The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
124
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sequence length |
294
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structure length |
269
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Chain Sequence |
RITPKKLRELSDLLRTHLSSAATKQLDMGGVLSDLDTMLVALDKAEREGGVDKDQLKSFNSLILKTYRVIEDYVKGSNFMLSIVEPSLQRIQKHLDQTHSFSDIGSLVRAHKHLETLLEVLVTLSQQGQPVSSETYGFLNRLAEAKITLSQQLNTLQQQQESAKAQLSILINRSGSWADVARQSLQRFDSTRPYTAIHRQMMAAHAAITLQEVSEFTDDMRNFTVDSIPLLIQLGRSSLMDEHLVEQREKLRELTTIAERLNRLEREWM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Migration-inducing protein 5
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| publication title |
Yersinia virulence depends on mimicry of host rho-family nucleotide dissociation inhibitors.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Signaling protein
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| total genus |
124
|
| structure length |
269
|
| sequence length |
294
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2006-06-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF09632 | Rac1 | Rac1-binding domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | ||
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2H7O A; 2H7V C; #chains in the Genus database with same CATH topology 3BQK A; 5JR9 C; 3A8Y C; 3E22 E; 3Q5E A; 2D0U A; 4LF4 T; 4IDP A; 4LER A; 4HFK B; 3RQE A; 4Q4Z F; 1SUM B; 3PUQ A; 4WW0 A; 1YZA A; 1V4A A; 2YU2 A; 2J1D G; 2Q9C A; 5L0I A; 4HWC A; 1TWH A; 3AE9 A; 4HWI B; 3AE2 A; 1S7Z A; 2EIJ C; 2WL8 A; 3O6X A; 5BR8 T; 1APC A; 1ZW3 A; 1KNP A; 3EHM A; 3EZI A; 4KC9 A; 2EPN A; 5BQH A; 2K48 A; 1RXQ A; 2EIK C; 2ZLY A; 5JP7 A; 1Y64 B; 4JE9 A; 3F2E A; 2PG8 A; 3KYJ A; 2WP9 A; 3NRH A; 3U5S A; 4MTO A; 2N1G A; 4O4J E; 2JQ9 A; 1EKY A; 2DNX A; 3K3Q C; 3JRT A; 3DJN B; 2E9X A; 2YN6 A; 1FEW A; 1V54 C; 4XEF A; 3DJU B; 5AQM B; 4JUR I; 3M15 A; 2PJQ A; 1ORY A; 2V7J A; 4K0U A; 2KLQ A; 1UUR A; 2DI4 A; 2WWU A; 4RBN A; 3I1A A; 5L3E B; 2V26 A; 5L4H A; 4P6I C; 2RA1 A; 2W2U A; 4UVC B; 5JRA A; 2IC9 A; 1IJ5 A; 3RKO F; 1MMD A; 4YJW A; 3AG2 C; 4ZI3 C; 4JW1 A; 2KSR A; 3EGD B; 5CI8 A; 3RYI E; 2YEV A; 5TJ5 E; 1OED B; 3RIU A; 2XQ3 A; 1TFO B; 3IQC A; 3P4R A; 3JAF A; 4DR4 T; 3NMI A; 3TK0 A; 1YA7 O; 5JRC A; 3AEG A; 5AQP B; 4MLK A; 5JR9 B; 2YQY A; 3SYN A; 3ZJ1 A; 4V1A v; 2YLG A; 2BG9 A; 4I1M A; 2DYS C; 3TLS A; 4DMW A; 4E0H A; 5FVL A; 1HE1 A; 3TLU A; 3GN5 B; 3TLV A; 1V55 C; 1V9D A; 1N36 T; 2ASR A; 4BJN A; 1M57 C; 2BL2 A; 1OCO C; 2L81 A; 4EZH A; 5FL1 A; 4CSA C; 4H9P C; 1T6Q A; 3LES A; 2NP9 A; 2VCC A; 2R6G F; 5KYW A; 1ZV4 X; 4YT2 A; 2KK1 A; 4GOU A; 5CB4 E; 3N24 A; 2OU6 A; 3PTR B; 2PP4 A; 2Y3H A; 5L3F B; 1XZY A; 2F4V T; 2A9U A; 3ZST A; 4IE5 A; 4U2Z A; 4Q7C A; 1E2A A; 5JDM A; 2AXD S; 4NTF A; 4N06 A; 5AQF B; 4B6I A; 3B0V C; 3LEV A; 1SE7 A; 3AVR A; 4BEJ A; 5KX5 E; 1E83 A; 3PMR A; 5IHY A; 4A2N B; 5FNV E; 2ZM8 A; 1D1A A; 3GWL A; 1A7D A; 5HWY A; 2J0W A; 4ERR A; 3C8G B; 2CCQ A; 1HNZ T; 1NFO A; 3V7O A; 4YY3 T; 4CN6 A; 2PFD A; 1HS7 A; 1QKR A; 1HNX T; 3VKH A; 4X1Y E; 3UUM A; 1E85 A; 4JEH B; 3UUB A; 1A0B A; 3C50 A; 4HFI A; 3L8I A; 5JSL A; 2XQ9 A; 3AEB A; 2J0X A; 4AK9 A; 4LDQ A; 2VCA A; 2ZXW C; 4JTA B; 3UQ4 A; 5E0O A; 3AAE B; 1IZN B; 5K0I A; 3LG7 A; 3N5L A; 2DWK A; 2Q4F A; 4KHP T; 1QLB A; 4LF9 T; 3LFM A; 2NUT B; 2IXO A; 3N9O A; 3DE8 A; 4AKI A; 2XSE A; 4CI3 B; 4J2C A; 3A7M A; 3Q6M A; 3LS0 A; 1AJ3 A; 2JJ9 A; 4M63 A; 3P4W A; 1OKK D; 2XM1 A; 4H9O C; 3O9X A; 2YL0 A; 5L4E A; 5CIV A; 5KYX A; 2B1E A; 3E0Z A; 4BJM A; 2W67 A; 4UIG A; 2C0S A; 3CEX A; 3SXK A; 3NZP A; 2XQ6 A; 5EGY A; 1YA9 A; 3ONJ A; 4U3C A; 5DS5 A; 2UUH A; 4AE4 B; 2EPL X; 1MQV A; 3IHR A; 1O87 A; 2NSG A; 3NVO A; 2GFH A; 1XMO T; 3UMH A; 3ZMV B; 2YKZ A; 3CSK A; 4ZI2 C; 3UU4 A; 4IE4 A; 2XQY A; 2E5L T; 3B0U X; 2R7T A; 5BUO A; 3AA7 B; 3HNI A; 3V5U A; 3EPV A; 2YLD A; 3EUH A; 1KU2 A; 4X1I E; 3SFE A; 3HJC A; 3PUZ F; 1T7S A; 5JR9 A; 4NXM T; 5LNK A; 2HN1 A; 3NBX X; 2LLY A; 2DI3 A; 4DOZ A; 3RW0 A; 4ZLD A; 5DJQ C; 4HFB A; 2LRK A; 3RRW A; 3DMD A; 4A5X A; 2NG1 A; 5FYM A; 3PJA A; 3SWH A; 1AUE A; 2V5D A; 2XLD A; 3FDQ A; 2BZB A; 3KV9 A; 3I4U A; 4U5D E; 2XAJ B; 3TKL B; 3POV A; 4EAH A; 2NTY A; 2KW3 C; 2XQ4 A; 5HXH A; 2R7R A; 3DAF A; 3A11 A; 1J8Y F; 2C03 A; 1VCT A; 1OW7 A; 2I15 A; 3ZEF B; 3ZJ2 A; 2R9R B; 3LJC A; 3ZT5 A; 1YD8 G; 4ASK A; 5IY5 C; 3C4Z A; 5L3V A; 2KWI B; 5HEG A; 2G0U A; 1YDI A; 2AP3 A; 3C8G A; 4FX5 A; 2Q9A A; 3HKB E; 5AQQ B; 2CNW A; 1D0Y A; 2ZPA A; 4OYJ A; 3M65 A; 1WRD A; 5JH7 E; 5L3Q A; 2M67 A; 2X0C A; 3JRM O; 2ZM6 T; 3ABL C; 2OJQ A; 2P0N A; 3U8P A; 4TV8 E; 3SZR A; 4WBO A; 4E0I A; 1HTJ F; 3ZDL A; 1VTM P; 3LLK A; 5JVD E; 5AQK B; 3UQ7 A; 3BRJ A; 1W2W A; 2XQ5 A; 3A9C A; 4YWQ A; 4ONS A; 5T1D B; 3EFO B; 1M62 A; 2IHR 1; 5LCY A; 3AOU A; 3C18 A; 2WDQ A; 4O4I E; 2KGO A; 2XS8 A; 1MIW A; 4TX5 A; 4KI0 F; 1UCU A; 2K9A A; 2X0Y A; 3KFW X; 2UXD T; 2VKD A; 4JVS A; 4E18 A; 3I0O A; 3AB3 B; 1FJG T; 2D5R B; 5LGU B; 1BDJ B; 2JQH A; 3FVY A; 1U4Q A; 3AE5 A; 1Z6A A; 2QE9 A; 3PUA A; 4Z91 A; 3ZYK A; 2J7P A; 4DV3 T; 1D0X A; 4U5H A; 4CSA A; 3V5Z A; 2IML A; 1YZC A; 4AE4 A; 2VWA A; 2XY8 B; 2LSI A; 2L6F A; 3RVZ A; 3EI0 A; 3GM3 A; 2HZ8 A; 4A4A A; 5AQI B; 2OJE D; 3QNU A; 3HNJ A; 3RF3 A; 3PDM P; 3MYF A; 2QA7 A; 2IYL D; 2HV7 A; 4WAB A; 5B1A C; 1T8B A; 2I6H A; 5JT4 A; 1ZHW A; 4XLP F; 1Z63 A; 5L0F A; 2JPF A; 3DP7 A; 4I0U A; 2YU1 A; 2LOS A; 1OCR C; 1YVI A; 2JMH A; 3U78 A; 4YXD A; 3ZCJ A; 1MMG A; 5HXS A; 4HEA A; 3RQF A; 1ZHZ A; 3RFY A; 1J5W A; 3JZ0 A; 3O1H A; 3HA4 A; 4XBF B; 3DXJ F; 4PNI A; 2FFH A; 4GKJ T; 2YZS A; 2GWW A; 1LIH A; 3JSZ A; 1I4Y A; 2CW0 F; 4EZ4 A; 4U5F E; 1U0B B; 3ZVR A; 2LP4 A; 3CQZ A; 3HI2 A; 2W45 A; 1VMA A; 2EPM X; 5JDG A; 2IXP A; 5ABH A; 4C3D A; 1LS4 A; 2ZXO A; 1NWM X; 3Q7G A; 3HL6 A; 4AKR B; 2NPU A; 4AKL A; 4CX9 A; 3S84 A; 4MFR A; 1VLS A; 4YTM A; 4LF6 T; 3LBX A; 3PV0 F; 1JNZ A; 3TLW A; 4H63 V; 2J62 A; 1GGQ A; 3LJB A; 4NY3 A; 2EHO B; 4H9Q C; 4D4N A; 2W00 A; 1FIO A; 2WMO A; 4BG0 A; 5EK2 A; 4EIW A; 2CEA A; 4HWF A; 1I6Z A; 3O39 A; 4CDY A; 2V7K A; 2PX0 A; 4EKW A; 2C04 A; 2A6E F; 3W15 B; 5B3I A; 2Q9Q D; 2HFI A; 1B68 A; 4KP3 C; 2LM2 A; 4EXT A; 4QI0 A; 1A41 A; 5T3T A; 2PFV A; 1RJ9 B; 4ISS A; 4ILA A; 2I8B A; 3B29 A; 3MBG A; 3QTH A; 4FWV A; 4DV5 T; 3HKD E; 4CBE A; 3EFO A; 3VM6 A; 2HPL A; 1KTM A; 4HE8 A; 4M1P A; 2W4X A; 5TAO A; 3CML A; 3KVA A; 2WU5 A; 3MAC A; 2KXP B; 3DI5 A; 4CS7 A; 1N1C A; 3N2G E; 2HJ3 A; 3RIU C; 2UUB T; 3RKO A; 3CX6 B; 3GM1 A; 3W8H A; 4NPP A; 1WGW A; 3AE3 A; 3FOP A; 4JEU B; 4O6N A; 4ER9 A; 2W62 A; 2E9X D; 3MXZ A; 4PJJ A; 1YYJ A; 2VAS A; 1OCZ C; 2CDQ A; 3NYJ A; 4TUY E; 5LMN T; 3OA1 A; 1L7C A; 3G4X A; 3H2U A; 3AQB A; 1ZHY A; 3S28 A; 4EIY A; 4JEB A; 3EHN A; 4U31 A; 5JDF A; 5AQT B; 3C8Z A; 1A7V A; 5E33 A; 4AQF C; 1EQ1 A; 2VL8 A; 4GKK T; 1NU9 C; 5IWA T; 2XXA B; 3FAP B; 2VC9 A; 1TWG A; 3VF0 A; 2LOP A; 4O2B E; 1A7E A; 3NMK A; 4XPY A; 3WAK A; 2CXF A; 4LMK A; 2WM9 A; 4JCZ A; 3LNM B; 4BJ5 C; 1M56 C; 2D4U A; 2XAQ B; 3FZH B; 3VYW A; 3AG3 C; 4MTF A; 3VR8 A; 2V6X A; 3PHF 2; 2EIN C; 5JDN A; 2C5I T; 3QB5 K; 4H9S E; 5DQV A; 1H9G A; 3FZM B; 5AQL B; 3Q5W A; 4JI6 T; 1M2V A; 2RSE B; 3SP1 A; 2H3R A; 4DR2 T; 4LFB T; 3EAB A; 4DR1 T; 4CN4 A; 4DR6 T; 5COM A; 1W0B A; 3AE7 A; 2R7W A; 3N2K E; 4QWN B; 1G4U S; 3QMK A; 5F5F A; 5DS4 A; 1HNW T; 2LM9 A; 3ZTZ A; 4ULV A; 4Z9I A; 1KEY A; 3GWN A; 1N34 T; 4PFP A; 4DID B; 2J45 A; 4IGG A; 2RD9 A; 2YIN A; 4JI4 T; 5DQT A; 1FTS A; 1RCP A; 4ZEY A; 1G5Z A; 1E2X A; 4OIN F; 3ETV A; 2MAW A; 2B0J A; 1TWA A; 4DR5 T; 4CS8 C; 1BBH A; 3O10 A; 4EHP A; 3N9N A; 4MVQ A; 1MMA A; 2NUP B; 4P0B A; 2CYD A; 2HV6 A; 1NFN A; 4HFF B; 1KNZ A; 1RJ9 A; 4B3R T; 5AQJ B; 1ZKE A; 3L34 A; 1BR2 A; 4YL0 A; 3B13 A; 3R84 B; 4J7T A; 4QXH B; 3JC6 D; 5KDM C; 4ZOL E; 4JIO A; 4PAC A; 1E1H B; 4QXC B; 2LSJ A; 2E2A A; 2QRX A; 1ZP0 A; 2H8A A; 3W4Y A; 4J7Y A; 1KK7 A; 5A69 A; 2QNL A; 2V6Y A; 4P0A A; 2K24 A; 3Q9D A; 3ZPO A; 1OED C; 3UUN A; 2P6V A; 4DO0 A; 1XWJ A; 5AQV B; 4W8K A; 3PDY A; 4FI5 A; 4RD9 A; 3C64 A; 4OK0 A; 3HTK C; 3FHD A; 3IQ6 A; 1T6U A; 4O4H E; 2KMF A; 2J4G A; 1E84 A; 5A6A A; 2KC3 A; 1HX1 B; 3N9Q A; 1LM3 B; 3LSV A; 2LHR A; 2NW9 A; 4ILC A; 5FY7 A; 5JDQ A; 2NSF A; 4C7O B; 1XWM A; 3UT5 E; 2YHS A; 1HCI A; 2BKO A; 3H2V A; 3WAQ A; 2BS4 A; 5AC5 A; 3ZTM A; 2YDS A; 2J47 A; 2VK9 A; 5AQR B; 2AWY A; 4IWB A; 1OED E; 2HHH T; 3PUV F; 4HFH A; 4CN1 A; 4YHJ A; 3RKG A; 4XEK A; 5AGF A; 1JOG A; 2J9U A; 1LS1 A; 3K6B A; 3W2W A; 4JZA A; 2WY2 A; 2CBJ A; 1XNQ T; 4X1K E; 4EBB A; 1SR2 A; 4P1N A; 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3X2Q C; 5LBQ B; 2MPK A; 4DBR A; 2M6I A; 3T9O A; 4JUY A; 4FAP B; 4PW8 A; 4WJ0 A; 5DS6 A; 4IJJ A; 2X9W A; 4CQI A; 1BR1 A; 4ZHQ E; 2YK0 A; 1N32 T; 2X9Y A; 1FMW A; 4L9I A; 1IW7 F; 4G7H F; 2J7P D; 5HSW A; 2Y39 A; 5AQO B; 3VU7 H; 1OW8 A; 3RIP A; 1HE9 A; 3U0C A; 1B7T A; 3WI3 A; 2FBW A; 4QH1 A; 3OEO A; 1VYK A; 2EPO A; 3KBU A; 3H65 A; 2HPJ A; 3NYL A; 5KYU B; 4AQY T; 1C03 A; 1Q0M A; 2W0G A; 3K1I C; 1US7 B; 2BKN A; 2FJB A; 3ZMS B; 4L5G A; 3VHL A; 5L3C B; 5IYZ E; 1UFB A; 4CI1 B; 5L0D A; 3I9W A; 4U74 A; 3ZC4 A; 4GYT A; 3UGP A; 4CS8 A; 2ICW G; 1Z7Q c; 1EA8 A; 2XLM A; 4HKA A; 3N2Z B; 4NQF A; 3FXD B; 3UNG C; 3EAM A; 1OWA A; 3NRX A; 2IOQ A; 1V74 B; 4DRH B; 4G7O F; 4PK6 A; 4Z8X A; 4FES A; 3L0I A; 2ZXR A; 4H63 H; 3LEO A; 5JLI A; 2L6H A; 4OIP F; 4LDR A; 1HG2 A; 4QKN A; 4AL0 A; 4KHZ F; 5HXC A; 4B6X A; 3EGD A; 1KNY A; 4Q5S F; 2UUA T; 2DL1 A; 1OED A; 1DOV A; 3U2L A; 5F5W A; 2YDR A; 3O55 A; 3G50 A; 2C5K T; 3B5M A; 4IAQ A; 1WAT A; 1ZW2 A; 4U9E A; 3HKK A; 2Y3D A; 4XAX B; 3ECS A; 2UXC T; 2OEX A; 4G7Z F; 3OYX A; 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