2H1DA

Resa ph 9.25
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
136
structure length
136
Chain Sequence
SDAPNFVLEDTNGKRIELSDLKGKGVFLNFWGTWCEPCKKEFPYMANQYKHFKSQGVEIVAVNVGESKIAVHNFMKSYGVNFPVVLDTDRQVLDAYDVSPLPTTFLINPEGKVVKVVTGTMTESMIHDYMNLIKPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular Basis for Specificity of the Extracytoplasmic Thioredoxin ResA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol-disulfide oxidoreductase resA
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 40
structure length 136
sequence length 136
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h1dA00
5H5RA 9GSSA 1XWBA 3IC4A 2KP2A 1VGLA 3C8EA 4ZIJA 4Z7XA 1B8XA 4F2IA 3CXGA 1PL2A 4K9ZA 5FWGA 4TR3A 4WR5A 4MJCA 4KE3A 4DSQA 1EP8A 3L0HA 4EO3A 3MDKA 2G0FA 5CRWA 2H0HA 3G7YA 1THOA 1H75A 4WBRD 2H72A 1Z6MA 2PWJA 3VPQA 1GTUA 2IMEA 4GF0A 5G1KA 4N0ZA 3GL3A 1RK4A 1OE8A 1NM3A 4J56E 1MEKA 3UL3A 5KN2A 4MLYA 3EWLA 4OCFA 3HVSA 4IJIA 4KA0A 2JSZA 5HFGA 4GRFA 4Q5NA 2HYXA 2P0GA 4XRDA 2V6KA 2NBSA 3ERFA 4N30A 2AYTA 4JZQA 2DLXA 1M9AA 4TR0A 1O6JA 5DDLA 1JLVA 5ID2B 3QPMA 3LJRA 2IPAA 4BWSA 1BYEA 4MH2A 3W6GA 3FW2A 5ECIB 1J9BA 1ZL9A 3DXBA 1M2DA 1SK2A 4NV5A 1VF2A 1M9BA 1G7EA 2BMXA 2QSIA 4MJEA 3TKSE 2CAQA 1DE1A 3U5RE 2KUCA 5ECNB 3Q19A 2H1BA 3TKRA 1FG4A 4YH2A 1HNCA 5F8BA 1GTIA 1XWKA 4ZL8A 3GH9A 1KBNA 4PXOA 3W8JA 2GVPA 4FYCA 4HDEA 1V57A 4O5RA 3EURA 4MZCA 1JZOA 2H19A 5DALA 4KH7A 4POLA 2C8UA 5F07A 1YF0A 1T8EB 4WEYA 2X8GA 1HD2A 1FOVA 1ZYQB 2YPMA 4F03A 2H1AA 3TB2A 1V40A 3H4KA 2M46A 5IQYA 4V2LA 1WE0A 4ZBAA 2GZPA 1YEXA 1U88A 3RAZA 3KD0A 1SKRB 2QKEA 3CMIA 2K18A 3CRUA 2OE0A 4BWQA 4YAVA 3P7XA 4NMUA 2FGXA 1R7HA 1U3AA 1WWJA 1EGOA 2B7KA 1OKTA 1U87A 4MJBA 2QC7A 3HJPA 2DC5A 4OWYA 2R37A 1F6MC 1U6TA 2CA8A 5JCUA 1XW6A 4FH8A 2EIQA 4XCSA 5KN1A 4DEJA 8GSSA 2GLRA 5DBQA 4IW9A 4TR1A 2BJXA 2GQKA 1VRSD 2FD3A 1TRSA 3P8WA 1A2LA 2YV9A 1I9DA 4IQAA 1Z7PA 3IK7A 2LUSA 3D5JA 4PX1A 1MTCA 4IQ1A 1FHEA 4CW9A 4X0XA 3UBLA 2FA4A 3KP8A 4GSNA 5CREA 4YQUA 1GSYA 1Y25A 2CZ3A 4QQ7A 1XOAA 2DMMA 3IBHA 3UBKA 2DJ3A 3DVXA 3H1NA 2H71A 5B6MA 1PN9A 5GAPD 3PR8A 2OBKA 3GURA 2IMIA 4O32A 1BJXA 4AJ7A 3D4MA 1T00A 1FB6A 4GTUA 1LBKA 2V32A 3BJ5A 2BTOT 5IMZA 1OYJA 4FYBA 1GTBA 5D9TA 5B8AA 4EF0A 2TIRA 3TJBA 2O87A 1K0MA 2VCQA 5LD0A 2C3NA 2B5YA 4OFTA 1LJRA 3IV4A 4KAEA 2LTKA 1SYXA 2VLTA 1FB0A 4LL4B 3TJFA 4MMMA 2GT5A 5ECHB 4NWYA 5IM9A 2VIMA 2C1YA 2M72A 2H73A 3QR6A 1TU8A 4J2FA 4ISDA 5KEJA 4GSTA 1B4QA 2A2RA 3RPPA 3UMAA 1XW5A 3LGCA 4F0CA 2J23A 1XVQA 3KM6A 2O85A 2OADA 2JZTA 3M9JA 1IYIA 5D93A 4JEDA 4IELA 2C0FA 3ZLPA 2XBIA 2KOKA 3DRNA 1R26A 2H01A 3QD9A 4KGIA 5CNWA 5H5QA 3K8NA 3M1GA 1GUKA 2H0GA 1A0RP 5IMAA 4OO4A 3ME8A 3TKQA 5DQYA 3UAPA 2PMTA 5KN3A 1RQMA 2LRTA 5GSSA 2FHEA 3KMOA 4KNDA 2VOCA 6GSXA 5ECQB 1SJZA 1X9SB 2HLSA 1ZOFA 4BVYA 3E3EA 5FHIA 3MAKA 4HZ2A 4I2TA 2VCXA 4EVMA 3I9V2 2VCVA 3M3MA 3HA9A 5JCGA 17GSA 2K9FA 1OAZA 1SYRA 1SKSB 5E59A 2PVOC 1XBSA 2LJAA 1EWXA 1HNAA 3IHQA 2LNTA 4I5QA 4AJ6A 1KEBA 3TDGA 1GSEA 3IK9A 1Z7RA 2E2GA 5AIVA 1C72A 1TU7A 3M0FA 2C4JA 3VWXA 1OC3A 1PX6A 2VCWA 1SJ6A 2WGRA 2LSTA 3SWLA 1EEMA 1K0BA 5DAKB 5HR2A 1FW1A 1YEPA 1GNEA 2IN3A 1KTEA 3N9JA 3KZQA 1TXXA 4DVCA 3TRXA 3UEMA 3HYPA 2FUG2 3PGTA 1GLQA 5D9XA 1XWCA 4F9ZA 2F9SA 1BAYA 2YZUA 1V58A 1O81A 1B9YC 3TUEA 3A2VA 2L57A 3TJJA 4RUVA 2P31A 1ZZYA 2NTOA 2HZFA 3D6IA 5IO2A 2YJHA 3GA4A 4HUAA 2H74A 3ME7A 1EOGA 6GSSA 2PBJA 2OE3A 5EVOA 3D21A 4F82A 1TOFA 4MZWA 3KXOA 2YWMA 1O73A 4LLRA 6GSVA 2NPBA 2OBIA 4G2EA 2CQ9A 2YWIA 3WYWA 4WF4A 3WGDA 1PSQA 2P5RA 1WJKA 3P2AA 4PNGA 5IOXA 3FR9A 3CTFA 4HU9A 3L9SA 3LQ7A 4JE1A 4G9HA 4FYUA 3Q74A 1X0RA 1GUHA 4XS6A 1NSWA 4TR4A 4WETA 6GSYA 1HQOA 5IMCA 3ZITA 1XW9A 1GSDA 3WT2A 2F8AA 2VL2C 1BG5A 1ERVA 4OD7A 3LXTA 1XWGA 1GULA 4G19A 2B1KA 5DCHA 3GKKA 5ECPB 4ECIA 2C3TA 1K3YA 4KB3A 1VF3A 1TJDA 2CX4A 2IIYA 4TVEA 5D9VA 2LQOA 1K3LA 2NVLA 4L5OA 5IPHA 3A2XA 1W89A 3F4SA 4MP4A 3TOTA 4NAXA 1M7TA 2L6CA 1WPIA 2IJYA 5DJMA 3KP9A 4BVXA 4RQRA 3CBUA 1MDKA 3AY8A 1UN2A 3TCOA 2DMLA 2DSAA 5IO0A 3GSTA 1K3OA 4RI7A 1EP7A 2GZYA 5DAKA 4FO5A 1A8LA 2X99A 1GUMA 1ZCPA 3ZMKA 1E2YA 1OC9B 3FZ5A 2C0GA 2PUKC 5COHA 1WRYA 3EMXA 3VPTA 2GQMA 5A5KA 5GSTA 5HR1A 4KSMA 2A4VA 1NHYA 2B3SA 2O7KA 2YCDA 3TKSA 3KTBA 1GNWA 3IXRA 4KDXA 3IRAA 1ILOA 1J0FA 5IMVA 1OE7A 1MDJA 3L9VA 2LRCA 2X8HA 3Q6OA 3WD6A 2H75A 1PA3A 3KEBA 1TKDB 3EU4A 2V41A 5ECSA 3VI5A 3HCZA 1TI3A 2IMKA 3ZIJA 3C1RA 4V1Ag 1ON4A 3IA1A 1YDKA 3N5OA 3HVXA 18GSA 4EC0A 4CHSA 4HQZA 4NHZA 4ECBA 2YWNA 2LNSA 2FWFA 2WZ9A 4K7OA 4IS0A 1W4VA 3CTGA 5B7CA 3VWUA 20GSA 2JADA 4MF6A 1WIKA 3CRTA 4GWRA 5A4VA 4KW6A 1QUWA 3W8SA 5D73A 4N11A 2GSQA 2IMFA 1M2BA 4ECCA 2C80A 13GSA 3BCIA 3UVHA 4ZB8A 5AGYA 3DEXA 1A0FA 2H30A 1V98A 2FCHA 4I2UA 1OKDA 3TJGA 1A2JA 3IPZA 5DJLA 3FZAA 4MCUA 4MH3A 2EC4A 1Z3EA 3J7Yk 4Q5QA 2B7JA 2ON5A 3E9JB 5LNKe 2VCZA 1GRXA 2HT9A 2WDUA 4GXZA 4OO5A 4HQSA 2ON7A 1QQ2A 2H70A 1WMJA 3TRQA 1PGTA 3TGZA 2ES7A 3LG6A 4PURA 4XRAA 1GSSA 3O3TA 2N5AA 1XIYA 10GSA 2O89A 5AIXA 2OACA 4K6XA 5IOWA 3I6AA 1K0NA 3UVTA 1J08A 4JU5A 2H1DA 3HKRA 1TDIA 2L5LA 2OKAA 3KH7A 3ED3A 3GL5A 3ZZXA 5HFKA 5ID2A 22GSA 3FKFA 1SKWB 1TK8B 1OC9A 3RDWA 1RW1A 2CZ2A 2J9HA 4KDYA 1A8YA 2V2GA 3L9UA 2IFQB 7GSSA 4OFNA 1K0DA 4QL7A 2QGVA 1U3IA 4WF5A 5CAXA 1GTAA 1XXUA 2FWHA 1ZGNA 3VWVA 1TTZA 2TRXA 4K7NA 2PPTA 3KIJA 2GSRA 3D4TA 1XOBA 2JU5A 2YNXA 5G1LA 5J4UA 2KLXA 1AAZA 2DJ1A 3C7MA 2FWEA 1K0AA 3CYNA 3GKXA 3ZIVA 2IL3A 4TRXA 2VUPA 2MYGA 3EC3A 1TK5B 4TXOB 1PKZA 1PX7A 2RLIA 1A24A 2HZEB 4NPBA 4BPYA 1K0OA 4MK3A 4ZB9A 2R4VA 2CVBA 3VURA 1S3DA 4KCEA 1EV9A 2GQLA 5JWOB 1UVZA 2A2SA 1AIUA 1ZYEA 3F4TA 3MSZA 4ML6A 4MPGA 3EU3A 4NXIA 1ERUA 1X5DA 2XHFA 16GSA 2X8CA 3O76A 2FA8A 2PERA 4PQHA 3APSA 3RHBA 2H6ZA 2YP6A 4XS1A 1TRWA 5D8IA 2GDRA 3UOMA 2GSTA 2JZSA 2VO4A 3F9UA 1QGVA 1EOHA 5CO3A 4OCEA 2JL4A 3HJOA 4JBBA 4XS4B 1MD3A 3TJKA 3I69A 3RPNA 4J57E 5B6NA 1G6WA 3FZ9A 3FZ4A 3ZFLA 3QAVA 1T4ZA 1SL2B 5JWRB 3VI7A 4Q5RA 1R4WA 5ECRB 3CSIA 5ECLB 3MWHA 2V1MA 14GSA 3A2WA 1Q4JA 4EDYA 2YWOA 2EIRA 2N5BA 1XPVA 5J41A 3J7Yb 3F8UA 2I3YA 4MDCA 3C73A 3MNGA 1V2AA 2CV4A 4ZBDA 1XWAA 3WGEA 5E4WA 4IHUA 1QK8A 1SK0A 2O8VB 5ENUA 2LJRA 3D0ZA 1PKWA 3M9KA 1X5EA 4FIWA 2PVQA 1WOUA 2REMA 4Q5FA 3Q18A 3DWVA 2CT6A 2DIZA 2N5FA 2YJ7A 3GSSA 2IFQA 3DIEA 3LFLA 3GV1A 4LA1A 3R2QA 4ULXA 2JZRA 4KDUA 4WR4A 3ISOA 5EY6A 3G7IA 5A4UA 1BX9A 3GFKA 3V1WA 3IDVA 4POBA 2R5GA 4L8EA 1QXHA 5HFIA 1JZDA 2LS5A 3LEFA 1EGRA 2B5EA 2MMZA 1T7PB 2XPDA 4MF5A 4N10A 1B48A 2HRFA 2VCTA 2L6DA 2RUFA 3FR6A 1EZKA 1O8WA 3GX0A 4WKWA 4POMA 2R2JA 4TXOA 4EKZA 4E8HA 4TN8A 3IAS2 3HVVA 1GSQA 4ECJA 2L4QA 2GGTA 3BD2A 4KCAA 2C3QA 2MMAA 3ZFBA 2H6YA 1EV4A 2MZCA 5FT3A 2RM5A 3LSZA 1YZXA 3HJMA 2CX3A 2HSHA 2HFDA 1AUCA 4OMVA 6GSUA 3ZL5A 4K1FA 4O92A 4L0UA 3GIXA 4MABA 4HEA2 3F6DA 1PL1A 3NIVA 3H93A 3HZ4A 2AJQB 1PQNA 3C71A 2XPEA 3TKPA 1BQ7A 4EDZA 4HU7A 3RBTA 4NV2A 3APOA 3FK8A 3DKSA 2EIOA 3F3RA 3OR5A 5F0GA 1R5AA 1YQ1A 1XCCA 4F0BA 2DJ2A 3DD3A 5HR0A 5ELGA 5DQSA 4PGTA 2KHPA 3QDNA 2GT6A 4V2MA 2VL9A 4YAPA 5J9CA 3DVWA 5CRGA 2DJJA 1BEDA 1N8JA 2WFCA 2K8VA 1A2MA 3F0IA 5CRHA 5IMFA 3U6VA 3I43A 4TR1B 2DBCA 2K6VA 1HNBA 1TP9A 2B1LA 3CSHA 1SL0B 4NHWA 4O7HA 1GL8A 2OJLA 3A3TA 4DSSB 4AJ8A 2YZHA 4ZB6A 2YANA 2HSYA 2R3XA 4L5LA 3UARA 2ZUPA 3US3A 2YV7A 1JZWA 5IMDA 3QOUA 4PNFA 2CVKA 5CP1A 4H86A 2G2QA 3LXZA 3WGXA 1JLWA 3A5WA 2L4CA 4TW5A 2HXKA 5ECKB 4P3YB 1F3AA 2HNLA 3HXSA 4G10A 4KSOA 3L78A 2PN8A 3KGKA 3ERWA 4HJ2A 4MPFA 4HS1A 4JRRA 4POKA 5DCGA 2K8SA 4GQCA 3QFBC 4AGSA 3G7JA 3CSJA 1ML6A 2WJUA 1ACVA 5G31A 3RHCA 2PU9C 4IP1A 3F3QA 1CQHA 1FVKA 1YKCA 3HHVA 5G30A 4ZBBA 1PD21 3FHKA 3QAGA 6GSTA 3GMFA 5INYA 2JSYA 2DJ0A 4BA7A 1USBA 4IP6A 4K8MA 2E0QA 4LMWA 1F37A 3BBYA 2XBQA 3VK9A 1VF4A 1TRUA 1B4PA 1UA5A 2F8FA 2FNOA 4KX4A 3EE2A 1B9XC 4CDOA 3HY2A 1IYHA 2H76A 4K0NA 2JACA 1KNGA 2P5QA 4IKHA 5JWQB 1Q98A 1DUGA 3KTLA 1JHBA 1DBYA 4KUNA 2LEGA 1G6YA 4MZBA 5IPGA 3VLNA 1H4OA 3LYKA 1FO5A 2OE1A 1G0TA 3IE3A 3DGQA 4HZ4A 5ABRA 1GH2A 3ZVJD 2KP1A 1T1VA 2GTUA 1FVJA 2NDOA 3GKNA 4EE0A 1QFNA 1A23A 5ECOB 2HE3A 3HD5A 3EINA 4RI6A 2F51A 4TOPA 3FR3A 3BCKA 1TW9A 3H79A 4PQIA 4N0VA 5A4WA 1LU4A 1SJIA 4EXJA 6GSWA 1GP1A 4TKYA 1O85A 2LJKA 4V1Ap 2MBTA 4HOJA 4ID0A 3FRCA 1V9WA 2H1GA 2GSSA 3TKSC 2VL3A 3TOUA 19GSA 3DMLA 1JFUA 2AHEA 1GWCA 2ALBA 2VD0A 2LV3A 3GTUB 5ECMB 1SD8A 2I4AA 2TRCP 1X9WB 3C1SA 1UC7A 2PGTA 1F2EA 5D9WA 4ZL9A 2HRNA 2AUVA 3EYTA 3GH6A 3GN3A 4WXTA 3KH9A 4QL9A 1YY7A 3IOSA 1ST9A 3LORA 4DSSA 3WT1A 4MF7A 2XC2A 1NHOA 3JCML 1PMTA 4ZILA 3GUSA 4MA9A 1JZRA 3LYPA 3QMXA 3D22A 5J5NA 2CVDA 3IAM2 1M2AA 3HDCA 2YOIA 2V6OA 5L71A 2H66A 1CQGA 4IBPA 3PINA 2LRNA 5EL8A 5G5FA 3GRXA 2Z9SA 3ZRDA 1SU9A 1WP0A 5ELAA 3SBCA 1YJ6A 1GSFA 5GAND 2FWGA 2IWTA 4D73B 1Z9HA 4K0GA 1OC8A 1ERWA 3F4RA 2HI7A 3LWAA 3ZMLA 2R6KA 1TRVA 4RQXA 1E6BA 5CRDA 4WBJA 1S3CA 1O7UA 4GQFA 3EVIA 4ZXGA 2MBSA 1S3AA 2I81A 2WRTA 2WS2A 2C0DA 4IJ3A 4AF2A 1R5PA 1T3BA 2X64A 2WB9A 1F9MA 1T4YA 3FEUA 1ERTA 1XZOA 1AC1A 1F3BA 1XFLA 2ZNMA 5F05A 2D2ZA 4GLTA 4TXVA 4JR6A 5F06A 2H6XA 3FY7A 2AB6A 2RIIA 4K2DA 3H8QA 4I6XA 2FLSA 2CAIA 4MJAA 4YQMA 3KJYA 5C00A 3ZVJA 2F3MA 1GSUA 4X1UA 4ACSA 1M0UA 2RM6A 4BL7A 1X5CA 2MMOA 4XHMA 4X43A 3NOFA 1AQWA 1AXDA 2OA7A 1XVWA 4I97A 2WULA 2B5XA 1OVNA 3NZNA 4IVFA 3F63A 3L4NA 1YKAA 2I9HA 2FY6A 5G2ZA 1Y6EA 2DIYA 5C04A 1DE2A 1VF1A 1I5GA 4L0WA 5KN0A 1URMA 3GTUA 3E0UA 3VWWA 5JCWA 1Z6NA 1N2AA 1K0CA 2VLUA 1EEJA 3KMNA 3IR4A 2LQQA 3GX8A 4ML1A 2VM2A 2L5OA 4HJMA 11GSA 4IGJA 2AAWA 1X9MB 3QCPA 4ILFA 5H5SA 5B8BA 4K7IA 1GLPA 1SK1A 2GS3A 3GHAA 3ZYWA 2VM1A 2GZZA 1DSBA 3FYGA 1PRXA 1MDIA 4EL1A 4GSSA 3EMPA 2M80A 4PUAA 2MMNA 3P90A 4JR4A 2L59A 2VL2A 4XTSA 2H0IA 3F6FA 1AQXA 1O8XA 4D73A 3VFIA 1Z5YE 3G9BA 3HZ8A 3O6TA 5LCZA 3DYRA 2LKUA 2ZCTA 2C0EA 1QMVA 4EUYA 1ABAA 1NW2A 1AQVA 5HQPA 4HI7A 2YN1A 5GZZB 4LL1B 5EPFA 2E2MA 1SL1B 1FAAA 2RUEA 2B6MA 4DSRA 4E8EA 3GYKA 5G5EA 1M99A 3ZREA 4OFMA 5HR3A 5IIZA 1THXA 2I1UA 2HZEA 3TRPA 5D96A 2E7PA 3ERGA 1SENA 3UJ1A 1MD4A 1G7OA 3M8NA 5AISA 3KCMA 4XIHA 5CYYA 3S9FA 2VAFA 1YF1A 2VD1A 5AN1A 5DALB 1TK0B 4V2NA 4ZL7A 1HYUA 2VLVA 1SD9A 4PUFC 3GNJA 3APQA 4IN0A 3ZTLA 1AW9A 3UIWA 4GCIA 2IMDA 5DVBA 1TI1A 4XS4A 4PQ1A 2DJKA 3QFAC 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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