2H73A

Crystal structure of thioredoxin mutant d43e in hexagonal (p61) space group
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
b'SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILEEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Thioredoxin Mutant D43E in Hexagonal (p61) Space Group
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
source organism Escherichia coli
molecule tags Electron transport
total genus 32
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h73A00
3D4TA 1U3IA 1AQWA 1Y25A 3NZNA 3ZMLA 3VWVA 2LRTA 4NHZA 1R5PA 2HYXA 2WULA 2RUEA 1HD2A 1K0DA 4ZIJA 5G30A 2B5YA 5LNKe 2CZ3A 4HU9A 3CTGA 3DWVA 1GTUA 4E8EA 3ME8A 2A2SA 3ZFLA 5D9TA 2R6KA 3C73A 4ZILA 2TRCP 4D73B 4PUAA 1I9DA 3DVWA 4TN8A 2H1BA 2C4JA 4G9HA 1FB6A 1OE7A 5JCGA 5ENUA 2H1GA 4MPFA 4HEA2 3UARA 1HNCA 1ZYEA 4F2IA 4X43A 1TRSA 4MZBA 1SYRA 1VF2A 2LSTA 4MJCA 3RPPA 6GSSA 2IIYA 3VI7A 5H5SA 2YNXA 4RI7A 3TGZA 4WXTA 2GQMA 2H0IA 5J41A 2VLUA 4GRFA 1XWKA 2WJUA 3QCPA 2QSIA 1WMJA 5D93A 4K0NA 1TRUA 1DSBA 4JRRA 2AAWA 4OO5A 2H1DA 3J7Yk 3TDGA 1VRSD 1EV9A 1YF0A 2AUVA 2NPBA 1SL2B 1FW1A 3HXSA 4MPGA 5ECQB 3FY7A 4H86A 4BWSA 5CRHA 5HFKA 3APOA 2H6ZA 2WDUA 4I6XA 2VCQA 3QOUA 1O8XA 3VPTA 3GKMA 3WGXA 2H70A 1BG5A 3CMIA 3TJBA 1GRXA 4AF2A 4V2LA 3VURA 2O7KA 3LJRA 3WT1A 1GH2A 2VCTA 4LL4B 2BMXA 3GA4A 2VLTA 2FLSA 5A4WA 1UC7A 2FWEA 4POMA 2V32A 1N2AA 3QR6A 2KP2A 4K7IA 2C0EA 3ED3A 4HU7A 1V40A 4MH3A 3APQA 3IRAA 5B7CA 1GTBA 1XVWA 1SJZA 4TR1A 2CX3A 4Z7XA 4IGJA 2DJKA 5E59A 3WGDA 2L6DA 3FKFA 3QD9A 2REMA 2GSRA 1K3YA 2IMKA 3IR4A 1GL8A 3KIJA 1J0FA 2B5EA 5INYA 4JR4A 1YF1A 5AIXA 3P7XA 4KB3A 1M0UA 3RAZA 3TKSE 4HI7A 2V41A 2L5OA 4BVYA 2P31A 4F82A 2GLRA 3KZQA 4GLTA 2JADA 8GSSA 3IK7A 1Z6MA 1EOGA 1AAZA 3ZYWA 1V98A 1GWCA 3ZIVA 1DE1A 1V2AA 4LA1A 2KHPA 3FK8A 2MMNA 3HJMA 3Q74A 5JWRB 1O7UA 1C72A 1WPIA 1JFUA 1PA3A 3W8JA 4O7HA 1ON4A 2MBSA 3FEUA 1FHEA 5AGYA 2O89A 3EU3A 2GSTA 3EE2A 4PX1A 5AISA 2FWGA 3DGQA 1FOVA 3LYPA 3GSTA 3QAGA 3GX0A 4NMUA 16GSA 3D22A 3C8EA 4GF0A 4MJBA 2YJ7A 4K9ZA 1Z5YE 1PL2A 2WRTA 4IKHA 1SU9A 4PUFC 3KP8A 1TK5B 2JSZA 1EGOA 5EVOA 3EVIA 4DSSA 3CSHA 5HFGA 1KBNA 3OR5A 3M9JA 2XPDA 3FRCA 4I2TA 1PL1A 3GL5A 1E6BA 2OBKA 1ST9A 2LTKA 5ECNB 2E2GA 1K0OA 2HZEB 3LFLA 3F4RA 1JLWA 1YJ6A 2YZUA 1QFNA 4V2MA 2VL3A 3IPZA 1H4OA 1XPVA 3BOAA 3ZREA 3A2VA 2LJAA 3WT2A 18GSA 4N10A 4I97A 1YDKA 5A4VA 2DBCA 2C3TA 1NW2A 4KUNA 4WEYA 3RHCA 4TR1B 3D21A 1FVKA 2NTOA 4ZL8A 5CREA 1BAYA 2WB9A 3GRXA 3BCKA 3MSZA 1A2JA 2YWIA 1LBKA 3M1GA 5FWGA 1W4VA 1EV4A 2M72A 2ALBA 3GKXA 2YZHA 5IIZA 3FZAA 2V6OA 2H0GA 4I2UA 1DE2A 4MJAA 4KH7A 3C7MA 2H76A 2LJKA 3F8UA 4TW5A 3G7YA 3ZL5A 5IOWA 1TU7A 3TUEA 5DCHA 4HZ2A 3M3MA 4FH8A 3ERWA 3EWLA 1X0RA 1X9WB 4RUVA 4GXZA 4PQHA 2I3YA 4F0BA 5IO0A 1GNWA 3V1WA 1OC3A 2X99A 2G0FA 1R7HA 3D0ZA 3WD6A 3TOTA 2F51A 2ZNMA 1GSQA 3KXOA 1O81A 4JEDA 1BJXA 2OJLA 3DVXA 3VPQA 3RHBA 1IYHA 4IP6A 4IP1A 3W8SA 2H72A 9GSSA 3ZRDA 4FYBA 4OCFA 3UBLA 1PQNA 4D73A 1FG4A 1M2DA 1GUMA 3HVSA 4MF5A 5ECRB 4DSSB 3KJYA 3LXTA 5HR2A 5D9VA 2YJHA 3MAKA 2X64A 4HZ4A 3DD3A 1KEBA 1HNBA 2KOKA 3I9V2 4V1Ag 5DDLA 3MWHA 2WZ9A 4IELA 1YY7A 2B7JA 1QK8A 4PXOA 2ES7A 1TXXA 3UVHA 3IE3A 3O6TA 2VM1A 3HYPA 4DSRA 4IQ1A 2B6MA 2VIMA 1ZYQB 5IQYA 2JZSA 3GN3A 4IJIA 5EL8A 1NSWA 4NPBA 2R3XA 4ILFA 2HT9A 4MF6A 1Z7PA 3IDVA 1K0AA 1W89A 2R37A 2HSHA 1PRXA 4K7NA 3BD2A 3C1RA 4CDOA 4GQCA 1FAAA 2CX4A 1JZRA 1ZZYA 1GLPA 2GQLA 4FYCA 2RLIA 4AGSA 4J2FA 3VWWA 3MDKA 4KGIA 1X9MB 1CQGA 2GSQA 3L9UA 1T1VA 2E2MA 2KUCA 3A2XA 1F6MC 5IMZA 3VK9A 4AJ8A 5ELGA 2VLVA 3FW2A 1OAZA 4WF5A 1RK4A 2PWJA 2CV4A 5ID2B 1ABAA 1QXHA 3DRNA 4K6XA 3L9VA 5D8IA 3I69A 2MMOA 4MJEA 3TJGA 5CRWA 2F8FA 2ZUPA 3F63A 4QQ7A 1JHBA 3F4TA 1WIKA 2EIRA 3TKPA 1MDIA 3GH6A 3QMXA 4KNDA 4LMWA 1TP9A 4PQIA 2KP1A 3HY2A 6GSXA 2LUSA 1ZL9A 11GSA 4HUAA 2L4CA 20GSA 2VCVA 2H8LA 2K18A 5FT3A 1ZCPA 4GSTA 5ECPB 4EUYA 1A2LA 4PGTA 5HQPA 1XBSA 4KA0A 1G6YA 2J9HA 5DQSA 2D2ZA 2IJYA 2IMDA 1PN9A 3GIXA 4KSMA 2H01A 2PERA 3IBHA 5JWQB 3PINA 3LORA 2QC7A 4IJ3A 1Q98A 4TXVA 6GSYA 4MK3A 5B6NA 1N8JA 4GWRA 5IPHA 2EC4A 3GURA 1PKZA 3JCML 4EDYA 6GSTA 4IBPA 3Q6OA 3N5OA 4K1FA 2PVQA 2GZZA 2C80A 3F6DA 4AJ7A 5ECOB 3KTBA 1X9SB 2B3SA 3D4MA 5GSTA 2XBIA 2H74A 3S9FA 1M9AA 2IN3A 2WS2A 3GTUB 4EE0A 5J5NA 2YV7A 4QL9A 4NHWA 2VD1A 2H30A 2MYGA 1XOBA 2R4VA 1GSSA 1HQOA 3GKNA 4XCSA 2H66A 2RUFA 1OE8A 2GZYA 2VL2A 1EEJA 1R26A 4BL7A 4IQAA 1YEPA 3VLNA 2JZTA 1ZMAA 3QPMA 1TK8B 3F3RA 3O3TA 4FO5A 2HZEA 2GS3A 2HLSA 5G5FA 3FZ9A 5DBQA 2PBJA 3TKSC 1X5DA 1K0NA 5EPFA 5IMFA 4KW6A 4E8HA 1SK2A 1TK0B 1LJRA 3J7Yb 3HVXA 3ZITA 2HNLA 4WETA 1SD9A 1EZKA 3HD5A 1AQXA 5JWOB 1T8EB 3AY8A 2VUPA 4KSOA 4XS1A 1GUKA 4G10A 1MEKA 3PGTA 4HQZA 1T00A 4K8MA 2IMIA 4N0VA 1O85A 19GSA 2BJXA 2VAFA 4MH2A 5B8BA 5D73A 1KTEA 4ZB8A 2DJJA 2PN8A 5IMAA 1A8YA 3VI5A 5GZZB 3HA9A 3KMOA 5DALA 2VD0A 4V1Ap 2N5BA 1Z3EA 12GSA 1XVQA 3FHKA 3UL3A 4DSQA 1A8LA 4MF7A 3VFIA 2GVPA 2IL3A 2C3QA 3BCIA 1M99A 2AYTA 5IOXA 2OADA 2TIRA 1FVJA 3M9KA 5DVBA 4OFMA 3F6FA 5C00A 4WR4A 1Z7RA 1AUCA 1TW9A 1JLVA 2L5LA 4MA9A 4POKA 2YN1A 3DXBA 2I4AA 3EYTA 4GSSA 2L57A 1A0FA 5HR0A 4IN0A 3F0IA 4ZBAA 2HXKA 1SYXA 4ECCA 5LD0A 1F2EA 4XTSA 2PUKC 4JU5A 4BPYA 2L59A 4YQMA 4G19A 5B6MA 4OO4A 2YANA 1SD8A 3LEFA 3VWXA 1XWGA 4N30A 1SJIA 1PKWA 1G0TA 2LRCA 1GSFA 1F37A 2VCWA 2X8CA 3ISOA 2LQOA 2HZFA 3US3A 3I6AA 3HDCA 2IMEA 4MZCA 1AIUA 1V9WA 2HE3A 3SBCA 1BX9A 1OVNA 5D9WA 2K9FA 3L78A 1EOHA 3L4NA 1TU8A 2C8UA 5C04A 1AC1A 1YQ1A 1CQHA 3FR3A 3TJKA 2V6KA 1GTIA 4L5LA 5IMCA 2XC2A 3GL3A 4RI6A 2XHFA 1FB0A 4ECJA 1TJDA 2I9HA 2RM6A 1SJ6A 4N0ZA 2O85A 1KNGA 2H73A 2I1UA 1XWBA 2WGRA 3DIEA 4Q5RA 1B8XA 1TKDB 3ZTLA 1YKCA 2DSAA 1EGRA 5ELAA 3K8NA 4MP4A 5ECLB 5HFIA 5CRGA 3IC4A 1YZXA 1Y6EA 3IK9A 5DALB 2MBTA 1GSYA 1WOUA 4IW9A 5DJLA 2BTOT 4OMVA 1T7PB 2LS5A 3KEBA 3D6IA 2QKEA 4YAVA 4LL1B 3KP9A 1MDKA 4XS4A 2YOIA 5G2ZA 3ZMKA 5KN3A 4GSNA 1UN2A 1WP0A 4KAEA 5ID2A 3KCMA 2CVKA 5KEJA 1K0BA 6GSUA 3KH9A 1X5EA 2MMZA 2F8AA 1ZGNA 1GLQA 1XWCA 2AHEA 3Q19A 3C71A 4XS6A 5ECSA 1K0MA 1SL0B 4IVFA 2C0DA 4HJ2A 2FHEA 4AJ6A 2DJ0A 4BWQA 3TRPA 1OC9A 2CAQA 1S3CA 3H1NA 1ERWA 3QFBC 4OD7A 4TXOA 5F0GA 3A5WA 4DEJA 2IFQB 4WF4A 2PVOC 2AV4A 1ERTA 1PX7A 3HHVA 1JZDA 3TCOA 2O8VB 4KCAA 4TOPA 4POBA 1GNEA 5FHIA 3G9BA 3TKSA 1A2MA 4ML6A 4YAPA 1XOAA 3UMAA 4JE1A 2FY6A 2GDRA 4V2NA 1B4PA 3E3EA 3LWAA 4RQXA 3A2WA 1Z6NA 4ZB6A 5COHA 3ZLPA 6GSVA 5ABRA 1XWAA 5J9CA 1WRYA 4CHSA 1AW9A 3GTUA 2JU5A 4GCIA 3CYNA 1IYIA 1XW9A 3DYRA 1TRVA 4I8BA 3W6GA 1FO5A 1WJKA 1O6JA 2DIZA 5IM9A 4F03A 5J4UA 3ZVJD 3P8WA 2GSSA 3TJJA 3LYKA 4JBBA 2FGXA 2LRNA 3HZ8A 2DLXA 2OKAA 3KH7A 5EY6A 2H6XA 3GX8A 4POLA 1B9XC 2JL4A 2YPMA 3GH9A 2FD3A 1G7EA 5IMDA 4PURA 3HZ4A 3TJFA 4GTUA 2H75A 2C0GA 1TI3A 4TKYA 5F06A 4XS4B 3F9UA 2A4VA 4RQRA 1SKRB 2CVBA 4IS0A 4MLYA 2PU9C 2PPTA 4J57E 5F07A 2R5GA 2FNOA 4HJMA 1R5AA 3QAVA 2K8VA 2JZRA 4JZQA 2HFDA 4KDXA 2EIQA 3DKSA 2Z9SA 1XXUA 2H6YA 1A23A 1O73A 3RBTA 2ON7A 3LG6A 1OC9B 2L4QA 2LV3A 4ZBBA 4LLRA 3HJPA 2ZCTA 4TXOB 1I5GA 1RQMA 2OE3A 1DUGA 3TB2A 3EMXA 4KE3A 3H4KA 4MZWA 1EEMA 5A4UA 1ILOA 2IWTA 2L6CA 3UAPA 2DJ3A 5KN1A 5GAND 3R2QA 17GSA 2N5AA 3GMFA 1USBA 4NV2A 3ZVJA 4OFNA 5ECMB 3EC3A 1ACVA 4XRAA 1HNAA 4NWYA 2E7PA 5DAKA 1XCCA 3UIWA 1XW6A 1AQVA 3IOSA 5AIVA 2JACA 2N5FA 1URMA 5E4WA 3PH9A 2LKUA 2TRXA 3RPNA 3CXGA 5ECHB 2LNSA 4FYUA 4HQSA 4Q5NA 2PMTA 2X8HA 1JZWA 2RIIA 3RDWA 3P90A 2M46A 1B4QA 2DMLA 1LU4A 1K0CA 3PR8A 4MCUA 1VF4A 3TKQA 3I43A 3HVVA 2JSYA 7GSSA 2CQ9A 1O8WA 5CP1A 2B7KA 2VOCA 3EURA 3FR9A 3QAWA 5CYYA 2G2QA 3LXZA 3FR6A 1OYJA 5CNWA 2HRNA 3GHAA 2VM2A 4J56E 5F05A 3CTFA 3CSJA 5ECKB 2GQKA 1HYUA 4KCEA 1JZOA 1U87A 1SENA 2CT6A 5J3RA 3CRUA 3ZZXA 1EP8A 2B1KA 3KMNA 3M0FA 4WBJA 4P3YB 13GSA 1T4YA 4FIWA 4N11A 3DEXA 3UBKA 4ULXA 4DVCA 1TRWA 3P2AA 4L0UA 1OC8A 3H8QA 4ZL9A 1F9MA 4QL7A 2CA8A 2P5QA 4BA7A 1XIYA 2MMAA 4L5OA 2CAIA 4LMVA 4PQ1A 3GUSA 3F4SA 4OFTA 1U6TA 2NBSA 2YP6A 3EU4A 4K2DA 1S3AA 5CRDA 4KX4A 3TRQA 2DC5A 2H1AA 1B9YC 1TTZA 4O32A 3IAS2 4WR5A 1X5CA 4KDUA 4X0XA 2LQQA 3LGCA 2FUG2 4L8EA 3ERFA 2LJRA 4TR4A 1YEXA 3Q18A 4ACSA 2B1LA 5JCWA 5LCZA 3IXRA 4Q5FA 1S3DA 4EO3A 5L71A 5G1LA 4HOJA 2H19A 2GT5A 5DCGA 1T4ZA 2XBQA 3HJOA 1XW5A 2C1YA 2FWHA 4ECBA 1PD21 5DAKB 1XFLA 1G7OA 1EWXA 4EF0A 4ID0A 3U6VA 2F9SA 1PGTA 1MD4A 1THXA 1MTCA 2AB6A 1G6WA 1RW1A 3N9JA 1GP1A 2WCIA 3GSSA 4CW9A 4YH2A 5H5RA 4X1UA 1V57A 3UJ1A 3MNGA 3O76A 2V1MA 3GYKA 2YWOA 5AN1A 2CZ2A 4YQUA 1R4WA 3WGEA 2PGTA 2LNTA 2IFQA 1J9BA 2GTUA 3UOMA 1THOA 3KD0A 2E0QA 3H93A 4HS1A 2I81A 1V58A 4OWYA 3E9JB 1MD3A 1PSQA 5F8BA 3EMPA 5D96A 3GKKA 4O92A 2GGTA 2LEGA 2VCZA 4NAXA 3DMLA 2RM5A 4OCEA 1H75A 3ERGA 1DBYA 1M9BA 3LQ7A 2X8GA 2FA8A 4ZL7A 2IMFA 1F3BA 5J9BA 3CRTA 1GUHA 4IHUA 2AJQB 4K7OA 3BBYA 3HKRA 1XZOA 4K0GA 3TOUA 2P5RA 1WE0A 4GQFA 1WWJA 3IV4A 4TRXA 4WBRD 1QMVA 2DJ2A 4NV5A 1UA5A 2FWFA 2J23A 1VF1A 2OACA 4ML1A 3D5JA 4PNGA 1Z9HA 4EXJA 5IO2A 5GAPD 4TR0A 4ZXGA 2VO4A 2O87A 1BYEA 3KM6A 3CBUA 5ECIB 2ON5A 3IAM2 2IPAA 3NIVA 4Q5QA 1VF3A 2HRFA 5IPGA 2GT6A 1ML6A 2VL2C 2B5XA 6GSWA 3SWLA 1AXDA 2DJ1A 4HDEA 1TDIA 2HSYA 2GZPA 3A3TA 2KLXA 5CAXA 1GSDA 4I5QA 4O5RA 3UVTA 1VGLA 1EP7A 4ZB9A 1ZOFA 3ZFBA 2OE1A 1E2YA 2K8SA 2YWMA 1SKSB 2F3MA 2NDOA 5G5EA 1TOFA 2OA7A 1SL1B 5H5QA 2DMMA 3E0UA 2OBIA 4WKWA 2QGVA 4ZBDA 3C1SA 1SKWB 1BEDA 2NVLA 2YCDA 2H0HA 4G2EA 1YKAA 4EKZA 3FZ5A 4TVEA 5HR3A 4NXIA 1M2BA 3GNJA 5A5KA 4EL1A 2WFCA 4XIHA 1GSUA 3KTLA 3NOFA 4MABA 1SK0A 3EINA 2MZCA 2YV9A 1M7TA 2H71A 2VL9A 3QDNA 3FZ4A 1T3BA 3F3QA 1PMTA 4KDYA 5KN2A 1MDJA 4YQVA 2A2RA 1UVZA 2DIYA 5DQYA 1A24A 4EVMA 2V2GA 4MMMA 3GFKA 3TRXA 2R2JA 4L0WA 3CSIA 3G7IA 14GSA 2K6VA 5B8AA 1BQ7A 5GSSA 3QFAC 5IMVA 2XPEA 1U88A 3APSA 4XRDA 1M2AA 3ME7A 2YWNA 2C0FA 4F9ZA 4MDCA 3LSZA 1Q4JA 2HI7A 3ZIJA 4ISDA 1ERVA 2VCXA 2M80A 1ERUA 3L0HA 2OE0A 3L9SA 4JR6A 1NHOA 1PX6A 1QGVA 5JCUA 1QQ2A 2CVDA 3KGKA 3BJ5A 5DJMA 2EIOA 1F3AA 3WYWA 1NM3A 4BVXA 3UEMA 4ECIA 2C3NA 1GTAA 4EDZA 3IA1A 5KN0A 2FA4A 3FYGA 3TKRA 4PNFA 3G7JA 10GSA 5D9XA 5G1KA 5G31A 3M8NA 1TI1A 1K3OA 22GSA 4TR3A 1NHYA 5CO3A 3HCZA 1SK1A 3H79A 4XHMA 3VWUA 3GV1A 1A0RP 1GULA 1B48A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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