2GHAA

Thermotoga maritima maltotriose binding protein bound with maltotriose
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
MQPKLTIWCSEKQVDILQKLGEEFKAKYGVEVEVQYVNFQDIKSKFLTAAPEGQGADIIVGAHDWVGELAVNGLIEPIPNFSDLKNFYETALNAFSYGGKLYGIPYAMEAIALIYNKDYVPEPPKTMDELIEIAKQIDEEFGGEVRGFITSAAEFYYIAPFIFGYGGYVFKQTEKGLDVNDIGLANEGAIKGVKLLKRLVDEGILDPSDNYQIMDSMFREGQAAMIINGPWAIKAYKDAGIDYGVAPIPDLEPGVPARPFVGVQGFMVNAKSPNKLLAIEFLTSFIAKKETMYRIYLGDPRLPSRKDVLELVKDNPDVVGFTLSAANGIPMPNVPQMAAVWAAMNDALNLVVNGKATVEEALKNAVERIKAQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein
publication title T. maritima maltotriose binding protein
rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 124
structure length 374
sequence length 374
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghaA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghaA01
3C9HA 4NF4B 3KN8A 5ITOA 4R72A 3DELB 1Y9UA 1OQGA 1RKMA 3RLFE 4BDMA 2O68A 1VFEA 1FW0A 3GXAA 4KCCA 5AA2A 1IXGA 2DE2A 1XC1A 3PV0E 1NL5A 2O6AA 4I9DA 3FZVA 4XTCQ 2QMWA 1MQJA 5CMBA 2UYFA 1IXHA 3I5OA 1B3EA 4OHNA 3MVXA 3MWBA 3IOWA 4Z0IA 1BKAA 1J1NA 4TOZA 2DE3A 2XXHA 2P2AA 4RK2A 3IK6B 3VFJA 2I0CA 4NTLA 1I6BA 1O7TA 1NMUA 1IUDA 4DE8A 2G93A 3VVEA 4EDPA 4R74A 3RUMA 1ZIUA 3RTFB 3CSGA 4H1XA 4U22A 1SQYA 4KQPA 2O84X 4KYSA 3TTMA 5HBCA 5I56A 4WKMA 5FTIA 4F18A 1MQHA 1YPNA 2RC7A 2DP8A 1MY2A 4KCDA 4F1YA 2Y7WA 3TYHA 3S9MC 2Y7KA 3BFTA 4G68C 4N6PA 2DS9A 1B7UA 1I6QA 3S2VA 4GXAA 2RC9A 4GIZA 2M8CA 4ZE9A 3KSJA 1N3XA 3H03A 1MH4A 2Z23A 2D5WA 4F2QA 4FEDA 1B40A 3K6UA 3MJNA 1LFIA 4LATA 3TEPA 2VOZA 3G3KA 2ZYMA 5J1DA 2Y7PA 2LAOA 5TPAB 1EU8A 4G4PA 4F3SA 1LB8A 3FD3A 1LGBC 3CFLA 1FQCA 1TFDA 4H5GA 3MVZA 4H0WA 4E0WA 3CIJA 3DLNA 3SKPA 1ELJA 4QF9A 2GRVA 5AA4A 2ZYNA 4ZEKA 5CMCA 1MG1A 2O1LA 3IO6A 4LUBA 4GVOA 1LCFA 1QW0A 3MW0A 4BDRA 2IEEA 3VLWA 2OWSA 4HCYA 1FQAA 5JK4A 4NF6A 2F36A 2I3WA 4H65A 3QUFA 5EHSA 1SDXA 2OBGA 4X1BA 2Q88A 1YCJA 1QUKA 2QPQA 5A5XA 3OXNA 3EHTA 4U23A 3PUZE 3MP8A 4O3BA 1JW5A 4OFOA 3M8UA 1A99A 3MAMA 5ELVA 4N13A 3VVDA 4QSDA 4C0RA 2F6PA 4MFIA 4G8NA 1UTBB 1D3KA 5DEXA 3HHFA 1BP5A 2HCAA 2I0BA 4NWCA 4ZZAA 2H25A 2NUVA 1MPDA 3U1OA 1Z7NE 1VFDA 4LZ5A 2P0SA 3PD8A 5I59A 1A8FA 1M5CA 4UACA 2B3FA 3GZGA 1M5BA 2KLFA 2R9JA 4R9GA 1B4HA 2RF1A 4OENA 1N04A 4QFOA 2NVUB 2R71A 5CBRA 4QRZA 3N6TA 4RK9A 4BDQA 4ZEFA 4JBZA 3OELA 4IO5A 3EHSA 3IL1B 4XXUA 3A3CA 2ONRA 5DYHA 3TCFA 1DPPA 1II5A 5AA2D 4G8HA 2BJJX 2WKYA 4ELPA 5AA1A 2Q2CA 4OETA 2I48A 3THIA 4PP0A 3D4CA 3S9EA 3CFXA 1NH7A 1TFAA 4HS7A 3HHGA 4YICA 1P1UA 3FGSA 2ONKE 3OO9A 1FQBA 4R6YA 4IGTA 1SW5A 3TCGA 3RT8A 2H5YA 1SI1A 4M4GA 4XKQA 2QS1A 4PFUA 4NF5B 5AE4A 3KSXA 4ZZEA 2OLBA 1MXYA 1R9QA 1MM6A 4F3BA 3FVKA 3ZKLA 3C32A 2NXOA 1SW2A 2ANJA 3L6GA 1S7YA 3A3UA 1AIVA 3O9PA 3R26A 2Q9TA 3L6HA 5JTYA 4PFTA 1Q35A 1B0LA 3UA8A 3TKDA 2I58A 2DWIA 3MPLA 1B46A 2XHDA 2QMXA 1B3FA 2XX7A 1S9TA 1IXIA 2OZZA 1MXVA 1OIBA 4GFRA 3V8XB 3FUZA 1B1HA 1M5EA 1B51A 4RXLA 3K1NA 2QS2A 1B0HA 5DT6A 3KFMA 5EYFA 5LOMA 4POXA 3OOAA 1B5HA 3V89B 5I84A 4NEDA 1QKAA 2DOJA 4F1VA 4YKKA 4ZECA 3FATA 2NOOA 1LAFE 3MC2A 5BWJA 5ICTA 3CFZA 2CMOA 4DZ1A 3KJ7A 2XXQA 1LLSA 1ZJLA 5I2KA 1B05A 3B6WA 1UQWA 4XKNA 4JXIA 3H3GA 4OMBA 3B6QA 5H8QA 2F35A 1WODA 1ZBMA 4MBPA 5KCJA 4FJPA 1B5JA 2V84A 3MZ1A 5BUUA 3C4MA 4LONB 1POY1 1MPBA 2REGA 4ZE8A 2Q89A 4KFQA 5L8DA 1F9BA 4X48A 2OWTA 1URGA 1LAGE 2HAVA 4JWYA 1NNTA 4EXKA 4ZEDA 4EXLA 4LP2B 1IXCA 4R2BA 1R6ZA 3S9NC 4Q5TA 3KN7A 4C1UA 2OCUA 3F11A 3OENA 1FTMA 1A40A 4ELQA 3K02A 1NFTA 2V93A 5I57B 2O69A 4JSOA 3TAJA 1OLAA 1B7ZA 3TFLA 3IOTA 1DTGA 1IZ1A 4NMYA 2QSXA 3PMXA 3CR9A 4ND9A 1PBQA 3TQLA 5TPAA 1POTA 3E9XA 3N6UA 3HV1A 4DDDA 1LB9A 3CG3A 3PUXE 3O6IA 4G68A 2I49A 3C31A 3GLBA 4DXUA 4FEBA 3IJOB 2RINA 1EZOA 4MF3A 2ZMBA 3TQWA 3KN3A 4OEVA 5B70A 1FTKA 3LSFB 4R75A 5CMMA 1A8EA 5KDTB 1FTLA 3IOVA 4PQJA 3TPAA 2YPNA 3UIFA 4DXBA 3S9LC 1B3HA 3OO6A 3CG1A 4KR5A 4C1TA 5KZTA 1XVXA 3SEYA 2QS4A 2H99A 4WEDA 3LUYA 1AH5A 4KYDA 4EQ9A 1ZMGA 4K3FA 2PYYA 2DXRA 1O64A 3OEKA 2REJA 4R6HA 2RCBA 1M5FA 4FECA 1FQDA 1MRPA 3TTRA 1OVBA 3K0VA 1UTBA 4DIGA 3HO7A 3B7DA 3U72A 2XXIA 4YKJA 3MQ9A 3RPWA 3O6GA 1SW1A 1M5DA 1P1WA 2GFEA 3H6TA 3QUJA 3SESA 2ABHA 1FTJA 4OFLA 4H8JA 1MDP1 4MLQA 1IITA 3BBRA 2Y7IA 3IB0A 1RYOA 4H67A 1Y3PA 4ONYA 3H6VA 4YAHX 3E3KA 1JEVA 4GF8A 3SEUA 5I58B 3MVYA 4P0IA 1SD3A 4YZZA 3FVNA 3FXRA 1LAXA 2ZYOA 4QFNA 3N94A 5I2NB 1EZPA 1GR2A 3LBSA 4IO2A 4HW8A 2Z22A 3TELA 1XOCA 4YU0A 4QHQA 3M3LA 3KJTA 1MY3A 3MUQA 4RPOA 2DWHA 2V3QA 1QKBA 4DCYA 4HTGA 3ILUB 4F39A 3EPEA 1GGGA 2FNCA 2VD2A 3SEWA 2DE4A 5F7VA 3QK6A 2AYSA 2PMSA 3PMWA 2XX9A 2RKMA 4OESA 3C33A 3KG2A 3D4GA 4OXVA 3FVOA 1B52A 1N84A 4OWDA 1UIVA 1UTHB 2X7QA 4WXJA 1JETA 4PE5B 4O3CA 1WDNA 5H8HA 2P1SA 4ESWA 3M3FA 4I62A 3FVGA 4NF8B 5DVIA 3QYTA 2XX8A 3KZGA 3V83A 5L9SA 3PPPA 4RPNA 3RN8A 1MQGA 1LSTA 1B1XA 2GH9A 3OO7A 2B65A 3T9HB 3G3IA 1N7XA 2A5SA 4OTEA 2PT1A 1XHYA 2ZNSA 1H45A 3W9VA 4IGRA 1AMFA 3TMGA 3OD7A 1O63A 2A5TA 3WAEA 3TZAA 2XXRA 4LQ5A 4L17A 4AB5A 4X1DA 4ZDMA 3RTWB 3OSQA 3H6UA 1URDA 2THIA 2I4BA 2D3IA 3I6VA 4U4SA 3TDJA 1H76A 3K1MA 3UK4A 4ESXA 4M1VA 1BIYA 4NF6B 4PETA 2X26A 3VE1B 3EHUA 1PB8A 4KD5A 3B6TA 3K6XA 4MH5A 1A7LA 3Q25A 1HSEA 2H4IA 3Q29A 1B3LA 3KOTA 3H7MA 2YJPA 2RC8A 3PGFA 2CZLA 2ZXTA 3DP4A 3HSTA 4ISUA 3ZSFA 1WVJA 5L9MA 4F19A 2NWJA 1SBPA 4LA9A 5CC2A 5DEXB 1L5TA 3VV5A 4KPTA 3G3JA 3S4UA 3TUSA 1H44A 1MY4A 5HPQA 4NF4A 1ANFA 3OO8A 2F78A 2OJTA 2I6EA 3T96B 5I59B 2R6GE 3ECRA 4KI0E 2DYXA 1LFHA 3MZBA 3QIMA 2HXWA 3ILTB 5KDTA 2V25A 5CI5A 2XXUA 1N0TA 3TTNA 3I3VA 1AOVA 2D21A 3CVGA 3SEVA 1LBCA 4U1ZA 5IKBA 3OMBA 5H8FB 4YMBA 2RCAA 3UN6A 3PPQA 4TQUQ 1DPEA 1B58A 3MP6A 1PB7A 1MDQA 1NKXA 4E0XA 1P99A 1IEJA 5TP9B 4ZS9A 3HPIA 3LR1A 5CM6A 1ZU0A 3IAZA 4XKRA 1MY0A 1B4ZA 3KEIA 4ELOA 1P1OA 4GRKA 1ZLQA 3U93A 1D4NA 3W9WA 2ZNTA 4R9FA 1R1NA 3FIRA 3K6VA 2VP1A 4QFPA 3P7IA 3T66A 5FHNA 1TT1A 3KGCA 4U1OA 1JVYA 2GHAA 3LSWA 4Q0CA 4BDOA 5M2VA 1I6AA 1QUIA 1QUJA 3IO4A 1JW1A 1EH3A 4PFWA 4R6KA 1MY1A 4THIA 4ECFA 4IO7A 3IJXB 4G2ZA 3Q26A 1TWYA 1GV8A 3OSRA 3DM0A 3FXQA 2HQ0A 2XXPA 2XXTA 1USYH 1JQFA 4OVJA 3MBPA 2O1MA 1QJMA 4H5FA 4RJZA 5I58A 1LBBA 3EN3A 3RGYA 3UP9A 3T93B 1ATGA 2OK2A 3VLVA 3K2DA 3WAFA 3DP6A 4F3PA 3IB1A 2YLNA 2B3BA 5I2NA 4DXCA 4JDFA 3OEMA 1XVYA 1I69A 5HM4B 4AQ4A 4GL0A 4Z7EA 4YKIA 4GOTA 3HN0A 3ODBA 3IX1A 2F5XA 2ZNUA 5FHMA 1OMPA 2VHAA 4JSDA 3LSXA 2PX1A 1UIUA 1SYHA 5I2KB 3M3KA 4OYVA 3GBBA 2HZKA 1B6HA 3MZ9A 2F8DA 1SI0A 5H8QB 2XXWA 5KCJB 4RNSA 1H3DA 4QFKA 5FHOA 3CRBA 3IOUA 3MPKA 1QULA 1D9VA 1B2HA 4I8CA 1SVXB 3HCQA 4KYEA 1LAHE 1N7WA 4F2OA 3MP1A 3JZJA 2I4CA 2DVZA 5CBSA 1UTHA 1Y20A 3Q28A 4FAJA 2QS3A 3ZS6A 3O97A 4FORA 4NF8A 3EQ1A 3SDFA 4EF2A 2O7IA 3QXMA 4FIMA 5H8NB 4YMAA 4IY5A 4NE4A 3BFUA 4EF1A 1OVTA 4GL8A 4H6DA 3UGWA 2QJEA 3GBAA 3FV1A 2DXYA 4GQOA 4RA1A 1SW4A 4OERA 4TLMB 1QVSA 3TTLA 3H4ZA 3Q27A 1JW4A 4I1DA 5FTHA 4G8MA 3VDFA 4GWOA 2X7PA 3VVFA 1B3GA 1MXUA 4F31B 4G68B 2HFBA 4U2RA 2QL3A 1XT8A 2VD3A 2XXYA 5DTBA 3SERA 2DQVA 2Q8JA 3USDA 3VXBA 1MS7A 1N3WA 5DVFA 5AA2B 1JEUA 2V3UA 3N26A 4R73A 4ZEBA 4BDNA 3TTKA 3UORA 2Z8FA 4OFJA 3DP8A 4R2FA 3LSLA 3JYRA 4Q30B 1JNFA 1IIWA 4OQOA 4QSEA 1Y3QA 4AB6A 4NF5A 1Y4TA 3G7WA 3T9VA 1LFGA 3PUWE 4YB5A 2VGQA 2GHBA 2E1SA 4F29A 4YKPA 1PC3A 1DSNA 2XXVA 4RYAA 4F22A 2Q2AA 2PT2A 4GD5A 1LCTA 5F1QA 1Y3NA 2XD3A 5CRYA 3SETA 3W15C 2UYEA 5I56B 1OQHA 3K1PA 3FASA 3R7XA 3QSLA 3PPRA 3JV9A 1A54A 3U8QA 1ZKBA 4IO3A 4HCWA 2F7BA 2ONSA 1R9LA 2DVCA 1JVXA 4POWA 3C36A 4DCXA 4F1UA 1B32A 2H9BA 2HZLA 1KWHA 5ITPA 3ONMA 2Z8EA 1URSA 1H43A 3G3FA 3H6WA 4IO4A 1MM7A 4O3AA 5K2YA 3VLUA 4LVQA 5K2XA 3TODA 3E4RA 1IQ7A 1Y1MA 4LZ7A 1MQIA 4KHZE 1FTOA 5DVJA 4Q8RA 3FJMA 3H06B 5H8FA 4N07A 2DSFA 2AIXA 3PPOA 1B9JA 1B5IA 1PBPA 1HSJA 2FYIA 4FATA 3G3HA 3C34A 1GTKA 5AA4B 4OEUA 3ZKKA 2F6GA 5TP9A 1YTVA 1N76A 3FV2A 2Z8DA 2H98A 1US4A 3T9UA 5IAIA 4EQ7A 5AA3A 2QRYA 3PUVE 5ISUA 3A09A 1TXFA 3O29A 1SYIA 2AL4A 2F7CA 1NNKA 1A55A 4IY6A 1RYXA 1T0KA 5B7DA 3R6UA 4MLVA 1VE4A 3FJ7A 3E13X 2DWAA 4H8IA 4U21A 5CMKA 1AL3A 1HSLA 2E0SA 4QFLA 5A5XB 4ZEIA 1NNPA 2ALUA 1CE2A 2UVGA 3CSBA 3O6HA 1PDAA 4JB7A 2XXXA 5I57A 4DLDA 1VR5A 2W7YA 2IA4A 3PPNA 1DOTA 3AXFA 3IORA 2ZYKA 3QAXA 2F97A 4XIGQ 4OZ9A 3TCHA 4EQBA 1MXZA 3O2AA 4FE8A 2F7AA 4XKPA 4RY1A 1ZTYA 1FQEA 2UVHA 4UA8A 2Y7RA 5ICQA 1DTZA 5H8HB 4BDLA 4BLAA 2Y84A 1GVCA 4YB6A 3CI8A 1OLCA 4P11A 3PMVA 3KOSA 1FQFA 2DWJA 2HAUA 2O7UA 3O28A 3SEXA 3VXCA 4P0GA 3FXUA 3V5AA 5TU0A 4WEPA 2AL5A 3MVWA 1MH3A 2XD2A 4F3GA 3K00A 4PFYA 1VSOA 3KBRA 1D9YA 1MXWA 3N5LA 3IR1A 3T9XB 3C35A 1NNFA 1EZ9A 5JEIA 4YB7A 1MPCA 2FA7A 3K4UA 2UVJA 3RNNA 2ESNA 2PBWA 1YAEA 4TLLB 3PUYE 1XS5A 3RY3A 2A5TB 1DMBA 5H8SA 2PVUA 4U4XA 4IB2A 3EF7A 2I3VA 4LQ2A 4X9TA 1S50A 4G77A 3BKIB 1BTJA 1CB6A 4JWOA 3U94A 5L9OA 1Q1KA 1B7HA 3FJGA 3PU5A 1MQDA 3RQTA 1MXXA 3PD9A 1USYE 4LZ8A 1BLFA 3K6WA 2HEUA 4GLIA 4NWDA 3T22A 4ELRA 3G3GA 3K01A 1US5A 5H8NA 3LC8A 3O66A 3U92A 1Y1ZA 5JTYB 5EHMA 2O51A 3RT6B 1FCKA 4JWXA 1P1NA 1Y4CA 1P1QA 2V3TA 4IO6A 2UVIA 1PEBA 4EUOA 2G29A 1PB9A 1Z7ME 2UXAA 2F34A 1NH8A 4GXSB 4QSCA 3IB2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C9HA 4NF4B 3KN8A 5ITOA 4R72A 3DELB 1Y9UA 1OQGA 1RKMA 3RLFE 4BDMA 2O68A 1VFEA 1FW0A 3GXAA 4KCCA 5AA2A 1IXGA 2DE2A 1XC1A 3PV0E 1NL5A 2O6AA 4I9DA 3FZVA 4XTCQ 1FPLA 2QMWA 1MQJA 5CMBA 2UYFA 3E78A 1IXHA 3I5OA 1B3EA 4OHNA 1YXIA 3MVXA 3MWBA 3IOWA 4Z0IA 1BKAA 1J1NA 5IZ1A 4TOZA 2DE3A 2XXHA 2P2AA 1EYKA 4RK2A 3IK6B 3VFJA 2I0CA 4NTLA 1I6BA 1O7TA 1NMUA 3KC1A 4XF5A 1IUDA 4DE8A 2G93A 3VVEA 4EDPA 4R74A 4OVPA 5I3SA 3RUMA 3A29A 1ZIUA 3RTFB 4MX6A 3CSGA 1AWBA 4H1XA 4U22A 1SQYA 4KQPA 2O84X 4KYSA 3TTMA 5HBCA 5I56A 4WKMA 5FTIA 1KZ8A 4F18A 1MQHA 1YPNA 2RC7A 2DP8A 1MY2A 2CEXA 4KCDA 4F1YA 2Y7WA 3TYHA 3S9MC 2Y7KA 3BFTA 4G68C 4N6PA 2DS9A 1B7UA 1I6QA 3S2VA 4GXAA 2RC9A 4GIZA 2M8CA 4ZE9A 3KSJA 1FBFA 1N3XA 3H03A 1MH4A 2Z23A 2D5WA 4F2QA 4FEDA 1B40A 4P3LA 3K6UA 3MJNA 1LFIA 4LATA 1LBXA 3TEPA 2VOZA 3G3KA 3D1RA 2ZZXA 2ZYMA 5J1DA 2Y7PA 2LAOA 5TPAB 2XWOA 4P1EA 1EU8A 4G4PA 4F3SA 2VT5A 1LB8A 3FD3A 1LGBC 3CFLA 1FQCA 1TFDA 4H5GA 3MVZA 4H0WA 4E0WA 5EQ7A 3CIJA 3DLNA 3IFCA 3SKPA 3B8BA 1ELJA 4QF9A 2GRVA 4I3YA 4N17A 5AA4A 1FPDA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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