2H8X | Genus

Total Genus 129

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	129
sequence length	358
structure length	358
Chain Sequence	ALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas putida
publication title	Xenobiotic reductase A in the degradation of quinoline by Pseudomonas putida 86: physiological function, structure and mechanism of 8-hydroxycoumarin reduction. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Xenobiotic reductase A
total genus	129
structure length	358
sequence length	358
ec nomenclature
pdb deposition date	2006-06-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2h8xA00

5KZEA 2B0MA 1AW1A 4OHQA 2PE4A 2JK2A 3WK0A 3TW7A 1OX4A 1OVDA 3GX9A 3W3OA 2YFOA 4MY9A 4DO5A 1W5NA 2V5BA 1ZCOA 3TXZA 2RH9A 3PULA 1YTDA 5AC8A 1MO0A 3IIPA 5D05A 2C1HA 4S1FA 3I68A 3C52A 3TQ0A 4I9AA 3PG8A 1H60A 3GKFA 5AHLA 3G1YA 3W7RA 1W5PA 1EUAA 3N2MA 1IIGA 3LB0A 4ZQCA 2C13A 4UTTC 5F2IA 3SIZA 3GXNA 2X2GA 3LXBA 3N14A 4UMAA 3HPXA 2FQIA 5EMUA 3RMJA 2B4GA 1M6JA 1EP2A 4HSNA 3EX4A 4DXVA 4KFPA 2E5BA 2ZZ7A 7TIMA 4UFHA 1GVOA 3NL6A 2AGKA 2EKCA 1JCJA 4UFMA 4DQWA 3NO5A 4QAIA 5CSRA 3MHUA 3QMRA 2PURA 1LRQA 3NL3A 3PBYA 2B7PA 3K30A 3LHTA 4CNOA 4HPJA 3ABQA 1MXSA 3DBPA 1SZNA 1MZHA 1KFJA 1J2WA 4MY1A 1F7BA 1AL7A 4JEQA 1G4PA 2Y7GA 3N34A 4WJEA 4N9EA 3H53A 3ZS4A 3EX2A 1G7UA 2QJHA 2QUVA 4LY8A 3HGRA 3QMTA 4JTEA 1HL2A 3G1HA 5CPLA 3BGGA 3UYCA 1EP3A 2RDUA 4QNWA 2QCDA 2A4AA 4GRSA 4ZQRA 2ZZ1A 2C19A 2WKJA 1JRCA 4JICA 3TSBA 4AF0A 4O1CA 1ADOA 2QCLA 3NQ8A 3G3MA 6ALDA 4RJEA 2Y85A 1VYSX 4OV9A 1LROA 1I4NA 2DZXA 3LM7A 4UFIA 4K37A 3PC0A 3YPIA 3MHGA 5D09A 3IGSA 3ZWTA 1V5XA 3PBVA 2NUWA 1VRDA 3M6YA 4E2DA 5DN1A 2I9EA 3NQGA 3W1TA 1GWJA 4L4MA 1KLZA 4JGDA 5BOOA 4MFDA 4CLMA 3DZ1A 3BPWA 4O57A 4LTSA 1SO4A 5K9DA 3MMTA 3ABSA 3W9ZA 1LORA 3MWAA 4I7VA 3LCFA 4WD0A 3KVKA 2BTMA 1BKSA 3LHZA 4N4PA 3QFEA 5LNVA 1P1XA 4JY9A 2CFFA 2WPBA 1KFCA 2A7RA 1LZOA 1K02A 4PCFA 1QFEA 3LI0A 1SUXA 3QPYA 4EF8A 3MP4A 2GVLA 3OVPA 4IPIA 5G1TA 3LCXA 4FNRA 3OG3A 3AJXA 3QH2A 2ALDA 4IMEA 1KFBA 3FA5A 3G8EA 5H2ZA 3ANYA 1A53A 1YDOA 3GZ3A 1DJNA 3G0SA 3TJXA 1MEWA 4GE8A 4RXGA 2ZRVA 4IMDA 3U2OA 2C18A 3W22A 3WJYA 2GPTA 3WJWA 3P5YA 3NOEA 3QQ0A 1G69A 5EPDA 1Z44A 3RFAA 3S1VA 4UCGA 2QJIA 3TIMA 2QCFA 3QZEA 3THQA 5D32A 3BW3A 1PE1A 6TIMA 3C3NA 1RV8A 4A2SA 4X9SA 1H7RA 4O4WA 1LDCA 4WXYA 3SI9A 3DFOA 4QSHA 1KBIA 2RKXA 4K39A 3BARA 1SZFA 3GAYA 3TKFA 4CQ8A 2BZNA 5U7SA 2V2DA 5D30A 1KM3A 4O12A 4LNYA 3CWOX 3LHVA 1P4CA 4MY8A 3VKJA 1FDYA 4DPQA 2NXGA 4O13A 4O14A 1PCKA 3EWXA 3CHVA 4LRSA 1ICSA 3PSVA 2G96A 1VLWA 5HJLA 4N2YA 2WV8A 4HKPA 3TW6A 2VENA 1OYBA 3EB2A 3IIOA 4MOZA 5AFDA 1TRDA 4H6KA 3W7PA 2A2IA 1TPFA 3KVMA 5FEZA 3GXPA 1GT8A 3F4NA 5IM51 2TSYA 1DBTA 2ZRXA 3W7QA 4XWUA 3NPXA 4HN4A 3P84A 1XUZA 3S1UA 4AB4A 4MUZA 5AOUA 4M6VA 3ABRA 5J5RA 3P8IA 3G3DA 1B9BA 4UR7A 4QITA 1SW7A 4ZQPA 3FOKA 3A24A 1M5WA 2CLMA 4UFKA 3PUDA 4MFEA 1FCVA 1TV5A 1HFBA 5EBUA 4A21A 1R46A 3GDKA 1H7XA 1SW3A 4NXSA 4HNNA 1Y0EA 3NM1A 1THFD 3L5AA 1KFLA 4K6AA 1OABA 2Q8LA 1PV8A 1M7PA 4MVAA 3W88A 1D3GA 1GPWA 3N9RA 1JCMP 3MBFA 4B5NA 3W1MA 4GFSA 4NZJA 3MO7A 2WSQA 1LM1A 2QCCA 3HGSA 1EWEA 1K8YA 3A21A 4LS0A 1WV2A 1K3UA 3W83A 4DELA 3M16A 3MI2A 1F6KA 1GEQA 4GC4A 4NX0A 2VFDA 4OT7A 1TB3A 3OIXA 2Z1BA 4I7WA 1NVMA 3KHJA 3EWUA 3NQAA 5C5YA 2X1UA 3JR2A 2F7FA 3UD6A 3GNNA 4TR9A 3CC1A 4FX6M 4ZQMA 5HR6A 3QRHA 5I3IA 4Z08A 1H5YA 3OVQA 1TPWA 4U4MA 4BR1A 3KFTA 3W2JA 5L9FA 3DH7A 5CKSA 3TMQA 3NA8A 4FO4A 1TRIA 4KFOA 1GG1A 4XKYA 2ZA1A 2OX1A 2A1YA 1XUUA 3L21A 4TX9A 4NJJA 3MYOA 3EKZA 3KVJA 3O6YX 1XBZA 1GZGA 4BI6A 3INPA 3EEGA 1MEIA 4QNEA 2Y70A 4FNUA 4NNAA 1W5OA 3A23A 4CCDA 4FB7A 4AMAA 5D03A 3MI6A 3LXAA 4FXSA 2FPYA 1OFQA 3MYPA 1UASA 1SO3A 3PY2A 3R2GA 4NJKA 4NJGA 5CZJA 3IVTA 1VC4A 2Y63A 3CIWA 2ZCGA 1BWLA 2DZWA 3NXFA 4A29A 1K03A 2ISVA 3ATZA 1LBLA 2Y7FA 5G1YA 1S3HA 1VCGA 3W7EA 2A6NA 1C9DA 1QO2A 4DPPA 1ZALA 3QSRA 5HWMA 1YXCA 4JTUA 2VFIA 1G4SA 3TX9A 3P67A 3NQEA 3UWYA 3W76A 3DI1A 2ZFAA 3GR8A 4FXRA 1SZGA 5DLCA 5EY5A 3W75A 3KAOA 3BG5A 5C2XA 3TK7A 1G67A 4W9TA 1A5CA 1PL9A 4FIQA 4GUFA 4JYFA 2AAMA 1FWTA 2Y6ZA 3MP3A 1NSJA 1SFLA 1AW5A 2VFFA 5FESA 2ATSA 4RX0A 3GLCA 4O19A 1KM6A 1SW0A 1OK6A 4LVBA 4JTLA 1XL9A 4IX0A 1WA3A 3GR7A 2DZTA 2C6QA 4LV4A 2V30A 1FXQA 3TU9A 5LGXA 4JN6A 2PCQA 1TREA 4NU7A 1SO5A 3W1PA 3VI2A 1PS9A 2WNNA 3LBCA 2R8WA 1TPVA 1YTEA 4DO4A 1SSGA 3IV3A 4K36A 4LC6A 4QJ1A 3UXDA 2FLIA 3V75A 3EKLA 4GUJA 5DXXA 1FDJA 1GOXA 2ISWA 2HMCA 4GJ1A 4TU1A 1JCLA 1RQBA 1T0OA 4E0CA 4O1BA 2HSAA 1YDVA 3LTPA 3RF9A 1QOPA 3W2KA 3RK8A 2V5LA 1SZEA 1W3TA 3L66A 1TV8A 4AHOA 5FF3A 3A9IA 2ZRWA 3VCRA 1VHNA 2EHHA 2YGYA 4WOQA 4ADTA 4DEFA 3B4UA 1UUMA 4EF9A 4ADUA 3UXAA 1MSSA 1TJRA 3S9YA 1FCQA 1D3HA 3ATYA 1TPDA 2QAFA 4UIOA 3V1PA 4UFLA 2YX0A 1OFBA 1ZHAA 2DJXA 2OT1A 1OF6A 2O7QA 2E6FA 5AYXA 3W7OA 2BXVA 1OFRA 4TMCA 1H51A 1U5JA 4HT3A 2JGQA 2W0UA 1H63A 1N55A 1YYAA 1OX4B 4IXXA 3W74A 3NGJA 3QM3A 4EOUA 4WY0F 1B4EA 3GB6A 4IXHA 1ZAIA 1DL3A 2DP3A 1CW2A 4O15A 1GYLA 3H55A 3NM3A 3NEVA 1I2OA 3F1QA 3LGEA 3P80A 2A7PA 1TIMA 1HUVA 3ELFA 3L65A 1WAUA 3TH6A 4E2BA 2QUTA 4YMZA 4RZ4A 2V9DA 3G1FA 3BW2A 2WO5A 1K7FA 3O6DA 4OGZA 3STEA 3M43A 3Q2DA 1KM1A 2VEMA 1QAPA 2DORA 4WZHA 1XFBA 2Y89A 4WXZA 4TMBA 1GVQA 1L9WA 1I2RA 2DZVA 4IMFA 3S6DA 4O53A 1ZY9A 1KA9F 2YPIA 1KFEA 3O1NA 5K4ZA 1H7NA 3Q37A 3P8JA 4QM1A 2V8ZA 2JKAA 2NLIA 2ZBTA 3CT7A 5EYWA 3LCIA 3W2UA 4CNPA 5TQLA 1KTCA 5A8GA 3W7JA 1AG1O 2ZZ3A 1O4UA 2FIQA 3LCLA 3IVUA 4FX8A 1M7OA 4M5PA 4JYDA 3EX3A 3QPZA 2E5CA 1EPXA 2Y88A 4AHPA 3W1UA 2G95A 1DV7A 3W7KA 1PHWA 2GJLA 5CPNA 3MBDA 4LVAA 1TO3A 4N02A 1FX6A 1ZJIA 4FNQA 4JTSA 2GJNA 1HG3A 1I8JA 1FQ0A 1R2RA 2E6AA 2HS8A 5D02A 4NXKA 1VCFA 2QCDB 3TE9A 1PHQA 2ZZ5A 2YYUA 3E96A 3TC6A 3IGXA 5FEXA 3IEBA 4AF0B 4C1KA 4AXKA 1I45A 2GUUA 1WX0A 4UMCA 3NQ2A 2R91A 3HG2A 3B8DA 3HPSA 3S1WA 4R53A 3RU6A 4DO6A 3R8RA 4BWLC 3CLMA 3NQFA 1QCWA 3HO8A 4O28A 4JTHA 4Z1BA 2ZA2A 1H61A 2RFGA 3NZ1A 1DQXA 3SGZA 3BG9A 3UWUA 1W1ZA 3B06A 1X1OA 5CZSA 3PVFA 3ZFHA 1W3NA 3R12A 5G2WA 3BVJA 3O07A 1GJPA 1O95A 5I3FA 1TPEA 4P61A 4PL1A 3G22A 2VEPA 4UTMA 3SJ3A 1PIIA 3W7MA 3TAKA 3DKLA 4MIMA 3FJLA 1A5BA 1AW2A 4NZFA 1KLYA 1ONRA 5DBUA 2YYTA 3UY7A 3Q94A 3ZR4A 1TTPA 1JRBA 1YLVA 2NWSA 2A7NA 3DFNA 4UTIA 2FFCA 5AHNA 5AYZA 1QPOA 2QJGA 3W2MA 3LRKA 1XBYA 3W7CA 1OYAA 4JY8A 3QW3A 2NX9A 3UPWA 1JQVA 4Z0JA 1DOSA 1E51A 4ORMA 4GUIA 3W7GA 1H7WA 2G97A 2OT0A 1VZWA 5HUOA 4Y96A 1DJQA 5LNRA 3C2EA 2WJZA 2ISSA 4YLWA 4RR4A 5F2GA 4JS3A 3NR0A 2H90A 1BTMA 3TA6A 1EEPA 3C2VA 1WBHA 3NNTA 3G1SA 1TTQA 3WJSA 2PRHA 5CSSA 1UJPA 3DFPA 3QSTA 4LV9A 3PBUA 5D2VA 5MHBA 4NQ1A 4JTIA 1TV7A 3GXTA 3QC3A 1TJPA 2ZRYA 3G1XA 2C14A 5E93A 5FF4A 3LLDA 3BLFA 2CLHA 2FTPA 1X1ZA 2Z6JA 3E0IA 4XTDA 1YXYA 1OFEA 3MHFA 4JXCA 2ZZ6A 3SECA 3STCA 4LOCA 2FPVA 1OHLA 2NV1A 3PBWA 4IWWA 3NQDA 3L9CA 4ADSA 2QAPA 3QW4B 3N19B 4NJHA 4UR8A 2QUUA 3HB9A 3RLVA 3UQNA 1ZFJA 1LOQA 3I7QA 4GNJA 4NJIA 3DKJA 1VR6A 5I3HA 5DBTA 3PM6A 4QISA 4NNBA 2X1TA 4O17A 3T78A 1VS1A 5LHFA 2DU2A 2YW4A 1OJXA 1ZAJA 4UXDA 3AO0A 5CZTA 1VYPX 5HWNA 1SFJA 1IF2A 4EVZA 1JR1A 3PWAA 4LVDA 3W7HA 4E38A 5KITA 5K2ZA 2J6XA 4KWWA 3HF3A 3W86A 3KRZA 4O0ZA 3HIJA 5CZ0A 3SR7A 3NZRA 4LVFA 1S5TA 1RPXA 3GDMA 4LW7A 3SY5A 1B4KA 2V82A 3L68A 4D2JA 2QCHA 4N6EA 5EA9A 4JR5A 4R34A 2E6DA 2GVJA 2J88A 4M7TA 4PTNA 1D9EA 2NV2A 1QNVA 3NQ6A 4FNSA 4PH6A 1JCXA 4MLJA 3HPZA 4MJZA 4A2RA 1ZENA 3GDTA 3KVLA 4IGHA 3T55A 2IQTA 1I2QA 2XN1A 3OHIA 1LTDA 4EIVA 3LCHA 1FXPA 3FYOA 4UUIA 2CLLA 1VPXA 3CM4A 1L6YA 1L6SA 4PA8A 3BLIA 2GVGA 4FHAA 4CCEA 1W56A 4LC8A 3S42A 3L2IA 1WBJA 2DJLA 1F2JA 1GVRA 1OFDA 1WXJA 4JD4A 3S1XA 4KFNA 3R13A 4N6FA 1OF8A 1SPQA 3I6RA 3LBMA 3LHWA 5SWUA 1ZAHA 4UNKA 2EF9A 5DY3A 1OK4A 3LCGA 3N3MA 4UTHA 3O06A 1K7EA 3M9YA 2H6RA 4PL2A 3C4UA 3D0CA 1AL8A 4XKYB 3FS2A 1GTHA 3CPRA 3T44A 4JX4A 4UC5A 5IBXA 3FLUA 3TQVA 4WY0A 1Q6OA 1F05A 3WK1A 2E68A 2VFEA 2CLFA 5FF2A 1W5QA 2E5DA 1JJKA 5G4EA 2QEZA 4UTKA 5AHMA 4K8EA 3PUOA 1FCBA 3EWBX 4DBEA 3FKRA 1I2NA 4ZQNA 3VE7A 2O7SA 4WOZA 4MJMA 3P60A 1AK5A 1T99A 2A21A 1LLWA 1R47A 3NQCA 5F2MA 3MW7A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2H8XA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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