2GRCA

1.5 a structure of bromodomain from human brg1 protein, a central atpase of swi/snf remodeling complex
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
EKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEKEDD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Probable global transcription activator SNF2L4
publication title Structural ramification for acetyl-lysine recognition by the bromodomain of human BRG1 protein, a central ATPase of the SWI/SNF remodeling complex.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 47
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 3.6.1.-:
pdb deposition date 2006-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2grcA00
4RVRA 4YYKA 4KCXA 3P1CA 4O7FA 4QNSA 3UVDA 4Z1SA 4N4GA 4NR9A 5L99A 4YY4A 4CUPA 5KTWA 5DFCA 5A83A 3UV4A 5IBNA 2RNWA 4HBVA 4QUTA 4LZ2A 5E9MA 3RCWA 4A9IA 4QSRA 5I29A 5KO4A 3ONIA 4LYWA 3NXBA 4NYWA 4Z6HA 4A9FA 5D26A 2L5EA 4TT2A 4NR6A 3O35A 4KV4A 1WUMA 2L84A 1WUGA 2RNXA 5A5RA 4YBTA 4KV1A 4UIUA 4O77A 5EWHA 5EWVA 4QEUA 5FH8A 4QSUA 4O7AA 4A9EA 4CUSA 4QYDA 5BT5A 5DKCA 5FE2A 5CTLA 4HBYA 5E74A 4MEPA 5CP5A 5FE5A 3JVKA 3LXJA 3HMEA 5CGPA 5CQ6A 5C4QA 5J0DA 5D25A 4TT4A 5E9LA 4BW1A 3JVLA 4MEQA 4UIYA 2D9EA 5L96A 5H1TA 5JWMA 5I1QA 3U5LA 4NYXA 4J0RA 4YADA 4TS8A 4YABA 4ZQLA 3U5OA 5I40A 5D3TA 4PTBA 2RI7A 3JVMA 5CRZA 3MXFA 4XY8A 3LQIA 4LYSA 3U5PA 4XY9A 4Z6IA 4UITA 4PCEA 3HMHA 5LJ1A 5DLXA 4CUUA 5D3PA 2YELA 4NR4A 5I80A 3UV5A 5EPSA 4UYEA 4UYFA 5EU1A 4NRAA 5H85A 3AADA 5D3RA 5HFRA 5I83A 4QZSA 5H1UA 2R0SA 4Q0OA 4X2IA 5FFWA 3LQHA 5A5NA 5CQ5A 5TB6A 3P1DA 5D3NA 2OSSA 5FG5A 5EVAA 5A5SA 1X0JA 5ENEA 4UYGA 5HJCA 4QR5A 5II2A 2N9GA 4OGJA 4NQNA 4HXMA 4IR6A 5CPEA 5FB0A 4LRGA 4IOOA 4N4IA 4NS5A 5CQ3A 4A9LA 5EM3A 4NR8A 5E3DA 4QSXA 4TTEA 4YYJA 5C8GA 5II1A 4IR5A 3U5MA 4UYDA 5AMFA 5CUGA 5F2PA 5CQAA 4YY6A 4J1PA 5G4SA 2R10A 1EQFA 4A9MA 1JSPB 2YEKA 2KTBB 5A5QA 4N4FA 2F6JA 4IR4A 4ZW1A 4A9NA 4O7EA 2WP1A 5EWCA 5FH6A 5CUBA 1N72A 5LVQA 2YEMA 5FE0A 4N4HA 5F1LA 5KU3A 3MUKA 5JI8A 3Q2EA 5LJ0A 3UVYA 5LVRA 5C85A 4QUUA 4MENA 5FE3A 3IU5A 5HM0A 5BT3A 5HELA 2DWWA 3QZVA 3QZTA 4FLPA 5F60A 5L8TA 5ENCA 5DKHA 5DYXA 4NUDA 4A9OA 3P1EA 4NUCA 2OUOA 5DW1A 5G4RA 4DONA 5FG6A 5FE7A 3UVXA 2E7OA 4LC2A 5A85A 3DWYA 5H1VA 4QR3A 5L98A 3UW9A 4Z93A 4F3IA 4HXNA 5D0CA 4UIXA 2RNYA 4QB3A 5AD2A 3ZYUA 5I86A 5HLSA 5I7YA 2MJVB 5CQ8A 5A5OA 4WHUA 4O75A 2D82A 2WP2A 5CQ7A 5CUEA 4QSPA 5LKXA 4TU6A 4O71A 4XUBA 5IGKA 4QSQA 4TQNA 2E7NA 5A81A 4TZ8A 5COIA 3UVWA 5IIDA 5F3AA 5ENJA 5C87A 4CLBA 5C7NA 3SVGA 2YYNA 3S92A 2DVSA 3G0LA 3MB4A 5L8UA 5DY7A 4QY4A 2L85A 4MR6A 5FE6A 5E9IA 4NXJA 3JVJA 4O76A 4CFKA 3Q2FA 4NRBA 5FE9A 4TU4A 3TLPA 5HRVA 4LYIA 2YQDA 5F63A 5IGNA 5EGUA 4BW3A 5FE1A 4CFLA 4WHWA 1JM4B 2LSPB 4QC3A 4HXSA 2RO1A 5E9VA 5HRXA 4YYNA 3U5KA 4YH4A 4OUFA 4XYAA 2OO1A 5CUCA 4J0SA 5DFBA 4NQMA 4O70A 5LKZA 4HBWA 2GRCA 2I7KA 4YYMA 3O34A 4LDFA 4NUEA 5DFDA 2DATA 5CQTA 5DBMA 3U5NA 5D3JA 4CL9A 5CFWA 4NR7A 4WIVA 2DVRA 2DKWA 3U5JA 5FB1A 5F61A 4NRCA 4ZC9A 4CUTA 4J3IA 5E9YA 5E7DA 2RFJA 5F36A 2F6NA 5KTXA 5EP7A 3GG3A 5DLZA 4CUQA 5D24A 5HCLA 3LQJA 5CQ4A 3SVFA 1ZS5A 4MR4A 4PY6A 4PCIA 4QBMA 4MR3A 5LJ2A 5FFVA 5DW2A 3I3JA 4O78A 4YYDA 2DVVA 1F68A 4AKNA 4OGIA 2RS9B 4UIZA 5DX4A 4YK0A 5HQ6A 2YW5A 5A5PA 5HRWA 4N3WA 3P5OA 4A9HA 5I7XA 4UYHA 3D7CA 5CUDA 3AQAA 4YC9A 4LZSA 5E3GA 4O72A 5HQ7A 4Z1QA 4Q0NA 4O7CA 5FH7A 5DYAA 5FG4A 3G0JA 3O36A 4YYIA 3IU6A 4HXRA 5CY9A 4TZ2A 5IG6A 5CS8A 4HXPA 4QEWA 5DYUA 4GPJA 5I89A 4CURA 4TYLA 5D7XA 5ENBA 5EV9A 5D3SA 4HXOA 5DYCA 3O33A 4ALGA 5FFYA 4IORA 5F5ZA 4A9JA 4LR6A 5EPBA 4MEOA 4C66A 4UIWA 4YAXA 4UIVA 3MB3A 2E3KA 4O74A 4BW4A 4YBSA 5K29A 5HENA 5E9KA 4YYGA 5BT4A 5CUAA 3MQMA 5IGMA 4YYHA 5D3LA 5DKDA 5LKTA 5E73A 5CRMA 5F25A 3LJWA 4HXLA 4BW2A 5A82A 5ENGA 4HBXA 5AMEA 5EQ1A 5D3HA 3HMFA 5ENIA 3SVHA 5EK9A 4QSTA 2YDWA 2DVQA 5EI4A 2I8NA 4ALHA 5FE8A 3K2JA 5A7CA 3UV2A 2R0VA 5KTUA 3MULA 4PKLA 4Y03A 4QSSA 4HXKA 4NR5A 4UYFB 5EWWA 5F62A 4BHWA 5AD3A 4IOQA 5EICA 5ENHA 4LZRA 5HFQA 5CZGA 3O37A 5EA1A 4MR5A 5EPRA 5EWDA 1E6IA 2R0YA 4IR3A 4QEVA 3QZSA 4YATA 5IGLA 5F1HA 3P1FA 5EISA 3DAIA 4QSVA 4QSWA 4TT6A 5E0RA 5ACYA 5L97A 4YBMA 5C89A 4NYVA 2NXBA 5I88A 5ETDA 4C67A 5FDZA 2FSAA 5KHMA 5TCMA 4QC1A 4QR4A 4QYLA 4O7BA 3S91A 3FKMX 5LUUA 5LKUA 4BJXA 5HEMA 4E96A 2G4AA 4YH3A 5ENFA 5FE4A 5FBXA 5HQ5A 4XUAA 4A9KA 4PS5A 2H60A 5ETBA 5CU8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RVRA 4YYKA 4KCXA 3P1CA 4O7FA 4QNSA 3UVDA 4Z1SA 4N4GA 4NR9A 5L99A 4YY4A 4CUPA 5KTWA 5DFCA 5A83A 3UV4A 5IBNA 2RNWA 4HBVA 4QUTA 4LZ2A 5E9MA 3RCWA 4A9IA 4QSRA 5I29A 5KO4A 3ONIA 4LYWA 3NXBA 4NYWA 4Z6HA 4A9FA 5D26A 2L5EA 4TT2A 4NR6A 3O35A 4KV4A 1WUMA 2L84A 1WUGA 2RNXA 5A5RA 4YBTA 4KV1A 4UIUA 4O77A 5EWHA 5EWVA 4QEUA 5FH8A 4QSUA 4O7AA 4A9EA 4CUSA 4QYDA 3VKHA 5BT5A 5DKCA 5FE2A 5CTLA 4HBYA 5E74A 4MEPA 5CP5A 5FE5A 3JVKA 3LXJA 3HMEA 5CGPA 5CQ6A 5C4QA 5J0DA 5D25A 4TT4A 5E9LA 4BW1A 3JVLA 4MEQA 4UIYA 2D9EA 5L96A 5H1TA 5JWMA 5I1QA 3U5LA 4NYXA 4J0RA 4YADA 4TS8A 4YABA 4ZQLA 3U5OA 5I40A 5D3TA 4PTBA 2RI7A 3JVMA 5CRZA 3MXFA 4XY8A 3LQIA 4LYSA 3U5PA 4XY9A 4Z6IA 4UITA 4PCEA 3HMHA 5LJ1A 5DLXA 4CUUA 5D3PA 2YELA 4NR4A 5I80A 3UV5A 5EPSA 4UYEA 4UYFA 5EU1A 4NRAA 5H85A 3AADA 5D3RA 5HFRA 5I83A 4QZSA 5H1UA 2R0SA 4Q0OA 4X2IA 5FFWA 3LQHA 5A5NA 5CQ5A 5TB6A 3P1DA 5D3NA 2OSSA 5FG5A 5EVAA 5A5SA 1X0JA 1ZKRA 5ENEA 4UYGA 5HJCA 4QR5A 5II2A 2N9GA 4OGJA 4NQNA 4HXMA 4IR6A 5CPEA 5FB0A 4LRGA 4IOOA 4N4IA 4NS5A 5CQ3A 4A9LA 5EM3A 4NR8A 5E3DA 4QSXA 4TTEA 4YYJA 5C8GA 5II1A 4IR5A 3U5MA 4UYDA 5AMFA 5CUGA 5F2PA 5CQAA 4YY6A 4J1PA 5G4SA 2R10A 1EQFA 4A9MA 1JSPB 2YEKA 2KTBB 5A5QA 4N4FA 2F6JA 4IR4A 4ZW1A 4A9NA 4O7EA 2WP1A 5EWCA 5FH6A 4AKHA 5CUBA 1N72A 5LVQA 2YEMA 5FE0A 4N4HA 5F1LA 5KU3A 3MUKA 5JI8A 3Q2EA 5LJ0A 3UVYA 5LVRA 5C85A 4QUUA 4MENA 5FE3A 3IU5A 5HM0A 5BT3A 5HELA 3ERRA 2DWWA 3QZVA 3QZTA 4FLPA 5F60A 5L8TA 5ENCA 5DKHA 5DYXA 4NUDA 4A9OA 3P1EA 4NUCA 2OUOA 5DW1A 5G4RA 4DONA 5FG6A 5FE7A 3UVXA 2E7OA 4LC2A 5A85A 3DWYA 5H1VA 4QR3A 5L98A 3UW9A 4Z93A 4F3IA 4HXNA 5D0CA 4UIXA 2RNYA 4QB3A 5AD2A 3ZYUA 5I86A 5HLSA 5I7YA 2MJVB 5CQ8A 5A5OA 4WHUA 4O75A 2D82A 2WP2A 5CQ7A 5CUEA 4QSPA 5LKXA 4TU6A 4O71A 4XUBA 5IGKA 4QSQA 4TQNA 2E7NA 5A81A 4TZ8A 5COIA 3UVWA 5IIDA 5F3AA 5ENJA 5C87A 4CLBA 5C7NA 3SVGA 2YYNA 3S92A 2DVSA 3G0LA 3MB4A 5L8UA 5DY7A 4QY4A 2L85A 4MR6A 5FE6A 5E9IA 4NXJA 3JVJA 4O76A 4CFKA 3Q2FA 4NRBA 3D1DA 5FE9A 4TU4A 3TLPA 5HRVA 4LYIA 2YQDA 5F63A 5IGNA 5EGUA 4BW3A 5FE1A 4CFLA 4WHWA 1JM4B 2LSPB 4QC3A 4HXSA 2RO1A 5E9VA 5HRXA 4YYNA 3U5KA 4YH4A 4OUFA 4XYAA 2OO1A 5CUCA 4J0SA 5DFBA 4NQMA 4O70A 5LKZA 4HBWA 2GRCA 2I7KA 4YYMA 3O34A 4LDFA 4NUEA 5DFDA 2DATA 5CQTA 5DBMA 3U5NA 5D3JA 4CL9A 5CFWA 4NR7A 4WIVA 2DVRA 2DKWA 3U5JA 5FB1A 5F61A 4NRCA 4ZC9A 4CUTA 4J3IA 5E9YA 5E7DA 2RFJA 5F36A 2F6NA 5KTXA 5EP7A 3GG3A 5DLZA 4CUQA 5D24A 5HCLA 3LQJA 5CQ4A 3SVFA 1ZS5A 4MR4A 4PY6A 4PCIA 4QBMA 4MR3A 5LJ2A 5FFVA 5DW2A 3I3JA 4O78A 4YYDA 2DVVA 1F68A 4AKNA 4OGIA 2RS9B 4UIZA 5DX4A 4YK0A 5HQ6A 2YW5A 5A5PA 5HRWA 4N3WA 3P5OA 4A9HA 5I7XA 4UYHA 3D7CA 5CUDA 3AQAA 4YC9A 4LZSA 5E3GA 4O72A 5HQ7A 4Z1QA 4Q0NA 4O7CA 5FH7A 5DYAA 5FG4A 3G0JA 3O36A 4YYIA 3IU6A 4HXRA 5CY9A 4TZ2A 5IG6A 5CS8A 4HXPA 4QEWA 5DYUA 4GPJA 5I89A 4CURA 4TYLA 5D7XA 5ENBA 5EV9A 5D3SA 4HXOA 5DYCA 3O33A 4ALGA 5FFYA 4IORA 5F5ZA 4A9JA 4LR6A 5EPBA 3D1BA 4MEOA 4C66A 4UIWA 4YAXA 4UIVA 3MB3A 2E3KA 4O74A 4BW4A 4AKIA 4YBSA 5K29A 5HENA 5E9KA 4YYGA 5BT4A 5CUAA 3MQMA 5IGMA 4YYHA 5D3LA 5DKDA 5LKTA 5E73A 5CRMA 5F25A 3LJWA 4HXLA 4BW2A 5A82A 5ENGA 4HBXA 5AMEA 5EQ1A 5D3HA 3HMFA 5ENIA 2EJNA 5EK9A 3SVHA 4QSTA 2YDWA 2DVQA 5EI4A 2I8NA 4ALHA 5FE8A 3K2JA 5A7CA 3UV2A 2R0VA 5KTUA 3MULA 4PKLA 4Y03A 4QSSA 4HXKA 4NR5A 4UYFB 5EWWA 5F62A 4BHWA 5AD3A 4IOQA 4AKGA 5EICA 5ENHA 4LZRA 5HFQA 5CZGA 3O37A 5EA1A 4MR5A 5EPRA 5EWDA 1E6IA 2R0YA 4IR3A 4QEVA 3QZSA 4YATA 5IGLA 5F1HA 4AI6A 3P1FA 5EISA 3DAIA 3VKGA 4QSVA 4QSWA 4TT6A 5E0RA 5ACYA 5L97A 4YBMA 5C89A 4NYVA 2NXBA 5I88A 5ETDA 4C67A 5FDZA 2FSAA 5KHMA 5TCMA 4QC1A 4QR4A 4QYLA 4O7BA 3S91A 3FKMX 5LUUA 5LKUA 4BJXA 5HEMA 4E96A 2G4AA 4YH3A 5ENFA 5FE4A 5FBXA 5HQ5A 4XUAA 4A9KA 4PS5A 1PUOA 2H60A 5ETBA 5CU8A
chains in the Genus database with same CATH topology
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