PFUA 3RPLB 4R75A 4QRZA 4EUOA 1TFAA 1ZU0A 2WYPA 1NV5A 3TELA 1A8FA 3IAZA 4OVJA 1ZMGA 4PCDA 1HSEA 3D4GA 4FAJA 3TTNA 2PFYA 1QGXA 4Z0IA 2W7YA 5ITPA 4XIGQ 5H8HB 3ONMA 2B3BA 2DDKA 2HEUA 1Y9UA 4H5FA 1PB7A 2QMWA 3BKIB 3UN6A 1FBGA 1N7XA 1SD3A 3Q29A 4U4XA 1OQGA 1LBZA 2HCAA 1HSJA 3MPLA 4I62A 3TQWA 1Y4CA 1FPFA 3U8QA 4E0XA 1R9QA 4E0WA 2XXYA 1MM6A 3T66A 4DLDA 4YB6A 5A5XA 5EQ8A 2QS4A 3CFLA 3MYUA 4R9FA 3TPAA 4ECFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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