2H6YA

Crystal structure of thioredoxin mutant e48d in hexagonal (p61) space group
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADDYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
publication title Crystal Structure of Thioredoxin Mutant E48D in Hexagonal (p61) Space Group
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
total genus 30
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h6yA00
1FB6A 4NV2A 3ISOA 1J0FA 2FGXA 1HNBA 3QR6A 3K8NA 2IWTA 1A23A 3FHKA 1GTIA 4EDYA 4GTUA 4EVMA 1MDKA 3UBKA 3VI7A 3OR5A 1VGLA 3NOFA 3LYKA 2CV4A 3GTUB 5GZZB 5J9BA 2LS5A 4EDZA 1U3IA 3ZMLA 4ML1A 2HRNA 2E7PA 3EVIA 3A5WA 3EE2A 3A2VA 5CREA 5G31A 2JSZA 2X99A 3IC4A 3TB2A 4G19A 4JBBA 4NHWA 3PGTA 1I9DA 1SU9A 2M46A 2V1MA 5F07A 3TOTA 3TJGA 2YN1A 3CMIA 4NAXA 1Z7PA 4PUAA 3WYWA 3F4RA 5B8AA 19GSA 2IMDA 2CA8A 1B8XA 3FZAA 1HYUA 2FNOA 13GSA 5A4VA 1DBYA 4XIHA 3ERGA 3EINA 4I5QA 1T00A 3ED3A 1AQVA 3KGKA 2V6OA 4MPGA 3KD0A 3APOA 2I81A 3HXSA 1JHBA 3LSZA 2RM6A 2H1DA 3H93A 5E4WA 2KLXA 1TRWA 2PMTA 3RPPA 1GNEA 4BL7A 1YKAA 2P5QA 5GAND 4TVEA 1JFUA 5B6NA 2CVBA 5HQPA 1EOHA 1RK4A 3G7IA 5G1KA 3KEBA 5CP1A 5DAKA 4MMMA 3D22A 4ECIA 3KMOA 4LMVA 3HDCA 1B9YC 3JCML 6GSXA 4RI7A 2NPBA 1OC3A 2IFQB 2NVLA 1GP1A 4HQSA 3GKMA 4I2TA 4WR5A 2EIQA 3FR6A 4ECJA 2NBSA 4WETA 3D5JA 3F3QA 3LGCA 2I4AA 5J9CA 2FD3A 3O76A 5D96A 4KDXA 5LD0A 1KEBA 1K0AA 5D8IA 5EVOA 3F8UA 2QSIA 3DRNA 1S3DA 1WMJA 3EU3A 4IP1A 2TIRA 2OA7A 5IPHA 1XOAA 2OBIA 2O85A 2JZTA 1ZGNA 2ZCTA 1Q4JA 3C8EA 4ZL8A 5A4UA 1AUCA 2H76A 3C71A 1PQNA 1Z7RA 1U88A 2B5XA 5DAKB 3MAKA 3UBLA 3TJKA 2H0GA 4TW5A 2K18A 1PMTA 2HRFA 4IN0A 2GSSA 5ELAA 3VWXA 4G2EA 4TR0A 3FR9A 2JZRA 4KA0A 2CAIA 3GL5A 1HD2A 5EPFA 4NPBA 3QAVA 5DJLA 1N8JA 4I2UA 5F8BA 4MJCA 1MEKA 5J5NA 3ZFLA 2L5OA 2HLSA 2HFDA 2C0DA 2KP1A 3D0ZA 1G6WA 5CRGA 2CAQA 4KW6A 2X8HA 2FA4A 2GT5A 4GCIA 2EIRA 1DSBA 3TOUA 3M9KA 4HJ2A 4F0BA 2H6ZA 4K2DA 2PBJA 4DEJA 2CZ2A 6GSTA 1T7PB 3AY8A 5H5SA 4EL1A 4MPFA 4POKA 2V32A 5ID2A 2P0GA 3GYKA 2L4QA 3KP8A 1UC7A 1XOBA 5FWGA 3UOMA 5B7CA 4N11A 2F8AA 4ZBBA 4J2FA 1BJXA 4GXZA 5EY6A 2RUFA 2V2GA 3LG6A 1O8XA 4F0CA 1Q98A 3RDWA 3QPMA 2O89A 3DEXA 3TRQA 3W6GA 3HJPA 2XBIA 1B48A 4WF5A 2VCZA 1AAZA 1YY7A 2VCVA 1IYIA 1YEXA 3TGZA 3FY7A 5D9TA 3HVVA 4WBRD 1G0TA 2CQ9A 3G7JA 2PU9C 2N5FA 4FH8A 1XPVA 2AJQB 5D73A 4ML6A 3IHQA 1B4PA 1EEMA 3L0HA 3P7XA 2LJKA 2WULA 2C8UA 4XS4B 4MZBA 5ENUA 3ZTLA 4NV5A 4N10A 1YF1A 3GV1A 4PNFA 3GL3A 3WGEA 3ZITA 2LJRA 20GSA 2V41A 1O8WA 4WR4A 4EXJA 3VPQA 4L8EA 2H0IA 2DJ0A 2DBCA 5IQYA 4MH3A 2H1AA 4PURA 2E2GA 1BAYA 3L9UA 5HR2A 3D6IA 4NWYA 3IOSA 3I69A 2DIZA 3RAZA 4Q5NA 4HS1A 4Z7XA 2H71A 4GRFA 3Q74A 1OVNA 4LMWA 3UARA 1A2LA 5AN1A 5ECSA 3EMPA 2O87A 3MDKA 1OKTA 4KUNA 4IQAA 2H72A 1FAAA 3H4KA 1Y25A 3PINA 4IVFA 2FWGA 3H79A 4K7OA 2IJYA 2X64A 1SL2B 1CQHA 5ECLB 3GSSA 5KN3A 4HQZA 1MDIA 1GH2A 1CQGA 3GKXA 1V9WA 4JR6A 4RQRA 5G1LA 4DVCA 1FHEA 4GWRA 2LNSA 2LEGA 1XWKA 5ABRA 1PA3A 5ECOB 1R4WA 1LU4A 4PQIA 3G7YA 4BA7A 4RUVA 3GFKA 2GQLA 1SJ6A 4FIWA 4MK3A 2YNXA 2RM5A 5CRHA 4I97A 4OWYA 5AIVA 1TRUA 1PN9A 4X0XA 2LNTA 3VK9A 2VL3A 2HI7A 3N5OA 5D93A 4KH7A 2HE3A 2HSHA 2M80A 2YP6A 4LLRA 2L59A 2DJJA 3IR4A 4FYUA 1EGRA 2AB6A 2D2ZA 3WGXA 5A4WA 3F9UA 3ERFA 3L9VA 3UIWA 2J9HA 4EF0A 2B3SA 1ST9A 4K7NA 2VD0A 2E0QA 3ZRDA 3IK7A 4HJMA 1JLVA 1XBSA 5DQYA 1SJZA 3C1RA 3P8WA 5JCGA 2M72A 2PGTA 4LL1B 2HT9A 5C04A 2F51A 5G5EA 1AQXA 2X8GA 1TXXA 4IJIA 3VWUA 1MD3A 1KBNA 1R7HA 5COHA 3HVXA 3ZLPA 3DWVA 5F0GA 2F3MA 1XW5A 1RW1A 3M1GA 5KEJA 2IIYA 4MABA 1WIKA 3UMAA 2VLUA 1EZKA 1FB0A 4JRRA 1NSWA 2C4JA 3U6VA 3P2AA 2LSTA 2WB9A 3IPZA 3WGDA 1ML6A 4JZQA 2A2RA 3CSHA 3KH7A 1M99A 3PH9A 4ZXGA 3KP9A 1U87A 2YWNA 2XHFA 4ILFA 3BOAA 3CSIA 2VUPA 3H8QA 1ZZYA 1AQWA 3TRPA 22GSA 2NDOA 3R2QA 2CX4A 4ZB6A 3U5RE 4ID0A 1QUWA 3BBYA 3H1NA 2G2QA 4ECBA 5DDLA 1TW9A 2V6KA 2VAFA 5DVBA 2VCTA 4DSQA 5DCHA 2LJAA 2GLRA 3DIEA 2C3TA 5DJMA 3VWWA 1M9BA 3HJOA 3KXOA 4ACSA 5ECQB 1BX9A 1I5GA 2VCXA 4MJEA 1EGOA 3J7Yk 2VD1A 1HQOA 3W8SA 5CNWA 1Y6EA 1DE2A 1HNCA 4NXIA 2YV9A 4K9ZA 2L6CA 2PUKC 1R5PA 1SD9A 5D9WA 1ABAA 2FWHA 1QXHA 2ALBA 2A2SA 1PKZA 1N2AA 4MDCA 2BMXA 1SKWB 4DSSA 3CTGA 2B5EA 5GAPD 2N5BA 1FOVA 1DE1A 1A0FA 1WWJA 2DJKA 2ON5A 3IXRA 3UVHA 5G30A 3HCZA 1B4QA 1XIYA 4FO5A 3EMXA 3I9V2 3UVTA 4OCEA 4IELA 4POLA 4TN8A 4OO5A 3GH6A 1EV9A 3A3TA 2EC4A 1NM3A 1M2DA 5HFGA 5GSSA 3M0FA 3ZVJD 2B1KA 4WBJA 4V2MA 2DJ3A 3HD5A 3RBTA 4OD7A 4WEYA 2TRXA 3GX8A 4LA1A 4KCAA 1ERTA 2HSYA 5CYYA 2VOCA 1VF4A 4G9HA 1YF0A 6GSVA 2FHEA 2XPDA 4HZ2A 1U6TA 3GN3A 4MLYA 4V1Ap 3TKQA 3GNJA 3IRAA 3CBUA 2H6YA 11GSA 4KNDA 1W89A 3CRTA 2DSAA 4HEA2 4XRDA 3ERWA 2GQMA 1GSQA 5F05A 3P90A 1V57A 2JACA 4YQMA 2DIYA 2VO4A 4WF4A 2PPTA 1GUMA 2H8LA 5IMAA 5HR0A 2MYGA 4K6XA 1FW1A 4IS0A 2OACA 4ZILA 3GKNA 1XWAA 3M3MA 1GRXA 3ME7A 5ECPB 1XVWA 1TKDB 12GSA 3UL3A 1OC8A 4JEDA 3QAGA 4HOJA 4L5OA 2L4CA 3FZ5A 4OMVA 4KX4A 4HUAA 2YWOA 3E3EA 2YCDA 1SJIA 4Q5QA 2WS2A 1AIUA 2RUEA 5IOXA 1GTBA 4BVYA 1RQMA 5GSTA 3DD3A 1T8EB 1EEJA 2BTOT 1J9BA 2FWEA 1XZOA 4ZBDA 3VI5A 1T3BA 2H70A 1TK0B 1S3CA 2VCQA 4XHMA 4TR3A 2LTKA 2OKAA 5HR3A 1A8YA 1T1VA 3UAPA 1USBA 4X1UA 2CT6A 5HR1A 3LYPA 1URMA 4F2IA 1XVQA 1TJDA 3HYPA 5IPGA 2H74A 4GF0A 4KDYA 4KCEA 4MJAA 1SD8A 3TCOA 1E2YA 1TTZA 2B7KA 2FWFA 2J23A 5CO3A 4I8BA 3TKPA 2JSYA 1S3AA 1XXUA 4ZBAA 4EC0A 3HZ8A 3I43A 3ME8A 2H6XA 1THOA 1OC9A 3KMNA 2X8CA 4OFMA 4H86A 3FW2A 2MBSA 4O92A 1X9SB 4TR1A 1YEPA 1BG5A 3KZQA 3EC3A 2E2MA 3HVSA 4ZB8A 2AHEA 3S9FA 1XW6A 1QK8A 4AJ7A 1KNGA 3FKFA 4L5LA 2JZSA 2GSTA 2K9FA 5KN1A 3CSJA 4N0VA 1ZOFA 2REMA 5KN0A 4YAPA 3KJYA 2I1UA 1GLQA 4GSSA 2H66A 2YZHA 4O32A 16GSA 2B1LA 2H73A 1FG4A 1XW9A 3N9JA 5ID2B 3KCMA 4IJ3A 5JWOB 2G0FA 2GDRA 1EWXA 5ECIB 3TJFA 1B9XC 3L4NA 1K3OA 2A4VA 1F6MC 2QKEA 10GSA 1G7EA 4DSRA 6GSWA 2WDUA 6GSUA 1OE7A 6GSSA 1XWBA 3VURA 4F9ZA 3VWVA 3FEUA 2YOIA 4OCFA 2P5RA 5IM9A 4TKYA 4X43A 2DLXA 4JU5A 4MJBA 4AJ6A 4NMUA 3NZNA 2MMZA 1GLPA 1PL2A 3BCKA 3IV4A 2R5GA 4YH2A 2XPEA 3HA9A 2K6VA 1T4YA 1BQ7A 3LORA 2H0HA 4V2NA 3TDGA 3M8NA 2MBTA 1G6YA 4IBPA 1QGVA 3HY2A 4I6XA 3HKRA 1SKSB 4JE1A 2C0GA 5D9XA 4KSOA 8GSSA 2ES7A 2OE1A 1JZOA 1SK0A 2GZPA 2DMMA 1M2AA 4IW9A 4MZCA 5CAXA 2EIOA 1TRVA 2KUCA 4TRXA 3FK8A 1GWCA 1PD21 1QFNA 1SK1A 1X0RA 4MH2A 2H75A 2CX3A 2CZ3A 1VRSD 3KH9A 1YZXA 1TI1A 3KIJA 4Q5FA 3LXTA 5LNKe 2IMFA 5ECHB 2GSRA 2WJUA 2GZYA 1EOGA 4GSNA 1A0RP 4QL9A 2XC2A 4WKWA 2I9HA 2LQQA 1K3YA 5G5FA 1QMVA 2DJ1A 2FY6A 1UN2A 4HU9A 2IN3A 4ZIJA 1K0MA 2JL4A 1XCCA 1MTCA 3V1WA 1GSUA 1K0NA 2IL3A 5DALA 1VF3A 3MSZA 1Z9HA 4HI7A 5L71A 3QDNA 2QC7A 2FLSA 1UVZA 3KTBA 5J4UA 3F6DA 3E9JB 4RI6A 3LFLA 4OFNA 1X5CA 4KDUA 3TKSC 1JLWA 3PR8A 3SWLA 4QL7A 2YPMA 3GHAA 4BVXA 4ZL7A 1G7OA 1TDIA 1NHYA 1PKWA 2HZFA 1AXDA 1ZCPA 5AIXA 1C72A 1H4OA 3GA4A 2OADA 3WT1A 4BPYA 4N0ZA 2GS3A 2AYTA 4EO3A 2MZCA 1OYJA 4KB3A 4XS6A 1JZDA 2IMEA 1PSQA 4TOPA 2C80A 4Q5RA 2B6MA 3W8JA 1Z6NA 3FYGA 6GSYA 3A2WA 4F82A 2O7KA 4IKHA 5DCGA 1ERWA 5ECKB 3I6AA 2OJLA 3CRUA 1XFLA 1Z3EA 4E8EA 3ZREA 3CYNA 1K0DA 4XRAA 2KP2A 2Z9SA 2L5LA 1WP0A 1A2JA 1PX6A 2R3XA 5CRDA 4ECCA 1X5DA 2HYXA 2H30A 3GRXA 3F6FA 4PX1A 2WGRA 3C73A 4MF7A 3ZIJA 4CDOA 1TI3A 2AAWA 1GUKA 3NIVA 1V40A 4PGTA 3Q18A 5F06A 5IO2A 1GSYA 1IYHA 2H1GA 3TJBA 17GSA 1K0CA 1GULA 1EP7A 3TJJA 2B7JA 3BD2A 2IFQA 3TKRA 1LJRA 2WFCA 2DJ2A 1XWGA 1OE8A 4IGJA 3D21A 4GLTA 5JWRB 1GL8A 2LQOA 4K0NA 2K8VA 1JZWA 3WD6A 3F63A 4L0WA 3LJRA 1R26A 2H01A 5KN2A 2AUVA 3GSTA 4GSTA 4F03A 3RHCA 2WRTA 3GH9A 2GSQA 3GUSA 1MD4A 1Z5YE 1ZYEA 5LCZA 3IBHA 3LWAA 5J3RA 2L57A 5CRWA 4G10A 2OBKA 1TK5B 2LUSA 1O73A 2MMOA 3DVWA 1SENA 4FYBA 3IK9A 2KOKA 2VLVA 1K0OA 3DXBA 2YWIA 1TOFA 2MMNA 4K0GA 1A2MA 2RIIA 3FZ9A 3J7Yb 4WXTA 2ON7A 4ZB9A 5G2ZA 3E0UA 4CHSA 3BJ5A 3GX0A 2VCWA 3FZ4A 3IAS2 1ERUA 4O5RA 4YAVA 2WCIA 4HU7A 1WPIA 2C1YA 5DBQA 2H1BA 5AISA 3GIXA 4K1FA 2YJ7A 1WOUA 1ACVA 1GSDA 4IQ1A 3LEFA 2FUG2 1TRSA 4DSSB 5EL8A 1NW2A 18GSA 2VL2C 2O8VB 1F3BA 3QD9A 5IMCA 4PUFC 4MF5A 3LQ7A 4OFTA 1H75A 5IOWA 4L0UA 1M7TA 3ZFBA 1J08A 4TXOA 4MF6A 1NHOA 5ECNB 4J56E 2OE0A 5H5RA 4POMA 5E59A 1GNWA 1YKCA 1WE0A 1F37A 1VF2A 3TUEA 3IA1A 1TP9A 5D9VA 5IIZA 4LL4B 3IE3A 5HFIA 4ZL9A 3QFAC 5JCUA 5C00A 2CVDA 3VPTA 1F3AA 1SKRB 1OKDA 2P31A 1HNAA 3O6TA 3VLNA 2LV3A 1W4VA 3ZZXA 1EP8A 3QAWA 1K0BA 2PERA 4XTSA 3QFBC 2JADA 1Z6MA 2LRCA 1MDJA 2R37A 2QGVA 1UA5A 4E8HA 3MWHA 3WT2A 2GT6A 4ISDA 2C3QA 1ZYQB 4XS1A 5IO0A 1GTUA 4BWSA 1AW9A 4EUYA 4MCUA 4XS4A 4CW9A 4AGSA 1LBKA 3IDVA 4BWQA 2FCHA 4TXOB 2VM1A 2RLIA 3KTLA 4TXVA 2VM2A 5H5QA 3MNGA 2HNLA 2IPAA 2ZUPA 1PX7A 3CXGA 3C1SA 14GSA 2YANA 4OO4A 2C0EA 2NTOA 3RPNA 3TKSA 5DQSA 2IMKA 5IMZA 1M2BA 3DKSA 1DUGA 3A2XA 2DC5A 2VLTA 2H19A 3CTFA 1TU7A 2TRCP 2B5YA 1F2EA 5HFKA 5B8BA 1ZL9A 4XCSA 4YQVA 2GTUA 1A8LA 1V58A 5INYA 3HHVA 2HXKA 3BCIA 2ZNMA 3ZYWA 4D73A 1EV4A 3F0IA 3EWLA 5ECRB 1O85A 2VIMA 9GSSA 2VL9A 2R4VA 5JWQB 2HZEA 3UJ1A 3GMFA 2YJHA 4V1Ag 2KHPA 3DVXA 1A24A 4V2LA 3RHBA 1GSSA 4K8MA 2GQKA 1SYRA 1U3AA 4GQCA 3QMXA 3GURA 3D4MA 3UEMA 1OC9B 3EU4A 1PRXA 4TR1B 2MMAA 4GQFA 5IMDA 3L78A 1GTAA 4ULXA 4YQUA 1XWCA 4PQHA 1ZMAA 1ERVA 2N5AA 5FHIA 5JCWA 1WJKA 1R5AA 1M0UA 4POBA 2R2JA 2LKUA 3EYTA 1M9AA 2C0FA 5ELGA 1SL1B 4D73B 5AGYA 4PNGA 1GSEA 1BYEA 1FO5A 4J57E 3F4TA 3LXZA 2HZEB 4IHUA 4KAEA 3HJMA 1O6JA 3HZ4A 4JR4A 4N30A 3VFIA 3QOUA 5J41A 2OE3A 2LRNA 4KGIA 1GSFA 3F3RA 2DMLA 3IAM2 1K3LA 1O81A 3US3A 2CVKA 2JU5A 2L6DA 1BEDA 1O7UA 1E6BA 3ZMKA 3DMLA 2IMIA 3M9JA 4AF2A 4RQXA 2GVPA 1ON4A 4MP4A 2YZUA 1ILOA 1OAZA 3FR3A 1WRYA 4KSMA 2BJXA 4O7HA 4FYCA 4IP6A 1GUHA 1QQ2A 1X9WB 5IMFA 4QQ7A 2K8SA 1JZRA 5FT3A 1VF1A 3Q6OA 2C3NA 2PVOC 1TK8B 3O3TA 3APQA 7GSSA 3ZL5A 2PN8A 1FVKA 1AC1A 4AJ8A 1SYXA 3F4SA 5A5KA 1X9MB 2R6KA 1V98A 3QCPA 1T4ZA 4HDEA 4MZWA 4PXOA 1KTEA 4HZ4A 4EE0A 2F9SA 2AV4A 2GZZA 3APSA 3ZVJA 3G9BA 2PVQA 1PL1A 2YWMA 1YJ6A 2VL2A 2PWJA 3GTUA 2I3YA 4KE3A 3Q19A 1THXA 2LRTA 3DGQA 3C7MA 4NHZA 3FRCA 2WZ9A 1SL0B 1YDKA 3ZIVA 2XBQA 5ECMB 2YV7A 4TR4A 3KM6A 3SBCA 2GGTA 2FA8A 1TU8A 4PQ1A 4EKZA 5DALB 3TRXA 4P3YB 5IMVA 3EURA 3TKSE 4K7IA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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