2GRCA

1.5 a structure of bromodomain from human brg1 protein, a central atpase of swi/snf remodeling complex
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
EKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEKEDD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural ramification for acetyl-lysine recognition by the bromodomain of human BRG1 protein, a central ATPase of the SWI/SNF remodeling complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable global transcription activator SNF2L4
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 47
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 3.6.1.-:
pdb deposition date 2006-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2grcA00
5I89A 5EICA 4QSSA 5AD2A 5ENBA 5KTXA 4BJXA 5EWHA 4HBVA 3LQJA 5AD3A 5JI8A 4YYDA 5A83A 5EV9A 5FE6A 4BW4A 3LQHA 4A9IA 4IR6A 2R10A 4A9OA 3LQIA 5CUAA 5EWCA 4WHUA 5II2A 5CGPA 3JVJA 2G4AA 4PKLA 4N4IA 4CUSA 5H1TA 1JSPB 2KTBB 4MENA 2F6JA 2D82A 5LVQA 1WUGA 5FE9A 4A9LA 2R0YA 4UYHA 4O7CA 3HMHA 5L99A 5HEMA 5CFWA 5HLSA 5FG4A 5FE7A 2LSPB 5L96A 5F62A 5HFQA 5D3LA 4F3IA 4UIYA 5AMEA 2RNWA 4QUTA 4CFKA 5LJ0A 5DKHA 2DKWA 4OUFA 5ETDA 4N3WA 4NRBA 4CUTA 4LR6A 4LZRA 4UIZA 5E73A 5FFYA 5FE4A 5G4SA 3AQAA 5I83A 4QC1A 4J0RA 2DATA 4MEOA 5CUCA 4O74A 4J3IA 2E7OA 4CUQA 5I86A 5L98A 5IIDA 5LKXA 5CTLA 5E9KA 5C4QA 5I1QA 2E7NA 4YYIA 4QR4A 3Q2EA 4IOQA 5IGLA 4O72A 5D3HA 4ALHA 4LZSA 5CUBA 4CLBA 4HXNA 5CRMA 3QZVA 3LJWA 4YAXA 3QZTA 5HM0A 5EVAA 4UYGA 5E3DA 4CUUA 4IR5A 4J0SA 4NQNA 5E9LA 4YYHA 4HXLA 2I8NA 5EQ1A 5F60A 5A5PA 3D7CA 4O7AA 5DFDA 4CUPA 5IGMA 5DKCA 3P1CA 5ETBA 4XY9A 5D26A 5CQ5A 5FFWA 3O33A 4O75A 2YDWA 4N4GA 5CP5A 5BT4A 4UYFA 2N9GA 5A85A 4QYDA 5CQTA 4LC2A 4DONA 5FE2A 5EU1A 4PCEA 4YC9A 5CQ7A 3P1DA 2RS9B 5TB6A 5BT3A 5D24A 5CQ8A 5EA1A 5EI4A 4UIXA 4N4HA 3JVLA 5DKDA 4NYVA 3Q2FA 5HELA 4QEVA 3HMFA 4NUDA 4X2IA 5A5SA 4IR3A 5K29A 5F25A 3UVXA 5EPBA 4TT6A 5A5OA 5C85A 2OUOA 5DY7A 3JVMA 4Q0OA 1JM4B 4A9NA 4QBMA 5CZGA 4TZ8A 5E9YA 5HQ6A 4XUAA 2DVQA 4MR5A 4TYLA 4LYIA 3MXFA 4YBTA 2RNYA 4ALGA 4TT4A 5D7XA 4CFLA 4YABA 5FG6A 2L5EA 5DYAA 4MEQA 4HBXA 4QYLA 3AADA 2YELA 2RI7A 4QY4A 5EWVA 5A5NA 5TCMA 5KU3A 5FE0A 5CQ3A 4YADA 5E9IA 5JWMA 5ENIA 5A5RA 3LXJA 3UV2A 3MULA 2F6NA 5DLXA 4A9JA 4CURA 5FG5A 2YQDA 5KO4A 4MEPA 3UVDA 5EWWA 5I7YA 3DWYA 5DX4A 4NR4A 3IU5A 2OO1A 4LRGA 5FE5A 4NQMA 3I3JA 3U5OA 5LJ2A 4PCIA 3S91A 4XUBA 5F36A 5DYXA 5HJCA 4NR7A 4Z93A 5I80A 5FE8A 4OGJA 4CL9A 5CQ4A 2DVVA 5DLZA 3U5LA 3G0LA 4O70A 3U5JA 5ENHA 3G0JA 5IBNA 5I88A 3O34A 2R0SA 3P1EA 3IU6A 3MB4A 5F1HA 4YYMA 4E96A 3O37A 4WHWA 4Z6IA 5C7NA 5EP7A 4IORA 4YY4A 5EK9A 1X0JA 4HBYA 3DAIA 3GG3A 4QSUA 5FH7A 4A9KA 4UYDA 4FLPA 5D3JA 5L97A 4Y03A 4NUEA 4BW2A 4YATA 5AMFA 4RVRA 5D25A 3UV5A 2R0VA 3FKMX 5HRVA 4HXPA 3RCWA 2WP2A 5E9MA 2E3KA 4Z1QA 4UITA 5FFVA 4NYWA 2D9EA 5FBXA 4YH4A 3SVHA 5I29A 4KV1A 2RNXA 5F3AA 4NRAA 2RO1A 5IGKA 4A9EA 4ZC9A 4HXSA 5CU8A 5CQAA 5HQ5A 4LYSA 2YEKA 4UYEA 5F63A 3UVWA 1EQFA 4PS5A 5F2PA 4TZ2A 4KCXA 4O77A 4HXKA 4ZW1A 5FB1A 4YYNA 5D3RA 4C66A 5A7CA 4IR4A 5EPSA 5C87A 4TU4A 2GRCA 3U5NA 4QSWA 5DYUA 5CUEA 2DVSA 4GPJA 5FDZA 3O36A 4A9MA 4QSVA 4BW1A 4NS5A 4TT2A 4QR5A 4QUUA 2I7KA 3P5OA 5LKTA 1F68A 4IOOA 1E6IA 2L85A 5E9VA 4UIVA 5CUDA 4YY6A 4YYJA 4QEUA 5DYCA 4TTEA 4UIWA 4O71A 2RFJA 4YBMA 3MUKA 5E7DA 5FH6A 5ENGA 4LZ2A 5F61A 5HCLA 2DWWA 2NXBA 5CPEA 5H1VA 5KHMA 4HXRA 2YYNA 4NR6A 5H85A 4XY8A 5A5QA 4C67A 5I40A 4PY6A 5KTWA 4QB3A 5LVRA 3ZYUA 2FSAA 5H1UA 5L8UA 5HRWA 4O76A 5A81A 4PTBA 5F5ZA 5FE3A 3TLPA 5D3PA 5EISA 3QZSA 5HENA 3MQMA 4NXJA 4O7BA 4NR9A 5E0RA 5C89A 4A9HA 5FE1A 5D3NA 4YYGA 3ONIA 3P1FA 3U5PA 2H60A 1N72A 3UW9A 4QR3A 4Z6HA 4MR6A 5D3TA 2YW5A 1ZS5A 5FB0A 2L84A 4QSTA 3UVYA 5DFBA 4NRCA 4QSPA 4HXMA 4QSRA 2WP1A 5HQ7A 4KV4A 5E74A 5EWDA 3SVFA 5KTUA 5HFRA 4LYWA 4BW3A 5CQ6A 5DW2A 5CS8A 4Q0NA 4QEWA 3HMEA 5CY9A 5L8TA 2DVRA 4QC3A 4QSXA 4QSQA 3U5MA 4QZSA 4UYFB 2MJVB 4NR8A 4OGIA 4YK0A 4TU6A 5A82A 5ACYA 5ENFA 5IGNA 4HXOA 5HRXA 5FH8A 5LKUA 5C8GA 3S92A 4MR3A 4WIVA 4A9FA 2OSSA 4Z1SA 4O7EA 3UV4A 1WUMA 4O78A 4ZQLA 5ENEA 4XYAA 3NXBA 3SVGA 5BT5A 4O7FA 4N4FA 4NR5A 4UIUA 5II1A 5CRZA 3O35A 5ENJA 5I7XA 5F1LA 4NYXA 3K2JA 4QNSA 4MR4A 4YYKA 4LDFA 2YEMA 4YH3A 5EPRA 5CUGA 4AKNA 5IG6A 4YBSA 4TQNA 3U5KA 5D0CA 4TS8A 5LKZA 5DBMA 4J1PA 5E3GA 3JVKA 5LJ1A 5DFCA 5ENCA 5EM3A 3MB3A 4BHWA 4HBWA 5D3SA 5DW1A 5EGUA 5G4RA 5J0DA 4NUCA 5LUUA 5COIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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 5I89 A;  5EIC A;  4QSS A;  5AD2 A;  5ENB A;  5KTX A;  4BJX A;  5EWH A;  4HBV A;  3LQJ A;  5AD3 A;  5JI8 A;  4YYD A;  5A83 A;  5EV9 A;  5FE6 A;  4BW4 A;  3LQH A;  4A9I A;  4IR6 A;  2R10 A;  4A9O A;  3LQI A;  5CUA A;  5EWC A;  4WHU A;  5II2 A;  5CGP A;  3JVJ A;  2G4A A;  4PKL A;  4N4I A;  4CUS A;  5H1T A;  1JSP B;  2KTB B;  4MEN A;  2F6J A;  2D82 A;  5LVQ A;  1WUG A;  5FE9 A;  4A9L A;  2R0Y A;  4UYH A;  4O7C A;  3HMH A;  5L99 A;  5HEM A;  5CFW A;  5HLS A;  5FG4 A;  5FE7 A;  2LSP B;  5L96 A;  5F62 A;  5HFQ A;  5D3L A;  4F3I A;  4UIY A;  5AME A;  2RNW A;  4QUT A;  4CFK A;  5LJ0 A;  5DKH A;  2DKW A;  4OUF A;  5ETD A;  4N3W A;  4NRB A;  4CUT A;  4LR6 A;  4LZR A;  4UIZ A;  5E73 A;  5FFY A;  5FE4 A;  5G4S A;  3AQA A;  5I83 A;  4QC1 A;  4J0R A;  2DAT A;  4MEO A;  5CUC A;  4O74 A;  4J3I A;  2E7O A;  4CUQ A;  5I86 A;  5L98 A;  5IID A;  5LKX A;  5CTL A;  5E9K A;  5C4Q A;  5I1Q A;  2E7N A;  4YYI A;  4QR4 A;  3Q2E A;  4IOQ A;  5IGL A;  4O72 A;  5D3H A;  4ALH A;  4LZS A;  5CUB A;  4CLB A;  4HXN A;  5CRM A; 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