2GWKA

Spvb adp-ribosylated actin: orthorhombic crystal form
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
371
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A steric antagonism of actin polymerization by a salmonella virulence protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Contractile protein
total genus 119
structure length 361
sequence length 371
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2gwkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2gwkA04
1MWKA 4FWMA 4H5WA 5AQFA 3LDPA 4JNEA 1QQOA 4IJNA 4BC3A 4BREA 3FZMA 5I9EB 3O8MA 3W0LA 1NGBA 3QFUA 3VEZA 3WEEA 5AQPA 4BGAA 4QS7A 4BROA 1HKBA 2ZF5O 4CZGA 4LC9B 1X3MA 2GUPA 1RDWX 3MN6A 1HUXA 4EHUA 3DJCA 1QQNA 5AQJA 5BN8A 3GG4A 5LY3A 2KHOA 2NLXA 1NBWA 2ASOA 4H0OA 2QWRA 1GLJO 2E1YA 1P8ZA 5AQLA 4XH4A 3R6MA 3C0BA 2V7ZA 3UKRB 3EKSA 4DCHA 4CZIA 2QWQA 3C7NB 4CZLA 1U2VA 4B1WB 3KZBA 4RWTA 5AZIB 2YJFA 1HX1A 2YJEA 1YAGA 2P9PA 1HLUA 3GDQA 2GELA 4H5RA 1ATSA 4EFHA 4CBUA 3A5MC 1Q18A 1SAZA 1ZBSA 2A41A 5TKYA 3ULEA 1NGEA 1TUYA 1EQYA 4CZFA 2PBDA 3QB0A 1U6ZA 1LOTB 3O4WA 3A5NC 4WYBA 1T44A 2CGJA 3HI0A 4WQ4A 1X3NA 2Q36A 2A6AA 3CQYA 4XH5A 4BR5A 4DQ8A 4EIAA 3FFKB 4CD3A 5BRHA 4FOIA 1V4SA 5AQGA 2P9LB 4FO0A 1GLCG 5JLHA 1ZXOA 5AQRA 1XQSC 4WQ5A 3AAPA 3O5BA 3CETA 4CZEA 4CJ7A 4WQ4C 1Y64A 4A2AA 4H0YB 3FE1A 5AR0A 3WXKA 4I6MB 4IJAA 1ZC6A 4IO8A 5AZJA 4H0VB 3D2EA 4BG8A 4Z94A 4WQ5C 2FSNA 4K43A 2CGKA 2FXUA 1BA0A 3GE1A 3TPQA 3I33A 3UKRA 5EY4A 3JXUA 3VERA 1TYQB 2UYTA 4YDUA 5F0XA 1BWFO 3J8AA 4FWLA 5LJWA 4E1JA 5AQHA 3H1QA 2D0PA 5AQKA 1GLFO 3VOVA 4BRDA 2P9IA 3DXKA 3LDOA 4C23A 5AFUA 3CJBA 2IIRA 4YDUC 3MN7A 2YHWA 3R9PA 3EKUA 5CE3A 3A8YA 3QICA 2I7PA 5BRDA 1MA9B 3WXJA 1QQMA 2QWMA 3GBTA 3IMXA 4PKHA 3UB5A 4H5TA 4BC2A 4IXCA 5AFUH 1K8KA 3IDHA 2FLOA 1NLVA 5BPLA 2E20A 1XUPO 3SMSA 1NMDA 2IVPA 1DGKN 3F9MA 3IFRA 1BDGA 2ZGZA 5AQOA 4BRHA 3DXMB 3L6QA 3P4IA 5E84A 2E2QA 2QWOA 3HTVA 1V4TA 2V51B 4FWSA 4GNIA 3WQUA 1NM1A 3FZFA 4MO4A 4MLEA 3CJ1A 5BPMA 2I7NA 1BOTO 4BGBA 3MK6A 1IG8A 3H3OB 4FPBA 3HBTA 2D0OA 3VF6A 3VF4A 5KQDA 4JHDA 4MO5A 3I8BA 1TUUA 2QWLA 4BRGA 4H5VA 3WQTA 1NGJA 3QBXA 4NO7A 3O6WA 3WXIA 1JCGA 3KHYA 2A40A 2E2NA 4J8FA 4BC4A 2P9SA 5EXWA 3ZEUA 5EVZA 3ZETA 3CJ7A 3D2FB 4BRKA 2YCHA 4JD2A 2OANA 5KPRA 4QS9A 1XC3A 3BEXA 4H5NA 4BQLA 1HJOA 2E1ZA 5AQVA 3VEVA 4BR4A 3O08A 5JMVA 2AP1A 1RGIA 4FPAA 3VPZA 4B1ZA 2E2OA 3H45C 1S3XA 2P9NB 1YVNA 3H3NO 3UKUA 5AQIA 2FSJA 4AM7A 4FWPA 2Q1NA 3DXMA 2A42A 2GTDA 4BR0A 4B1VA 1KAXA 4RTFD 2GWKA 5BN9A 2ZWHA 3U8XA 3D7EO 2P9UB 1J6ZA 4BRPA 4B1XB 3IUCA 1ESVA 3MCPA 3MN5A 3OHRA 4ISEA 1JCFA 1KAZA 5F2RA 3LM2A 5AQMA 4BVPA 4BRNA 1ATNA 1Z6RA 3FZHA 4BRMA 4IWVA 1BG3A 4BVOA 2AA4A 3A5LC 3U4LA 1GLLO 1YXQA 3CJAA 1NGIA 1C0FA 2VWBA 1KXPA 1QZ6A 2P9KB 4Y0WA 3W3DA 4M7YA 2QM1A 5BRFA 3TU5A 3M1FA 3ENHA 3VGKA 2F9TA 4CBWA 2ASMA 1BU6O 2FF6A 3LM9A 2YHXA 3VESA 3C7NA 4EAHD 5AZIA 4M7XA 2D1KA 4DB3A 5E26A 3HM8A 4CBXA 4GY2B 4BC5A 1DKGD 3H46O 5AQZA 3VEOA 1BO5O 3O1BA 1R59O 4O5FA 1IJJA 4EHTA 3ZX2A 1D4XA 3GOIA 3SJHA 3VETA 1X9JA 3DAWA 5ADXA 3FZKA 5KQ8A 2Q97A 3AY9A 4BRCA 1E4FT 3CHWA 2W41A 4FWNA 4A61A 2P9LA 5JLFA 2CH5A 5KPZA 5AQQA 3ATVA 1QHAA 4BG9A 5AQYA 2P9UA 3A5OC 2Q0RA 2D4WA 2QWPA 5ADXH 1H1VA 4L3QA 5AQSA 3VGLA 3H1VX 3ZX3A 3O80A 2GWJA 1U2VB 3A0IX 4MLHA 4XH1A 4I6MA 1NGDA 3CJ9A 5AQXA 4K42A 1NGGA 4H0XB 3MMVA 5BR9A 2EWSA 2P9PB 5LJVA 3MN9A 4CD1A 1WOQA 4HTLA 3CJCA 2P9KA 2YI1A 4XEIA 4FWKA 4B9QA 1GLBG 2V52B 5JICA 3HZ6A 2HF3A 3B8AX 3FR0A 4FWRA 4H0PA 4CZMA 4CI6A 4H0TB 1TYQA 4BRIA 5EOYA 1OKJA 1BA1A 2HOEA 1WUAA 4BRQA 3WT0A 5AQNA 1KAYA 3MDQA 3GL1A 3BF1A 2Q0UA 1SQKA 1T6DA 3AARA 3ID8A 3U9ZA 4ISFA 2FF3B 1LCUA 1BUPA 3FLCO 5FPNA 1MWMA 1NGFA 4JN4A 3O1WA 4PL8A 2NZTA 4BRFA 3CERA 4FL9A 1NGAA 5AZJB 1G99A 3SMPA 1S22A 4HWIA 3D2EB 3EL2A 5B8HA 3QMLA 2BUPA 4B1UB 3G25A 2E88A 4K25A 4PL7A 1Z05A 3HSCA 3L4IA 2NRHA 4ISGA 5FPDA 1YUWA 1HKGA 4BQZA 3H6EA 4M63C 2BTFA 2A5XA 2FSKA 3M6GA 1JCEA 3QBWA 3VENA 5AQTA 1GLDG 3LDLA 3CIPA 2ITMA 3AAQA 4KBOA 2P9IB 2YHYA 3DXKB 3DWLA 1E4GT 2Q2RA 4BRLA 2WUSA 4BR7A 2VYPA 3BP8A 3EZWA 4RCHA 4H03B 2GEMA 4PKIA 2PAVA 1RFQA 3RSEB 1K8KB 2HF4A 2DPNA 1T6CA 4CZKA 1MDUB 3ENOA 3ATUA 3R8EA 3KVGA 4F9OA 3WUHA 3CQXA 3VF2A 3FZLA 3D2FA 2J4RA 3M3ZA 2QXLA 3JS6A 3VEYA 2ASPA 4BR2A 3SK3A 2F9WA 2E2PA 1CZAN 4IZ9A 2HMPA 1QZ5A 3S41A 1NGCA 1SZ2A 2P9NA 3WXLA 3SLCA 4DHYA 3WEEB 3LDNA 1DEJA 3CI5A 4JHDB 2V7YA 5FPMA 3VEWA 1C0GA 1GLEG 3VEXA 2CGLA 3UE5A 1NWKA 2IVOA 2E8AA 2ZGYA 2Q31A 3BF3A 4A62A 2CH6A 4B1YB 1HPMA 5BREA 1ATRA 3LDQA 5F1XA 5BPNA 5KPTA 2P9SB 3QFPA 3EO3A 3L0QA 3ZEUB 3BUZB 5AQWA 2IVNA 3ZETB 4BR9A 5EX5A 3QDKA 4CZHA 4FWQA 4A2BA 4JAXA 4JD2B 4PKGA 2A3ZA 3FGUA 3EN9A 2W40A 3LL3A 5ELZA 2QWNA 4CZJA 3RSEA 3U9DA 4NB4A 4QS8A 4BRAA 4O8KA 2VCPA 2H3GX 1GLAG 3UKUB 5FPEA 1HKCA 5AQUA 4AM6A 1NGHA 3ULEB 3ZX0A 4FOEA 2QW9A 4K41A 3VGMA 4FWOA 4FSVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z1HA 3KKRA 2XY8A 3OBYA 3TAQA 1J5OA 4WF9L 4JNEA 1QQOA 5I9EB 3FZMA 4CK1A 3M8RA 3P31A 3VEZA 4BROA 3QNOA 3P83D 3DOKA 4EHUA 1W2BM 1TAUA 3VQ5A 4JI6K 2NLXA 2ASOA 2QXFA 4H0OA 3SAHA 1NKCA 4O5BA 4JV5K 1GLJO 1DLOA 2O8DB 2E1YA 1P8ZA 5HBMA 5AQLA 4N76A 2V7ZA 2YHBA 4OVLA 1ZBLA 3C7NB 1S5JA 4YOUA 4CIFA 4RWTA 1SL1A 4DV4K 3KIOA 5AZIB 3AVGA 1HX1A 2YJEA 1YAGA 2P9PA 1NK5A 1HLUA 4H5RA 2GELA 2OTJN 3NGYA 1ATSA 2OPQA 1C0UA 4BDYA 4DSJA 4XIUA 1TAQA 1ZBSA 3CQ8A 1NGEA 2RHKA 4IG3A 3SQ1A 3QB0A 1U6ZA 1LOTB 3O4WA 1VQLN 1VQNN 1S9EA 1X3NA 3CQYA 4XH5A 1FK9A 3D6RA 4CD3A 5AQGA 1RCHA 5KRTA 4GV3A 4FXDA 5JLHA 1ZXOA 5GIOA 3K5LA 4GMJB 4KI4A 4WQ5A 3AAPA 3AVNA 3J80O 3SUQA 4FVUA 4CZEA 1DTTA 3AO5A 2F96A 2FBXA 3FE1A 2B4JA 5AR0A 5FRMA 2G8WA 1LWEA 4KHNA 3AA4A 4IO8A 2E6MA 4MDAA 2F7TA 3K0SA 2PZSA 4BG8A 4Z94A 3KJVA 3ZSQA 2FXUA 1RTIA 4YOYA 2KLAA 3ZSWA 4I9QA 4Z4FA 3UKRA 2DY4A 3CCVN 3JXUA 1QQCA 3VERA 2I5JA 4YDUA 3K59A 3ZT0A 4NCAA 1DTQA 3O9SA 3WNFA 3J8AA 4LY7A 4IFEA 5LJWA 1RTJA 3DOLA 1BIUA 3VOVA 1RT4A 4L8RB 1Q9XA 5FLXO 3V9WA 4DSLA 1VSLA 5AFUA 1CZBA 4OGCA 2WFBA 2IIRA 5CE3A 2IS3A 3OS2A 3LDSA 3BZCA 1TV6A 3GBTA 2Y1IA 3UB5A 2Q3SA 4H5TA 1HQUA 4IXCA 2O8EA 2FLOA 5LL6Z 2F4VK 2HW3A 4JI4K 1L5UA 1XNQK 4UY8O 1WSIA 4CFAA 4BRHA 3DXMB 3P4IA 5C2FA 2E2QA 3DLBA 4GNIA 3NVKA 3L2RA 1KVCA 1NM1A 4MO4A 3WNHA 3OYCA 4IKFA 1SS6A 2NRWA 5BPMA 1IG8A 1YHQN 5C2DA 4EZ9A 5CR4A 1JXBA 3I8BA 4K8XA 3G0ZA 3OYFA 3S9HA 3ISNC 3QBXA 2E2NA 2OA8A 1QSYA 4BC4A 2P9SA 3F5TA 3ZEUA 1DT9A 4YOWA 3CCQN 1R0AA 3U6FA 1S1VA 4B9VA 4B3RK 2E1ZA 3VEVA 1VQ5N 1GOCA 1XWLA 4Z4CA 3TWHA 1T03A 2QA4N 1ZBIA 1VSJA 1T8EA 1RT5A 2JGUA 2NRXA 5AQIA 3K5MA 4JS5A 4DSIA 2OPPA 3KK7A 2WOMA 4AM7A 4DSEA 1XC9A 4IOCL 1TK5A 2A42A 2GTDA 3KLIA 4F3TA 2UXBK 4KH4A 3OYHA 3IKMA 3LZIA 1KAXA 5TKWA 4RTFD 2GWKA 5BN9A 2HBLA 4YOXA 4B1XB 3C6AA 3QEXA 2VWKA 3PSFA 1WBDA 4M3RA 1ATNA 3MX2A 3FZHA 4BRMA 1CXQA 4KFBA 2AA4A 3PIPL 1D9DA 1GLLO 5KGXA 1YXQA 3CJAA 1NGIA 2A1SA 4O4GA 2VWBA 2P9KB 3NCIA 3E01A 4M7YA 4DTXA 2QM1A 4CFDA 4KB0A 4FJ5A 3O3FA 3VGKA 4HCBA 4E1NA 4DV2K 2ASMA 2FF6A 3LM9A 3VESA 1FW6A 1NJXA 3NBPA 4LH5A 4B08A 3KWIA 3ZSOA 2D1KA 5FRNA 1YIJN 4GY2B 4IEEA 4OPKA 3AVBA 4IG0A 2GBZA 2DFEA 1X9JA 3P38A 2O8CA 4Z4GA 5KQ8A 1Q86O 4BE7B 1WB9A 4AHUA 4BECA 4DF8A 5AQYA 2KKZA 3A5OC 1RT3A 2D4WA 3J7YP 2D5RA 5AQSA 1RTHA 3H1VX 3ZX3A 4FM1A 3CJ9A 5AQXA 4YOTA 3SUPA 2ZD1A 1VRUA 5LJVA 4E7LA 1G15A 4CD1A 3NGZA 3TARA 3AO2A 4DF4A 1WSEA 3AO3A 4DQIA 4FZZA 4KHQA 4KO0A 1EX4A 1KVAA 4CZMA 3HVRA 4H0TB 3U3YA 3NH0A 3G10A 5EOYA 2LSNA 4DTUA 3DLKA 1OH6A 4BRQA 1QTMA 5AQNA 1IBKK 3MDQA 3GL1A 3T69A 3CFPA 1SQKA 3AARA 1U47A 1HPZA 4DMNA 3CPWM 1BUPA 5FPNA 4CK3A 1CZ9A 4OPAA 4IEIA 2NZTA 3IS9A 4BRFA 1GOAA 1SL2A 4IFYA 4KRFA 4E3SA 1Z25A 3AA3A 4FL9A 4OLBA 5AZJB 2KW4A 4X64K 1S22A 1WAJA 2XO7A 2A1RA 4A59A 5B8HA 3QMLA 4FW2A 3G25A 3HT3A 2NRHA 4ISGA 1YUWA 4JK7A 1BI4B 4M63C 2BTFA 4W5QA 3CC7N 1LWCA 3M6GA 1JCEA 3VENA 1VHXA 4FJXA 5AQTA 3RMDA 1N34K 2OZMA 4CF0A 4JI2K 1VQ6N 3AAQA 2YV0X 2WBNA 2P9IB 2YHYA 1NG9A 3DWLA 3NF6A 4B9UA 1KLMA 1E4GT 1RT6A 4FZYA 3KLFA 1IO2A 5EU7A 3AVFA 3V9XA 4Y1CA 1I39A 1K8KB 2HF4A 2VWJA 1YJ9N 1N32K 1T6CA 1RDUA 4DR3K 3AA5X 4DLEA 3ATUA 1J9AA 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 3MXJ A;  2O8B A;  1NK7 A;  4B9S A;  3QIO A;  2G8V A;  3NF7 A;  1VAZ A;  1HR0 K;  4CW7 B;  4B3T K;  4AHS A;  1HYZ A;  4H4O A;  3BP8 A;  3EZW A;  4H03 B;  3ZT4 A;  3RSE B;  3OYI A;  2DPN A;  1QHT A;  3F73 A;  1MDU B;  4E0D A;  3KVG A;  4F9O A;  5J2M A;  3E9O A;  3D2F A;  4CGI A;  1VQP N;  2QXL A;  2ASP A;  4BR2 A;  3SK3 A;  2BE2 A;  2F9W A;  4EP4 A;  2VG5 A;  4DV5 K;  2W42 A;  2E2P A;  4IZ9 A;  1JL1 A;  3LWM A;  1HYS A;  2P9N A;  3SLC A;  1KFD A;  3WEE B;  1GOB A;  2C1I A;  1JLB A;  4JHD B;  4BAC A;  4AHV A;  5D3G A;  1C0G A;  3VEX A;  3SPY A;  2X78 A;  4OKK A;  2CGL A;  4V19 S;  3RMB A;  3AGR A;  4JKG B;  4I9L A;  3CCL N;  4AH9 A;  3LAM A;  4JYA K;  4BE2 A;  2RPI A;  1WLJ A;  4DKW A;  5KPT A;  4DLG A;  3QER A;  3ZET B;  1OH7 A;  3QDK A;  2BGG A;  4JAX A;  4JD2 B;  1K73 O;  4DSK A;  1RDD A;  4ILH A;  1NKB A;  3SUN A;  3NH1 A;  2ATQ A;  3U9D A;  4NB4 A;  4PY5 A;  4QS8 A;  1JLQ A;  3LP1 A;  3M8S A;  4AM6 A;  4M3Y A;  5SZT A;  4FOE A;  4EZ6 A;  4K41 A;  4FSV A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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