2GWKA

Spvb adp-ribosylated actin: orthorhombic crystal form
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
371
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title A steric antagonism of actin polymerization by a salmonella virulence protein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
total genus 119
structure length 361
sequence length 371
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2gwkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2gwkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2gwkA04
4FSVA 4CZLA 2BTFA 1X3NA 2ZF5O 4FPBA 4BRHA 5CE3A 4K42A 2P9LB 1GLCG 4XH4A 3UKUA 3AARA 4FO0A 3EO3A 3HZ6A 3MN9A 3RSEB 1HLUA 2Q97A 4B1WB 5FPEA 3CJ1A 1MA9B 1ESVA 3WQUA 3QICA 4CZMA 3ATVA 2J4RA 3OHRA 1ATSA 1DGKN 1X9JA 4CD1A 5AQNA 3O4WA 3L6QA 4O5FA 5EVZA 3JS6A 4BVPA 2A5XA 1E4GT 2YHWA 2PAVA 1RDWX 3U9DA 1IG8A 1P8ZA 4H0XB 1RFQA 1ZC6A 4BQLA 3LDOA 3CQXA 4H03B 3VGMA 2FSNA 4PKGA 3VENA 3L0QA 4B1UB 1U6ZA 4KBOA 3HI0A 3D2FA 3ULEA 3VERA 3BF1A 3H46O 3R8EA 3UKRB 1JCFA 5AFUH 2YJEA 1IJJA 3DAWA 3O08A 5BN8A 2P9UA 2NRHA 2QWOA 5AQZA 2FF6A 2YHYA 3H45C 3IUCA 2Q31A 2E2NA 2I7PA 5AQOA 4BGBA 4ISFA 4B9QA 3M1FA 3O1WA 4M7XA 3C7NB 5KPTA 3QFPA 5ADXH 2A41A 1WUAA 3H3NO 3IFRA 5BN9A 4BG9A 3GL1A 1GLBG 2E8AA 4BRFA 3GDQA 4RCHA 3HTVA 3WXIA 2NZTA 1U2VB 4EFHA 2QWLA 5JLFA 2Q36A 2P9KA 1K8KB 1YAGA 5EX5A 1QQNA 2QWMA 4BRMA 4CI6A 4CZGA 4WQ5C 3O6WA 2CGLA 3A5MC 3SLCA 3VF4A 2CH6A 1D4XA 4CZJA 4BC2A 5AQSA 4BRNA 1SZ2A 1Q18A 2V51B 3P4IA 2YHXA 4EHTA 3CQYA 3EKUA 1T6CA 3O8MA 4BRGA 5AQTA 4HTLA 1HKBA 3D2EB 2P9NB 4FWMA 1C0GA 5KQDA 3W0LA 3KHYA 4IXCA 1DEJA 5AR0A 3WXJA 4CD3A 1YXQA 5JMVA 2D0OA 4H0VB 1NGAA 3MMVA 1NLVA 4HWIA 1JCEA 2QW9A 3VEZA 4BR2A 3LDLA 4B1YB 2DPNA 3DXMA 2V52B 5AQPA 4BC3A 2V7ZA 2FF3B 1X3MA 3DXKA 3FZHA 3GOIA 5AQUA 2P9SB 5LJVA 3LDNA 4A2AA 1HX1A 3SK3A 3FFKB 3JXUA 4H0PA 5AZIB 3CJBA 4H0YB 3HBTA 1HPMA 2P9PB 3TU5A 2F9WA 1E4FT 1Z6RA 2HF3A 3B8AX 1NGFA 3ENHA 4FL9A 4H5RA 5FPNA 3H3OB 3GG4A 4FWKA 1HJOA 1QQMA 3A5NC 3UKUB 4RTFD 4CZFA 2QWQA 1S22A 2WUSA 5I9EB 3DJCA 4K25A 1XUPO 4MLEA 4IWVA 3FLCO 1NGBA 1LCUA 1NGDA 4WQ4C 5AQYA 2ASPA 4A61A 4PL7A 1QZ5A 4B1ZA 3WEEA 1LOTB 1SAZA 2AP1A 3DWLA 4BRIA 4BR7A 2D4WA 4A2BA 2OANA 2E1YA 5F2RA 4CBUA 2CGJA 1HKCA 4NO7A 3VESA 1H1VA 5BRHA 3LM2A 4GY2B 1HUXA 3VEOA 3M3ZA 4H0TB 4CJ7A 4B1XB 3EZWA 3D2FB 3CJCA 1BU6O 4JHDA 1XQSC 3ULEB 4BROA 5AFUA 3CERA 3KZBA 4BR4A 2E20A 2E88A 5FPMA 5AQKA 4MO4A 2P9UB 4FWSA 3VEYA 4M7YA 3GE1A 3FR0A 3VETA 1R59O 4BQZA 1BUPA 3CJAA 1BWFO 5BPLA 3I8BA 3ZETA 3IDHA 4MLHA 2FXUA 2QWNA 4BRQA 4YDUA 1WOQA 1BA0A 2HOEA 3WT0A 1GLJO 2P9KB 4I6MA 5BRFA 4BRPA 3R9PA 2YI1A 1KAXA 1MWKA 1GLAG 4XH5A 2IVOA 3FZKA 1CZAN 2QWPA 2Q0UA 2P9IA 1GLFO 3U8XA 3VEWA 3VOVA 2IIRA 2YJFA 3VEXA 3FGUA 2GTDA 4H5WA 4CBWA 1NGJA 1J6ZA 1V4SA 5E26A 4L3QA 1NGIA 2A42A 4B1VA 3ZX3A 4FWPA 3LDPA 4CBXA 4BR9A 5AQWA 4JNEA 4FWLA 1TUYA 3VGKA 3WQTA 2GELA 3DXKB 3U9ZA 3SMPA 3H1VX 4MO5A 4FOEA 1KXPA 1BO5O 4PL8A 1XC3A 1OKJA 1YUWA 4IJAA 5LJWA 2ZWHA 3F9MA 1ZBSA 1NGHA 4PKIA 4NB4A 1BG3A 2CH5A 2KHOA 4FOIA 2Q1NA 3BEXA 4RWTA 1MDUB 3IMXA 3A5LC 5BREA 2FSJA 1NM1A 4QS9A 3G25A 1YVNA 2E2OA 2FLOA 5KPRA 3VGLA 4C23A 2Q0RA 3MCPA 3QBXA 3H1QA 2EWSA 1HKGA 4BVOA 3ZX0A 4FWQA 4BC5A 3QDKA 3WXKA 1EQYA 2H3GX 5AQIA 2ITMA 4JD2A 3QB0A 3WEEB 3SJHA 4BR0A 3O1BA 3FZMA 4JN4A 4F9OA 4DCHA 4J8FA 3I33A 5AZJA 3J8AA 2Q2RA 1T44A 3BF3A 2D1KA 1RGIA 3HM8A 1ATRA 4FWNA 3AY9A 5KPZA 1TYQA 4JHDB 1V4TA 4AM7A 1KAZA 2VWBA 2IVNA 1GLDG 3CJ7A 1S3XA 2GUPA 3D7EO 4YDUC 1Y64A 1BOTO 4XEIA 2E1ZA 4BR5A 2W41A 3MN7A 5BPMA 1TUUA 2E2PA 3ZEUA 1QQOA 4FWOA 3VPZA 3A8YA 3GBTA 4BG8A 5BPNA 4LC9B 5E84A 3O80A 3LL3A 5JICA 3ZETB 2HMPA 5F0XA 4JAXA 2ZGZA 5AQJA 2P9LA 4O8KA 5EY4A 1Z05A 3MN5A 3RSEA 5ADXA 4I6MB 3VF6A 3L4IA 4FPAA 3M6GA 5AQGA 3H6EA 5BR9A 3ATUA 5BRDA 1QHAA 2P9IB 1GLLO 3ZX2A 4WQ4A 4IO8A 2QXLA 2W40A 2VCPA 4EIAA 3CI5A 1T6DA 2FSKA 4CZHA 2ASMA 4E1JA 3CETA 3EN9A 5AQLA 3AAQA 5ELZA 4BRCA 4Y0WA 2F9TA 3MDQA 1KAYA 5KQ8A 2A40A 2D0PA 5TKYA 3FE1A 3CIPA 3CJ9A 4H5NA 4BRDA 2ASOA 1BA1A 4K43A 2NLXA 3KVGA 4DQ8A 2GWKA 3QMLA 3EL2A 4H5TA 4AM6A 3UKRA 4ISGA 2E2QA 5AQHA 1ATNA 5B8HA 4WYBA 2VYPA 3TPQA 1QZ6A 3U4LA 4BRKA 3S41A 4QS8A 5AQMA 2UYTA 1NBWA 2HF4A 3A5OC 4BC4A 1ZXOA 1NMDA 2QWRA 3DXMB 3C7NA 4ISEA 2I7NA 3FZLA 4A62A 4IJNA 3W3DA 3VF2A 2QM1A 2IVPA 2BUPA 2A6AA 1MWMA 3R6MA 5JLHA 3CHWA 4Z94A 1NGCA 4K41A 1BDGA 4BREA 5FPDA 1U2VA 2CGKA 4EAHD 1K8KA 5AQQA 5AQXA 4CZKA 3O5BA 3UB5A 3LDQA 3ID8A 4DHYA 4IZ9A 3A0IX 4FWRA 4H5VA 5AQRA 3ENOA 3C0BA 5F1XA 4CZIA 3SMSA 4JD2B 4PKHA 4BRAA 3AAPA 3MK6A 4BRLA 3QFUA 3D2EA 2P9NA 3MN6A 5LY3A 1NGGA 3HSCA 3EKSA 3BP8A 1SQKA 3WUHA 5AZJB 4DB3A 4WQ5A 2ZGYA 1NGEA 3UE5A 2A3ZA 2PBDA 5EOYA 4QS7A 4CZEA 4H0OA 3BUZB 1TYQB 4EHUA 1G99A 2AA4A 4XH1A 4M63C 5EXWA 1GLEG 2P9SA 3LM9A 4GNIA 5AQFA 5AQVA 5AZIA 3WXLA 1C0FA 2GEMA 3VEVA 1JCGA 3ZEUB 4BGAA 3QBWA 2P9PA 2YCHA 1NWKA 3FZFA 2V7YA 1DKGD 2GWJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FSVA 2BTFA 1HQUA 1X3NA 4I2QA 3PY8A 1DT9A 4DTUA 4N76A 4BRHA 4DSEA 2JGUA 5CE3A 4K42A 2FBXA 3MN9A 3HZ6A 3RSEB 2Y1IA 2Q97A 2ATQA 3LWMA 1ESVA 3L2UA 5D3GA 3ATVA 3R1XA 3AO5A 3OY9A 3QNNA 1NKCA 4CD1A 5C0YA 3L6QA 1D5AA 4O5FA 1RBTA 1VQKN 2YHWA 1ZBFA 2PAVA 1JLQA 1LWCA 3MEGA 1FKOA 2FBYA 2KZMA 1GOCA 3AA5X 3LDOA 3RVCA 3VENA 3ZSVA 3T1YK 4JI4K 3L0QA 4JKCA 1U6ZA 3NF8A 3D2FA 2VG5A 3BF1A 3H46O 3R8EA 3UKRB 3ZYYX 1TVRA 1BCOA 3O08A 2NRHA 1SUQA 3I55N 4DTSA 5CHIA 2I7PA 4BGBA 4YOXA 3M1FA 3O1WA 4M7XA 1OH7A 5KPTA 4Z4EA 3QFPA 1K73O 3S3MA 3CFPA 1GLBG 3GDQA 4DLGA 2HHHK 2QKBA 2NZTA 1U2VB 5FRNA 4EFHA 4OKKA 4YFUA 1BQNA 2Q36A 4JKDA 5EX5A 2UUAK 4BRMA 4O4GA 3A5MC 5LMNK 4IKFA 4Q0BA 1D4XA 4CZJA 4F3OA 5AQSA 4BRNA 3OYFA 3P4IA 3R3LA 5C12A 1YJWN 2YHXA 4EHTA 3CQYA 1T6CA 4BRGA 5AQTA 3KLHA 1HQEA 4HTLA 4FJNA 3D2EB 1KVBA 4LF8K 4BE2A 3WXJA 4CFDA 3TAQA 4HWIA 4DR3K 1OH5A 1JCEA 2QW9A 1U04A 4BR2A 3SQ0A 2V52B 3DLHA 1JLBA 5AQPA 4HUGA 1Q81O 1J5EK 4CFAA 2FF3B 1NOYA 3SK3A 2PZSA 4B3OA 4FW1A 3CJBA 4KRFA 3E01A 3TU5A 1X1PA 2F9WA 2IDOA 5CR4A 1L3TA 3VQBA 5GAHP 1NGFA 2XHBA 3H3OB 3F2KA 1VSHA 1TKTA 1JLCA 4E7JA 3A5NC 5FROA 3MWTA 3THYB 1TKDA 1XHXA 4DS5A 1NGBA 4JI0K 1C6VA 4WQ4C 3TAMA 3PX4A 4DFKA 2G8KA 3WEEA 3HL8A 2O8BA 3DWLA 4BRIA 4F2RA 5KRTA 4FM1A 1ASVA 1RT3A 5F2RA 4CBUA 2O4IA 2HB5A 3AVLA 4ILJA 4F3TA 3QERA 3E9PA 4NO7A 4E1MA 5BRHA 1T7PA 4GY2B 1JL2A 3M3ZA 4H0TB 4FJ8A 5CZ2A 3CJCA 4JHDA 4BROA 3QETA 4DV4K 5BR8K 3CERA 3KZBA 3K5LA 4DTNA 2E88A 3TI0A 1XMQK 4NYNA 2VG6A 3ZSXA 1S1VA 4W5RA 1R59O 1VQPN 1BUPA 1UA0A 3CJAA 5EU7A 4JI1K 3U3YA 2FC0A 1HJRA 3I8BA 4MLHA 2FXUA 1X9SA 1N36K 4YDUA 1QSYA 1EWRA 3KD1E 1BA0A 1IH7A 3CCVN 4LF5K 2P9KB 3E66A 5BRFA 4DR6K 2QK9A 3R9PA 3T1HK 1WSJA 2YI1A 4CJFA 1MWKA 4XH5A 2IVOA 1NK9A 1CZAN 3C95A 1TK8A 3VEWA 3U8XA 3VOVA 3OS2A 3SBTA 4CGHA 5TKWA 4DTMA 1KLNA 1EO1A 2RPIA 4JEPA 4CFCA 3AVAA 2HHXA 2F96A 4X64K 2UUBK 3V6DA 4CERA 3T1AA 2EX3A 1RBVA 1WSIA 4FWPA 3O3HA 1N8RO 3DYAA 1BISA 4E0DA 3CCRN 4OLBA 1A5XA 4DFJA 5M1FA 1XWLA 1LAWA 3SMPA 4FOEA 1LWEA 1YI2N 4U67L 4IOCL 1XC3A 1OKJA 1YUWA 1NK5A 5J1EA 3O3FA 4JKBA 3LANA 4DFMA 2HHVA 3H08A 1LAVA 2OA8A 4PKIA 2KHOA 1VSEA 3HVTA 1YTAA 3BEXA 3D0PA 3A5LC 3LP2A 2NRXA 3MX2A 2D0AA 4N47A 1YVNA 2E2OA 2BE2A 4HTUA 3MCPA 1N6QA 4BVOA 1S1TA 3QDKA 3VTIA 3ZSWA 1EQYA 2Q3SA 2ITMA 2HHQA 2ITGA 4JD2A 3TABA 3QB0A 3SJHA 4ID1A 4W5OA 4L8RB 1Q8IA 3KTQA 2P5OA 4F9OA 4B3RK 4DCHA 4FK0A 1ZYQA 3DLKA 4DV6K 3CCSN 4E19A 1UA1A 2OPQA 3V1QA 5KPZA 1YJ9N 4DMNA 4AM7A 1KAZA 2VWBA 4DR4K 3CJ7A 1N34K 1BOTO 1T3VA 5T7BA 4BR5A 4IFVA 3MN7A 5BPMA 4B9LA 3CG7A 4KB0A 4EP5A 1VQ4N 5E84A 5JICA 3ZETB 5F0XA 3S5TA 1NU0A 3VQDA 3HVRA 2C1IA 1XNQK 4O8KA 1Z05A 1EXQA 3L4IA 4FPAA 1BI4B 3OYLA 3N4PA 2IC3A 3NH2A 4B9UA 4DV3K 3ZX2A 4CJ3A 1RTHA 1NKBA 2G8FA 4FLZA 1L5UA 4CZHA 4E1JA 2X6NA 5AQLA 3AAQA 1ZBLA 4BRCA 4Y0WA 5KQ8A 2A40A 1I39A 1VAZA 3OBWA 2D0PA 4H8KA 1LV5A 1QS4A 2HBKA 3I56N 3CIPA 5KGWA 3P31A 5C15A 1HMVA 3LAMA 2P5GA 1BA1A 4K43A 3EL2A 2E2QA 2O8CA 4RW9A 4LF7K 3D45A 3HK2A 4X66K 3NF9A 4QS8A 4BY9C 4LF6K 3HPGA 1IBLK 3T19A 4QCLA 4OGCA 1NK6A 5C2DA 2IVPA 4CJ5A 2A6AA 3HP9A 4HUEA 2G8UA 3CHWA 4XJXA 4FK2A 1BDGA 4BREA 3SJJA 4B8CA 3LP0A 4IFYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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