2H74A

Crystal structure of thioredoxin mutant d2e in hexagonal (p61) space group
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SEKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Thioredoxin Mutant D2E in Hexagonal (p61) Space Group
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
source organism Escherichia coli
molecule tags Electron transport
total genus 30
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h74A00
3W8JA 5GAND 1TTZA 2FWFA 1O81A 1EP8A 2LRTA 2AB6A 1TOFA 4BA7A 1O85A 3IK9A 4OCFA 3F9UA 3CMIA 3CRUA 2VCVA 4QL9A 3GTUB 1VF3A 4KCAA 4KW6A 2OE3A 3U5RE 3HJPA 3EU4A 4J2FA 4N0ZA 5G1LA 2LV3A 2LQOA 2JZRA 2E2MA 1GUKA 3IR4A 2OA7A 3BBYA 1I9DA 4PQ1A 1QMVA 4RI7A 2VCXA 4Q5NA 1V40A 2R5GA 2IIYA 2ZUPA 3GX8A 5G1KA 4IJ3A 3VURA 5KN3A 4Q5FA 2AJQB 4KDUA 1Z7RA 4EXJA 1UVZA 4HS1A 1TXXA 3QFBC 1VF2A 2O87A 2VM1A 3F3RA 3M8NA 2R2JA 3FRCA 2FWGA 1U87A 4EDYA 2REMA 2PERA 5HR1A 2P5RA 2HNLA 3JCML 2LRCA 3CRTA 1QGVA 4X0XA 4PX1A 3UAPA 3VI5A 4ML1A 3PH9A 4K9ZA 1BEDA 2IL3A 2H6YA 4IP6A 1TW9A 5H5SA 1OC8A 3M9KA 2OE1A 4POLA 3GFKA 2GLRA 1TK0B 1JLVA 1SJIA 1GULA 22GSA 1M7TA 1M0UA 2B5YA 3ERGA 1OAZA 4MJCA 2DLXA 5LNKe 3QOUA 2WULA 3HJOA 1Z6NA 1KBNA 2CVDA 3RDWA 4L5LA 1H75A 1ZCPA 2VD1A 1R5PA 1DBYA 4IP1A 4IW9A 1SD8A 2VL2C 2HLSA 3IA1A 4O5RA 4KAEA 3TRQA 1MD3A 3IK7A 6GSYA 5A4VA 3QCPA 2JSZA 2YZHA 3D21A 2H1AA 2GGTA 4MCUA 4NHWA 2LEGA 1ACVA 4DSRA 2P31A 3CBUA 4V1Ap 1AXDA 4NAXA 2VOCA 1FB6A 6GSSA 3IXRA 2EIQA 4P3YB 4AJ6A 2XBIA 5INYA 3VI7A 3HVXA 1GTAA 4JU5A 2MBTA 2LNSA 2R3XA 1GRXA 1EZKA 5KEJA 1NHOA 3KZQA 4F82A 1JZRA 3IAS2 4MMMA 2JZTA 4JE1A 4MPGA 4NMUA 4RUVA 4MH2A 2YWIA 1R26A 1GLQA 3IRAA 4POKA 4IGJA 3H79A 3CSHA 5COHA 3QAWA 4XIHA 4YAVA 3QR6A 3ZL5A 5J9BA 1Z3EA 3O6TA 2XPDA 4JR6A 1BG5A 2O85A 1T8EB 2GSTA 4TOPA 2ES7A 1PSQA 5DAKB 2A2SA 2YJ7A 4NWYA 2DJ1A 3GKMA 3VFIA 4J57E 1TP9A 2F8AA 1J08A 2MZCA 4ML6A 2E2GA 4OWYA 3GRXA 4WBRD 1VF1A 1M2BA 1XPVA 1GSQA 2XC2A 5CREA 5HFGA 3M9JA 3WT1A 2DIZA 2OKAA 3FZ4A 4ECIA 1I5GA 5DJLA 2TRCP 3UEMA 2C0GA 1IYHA 2X8GA 1WOUA 3TKSC 2I3YA 3GA4A 2VO4A 4ZXGA 4RI6A 1KTEA 2H75A 1A0RP 2L59A 3EC3A 3ZZXA 5HFKA 2K9FA 2WGRA 2H19A 2YWMA 2F51A 1FVJA 3IC4A 4TXVA 2AUVA 4GQFA 3BOAA 2E0QA 3FYGA 4QQ7A 5F0GA 2LJAA 4K7IA 1XVQA 1YKCA 4PURA 2C3TA 2H74A 3DMLA 2WB9A 4XS6A 1GUHA 1UC7A 1M99A 4ULXA 3QAVA 1Y6EA 4F0BA 17GSA 5J9CA 1AQWA 5JWOB 2GZPA 4O7HA 1K3YA 4KGIA 4I2TA 2FCHA 1ERTA 4GWRA 3US3A 3UARA 4GSSA 2QKEA 4OCEA 2IWTA 4LA1A 1XCCA 1OC9B 4TR1B 1PX6A 3GURA 1UA5A 3A2XA 3K8NA 1W4VA 4Q5QA 5GZZB 5HR0A 4G2EA 3MDKA 1JZWA 3FHKA 1NM3A 5DAKA 4KDYA 2E7PA 1YEPA 3MAKA 1WIKA 5JCUA 2WFCA 2X99A 3DWVA 4MLYA 3AY8A 2OACA 5AGYA 4Q5RA 2B1LA 3M3MA 2NTOA 1T00A 3APQA 3GIXA 4E8EA 2FUG2 3GKKA 3TGZA 1YKAA 3UOMA 3C8EA 1SKRB 5B6NA 3ZLPA 2F8FA 5IMZA 2B7JA 5L71A 1H4OA 3P2AA 3TJGA 2H66A 3L9SA 2GSSA 3W8SA 1SL2B 1T4ZA 2KOKA 1K3OA 1K3LA 5DQSA 2H71A 2GTUA 5EVOA 4WETA 3FZAA 2C8UA 4XRDA 12GSA 1XWGA 1G6YA 1XVWA 3PR8A 3HVSA 4JRRA 1WE0A 1V58A 1WMJA 3C7MA 1SYXA 6GSXA 3CTGA 3P90A 5B6MA 1DE1A 1SENA 2KP1A 4F0CA 4AF2A 1X9SB 3WD6A 2XPEA 3EYTA 4GSTA 3GMFA 4X43A 5F07A 3HA9A 2FY6A 2KHPA 4LL4B 1O73A 4AJ8A 4N30A 1GSYA 4G9HA 3NZNA 4MZWA 4OFTA 2F9SA 1HD2A 2WCIA 1TRUA 2P0GA 4DVCA 3UIWA 5CAXA 1LU4A 2V41A 4OO5A 2FWHA 3NIVA 5ECNB 4TR1A 1OC9A 2PBJA 2ON5A 4BVXA 1X5EA 1F9MA 2H1GA 2CVKA 4TR3A 3Q6OA 4YQVA 1XWCA 13GSA 2DJ3A 5CRDA 4PUFC 4HOJA 2CX3A 3IHQA 3FY7A 3ZFLA 2C1YA 11GSA 1UN2A 1QXHA 3HJMA 1B4QA 1A8LA 3RAZA 1GSSA 1PD21 1T3BA 5DCHA 1XW5A 5CRWA 4F9ZA 4V2MA 4EL1A 4IS0A 1VGLA 1E6BA 2B1KA 4YH2A 3GSSA 4EO3A 2GVPA 4RQXA 4L8EA 4WR5A 2VUPA 2XHFA 1WWJA 5EL8A 1GTUA 4MF7A 1EV4A 1Z9HA 2B7KA 1ERVA 1ZOFA 1SKWB 2L6DA 2RUEA 4ZL8A 2CQ9A 3F0IA 1K0AA 2H0GA 4V2LA 2VL3A 1AIUA 2LJKA 2KP2A 2VIMA 8GSSA 4KH7A 1TU8A 3TDGA 4GSNA 4PQIA 4YAPA 3WT2A 3ERWA 3Q74A 1ZGNA 1QQ2A 4IN0A 5DBQA 1OC3A 1SJ6A 1CQHA 4IBPA 2FLSA 2H01A 3E0UA 4ZL7A 2YJHA 2F3MA 5JWQB 3KCMA 1WP0A 3TJBA 1GNEA 2GQMA 1GSUA 1A23A 3HXSA 2RIIA 4NV2A 4EC0A 2BTOT 3C1RA 1YEXA 3ZTLA 4FYBA 1M2AA 3HY2A 2K18A 4KCEA 1PRXA 3HZ8A 1YY7A 4O32A 4KNDA 5E59A 2A2RA 1F3AA 1EOGA 4K8MA 1YDKA 4OMVA 1S3DA 1AQVA 3GHAA 2GZZA 4N10A 1MD4A 2YZUA 4BWQA 5J4UA 3KTBA 3HCZA 2FA8A 1TU7A 1FB0A 2D2ZA 4GF0A 1B4PA 2M46A 1FHEA 3LG6A 4I5QA 4FIWA 2CVBA 5GSSA 1EOHA 3ME7A 1AC1A 4TKYA 3UVTA 2H0HA 3F3QA 1C72A 1SYRA 5ECSA 2TIRA 1FAAA 1YZXA 2EIRA 4PXOA 5IPGA 3VPQA 4ECJA 3LQ7A 3RPPA 1JHBA 2DJKA 1W89A 2DJ0A 2CV4A 2CZ2A 1PL2A 1O8XA 3TRXA 2VM2A 4F2IA 5DQYA 2X8HA 1XW9A 4IVFA 3HHVA 3L9VA 2V1MA 4PNGA 3LYKA 18GSA 4D73A 2YN1A 1HNCA 4X1UA 4LMVA 1X9MB 5H5RA 5LCZA 1EGRA 4G19A 1GTIA 5EY6A 1GSEA 2VL2A 1N8JA 3C73A 3IOSA 2KLXA 1TRWA 4POMA 3MSZA 3FZ9A 1KNGA 5FWGA 3IBHA 2HXKA 1B9YC 5G5EA 5FT3A 4BWSA 3L0HA 3WGDA 1X5CA 1ZYQB 1FW1A 4WF4A 2IN3A 1M9AA 1JLWA 3TRPA 5ELAA 1SK0A 1XWKA 1ZMAA 3CSIA 3TB2A 3KH9A 1QUWA 2YNXA 5C00A 2X8CA 4GTUA 1V98A 2HT9A 5D9TA 3L78A 1N2AA 2AHEA 5GAPD 1U3AA 3RBTA 1U88A 2H73A 1K0NA 5IMFA 2ON7A 3VK9A 2IMDA 1Z6MA 3Q19A 1K0CA 4GQCA 1ILOA 3LGCA 1AAZA 2YOIA 2GT5A 2H30A 1SKSB 4FO5A 3H4KA 2DSAA 2K8SA 2VAFA 4V1Ag 1T7PB 2EC4A 3UBLA 4CHSA 1FG4A 2V2GA 2ZNMA 2H6ZA 2WJUA 3LXTA 4EUYA 3KTLA 4NV5A 1XXUA 2EIOA 4IJIA 9GSSA 4MA9A 3IPZA 2PUKC 2QC7A 1B9XC 3F6DA 5IOWA 2C80A 2N5BA 1F6MC 5ECOB 1Q4JA 1FO5A 1HQOA 2R37A 3TKSA 2LRNA 2O89A 1SD9A 1K0OA 4WEYA 3UJ1A 2PU9C 5IPHA 3HVVA 3FEUA 1ZYEA 4PQHA 5KN0A 1YF1A 1BYEA 2H1BA 6GSWA 3TJKA 2I9HA 1VF4A 1J9BA 4TRXA 3ZFBA 2GSRA 5IMDA 3CSJA 5G30A 1NSWA 1T4YA 3A2VA 2B6MA 4CW9A 3GL3A 3O3TA 4LL1B 16GSA 1HNAA 4DSQA 5JCWA 3EMXA 1YJ6A 4DEJA 3VWUA 4MJAA 3PINA 3ZIVA 1E2YA 1V2AA 1GL8A 4HDEA 1GWCA 2LS5A 5G31A 1ERWA 4GRFA 2K6VA 1SK1A 2YCDA 2LSTA 5KN2A 4IELA 4MABA 4MF6A 3FR9A 2ZCTA 2LKUA 1GH2A 4YQMA 1BQ7A 5D9VA 1OYJA 3H1NA 4OFNA 4HZ4A 1HYUA 1JFUA 2P5QA 5J5NA 3S9FA 1T1VA 3GKNA 1G0TA 1PL1A 5C04A 2L57A 2NDOA 1A2JA 3FKFA 3G7IA 2YPMA 1O6JA 1K0DA 1ERUA 2H6XA 3TUEA 5IO0A 2OJLA 1M9BA 3QMXA 4K6XA 2MMZA 1DUGA 4MPFA 1VRSD 1MDJA 4N11A 5IO2A 3GSTA 3QDNA 2G2QA 3KJYA 5JWRB 1URMA 5F05A 3NOFA 1MDKA 3O76A 4JEDA 1A24A 2GS3A 5G2ZA 2IMEA 2R6KA 2JZSA 5DDLA 3FR6A 5ECRB 2LTKA 5F8BA 2L6CA 3VWVA 5EPFA 1PN9A 2GT6A 3KMNA 3G7JA 3APSA 2LUSA 5AISA 4EDZA 3CYNA 3ME8A 3DIEA 2JADA 3EWLA 1TI1A 3LWAA 3TJFA 2VCWA 2AV4A 3GH9A 4TR4A 3D5JA 5DJMA 1Z7PA 4ECBA 1THXA 2OBIA 3D4MA 4KX4A 1TK5B 2BMXA 2G0FA 3GN3A 1SK2A 2HFDA 5CO3A 1R5AA 4V2NA 4PGTA 3RHBA 2LQQA 3G9BA 3TOUA 2OBKA 3P7XA 3G7YA 1O8WA 5J41A 4ZB9A 3QPMA 2HSYA 2MYGA 4OO4A 4ZB8A 1QFNA 4K2DA 3LYPA 4JR4A 4AGSA 5B8BA 5D73A 4Z7XA 3KM6A 4IHUA 4K7OA 3ED3A 5LD0A 3DEXA 4RQRA 3U6VA 3BD2A 3MWHA 3DRNA 2DJ2A 3IE3A 4MJEA 1GP1A 1SL0B 5DALB 5CRGA 4D73B 1EP7A 3TKRA 3D22A 3L9UA 2NVLA 1X9WB 3FW2A 5A4UA 3DYRA 2PPTA 2R4VA 2YWOA 2J23A 1KEBA 2BJXA 4MP4A 5DVBA 3GUSA 1SL1B 2DJJA 2V6KA 3HZ4A 1TK8B 3APOA 3ZVJD 4EVMA 2CT6A 1PGTA 3F4SA 4FYUA 3ZIJA 1MTCA 1ON4A 1THOA 1RK4A 3KMOA 1K0BA 1WRYA 5HQPA 1PX7A 3OR5A 2JACA 5DCGA 4MZBA 3VPTA 3IDVA 1NW2A 2QGVA 5ENUA 2NPBA 4JBBA 3BCKA 1B8XA 5IMCA 1X0RA 3GKXA 1IYIA 2N5AA 2VCZA 2FGXA 2FD3A 5J3RA 3VWXA 2QSIA 1GUMA 4KSMA 3F63A 2DMMA 2CAIA 1XBSA 2VCTA 1GSDA 4NPBA 5CNWA 3UMAA 2C3QA 3LORA 3SWLA 1YF0A 1ABAA 2ALBA 2B5EA 5AN1A 3M0FA 3GH6A 1WPIA 1PA3A 2WS2A 4BVYA 5ECHB 3DVWA 3I69A 2C0FA 2DMLA 3GV1A 4K7NA 3HDCA 5B8AA 3ZITA 2I1UA 2CA8A 2IMIA 3RPNA 2B3SA 4DSSB 2DC5A 2H76A 1MDIA 2HZFA 1LBKA 2C0EA 5G5FA 3FK8A 5A4WA 2IFQB 1V57A 5GSTA 3I9V2 2HZEA 3LEFA 2HYXA 2LNTA 4HEA2 3H93A 6GSVA 4K1FA 4TN8A 4ZIJA 5DALA 3A5WA 2JSYA 4JZQA 4GCIA 4KE3A 3P8WA 4H86A 2I4AA 5ABRA 4OFMA 3D4TA 3V1WA 4ZBBA 3LFLA 3HD5A 2LJRA 2H70A 1TI3A 1FVKA 1Q98A 1GSFA 2J9HA 3CXGA 1JZDA 1BJXA 2HE3A 2RM5A 1HNBA 3TKQA 2GDRA 1MEKA 1Z5YE 3EVIA 2FNOA 1TRSA 3GTUA 4I8BA 5HR3A 2O7KA 3VWWA 1AUCA 1Y25A 2WRTA 20GSA 4ILFA 4LMWA 3TOTA 3BJ5A 2B5XA 4QL7A 2Z9SA 3Q18A 5ID2B 2X64A 1EEMA 1XIYA 3DXBA 2OADA 1ML6A 2MMAA 3WGEA 1GTBA 1DSBA 1LJRA 1GLPA 2H8LA 1BX9A 3J7Yb 4MJBA 3I43A 5CRHA 5ECIB 1ST9A 2CX4A 2NBSA 5IMVA 1X5DA 3LXZA 2L5LA 1G7EA 1A2MA 3CTFA 4HI7A 1YQ1A 6GSUA 5KN1A 1O7UA 3E9JB 2L5OA 5D9XA 4ZILA 5B7CA 3KXOA 3PGTA 2IPAA 3E3EA 4TXOB 4TW5A 3VLNA 2IMFA 3M1GA 1U3IA 5ECQB 1EV9A 3UL3A 1A0FA 4KUNA 3TKSE 3ZREA 4HJMA 2HSHA 4XCSA 2RUFA 1ZL9A 4IKHA 1PKWA 3C1SA 4DSSA 2DIYA 3F4TA 3IV4A 4KA0A 5D93A 2H72A 3TCOA 5AIVA 1JZOA 3ZYWA 4HUAA 5HR2A 3ZVJA 2MMOA 3RHCA 2HRFA 3ZMLA 2MBSA 2IFQA 3N5OA 3UBKA 2AAWA 3QAGA 4WR4A 3F6FA 3F4RA 2I81A 1TRVA 4HZ2A 3ISOA 5ELGA 4L0UA 1AQXA 3I6AA 1G6WA 5IOXA 3F8UA 4FH8A 3WYWA 4ZBDA 1V9WA 2FHEA 3A3TA 4J56E 4PNFA 2VLVA 3HYPA 2YP6A 1WJKA 4WKWA 5IIZA 3BCIA 2VD0A 2GQLA 1EEJA 4F03A 1ZZYA 2PMTA 1TKDB 4MF5A 4HU7A 1SJZA 3N9JA 3TJJA 2O8VB 19GSA 2VCQA 5CP1A 3DGQA 4HQSA 10GSA 2RLIA 5F06A 4AJ7A 1G7OA 2TRXA 4HU9A 5CYYA 1FOVA 3W6GA 4XRAA 2H0IA 2PWJA 5ID2A 1F37A 2V6OA 5HFIA 3HKRA 2HRNA 4EE0A 1XZOA 3DD3A 4XHMA 3ZMKA 3GX0A 1XFLA 2H1DA 3IAM2 3H8QA 4WBJA 1S3AA 1OKTA 4ISDA 4MH3A 5ECKB 3GL5A 4I97A 3WGXA 4I6XA 2GQKA 4N0VA 4CDOA 2YANA 1F2EA 4POBA 2PN8A 4XS4B 2JU5A 4MDCA 4XTSA 4TXOA 4ZB6A 3ERFA 1A2LA 2VLUA 1XOAA 2CAQA 4KB3A 2IMKA 2AYTA 4IQ1A 1F3BA 3J7Yk 4LLRA 3FR3A 4NHZA 1XWAA 1PQNA 2FA4A 4L0WA 1R7HA 3KD0A 1A8YA 2VL9A 2PVOC 4XS1A 2YV9A 4GXZA 3KP8A 2L4CA 4OD7A 1U6TA 2WZ9A 5FHIA 5ECMB 5ECLB 3EMPA 2YWNA 2DBCA 3LSZA 4FYCA 1B48A 2WDUA 2JL4A 2RM6A 5IMAA 1CQGA 1K0MA 3QFAC 1EWXA 4TVEA 4ECCA 5A5KA 1BAYA 3GYKA 2GSQA 1NHYA 4MK3A 3KIJA 4E8HA 2YV7A 4ZL9A 5ECPB 4K0NA 7GSSA 5E4WA 1AW9A 2M80A 1USBA 5D9WA 3DKSA 4MZCA 1S3CA 1OKDA 2L4QA 2XBQA 5AIXA 1XWBA 1DE2A 2C4JA 2V32A 4PUAA 4G10A 1OE7A 4KSOA 3KH7A 2A4VA 1SU9A 1J0FA 1TDIA 2VLTA 3LJRA 3EINA 1EGOA 2PGTA 1QK8A 2HI7A 4I2UA 4ID0A 3R2QA 4K0GA 1RW1A 1R4WA 4YQUA 3TKPA 3KP9A 2PVQA 1PKZA 4KDXA 2KUCA 1XOBA 3EURA 4NXIA 3QD9A 5D8IA 3D0ZA 1OE8A 3C71A 4EKZA 2C3NA 4ZBAA 2K8VA 2IJYA 1XW6A 5IQYA 3GNJA 4BL7A 3L4NA 3EE2A 2OE0A 3D6IA 4HJ2A 5H5QA 3EU3A 3MNGA 2MMNA 6GSTA 5D96A 1PMTA 4O92A 4BPYA 1RQMA 4XS4A 3DVXA 2CZ3A 5IM9A 2GZYA 3A2WA 3UVHA 1TJDA 2HZEB 2N5FA 5JCGA 2C0DA 1M2DA 14GSA 4TR0A 3SBCA 1OVNA 3ZRDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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