2H6YA

Crystal structure of thioredoxin mutant e48d in hexagonal (p61) space group
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADDYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Thioredoxin Mutant E48D in Hexagonal (p61) Space Group
rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
molecule keywords Thioredoxin
total genus 30
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h6yA00
5AN1A 1EWXA 3H4KA 4TKYA 4RI6A 3GUSA 5A4UA 6GSXA 4O32A 4YQUA 3DEXA 2CX4A 5B8AA 5ELAA 1EZKA 4AGSA 2F8FA 3O76A 2PERA 3N5OA 1OYJA 2C80A 2BTOT 5AGYA 3ZYWA 3GH9A 1PRXA 3P90A 4RUVA 4MCUA 2EIOA 3IDVA 2YJ7A 1JZRA 3C73A 5J3RA 1KEBA 4ILFA 2VD0A 3KEBA 3KTBA 3HHVA 2H8LA 2HFDA 3GSTA 2WDUA 2VCXA 1B9XC 5HFGA 3CSIA 3TJGA 5CRHA 3L0HA 1A2MA 2DJ3A 4LLRA 3UAPA 1CQGA 1FHEA 1AXDA 1SK0A 3U5RE 2EC4A 4ID0A 4CHSA 1J9BA 4MMMA 1YQ1A 4DVCA 1GSUA 2JADA 2H66A 3GX0A 4ZBDA 4E8EA 3C7MA 5KN2A 2LUSA 1NHYA 2VL9A 3GTUB 2YWNA 3DVWA 1THXA 2P5QA 3FR6A 4MZBA 1ZCPA 1R5PA 4EC0A 2LNTA 5FWGA 5LCZA 3FZAA 4Q5QA 5G31A 5KN3A 1EEMA 1K0BA 4OCFA 3UOMA 3IRAA 3ZITA 3DD3A 2O87A 5KN0A 2TIRA 3VFIA 1SL1B 4XS1A 1T7PB 5ELGA 1T4YA 2WJUA 4LA1A 3HZ4A 1M2BA 1O85A 2FUG2 2IWTA 1Q98A 3GMFA 5ECHB 1J0FA 5ECIB 2DJJA 3HJPA 4KX4A 4MDCA 4XIHA 5LD0A 3CRUA 2I9HA 4ISDA 1EOHA 4KW6A 4TW5A 2QGVA 3HYPA 4L0WA 3M1GA 4TVEA 1UN2A 3GKKA 4MA9A 4ZILA 4IQ1A 2VLTA 5D8IA 2GLRA 1FB6A 3ZREA 3QR6A 1PL2A 1SL0B 3EE2A 3DXBA 3EMXA 4PUAA 4HQZA 4X43A 5IOXA 1TOFA 2LRCA 3HZ8A 3UARA 3HVSA 4WEYA 4EE0A 3GFKA 4ZB9A 1URMA 5HFKA 3KP8A 2R37A 3GA4A 4ML6A 1M9BA 3LG6A 2X8CA 2CA8A 2IPAA 2VM2A 5ECKB 1UVZA 4POBA 3MSZA 2CVKA 2KP2A 3GTUA 3SBCA 3VWXA 3KH9A 2F51A 2X99A 3M8NA 3RPNA 1W89A 1R7HA 3VPTA 4TRXA 4Q5RA 1PX6A 1RW1A 1XZOA 1OKDA 4KA0A 1S3AA 3IAS2 1NW2A 1AW9A 5D9XA 1HNBA 2PUKC 2C0EA 1R4WA 2YCDA 4GTUA 4MF6A 2GQLA 2NBSA 1OAZA 1NSWA 1MTCA 2KHPA 2OKAA 3PR8A 4H86A 3D0ZA 4HDEA 3GKNA 3CYNA 1BYEA 4KDXA 4EUYA 3UIWA 1B9YC 1MDJA 2H74A 1FG4A 2DC5A 1BX9A 5AIVA 1PKWA 5JCUA 2OE3A 2MYGA 3A3TA 2R2JA 1A0FA 4KDYA 1JFUA 2B5YA 2GVPA 3HJOA 2MMZA 3WD6A 3PINA 2LTKA 3ZIVA 3FY7A 2VUPA 4MJEA 3JCML 3RBTA 1BG5A 1B4QA 2A2SA 3GURA 2PMTA 4PX1A 3TKSC 5ID2B 2CVBA 5GSSA 3IV4A 3GSSA 3IE3A 1DBYA 3KM6A 3WGXA 3LEFA 2CZ2A 4FIWA 2HYXA 3E0UA 5G5FA 1XWCA 3CXGA 1PSQA 3CTFA 4X0XA 3UVTA 3TGZA 3V1WA 1GLQA 3DRNA 5D96A 2C4JA 1V57A 2C8UA 1S3DA 2NPBA 5GAPD 2VLVA 3BJ5A 1AIUA 5ECPB 3HD5A 2YWIA 2XBQA 2VL2C 4HS1A 1ERWA 4IQAA 4EDZA 4XS6A 4PQIA 1SYXA 5J5NA 2VO4A 2FWHA 4F0BA 5IMAA 2IMKA 3EU4A 3FZ9A 4IP6A 2FLSA 3RHBA 1HYUA 4JR6A 4POKA 5JWOB 1TW9A 17GSA 4MJCA 4MZCA 2K18A 3N9JA 2AB6A 3WGEA 4F0CA 2ZUPA 1T3BA 2M80A 3HJMA 2X8HA 1AQXA 3LXTA 3L4NA 2FHEA 4ZBAA 1SD9A 1TRUA 2YANA 4CDOA 3F0IA 3LWAA 3UEMA 4TXOA 3ZLPA 3F3QA 3GX8A 3D22A 2YZUA 5HR2A 2L6CA 2PGTA 5ECRB 3L9UA 4K9ZA 1H75A 4IKHA 3O3TA 4IVFA 1G0TA 2H30A 3Q74A 2A4VA 4NAXA 1WRYA 5ID2A 2E2MA 4HZ4A 2ON7A 4PNFA 4ZL7A 2KUCA 3I43A 5D9WA 1ACVA 1A8LA 3C1RA 2REMA 3GYKA 2ALBA 3EWLA 1WE0A 3QAVA 5IO2A 4K0GA 1KTEA 2LSTA 4KSOA 3APOA 2QSIA 4F9ZA 2MMAA 1K0AA 4FYUA 1ILOA 4HU9A 3UBLA 2O85A 3CSJA 4V1Ag 3I69A 3HA9A 3GV1A 3QD9A 3KGKA 4F82A 6GSTA 1VRSD 3G7JA 1K3OA 4HJ2A 3VWUA 2GDRA 4ACSA 3KCMA 1Y6EA 4MABA 2H01A 5D93A 3DIEA 4EL1A 1Z9HA 5EPFA 3R2QA 3Q6OA 3WT1A 3BOAA 1YKAA 2GSSA 1F6MC 3TJFA 5DCHA 2FA4A 1SJZA 1FAAA 3K8NA 3WT2A 5DDLA 4OFMA 3UJ1A 2CVDA 2H70A 2RIIA 2G2QA 2RUEA 5DJLA 1JZOA 1O6JA 4OFTA 1W4VA 4K6XA 4TR1A 2L6DA 3IK9A 2YV7A 1PGTA 3P8WA 1EP7A 3M9JA 1GTBA 2P0GA 5DCGA 1QXHA 1UC7A 2WZ9A 3U6VA 1XBSA 1BQ7A 1TDIA 1YZXA 2RM5A 3FK8A 2PWJA 4J2FA 5A4VA 2E7PA 3F9UA 1SD8A 2JZTA 5G1LA 4XS4A 5G5EA 2L4QA 5C04A 2YWMA 4Z7XA 2HXKA 2VD1A 2YWOA 1ZZYA 2NTOA 1AAZA 2OACA 3QAGA 5DJMA 4DSSA 3DYRA 4K2DA 5CAXA 4GF0A 1KNGA 4N30A 4J56E 1PKZA 4F03A 2PVQA 3LYKA 5IM9A 1ST9A 2L59A 2G0FA 3EINA 4ZXGA 3ZIJA 3TOUA 5CNWA 2FY6A 3KMNA 2YN1A 5DBQA 4HOJA 1DUGA 1BAYA 2IMDA 2C1YA 4Q5FA 3PGTA 3LYPA 4MPGA 3F6FA 3LSZA 4BA7A 3GH6A 4FYCA 4XRDA 3H8QA 1EV9A 3UMAA 5FT3A 1GSEA 1HNCA 3TKSA 2H6XA 1XWAA 5B6MA 3LGCA 2HRFA 19GSA 3LQ7A 4EVMA 4K0NA 5ECSA 3RDWA 4MK3A 2LRNA 3L78A 5IMDA 1XXUA 5COHA 4V2LA 4RI7A 4XHMA 1SYRA 4LL4B 3L9VA 4JR4A 5ECMB 1GNWA 1I9DA 1GSYA 2DJKA 2VL2A 4PQHA 4XTSA 1AC1A 4IELA 4KB3A 2ZCTA 1BEDA 2E0QA 1O7UA 4IS0A 2GQKA 1OKTA 5EL8A 3IC4A 4IHUA 18GSA 2J23A 2WGRA 1QMVA 1V58A 1U87A 4ECIA 3C71A 3HVXA 1Z7RA 1FB0A 2K8SA 14GSA 4ZL9A 3EYTA 1GTUA 4P3YB 1TJDA 2FCHA 4V2MA 2ON5A 4ECBA 4I97A 2BMXA 2M72A 3VWVA 2I3YA 1TK0B 4MJAA 3ISOA 1N2AA 5DQSA 2KOKA 2H6YA 1M9AA 3APQA 4RQRA 1WPIA 3KJYA 4YAVA 2VCZA 1F2EA 2LQQA 2CAIA 2H75A 4PQ1A 2LQOA 1MD4A 2R6KA 2MZCA 1O8WA 4PGTA 2XPDA 4AJ8A 1MD3A 2H1GA 3F4TA 5HR1A 3VLNA 1PMTA 4OO5A 1E2YA 1X5CA 1XFLA 2B6MA 2KP1A 1VF1A 3HVVA 1SKSB 1ZL9A 2JL4A 3IR4A 4G9HA 3GN3A 4IN0A 5CREA 2WS2A 4BVYA 2V1MA 1LJRA 4I5QA 1YF0A 2I4AA 2RLIA 2AAWA 2OE0A 2AHEA 5F05A 1WP0A 1XPVA 3KXOA 4FO5A 1SJ6A 3CMIA 1A23A 1GSFA 2OA7A 4BWSA 2NDOA 3VPQA 2X64A 4EO3A 2VIMA 2WFCA 2H19A 1B48A 2H6ZA 2H1DA 3DWVA 1XCCA 3FZ5A 4N10A 1GUKA 3GKMA 2FA8A 2FD3A 1OC8A 4POMA 2VOCA 4HQSA 4TXOB 4EXJA 4DEJA 3S9FA 2B7JA 4JE1A 5CP1A 2R4VA 1A24A 3P2AA 6GSUA 4O7HA 1UA5A 2H1AA 2QC7A 3DMLA 4ZIJA 3ERGA 5GSTA 3F63A 4V1Ap 3E3EA 5LNKe 1MEKA 1X9WB 4ZBBA 3TKRA 1TU8A 4E8HA 4GQFA 3CSHA 4GRFA 4WR5A 3LORA 1XWKA 2EIQA 3ME7A 2JZSA 4NHWA 1EGOA 3QOUA 4BWQA 3VWWA 4XCSA 1U6TA 1XW9A 2DJ2A 1ZYEA 2C0DA 2N5AA 1B8XA 1WWJA 1AUCA 2DBCA 4BPYA 3FW2A 2VCWA 3HY2A 2HNLA 5F06A 2OE1A 1K0CA 3A2WA 2OBKA 3IAM2 5ECLB 3VI5A 4MJBA 3FZ4A 1Z6NA 1K0NA 1ABAA 1VF4A 1BJXA 1RQMA 1F3BA 4IGJA 3ZFBA 3EMPA 1J08A 3GRXA 4KSMA 2OADA 2DIYA 3QDNA 1YF1A 2DJ0A 4V2NA 3ZMKA 3RHCA 2VL3A 3TRQA 1LU4A 1GTIA 1X9SB 4ZB6A 1OVNA 1XWGA 1ZOFA 2JSZA 2K9FA 1G6WA 4WBJA 5IIZA 6GSWA 1FOVA 1M0UA 4GQCA 2YZHA 4NV5A 3ED3A 1DSBA 1GH2A 2C3NA 3FHKA 1DE2A 2O7KA 1U3AA 3GL5A 6GSVA 4TR1B 4DSRA 3AY8A 4DSQA 3ZL5A 1USBA 1GWCA 1SU9A 2IJYA 3LFLA 1V40A 11GSA 3D6IA 4PXOA 4YH2A 2VAFA 4HJMA 5JCWA 2GSTA 2M46A 5IMFA 4O5RA 5DALA 3H79A 2B5XA 1Z6MA 1THOA 2OJLA 1Q4JA 2CT6A 2XPEA 2F8AA 5B7CA 3TOTA 4WBRD 1O8XA 1KBNA 3KZQA 4XS4B 3A2XA 3RAZA 2AV4A 1PL1A 1XVQA 2GT6A 1V2AA 4K8MA 3FEUA 1ZGNA 3HKRA 3I6AA 4DSSB 20GSA 3IOSA 3KMOA 2ES7A 5IO0A 1JZDA 5DAKB 2VM1A 4AF2A 4TR3A 3US3A 4KCEA 1R26A 5DVBA 1AQVA 2LRTA 1GULA 2PN8A 3P7XA 5IMZA 4OO4A 4NHZA 1TI3A 3NIVA 1SJIA 1VF2A 1GRXA 2O8VB 2GGTA 5CRGA 1JLWA 1GSDA 4JEDA 2C0FA 4PUFC 3KD0A 7GSSA 5J41A 3BCIA 4RQXA 4N0ZA 4WKWA 3TDGA 3EVIA 5G30A 4MH2A 1C72A 2J9HA 4QQ7A 2CZ3A 2YV9A 4GSSA 3F6DA 22GSA 2XC2A 2H0GA 2YNXA 4G19A 1DE1A 1F3AA 1HD2A 2PBJA 1V9WA 5C00A 3IHQA 1QGVA 2MBSA 4MF5A 1VF3A 4IJ3A 3CRTA 1A0RP 1EEJA 2V32A 4EKZA 3Q19A 3GL3A 5L71A 3MDKA 5IPGA 3KTLA 3W8SA 2YPMA 4JZQA 5D73A 5IMVA 2V6OA 4I8BA 5J4UA 1ON4A 1GNEA 1G7OA 2IIYA 3BBYA 3QPMA 4MP4A 2HE3A 4EDYA 1SK1A 1X9MB 5DAKA 1O73A 2YJHA 1XOAA 4X1UA 4KUNA 3QFAC 4MPFA 2LJAA 1FO5A 4OWYA 5B6NA 1Y25A 1SENA 5F8BA 2VCTA 1ZMAA 3GHAA 1G7EA 5HFIA 1V98A 3G9BA 4YAPA 2IMFA 3EURA 5HR0A 2FWFA 2N5BA 13GSA 2P31A 4WR4A 1A2LA 2N5FA 3ZVJA 2FWEA 1TRWA 3TJKA 2BJXA 2DMMA 2MBTA 4WETA 3I9V2 5DQYA 2IFQB 3ZRDA 1XOBA 3FKFA 2L4CA 1EOGA 4K7IA 3M0FA 2K8VA 1ERVA 4GSNA 1WMJA 2FWGA 2LEGA 4HI7A 5A5KA 4HUAA 2QKEA 2GZYA 1WOUA 3QFBC 3SWLA 2L5OA 2YOIA 2GQMA 2HI7A 3ZFLA 4POLA 3C1SA 2HZFA 3D5JA 3UL3A 3QMXA 4I2TA 5EY6A 1TU7A 2LV3A 3TB2A 2LNSA 1PQNA 2V6KA 3UBKA 3G7IA 1GUHA 2HRNA 1QK8A 3EU3A 4MF7A 1TXXA 3F4SA 3LJRA 2GZZA 4KH7A 9GSSA 5ECOB 1TTZA 1XWBA 2MMOA 1T1VA 2XBIA 8GSSA 5ENUA 2E2GA 4MLYA 4TN8A 1TKDB 2B7KA 1X5DA 2PVOC 1TRVA 4K1FA 2V2GA 3IXRA 5E4WA 1OE7A 5KN1A 1PD21 5CRDA 2B1KA 2H72A 1TK5B 4L5OA 1CQHA 4GWRA 2LJRA 4FYBA 3NOFA 3FR3A 3LXZA 1FVJA 10GSA 4IJIA 1S3CA 1X0RA 2RUFA 1GL8A 1M99A 3WYWA 4QL9A 2IFQA 3BCKA 1ZYQB 4ECCA 3ERWA 5J9BA 1K3LA 12GSA 2AJQB 5H5RA 3C8EA 1GSQA 4FH8A 3DVXA 5AISA 4ZL8A 3CBUA 2GSQA 1F37A 3TRXA 3QCPA 1XW5A 4IW9A 2C3QA 2DJ1A 1GSSA 3ZTLA 4TOPA 1QUWA 3ZVJD 1TRSA 1O81A 4OCEA 2LKUA 3F4RA 4WF5A 2H0HA 5CO3A 1MDKA 1R5AA 4JU5A 3D4MA 5IMCA 2GT5A 4NXIA 4NWYA 2D2ZA 1A2JA 3IK7A 3VURA 2MMNA 3EC3A 1LBKA 2CX3A 5JWQB 2K6VA 1YJ6A 4Q5NA 1QFNA 1YY7A 4ECJA 5EVOA 1YEXA 1EGRA 1PX7A 4I2UA 3G7YA 1TP9A 4IBPA 2V41A 3TKQA 2JZRA 4AJ7A 1QQ2A 1TK8B 3TJBA 4O92A 1A8YA 5H5SA 2HSYA 3GIXA 2FNOA 3D21A 3VI7A 2C3TA 1U3IA 2C0GA 2B3SA 1OC9B 2AUVA 4JRRA 4IP1A 3GKXA 2DIZA 4J57E 3UVHA 2Z9SA 4JBBA 4N11A 3MNGA 6GSSA 3APSA 2WCIA 4GSTA 1XIYA 2TRCP 1IYIA 3IPZA 2HSHA 3ZZXA 1JZWA 5G2ZA 3FR9A 1WJKA 3HXSA 3TRPA 1K3YA 5DALB 5G1KA 2F3MA 3Q18A 2IMEA 2LS5A 1EP8A 4OMVA 2VCVA 1M2AA 5D9TA 2PU9C 5F07A 1YEPA 3CTGA 1SKWB 4KDUA 3QAWA 2DMLA 3FYGA 4ML1A 3TKSE 2L57A 4PNGA 2A2RA 1OC3A 3F3RA 4BVXA 5IPHA 2EIRA 1NHOA 1ERUA 2R3XA 2VCQA 5IOWA 1E6BA 1M7TA 5CYYA 3IBHA 1FVKA 3OR5A 2GZPA 2GSRA 3DGQA 3H93A 1SKRB 1T8EB 3W6GA 1YDKA 3TCOA 5A4WA 4ZB8A 5J9CA 1T4ZA 3L9SA 5AIXA 1I5GA 1SL2B 5JCGA 1N8JA 2X8GA 5ABRA 4XRAA 4HEA2 1PN9A 4TXVA 2AYTA 1YKCA 1SK2A 4N0VA 1JLVA 3ZMLA 5ECNB 5E59A 5H5QA 2H76A 1ERTA 3KP9A 4K7NA 2WULA 3E9JB 1OC9A 2IMIA 2PPTA 2H1BA 3HCZA 4ULXA 3D4TA 1B4PA 1Z3EA 2I81A 1JHBA 1AQWA 1K0OA 3FRCA 4LL1B 2I1UA 1T00A 3PH9A 4YQMA 1ML6A 3KH7A 4NV2A 1GTAA 3MWHA 5KEJA 2P5RA 1HQOA 3A5WA 3J7Yk 3ME8A 1K0MA 5JWRB 3WGDA 4GLTA 4CW9A 2JU5A 2L5LA 4D73B 2FGXA 4L8EA 2NVLA 1Z5YE 4BL7A 3RPPA 1XVWA 2HT9A 1G6YA 5HQPA 3H1NA 3A2VA 1WIKA 1MDIA 2HZEB 4G2EA 2XHFA 4MH3A 3TKPA 4AJ6A 3DKSA 5B8BA 2H73A 1X5EA 3TJJA 2CV4A 1GP1A 1IYHA 4EF0A 3IA1A 1M2DA 2RM6A 5GZZB 3ERFA 4KNDA 5IQYA 2JACA 4GCIA 2HLSA 5GAND 2F9SA 1NM3A 2IN3A 4L5LA 2DSAA 1U88A 2O89A 2R5GA 1F9MA 1FW1A 3MAKA 4WXTA 4G10A 2GTUA 4KAEA 4OFNA 1H4OA 4L0UA 2TRXA 4QL7A 1PA3A 2WB9A 4TR0A 4OD7A 2KLXA 3GNJA 4LMVA 2YP6A 3KIJA 4LMWA 2CAQA 4HU7A 2B1LA 4NMUA 3J7Yb 3VK9A 4KCAA 2JSYA 4KE3A 4NPBA 5ECQB 1Z7PA 4KGIA 5CRWA 3O6TA 3NZNA 4K7OA 2WRTA 2IL3A 2VLUA 2GS3A 1RK4A 16GSA 4YQVA 5FHIA 3F8UA 3BD2A 3TUEA 2H0IA 4I6XA 2ZNMA 2B5EA 2CQ9A 1K0DA 4D73A 1HNAA 4HZ2A 6GSYA 5HR3A 2DLXA 3HDCA 4WF4A 3M9KA 1OE8A 1TI1A 1GUMA 1VGLA 2OBIA 5F0GA 5INYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite