2H70A

Crystal structure of thioredoxin mutant d9e in hexagonal (p61) space group
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
b'DKIIHLTEDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A stability pattern of protein hydrophobic mutations that reflects evolutionary structural optimization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
source organism Escherichia coli
molecule tags Electron transport
total genus 30
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h70A00
2HFDA 2LQOA 1YF0A 4KCAA 3GURA 2OKAA 2PGTA 4X1UA 2JACA 3EU4A 3ZMLA 2H76A 2GLRA 3IPZA 1YEPA 1VF4A 1TI3A 2B1LA 2TRCP 3VLNA 2KOKA 1B4QA 2YZHA 2B6MA 1Q98A 1N2AA 2HLSA 1MD4A 4K2DA 1ZGNA 3QD9A 3W6GA 6GSVA 5H5RA 2C3TA 2NPBA 4WF5A 3F3QA 3GKXA 1XIYA 1S3AA 4OFTA 2EIRA 4MZBA 4I5QA 3LSZA 1XW6A 1SKWB 1WPIA 1AW9A 3TKSE 1YF1A 4LLRA 5HFGA 2EC4A 3QFBC 1DSBA 1THOA 2B5YA 1B4PA 5G5FA 1UA5A 5D73A 3U6VA 4NV2A 3GV1A 3CRTA 3FEUA 4KDXA 1XWAA 2OJLA 4J56E 3G7IA 2YP6A 2GSSA 4TR1A 1EV4A 1XW9A 1EEJA 1QXHA 2FCHA 1QK8A 1YKCA 2H66A 1AQVA 5DJLA 2GSTA 1XCCA 3M0FA 3KH9A 4NPBA 5GSTA 1SL2B 5CP1A 4BWQA 4K6XA 3HVXA 1AQXA 2PU9C 2YPMA 1O8WA 2LUSA 2H1AA 1BAYA 3E0UA 5COHA 3Q6OA 3KGKA 1K0CA 2ON7A 2VLVA 3KMNA 4PNGA 1AQWA 1N8JA 3BD2A 4XS4B 4V1Ap 4OWYA 4EO3A 1NHYA 4NV5A 1FG4A 3HJPA 4PX1A 1E2YA 1EEMA 3ZVJA 3WT2A 1T1VA 3HY2A 2VIMA 3RPPA 5G5EA 3L0HA 3UOMA 3F4RA 1FVJA 2R5GA 2YANA 2CZ2A 1HNBA 1Z9HA 2Z9SA 5G30A 4WF4A 4J2FA 2JZRA 1SK1A 1GLPA 3MAKA 3QR6A 2H30A 2VL2A 3HZ8A 1JFUA 4RI7A 2GGTA 3GKMA 3FZAA 2YOIA 2B5EA 1A23A 3QMXA 1HNAA 2H01A 5DAKB 3IK9A 3ZITA 5J41A 5L71A 1AAZA 3C73A 4I97A 4K7OA 3UEMA 3QAGA 4IGJA 1VGLA 3APQA 1GNWA 5C04A 3VWWA 3TKSA 2C0EA 1ZL9A 8GSSA 1O7UA 2FD3A 1PMTA 5JCUA 4PXOA 2E2GA 3EVIA 5H5QA 3EURA 2LJRA 1AXDA 4F82A 5IIZA 3M8NA 2HSHA 5DALA 4TXVA 2XHFA 1A2JA 1T8EB 2WB9A 4AJ8A 3D5JA 3HCZA 1X9MB 4XRAA 1ZMAA 1FAAA 1WE0A 1QQ2A 5ECRB 2VM1A 3QFAC 2GSRA 3UL3A 4JBBA 2CVBA 5F8BA 2LRCA 1GULA 2B7JA 5ECMB 1ZOFA 1M2DA 1TJDA 2VD0A 4HQSA 3SBCA 2HNLA 2H1BA 1XWGA 1USBA 2IWTA 3P8WA 2LNTA 3RAZA 4IP1A 2R3XA 4FYCA 3F6FA 2REMA 2DJ2A 2L57A 3P7XA 1TTZA 3CSJA 1G0TA 1XWCA 4TKYA 2L5OA 1V9WA 3KD0A 4FH8A 4FO5A 3IAM2 4JRRA 3GN3A 4PURA 2F8FA 4AJ6A 2CVDA 1ZYQB 1PQNA 5HR2A 3GUSA 2PMTA 5IMCA 5FT3A 4TR4A 2H74A 3KZQA 4OO4A 1SYXA 4OD7A 1FOVA 4IKHA 1T7PB 2GZPA 2I1UA 5ENUA 1GWCA 4ULXA 2KLXA 1GUKA 3LJRA 1F3AA 1GSSA 3APSA 1Z7PA 5AIVA 2FUG2 3H4KA 3ZREA 5JCWA 1KBNA 3F3RA 5AIXA 3D21A 4DSQA 4O7HA 5F0GA 1M9BA 4Z7XA 5GSSA 4ZL9A 4LMWA 3A2WA 4QL9A 2IL3A 3K8NA 3ERFA 1X0RA 2H6XA 1V98A 4POLA 1QUWA 1C72A 1LBKA 1EOHA 3GKNA 4RQRA 5E59A 2YWOA 4IHUA 4GRFA 4XS1A 1O73A 1NHOA 3HZ4A 1X9WB 2XBIA 2VCVA 2JZTA 5B6MA 3UBKA 5IMAA 4KH7A 2V32A 3QAVA 1GLQA 5D93A 4I2TA 3MWHA 5IOWA 4MJCA 1K0MA 3F4TA 2C4JA 3DMLA 1G7OA 3GX8A 1I9DA 1F3BA 1SD9A 3KIJA 1AIUA 5AISA 3NOFA 3GL5A 4YH2A 1PKWA 3ME8A 1TP9A 4X43A 2DBCA 4WXTA 1TRWA 4G19A 5B6NA 4MLYA 2IFQA 4EL1A 1EZKA 2CV4A 1F6MC 5FHIA 2L6DA 1O85A 1JZWA 4G9HA 4KX4A 3NIVA 1GP1A 1UVZA 1NSWA 3D4TA 4OO5A 3VWVA 4YAVA 3FR6A 2CT6A 1M99A 4WETA 3KTLA 4IN0A 2NVLA 3H79A 4ZL8A 3DGQA 3HD5A 1A2MA 3V1WA 1YZXA 2YZUA 3QAWA 1R7HA 2H1DA 4RUVA 5ABRA 1BX9A 2H70A 3WGDA 2LS5A 3WT1A 3UVHA 1F9MA 3ZL5A 1SL1B 1CQHA 4XRDA 3IK7A 1YDKA 1IYHA 1E6BA 4IJIA 3IXRA 2N5AA 5J3RA 4NMUA 3FK8A 4L0WA 5HR1A 1BQ7A 1K0NA 2CX3A 3F8UA 2TRXA 2ES7A 4BPYA 1EGRA 3DEXA 3LYPA 1WRYA 2QGVA 4E8EA 3GMFA 4TN8A 5JWRB 1FO5A 4GWRA 2F9SA 2HI7A 3TJKA 3TCOA 2LTKA 2VCXA 4BL7A 1OE8A 2FA4A 2PN8A 4IJ3A 2O8VB 3VPTA 1Z3EA 4HDEA 2LJKA 1SYRA 2KUCA 1G6WA 3GSTA 2HZFA 1IYIA 2JSZA 2NDOA 3E9JB 1H75A 3CXGA 1ZCPA 3RBTA 4KNDA 2VCQA 2DJJA 3ZVJD 2OE1A 1X5CA 3TKSC 3UBLA 4MDCA 5DCGA 3C1RA 1V40A 1ERTA 1GTBA 2OACA 5ID2B 4G2EA 5J9BA 2DSAA 2K8VA 1T4ZA 3ZIVA 3TRXA 1KTEA 5LCZA 4ECBA 3VFIA 4LL1B 4MJBA 4OFNA 4KSMA 1ZZYA 1A0RP 1YY7A 3HDCA 3HJMA 4Q5NA 3MSZA 4ZB9A 2XPEA 3CTFA 3ZIJA 3GNJA 1U6TA 5ELAA 1LU4A 2M72A 1ERVA 2E7PA 1M2BA 4MF7A 1GH2A 1WWJA 2AYTA 4EF0A 3EC3A 5F05A 3ED3A 3IDVA 4PUAA 5ELGA 1PKZA 3HXSA 1YJ6A 4I2UA 4MABA 1WOUA 2XC2A 2EIOA 4YQVA 3LXZA 5CO3A 4MK3A 4HUAA 1A8YA 3I6AA 4H86A 2K18A 5IPGA 1SJ6A 1SK2A 2RUEA 1UC7A 4IQ1A 4ZB8A 1O8XA 3M1GA 10GSA 1OC3A 1EP7A 4EE0A 2JZSA 1M2AA 4YAPA 3S9FA 1QFNA 2JSYA 1FB6A 5IOXA 1GSQA 1OC8A 2VOCA 1TOFA 4KE3A 2O89A 1S3CA 4Q5QA 4AJ7A 5ECHB 4ML6A 2LNSA 5CAXA 1UN2A 3L4NA 5ECIB 4NAXA 5IMFA 5HFKA 3DKSA 3UMAA 5LD0A 3Q74A 1XVQA 3GTUA 5G2ZA 1XWKA 3P2AA 9GSSA 1RK4A 3BJ5A 5J9CA 1GTAA 19GSA 1Y6EA 3EINA 2GZZA 4V2NA 2HXKA 1LJRA 3HJOA 4EUYA 2C3NA 1WJKA 5H5SA 1PRXA 4V1Ag 2GTUA 3I69A 3W8JA 1GSYA 2FLSA 2MMAA 2DJ3A 2PPTA 4GTUA 3UAPA 2FWFA 3QPMA 1QMVA 3BCIA 1JZDA 4N0VA 4TOPA 2FY6A 2OE3A 4NHWA 3GSSA 2YCDA 2HZEB 3EU3A 3D4MA 1GL8A 4XCSA 4DSSA 3FW2A 2GT5A 3KP9A 2L6CA 2BTOT 3DRNA 5CRDA 5F06A 4CHSA 1A8LA 3NZNA 1ML6A 3IAS2 3VI5A 3J7Yb 3D6IA 4MZCA 2RM5A 2P5QA 1OC9A 4DEJA 3GHAA 3DWVA 2IPAA 1QGVA 4MF6A 3KH7A 2A2SA 5EL8A 1FB0A 4L0UA 2G0FA 5CNWA 2GDRA 1WIKA 3IR4A 3CSHA 1XPVA 1GTIA 5A4WA 4FIWA 14GSA 3LFLA 3U5RE 1V57A 3TJFA 3H1NA 2I81A 3C1SA 3CTGA 4K9ZA 2FWGA 3CBUA 3LG6A 3FY7A 1TXXA 2B1KA 1R4WA 2CVKA 3A5WA 3HVVA 3G7JA 1GSFA 4HZ2A 4JZQA 3KMOA 3PINA 2V6OA 20GSA 1WMJA 4AF2A 5AGYA 4TXOA 1DE1A 4WR4A 4BA7A 2OE0A 2PERA 4IP6A 6GSSA 1AC1A 2KP2A 2RUFA 1YEXA 4TR1B 2H0IA 7GSSA 3FZ4A 1U87A 2KHPA 4KUNA 1Y25A 4JU5A 2N5BA 3TB2A 2IIYA 1U3IA 1CQGA 1PX7A 3GTUB 4HJMA 4IELA 2H8LA 4D73A 5HQPA 3DD3A 3RHCA 1T3BA 2VAFA 4ZB6A 3F6DA 3O76A 1BYEA 2CX4A 2FHEA 5DDLA 2MMOA 1ERWA 5IMZA 1HQOA 3TOUA 4F9ZA 2X8HA 3IV4A 2PBJA 4AGSA 3ISOA 3HKRA 1DUGA 4ZIJA 1PL1A 4TR0A 4ZILA 3ZYWA 2L5LA 3G7YA 4I6XA 1K0BA 1RW1A 2OADA 1OKDA 5IPHA 1S3DA 4CDOA 5ECSA 4ECIA 4JEDA 3G9BA 3RDWA 1EWXA 3EMPA 3UARA 4EC0A 4BVYA 4L5LA 1SKSB 4GQFA 1DBYA 3N9JA 3VWUA 3J7Yk 6GSYA 4HOJA 1PX6A 3KEBA 4GQCA 4DSSB 3RHBA 6GSXA 3LQ7A 2RIIA 4MJEA 1PD21 3AY8A 3H93A 2R4VA 4L5OA 3IE3A 4EDYA 3QOUA 4GLTA 5D9VA 1TKDB 1K0AA 2WS2A 4PGTA 4GXZA 3GFKA 3HHVA 5DBQA 5G31A 2IMIA 5G1KA 2DJ1A 3PH9A 3TKRA 1PGTA 2XBQA 6GSWA 4XTSA 3TDGA 2VCTA 2HSYA 2L4QA 4IW9A 3C71A 4ZL7A 1VF1A 4POBA 5JWOB 4WBRD 4K8MA 4ACSA 2PVOC 4GSSA 2YJ7A 3GA4A 1VRSD 2MBSA 3KJYA 4HJ2A 5DALB 3EYTA 2VUPA 1A2LA 1SL0B 1V2AA 2F51A 2VL9A 4O5RA 1K0OA 2XPDA 3BBYA 2YV7A 3ERWA 2P31A 22GSA 4ZBDA 3IA1A 5CREA 2CZ3A 1B9XC 2DMLA 1THXA 2MBTA 1MEKA 2GSQA 4POMA 16GSA 5D9XA 3LYKA 1B9YC 2H71A 2H75A 2VD1A 2WDUA 1J0FA 5GAPD 3RPNA 2VO4A 1O6JA 2C1YA 3BOAA 3D22A 1PA3A 4HU7A 4GCIA 3GL3A 3TJJA 3EE2A 3QCPA 2H6YA 2O7KA 1J9BA 5EPFA 2HYXA 1TDIA 5EY6A 3M3MA 1U3AA 4MPFA 3KXOA 2IMDA 4HZ4A 1K3YA 5E4WA 2OA7A 2HRNA 2A4VA 2V41A 5DCHA 4WBJA 3US3A 2J9HA 2WFCA 2PVQA 2ZCTA 3L9VA 4K7NA 3FR3A 11GSA 5JCGA 1HD2A 1K3OA 5DQSA 4MZWA 2KP1A 1MTCA 2V6KA 2F8AA 3F4SA 1PSQA 2BMXA 5IO2A 1SD8A 1XZOA 1U88A 3TKQA 4TVEA 3KP8A 1HYUA 2VL2C 1PL2A 2K6VA 2P0GA 4EDZA 4XS4A 2ZNMA 4DSRA 4X0XA 4ZBAA 2V2GA 5A4VA 1XOAA 2V1MA 1AUCA 2WULA 4HI7A 1JLWA 3C8EA 3MDKA 5IMDA 3HYPA 3I43A 3ZZXA 3PGTA 2E0QA 2BJXA 3PR8A 1R5PA 4BWSA 3LGCA 1EGOA 2GZYA 1YKAA 3CSIA 4K0NA 4IVFA 4HQZA 3ZTLA 2RLIA 3EMXA 4V2MA 2GQKA 2RM6A 3ZRDA 3A3TA 3IHQA 5IM9A 1TRVA 5ECNB 2FWEA 4MCUA 5DQYA 3TOTA 1GNEA 2JL4A 3F0IA 5DAKA 1K3LA 4V2LA 1GSUA 2JU5A 5DJMA 3VPQA 3D0ZA 2DLXA 4O32A 4KGIA 1BG5A 1ILOA 1MDKA 2DC5A 5IQYA 2PUKC 2CQ9A 3KM6A 1Z7RA 4ILFA 1XW5A 4ML1A 3KTBA 3CMIA 2H19A 1G6YA 2C0DA 4GSNA 4BVXA 1JLVA 4Q5RA 3WGXA 2IFQB 1GSEA 2B3SA 3ZLPA 1FVKA 4MF5A 4MJAA 3DXBA 1SU9A 1DE2A 4NHZA 2LSTA 5JWQB 4HS1A 3TRQA 1ERUA 1VF2A 1G7EA 1SJIA 1A0FA 1TK0B 2J23A 2M80A 4N0ZA 2E2MA 3L9SA 1KNGA 3TJGA 2LQQA 3UVTA 1XVWA 2I9HA 2H0HA 4MH2A 4PQ1A 1K0DA 2H72A 1MDJA 4FYUA 5D9TA 4N11A 3HA9A 1R26A 3E3EA 2FNOA 3LORA 2F3MA 2O87A 4WR5A 2H73A 1OKTA 1T4YA 3A2XA 2HT9A 4JE1A 4P3YB 2PWJA 3DVXA 3APOA 1F2EA 5A4UA 1GUHA 13GSA 2X64A 4QL7A 2CAQA 1R5AA 4K7IA 2I3YA 3Q18A 2DIZA 1RQMA 5ECKB 4PQHA 2GS3A 3FZ9A 4RI6A 1GUMA 4FYBA 1TU8A 2LRNA 4JR6A 4PUFC 5AN1A 5A5KA 2X8CA 4J57E 2YWIA 1M9AA 4KAEA 3VK9A 2C8UA 3GX0A 2WJUA 4GSTA 2WCIA 4CW9A 1FW1A 2WGRA 3ZFLA 4ZBBA 2DMMA 1J08A 4KW6A 1URMA 3FR9A 3H8QA 5DVBA 1HNCA 1M7TA 3LXTA 4MP4A 5ECPB 3O3TA 3TGZA 4KB3A 4F03A 2YWMA 1GTUA 2QC7A 3ZMKA 1XOBA 4HEA2 5HR0A 17GSA 1NM3A 2K8SA 4F0CA 3KCMA 1ACVA 2R37A 4ISDA 1V58A 4WEYA 4YQUA 3W8SA 5B7CA 1F37A 2QKEA 2OBIA 2GQMA 5GAND 3WD6A 1SKRB 5F07A 2K9FA 1TU7A 3FKFA 2YV9A 4O92A 1A24A 2ON5A 3OR5A 5C00A 2AUVA 1M0UA 1GRXA 3A2VA 3M9JA 1SK0A 6GSUA 1XFLA 3FZ5A 2C0GA 2DJKA 2VCZA 1EOGA 2LEGA 3DVWA 1WP0A 2O85A 1SJZA 4XHMA 2L59A 3BCKA 4K1FA 3ERGA 1T00A 4RQXA 3GH6A 4KDUA 2H1GA 4LL4B 4ZXGA 1JHBA 2FWHA 3ZFBA 1TK5B 3TRPA 2B7KA 3VI7A 5HFIA 1GSDA 2AJQB 1TI1A 1OE7A 3JCML 1Q4JA 1VF3A 3I9V2 3F9UA 3WYWA 3UJ1A 3N5OA 5CRHA 1SENA 4F2IA 1PN9A 1XBSA 1X9SB 3GH9A 2VLTA 12GSA 1TW9A 5D96A 2AV4A 2IJYA 4N10A 2CAIA 2HRFA 2C80A 5B8BA 3EWLA 4PNFA 1ON4A 5CRWA 2H0GA 2LJAA 3VURA 1B8XA 3LWAA 3SWLA 2HE3A 2LRTA 1YQ1A 2NBSA 2C3QA 4G10A 4Q5FA 2A2RA 2GVPA 5ECQB 4KCEA 4EVMA 4LMVA 4ID0A 1X5DA 4TR3A 5G1LA 6GSTA 4TRXA 1ABAA 1NW2A 2VL3A 1Z6NA 4GF0A 1JZOA 5LNKe 2YJHA 2WRTA 2OBKA 4LA1A 5D8IA 4MH3A 4OMVA 1Z5YE 4F0BA 4EXJA 2R6KA 4L8EA 4WKWA 3FYGA 4XS6A 3Q19A 5ID2A 3FHKA 4POKA 1OC9B 1TRSA 3DYRA 3WGEA 4OCEA 3P90A 1KEBA 3IBHA 5KN2A 3MNGA 5INYA 4KA0A 3TJBA 2B5XA 5KN1A 4XIHA 2R2JA 5GZZB 1TK8B 2IMEA 2AAWA 2MZCA 2AB6A 5J5NA 3F63A 1O81A 3CRUA 3DIEA 1I5GA 3L78A 1W89A 2YWNA 1W4VA 1TRUA 1EV9A 4TW5A 5KEJA 1JZRA 3C7MA 4MPGA 2WZ9A 2I4AA 2MMZA 2CA8A 1H4OA 4JR4A 3GKKA 4TXOB 4IQAA 5IO0A 1FHEA 3TKPA 1ST9A 3HVSA 1XWBA 3GIXA 2MMNA 2C0FA 3IC4A 4OCFA 1MDIA 2FA8A 2H6ZA 2NTOA 18GSA 2YNXA 2D2ZA 2ALBA 3R2QA 3TUEA 4KSOA 4D73B 2DJ0A 4EKZA 2IMFA 2TIRA 1EP8A 3QDNA 3LEFA 2AHEA 1MD3A 3GRXA 4MMMA 4QQ7A 4YQMA 3IOSA 5HR3A 2JADA 3VWXA 5FWGA 1X5EA 2LKUA 4NWYA 3ME7A 2GT6A 2YN1A 4K0GA 5EVOA 4E8HA 4IS0A 1OAZA 2VCWA 2X99A 2LV3A 4MA9A 4NXIA 2L4CA 2X8GA 1BEDA 1ZYEA 3UIWA 2DIYA 2N5FA 3FRCA 4N30A 3M9KA 4HU9A 1B48A 5CYYA 2P5RA 2G2QA 4PQIA 4ECCA 2ZUPA 4IBPA 5J4UA 2IN3A 4DVCA 2IMKA 5IMVA 3O6TA 4OFMA 4ECJA 3L9UA 4I8BA 4KDYA 5D9WA 2MYGA 2FGXA 5ECOB 5CRGA 3IRAA 2VM2A 2HZEA 2EIQA 2QSIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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