2GQKA

Solution structure of human ni(ii)-sco1
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
173
structure length
173
Chain Sequence
b'SFTGKPLLGGPFSLTTHTGERKTDKDYLGQWLLIYFGFTHCPDVCPEELEKMIQVVDEIDSITTLPDLTPLFISIDPERDTKEAIANYVKEFSPKLVGLTGTREEVDQVARAYRVYYSPGPKDEDEDYIVDHTIIMYLIGPDGEFLDYFGQNKRKGEIAASIATHMRPYRKKS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A hint for the function of human Sco1 from different structures.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO1 protein homolog, mitochondrial
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal transport
total genus 49
structure length 173
sequence length 173
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2gqkA00
3L0HA 4TR0A 3LJRA 1GSUA 2C80A 2MMAA 4MMMA 4RQRA 2RUFA 3L4NA 3GYKA 5D73A 3ZREA 2YV9A 1FW1A 2E0QA 2AUVA 1GWCA 1ZGNA 4TR1A 4BA7A 4MP4A 2H6ZA 5IIZA 1Z3EA 4GCIA 4MPFA 1OC8A 3L9VA 2LRNA 4MJBA 5ECOB 4HS1A 4KSOA 2F8FA 4IW9A 1PKWA 2H73A 3EMPA 4POKA 4MCUA 4KCEA 1EGOA 3MDKA 3F6DA 3IE3A 4N0ZA 2AB6A 4OMVA 3CTGA 4HU9A 3EMXA 3UMAA 2XHFA 2H1DA 4WR4A 4LL4B 4XS6A 1AIUA 3ZTLA 5ID2A 5FHIA 3HJPA 1DE2A 3CRUA 4WF5A 2P0GA 1ZZYA 4G19A 3HVXA 1URMA 1B9XC 1R26A 2HE3A 3M3MA 4Q5NA 3TRXA 4XTSA 4NV5A 1XFLA 5DJLA 4AJ7A 1Z6MA 1A23A 1MD4A 4Q5FA 3ZL5A 3D4TA 4E8EA 2DIZA 4ECJA 4HOJA 5ECHB 2VOCA 5DQSA 1GNEA 2YV7A 4G2EA 4ZBBA 3ZIJA 2GDRA 4NPBA 3PGTA 1W89A 5CYYA 3MAKA 4GQFA 2JADA 2G0FA 1TOFA 2CA8A 2WJUA 3KCMA 1GL8A 3D4MA 3GSSA 1NHOA 1ERUA 1K0CA 4TXOB 2FGXA 1B8XA 1VF1A 4IP6A 1E2YA 1XWKA 2A4VA 1XW6A 3KZQA 1TP9A 1M2DA 2CZ2A 1XW9A 3UAPA 3ED3A 4DSQA 3FW2A 2M72A 3N5OA 4YQVA 4ML1A 3DIEA 3V1WA 1R7HA 1X5DA 4V2MA 3F8UA 4FYCA 4I6XA 2GZZA 2GQMA 1F3AA 2B5XA 2C3QA 4KB3A 2IMDA 1I5GA 2GZPA 1K0AA 1VF3A 1Z5YE 3APSA 3FZ5A 2IL3A 3DKSA 4MDCA 3EWLA 11GSA 1EP7A 5IMCA 3ME7A 3TOUA 2F3MA 1K0OA 3GURA 3QFAC 2FCHA 4GSTA 5H5SA 2A2SA 4J56E 3TGZA 2QC7A 2H1AA 1A2MA 4ZXGA 4QL9A 3VPQA 5J3RA 3FZ4A 3KXOA 4TVEA 5EL8A 5D9XA 1KBNA 3PINA 2H0HA 1XBSA 1A8LA 4Q5RA 1M2BA 2V32A 5H5QA 3ZVJA 1Y6EA 4EUYA 5IO2A 1Z9HA 4EDYA 1FVJA 3Q18A 3NIVA 5D8IA 3R2QA 3HVVA 2C0GA 3GHAA 3I43A 5E4WA 3ERFA 1GSYA 1JLVA 4H86A 4OFTA 3J7Yb 1GP1A 4O32A 4RQXA 2VL9A 5IMFA 5CREA 1X9WB 2YJHA 2VD0A 2L57A 4MABA 4N11A 2C0EA 4K6XA 2MMNA 1YEXA 1USBA 1GUHA 3TJJA 1U87A 4JEDA 2JL4A 4MA9A 4YAPA 2GVPA 3BJ5A 1OE8A 2QSIA 5AIVA 1B4PA 1K3OA 4K7OA 2QGVA 3CSJA 1PSQA 1ERWA 5J9BA 5E59A 1EV9A 1IYIA 4PX1A 2JACA 5F05A 1HYUA 1AQVA 4KSMA 2ALBA 2KLXA 4XRDA 1WE0A 1T1VA 3HJOA 3GH9A 2V6KA 2GSQA 2VLTA 3GMFA 3I6AA 5JCUA 4I2UA 2I1UA 2XBQA 4AGSA 3QFBC 2H72A 1AC1A 3ZMKA 2LJKA 3IV4A 4NHWA 3GUSA 3DRNA 4ZL7A 3ZYWA 2H6YA 1SYXA 2OE0A 1SJ6A 2DBCA 2KHPA 4TXOA 5G1KA 2VO4A 3L9UA 5G30A 1O6JA 1F2EA 3DEXA 4IVFA 3UEMA 4MJEA 2FWFA 2LRCA 1A0RP 1PL2A 3MWHA 3KP8A 2EIQA 1WP0A 2FNOA 3ZZXA 1B9YC 5DVBA 3MSZA 3P7XA 2WB9A 1JZOA 4ZILA 4X0XA 1S3DA 1O85A 2RLIA 1GLPA 2GT5A 4ID0A 3UOMA 3EINA 4K0NA 1AQWA 5AISA 5IQYA 5IOWA 4BL7A 4F82A 4FYUA 1G7OA 4Z7XA 2B7KA 1EP8A 3TJFA 3Q19A 19GSA 1YJ6A 4HDEA 4OCEA 2JU5A 2V6OA 4PQIA 5CNWA 3UIWA 1TTZA 2BTOT 3EU4A 4KGIA 3FR9A 3I9V2 1Q98A 1XPVA 3IK9A 4MF6A 2VD1A 2EIOA 5HFKA 4WKWA 4PGTA 4K8MA 4ZL8A 3UVTA 1NHYA 4I8BA 1B4QA 3NOFA 3UVHA 1UC7A 5ABRA 2H71A 2CVKA 5IMDA 4D73B 2PU9C 3IXRA 4JU5A 1ACVA 2VCWA 1JZWA 4GLTA 2VLVA 1XWAA 1ON4A 4EF0A 3CRTA 2L59A 5IMAA 3LFLA 2FWEA 4ML6A 5DQYA 1I9DA 2PGTA 3CXGA 4V1Ag 1THOA 1UVZA 4MF5A 2YN1A 2JZRA 3LXZA 9GSSA 4K9ZA 3RBTA 1XWGA 1W4VA 5CRDA 3C73A 2H0IA 3ISOA 5CRHA 2YP6A 3RPPA 1U6TA 2CZ3A 3IOSA 2R6KA 1WMJA 3A2XA 5H5RA 2GSSA 1WOUA 2DIYA 2ES7A 2HFDA 2R5GA 1K3YA 1M9BA 5FWGA 4LLRA 1PRXA 5A4VA 5G2ZA 4EC0A 2NVLA 1BQ7A 1N8JA 1F3BA 3GSTA 1DE1A 2N5BA 2KUCA 6GSSA 3H1NA 1A2LA 5IOXA 3CYNA 5CRWA 2H30A 2YJ7A 1SU9A 3CSIA 2P31A 2L5OA 5AGYA 2J9HA 3F63A 2CT6A 3CBUA 2DJKA 2FD3A 3RDWA 1X9SB 2CVDA 2GSRA 3HZ8A 4E8HA 3E0UA 1G0TA 1OAZA 4P3YB 1QUWA 4MPGA 2PPTA 2TIRA 2L6CA 3TRQA 5B7CA 2WGRA 2ZCTA 1A2JA 3A3TA 2I9HA 5ECPB 1Y25A 2CAQA 4IELA 1SYRA 5COHA 3HDCA 2ZUPA 3QAVA 1K0MA 5ECSA 1TU8A 4XHMA 1VF2A 4IGJA 3GFKA 1K0BA 3FK8A 2DSAA 5GSTA 2H19A 3IHQA 3KGKA 2O8VB 4ECIA 1YKCA 4BWQA 1GUMA 2VUPA 2E7PA 4WXTA 4D73A 5HR0A 5IO0A 3DXBA 3WYWA 1T8EB 1XOBA 4V2LA 5HR3A 2F8AA 2O89A 1RW1A 1FVKA 4NHZA 4MK3A 3EVIA 5C04A 3FY7A 4WF4A 16GSA 3I69A 2FUG2 4TXVA 3FYGA 3HXSA 3TDGA 2M46A 2VIMA 2B1LA 3GKKA 3U6VA 2R2JA 2VM1A 1F6MC 2RM5A 4BVYA 4GSSA 1WRYA 1CQHA 3TKPA 3D6IA 1OE7A 4F2IA 3FHKA 2WFCA 2HYXA 2NTOA 1TW9A 4BVXA 3IK7A 6GSUA 3CMIA 2OACA 1TRVA 4WBJA 6GSTA 4YQUA 2B6MA 4G10A 2N5FA 4PUFC 3IA1A 4K2DA 1HQOA 1JLWA 3LORA 1FB0A 1XWCA 2YOIA 3G9BA 4L5LA 3GA4A 5GSSA 4ZL9A 5HR1A 1B48A 1O8WA 4K7NA 2K9FA 2DJ1A 5JCGA 3QMXA 1YEPA 3UBLA 1FB6A 3D0ZA 3FEUA 1AUCA 7GSSA 3HYPA 2BMXA 4F9ZA 1WJKA 3PH9A 3LSZA 4HJMA 1PGTA 3HJMA 4EO3A 3GKNA 3HVSA 1YF1A 3GRXA 5EY6A 5L71A 4IP1A 1NM3A 4KDUA 4ZBDA 2GQLA 5IPHA 1V2AA 4V1Ap 1JZRA 2V41A 3FZAA 4FYBA 4PXOA 3KMNA 2IMKA 2IPAA 2GSTA 4DSSB 2BJXA 4YAVA 3KIJA 4I2TA 1DBYA 4I5QA 2GQKA 4MH3A 1GULA 3KJYA 4ZB6A 1XWBA 2VCZA 5INYA 3GKMA 1U3AA 2IIYA 1GSFA 1SKRB 1V9WA 1O7UA 17GSA 2IMFA 2HRFA 1X5CA 2DJJA 1BG5A 1N2AA 5HQPA 4EXJA 2HSHA 2B5EA 2YANA 5J4UA 4FO5A 1MDJA 3GTUA 4ZB8A 2H01A 1ZYQB 4NXIA 1V57A 4DVCA 1RK4A 1A0FA 5D9WA 2CV4A 2YWNA 4OCFA 3WGDA 4AF2A 4ZB9A 4KCAA 1VF4A 4EVMA 5ECIB 1K3LA 4DSRA 2XPEA 3QOUA 1NSWA 4TN8A 2K18A 1FAAA 2HT9A 1QMVA 3M9JA 1HNBA 3W8SA 2YZUA 3F3QA 13GSA 1O73A 1TDIA 5JWOB 2JZTA 1ZYEA 6GSYA 5ECKB 2Z9SA 3NZNA 3HD5A 1EV4A 3HCZA 2H70A 4F0BA 4GQCA 3O76A 2K8VA 4CDOA 2HRNA 1TK0B 1K0DA 14GSA 2PN8A 2MBTA 3DVWA 3HY2A 2WZ9A 5F8BA 4KH7A 1GSSA 2A2RA 2YNXA 3ERGA 3S9FA 4IBPA 1SENA 3IRAA 5JWQB 1EWXA 2FLSA 4N10A 4EDZA 2VCQA 4YQMA 3GX8A 5A4UA 2O87A 2P5RA 2GTUA 5DCHA 2GGTA 1HD2A 4TRXA 2DMLA 1DSBA 2DMMA 3VURA 4CHSA 2TRXA 1S3CA 2PMTA 2IJYA 3G7IA 1CQGA 4JZQA 2F9SA 1EOHA 2B7JA 2XBIA 4KNDA 1GTUA 5DALB 5J5NA 3ZVJD 2F51A 2AYTA 2CX3A 4ECCA 2LNSA 1T00A 3QCPA 1AQXA 4ACSA 3FZ9A 4NMUA 4X43A 5F06A 4J57E 3IAM2 2YWMA 4DSSA 1TI3A 4MH2A 1X5EA 2LNTA 1WPIA 3LGCA 4WEYA 3VI7A 2GS3A 4JR6A 4F0CA 2LEGA 4IQAA 1OC3A 2ON5A 3WD6A 1SJZA 5D9VA 3TKQA 4GRFA 4IHUA 2B5YA 1F37A 3CSHA 3LXTA 3A5WA 3ZIVA 2EC4A 3H93A 5AIXA 1GTAA 4G9HA 1QGVA 1J9BA 18GSA 3TB2A 1H4OA 1J0FA 2KP2A 3DGQA 3EC3A 1BEDA 4CW9A 2HXKA 2LRTA 5F0GA 5JCWA 4AJ6A 4PQ1A 4XS4B 3JCML 4MJCA 1PMTA 3BCKA 3E3EA 2FA4A 1M99A 2HZEB 3LEFA 1FO5A 2C0FA 3QR6A 1S3AA 3J7Yk 2PVOC 2AV4A 5IM9A 1ERVA 5DBQA 2GT6A 1OVNA 1LJRA 3WGXA 1LU4A 4PNGA 5GAND 3F9UA 4WR5A 2P5QA 2PWJA 3PR8A 3IDVA 1QK8A 3MNGA 2X8CA 5LNKe 4O5RA 3K8NA 4GTUA 3H4KA 1H75A 1MDIA 1EGRA 3QPMA 4NWYA 1AXDA 2X64A 5CRGA 3Q6OA 3GKXA 2H6XA 2VL3A 5C00A 4BPYA 3APQA 2FWHA 3N9JA 1OC9A 1SJIA 2FHEA 2MMZA 3UL3A 2IMEA 1U88A 2KP1A 3L9SA 4POBA 1G7EA 3IPZA 1YZXA 5ELGA 1PL1A 1RQMA 5A4WA 2I3YA 3DMLA 6GSWA 3M0FA 4XCSA 2WULA 5DALA 1SK2A 4L0WA 4LA1A 1KEBA 2TRCP 4QL7A 1YQ1A 3A2VA 3EURA 1XIYA 2C4JA 3VWUA 3BBYA 3OR5A 4GWRA 4ULXA 4K0GA 4EKZA 1HNAA 3QAGA 3GV1A 5D93A 1FG4A 1SKWB 4HJ2A 3LWAA 1T4YA 4K1FA 2OJLA 1M7TA 2OA7A 1TKDB 3CTFA 4MZBA 3HKRA 3VWWA 3G7JA 4ZBAA 4MZCA 1T4ZA 2RM6A 3KTLA 4KUNA 2C3NA 2GZYA 1LBKA 3US3A 2CVBA 3C8EA 2KOKA 2LV3A 2FY6A 4KAEA 1SK1A 1MD3A 4IJ3A 3ZFBA 4YH2A 1X9MB 4POMA 5ECMB 6GSXA 1R5PA 2H74A 3KH9A 3GTUB 4TR4A 1U3IA 2O7KA 1XW5A 4XS4A 2WRTA 5B6MA 4MF7A 4F03A 3FKFA 1V58A 1NW2A 4OWYA 4ISDA 2R37A 2XC2A 4MZWA 4DEJA 2HZEA 2LSTA 1TJDA 3M9KA 2NBSA 4N30A 2VM2A 1SK0A 1PX7A 4L0UA 4OD7A 1M9AA 3D21A 3D22A 2O85A 4HZ4A 5A5KA 3ME8A 3P8WA 1UA5A 3U5RE 3GL3A 5LD0A 3RAZA 4NAXA 1R4WA 5D96A 1ML6A 3HZ4A 5ECNB 2E2MA 1M2AA 2L4CA 3SBCA 4HU7A 4NV2A 1TK8B 4LL1B 2JZSA 2B1KA 1BX9A 1TU7A 3W8JA 1Z7PA 4O7HA 4JE1A 4WETA 5DAKB 4KW6A 1GTBA 1XXUA 4WBRD 3W6GA 5IMZA 3LG6A 2H76A 2PERA 3DWVA 3HA9A 3KH7A 4RUVA 2R4VA 3EE2A 3VFIA 1PQNA 1ZOFA 1YKAA 5B6NA 2OE3A 2WS2A 2J23A 4POLA 1KTEA 4KE3A 4LMWA 3GX0A 1Z7RA 2IN3A 4RI7A 5ECRB 2L5LA 2H8LA 5G31A 4IJIA 3VWXA 4L8EA 1FOVA 1G6YA 2REMA 2YCDA 2MYGA 1TRWA 3IC4A 4PUAA 1XOAA 5ECQB 3HHVA 3VPTA 3Q74A 1IYHA 4TR3A 3FR3A 5FT3A 4KDYA 4XIHA 3UBKA 5LCZA 2WCIA 2IFQB 2C8UA 2LQQA 5EPFA 2DC5A 4TKYA 5DJMA 3GN3A 2WDUA 1E6BA 3VLNA 5J41A 2X8HA 20GSA 6GSVA 2YWOA 1ERTA 3GL5A 1XZOA 1O81A 3DVXA 1EOGA 3IAS2 3F4SA 2CAIA 2RUEA 1WIKA 1XVWA 3KMOA 3FRCA 3TKRA 1AW9A 3LYPA 3EYTA 3TKSC 1VGLA 1VRSD 1HNCA 2C0DA 2H1BA 2K6VA 5HFIA 1THXA 4JR4A 1Z6NA 2VAFA 1GSDA 2AAWA 4JRRA 1SD9A 4LMVA 1PKZA 2LKUA 1R5AA 1SKSB 1GUKA 3WT2A 2HZFA 4TOPA 2I4AA 2X99A 3TCOA 4K7IA 2DLXA 4J2FA 5IMVA 3TKSA 4N0VA 1PN9A 2ZNMA 2K8SA 4OO4A 1X0RA 3APOA 5CO3A 3RHBA 1JZDA 3QAWA 1T7PB 2VLUA 4GF0A 1BJXA 5CAXA 1TI1A 1YF0A 4FIWA 3BCIA 3TJBA 2YWIA 3ZFLA 4ILFA 3F3RA 5G1LA 5B8BA 1T3BA 3H8QA 1ABAA 2X8GA 2QKEA 1EEJA 2PUKC 1SL1B 3LYKA 1M0UA 2NPBA 1FHEA 10GSA 1V40A 8GSSA 1A8YA 1QQ2A 1EEMA 3P90A 3F6FA 1WWJA 5DAKA 3FR6A 5KN1A 3M1GA 2XPDA 2C1YA 1PX6A 1OC9B 3C1RA 3M8NA 3TJKA 4MLYA 1J08A 4O92A 3RHCA 5EVOA 2C3TA 1OYJA 2I81A 2OADA 5JWRB 4IQ1A 1TRUA 2OE1A 1GTIA 3P2AA 4ZIJA 3GNJA 3TRPA 1PD21 2DJ0A 3ZRDA 2IWTA 3UJ1A 5GZZB 3GIXA 1MDKA 2LJRA 3E9JB 1GRXA 4MJAA 2FWGA 4HQSA 3ERWA 3IBHA 4IS0A 3QD9A 2G2QA 4I97A 2DJ2A 1K0NA 3C1SA 1JFUA 3G7YA 2L6DA 3DYRA 2EIRA 2RIIA 4PURA 3A2WA 2D2ZA 1ZL9A 2IFQA 4OFMA 4GXZA 4QQ7A 3IR4A 2FA8A 2L4QA 2LTKA 2AHEA 3VI5A 1GSEA 2B3SA 3BD2A 4X1UA 4TW5A 1O8XA 5G5EA 5DDLA 3TJGA 12GSA 1G6WA 4GSNA 3TOTA 3SWLA 1GNWA 5DCGA 1ST9A 1GLQA 2V2GA 4EL1A 4HEA2 1DUGA 5CP1A 2MMOA 2OBIA 3KTBA 2YZHA 4AJ8A 1JHBA 4OFNA 3UARA 4RI6A 3F4RA 3EU3A 4Q5QA 4HUAA 2VCTA 2H0GA 4TR1B 2VCXA 3TUEA 2MZCA 2ON7A 3KEBA 4KDXA 5KN0A 5ELAA 2HNLA 2LJAA 2OBKA 3QDNA 1AAZA 5ENUA 3WT1A 1GH2A 3KP9A 1OKTA 2HI7A 4L5OA 2M80A 2LS5A 5ECLB 5KN3A 4IKHA 2IMIA 4PQHA 4EE0A 1TRSA 3ZITA 2MBSA 3O3TA 2R3XA 4HI7A 1YDKA 3ZLPA 1KNGA 3VWVA 3ZMLA 1OKDA 1GSQA 1BAYA 1SL2B 4JBBA 2HSYA 4XRAA 22GSA 5ID2B 2YPMA 1TXXA 4KX4A 1QXHA 5KN2A 2GLRA 3O6TA 5IPGA 4HZ2A 3H79A 1MEKA 5HR2A 5KEJA 1XVQA 2NDOA 2LQOA 4OO5A 3WGEA 5HFGA 1A24A 1XCCA 5D9TA 2V1MA 2PVQA 1YY7A 4KA0A 5J9CA 4IN0A 3LQ7A 3RPNA 1Q4JA 1BYEA 3BOAA 3DD3A 1QFNA 1SD8A 2E2GA 2OKAA 4XS1A 1TK5B 2CX4A 2VL2C 5F07A 1UN2A 2DJ3A 2H66A 5B8AA 3GH6A 4BWSA 2VCVA 4FH8A 1ZCPA 3KD0A 3L78A 2LUSA 3C71A 2H1GA 3F0IA 1ZMAA 1C72A 3VK9A 5G5FA 2H75A 1MTCA 2PBJA 2N5AA 1ILOA 1F9MA 1V98A 2HLSA 4PNFA 2VL2A 3F4TA 1EZKA 2CQ9A 2JSZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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