2H3BA

Crystal structure of mouse nicotinamide phosphoribosyltransferase/visfatin/pre-b cell colony enhancing factor 1
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
476
structure length
466
Chain Sequence
EFNILMATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKEVYREHFQDDVFNERGWNYILEKYDGHLPIEVKAVPEGSVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLMETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGIALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTEAPLIIRPDSGNPMDTVLKVLDILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKKWSIENVSFGSGGALLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGVNVFKDPVADPNKRSKKGRLSMHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGHDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEVRKNAQLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of Nampt/PBEF/visfatin, a mammalian NAD(+) biosynthetic enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
total genus 159
structure length 466
sequence length 476
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2006-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2h3bA02
4RZ5A 1RVGA 2EAWA 3C8FA 3O6CA 3W2NA 5AC8A 3P74A 5TBOA 1FWWA 1PIIA 3HPZA 2CLHA 3S9YA 3A5VA 4IMGA 3NDOA 4WY0A 4WX2A 3P84A 4NVTA 1H62A 2PC4A 3SI9A 2CU0A 4IMCA 2NXGA 1TQXA 3G0XA 4PH6A 5A5WA 4O1CA 3BG5A 3NZ1A 1BTMA 2A4AA 2RKXA 2DORA 1G6CA 4RJEA 3EXRA 2NV2A 4CLMA 4TR9A 3LB0A 1GVQA 1L6WA 1JQVA 2EKCA 5LSMA 1QMLA 2ZRWA 3HIJA 4E2DA 3W1NA 4BI7A 2FPVA 3TNOA 2ISWA 4RV8A 4LS1A 3VE7A 4ADUA 3WJWA 1TYGA 1Z48A 1XBVA 3ATYA 3TAOA 3P82A 3BLIA 3LHUA 2IQTA 5CPLA 5EYWA 2QJHA 2JK2A 4AAJA 4O57A 4FXRA 4DF1A 2H3DA 1RD5A 1OFEA 3B06A 3G1DA 1X7FA 3KOFA 2A1YA 5D04C 1SU5A 3M43A 2GPTA 3EX4A 2G97A 4RZ4A 4R33A 4K7VA 3P7YA 3DFTA 1ONRA 4HSNA 3PY2A 1PE1A 5D2WA 3UD6A 3M1ZA 3THQA 4JDYA 2BLEA 3TMLA 1KM5A 2B7QA 2X16A 2NX1A 1QAPA 3E0IA 2E6AA 2YW3A 3B05A 2QUTA 1KM3A 3EWBX 3L67A 2YZRA 2KZHA 4KFOA 3R5EA 3C2FA 1KLYA 3YPIA 1KM6A 4O8RA 1I8JA 4TIMA 4AF0B 3QW3A 1J2WA 1FCBA 3A24A 3EX3A 5AN7A 4L4MA 1IIHA 2GQAA 3TIMA 1KTNA 1N55A 1M7PA 5LKYA 2X1TA 1RQBA 3OVRA 3G24A 2BZNA 1OABA 4BF9A 3W86A 1R2RA 1B4KA 3L65A 1TB3A 3MP4A 2HMCA 3PUEA 3MHFA 2WSYA 3NZRA 2V2DA 4OHQA 3JR2A 5AHIA 3CM4A 5G2HA 3IIPA 3IGXA 4GUJA 2ZTKA 1A5CA 1GVRA 4O10A 3W1PA 3E9AA 3ABRA 2QCMA 2A2IA 1XBZA 1W3TA 2WJZA 3QYQA 4AF0A 1JUBA 1OG0A 1EP3A 1I2NA 4EVZA 1OVDA 3CWNA 4M6VA 3G1VA 3PBYA 4N4PA 1L9WA 2ZCGA 4OV4A 4O1DA 1LBLA 1ZAJA 1TPVA 1NF7A 3S1XA 3UNDA 4ZQCA 4HPJA 2Y7DA 1LDCA 1SO6A 4Z08A 3DFQA 2ZRVA 1QO5A 1JCXA 4FO4A 3DHDA 3TXVA 2TPSA 3NQFA 1EUNA 1V5XA 5CPMA 1A5SA 3NL2A 1H7NA 1JJKA 1QOQA 4UMBA 5DBTA 2ABAA 1RQEA 5EPDA 3OBKA 3E96A 5KZMA 5AHMA 4JTGA 2E5BA 4LV9A 3KRUA 1XCFA 3KVMA 3DFPA 2J6XA 1FWRA 5CG7A 2DZVA 3MW7A 1KTBA 3STCA 3MO7A 4FHAA 3TSMA 3ZWSA 5KMYA 1NSJA 3G3DA 3MHUA 1YTDA 3KVJA 1IIGA 5AHLA 3BGGA 1LM1A 1DOSA 4DF2A 3N34A 3QRHA 2W6RA 4KKXA 5BNKA 2E77A 3O8AA 2Y88A 2QCCA 1SZGA 3W1UA 3C2EA 5AC6A 3VI2A 4Z0JA 3TW7A 3SSJA 1YXCA 3W2MA 5G1TA 1VHCA 4IMEA 5I3IA 3QFEA 4UNKA 2O7QA 2W0UA 3GYEA 3NQ6A 3CU2A 5EA9A 3DFNA 3FIGA 3GK0A 3WK0A 4YCOA 3NQGA 2VEIA 1FWSA 3TAKA 4XWUA 4IOTA 1H5YA 4GUGA 4ZVJA 3TV8A 1ML1A 5DELA 2W79A 1VCFA 5IBXA 3LX9A 1TMHA 3K30A 1VC4A 5HULA 1I4NA 2C6QA 5G5IA 4BWLC 3JS3A 4JTIA 3HPSA 1G67A 3FLUA 4LV4A 1W1ZA 3DBPA 3TC6A 1EP1A 4R34A 3S1WA 2ZDRA 1UBSA 5HINA 2AQWA 4MVAA 2ZTJA 3CTLA 3NPXA 2YDAA 4O4VA 3W7LA 3S5ZA 4IPIA 4JYEA 1H63A 1TTIA 2GJNA 3O16A 5IBXC 4HSOA 1OFQA 1UB3A 2LLEA 2V82A 3GB6A 1QOPA 3L66A 4YLWA 3SW6A 2ISSA 4EIVA 3CLMA 4NZFA 4QNEA 1R30A 4NJIA 4NU7A 4UFIA 1L6SA 5L9FA 1DJQA 2BTMA 5BMWA 3W7PA 4UNLA 5HQEA 2QUUA 1D3HA 4MYAA 4LY8A 4L4LA 2QEZA 4N9BA 2Y89A 1Q6LA 2ZZ2A 3T4CA 4C1KA 3Q2DA 1DVJA 1WBHA 3EKZA 2E1DA 1YDOA 3I6RA 1OK6A 2RH9A 3NPWA 1SSGA 1VCVA 3NPVA 1O95A 3G1AA 1WXJA 2X2GA 1B3OA 3RF9A 5K9CA 4P2VA 1WOAA 1IXOA 3O63A 3GIYA 3MUXA 3LCWA 2EHHA 3NQ7A 3UPBA 5HUPA 2CFFA 1ZHAA 1KFLA 4R53A 3EWWA 3LV5A 4N02A 1KFKA 3G1XA 2G95A 1T8XA 3W23A 4DO5A 1H1ZA 1DBTA 1HUVA 5I3KA 4JN6A 1FCUA 3STFA 3W7RA 3N9RA 4QAIA 3GDLA 4UIOA 1DHPA 2NUXA 3QH2A 4QISA 1C8VA 4X9SA 2DZSA 1Q6RA 4DBDA 4HPXA 3HB9A 4JTFA 4H4IA 4UXDA 5HMSA 2QF7A 1TSIA 1W3NA 4NUWA 3M6YA 3A22A 4JEQA 3LBCA 4YXGA 1R46A 3H54A 3BLFA 3OVQA 4FX6M 1K8ZA 5CSSA 2A6LA 3QF0A 4O16A 5KITA 1YTEA 3LTYA 1HG3A 1TTPA 5HUOA 3BO9A 4RK8A 1LORA 3O6YX 2XFWA 2I1OA 3S5YA 3A21A 4S2BA 1BWKA 1FWNA 3W73A 1GJPA 4Q4KA 2XN0A 3ABQA 3G1HA 5DY2A 5FF3A 2Q3RA 1KW1A 4Z1BA 1BWLA 2FJKA 3MI3A 2G96A 3LXBA 5D32A 4QSHA 1W5NA 4NNAA 1GOXA 1PVNA 1XC4A 5FEWA 4UTLA 3KAOA 4PTNA 1WAUA 4O1AA 1SFLA 4LT9A 1TRIA 3IRDA 4WD0A 1FDZA 5CZSA 5C55A 3BK0A 2ATSA 3TQVA 3L0GA 3TXZA 4JTLA 3RLVA 2G5WA 1I2OA 4ORMA 4JIQA 1UUOA 3G22A 4DELA 4O53A 5LGZA 2C1HA 3C52A 2NXHA 4IWWA 4ZQNA 4ZQMA 3U8GA 1Q3NA 5BMXA 3C56A 3BVJA 1GTHA 1NVMA 4A3UA 2B7PA 1U5JA 1X1ZA 2JBMA 3W2UA 4NNBA 2OT1A 2Y85A 3KVLA 3NQEA 4JTHA 3QMTA 4FIRA 1S5VA 3C4UA 3IIVA 3W9ZA 3P5YA 2E09A 5GVJA 3P67A 2FPYA 1JR1A 3HGSA 3M5ZA 1M7OA 1SW0A 2DZTA 5CKSA 4LS2A 1FBAA 5FEPA 1GWJA 4JS3A 3BW4A 1ALDA 4M19A 5I3HA 3G1FA 3PBUA 3BPWA 5AYYA 1GTEA 3OA3A 4KWWA 1EA0A 2C3ZA 4MZYA 3O15A 1YDVA 2ZQ0A 4MYXA 5DN1A 3FEMA 3TROA 1TV7A 2CZEA 3EXTA 2ZRZA 4IUOA 4WOZA 5I3GA 4ORIA 1FXQA 4TMCA 3PUDA 3IIOA 3GNNA 2ATMA 4UTWC 4JIPA 3UWVA 3N14A 3FFSA 2E6YA 2JGQA 3MI2A 4A2SA 3MP5A 1KTCA 2ZZ4A 2V81A 1FUYA 1R2SA 1M6JA 4POCA 2RDWA 8TIMA 4JYFA 3IGUA 1GZGA 3THAA 3KRSA 1Q6OA 3DFOA 4FX8A 4I7WA 1S3HA 1FDYA 1K03A 2PRLA 1NFBA 2CLIA 3OG3A 4MZ8A 1TPWA 1T99A 5AYXA 4YMZA 2NUWA 4UTMA 1HL2A 1BEUA 1J5TA 3PF3A 1XXXA 3S1UA 3R2GA 3OHIA 2CZ5A 3LRMA 4ZQPA 4K38A 2YR1A 1SO3A 4NZJA 3A23A 4LS0A 2VOMA 2YX0A 3PULA 2A7PA 1F76A 4H6KA 4LVBA 2NX9A 3GDRA 1GG0A 3O07A 3NGJA 5F4XA 3W1XA 4GC4A 5E1QA 3QM3A 4QJ1A 1RZMA 1DORA 1LROA 5D33A 4LW7A 4PCFA 5BOOA 1IXQA 1EX5A 1EUAA 5LHFA 2YFNA 1Y0EA 3W7OA 2FDSA 4HKPA 1QO2A 1TIMA 3DKJA 5EL1A 3HG3A 5FI8A 1M5WA 3NXFA 2EPHA 3VFLA 1H7XA 5FF4A 5KTLA 4NQ1A 3S5NA 1IF2A 1AMKA 2RFGA 1H60A 4UTKA 2JKEA 2A21A 2CWNA 4H3DA 1TJPA 2DU2A 1NF0A 1AG1O 3E12A 1G7UA 3ATZA 1R2TA 3EX1A 4EWND 5CZ0A 4CQAA 4FNQA 3SECA 1HO1A 1H7OA 4JTEA 4XZ9A 4LVGA 3GDTA 1SW7A 3U2OA 1EIXA 4NXKA 3G3MA 2QJGA 4W9TA 3QQ1A 1IGSA 3CHVA 4XKYB 4JTKA 5E0KA 4O19A 1J4EA 3GR7A 2DZXA 1ZCOA 4AMAA 4M6QA 3R12A 4GBUA 3GLCA 1VYPX 3MBDA 4Y9AA 1SO4A 4XBSA 2D73A 2Y6ZA 1QNVA 1SSDA 1N7KA 3N2XA 1R47A 3IGSA 5FESA 1LRNA 3LI1A 1OYAA 3MYPA 1UCWA 1VCGA 4XKYA 4AXKA 5DXXA 4AWUA 1YDNA 3T7VA 4DF0A 2E6DA 4TU1A 3QPYA 1K8YA 2FPTA 4MKNA 1LYXA 4QM1A 3L9CA 1TREA 3B0UX 3NG3A 4UTHA 4Z1CA 3OVPA 3HJZA 3P80A 1XUUA 2AGKA 1F6PA 2CLFA 2Z1BA 4FNPA 3S0CA 4Q33A 4UR8A 3QJAA 4TO8A 3DENA 6ALDA 3CWOX 3G0UA 3USBA 1F5ZA 2OZ0A 3W7HA 3PVFA 4JD4A 5AB3A 1YXYA 4O4WA 3HG5A 3B8DA 1UJPA 3W7DA 3W3OA 3GKAA 3NQVA 3EWZA 1H61A 2A6NA 3A9IA 4UTTA 4UC5A 2ZRYA 4FF7A 1QCWA 3C6CA 5DY3A 3LHYA 5F4SA 4N2YA 2I9EA 1B9BA 2GQ8A 4IMFA 3G8RA 3SR7A 3W76A 3I7SA 3C2OA 3NR0A 3T55A 4U4MA 3W2LA 2YYUA 1QPQA 2WQPA 2Y61A 1Q6QA 2EF9A 4Z0SA 3VNDA 3FYOA 2CZDA 4HN4A 3W22A 4E2BA 1JRCA 3RFAA 1ICPA 4TMBA 1TPFA 3NM1A 1THFD 1V7YA 3NAVA 3ZS4A 4UTTC 1TPDA 1IXPA 5EKYA 1ZAHA 5I3FA 4M7TA 5HWNA 3W2JA 3AJXA 3B4UA 3W1AA 5F2IA 4QIUA 3W7NA 5H91A 1TPUA 3PBVA 1EB3A 1GPWA 3W7QA 2TSYA 3RU6A 3TC7A 2V9DA 3HGRA 3NNTA 1H1YA 3F4WA 1KM0A 4LOCA 2J27A 4RR4A 1LLZA 3OIXA 2WSRA 2F7FA 3HOJA 3NYZA 4S1FA 2ZRXA 3GVGA 4HT3A 3BW2A 1NEYA 3N9SA 5LZLA 2E5CA 1O60A 4BI6A 1MXSA 1AW1A 1AW2A 1ZAIA 3FJLA 1YXDA 4BK9A 3FOKA 1VYSX 2VFDA 1VRDA 2YGYA 3HPXA 4X22A 1WDWA 4JYDA 2RHGA 3W1TA 2GVLA 1ME7A 1TCDA 1D3GA 1YLVA 1VH7A 2WNQA 2VEKA 3UZJA 4HNNA 3TE9A 4JTTA 3DI0A 4JX4A 1Z41A 3LXCA 1WQ5A 1F7BA 5BW6A 2VFIA 3PG8A 4ZMGA 2VKZG 3GKFA 2WKJA 3HQ1A 3CPRA 3WJXA 3PBWA 1KV8A 4D2JA 4DO4A 2WV8A 4WOQA 3HBLA 3N73A 1EWDA 1WA3A 3VE9A 4JX6A 5BRBA 3IVTA 4RKAA 1DV7A 2QCHA 3C2RA 3W7JA 1KBJA 2VEPA 4GUFA 1AL7A 1VS1A 4Y96A 1I2PA 1WV2A 4NXSA 2FFCA 4N6EA 5TQLA 1SFJA 1G4PA 3W84A 3NOEA 3GXTA 4JX5A 5ABTA 1ZY9A 4UTUA 1ZALA 1ZJIA 3M0ZA 1WX0A 1G4SA 2CZFA 1K8XA 4JXCA 1LOSA 4BR1A 1PCWA 3N3MA 2Y63A 1W31A 3WK1A 4JTUA 1YTKA 1C29A 3M44A 3O05A 3M5XA 4LWWA 5AHFA 3UZ5A 3W88A 4LU0A 3W2KA 3W75A 2ZZ3A 2A0NA 3AO0A 2QUVA 1OFPA 7TIMA 1ME9A 3PS7A 5D05A 3NQ8A 2P1FA 2Z2UA 4K8EA 2YXGA 3HGJA 1X6UA 3OEXA 1FY6A 3SZ8A 3DH7A 3M9YA 2H6RA 1U83A 1C9DA 4A29A 3IIXA 4GNJA 5G2WA 2QCGA 2WOQA 1X8FA 4XQ6A 1XBYA 5LNUA 5F2MA 4O13A 5C2XA 3LCXA 1O5KA 3M47A 3HMJG 5D2YA 3EX2A 3G18A 2DZUA 2V0TA 3H53A 1TV5A 4CCDA 6TIMA 3H55A 5D03A 5LNVA 2R94A 1I2RA 3FKKA 3W07A 5J5DA 2Z6IA 4A21A 3KRZA 4NJHA 2P10A 4MLRA 5DCBA 2CLLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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