2H4IA

Crystal structure of the complex of proteolytically produced c-terminal half of bovine lactoferrin with lactose at 2.55 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex of proteolytically produced C-terminal half of bovine lactoferrin with lactose at 2.55 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h4iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h4iA02
1H76A 3QAXA 2I3WA 1AL3A 4XIGQ 4X1DA 1VE4A 1PB7A 3K1NA 3G3HA 4EF1A 4FEDA 1MQGA 2PMSA 4BDRA 3CSGA 4RNSA 2F78A 5EHSA 3OOAA 1B58A 4BDLA 5LOMA 3LSXA 2I58A 4KQPA 1LCTA 3C4MA 3DP6A 5IKBA 1BLFA 5I58A 3EF7A 1H43A 3O6HA 3FVOA 4FORA 4NE4A 3MJNA 2GH9A 1UTHB 4OFOA 3IO4A 1GV8A 1Y1ZA 3IOWA 1B0LA 3QUFA 2I6EA 3O97A 1XS5A 2G93A 4TLMB 2DVCA 1WVJA 2REGA 4N07A 3U72A 4R2BA 2B65A 2A5TB 4OHNA 3O6GA 1DPPA 2Q9TA 1Q1KA 4DLDA 4G68C 3UGWA 4F3BA 2OK2A 1MDP1 3PMVA 3PPOA 4ZEKA 5H8QB 1WDNA 2Z8FA 1SW4A 2D5WA 2F35A 1URDA 1S7YA 4MF3A 3IL1B 1QUKA 2ZYKA 4MH5A 2GHAA 2XX7A 1H3DA 2M8CA 3DM0A 1A55A 5L8DA 4O3AA 1B5HA 1UIUA 3BKIB 1QW0A 5H8SA 3MVXA 4X9TA 2E0SA 4POWA 4F19A 1URGA 4U21A 4ZEBA 3ZKLA 4GWOA 4OQOA 1NMUA 4RA1A 5AE4A 4DCYA 4ZE9A 1TXFA 4UACA 1SW2A 2WKYA 3PUZE 5H8HB 4KYDA 4OERA 2QL3A 1HSJA 2XD3A 1TFAA 1LB8A 1EZOA 5K2YA 1ZIUA 4WEPA 4KFQA 3IOTA 2ZYOA 4KR5A 1B3EA 3KFMA 3LC8A 4JDFA 2F34A 3DELB 2ABHA 3JYRA 1PC3A 2UYEA 4IGRA 1SVXB 4GF8A 1M5BA 2DVZA 3A3CA 3T9VA 3PGFA 1GGGA 5L9SA 4R74A 4U22A 4H0WA 4DCXA 3WAFA 2ANJA 2Q2CA 4PE5B 2YJPA 2HQ0A 1FCKA 4M4GA 3TODA 2PX1A 4H8JA 4LATA 3V5AA 3T22A 2Q2AA 1A7LA 4G8NA 2PBWA 3HO7A 2OLBA 3TMGA 4F3GA 3FD3A 1ZJLA 1LCFA 1LGBC 4MFIA 3MPKA 2NVUB 4FJPA 3IB2A 3KEIA 2DYXA 4POXA 4RXLA 3G3FA 2REJA 3D4CA 1OQGA 3FV1A 3IR1A 2Q88A 1LAFE 2H98A 1P1QA 2XXTA 4H5GA 5JTYA 4JSDA 3CR9A 3FASA 2I0BA 4PFWA 3EPEA 3TQWA 3K6WA 1JVYA 5KCJA 3S4UA 3FXUA 4ONYA 3IB1A 2V3UA 5ITOA 5I56A 2QMWA 1SYHA 1US5A 2XHDA 4XKQA 3PD9A 1FQEA 3VDFA 4GIZA 4R6HA 1EZ9A 1LAGE 3PPRA 1FW0A 3L6HA 3HV1A 5I84A 2QPQA 2XXQA 3FIRA 5F1QA 4LZ7A 2PYYA 3ILTB 2W7YA 3PV0E 1MY1A 4YZZA 1D9VA 1AH5A 3PD8A 2V25A 3T66A 2HCAA 3RNNA 3N6UA 5HBCA 2D3IA 4IO4A 4KYEA 3DP4A 2ZYMA 1MQIA 2IA4A 2B3FA 3S9MC 5DVFA 2UYFA 3H03A 2DOJA 1TT1A 4KCCA 4OTEA 4Q5TA 5ICTA 4LUBA 5H8NB 1P1OA 2FA7A 4R2FA 4HCYA 4FE8A 4ZZAA 1A8FA 4EF2A 5AA3A 1ANFA 3H4ZA 4DDDA 2DP8A 3C33A 1BKAA 4F3PA 4OVJA 3TELA 3SKPA 1XT8A 2CZLA 1LFIA 2RC8A 1MPBA 4R6YA 2Z8EA 1UTHA 3PPPA 4F2QA 3C35A 3QUJA 1I69A 1QUJA 1IXCA 1Z7ME 3MVYA 3OENA 1BIYA 2HEUA 2O1MA 2A5TA 4ZZEA 3C32A 5HM4B 4LONB 4LQ5A 2DWJA 4WKMA 1MG1A 1A99A 1ZBMA 1O63A 2DSFA 3FUZA 1RYXA 4PFYA 4OXVA 5I57B 3CG1A 3C34A 1MXZA 5TP9B 4YKIA 4EDPA 2F6GA 4IGTA 4QFKA 4XTCQ 5H8QA 3TTMA 3IAZA 4KCDA 5K2XA 3ZKKA 2O7IA 1UIVA 5JTYB 2ZNSA 2XXWA 1LBBA 4IO7A 1Y20A 4G8HA 1USYE 3R26A 3IB0A 2THIA 3S9NC 3IJOB 3LSWA 4NF4B 1ZTYA 2O68A 4LQ2A 1PBQA 4IB2A 4YKJA 4U4SA 3RQTA 4OETA 3MP1A 4H1XA 3K6XA 3PUWE 3TZAA 2OCUA 3EQ1A 1MXWA 3UORA 4TLLB 2YLNA 4WXJA 3F11A 2ONSA 3IOUA 1JVXA 1OLAA 1FQCA 3T93B 4H65A 1H44A 3TAJA 3CG3A 5H8HA 1Y4TA 2H5YA 1SI1A 4ELRA 1B7ZA 3M3LA 4F31B 4QSDA 3MVZA 3CVGA 4F3SA 4AB5A 2AIXA 3TTKA 4RK2A 3G3JA 1NNFA 4HW8A 2ZNUA 1O7TA 3FVGA 2HFBA 3TYHA 1VSOA 1B3FA 4NWDA 2H25A 2X26A 3RTFB 2F36A 3KOSA 1JEUA 1RKMA 4X48A 2H99A 1B6HA 3P7IA 1SW5A 3IJXB 3MC2A 4ELOA 2F8DA 4K3FA 1WODA 3V8XB 2PT2A 2GHBA 4JWYA 3PPNA 5CMCA 3GBAA 1J1NA 1Y3QA 3K01A 1JW4A 1IITA 3OO9A 4ND9A 1DMBA 3VV5A 3H6WA 2XXXA 5ELVA 2KLFA 4YB5A 5DTBA 3U93A 1Q35A 4MLVA 1B1HA 4KI0E 1IXIA 4GVOA 1UTBA 3OO7A 3MP6A 3M8UA 4TQUQ 4ZECA 3B6QA 1OVTA 2VGQA 1POTA 4PFUA 3N6TA 4NMYA 1MXUA 1PDAA 3W15C 3CFXA 3QXMA 3UK4A 4OENA 3G7WA 3HCQA 4DE8A 1N7XA 2R9JA 3CIJA 4QHQA 2DQVA 3PUXE 3VVEA 3OSQA 3DLNA 3EN3A 1R6ZA 2QS1A 4H6DA 3TUSA 2HAUA 3SETA 3UA8A 2E1SA 4EQ9A 5FTHA 4XKRA 4Q0CA 1SBPA 1F9BA 1B2HA 4OESA 3K2DA 4I8CA 3BFUA 2HZKA 1EZPA 2UVJA 4EXLA 2X7PA 3U94A 1MH3A 4F18A 3MPLA 5BUUA 4BLAA 4YMAA 3IORA 2OWSA 2I4BA 2GFEA 1PBPA 1Y9UA 4ZDMA 1H45A 4NF5B 1JW5A 4QFLA 3VE1B 1A40A 5FHMA 4N13A 4RJZA 4ISUA 4Z0IA 4LA9A 1ZKBA 1FTOA 5I59B 4GXSB 2FNCA 4H67A 5H8NA 4GXAA 3A3UA 3L6GA 2XXVA 4IY5A 1VFEA 3ILUB 1MXXA 3HPIA 3Q28A 4GD5A 3O2AA 1FTLA 3M3KA 4FIMA 3E9XA 1PB9A 3H6VA 5CMBA 2YPNA 4NF8B 3T9HB 4RPNA 3MBPA 3VFJA 1B7UA 3VVFA 1DTGA 1PEBA 1XVYA 2R71A 3BFTA 3C36A 3E3KA 1BTJA 1N7WA 5TPAB 3K6UA 1NNTA 4DIGA 4QFOA 3K6VA 5CMMA 4NEDA 3TTRA 1II5A 2UVIA 4M1VA 5AA2B 2QJEA 4BDOA 2B3BA 1O64A 2Q89A 3SEUA 3R7XA 1R9LA 3K4UA 1MPDA 4F1VA 3TDJA 3Q27A 3K1PA 5I57A 1UTBB 3SEYA 4OEVA 5TP9A 1A8EA 1AIVA 5CRYA 2QSXA 4U4XA 3LSLA 2LAOA 4QFNA 4G2ZA 1QKBA 3FJGA 4XXUA 5H8FB 5CBRA 4PFTA 3GBBA 4NF4A 5TU0A 4EXKA 4I62A 1LAHE 1HSEA 1B3HA 4ELQA 4U1ZA 4GFRA 3K00A 3A09A 1R1NA 2UVHA 3KSJA 3RPWA 3TTNA 5AA1A 3LSFB 2RKMA 2GRVA 4ESWA 4Q8RA 1A54A 4MBPA 3KN7A 1B7HA 1YCJA 2NWJA 4BDNA 4BDMA 3SESA 5CBSA 1Z7NE 2VP1A 1P1NA 1CE2A 1IZ1A 2OJTA 1D9YA 2Y7WA 4P0IA 3ECRA 2QMXA 2XXUA 3S9EA 1MQHA 2QRYA 2DWHA 1NNKA 3G3GA 4XKPA 1P1UA 4PP0A 5CC2A 4YB6A 2AL4A 3V83A 4IO5A 1D4NA 3LUYA 4F1UA 1FQAA 3THIA 3KZGA 3AXFA 3U8QA 1QJMA 5DVJA 2P2AA 1AMFA 4F2OA 3KGCA 1B40A 3HN0A 4R9GA 5IAIA 2O7UA 1QKAA 3S9LC 2Y7KA 4P0GA 5I2KB 2DE3A 2XXPA 4O3BA 1FTKA 4QSCA 1GVCA 2O1LA 5HPQA 1JETA 1JEVA 3T9UA 4R75A 2XXHA 3I3VA 3GZGA 2UVGA 1S50A 2P0SA 5DT6A 1M5FA 3I5OA 3MQ9A 1MY0A 4WEDA 2IEEA 2RC7A 2V3QA 3IX1A 3EHTA 4NWCA 2OZZA 3RLFE 4MLQA 3QK6A 4QF9A 3CFZA 3KN3A 3Q29A 3WAEA 3TQLA 2ALUA 2ONKE 3HSTA 4OFLA 2HXWA 3E13X 4P11A 4DZ1A 5ICQA 5B70A 1NL5A 1PB8A 4HS7A 4C1TA 4C1UA 4OZ9A 4G77A 1B4HA 4I1DA 5ISUA 2ESNA 2VHAA 3PMXA 3W9VA 4U23A 2AYSA 1MPCA 3TCHA 5B7DA 2I0CA 3CI8A 4R9FA 1MS7A 1MM7A 1ZMGA 4NF5A 4Z7EA 4RYAA 1NFTA 2F7CA 3FVNA 4YKKA 2I4CA 4UA8A 5I59A 1S9TA 4IO3A 2OWTA 5DYHA 2XXYA 4GQOA 2ZNTA 5FTIA 3MUQA 4HCWA 4OEUA 1TWYA 3H6UA 3UIFA 3VVDA 5CI5A 3UP9A 3SDFA 3FZVA 1ZU0A 5M2VA 4G8MA 2A5SA 4NF8A 3RTWB 3U92A 1MM6A 3I6VA 3HHFA 3PU5A 3R6UA 1YTVA 1B5IA 2QS4A 4YICA 5TPAA 3OO6A 3KJ7A 4NTLA 3QYTA 2PT1A 5DEXB 1M5CA 5AA2A 5KDTA 1B51A 1Y3NA 3N5LA 3SEWA 1ZLQA 2F97A 2Y84A 3PPQA 4ESXA 1RYOA 3D4GA 1MH4A 2VOZA 3IO6A 3OO8A 1EU8A 2NUVA 2O51A 4Q30B 3B6WA 1D3KA 3ZS6A 5L9OA 2QS2A 4F22A 1B3LA 3IK6B 1LLSA 4X1BA 1I6QA 1MY3A 1B9JA 4JSOA 3FVKA 3FGSA 3VLUA 1M5DA 1DPEA 5H8FA 4C0RA 3EHSA 3H6TA 4JWXA 3SERA 3UN6A 4FAJA 3CRBA 4GL0A 1N04A 3ODBA 2HZLA 1SYIA 3C31A 3O9PA 3N94A 1B5JA 4JBZA 4AQ4A 4QFPA 3GLBA 3MVWA 1N3WA 1FQFA 4KHZE 3CFLA 2VD2A 4ZEDA 5A5XB 2ZMBA 3GXAA 4OMBA 3U1OA 4PQJA 4RK9A 2BJJX 2RC9A 4NF6B 4KPTA 5JK4A 4GRKA 1NH8A 2ZYNA 3RT8A 1B1XA 3Q26A 4FATA 4OYVA 3KOTA 1YAEA 4G68B 3FV2A 4YMBA 3DP8A 2D21A 3EHUA 2F7BA 3G3IA 5AA4B 1IXGA 1P1WA 2V3TA 3W9WA 2DXYA 2V93A 1MRPA 4EQBA 4FECA 3TEPA 5I2NB 3TPAA 4XKNA 1LB9A 2XD2A 1Y4CA 4THIA 3CSBA 3IOVA 1DOTA 4OFJA 3FXQA 1SDXA 5I2KA 3ONMA 1OIBA 5F7VA 1JQFA 3KN8A 3H3GA 1MXYA 4ELPA 4E0WA 3ZSFA 4DXBA 3QIMA 1L5TA 2F5XA 4RPOA 1GR2A 4YB7A 1SI0A 4YAHX 3TKDA 3K1MA 5L9MA 3HHGA 3H06B 1VR5A 5KDTB 3RUMA 3H7MA 5ITPA 4I9DA 5J1DA 5CM6A 2AL5A 4FEBA 1BP5A 1KWHA 1I6BA 1QVSA 2O6AA 4ZEIA 3M3FA 2PVUA 5FHNA 1N0TA 3OEKA 2QS3A 1UQWA 5I58B 2VD3A 1NH7A 2R6GE 2RF1A 2RCBA 1FTMA 2XXRA 4F39A 1MDQA 3RT6B 4PETA 3G3KA 4ZS9A 4DXCA 2I3VA 1VFDA 4QSEA 3VXBA 1MQJA 3PMWA 5BWJA 5FHOA 3SEXA 3OSRA 5DVIA 1P99A 1MY2A 5EHMA 1I6AA 3SEVA 2ONRA 2CMOA 2XX9A 3FATA 1B4ZA 1NKXA 4EQ7A 3MP8A 4ZE8A 4HTGA 2HAVA 1FQBA 3MAMA 1XOCA 1POY1 4BDQA 1MQDA 1B0HA 5EYFA 2F6PA 3FJ7A 4L17A 2XX8A 4ECFA 3VLVA 1FQDA 3JV9A 1LFGA 1IIWA 1LAXA 1YPNA 2H9BA 4DXUA 2XXIA 3PUVE 3S2VA 2FYIA 1T0KA 1FTJA 3OD7A 4AB6A 3OELA 2F7AA 3LBSA 3K0VA 1US4A 4E0XA 3MZ9A 1MY4A 1OQHA 2OBGA 3B6TA 4GLIA 2DE4A 1NNPA 1HSLA 2DE2A 1IUDA 2DS9A 1CB6A 2O84X 4O3CA 3MZBA 3RGYA 4JWOA 2DWAA 1Y3PA 1SD3A 4OWDA 1R9QA 3K02A 4H8IA 5DEXA 1N84A 3TFLA 1DSNA 1N76A 4F1YA 1B05A 4H5FA 3B7DA 5CMKA 4G4PA 4N6PA 3C9HA 1B32A 4LVQA 3QSLA 3TCGA 2RCAA 4EUOA 1IEJA 3RY3A 3O6IA 1MXVA 3TCFA 4LZ8A 3T9XB 3V89B 1OVBA 1LFHA 1AOVA 3E4RA 3T96B 5JEIA 2Y7IA 4F29A 1N3XA 3PUYE 3KJTA 1JW1A 4JB7A 2DWIA 4YU0A 2Y7RA 1IQ7A 3OMBA 2Z8DA 4GL8A 1XHYA 1URSA 3KSXA 2NXOA 3USDA 2Z22A 3KBRA 4R72A 1SQYA 1LBCA 2NOOA 3KG2A 4LP2B 1M5EA 2V84A 2O69A 4ZEFA 4R73A 5A5XA 4KYSA 3VXCA 1QULA 3OXNA 4YKPA 3Q25A 4IO6A 5KZTA 4NF6A 3N26A 4QRZA 4IO2A 5KCJB 3MWBA 4IY6A 2ZXTA 1LSTA 1Y1MA 1QUIA 1JNFA 1GTKA 4G68A 4LZ5A 3TTLA 5I56B 2G29A 2DXRA 3FXRA 3MW0A 4JXIA 2Z23A 1EH3A 1XVXA 1OLCA 2RINA 3LR1A 5AA4A 4RY1A 1ELJA 1SW1A 1XC1A 1TFDA 4KD5A 3VLWA 1DTZA 4TOZA 5AA2D 2Q8JA 5I2NA 3FJMA 3O28A 1B46A 3O29A 4U2RA 1USYH 2I48A 4R6KA 3JZJA 4GOTA 2H4IA 3OEMA 1ATGA 2I49A 3BBRA 1IXHA 4U1OA 3RN8A 2Y7PA 1B3GA 2UXAA 2P1SA 2X7QA 1OMPA 1B52A 3MZ1A 3O66A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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