2GHAA

Thermotoga maritima maltotriose binding protein bound with maltotriose
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
MQPKLTIWCSEKQVDILQKLGEEFKAKYGVEVEVQYVNFQDIKSKFLTAAPEGQGADIIVGAHDWVGELAVNGLIEPIPNFSDLKNFYETALNAFSYGGKLYGIPYAMEAIALIYNKDYVPEPPKTMDELIEIAKQIDEEFGGEVRGFITSAAEFYYIAPFIFGYGGYVFKQTEKGLDVNDIGLANEGAIKGVKLLKRLVDEGILDPSDNYQIMDSMFREGQAAMIINGPWAIKAYKDAGIDYGVAPIPDLEPGVPARPFVGVQGFMVNAKSPNKLLAIEFLTSFIAKKETMYRIYLGDPRLPSRKDVLELVKDNPDVVGFTLSAANGIPMPNVPQMAAVWAAMNDALNLVVNGKATVEEALKNAVERIKAQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title T. maritima maltotriose binding protein
rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Thermotoga maritima
molecule keywords maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein
total genus 124
structure length 374
sequence length 374
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghaA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghaA01
3B6QA 1EZPA 3MW0A 4OQOA 1Z7ME 2RCAA 2XXTA 1M5BA 3UORA 4DXBA 1R9QA 5BUUA 3C32A 3T9VA 3UN6A 4HCYA 4FIMA 3A09A 1YCJA 4HTGA 2Q2AA 2OWSA 4ZECA 3KN7A 4F3BA 1SW1A 1URGA 4XIGQ 4KCDA 4DZ1A 4Z0IA 2VD2A 1A8EA 3V5AA 1QUIA 3IORA 3G3IA 2ESNA 2CMOA 3MZBA 2OWTA 2HEUA 1D9YA 3OXNA 1DTZA 3LC8A 4EXKA 2M8CA 4ZDMA 1KWHA 1M5FA 1H45A 2DVCA 3PUZE 3T96B 3TTMA 3TFLA 3D4GA 1OLCA 4NEDA 1A40A 1UQWA 4JWOA 3IK6B 1J1NA 1Y9UA 2ONKE 2YJPA 3RLFE 1ZLQA 2I58A 1B6HA 1XT8A 4M4GA 1VR5A 4NF5A 1B32A 4ZS9A 5FHMA 4NF4A 2XX8A 3OSRA 2XXQA 4QFNA 1QKBA 2GFEA 4OWDA 4RYAA 1SW5A 3Q26A 4LA9A 2PX1A 5HBCA 2F6PA 2XD3A 1OQGA 1UTBA 3B6WA 2QS3A 2I49A 3LBSA 4F29A 4ND9A 4H5GA 1JNFA 1QVSA 1B58A 4IO6A 1B2HA 3USDA 4EF1A 2G29A 3I6VA 3THIA 3IOUA 4KCCA 4BDRA 3HPIA 1LCFA 3MJNA 1IITA 4P0IA 4QFKA 3H03A 5JEIA 2PMSA 2F5XA 3Q27A 2DWJA 2QS4A 2Z22A 4I9DA 4YB6A 5H8QA 1EZ9A 3PU5A 4KYDA 5TPAB 3IAZA 1H43A 1ZJLA 4I62A 4KYEA 3E13X 3H4ZA 3T9UA 3S4UA 3K6VA 2FA7A 3PV0E 1TWYA 2RKMA 2OJTA 1MPDA 1LFHA 2F36A 4OFOA 5DT6A 5CBRA 1OVBA 2PT1A 4EXLA 4EUOA 4QRZA 3G3FA 3TPAA 4IO5A 4AB5A 1FQCA 4O3CA 3DP4A 4U1ZA 2ZXTA 3T22A 3TEPA 1ZKBA 5EHMA 3ODBA 3MZ1A 1LAGE 2F6GA 4YMBA 1LLSA 4E0WA 3ILUB 4U1OA 3KFMA 3FD3A 4Q8RA 4U23A 1NFTA 1ZU0A 4U2RA 3L6HA 1I6BA 2I3WA 1NNFA 1URSA 3K00A 2E1SA 5I56B 1LBCA 1ZMGA 3G7WA 3KN3A 2R71A 4G77A 3FVNA 4YKKA 3G3JA 2A5TA 5TP9B 2DVZA 1IEJA 2RINA 4YB5A 5DYHA 4NF6A 2XX7A 4NF5B 1AMFA 3KEIA 3TCGA 3FVOA 4NWDA 3QK6A 3TDJA 1PB7A 2F7BA 2V3QA 2OK2A 2QJEA 3U94A 3TCFA 3HSTA 4Q5TA 4JWXA 5BWJA 1LAHE 4N13A 4IO3A 3VLWA 1ANFA 2XXHA 5CM6A 4F2QA 2YPNA 1QUJA 2XD2A 5A5XA 4WEPA 4QFLA 4NMYA 3QIMA 3PPQA 3IB1A 5I84A 3VVDA 1URDA 3RUMA 2QRYA 3IL1B 2ZNTA 3M3LA 4IGTA 1OIBA 5EHSA 3QXMA 2ZMBA 1M5EA 4KI0E 1QKAA 4RPNA 3IOTA 3HN0A 3CFLA 3KG2A 1MQJA 2VGQA 4R74A 4EQ9A 1H44A 2Y7RA 4OESA 3MC2A 1WVJA 4R6YA 3PMWA 1USYH 1EH3A 1N3XA 4YKPA 3WAFA 2F34A 1AH5A 1I69A 4ECFA 2H98A 3IO4A 3MPLA 3VXCA 5I2NA 3EPEA 5AA4B 1B3LA 4DCXA 2I0BA 4N6PA 5I57A 1VFEA 3PMXA 3TAJA 1MH3A 2HXWA 3CFZA 3PUVE 4FEBA 1RYOA 2XHDA 3CR9A 3VVFA 2AL5A 2VP1A 3SEUA 5KDTA 3PMVA 1LGBC 2HAVA 1N0TA 5AA2D 4RY1A 1T0KA 1B7ZA 2XXPA 4QSEA 2Y7KA 4YKIA 3CSGA 2RC8A 3TELA 1PB8A 2QPQA 2X7QA 5JTYB 2FNCA 3HCQA 4DE8A 1Y1ZA 2A5TB 2THIA 1FCKA 3LSXA 3AXFA 4NE4A 5B7DA 3IJOB 4OEVA 5I59A 3F11A 4RK2A 3T9HB 1SBPA 3O9PA 4MH5A 1S7YA 3O6HA 4H5FA 1XOCA 2QSXA 3RQTA 4N07A 1LB9A 2XXIA 3C36A 3OO6A 1MS7A 4YB7A 1DMBA 1B7UA 2I6EA 4MLQA 4K3FA 2LAOA 3S9MC 2NWJA 4JWYA 1YPNA 3ZKKA 3FV2A 4FECA 4X48A 1MXYA 1PB9A 3OEKA 1I6AA 4JBZA 2NOOA 4ESWA 4GXAA 1CB6A 4XKQA 5CMKA 1IZ1A 4RNSA 3S9NC 3ONMA 3PPRA 1MRPA 5KZTA 2RC9A 2XXXA 1SI1A 1MM6A 2PBWA 4FJPA 3EF7A 4YKJA 1P99A 5CMCA 2Y7IA 2F35A 3PPPA 2FYIA 1JW1A 2DXRA 2HZLA 2DWHA 1FQBA 2F7AA 2DE3A 1WODA 1AOVA 5I57B 4KFQA 4YU0A 2B65A 5TPAA 1NNPA 5AA2B 1OVTA 1B40A 5KDTB 1B5IA 2B3BA 5CC2A 2H99A 3SDFA 3VVEA 2Z23A 5K2YA 3LSWA 3FXUA 3DP6A 3FV1A 1JETA 1B4HA 5IKBA 2D21A 2KLFA 3P7IA 4G8NA 1WDNA 4L17A 3C31A 2PT2A 1B3GA 2I0CA 3FXQA 3M3KA 1JVYA 1UTHB 3MVWA 1BIYA 3QUFA 5I59B 2IA4A 1RKMA 2OZZA 1UIUA 1N76A 1FTLA 3FJMA 1MXXA 3MVZA 2NXOA 1GVCA 5I56A 3D4CA 3K6UA 2QMWA 1XHYA 1Y4TA 1A55A 3S9LC 3W15C 4PQJA 3N94A 5DEXB 3H3GA 4R73A 5TP9A 3HO7A 3DELB 4OMBA 3SKPA 1MXZA 2H25A 1POTA 2Z8EA 1LFIA 1XVYA 3PUXE 4GL8A 3FIRA 2DS9A 3RY3A 5ICQA 3SEYA 2XXRA 3KGCA 3TZAA 1VSOA 5H8SA 3RNNA 2ANJA 4IY6A 3GZGA 4KHZE 3MAMA 2UVIA 3H6WA 5DVIA 3KOSA 2XXYA 3OEMA 1FTKA 3H6TA 1MXUA 2DOJA 4LQ5A 1QJMA 3TKDA 4R75A 5L9SA 3JV9A 1JW5A 2NVUB 1IUDA 1ZBMA 1O7TA 4P0GA 3MBPA 2F78A 2Y7PA 4QFPA 1SDXA 4TLMB 5FTIA 1JEVA 4U22A 2O6AA 4QF9A 1II5A 3RT8A 4ZEDA 2E0SA 2AL4A 4F3SA 1SVXB 4JXIA 2DE4A 1BLFA 4F22A 2B3FA 3CRBA 4RJZA 4EF2A 4F1YA 5HPQA 3C33A 5KCJB 5M2VA 2AIXA 4U4XA 3CI8A 3CFXA 4LP2B 2YLNA 4JB7A 3K02A 2BJJX 3Q25A 3O97A 5AA4A 1SQYA 1M5CA 5K2XA 1Y20A 2OBGA 4E0XA 3O6GA 2ZYNA 1SI0A 1AL3A 4BDMA 4PFTA 1Y3NA 3PD9A 5EYFA 3MVYA 4JDFA 1NH8A 2I48A 1NKXA 4RA1A 3BFTA 1VE4A 2O1MA 3MZ9A 3OMBA 3MVXA 3BFUA 1N3WA 4XKNA 3B7DA 1IIWA 1SW4A 3S2VA 4G8MA 3FVGA 3SEVA 1FQDA 4BDLA 1LAFE 2O7IA 4I1DA 1RYXA 3IJXB 3O6IA 5JTYA 1MY2A 1HSLA 4OHNA 4EQBA 1A7LA 3TODA 2UYFA 4UA8A 3G3HA 2XXUA 4DXUA 3TTLA 5DVFA 4OEUA 1O64A 4ZZEA 4DLDA 3PUWE 2P2AA 3CSBA 1MQDA 3HV1A 3VDFA 4G68C 2UVJA 2IEEA 4KR5A 4O3AA 4IO4A 4AQ4A 4C1UA 4OENA 3TYHA 2G93A 4LATA 4ZE9A 4WKMA 4F31B 1MDP1 4H1XA 2GH9A 3KSXA 2Y84A 1TXFA 1CE2A 1P1OA 1DSNA 4BLAA 1LFGA 1P1WA 1IXGA 4PE5B 4TLLB 3FUZA 2I4CA 5CMBA 1IXCA 5ISUA 3UP9A 1SD3A 3DLNA 3T93B 4H8IA 1US5A 3TCHA 2XX9A 1NNKA 3U8QA 1ZTYA 1FTJA 3MP8A 4YAHX 2Q8JA 4QSDA 1D9VA 1PC3A 4F18A 1SYHA 1FW0A 4OERA 2ALUA 3C35A 1BKAA 4LVQA 3GLBA 5AA2A 2R9JA 1FTOA 3R7XA 1D3KA 3OENA 4POWA 4RK9A 4GVOA 4I8CA 5CBSA 1YTVA 1I6QA 4PP0A 3IOVA 1PDAA 1Z7NE 4H0WA 4GQOA 3PD8A 1DOTA 2HAUA 3PGFA 3UIFA 1R6ZA 1B05A 4Z7EA 3VFJA 3DP8A 3WAEA 3MPKA 4X1DA 2DQVA 1GGGA 1UTHA 4PFYA 4ESXA 1NL5A 1H76A 3K6WA 3N5LA 1SYIA 4BDOA 4RXLA 3CG3A 3VLVA 2OCUA 1P1QA 4ONYA 1LCTA 3V89B 2X7PA 2HFBA 1B5HA 2I4BA 5DEXA 4ISUA 2O7UA 5H8HB 3RGYA 4THIA 3UK4A 3OOAA 3LUYA 3K1PA 3JZJA 1LSTA 1OLAA 5L9MA 2Q2CA 5B70A 4PETA 4MBPA 1H3DA 4C1TA 1JW4A 1MPCA 4F2OA 4H65A 1ELJA 4ELOA 4R6KA 4FATA 2DWIA 3M3FA 4KYSA 5L9OA 2QS1A 5CI5A 3VV5A 2VHAA 3K2DA 3H7MA 3RTFB 3A3CA 3VLUA 2ABHA 3IB2A 4ZE8A 3QUJA 1FQEA 3OO9A 1MQGA 3HHGA 4LUBA 2RF1A 2H9BA 3K4UA 2VOZA 5AA1A 4POXA 2DSFA 1MY3A 3EHUA 3LR1A 4ZEIA 1MY4A 4LZ8A 4ZEKA 5DTBA 2P1SA 1BP5A 2GHBA 5LOMA 4M1VA 4JSOA 3LSLA 4X9TA 5KCJA 2ZYKA 4P11A 4MF3A 3OO7A 3SESA 1UIVA 2V25A 2HZKA 4IO2A 2ONSA 1Y3QA 3Q29A 3H6VA 3OELA 4OZ9A 3KZGA 4ZEFA 1TFDA 2Q9TA 4YMAA 1MH4A 3TMGA 1EU8A 1L5TA 3EN3A 1MY0A 4GIZA 1NH7A 4IY5A 2O51A 3KN8A 2F7CA 3UGWA 2PYYA 1P1UA 2DWAA 2NUVA 2ZYMA 4GXSB 5AA3A 1R1NA 2ZNUA 1B3HA 4HW8A 3EHSA 4OETA 3K1NA 1A54A 3H6UA 2ONRA 2DE2A 3EQ1A 4ZZAA 4G2ZA 1PBQA 1OQHA 3N26A 4FEDA 5I2KB 3A3UA 3G3KA 1MDQA 5F7VA 3M8UA 2ZNSA 1HSEA 1BTJA 4HS7A 3CVGA 4OYVA 5ELVA 1JQFA 3H06B 4LQ2A 5CMMA 4OVJA 5CRYA 2I3VA 3B6TA 4R72A 5ITPA 1TFAA 3T9XB 4HCWA 3SETA 1IXIA 3BKIB 1A99A 4NF8B 4Q0CA 1B1XA 4JSDA 1IXHA 2RC7A 5I58A 4OTEA 4OFLA 1N04A 4C0RA 3HHFA 1NMUA 4F39A 4IO7A 3N6UA 4F1VA 4DIGA 4F3GA 3OO8A 3QAXA 4DCYA 3MQ9A 5H8FB 2P0SA 4ELRA 1M5DA 2VD3A 3MP1A 5J1DA 1TT1A 3IO6A 4GD5A 4Q30B 2O69A 3E9XA 2DP8A 1ATGA 1JVXA 4R6HA 3K01A 4R2FA 4YZZA 1FQAA 2RCBA 1B51A 1VFDA 1US4A 4U4SA 2W7YA 4LZ7A 3U1OA 2D3IA 1PEBA 5HM4B 4IGRA 3TTNA 3KSJA 1MY1A 3RTWB 3TQLA 5DVJA 2V84A 3FGSA 4EQ7A 3ZKLA 5L8DA 2Z8FA 3R26A 4G4PA 1B0LA 4KQPA 1N84A 2R6GE 4G68A 1Y3PA 3E4RA 4KD5A 4ELQA 3Q28A 3FZVA 3U93A 1Q1KA 4DXCA 4UACA 1JEUA 4GF8A 4H6DA 1GV8A 2A5SA 2XXVA 4EDPA 3SERA 2UXAA 1B4ZA 4GRKA 1IQ7A 1LB8A 3PPOA 3C4MA 2CZLA 5FTHA 4H8JA 3SEWA 4WXJA 3LSFB 3PUYE 3O29A 4QHQA 1N7XA 3TQWA 3VXBA 2QS2A 4GOTA 3K1MA 2V3UA 5TU0A 4MLVA 1PBPA 4FAJA 1O63A 1QUKA 4PFUA 2H4IA 3EHTA 2D5WA 1Q35A 4XKPA 5AE4A 2UVGA 1D4NA 4NF4B 1SW2A 5H8NA 1B5JA 3RPWA 1LAXA 5I58B 4WEDA 2Z8DA 1DPEA 5H8HA 3FJ7A 2X26A 3ZS6A 3W9VA 3G3GA 1B46A 2REJA 1B3EA 4QSCA 4GFRA 3U92A 3GBBA 3TTKA 1UTBB 4AB6A 1XC1A 3K6XA 1GTKA 1Y4CA 3TTRA 2OLBA 4GWOA 4OXVA 3O28A 3IR1A 4LZ5A 2O84X 3GXAA 1S50A 2Q89A 2ZYOA 1B9JA 3C34A 4OFJA 1B52A 5H8QB 1MXVA 3BBRA 1XVXA 1GR2A 4F1UA 1F9BA 1DTGA 4IB2A 5JK4A 3QYTA 5FHNA 3TUSA 1B3FA 2AYSA 4X1BA 2UVHA 1HSJA 4YICA 4GLIA 1FQFA 2XXWA 3CIJA 4G68B 1B7HA 5FHOA 1B1HA 3GBAA 3FXRA 3N6TA 5F1QA 3T66A 3KJTA 3KOTA 2V3TA 2V93A 2GRVA 1S9TA 4MFIA 3W9WA 1A8FA 2HCAA 2H5YA 4LONB 1XS5A 2DYXA 1OMPA 3K0VA 1P1NA 2GHAA 4R2BA 2PVUA 4F19A 1NNTA 4NWCA 3VE1B 1LBBA 1EZOA 2UYEA 3OD7A 4GL0A 4TQUQ 4NF6B 5ICTA 2O1LA 3FJGA 2F8DA 1R9LA 4R9GA 3QSLA 3JYRA 3RN8A 1ZIUA 4FORA 1AIVA 5H8NB 2O68A 1MXWA 2Y7WA 3IOWA 3U72A 1Y1MA 5ITOA 3MP6A 5I2KA 3O66A 3RT6B 3L6GA 3SEXA 3I5OA 1DPPA 4U21A 4FE8A 3IB0A 4NTLA 1MQHA 3PPNA 4BDQA 3O2AA 4BDNA 1B0HA 3MUQA 4G8HA 5A5XB 3V83A 4O3BA 4NF8A 3FASA 3ECRA 3OSQA 1FTMA 3ILTB 4TOZA 3E3KA 2REGA 3FATA 3I3VA 3KJ7A 3R6UA 3MWBA 2Q88A 4XXUA 4R9FA 1MG1A 1YAEA 2HQ0A 4DDDA 4QFOA 5H8FA 2F97A 2DXYA 3CG1A 3DM0A 1MQIA 2QMXA 1USYE 4H67A 4KPTA 4F3PA 1MM7A 1N7WA 2QL3A 4XKRA 3IX1A 3C9HA 2WKYA 3KBRA 5IAIA 1POY1 3FVKA 5I2NB 3UA8A 3ZSFA 4ZEBA 3V8XB 1QW0A 4XTCQ 1MPBA 1QULA 4RPOA 4PFWA 3S9EA 4ELPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EYIA 3B6QA 1EZPA 3MW0A 2CZKA 1NUZA 4OQOA 1Z7ME 2RCAA 2XXTA 1M5BA 3UORA 4DXBA 1R9QA 5BUUA 4UABA 3C32A 3T9VA 5IZ3B 3UN6A 4HE1A 4HCYA 4FIMA 3A09A 1YCJA 4HTGA 2Q2AA 2OWSA 4ZECA 3KN7A 4F3BA 1SW1A 2ZZXA 1URGA 4XIGQ 1LBXA 4KCDA 4DZ1A 4Z0IA 3B8BA 2VD2A 1A8EA 3V5AA 1QUIA 3IORA 3G3IA 2ESNA 2VPNA 2CMOA 3MZBA 2OWTA 3PTYA 2HEUA 1FPIA 1D9YA 3OXNA 1DTZA 3LC8A 1KA1A 4EXKA 1RDYA 2M8CA 4ZDMA 1KWHA 1M5FA 1H45A 2DVCA 3PUZE 3T96B 3TTMA 3TFLA 3D4GA 1OLCA 4NEDA 1A40A 2FBPA 1UQWA 4JWOA 3IK6B 1J1NA 1Y9UA 2ONKE 2YJPA 4MNIA 3RLFE 1ZLQA 2I58A 1B6HA 1XT8A 3LUZA 4M4GA 1VR5A 4NF5A 1B32A 4ZS9A 5FHMA 4NF4A 2XX8A 3OSRA 2XXQA 4QFNA 1QKBA 5EQ7A 2GFEA 4OWDA 1FPLA 1SW5A 4RYAA 4O7MA 3Q26A 4LA9A 4N81A 2PX1A 5HBCA 2F6PA 2XD3A 2CEXA 3KC1A 1OQGA 1NV6A 1UTBA 3B6WA 2QS3A 2I49A 3ISPA 4HE0A 3LBSA 4F29A 4ND9A 4H5GA 1JNFA 1QVSA 1B58A 4NQ8A 4AS5A 4IO6A 1B2HA 3USDA 5IZ1A 4EF1A 2G29A 3I6VA 1YXIA 3THIA 3IOUA 4KCCA 4BDRA 3HPIA 1LCFA 3MJNA 1IITA 4P0IA 4QFKA 3H03A 5JEIA 2CZHA 2PMSA 2F5XA 3Q27A 2DWJA 2QS4A 2Z22A 4I9DA 4OVRA 4I3EA 4YB6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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