2GQLA

Solution structure of human ni(ii)-sco1
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
173
structure length
173
Chain Sequence
b'SFTGKPLLGGPFSLTTHTGERKTDKDYLGQWLLIYFGFTHCPDVCPEELEKMIQVVDEIDSITTLPDLTPLFISIDPERDTKEAIANYVKEFSPKLVGLTGTREEVDQVARAYRVYYSPGPKDEDEDYIVDHTIIMYLIGPDGEFLDYFGQNKRKGEIAASIATHMRPYRKKS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A hint for the function of human Sco1 from different structures.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO1 protein homolog, mitochondrial
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal transport
total genus 55
structure length 173
sequence length 173
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2gqlA00
4V2NA 2XBIA 3F8UA 5ECMB 3U5RE 4WKWA 3HVXA 3ME8A 5EVOA 3FEUA 3PGTA 4MF7A 1S3CA 4ML1A 3DVXA 2CZ3A 2R4VA 2B6MA 2BTOT 5G30A 3EYTA 1AQVA 1PSQA 3KP9A 3N5OA 3TDGA 3WD6A 3KIJA 2B5EA 1VF4A 4MJAA 4EC0A 2OACA 1K0CA 2YN1A 3KXOA 4BWQA 5G1KA 4HZ4A 3J7Yk 3F4SA 4TR1B 2REMA 3ZVJA 1XBSA 1IYHA 5J9BA 3BBYA 3UAPA 3Q18A 2R5GA 5LNKe 2KOKA 3L9SA 3TOTA 2FA8A 2LS5A 3TKQA 3BD2A 1E2YA 3NOFA 3IOSA 2VCVA 3HJPA 4EVMA 2YNXA 3ZIJA 2H0HA 12GSA 1K3LA 3QCPA 4WETA 3TKRA 3QFBC 2O7KA 4WEYA 5DBQA 1F6MC 5F06A 3F6FA 3A5WA 1HNAA 3EINA 5JCGA 2CAIA 4BVYA 4F82A 3TRPA 1XOBA 2FD3A 5IPHA 3MAKA 3TB2A 3ZTLA 3O76A 1M2BA 1PL2A 2RM6A 1EOGA 4HJMA 5AGYA 1NHOA 1XW5A 3QR6A 4KE3A 2YWNA 2LV3A 3TJGA 2HXKA 4RQXA 1EV9A 1VGLA 3O6TA 2DJ1A 2LRTA 5LCZA 2OA7A 3GTUB 2QKEA 3TOUA 1CQGA 5INYA 3TRQA 1QK8A 2TRCP 1GSQA 4GTUA 1TRWA 2MBTA 4DSQA 4Q5RA 1WP0A 3F4RA 1G6YA 4MF6A 5HR3A 1AQWA 5CNWA 2PN8A 1TRUA 17GSA 2PERA 2PGTA 4L0WA 2GSRA 3I43A 1A2JA 2EIRA 4RI6A 2J9HA 5IMFA 1N2AA 3TJJA 1SKSB 4KX4A 3IDVA 4ML6A 4EDZA 5D9TA 3R2QA 2NVLA 2DJKA 4BL7A 2F9SA 1LBKA 2GDRA 2XBQA 1BG5A 4ZBAA 2H70A 2H6ZA 19GSA 3SBCA 1SK1A 2GZPA 4OD7A 2MMNA 1SJIA 4HQZA 1SD8A 4J56E 4K6XA 2YANA 1YF1A 2DIZA 3E3EA 3K8NA 3WGDA 1DE2A 4NMUA 2VD1A 1WWJA 4YQVA 1PL1A 1WE0A 1XCCA 4PQHA 3TUEA 1UA5A 4BPYA 3AY8A 1QUWA 1G0TA 2WFCA 4IHUA 3C8EA 4GF0A 3UL3A 1ZOFA 5F8BA 2DSAA 5CREA 1GSFA 1MDKA 1AW9A 3GRXA 4GQFA 2H6YA 1H75A 1R7HA 2YP6A 5D93A 3MWHA 4WXTA 2VCXA 5J4UA 2QGVA 3U6VA 2GZZA 3J7Yb 5EY6A 2RUEA 4ZL8A 2I9HA 3C71A 3L9VA 5HFIA 5CYYA 4KAEA 1CQHA 2PWJA 3A2XA 4K7OA 2KUCA 2XPDA 5D96A 3EC3A 1B9XC 3KH9A 1XIYA 6GSXA 1RW1A 1AUCA 4XHMA 1GNWA 2PVQA 2JZSA 1KEBA 1O6JA 2C4JA 1AAZA 3QPMA 2JADA 5J5NA 1F9MA 2RUFA 3IAS2 4KSOA 1AXDA 4F0CA 1URMA 2CVDA 5C04A 4MH2A 4PX1A 4DSSB 2DC5A 3EMXA 3IAM2 1GSSA 1X9WB 4FO5A 4KDUA 5A4UA 4TR0A 6GSUA 4I97A 1RQMA 3D6IA 5F0GA 2XC2A 2E7PA 3GURA 4ECJA 3H4KA 2F3MA 4WF4A 4GRFA 2B1KA 3KCMA 2VCQA 4YAPA 3EWLA 3L78A 1B9YC 2FWHA 3KM6A 3BOAA 5ENUA 4GWRA 4ACSA 5D9XA 2CQ9A 4V1Ag 4NAXA 3PH9A 1ZCPA 5GSSA 2L59A 4EUYA 8GSSA 2C8UA 1EP8A 4POLA 5EPFA 1K0MA 2RLIA 3HYPA 1ERTA 3DMLA 1QXHA 3ME7A 5DJLA 3WGEA 2C80A 1TK5B 4KDXA 3APOA 3RBTA 4EDYA 4E8HA 5DAKB 4IVFA 4ZILA 1A0RP 1SJZA 4TR4A 1XXUA 4KCAA 2HFDA 5HR1A 1SYXA 4QL9A 3M9JA 3FR6A 22GSA 5JWOB 3DKSA 1TXXA 1GUMA 3F0IA 3D21A 4MF5A 2WJUA 1Z7RA 3CSIA 5DQYA 3RHCA 1A8LA 2HZFA 3GA4A 3IE3A 2FWFA 2LQQA 3GKNA 3I69A 3S9FA 1M0UA 1UC7A 1V40A 5IMCA 5L71A 2NDOA 4MMMA 1O73A 4QL7A 1R5AA 2VIMA 1BAYA 4P3YB 2F8AA 1MD3A 4BVXA 2ES7A 3OR5A 3M0FA 2LQOA 2YJ7A 5ECKB 5ECOB 2WCIA 1KBNA 4IELA 4AGSA 1ABAA 20GSA 2G0FA 2AAWA 1EEMA 4XS1A 5ELAA 5KN2A 2YJHA 18GSA 5HR2A 2CAQA 4TKYA 4ZBBA 2EC4A 2LRCA 4CDOA 2VUPA 3WGXA 4MDCA 3D4TA 3N9JA 3HDCA 1FVJA 2H71A 4PXOA 10GSA 3D4MA 3P2AA 2GS3A 4HU7A 1O85A 1GWCA 2ON7A 3HVVA 2D2ZA 7GSSA 4PQIA 1TW9A 2VM1A 4PNFA 3GYKA 2QSIA 3H79A 4MZCA 4PUFC 4ZL7A 2H73A 4AJ7A 3VWWA 4LA1A 2Z9SA 2YWMA 3WT1A 3HA9A 5IMDA 1SK0A 5F05A 3VFIA 1RK4A 2KP1A 3LXTA 2GSSA 3IR4A 4TW5A 5FT3A 4XRDA 1M7TA 5LD0A 4OO4A 1T1VA 2FWGA 2WZ9A 4ECCA 1BX9A 5E4WA 4F03A 4NHZA 2I4AA 9GSSA 1X9MB 2V2GA 1FVKA 4K7NA 1Y25A 5ECRB 2H01A 3KTLA 4LMVA 1OYJA 3FK8A 2VLUA 1TTZA 1QGVA 4MH3A 1EP7A 5IQYA 2FA4A 5ECIB 3UBLA 1BEDA 4ZL9A 5DQSA 1U87A 4ECBA 2AHEA 1TI1A 1PN9A 2WB9A 1PGTA 2MMOA 3ED3A 2PUKC 3IXRA 1TK8B 2JZRA 3GN3A 3MNGA 2PMTA 1JFUA 3TRXA 2YCDA 2FNOA 4YH2A 1EGRA 4HJ2A 3W6GA 3EE2A 3GFKA 3GHAA 3F3RA 3UARA 5DALA 5GSTA 5G5EA 2HZEA 1S3AA 2OKAA 4L8EA 2E2MA 5JCWA 1WJKA 5ECPB 2YPMA 3MSZA 2C0DA 4OWYA 1X5DA 1S3DA 3BCIA 1TDIA 3HZ4A 3KMNA 1VF3A 4IGJA 2DJJA 1JZRA 1V57A 4BA7A 2I3YA 3C7MA 3FHKA 1HD2A 3EVIA 5COHA 3GKXA 1GTUA 1M2AA 1B4QA 2IPAA 2C1YA 1GNEA 2CA8A 4DVCA 2AUVA 5IOWA 3D5JA 2H30A 2KP2A 3QAWA 3TJFA 4CW9A 1XWAA 1OC3A 1A2MA 3HJMA 5DJMA 3IA1A 2C3TA 1FAAA 3LEFA 4JE1A 4IQ1A 2DMMA 2L4QA 1N8JA 2MMAA 4GLTA 4HZ2A 5B7CA 3QFAC 3UVTA 4PURA 1Z7PA 1HNCA 2C0EA 3CTFA 2X99A 5IPGA 2N5AA 3CBUA 4TXOA 2L5OA 1UN2A 4V1Ap 3A2VA 2P0GA 4POKA 4K1FA 3M9KA 4O7HA 4F9ZA 2LJRA 5C00A 3C1SA 2JSYA 2DMLA 1JZOA 3LWAA 1GP1A 4PUAA 1AIUA 3L9UA 2IFQA 4J57E 2GQKA 4GSNA 1GSDA 3H93A 2PPTA 1T4YA 3MDKA 2B7JA 2LEGA 1TK0B 4G10A 3W8JA 1YKAA 1TU7A 1K0NA 3IK9A 1K3YA 3V1WA 3GL5A 2L6CA 4G19A 3LYPA 2FY6A 2X8HA 2R37A 2HZEB 1PX6A 1PKWA 4X1UA 1G7EA 1HYUA 4LL4B 4BWSA 4EO3A 4IJ3A 2DLXA 4I6XA 4K7IA 4JRRA 1SENA 2IN3A 1A2LA 2K9FA 1ZZYA 1U3AA 4TN8A 4RUVA 2GT6A 3KH7A 2PBJA 4OFMA 2VOCA 1JHBA 2IJYA 1R26A 1FHEA 1EV4A 1O81A 1XW6A 4JBBA 2K18A 3VPTA 3O3TA 5CAXA 3A3TA 3GX8A 3DYRA 3I9V2 4IW9A 4MP4A 2HT9A 5CRDA 1XVWA 3US3A 2H0IA 5D8IA 5KN0A 2AJQB 2JSZA 3TJBA 4IQAA 2GT5A 4AJ8A 4D73A 2F8FA 1EGOA 3EU3A 2CZ2A 1U88A 1Z6NA 2OADA 1HNBA 3IK7A 2H1GA 3GSSA 5J41A 1TU8A 2KHPA 3F6DA 4TXOB 2HRNA 4FYCA 3ZITA 5IMZA 1V2AA 4MZBA 5ECNB 1KNGA 4V2MA 2N5BA 2GQLA 1YY7A 2LUSA 4TRXA 1G7OA 4FYUA 1OC8A 2IWTA 2H72A 1SL0B 1OE8A 3FZ4A 2IFQB 2L4CA 4MPFA 3TKSA 4IJIA 4I8BA 4JEDA 2M80A 3ERWA 3HY2A 1K0DA 1BQ7A 4KB3A 1V9WA 5B8BA 4ILFA 4NXIA 5G2ZA 2LSTA 5HFKA 4KCEA 3RPPA 3VWVA 3ZL5A 1F37A 1Z6MA 4NWYA 3G7YA 2VD0A 2A2SA 2R3XA 4PQ1A 4LMWA 1PQNA 1SJ6A 3G9BA 5G1LA 2FCHA 3KEBA 2C3NA 1ZGNA 4XCSA 4ZB6A 1OKTA 6GSWA 1AQXA 6GSYA 2GSQA 2CVKA 3UIWA 4XTSA 1TJDA 3E9JB 2YWIA 5GAPD 4KGIA 2ON5A 3GX0A 3VWUA 3BCKA 1EZKA 1VF1A 3P90A 3DRNA 3JCML 2FWEA 4ID0A 4XIHA 4JU5A 1NM3A 5EL8A 1E6BA 1XWCA 4PGTA 2FLSA 4F2IA 14GSA 2O85A 1GTBA 3FZAA 1X0RA 1M9AA 4MA9A 3ZFLA 3WYWA 2V1MA 3F63A 1GRXA 4WF5A 2TRXA 2GTUA 1B48A 4HUAA 5J9CA 4JR4A 2V6OA 2CVBA 4D73B 5J3RA 1FG4A 4GSTA 1Q4JA 3UMAA 1K0OA 2V41A 2OBKA 1TKDB 1ON4A 1Z9HA 2WULA 5GZZB 1JZDA 4GQCA 1OE7A 1WIKA 3DIEA 5A5KA 3TGZA 1GUHA 2PVOC 2IMIA 4FIWA 4K2DA 1HQOA 3LJRA 3CRUA 5G5FA 2C3QA 3LXZA 3GIXA 1ST9A 3RHBA 1YZXA 2B5XA 2RM5A 3W8SA 2N5FA 1X9SB 1J9BA 1EWXA 3EURA 3KMOA 3UOMA 3HKRA 2I81A 2H19A 4IBPA 6GSVA 1THOA 2H1DA 1FB6A 4F0BA 3HD5A 4RI7A 4MLYA 1TRSA 4I2TA 1X5CA 2HI7A 2X8CA 1A24A 3DVWA 1PKZA 1XWKA 4K0NA 4FH8A 1T8EB 5HFGA 3VI5A 5ECQB 2DJ2A 2BJXA 4XRAA 3RPNA 3VWXA 2GGTA 3DGQA 1JZWA 1K0BA 3HCZA 4QQ7A 3KZQA 1ACVA 3CMIA 1XWBA 3M8NA 4MJEA 1T3BA 2K8VA 3EU4A 3HHVA 4MCUA 1Q98A 5IIZA 4J2FA 2YOIA 5GAND 1ML6A 5FHIA 1PMTA 1M9BA 1A8YA 2NTOA 1LU4A 2VO4A 1UVZA 3L0HA 5F07A 1DE1A 3SWLA 1V98A 5CO3A 1GTIA 3KD0A 2H1AA 2P31A 1GUKA 3LYKA 2V32A 2IMKA 2GSTA 2KLXA 4L0UA 1O7UA 1VF2A 4E8EA 2H1BA 2OE1A 1GSUA 4N10A 3GTUA 4ZIJA 2HNLA 4GXZA 2YZHA 2EIOA 1YJ6A 3VLNA 4NPBA 3DWVA 3E0UA 1PX7A 5ECHB 1XWGA 4MABA 3APQA 3G7IA 2IMEA 2DJ0A 5KEJA 3GH6A 1Z3EA 4X0XA 4XS4A 3ZREA 1I5GA 1YF0A 1KTEA 5DVBA 4HDEA 1GTAA 2K6VA 4JR6A 2WRTA 3CTGA 1H4OA 6GSTA 1O8XA 1MDIA 2H75A 4YQMA 2MZCA 2MYGA 4PNGA 5ID2A 2FHEA 2A4VA 4ECIA 4G9HA 5IMVA 4DSRA 3D22A 4GCIA 4IP1A 2O8VB 2TIRA 5HR0A 5IM9A 2YV9A 2VL3A 3GSTA 3APSA 5D73A 2AYTA 1M2DA 5JWRB 1TOFA 2H6XA 2VCTA 3PINA 3FZ5A 1MTCA 4V2LA 5FWGA 3UJ1A 6GSSA 5KN3A 1T7PB 3UBKA 3M3MA 4EL1A 2E2GA 1YQ1A 3HXSA 4KNDA 1GLQA 1NHYA 3GNJA 1XZOA 2VM2A 4N30A 4AJ6A 4RQRA 2HYXA 1USBA 4ZB8A 3ZMLA 2H66A 2PU9C 2HRFA 1ZL9A 1ILOA 2M72A 3F9UA 2H74A 3LFLA 4Q5FA 4TXVA 1R4WA 1F3AA 3G7JA 3GKMA 4POMA 3FZ9A 4L5OA 5DDLA 5HQPA 3KP8A 4MJCA 2IIYA 5JWQB 2VCZA 2LNTA 4WBJA 4OCEA 1T4ZA 2DIYA 3LG6A 4LLRA 1GULA 2ZUPA 2GLRA 2A2RA 2V6KA 1QMVA 1PA3A 3LQ7A 4FYBA 2OE3A 4IKHA 4KUNA 3CSJA 1WMJA 3HJOA 4O92A 3ZYWA 1K0AA 1TP9A 13GSA 3ZMKA 5IO0A 2LTKA 4K0GA 4G2EA 2B3SA 2DBCA 2H8LA 4WBRD 2JZTA 3LORA 4XS4B 2OE0A 4OCFA 4KH7A 4NV5A 4Z7XA 3H8QA 1THXA 3ZVJD 4EE0A 3VK9A 3KTBA 4OFTA 3P7XA 5A4VA 1BYEA 1FW1A 3UVHA 5CRGA 4I5QA 4NHWA 1ZYEA 4AF2A 1YEPA 4DSSA 3FY7A 5ID2B 3IBHA 5DALB 1F2EA 1ZMAA 3ERFA 3IC4A 4ULXA 5KN1A 2X64A 1JLVA 2G2QA 3FKFA 5AIVA 3CRTA 3VI7A 5IMAA 3H1NA 1PD21 2AV4A 3P8WA 5H5RA 1F3BA 1SL1B 1QFNA 2L5LA 1NSWA 4OO5A 3HVSA 1QQ2A 3QAGA 2FGXA 3TCOA 4I2UA 1XW9A 2VCWA 1ERUA 3GV1A 2CX4A 4HS1A 3Q19A 1ERWA 5JCUA 3D0ZA 4K9ZA 2VAFA 4EXJA 4KW6A 2LRNA 4DEJA 5DAKA 2MBSA 3TKPA 3ZRDA 4EKZA 4KA0A 3RDWA 3ZZXA 2BMXA 1GLPA 3Q74A 1SU9A 3UEMA 1A0FA 4TR3A 1XOAA 3FR3A 5IOXA 4HEA2 2C0FA 5IO2A 4ISDA 2K8SA 2P5RA 2JL4A 2ALBA 4CHSA 3BJ5A 5ABRA 3KJYA 3F3QA 3ZFBA 1NW2A 4OFNA 5ECLB 4IN0A 2NBSA 1V58A 4TVEA 3FR9A 2HLSA 2I1UA 1MEKA 2L6DA 2R2JA 5D9VA 3NIVA 1WPIA 2C0GA 2GQMA 2H76A 4N0VA 4N11A 4WR4A 3VPQA 2NPBA 4IS0A 16GSA 1J0FA 4HU9A 1YDKA 1SD9A 3IV4A 2E0QA 1SKRB 2GZYA 2OJLA 5B6NA 1FOVA 2JACA 2CT6A 3ERGA 4TOPA 4ZBDA 1BJXA 3GUSA 1EOHA 4KSMA 1OC9A 4HOJA 3FRCA 5B8AA 3QAVA 1XPVA 1MDJA 1IYIA 5AISA 2AB6A 3GL3A 5G31A 2CV4A 2H0GA 4MJBA 3GH9A 1AC1A 1X5EA 2L57A 3WT2A 4MZWA 4K8MA 2LNSA 5ELGA 3IHQA 4H86A 1JLWA 4YAVA 5DCHA 1VRSD 1SYRA 2ZNMA 3ZLPA 2LJKA 4HI7A 1Y6EA 1EEJA 3PR8A 5CP1A 4Q5QA 2P5QA 4JZQA 2R6KA 1SKWB 2XPEA 4XS6A 4OMVA 1MD4A 3FYGA 1FO5A 2HSHA 3LSZA 4POBA 3DXBA 3C1RA 1K3OA 1XFLA 4NV2A 3HZ8A 1I9DA 2YWOA 1GSEA 3M1GA 4O5RA 1Z5YE 2LKUA 2IMFA 1B8XA 4X43A 1T00A 2O89A 3F4TA 5AN1A 2B1LA 4HQSA 1XVQA 3DD3A 3Q6OA 3NZNA 1J08A 3QD9A 1SK2A 1R5PA 2RIIA 1YEXA 1OAZA 2IMDA 5ECSA 2CX3A 4WR5A 1B4PA 2FUG2 1W4VA 3C73A 1OKDA 3CYNA 2VL2A 3TKSC 4MK3A 3IPZA 5B6MA 1TRVA 5CRWA 1U6TA 1SL2B 2IL3A 3EMPA 1G6WA 2B7KA 2O87A 2XHFA 2HSYA 2LJAA 1GSYA 3CSHA 3TKSE 3QMXA 1WOUA 11GSA 1O8WA 2JU5A 1LJRA 3IRAA 4TR1A 2J23A 3GKKA 1PRXA 5H5QA 1TI3A 3VURA 2YV7A 2WDUA 2WS2A 1OC9B 5A4WA 3L4NA 3RAZA 4KDYA 3CXGA 2QC7A 2GVPA 4ZXGA 3LGCA 2VL9A 5E59A 1M99A 2DJ3A 2EIQA 3QOUA 4EF0A 1U3IA 2M46A 5AIXA 1DSBA 4LL1B 1C72A 2VLVA 1ZYQB 1DBYA 1A23A 3ZIVA 3GMFA 4N0ZA 4IP6A 1WRYA 1GL8A 2X8GA 2HE3A 3FW2A 1OVNA 2VLTA 4Q5NA 4MPGA 3QDNA 5CRHA 3TJKA 1DUGA 3A2WA 3I6AA 5H5SA 4GSSA 2OBIA 2MMZA 1W89A 3ISOA 3KGKA 2WGRA 2B5YA 1GH2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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