2GWKA

Spvb adp-ribosylated actin: orthorhombic crystal form
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
371
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title A steric antagonism of actin polymerization by a salmonella virulence protein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
total genus 119
structure length 361
sequence length 371
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2gwkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2gwkA04
4A2AA 2I7PA 2Q97A 3BF3A 4BG8A 3M1FA 2F9WA 3A5OC 1U6ZA 4EFHA 1TUYA 4PL7A 3BP8A 2P9UB 2ZGZA 4RCHA 5AQVA 4BRAA 3GE1A 4CBWA 2YHWA 4I6MB 3QB0A 4BG9A 3QMLA 4FWPA 1E4FT 5BRFA 3U4LA 3AARA 3ZX0A 3U8XA 3ZX3A 4EHUA 5AQTA 3UKRB 1Q18A 1QHAA 2P9PB 3VESA 5AQQA 2P9UA 4EAHD 3O08A 5BR9A 4B1XB 3VEOA 3VF2A 4BRPA 4I6MA 1X3NA 1TYQB 3VENA 2ZWHA 1G99A 3HZ6A 3MN6A 1ZBSA 1QQNA 3S41A 4DCHA 4BVOA 3EKSA 1NGIA 5EY4A 3FR0A 3LDPA 3UKRA 2VWBA 4FOEA 3LDNA 3A5MC 2Q0UA 3VF4A 3O80A 4CZMA 3FZKA 3LDLA 3WXLA 3KVGA 2Q1NA 4FWMA 2V52B 2W40A 3QFUA 5AQFA 5TKYA 4QS8A 5BPNA 1RGIA 3WXIA 3VPZA 1TYQA 1V4SA 3ATUA 2FXUA 2GWKA 3W0LA 1MA9B 5AZJB 3R6MA 2P9LB 2ASOA 3I8BA 3EKUA 1NLVA 2D0PA 4FWKA 4BR9A 5JLHA 4BRIA 4BRNA 2FF6A 1NGGA 1E4GT 1NGJA 3VF6A 1Y64A 5F1XA 4BRCA 3I33A 1KAZA 3BEXA 3L4IA 5AQMA 3WXKA 4M63C 2YJEA 1ATNA 3KZBA 3OHRA 2FLOA 4H03B 2QWOA 1WUAA 3SMSA 5E26A 5AZJA 4WQ4A 4MO4A 2P9LA 1U2VB 1V4TA 1BWFO 4CZIA 3VEZA 3ID8A 2ASPA 3G25A 4CD3A 1GLLO 4FL9A 5AQUA 5JMVA 3C7NA 4FWNA 2Q2RA 3P4IA 3CJ7A 3D2EB 4FWSA 4H0TB 1HKBA 1D4XA 3RSEB 1XQSC 3C0BA 3H1QA 4BR5A 3SJHA 5KPTA 1U2VA 3EZWA 5LJVA 4CD1A 3CJAA 1NGBA 4RWTA 3A5NC 1QQMA 1ZC6A 2E2OA 3CJBA 3CJ1A 2D4WA 2ASMA 4BRGA 2V7YA 3F9MA 3VGLA 4B1YB 3D2EA 5I9EB 1NWKA 3BF1A 3RSEA 4GNIA 3EL2A 1K8KB 1XUPO 3SMPA 3M3ZA 1NGEA 1HLUA 3WT0A 3UB5A 4FWOA 1NGDA 1NBWA 1R59O 3VEYA 2Q0RA 2D0OA 2P9NB 2YCHA 2F9TA 3VOVA 4JHDB 4F9OA 5KPZA 5AQNA 2QWRA 1YXQA 3D2FB 4XH1A 2E20A 3CJ9A 4BC3A 4H0VB 5AQKA 3SLCA 2KHOA 2V51B 4H0PA 2GTDA 1KXPA 3WQUA 1K8KA 3O6WA 5CE3A 3AY9A 2P9SB 3FGUA 2FSJA 1SQKA 2A6AA 2P9KB 2AP1A 1MWMA 2FSNA 4B9QA 2A40A 1HX1A 5BN8A 4B1UB 4FOIA 3UE5A 3D2FA 4H5WA 4O5FA 5EVZA 5AQJA 3VGKA 2E88A 3WUHA 2HOEA 4CZGA 3BUZB 3MMVA 2OANA 2A42A 3O1WA 4H5TA 2P9SA 4JAXA 2E2NA 1TUUA 4AM6A 2P9KA 3GOIA 2GUPA 4HTLA 2ZGYA 3CQYA 1T44A 4CZKA 4IXCA 4DQ8A 2J4RA 3L6QA 4FWLA 4L3QA 1GLFO 1Z05A 3LM2A 4CZEA 3R8EA 3FZHA 2P9PA 4NO7A 4WQ4C 2GELA 5BREA 4CBUA 2HMPA 3AAPA 1JCEA 4A62A 5KQ8A 3TPQA 4CI6A 5E84A 1GLJO 3QBXA 3CERA 4BC5A 4E1JA 1HUXA 4BC4A 4GY2B 2QM1A 4H5VA 5AQLA 3TU5A 4BGAA 2I7NA 3CHWA 4M7XA 1H1VA 5JLFA 1LCUA 2CGKA 4BQZA 5AQWA 4BRKA 2QWLA 3JS6A 1QQOA 2ZF5O 2V7ZA 3FZMA 2VYPA 3MDQA 5FPEA 5AR0A 5EOYA 1J6ZA 3U9ZA 3D7EO 3IMXA 4IJNA 5LY3A 3VEVA 2NZTA 4H5NA 3HSCA 1YUWA 1RFQA 4BRLA 1GLAG 3ULEB 2Q36A 3FFKB 3FZLA 1ATRA 4JD2B 3MN5A 4Y0WA 3GBTA 4PL8A 4CJ7A 4B1ZA 2CGJA 3H1VX 2E1ZA 1C0FA 1HKCA 1BA0A 4DB3A 4FWQA 5BN9A 2GWJA 4H5RA 3LL3A 2UYTA 1RDWX 2YHXA 5ADXA 1GLEG 1BU6O 2A5XA 5FPDA 2CGLA 3ZEUB 3ZX2A 1JCGA 3ULEA 4YDUA 2QWPA 2BUPA 5AFUA 4CZFA 4IWVA 3CQXA 1EQYA 1ESVA 1WOQA 4BRFA 2QXLA 5AQOA 4LC9B 5B8HA 3IDHA 1HPMA 2BTFA 2W41A 2E8AA 3CJCA 2HF3A 3GL1A 4Z94A 3QDKA 4H0OA 5FPMA 4H0XB 2QWNA 3ATVA 3QFPA 2VCPA 4O8KA 1BA1A 1HJOA 2FF3B 4H0YB 4JNEA 5AQYA 3HBTA 1IJJA 4AM7A 3A8YA 4ISFA 4BR0A 3KHYA 3DJCA 4ISGA 1NGHA 4K43A 3GG4A 4ISEA 4IZ9A 1SAZA 4QS7A 4MO5A 5AQRA 3O4WA 2Q31A 4XH4A 2P9NA 4JHDA 3EO3A 1GLDG 4EHTA 3DAWA 3WEEB 4BR7A 2YJFA 4BRMA 1Z6RA 2NLXA 3HM8A 4J8FA 3FE1A 3R9PA 5AQIA 5F0XA 2A41A 3O5BA 4NB4A 2CH5A 3UKUB 3H3OB 5BPMA 4WQ5A 2AA4A 2H3GX 5KQDA 3U9DA 1T6CA 3MK6A 4B1VA 1C0GA 2YHYA 1IG8A 1X9JA 1OKJA 3LM9A 2WUSA 4FPAA 4CZJA 4CZHA 1YVNA 3WEEA 4BRQA 4IJAA 5AQPA 1QZ5A 1T6DA 4BROA 4PKIA 3H46O 1BO5O 2HF4A 3UKUA 1MDUB 2FSKA 2IIRA 3L0QA 4BC2A 2QWQA 5KPRA 1ATSA 4IO8A 4FSVA 3CETA 3HI0A 5BRDA 2E2QA 3LDOA 3WXJA 4WYBA 1SZ2A 2E2PA 2NRHA 4PKHA 4BRDA 3CIPA 2QW9A 4BQLA 3DXMB 3H6EA 3J8AA 1DKGD 4YDUC 4PKGA 4BREA 1MWKA 1BUPA 2E1YA 5AQXA 3LDQA 3VETA 1DGKN 3H45C 3AAQA 4XEIA 4FWRA 2PAVA 3GDQA 1S22A 4CZLA 3EN9A 1NGFA 3FLCO 1QZ6A 1KAYA 4C23A 3VEWA 1ZXOA 3ENHA 4EIAA 2A3ZA 3DXMA 3H3NO 3M6GA 5ADXH 3QICA 4CBXA 5BPLA 3B8AX 1P8ZA 1JCFA 2IVPA 4HWIA 1LOTB 4XH5A 4JN4A 4BRHA 5LJWA 1BOTO 3ZETB 4QS9A 3C7NB 5JICA 5AFUH 4BR2A 2P9IB 4BR4A 5F2RA 3W3DA 4RTFD 3VGMA 1BDGA 4A2BA 1HKGA 2EWSA 2PBDA 3ENOA 3DXKB 3IFRA 5AQZA 4K25A 2D1KA 4JD2A 4K41A 3A5LC 2CH6A 1NGCA 3CI5A 3MN9A 5AZIB 5EXWA 4BGBA 3IUCA 4BVPA 4FO0A 1NMDA 3ZETA 3JXUA 5FPNA 4M7YA 2P9IA 1NGAA 4MLHA 1YAGA 2IVNA 3SK3A 2IVOA 3ZEUA 5AQSA 3DXKA 3FZFA 4K42A 3QBWA 1S3XA 1GLBG 4WQ5C 5AQGA 2ITMA 1KAXA 3O8MA 3A0IX 5AZIA 3O1BA 4FPBA 1DEJA 3MCPA 4KBOA 1XC3A 5EX5A 3VEXA 1X3MA 3DWLA 1GLCG 5BRHA 3WQTA 5AQHA 3MN7A 1CZAN 3HTVA 2QWMA 4A61A 3VERA 2YI1A 1BG3A 4DHYA 2GEMA 4B1WB 4MLEA 5ELZA 1NM1A 2DPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UA1A 4A2AA 4M3TA 1L3SA 3DMJA 5HRPA 3BF3A 4BG8A 1JLBA 1FKOA 4CFDA 4JI2K 3QETA 3AVNA 4EFHA 3KK1A 4LD0A 2P9UB 4OKKA 4FLXA 1RTJA 4DFMA 4CBWA 3NMUA 3AVBA 5KGXA 3QMLA 4FWPA 3VQQA 4X62K 4YFUA 4DTJA 3AARA 5C12A 4N56A 3U8XA 1BQNA 3O9UA 3ZX3A 1NK5A 1YF5L 1WBBA 4W5QA 2WOMA 4EAHD 1KTQA 4B9MA 4B1XB 3VF2A 1TKDA 3V9XA 4BRPA 1ILYA 4DQPA 3VENA 3ZT2A 3HZ6A 1HYSA 3TSQA 4RW7A 3S41A 3PO5A 4DCHA 4E0DA 4FJ7A 1XHZA 4FZZA 3OYAA 2Q0UA 2RE2A 3QLHA 5IWAK 4O4GA 1M90O 4CJSA 4CEFA 2VGMA 4FVMA 3CYMA 4KHNA 4DV4K 1OH5A 2G8HA 2QEXN 2ITGA 3BGRA 3EKUA 1NLVA 4BR9A 4CJUA 1FJGK 1NGGA 2E6MA 5C24A 1J5EK 4CK2A 4DV3K 1VQPN 3NCIA 4DQRA 4IBNA 3ZSOA 4CHPA 3ZSYA 1NU0A 3BEXA 3WXKA 1GOCA 4H03B 2DY4A 3SMSA 2KW4A 4G9ZA 2HBLA 2P9LA 4LSLA 4FLTA 1BWFO 3ID8A 3OJSA 2ASPA 4CD3A 1VRTA 4B8AB 5DM6L 3HRGA 4BE0A 3TTCA 4H0TB 4ZHRA 1IBMK 3CXCM 4E19A 3QINA 4KHYA 1IBLK 4BE2A 4NLCA 4ZTJA 1U2VA 2NNWA 1WLJA 4CD1A 3CJAA 3A5NC 3ZT1A 3SBTA 3CJBA 1VRUA 3CJ1A 3KD5E 3SAGA 3SZ2A 4BWMA 2Y1JA 3EL2A 1K8KB 3UIQA 2O8FB 4FWOA 4AHCA 3HJFA 4IG3A 4CF2A 4JI8K 3T7ZA 3SUPA 4QOZB 1J9AA 4BC3A 4H0VB 3T1YK 1NJXA 2V51B 2VQFK 5J2PA 4CFCA 5KI6A 2OTJN 2XRIA 3LALA 2FSJA 2P1JA 2P9KB 1MWMA 3L2UA 4E7IA 2A40A 1HX1A 2O4IA 5BN8A 3UE5A 1YT3A 3V81A 2XY8A 4KH6A 4CJFA 4B8CA 4KPYA 5EVZA 4DF8A 4R5PA 4LFBK 4CJ5A 2YHBA 3ENBA 3VQCA 4K0KK 3SQ4A 3LP2A 2P9SA 4IOXA 4JAXA 4OJRA 3E9OA 1TUUA 1F21A 4AM6A 1TK8A 4IXCA 1O1WA 4X66K 1GLFO 3LPUA 4LSNA 4CEAA 3I8DA 2OYQA 3NGIA 3LM2A 5HLFA 4WQ4C 3V9SA 1SL1A 2GELA 3SPZA 1TKZA 1C0MA 1X9MA 1LWFA 4LFAK 1G15A 3QIPA 1NKEA 3G71N 3RMDA 5AJ3K 5KQ8A 3TPQA 4CEBA 3WNFA 1RBSA 4HTUA 1NKCA 4B3RK 3HYFA 2NRXA 2X6NA 4BC4A 2QM1A 4HUGA 5HRRA 4FJ9A 4OO1J 2I7NA 1VQ9N 4M7XA 1SUQA 3RMCA 5JLFA 1LCUA 1SS6A 1TKXA 4BRKA 2QWLA 3SCXA 1RDUA 4XIUA 4FJJA 1Z25A 1IH7A 1ZBLA 4E1MA 1XC9A 4YHHK 1J6ZA 1U48A 3IMXA 3NHGA 1B9FA 4H5NA 1GLAG 3QIOA 3K9JA 4JD2B 3SYZA 2F8TA 4CJ7A 2CGJA 4YORA 3H1VX 3KD1E 3T19A 1HNXK 4FWQA 4JRPA 5C42A 4M3RA 3NF7A 1Y97A 2YHXA 2RKIA 3OYMA 2A5XA 5TKWA 4LFCK 3ZX2A 3HOTA 1YTUA 4M3WA 3CC7N 4Z0UA 4BRFA 5AQOA 4LC9B 4DFJA 3IDHA 3P39A 3CCEN 2OPQA 4U7BA 3GL1A 1BI4B 3QNOA 4MQ3A 1HYVA 1IKWA 4E7KA 2LSNA 2QWNA 1RBUA 3MEEA 4KKOA 1BA1A 4CJRA 4KO0A 4JI6K 1BCMA 3O9RA 4AM7A 4ISFA 3KHYA 4DKWA 3M8RA 2HBJA 4GV9A 2O8EB 1TVRA 3J80O 4K43A 1LV5A 1J53A 3K5LA 3GG4A 1WNSA 3CPWM 3V1OA 2XO7A 3DAWA 2YJFA 2C1GA 3OVNA 3FE1A 3R9PA 5AQIA 1WB9A 1VSDA 4DV5K 4NB4A 3UKUB 5BPMA 2Z1GA 5KQDA 1RTHA 3TI0A 4CIGA 3HM9A 3R3LA 3O3FA 1OKJA 4KTZA 4DF4A 3VQ6A 4CJLA 4CZHA 5C25A 3TARA 4NYFA 4DSLA 3WEEA 5AQPA 2F8SA 3PV8A 4PKIA 2HF4A 4YY3K 1MDUB 2IIRA 4ZTFA 2NRRA 3AA5X 5GADP 2QWQA 3CETA 3HI0A 4RW8A 4YOXA 1T8EA 4WYBA 4ELVA 3DRPA 2NRHA 2X78A 1N36K 3DXMB 3ISNC 1DKGD 3OYBA 4PKGA 1IV0A 1BUPA 1CZ9A 2E1YA 2HW3A 1S6QA 3IAYA 4C8KA 4ID1A 2F4VK 4CZLA 4JI7K 1HMVA 4BDZA 4LF7K 2YKNA 1NGFA 3DLRA 1VSJA 4C23A 4HVJA 4FZXC 4KRFA 3CYGA 4DU3A 4CJVA 2BANA 3NVMA 2ZJPL 3QICA 5BPLA 4OX9K 1P8ZA 1NK8A 2XY5A 4CESA 5GIOA 4JS4A 3CC2N 3ZETB 4F8RA 4Y1DA 3J7YP 1KFDA 3C65A 4CFBA 3W3DA 4RTFD 3VGMA 1BDGA 1HKGA 2EWSA 4E7JA 4FW2A 4CIEA 2PBDA 4KHWA 2OZSA 4JD2A 4BEBA 4K41A 3HO1A 3A5LC 4WCEL 1WSJA 4CEQA 5AZIB 3IUCA 1NMDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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