2H6XA

Crystal structure of thioredoxin wild type in hexagonal (p61) space group
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Thioredoxin Wild Type in Hexagonal (p61) Space Group
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
source organism Escherichia coli
molecule tags Electron transport
total genus 31
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h6xA00
20GSA 5H5SA 1A8LA 3VI7A 2OE0A 3CRUA 2FWGA 3IHQA 4PURA 1EWXA 1U6TA 1HNAA 3TGZA 2D2ZA 3ZLPA 1B8XA 2OE1A 4DSSA 4IP1A 1PL2A 1XFLA 2MMZA 4ECCA 2RUFA 2LV3A 5GSTA 2JSZA 4XCSA 5F8BA 4CHSA 1R26A 2DJ2A 2LRCA 3GL3A 2YWMA 4LL1B 5F07A 4N0ZA 2MMNA 3HZ8A 1DE2A 1QQ2A 1BAYA 2CV4A 2ES7A 3IK9A 2GLRA 1NW2A 2TIRA 1TW9A 2LQQA 3KJYA 3EURA 4HU9A 5H5QA 3EYTA 3IBHA 3FZ5A 2JZRA 2C0DA 4MJAA 5C04A 1R4WA 2ON5A 4K1FA 2GGTA 3CSHA 5JWQB 4HZ4A 4JRRA 2YANA 5CYYA 1XXUA 1X5CA 1AIUA 3FR6A 2PMTA 4MZCA 1XIYA 1XWKA 2MMAA 2NPBA 5IPHA 1Q4JA 2G2QA 5DJMA 4XS4A 3RDWA 2HSHA 5IMAA 5ECSA 1GSEA 4XS4B 4YAVA 5CREA 2CQ9A 3TRXA 3US3A 4LMWA 1X9MB 5HFGA 2FHEA 2RM6A 3EMPA 1K0AA 2O7KA 3L78A 4PQ1A 2WGRA 4KA0A 1XWGA 1G6WA 1EEJA 1T1VA 3BCKA 3VI5A 2VLVA 1M99A 5D8IA 4TR0A 2C0EA 4L5LA 1XWCA 2K9FA 2CZ3A 2PPTA 4ZBBA 3HVVA 5EY6A 3CBUA 1F9MA 4GSNA 1GUKA 4KNDA 3TKSA 1TK8B 5J5NA 1PKZA 3VPTA 2YV9A 1W89A 3GNJA 4IQAA 3CRTA 3N9JA 1WIKA 5EPFA 5DQSA 2J23A 1SK1A 1OC9A 3DVXA 3KGKA 3DEXA 1VF2A 4WETA 2J9HA 3QD9A 1NSWA 1I9DA 3FYGA 3LXTA 1OYJA 2BJXA 2NVLA 1PSQA 4IQ1A 5CRGA 2R6KA 3ZVJD 4RI7A 2LJKA 5ECRB 5H5RA 5IMCA 5IOXA 1A24A 3C1SA 3UEMA 3HXSA 1DSBA 5AN1A 2H75A 2YOIA 3QDNA 3FEUA 4GSSA 4Q5QA 4MMMA 2IN3A 1SD8A 2DJKA 4LLRA 1GRXA 3PINA 4G9HA 2X8CA 3ERWA 2B3SA 3KZQA 1J0FA 4G19A 1JZOA 2MYGA 1SL2B 4AJ6A 3EMXA 4IVFA 5ELGA 3UBLA 1V40A 3IXRA 2PERA 2MMOA 2AJQB 1R7HA 2ZNMA 1QFNA 5G5FA 6GSSA 3L0HA 3Q19A 2P0GA 2X99A 3IK7A 3EE2A 3TB2A 2X8GA 3W8SA 4POMA 4XRAA 5J41A 1QUWA 5ECIB 3NOFA 1F6MC 3GH9A 5IQYA 3KIJA 4ECJA 3HKRA 5JCUA 2KUCA 2XPEA 1VRSD 4V1Ag 5D9VA 5IMZA 1OE7A 3A2XA 5E4WA 2P5RA 1AC1A 2JL4A 3ZZXA 1GL8A 3I43A 1M2BA 1AQVA 1GUHA 2I4AA 4KW6A 3F9UA 3APSA 2H1DA 4IP6A 4GF0A 11GSA 2WULA 1JHBA 2WCIA 1PGTA 5F06A 6GSXA 1YY7A 3ZRDA 3W6GA 3C1RA 4IGJA 2I81A 1EGOA 2FCHA 4GTUA 2GSRA 5ENUA 3ZREA 2H66A 5GZZB 2HLSA 2VCQA 1AW9A 1AUCA 4O32A 5DCGA 1K3OA 14GSA 4NAXA 2OA7A 3ZMKA 2BTOT 2VLTA 2H72A 4L8EA 1Y6EA 3A5WA 3RPNA 1GTBA 5EL8A 4TR3A 3UOMA 4XS1A 4NXIA 1I5GA 2OACA 3EVIA 1AAZA 2EIQA 1T00A 1EP8A 1T4ZA 2L57A 3DGQA 3GH6A 2L5OA 3TJBA 4YQMA 3WT2A 3F4SA 1VF3A 1YJ6A 4PGTA 3H8QA 4OD7A 3GL5A 3KM6A 1CQGA 2GZYA 1LJRA 2FWFA 2L59A 4OFTA 17GSA 1SJ6A 2LNTA 2IWTA 2LNSA 1ZOFA 2GQKA 3G7JA 4IJIA 4FYUA 3DIEA 3G7IA 3FRCA 5IM9A 3D0ZA 1SKWB 1VF1A 3HJOA 3GTUB 3HD5A 4IS0A 4FYCA 4KX4A 4KSOA 3LJRA 2X8HA 5LCZA 3TOTA 1HNBA 3LXZA 1WOUA 2LKUA 2FWHA 4IN0A 3E9JB 2VUPA 2WRTA 4EKZA 2AAWA 4MDCA 3RAZA 3HVSA 3GUSA 4YQVA 3D5JA 4EVMA 2B5XA 3EINA 3GN3A 4OCEA 1AQWA 2FGXA 18GSA 3GYKA 1A23A 4BWQA 2ON7A 3TKQA 6GSYA 2HNLA 1ACVA 5A4WA 2VIMA 4L0WA 2FY6A 3ZYWA 1GTIA 1LU4A 3V1WA 1RW1A 1FW1A 4N0VA 3LORA 1EP7A 2ZUPA 3TDGA 3W8JA 1WPIA 3RHCA 4F0CA 4L0UA 1KTEA 3IE3A 4BWSA 2IIYA 4PQHA 3MSZA 6GSTA 3LWAA 1TDIA 2DSAA 4G2EA 2YJ7A 1JLVA 3GHAA 2L6DA 2IMEA 1GNEA 2KLXA 3N5OA 4BPYA 1ERTA 3UMAA 1SL1B 2H6ZA 4K2DA 1HQOA 3GRXA 2FLSA 3BOAA 4MLYA 2I1UA 2DJ0A 4WF4A 1EEMA 3HJMA 2QKEA 2MBSA 4JE1A 2B1KA 1K0CA 3D6IA 5AGYA 4F0BA 2YJHA 2Z9SA 1WP0A 4K7OA 2PU9C 2R2JA 1A0FA 1THXA 4MF5A 3GX8A 5AIVA 3CSIA 5B6NA 1TK5B 3O3TA 3KTLA 3IA1A 4K7NA 1MEKA 1SK0A 5IIZA 3H79A 4OFNA 2KHPA 4KCAA 2YPMA 3S9FA 4E8HA 2EIRA 4MK3A 4IBPA 4Z7XA 2GQMA 1EV4A 2DC5A 3KP9A 2V6OA 3HY2A 3IAS2 4K0GA 3F6DA 1TTZA 2B7KA 2WFCA 1BQ7A 2OJLA 2VCWA 4OMVA 2LRNA 4D73A 3DD3A 2M72A 2JSYA 4K0NA 3WT1A 2CA8A 5HR0A 4HZ2A 3CXGA 4ZB9A 2L4CA 4CDOA 2N5FA 3GKKA 5G2ZA 2L5LA 4MF6A 2XC2A 1O8XA 2IMKA 3GFKA 3UARA 3QAGA 4GXZA 2ZCTA 4F03A 5DCHA 1K3LA 3GMFA 2O8VB 2EIOA 2VM1A 3R2QA 4K6XA 4EDZA 1SJIA 1MTCA 1O73A 1XVQA 2QC7A 1Q98A 1Z7PA 1PMTA 3PH9A 1KBNA 3WGDA 3IOSA 2LTKA 5A4UA 4PX1A 1YDKA 4I97A 3KH7A 2H30A 4GCIA 3C8EA 2XHFA 2DMMA 2OBKA 5IO0A 4MA9A 4O7HA 5IMFA 4FO5A 3QAVA 2JADA 2TRXA 5ECMB 2NTOA 2VCVA 2HZEB 1BYEA 3WGEA 3ME7A 3DKSA 4HQSA 5IPGA 2AB6A 1SL0B 2PVOC 1F2EA 1B4PA 1GSSA 3UAPA 3U5RE 2MBTA 4EDYA 5ECPB 1VF4A 3I69A 2R37A 2IL3A 1OKTA 2V1MA 2HXKA 1OVNA 2IFQB 1ERVA 5ECLB 4P3YB 3QFAC 3F8UA 2RUEA 4GSTA 4Q5NA 1LBKA 2DBCA 2GT6A 1OKDA 2DJJA 1N8JA 1GWCA 1BX9A 1OC3A 3ME8A 2LEGA 3TJJA 5DAKB 3ZTLA 5IMVA 3LG6A 4PXOA 1K0BA 8GSSA 3WD6A 3ISOA 1M2DA 4KDXA 3C7MA 1MDJA 2VL2C 4JR4A 1R5PA 1ZCPA 1TI3A 4EXJA 4ZL7A 2HT9A 1FAAA 1RQMA 4POLA 4ISDA 1G6YA 5B6MA 3GKXA 1GSYA 2PVQA 3Q18A 4JEDA 2OBIA 3QOUA 3LYPA 4X0XA 3D4TA 1MD3A 3M9KA 22GSA 3LFLA 4MCUA 3FZAA 4KGIA 3ZITA 2YWNA 4L5OA 4EL1A 3KH9A 1PA3A 3FZ4A 5D73A 5ECHB 5G5EA 1SK2A 1GTAA 5HFKA 1ST9A 4XTSA 1Z9HA 13GSA 2CAIA 1GSUA 4TXVA 3VWXA 2H1AA 4HJMA 3M8NA 5CRHA 4MJCA 2I9HA 1PN9A 4BA7A 2F8AA 3LEFA 1BG5A 1M9BA 2B7JA 2X64A 5G1KA 3QAWA 1XW9A 1YKAA 3GSSA 4NV5A 2K18A 3TCOA 3QFBC 2HI7A 3CYNA 2PGTA 1IYIA 1K3YA 3APQA 5IOWA 3TRPA 5DALB 1TRUA 2FA4A 3KMOA 2VD0A 1V9WA 1T4YA 2DJ1A 4NMUA 2OADA 1XZOA 3FY7A 5HQPA 3EU3A 1YEPA 3DRNA 3LYKA 5F05A 1WE0A 4GLTA 3TOUA 4NV2A 4ILFA 1URMA 4I2TA 4WBJA 4HEA2 2DJ3A 3FR3A 4RI6A 2HE3A 1YEXA 1BJXA 2YNXA 4TR1B 1A0RP 3CTGA 1FHEA 2R5GA 1V58A 4N30A 5F0GA 2HZFA 1W4VA 3GV1A 1KNGA 1JZDA 1E6BA 2DIZA 3TKPA 3CSJA 2K8SA 5A5KA 5G30A 5ELAA 4WKWA 4TOPA 2I3YA 3ZL5A 1SD9A 4ZIJA 6GSVA 3NZNA 1GNWA 2JU5A 1A2JA 4F2IA 2K6VA 3GIXA 2C8UA 5KN2A 3D4MA 2O87A 2H0GA 2M46A 2VL2A 1ERWA 2FWEA 3KTBA 3M9JA 1G0TA 2HFDA 4ZB6A 4K7IA 5D9TA 3A3TA 1QGVA 1UVZA 5ID2B 1EZKA 3BCIA 1NM3A 3GKMA 5IMDA 5J3RA 3F63A 1SU9A 1AXDA 5J9BA 4H86A 3H1NA 1S3CA 4DSRA 5J4UA 4TVEA 4HU7A 1TKDB 3RPPA 3P90A 3H93A 2C80A 4IJ3A 4J56E 2V32A 3C71A 3GTUA 2QSIA 4OWYA 2M80A 4DSQA 3EU4A 4WR5A 2VCTA 2H71A 4JZQA 3ZFBA 3MWHA 3M3MA 4F9ZA 2WB9A 4XHMA 4YAPA 2IJYA 1EOGA 5DDLA 2REMA 1K0DA 2P31A 3GKNA 1A2MA 2F51A 3J7Yk 3HHVA 2VL3A 3ZIJA 1IYHA 4TR4A 1M0UA 4EO3A 1B9YC 1BEDA 4ECBA 3SWLA 1GTUA 5D9WA 4J57E 1SYRA 2AHEA 1GP1A 1DBYA 2YV7A 1G7EA 4GWRA 3G9BA 3HYPA 3QPMA 3VFIA 2KP1A 3IAM2 4YQUA 1XVWA 2NBSA 1FVJA 4MJEA 3VWWA 1SYXA 2V41A 1PD21 1H4OA 3VURA 2HRNA 2AV4A 2CZ2A 1Z6MA 5JWRB 1XBSA 4BL7A 2GZPA 2P5QA 1XOBA 2L4QA 2H01A 3IDVA 1VGLA 2VAFA 2RM5A 2LUSA 3U6VA 2VD1A 2RLIA 2F9SA 1X9SB 3ZVJA 1A2LA 2H19A 1UC7A 2VLUA 1S3AA 4AJ8A 2KOKA 4TXOA 5GSSA 5D9XA 1FO5A 1GULA 4TXOB 2G0FA 4KDUA 4ML6A 2NDOA 4NHWA 5E59A 5CNWA 2C0GA 4HI7A 2GZZA 1GUMA 4ECIA 4KUNA 3LQ7A 3ERFA 2E7PA 3QCPA 1ON4A 3TUEA 1PX6A 4X1UA 3HA9A 3UL3A 1M7TA 19GSA 3TKRA 4WR4A 1PRXA 1TRVA 2LJRA 4OO4A 4JBBA 4MH2A 3QR6A 4EF0A 3LSZA 3OR5A 1XW5A 1YQ1A 4O92A 3UVTA 2BMXA 3ERGA 1ZL9A 2WS2A 2VL9A 2FNOA 5DVBA 5J9CA 1Z6NA 1J08A 1TU8A 2A2SA 2E2MA 4NPBA 4PNGA 5LNKe 2KP2A 4QL7A 2JZSA 2F3MA 3EC3A 3RBTA 3BJ5A 4HQZA 4YH2A 3QMXA 4XRDA 2O89A 4ZILA 3NIVA 2GDRA 4V2LA 4JU5A 1FB0A 4OFMA 4DSSB 5G31A 1S3DA 4EE0A 2HZEA 3TJGA 2OE3A 1KEBA 5KN0A 4TKYA 1YF1A 1B9XC 1N2AA 5JCWA 4MP4A 4RQXA 4WEYA 3KCMA 1Z3EA 5JCGA 1MDKA 4ID0A 4WBRD 2VOCA 5GAPD 1F3AA 4AF2A 2C4JA 3APOA 2V2GA 3ZMLA 4HJ2A 3DVWA 1X5DA 4X43A 2C1YA 3UBKA 1T3BA 1XWBA 2YWOA 4GQCA 2GT5A 2HYXA 2IFQA 3TJKA 1SENA 2H76A 3L9VA 2A2RA 3KEBA 1XPVA 4Q5RA 5DQYA 3FK8A 3EWLA 3DYRA 3HCZA 3K8NA 7GSSA 2IPAA 3O6TA 5ECKB 5DAKA 3HZ4A 2L6CA 1O6JA 1XWAA 3FKFA 4TW5A 3FW2A 5HFIA 2VCZA 2B6MA 4ACSA 4I5QA 4V1Ap 5CP1A 5A4VA 3E0UA 3VK9A 4AJ7A 3TKSE 2R4VA 4EC0A 1EGRA 2WJUA 4OCFA 2CX3A 1TI1A 3F3QA 3Q6OA 2YWIA 2PN8A 1ML6A 3M1GA 5LD0A 1E2YA 4WXTA 5AISA 2YCDA 1SJZA 4AGSA 3ZFLA 4LMVA 1MD4A 3UJ1A 1X5EA 4XS6A 1X9WB 5ECNB 2E0QA 4MABA 5CAXA 3JCML 1FVKA 3D22A 1B48A 3IR4A 1F3BA 1MDIA 5AIXA 4PUFC 3KD0A 5B7CA 3SBCA 1OC9B 2H73A 2GQLA 3IC4A 1GH2A 1YF0A 2H1BA 2JACA 3PGTA 4ULXA 1WMJA 4HUAA 1ZYEA 1XW6A 2H6XA 2JZTA 2H1GA 4V2NA 1UA5A 2CVKA 2ALBA 3L9UA 4MPGA 2DLXA 10GSA 1GSFA 2VO4A 2FUG2 5KEJA 2LSTA 1U87A 1RK4A 1ZZYA 2K8VA 4K9ZA 2LS5A 2C0FA 2GTUA 3WGXA 1EV9A 3F0IA 2XPDA 4I2UA 5DALA 4KSMA 4NWYA 1XOAA 4KDYA 1B4QA 1HNCA 1TRSA 2R3XA 1U88A 5CRDA 5G1LA 2QGVA 3PR8A 5INYA 4FH8A 4BVYA 1U3IA 3HDCA 1UN2A 4TR1A 2DIYA 3HJPA 3VWUA 3M0FA 3FHKA 4GQFA 1FOVA 1WRYA 1V2AA 2VM2A 5CO3A 3O76A 3I6AA 2H8LA 5KN1A 1QMVA 2CT6A 12GSA 1T7PB 3VLNA 4E8EA 2N5BA 1O7UA 3CTFA 3DXBA 2LQOA 5HR2A 4MJBA 1WJKA 4I6XA 1TP9A 1ERUA 1J9BA 4OO5A 2YN1A 2N5AA 1X0RA 1V57A 3MNGA 4HDEA 1K0OA 2AYTA 2FD3A 1PL1A 3MDKA 1USBA 2MZCA 2LRTA 3P2AA 4KE3A 1K0MA 5B8BA 5FWGA 1AQXA 5D96A 4KAEA 1ZGNA 3C73A 1TOFA 1NHYA 2YP6A 5ID2A 1NHOA 3F4TA 4F82A 2IMFA 5CRWA 3I9V2 3IV4A 1V98A 4IHUA 1YKCA 4DEJA 5DJLA 2H6YA 2H70A 4PNFA 1ZYQB 1C72A 3L4NA 1GSDA 4NHZA 9GSSA 1FB6A 4POKA 2GSQA 1JZWA 2GS3A 1HYUA 1T8EB 4GRFA 1JLWA 4Q5FA 5EVOA 3TRQA 1Y25A 4FYBA 5FHIA 4DVCA 1TRWA 4ML1A 3BBYA 1THOA 2OKAA 5C00A 2HSYA 4MZBA 3VPQA 3J7Yb 4EUYA 6GSUA 1G7OA 4ZB8A 5L71A 1OE8A 1ZMAA 1FG4A 2PBJA 1JFUA 3F3RA 6GSWA 1ABAA 4I8BA 1H75A 5JWOB 1DE1A 1JZRA 2CAQA 3IPZA 5COHA 3F6FA 3TJFA 4BVXA 2C3QA 3D21A 2O85A 3A2VA 3DWVA 2DMLA 5ECOB 4ZL8A 2IMIA 3E3EA 2C3TA 3GURA 4O5RA 4LA1A 2EC4A 4ZBAA 4RUVA 4V2MA 2H0IA 4PQIA 4KCEA 2H0HA 4HOJA 5HR3A 5IO2A 4N10A 4QQ7A 2H74A 3CMIA 2GSSA 2RIIA 1K0NA 2B1LA 1OC8A 3GA4A 3HVXA 4TRXA 3RHBA 4MPFA 1TJDA 3FR9A 4POBA 1TK0B 4KB3A 4MF7A 4JR6A 1YZXA 3GX0A 4K8MA 1DUGA 4J2FA 1TXXA 1O8WA 1PKWA 3L9SA 1GSQA 2WZ9A 2GSTA 5ABRA 16GSA 1PX7A 4ZXGA 1A8YA 3H4KA 2YZUA 3DMLA 1SKSB 2CVDA 5D93A 3P7XA 2AUVA 3VWVA 2XBIA 2F8FA 4IKHA 4RQRA 2LJAA 4ZL9A 5B8AA 1Z7RA 4MH3A 2FA8A 1SKRB 4N11A 4QL9A 2PWJA 2GVPA 4MZWA 4PUAA 2VCXA 1QK8A 2PUKC 3BD2A 3P8WA 1EOHA 2C3NA 2XBQA 3TKSC 1GLPA 3A2WA 3ZIVA 1R5AA 1F37A 3G7YA 2E2GA 4G10A 1O85A 4KH7A 1PQNA 1XCCA 3IRAA 5ECQB 4HS1A 3ED3A 3LGCA 2CVBA 3UVHA 3KP8A 3AY8A 4WF5A 1M9AA 3F4RA 5FT3A 2A4VA 1ILOA 1QXHA 4CW9A 2B5EA 3MAKA 1GLQA 2V6KA 2TRCP 1O81A 1Z5YE 4TN8A 4ZBDA 2IMDA 1CQHA 1HD2A 4LL4B 5DBQA 4XIHA 3GSTA 2CX4A 3Q74A 1M2AA 1TU7A 5KN3A 3KXOA 2YZHA 1WWJA 3KMNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite