2H4IA

Crystal structure of the complex of proteolytically produced c-terminal half of bovine lactoferrin with lactose at 2.55 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of the complex of proteolytically produced C-terminal half of bovine lactoferrin with lactose at 2.55 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h4iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h4iA02
1B46A 3RQTA 4FECA 5I84A 3LSWA 4BDRA 2H25A 2OLBA 1FQFA 4XXUA 4IO5A 3KN8A 4YKIA 3UK4A 4OEVA 1J1NA 3K1MA 3Q29A 4F3BA 3T93B 3RT8A 5ITPA 2P2AA 2DVCA 2UXAA 5JTYB 4ZEBA 2FYIA 1BLFA 3E3KA 1MY3A 2CZLA 2DQVA 1YPNA 4DCXA 3OENA 3PPNA 3MPKA 1II5A 2QMWA 5DT6A 3T66A 2Y7IA 4C1TA 3KSXA 4DDDA 2XXRA 3SESA 5J1DA 3IJXB 1I69A 1Z7NE 2D3IA 4H5GA 4NF4B 2RF1A 4BDQA 4WXJA 2QRYA 5I58B 4XKQA 4OMBA 4OETA 1JVYA 2XXYA 1UIUA 3CSBA 3THIA 3IB2A 3D4CA 1B3GA 4EF1A 5A5XA 2PVUA 1NNFA 4U1ZA 1SW2A 1PBPA 5I2KA 1ZKBA 3UORA 1SI1A 4F1YA 5CMMA 5CBSA 3H6VA 1R1NA 4M4GA 2Z22A 1LCFA 3R7XA 1VFDA 3H03A 3OO8A 4R75A 1MXUA 3VE1B 3OOAA 1IUDA 1JEUA 2ABHA 2IEEA 3CIJA 3DP8A 4GXSB 3ODBA 1POY1 4Q0CA 4R6KA 4RNSA 3S4UA 3SEVA 1QKBA 4GL0A 4X1BA 1NNPA 4LATA 4Z0IA 1MDQA 4I1DA 5EHSA 4RPOA 2DXRA 3CG1A 3RLFE 5ICTA 2WKYA 4ELOA 1ZBMA 4GRKA 1GR2A 2F5XA 1B52A 1IXCA 1H45A 4FIMA 3RGYA 3JZJA 3U94A 3H6UA 1N04A 1XC1A 2X7QA 2VD3A 3CI8A 3FUZA 4E0WA 1MPCA 1MPDA 1NL5A 1XS5A 1WDNA 4I8CA 1N3XA 5CI5A 5DTBA 1JVXA 2V3TA 1LFGA 4LVQA 3FXUA 1LCTA 2Y7RA 3DELB 5FTIA 4OZ9A 4QFPA 5L9SA 3ONMA 4AB6A 4WKMA 4OHNA 2DXYA 3EPEA 3TODA 2OCUA 3H6TA 5IAIA 5ICQA 2LAOA 3C34A 1DOTA 1FQDA 1ZTYA 3MP1A 3O29A 4KQPA 3KSJA 3EQ1A 1URDA 2R71A 3M3LA 1P1NA 3QXMA 4Q30B 4ELRA 3IX1A 4N13A 4X9TA 3RNNA 4P0GA 3MQ9A 3H3GA 4H1XA 1FW0A 5I2KB 5JEIA 3K00A 3GZGA 4QHQA 5B7DA 3C32A 3FZVA 4QRZA 4N07A 1Y3QA 2V3UA 4NF8A 2QS2A 1OVBA 1QULA 3MVWA 4IGRA 4TOZA 4H0WA 4KHZE 1WVJA 4KYSA 4QSEA 5H8QB 2THIA 4QSCA 3CFZA 3W9VA 3V83A 2ZYKA 3IORA 4LONB 1DSNA 2VGQA 3VVEA 4EDPA 3TCHA 3HHFA 2XXVA 3CVGA 1MY1A 5CM6A 3MZ1A 1DMBA 3PMXA 2NOOA 2O7UA 4TLLB 4LZ7A 1Y1ZA 4G2ZA 3KN7A 4QF9A 3E9XA 3ECRA 1B6HA 3K02A 2V84A 4XIGQ 5DEXA 2I4CA 3FJ7A 2DS9A 4ZS9A 3LR1A 4AB5A 4YICA 5B70A 2OWTA 5I59B 3MVXA 1B2HA 3FGSA 1LB8A 4KCDA 5I57B 1SQYA 2ZYOA 4IGTA 4FJPA 4U2RA 4F3SA 3M3KA 2QMXA 3SEWA 1OLCA 1B40A 2XXXA 4YMBA 4KFQA 4C1UA 4LZ8A 3EF7A 4R73A 3N26A 4JSDA 3HN0A 3T22A 4POWA 2ALUA 3TPAA 3GLBA 5KCJA 3O66A 2YLNA 1MDP1 2RCBA 2ZNSA 3IOWA 2O68A 4KCCA 3H6WA 2D5WA 1EZ9A 1XVXA 1A99A 1FTKA 2I3WA 2VHAA 3PPPA 4IY5A 2VP1A 5TP9B 5TPAB 1IITA 1BIYA 2REJA 3QUJA 4NMYA 2Q9TA 1P1QA 1RYOA 2P1SA 3N6TA 1OVTA 3BFUA 1NH7A 3K6UA 5CBRA 4DE8A 2ZXTA 4F22A 1FTOA 1M5FA 2ONRA 5I59A 3PPQA 5L8DA 1H3DA 4GD5A 4PFWA 3BKIB 4YB7A 3U93A 1B4HA 4E0XA 3MC2A 1UTBB 1MM7A 3DP4A 2H4IA 2QL3A 3UP9A 4I62A 2I4BA 1Q35A 1AMFA 1FTLA 3FVOA 4JXIA 2Y84A 1YTVA 5HBCA 4ZEDA 3TELA 3TCGA 1MM6A 4JWYA 5DVFA 3FV1A 2OZZA 2B65A 2GRVA 3B6QA 4ND9A 3OSQA 2ZYNA 3PMWA 4F39A 2RC8A 4FAJA 1B3EA 1BP5A 4YZZA 1MS7A 2Y7WA 3C31A 1FCKA 1QUKA 1SYHA 4U4XA 1N0TA 3LBSA 4MLQA 1NKXA 1LBBA 3H4ZA 1H44A 4G4PA 2XD2A 3RT6B 2UVHA 5AA2D 2E0SA 2F36A 1Y1MA 3KN3A 4DXBA 2AL4A 3TCFA 1A55A 2I48A 3U8QA 2XHDA 4NEDA 4P0IA 3UIFA 2V93A 1I6AA 3CR9A 1I6QA 2NXOA 3K01A 5AA4B 3TTLA 1USYE 4NWCA 5M2VA 1IIWA 1IQ7A 1Y3PA 3MVYA 3W9WA 3C35A 3TDJA 4F18A 5FHMA 3VVDA 2QPQA 4MH5A 4ONYA 4PP0A 5TPAA 5TP9A 3G3FA 1LB9A 4DCYA 2Y7KA 3MWBA 4FE8A 5AA3A 4HCWA 3IR1A 4U21A 3KJ7A 3T96B 4H65A 3PU5A 1JETA 3FVGA 4RA1A 2HXWA 4KD5A 3KGCA 2HAUA 1I6BA 1R6ZA 3N94A 3KZGA 4ZE8A 4NWDA 4BDOA 3HO7A 1OMPA 1LAHE 3LC8A 4NTLA 1SW5A 1PB7A 2XX8A 1UTBA 4ZZAA 4F1UA 3PUXE 1A8FA 1MXYA 1P99A 3VXCA 1MXWA 3MZBA 1SYIA 4G77A 3FXQA 4PETA 5KZTA 3KOSA 1YCJA 3RY3A 1JEVA 1B51A 2Z23A 1F9BA 4I9DA 1DTZA 5L9OA 5AE4A 2HZKA 5CMCA 2H5YA 4IY6A 3EN3A 4IO6A 5HPQA 3IOUA 2G29A 2OBGA 2XXPA 4OFJA 3C4MA 1MQDA 2XXHA 4QFOA 4ZEIA 4OXVA 1Y4TA 4F2OA 2XD3A 4R74A 3QIMA 2DE3A 1B3LA 3OO9A 1YAEA 3Q25A 2ESNA 4NF6A 4EQBA 3SETA 3E4RA 4H8JA 4LQ5A 2PMSA 4NF5A 1TT1A 5AA4A 1Y20A 4GL8A 3HHGA 4K3FA 1JNFA 1RYXA 1HSEA 3R26A 4LQ2A 1MQGA 3OELA 1HSJA 2F8DA 4LA9A 3T9UA 1A7LA 3Q26A 3D4GA 3LSFB 2DSFA 3RPWA 1Q1KA 4H67A 2V25A 4KYEA 1B4ZA 3EHSA 1N7WA 3SKPA 4XKRA 3PV0E 3KEIA 3UA8A 2G93A 4BDMA 4NF8B 1POTA 1XHYA 2NUVA 4R2BA 2DP8A 2F35A 3IJOB 1D4NA 1H76A 1HSLA 1PEBA 2XXWA 2ZNUA 1BTJA 4M1VA 3KOTA 4OQOA 5AA2B 1T0KA 4KPTA 1LSTA 4GOTA 1Y4CA 3PUYE 4X48A 1MY2A 1H43A 1JW5A 4IB2A 1CB6A 1LGBC 1OIBA 2Y7PA 4PFUA 3LUYA 4YKPA 3UN6A 1NMUA 3VLUA 5CC2A 4HS7A 5DEXB 1LLSA 2XXIA 4POXA 2PX1A 5F1QA 4GXAA 1ZJLA 3OSRA 3QK6A 1A54A 2DVZA 4DXUA 2H99A 1MXZA 2O6AA 3N6UA 3E13X 3FD3A 4LUBA 4OFOA 1FQEA 3AXFA 1KWHA 3BBRA 2DE2A 3HPIA 3PPOA 4H8IA 4U22A 4X1DA 5IKBA 4HCYA 2XXTA 2Z8EA 1M5BA 3V8XB 3LSLA 1PBQA 2HEUA 3A09A 3B6WA 1Y3NA 3M3FA 4NF6B 5L9MA 1EU8A 2HZLA 1GV8A 2PT1A 2QS4A 5H8NB 1DPEA 5I56A 1PB9A 3TTRA 4EQ9A 3B6TA 5KCJB 1S9TA 1M5DA 3A3UA 2DOJA 5ISUA 4ZDMA 4BDNA 3C36A 4YAHX 4ZE9A 3G7WA 1JW1A 3EHUA 3DP6A 4DLDA 3GXAA 4YB5A 1SI0A 3OXNA 3MP6A 1OQHA 4G8NA 3O97A 1RKMA 1EZOA 4Z7EA 5K2YA 4XKNA 4ESWA 5TU0A 1S7YA 5F7VA 2H9BA 3OD7A 3C33A 1URSA 4TQUQ 3O2AA 5CMBA 4NF5B 3TTKA 2V3QA 4EXLA 1XVYA 2B3BA 4MFIA 3QSLA 1LBCA 4G8MA 4RK2A 1SDXA 1OLAA 3O6GA 5H8HB 3T9HB 4Q8RA 4HTGA 2HQ0A 2I58A 4F31B 3MUQA 5H8SA 5K2XA 1JQFA 2NWJA 4THIA 1MY0A 3PD9A 2DYXA 1SW4A 3MW0A 4RPNA 3U92A 1MPBA 3CFLA 4RJZA 3ZKKA 3L6HA 2A5SA 3MVZA 3K4UA 4O3CA 4F1VA 1LAXA 3Q28A 1PC3A 5FHOA 1XT8A 4UACA 3G3GA 2RC7A 1FQAA 4ZZEA 2F6GA 3TMGA 2P0SA 2DWHA 3V89B 4MLVA 1UIVA 5ITOA 1NNKA 3RTFB 5EYFA 1ELJA 1O63A 4IO3A 4R6HA 5H8NA 1O7TA 3PD8A 4U4SA 4BLAA 4JBZA 2UVIA 4ELPA 5CMKA 3IK6B 1MQJA 3FASA 1SBPA 2E1SA 1B58A 2HCAA 4QFLA 4YKJA 4TLMB 3OEKA 4GWOA 3G3IA 4G68B 1QVSA 4XKPA 4F29A 3V5AA 1UTHB 4F3GA 2AIXA 4PQJA 1VFEA 3TKDA 1FTMA 1S50A 1ZIUA 4OERA 3PPRA 2Q89A 5I56B 2GH9A 2O51A 4FATA 4QFKA 3USDA 4OVJA 3PUVE 4DIGA 4ZEKA 1R9QA 3R6UA 3MP8A 5FTHA 2CMOA 4G8HA 2ONSA 3IB0A 1N84A 4H6DA 3CSGA 2H98A 1VSOA 4H5FA 3FVNA 1B7ZA 1LAFE 3CFXA 3K1NA 3KFMA 4GFRA 4O3BA 2XXUA 4QFNA 5EHMA 2BJJX 1IXIA 3M8UA 1LFHA 4ESXA 2XX9A 3WAEA 2D21A 3S9LC 2O1MA 4R2FA 3C9HA 1Z7ME 3H7MA 4RYAA 1OQGA 2REGA 5H8HA 3SEUA 5DVJA 3ZS6A 3TTNA 3SERA 2Q2CA 3W15C 1B7HA 2GFEA 3O9PA 3P7IA 2Q88A 2ZYMA 3FATA 1PDAA 1TFDA 2I49A 1QUIA 3OMBA 4IO2A 3TTMA 2AL5A 2DWIA 2KLFA 1MXVA 2RCAA 2UYFA 4IO4A 4YB6A 3RTWB 4HW8A 4JWXA 5BWJA 5BUUA 3MPLA 1AH5A 4F2QA 1SD3A 1P1WA 1MXXA 5H8FB 3TYHA 1B05A 1ZU0A 3ZKLA 4YMAA 3VV5A 1MH4A 4EQ7A 3GBAA 1UQWA 3WAFA 3H06B 3K0VA 3PGFA 4YU0A 1IZ1A 5HM4B 2O1LA 1QW0A 4KYDA 1USYH 1BKAA 1VR5A 1NNTA 4L17A 1O64A 1QUJA 5AA2A 2UVGA 1EH3A 1SVXB 1IEJA 5LOMA 3PUZE 3QYTA 3TZAA 3MZ9A 4NF4A 4G68A 1NH8A 1B5JA 5JK4A 1UTHA 2OK2A 2F34A 4RY1A 2OJTA 1B1HA 1D9YA 1VE4A 2UYEA 4EF2A 4PE5B 4FEDA 2ONKE 2DE4A 1GTKA 4JB7A 3TQLA 3HV1A 3TQWA 4BDLA 2O84X 3IOTA 3Q27A 2I0BA 2VOZA 5H8FA 3G3KA 2B3FA 2QSXA 3IO4A 2RKMA 4KI0E 3TEPA 1B0HA 1MY4A 4GLIA 3KBRA 4GQOA 4OENA 1MH3A 3RN8A 3GBBA 4AQ4A 2UVJA 3K6WA 1GGGA 1LAGE 3G3HA 3IOVA 3O6IA 1MQIA 2Q2AA 2QS3A 4RK9A 3VVFA 2AYSA 2F7BA 4R72A 2R6GE 4Q5TA 4R9FA 4ISUA 1D3KA 5ELVA 1LFIA 1CE2A 4ZEFA 3S9EA 4JSOA 2FNCA 1D9VA 1WODA 2A5TA 2GHBA 2VD2A 4FEBA 1URGA 3B7DA 1TWYA 1ZLQA 3RUMA 3JYRA 1B7UA 4OFLA 1ATGA 1B3FA 1B0LA 3FIRA 3ILUB 4LP2B 4OYVA 3U72A 3TUSA 2PT2A 4GF8A 2Z8DA 3LSXA 4GIZA 4U23A 5I2NB 5KDTB 2I0CA 3A3CA 4DXCA 3VDFA 3FJMA 4JDFA 1N3WA 1US5A 3U1OA 2YJPA 2M8CA 1Y9UA 4NE4A 5AA1A 1QJMA 4GVOA 4YKKA 3KJTA 4JWOA 3K6VA 3S9MC 3QAXA 3OO7A 4EXKA 3BFTA 4P11A 4PFTA 2ZMBA 1DPPA 3OO6A 2QS1A 2PBWA 3IO6A 3IB1A 4FORA 3CG3A 3K1PA 2NVUB 2F7CA 2F78A 1B5HA 2R9JA 3T9XB 4ZECA 3VLVA 4MF3A 3S9NC 4XTCQ 1JW4A 2DWJA 2XX7A 2O69A 3MBPA 1P1OA 2RC9A 3QUFA 4G68C 3PUWE 4OESA 1N76A 4OTEA 5H8QA 4F19A 1IXHA 1DTGA 3F11A 4ELQA 2FA7A 3L6GA 1TFAA 4UA8A 1FTJA 3K6XA 1N7XA 4OWDA 1NFTA 3TFLA 3HSTA 5KDTA 2GHAA 1B9JA 3CRBA 3HCQA 4WEPA 3MJNA 3EHTA 4R9GA 5DVIA 5DYHA 3ZSFA 1FQBA 2I3VA 2X7PA 5CRYA 2DWAA 1FQCA 3VFJA 2F6PA 3FV2A 2ANJA 2A5TB 2ZNTA 1SW1A 2HFBA 3G3JA 3SEXA 1AIVA 1M5EA 1R9LA 1MQHA 3SDFA 5I57A 1TXFA 2IA4A 2F7AA 3O6HA 4C0RA 3DM0A 1AL3A 3FVKA 2OWSA 3TAJA 3UGWA 3O28A 2HAVA 1B3HA 5I2NA 1US4A 2X26A 3IL1B 2W7YA 3I5OA 4U1OA 1M5CA 4QSDA 5FHNA 5I58A 1QKAA 1A8EA 3I3VA 3SEYA 4DZ1A 3S2VA 4IO7A 2Q8JA 1B5IA 1EZPA 1XOCA 4LZ5A 4R6YA 5A5XB 1B1XA 4N6PA 4WEDA 2PYYA 2F97A 4F3PA 2O7IA 5JTYA 3FXRA 1P1UA 1AOVA 3K2DA 1MG1A 2I6EA 1IXGA 3ILTB 2QJEA 3KG2A 3VXBA 3VLWA 1ZMGA 2YPNA 3DLNA 3FJGA 4OEUA 1MRPA 4KR5A 2RINA 3N5LA 3PMVA 4MBPA 4O3AA 2Z8FA 1L5TA 4ECFA 3JV9A 2XXQA 1GVCA 3MAMA 4EUOA 3IAZA 3OEMA 4PFYA 1A40A 3T9VA 1ANFA 1PB8A 4RXLA 1B32A 3I6VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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