2HAVA

Apo-human serum transferrin (glycosylated)
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
676
structure length
676
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The Crystal Structure of Iron-free Human Serum Transferrin Provides Insight into Inter-lobe Communication and Receptor Binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
molecule keywords Serotransferrin
total genus 192
structure length 676
sequence length 676
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA03
2UVHA 2X7PA 5CMCA 1B52A 1M5BA 4ISUA 4NWCA 4PQJA 3ZS6A 1S7YA 3SEXA 1A8FA 5AA2A 5I2NB 2DVZA 4LZ7A 3Q29A 5FTIA 1JEUA 1ELJA 4BDOA 3KZGA 1B3EA 3CG1A 4BDLA 1IXCA 1MXYA 1UIVA 2XXXA 5CBRA 1DOTA 2THIA 3O97A 1YPNA 1OLAA 2D21A 1L5TA 3T9VA 2GRVA 3MPLA 1EU8A 2Y7WA 4X1DA 4RPOA 3S9LC 1QVSA 1NL5A 2NOOA 3U1OA 5JTYA 4F19A 4F3PA 2R71A 2WKYA 3HSTA 4ONYA 1VFEA 2Y7PA 5DT6A 4DLDA 2F7BA 2FNCA 4NF8B 1R6ZA 2XHDA 4U23A 4HTGA 1VSOA 4QFPA 2P0SA 3W9VA 4KHZE 4NF4A 3IX1A 1JNFA 2B3FA 4EF1A 3QSLA 3TYHA 2DWHA 2NUVA 4RK2A 2P2AA 4GFRA 3H4ZA 3TTRA 4JSDA 1DPEA 1M5CA 4ESWA 4MBPA 2XXYA 3KFMA 4PFWA 3C33A 2Z22A 3FJGA 4Z7EA 2A5TA 4NF6B 3FD3A 4JBZA 1RYOA 2B65A 4GOTA 1B2HA 3PUVE 3OO8A 3T9XB 4YB5A 2P1SA 3OELA 1QUIA 2LAOA 4I1DA 1NNPA 4THIA 2D3IA 3UN6A 1NFTA 3UP9A 5JTYB 3B6QA 2ZYMA 4QSEA 3VV5A 4GRKA 3B6WA 4G8MA 4X9TA 1ZU0A 3UIFA 1B3FA 4IGRA 3TKDA 2ALUA 3K6XA 4F29A 2ZXTA 3CIJA 1OLCA 2DSFA 2Z8DA 3HHGA 1D9YA 4FJPA 1S50A 3D4GA 3RT8A 1IIWA 2R9JA 2ANJA 3FXQA 1I6AA 1MDP1 2O69A 2PYYA 4KYSA 4OYVA 4POWA 2QL3A 3VXCA 3S9EA 3TQWA 1GR2A 3FIRA 2F6PA 4F31B 4H5GA 3T9HB 5KCJB 2DYXA 3FXRA 5ICQA 4ESXA 2D5WA 3OO6A 3THIA 4F18A 3IOTA 4NF4B 5DVIA 1P1OA 3OENA 3G7WA 2AIXA 4QHQA 4ZEIA 4RXLA 3E9XA 3EF7A 1NH7A 4YU0A 4HS7A 1LLSA 3PUXE 3T22A 3H6UA 2O6AA 3MP1A 1UIUA 4ZEBA 4OEUA 4PP0A 4F3GA 3AXFA 4NE4A 3T93B 3HPIA 5K2YA 4YICA 1N76A 3I5OA 3MP6A 2DOJA 3HCQA 4ZS9A 1SW1A 5FHOA 2UVIA 3G3HA 2PT1A 2AL4A 2VD2A 1PB9A 3LSLA 3PPQA 5CBSA 1H3DA 2FYIA 3UA8A 3VLWA 5H8FA 1P1WA 3TELA 3BFUA 3K01A 3K1PA 5AA2B 3OO7A 5I2NA 3CR9A 1ZJLA 3PMWA 4G68A 1MG1A 1USYH 4IY6A 3H03A 1B1HA 2V3QA 5ITOA 4R72A 4ZE9A 5JEIA 5A5XA 1P99A 5AA1A 2H5YA 3S9NC 4U21A 4BLAA 1Y3QA 4KCDA 3IR1A 1MQIA 2DP8A 1JEVA 3M3LA 5DVFA 4DXBA 5B7DA 5LOMA 5ISUA 5ICTA 3RNNA 4LATA 2ZYKA 4AQ4A 4N13A 5TU0A 4G68B 3FJMA 3M3KA 4G8NA 1ZMGA 3C34A 2UVGA 1FQCA 4GIZA 3C9HA 4ZE8A 2DQVA 3HO7A 1LB8A 2REJA 2UVJA 3HV1A 4YKJA 5H8FB 2Q8JA 3V5AA 1D3KA 1ANFA 3IJXB 1LSTA 1SI1A 1IXIA 2VP1A 3VE1B 4F2OA 1PDAA 4TLMB 4QFNA 2Q2CA 2H98A 1BLFA 2V3TA 2W7YA 5I57A 1LAXA 1AOVA 4KYEA 4PFYA 3DLNA 2OJTA 3KN8A 3IB1A 4U1OA 5J1DA 3B6TA 3MAMA 3W9WA 1IITA 1M5FA 1B0LA 2UYEA 3DM0A 3ECRA 4ZDMA 3A09A 4GXSB 2Z8FA 4U2RA 4JXIA 2PVUA 2DXRA 1HSEA 3FGSA 3K6WA 2DE4A 1SI0A 4GL8A 1LAHE 2ZYNA 4U1ZA 2Y7IA 3M8UA 5CI5A 1MPBA 4RNSA 5H8HA 1YCJA 3KN3A 2NXOA 3O2AA 4RYAA 2QMWA 1R9LA 5CMKA 3U72A 1N04A 3N26A 4PE5B 1XS5A 1PBPA 4G77A 4OFOA 3H6WA 5DVJA 1N7WA 4Z0IA 3VVEA 2R6GE 3Q28A 1Y1MA 4C0RA 4R6KA 3O9PA 2HAUA 5ELVA 5I2KA 2F6GA 1CB6A 3CVGA 1MY1A 2OCUA 3O6GA 4GWOA 4LP2B 1LCFA 3K0VA 3TEPA 2PT2A 3VDFA 2OK2A 1YTVA 2V84A 5M2VA 3K6VA 4F22A 4MF3A 5H8NB 1QKBA 3OO9A 2RCBA 4R2FA 2O1LA 1Y4CA 4HW8A 1FQAA 1A54A 1JW4A 1PEBA 1M5DA 5EHSA 5DEXA 2DXYA 1MXZA 1AH5A 3F11A 1H45A 1Y3PA 4H6DA 4OWDA 4PFTA 3IO6A 2XXHA 2KLFA 2VGQA 1B46A 3TCFA 1DTZA 3MVXA 4GQOA 4H65A 3RGYA 3GZGA 2BJJX 1LFGA 4EDPA 3G3FA 3R26A 4NTLA 3QK6A 3SERA 4OVJA 1EZ9A 1F9BA 4YKPA 1R1NA 2G29A 3K1MA 4U22A 5CMBA 3SEVA 1MXVA 1FCKA 3VLUA 3GBBA 3T66A 2E1SA 3C4MA 1H76A 3BFTA 2H9BA 4F1UA 3IL1B 3ILUB 4IO5A 3M3FA 4O3AA 3EN3A 3C32A 4KYDA 4YB6A 3PU5A 1I69A 2I3VA 1B7HA 1QJMA 4LQ2A 2Y84A 4O3BA 5CMMA 5I59B 3EPEA 3I6VA 3TZAA 4NF8A 2XD3A 3LUYA 4XKNA 1PC3A 1ZIUA 2F5XA 1OQGA 2F36A 4R9GA 1OVBA 4YAHX 2RC9A 1II5A 4YKKA 1HSJA 2O51A 4FE8A 3R7XA 4DXUA 1I6BA 2Y7RA 1SDXA 1WVJA 3CFLA 2F97A 3L6HA 1LB9A 1XHYA 2I4CA 3DELB 2VHAA 2VD3A 3VFJA 1MQDA 1FTKA 1M5EA 2RKMA 3H7MA 3G3IA 4HCWA 1MXXA 1DSNA 2XXUA 3HN0A 4X1BA 4F1YA 3LSWA 1KWHA 1B0HA 1IEJA 2RF1A 4YMBA 5BUUA 3OSRA 2QSXA 3A3CA 4FEDA 3GLBA 1B5JA 3T96B 2I48A 1J1NA 2ZYOA 1SW2A 3RN8A 3S9MC 2PX1A 3R6UA 1PBQA 1FTJA 1O7TA 1IQ7A 5DTBA 1MXWA 3FVGA 3MC2A 2HQ0A 3B7DA 5TP9A 4ZZEA 3RUMA 4JWOA 3USDA 3PPNA 3ZKKA 2F7AA 3K4UA 3KSJA 1IXGA 1JQFA 1POTA 1YAEA 3A3UA 2YPNA 4I8CA 4IO6A 3IORA 1GTKA 3CG3A 2H4IA 2QMXA 3PGFA 2QPQA 1R9QA 5IAIA 3QXMA 1LGBC 1LCTA 1LBCA 4WKMA 4NF5B 3TCHA 3U8QA 3QUJA 1MQJA 3TAJA 4ELQA 1FTLA 1GV8A 3K00A 1B40A 3LR1A 1VE4A 3C36A 1MH3A 1Z7ME 2Y7KA 3MZBA 4XXUA 1LBBA 2I49A 2O7UA 3FZVA 2HCAA 1MQGA 2QS1A 3IO4A 4XKQA 3H6VA 3UGWA 4E0XA 3ILTB 3U94A 2ONKE 1Y1ZA 3H6TA 1QULA 3N94A 4ZEDA 1EZOA 2RCAA 3PPRA 3PMVA 5CM6A 1FTOA 1FW0A 2I6EA 2A5SA 2IA4A 3O6IA 3PUYE 4OXVA 1JW5A 3OSQA 3CSBA 3KEIA 4DZ1A 1MY4A 1T0KA 1SW4A 3IJOB 1P1QA 3PV0E 3O66A 5L9MA 3SETA 4EXLA 3PPOA 3FV2A 1CE2A 3RPWA 1MY0A 3N6TA 1A99A 3CFXA 3EHTA 3E3KA 2ZNSA 3MP8A 3MUQA 3H3GA 1H44A 3QYTA 4FORA 4WXJA 5I56B 5I58A 1Y3NA 3CI8A 3FV1A 4NMYA 1WDNA 4OQOA 1IZ1A 2Z8EA 4ZECA 2ABHA 1TT1A 5TPAA 4KD5A 1LFHA 1MM7A 3TCGA 1EZPA 1N7XA 1US4A 1B4HA 1A7LA 3OEMA 2REGA 4XKPA 5EHMA 2CZLA 1RKMA 1FTMA 1D9VA 3EHUA 3GXAA 4DCXA 1NMUA 4LQ5A 4BDQA 3CRBA 3BBRA 5H8SA 2Q89A 3G3JA 3K2DA 1B4ZA 1LAFE 4YZZA 4EF2A 4ELOA 3CFZA 1OIBA 3I3VA 5I58B 4G2ZA 4Q8RA 1BKAA 5I2KB 1AIVA 3IK6B 4R2BA 3MVWA 2DE2A 4K3FA 2XXIA 1MY2A 4XIGQ 4OEVA 5L9SA 1B51A 4G68C 1NNTA 4XTCQ 4Q0CA 1USYE 1B3LA 2DWJA 4OHNA 4OFJA 4FATA 1LAGE 2ZMBA 4QFLA 1MDQA 3U93A 5L9OA 3HHFA 3V83A 2HZKA 2UYFA 2V25A 2O1MA 3O29A 3SEYA 5B70A 4H67A 2E0SA 3QUFA 3MZ1A 4IY5A 3FJ7A 2O7IA 4IO3A 4NEDA 4OMBA 4F2QA 3U92A 3FUZA 4C1UA 5CC2A 3QAXA 2RINA 3CSGA 3IB0A 1B7ZA 4Q5TA 1N3XA 3G3KA 3GBAA 3IAZA 2Q9TA 2HFBA 4RK9A 2G93A 5FTHA 3FVNA 1XVXA 4ZEFA 2YJPA 4E0WA 5H8QA 3MWBA 2NWJA 2RC8A 1B3GA 3EQ1A 3MJNA 4LZ8A 4P0GA 3IB2A 1LFIA 4OERA 3ZKLA 2AL5A 3C31A 1MH4A 3N6UA 4LONB 4YMAA 5TPAB 5IKBA 4H1XA 2M8CA 2F78A 4O3CA 4OESA 4U4XA 3SDFA 1B32A 3E4RA 1FQBA 4FAJA 4EQ9A 1QUJA 4DDDA 3KG2A 5HPQA 4G4PA 1MY3A 1NNFA 2ONRA 5I56A 1HSLA 1A55A 3OOAA 2XX8A 3D4CA 1N84A 1B3HA 3S4UA 3ZSFA 1URDA 3K02A 2AYSA 3JV9A 3LSFB 3PUZE 4LA9A 5KDTA 1XVYA 5TP9B 2QS4A 4R9FA 4POXA 1US5A 3MVYA 4JDFA 4EQBA 3PD9A 4Q30B 3FATA 1DTGA 1B58A 2XD2A 3SKPA 3OXNA 1B7UA 1S9TA 4N07A 1JW1A 4JSOA 3RLFE 3IOWA 4I9DA 4DIGA 5A5XB 3TUSA 1FQDA 1N0TA 4IB2A 4H0WA 3TPAA 5AA4A 2XX7A 3FXUA 1NKXA 1BP5A 1UTHB 2ONSA 3EHSA 1MXUA 4KFQA 4EXKA 2V93A 3ONMA 1SYIA 4WEDA 3FASA 3MZ9A 3TFLA 3DP4A 3KJTA 3SEUA 4GXAA 1B9JA 3FVOA 4LUBA 1TFAA 5F7VA 1UTHA 2DVCA 1IXHA 4KPTA 1ZBMA 1ZKBA 3JYRA 4JWXA 5AA4B 2DWAA 1SBPA 3Q25A 4NF5A 4QSDA 4AB6A 1FQFA 1GGGA 1PB8A 1VR5A 1POY1 2HXWA 1OVTA 3QIMA 4R73A 4LVQA 4DXCA 4R74A 5KCJA 5BWJA 3ODBA 1XT8A 4GL0A 4TLLB 4ELPA 2XX9A 5AA2D 4ELRA 2OZZA 3TMGA 1ZLQA 1B5HA 3IOUA 3PMXA 2PBWA 4YB7A 1O64A 3RTWB 3MPKA 4AB5A 4QFOA 5HM4B 3DP6A 3TTKA 3E13X 1RYXA 5L8DA 3N5LA 3LC8A 4IO2A 1FQEA 1BIYA 1EH3A 3PPPA 4IGTA 5DYHA 2I3WA 1O63A 4RJZA 1QW0A 4DCYA 3KJ7A 2OWSA 2O68A 2QJEA 5KDTB 2GFEA 3LBSA 1JETA 1VFDA 4IO4A 4KR5A 3VXBA 4I62A 3KN7A 3MBPA 4R6HA 2XXPA 2Q88A 3K1NA 3Q26A 1P1NA 4PETA 5H8QB 1B6HA 2I58A 2F8DA 2XXVA 3RTFB 2OWTA 2FA7A 4RPNA 2GH9A 4MFIA 2Q2AA 1SD3A 4RY1A 2GHBA 1MS7A 2ESNA 3FVKA 1WODA 3OD7A 2H99A 2QRYA 3TODA 1AL3A 4F3BA 3W15C 1A40A 1JVXA 4GVOA 4U4SA 5EYFA 5I84A 1Y20A 4H8IA 1SVXB 5I59A 2B3BA 2HZLA 2A5TB 4NF6A 1ZTYA 3KOSA 1MRPA 1Q1KA 1SYHA 2I4BA 3KOTA 2RC7A 4UACA 4KQPA 1GVCA 3OEKA 4X48A 3V8XB 4JWYA 4EQ7A 1SW5A 3MVZA 5H8HB 3Q27A 4GD5A 1JVYA 3DP8A 4L17A 4H5FA 4QSCA 3SESA 1MPCA 4ZEKA 1IUDA 4F3SA 4OFLA 2I0BA 5CRYA 4ZZAA 3T9UA 2F7CA 1Q35A 2XXWA 3G3GA 3L6GA 4OZ9A 1Z7NE 4OETA 4C1TA 1I6QA 3VLVA 4LZ5A 2YLNA 3O6HA 4G8HA 3JZJA 4P0IA 1MPDA 2H25A 4JB7A 4XKRA 5DEXB 2O84X 4YKIA 5I57B 1A8EA 3RT6B 3KGCA 3C35A 4FECA 4MLVA 2NVUB 1XC1A 5F1QA 3TDJA 2DS9A 4FIMA 3WAEA 4BDRA 2CMOA 2PMSA 3KBRA 4R75A 4GLIA 3PUWE 5H8NA 3TTMA 5AE4A 1URSA 1OQHA 2IEEA 1DPPA 3KSXA 1AMFA 2Z23A 5JK4A 3VVDA 1XOCA 1MM6A 2ZNUA 2ZNTA 5HBCA 3VVFA 2UXAA 2X7QA 4N6PA 4KCCA 1OMPA 4QF9A 5FHMA 2DE3A 1TWYA 4R6YA 1SQYA 3UORA 4BDMA 3MQ9A 5ITPA 3MW0A 2HAVA 3H06B 3TTNA 4M1VA 4DE8A 2QS2A 4QRZA 1TFDA 3LSXA 4WEPA 2XXRA 3OMBA 1BTJA 2OLBA 2V3UA 1Y4TA 4H8JA 1UTBB 4UA8A 3TQLA 1DMBA 1TXFA 1UQWA 1Y9UA 4OENA 4PFUA 3BKIB 5FHNA 4F1VA 4ECFA 1NH8A 1QKAA 1D4NA 4ND9A 1PB7A 4QFKA 1H43A 1URGA 2QS3A 2XXTA 5K2XA 4EUOA 5AA3A 3TTLA 3SEWA 4GF8A 2HEUA 4HCYA 4MH5A 1ATGA 2F34A 4MLQA 4TOZA 4FEBA 2X26A 3P7IA 1NNKA 4RA1A 2GHAA 3RY3A 4TQUQ 5KZTA 1UTBA 1MQHA 1QUKA 4F39A 2DWIA 3PD8A 1N3WA 2VOZA 1B05A 3IOVA 2I0CA 4KI0E 2XXQA 3V89B 2F35A 2OBGA 1P1UA 3O28A 4M4GA 4P11A 4OTEA 3RQTA 3S2VA 4BDNA 3WAFA 1B5IA 3UK4A 1B1XA 4NWDA 3K6UA 4IO7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2X7PA 5CMCA 1B52A 4PQJA 3SEXA 1A8FA 5AA2A 4X8RA 4MNPA 1UIVA 1IMDA 1DOTA 2THIA 1YPNA 4X1DA 1EU8A 3RPLB 1NL5A 2Y7PA 5DT6A 2FNCA 2XHDA 3W9VA 4HTGA 4PE3A 4QFPA 5IGAA 4EF1A 4P3LA 1DPEA 4MBPA 1NV5A 2XXYA 2Z22A 3FJGA 4JBZA 3PUVE 2V4CA 4THIA 1INPA 4GWXA 3UP9A 3B6QA 1ZU0A 3TKDA 1NV7A 4GWUA 4F29A 4MCOA 1OLCA 2DSFA 3FXQA 1I6AA 2PYYA 4KYSA 1T0KA 3VXCA 4AS4A 2Y5LA 1GR2A 3TQWA 4GX3A 1YYZA 4F31B 2DYXA 5ICQA 4F18A 4NF4B 2O6AA 4HE1A 4OEUA 4F3GA 3AXFA 3RPLA 3T93B 5K2YA 1N76A 3MP6A 4ZS9A 3PPQA 5CBSA 5H8FA 1P1WA 3BFUA 3K1PA 5AA2B 3CR9A 4R72A 2H5YA 4U21A 3RNNA 4P47A 4G68B 3FJMA 1FQCA 4GIZA 3HO7A 2UVJA 2Q8JA 1D3KA 3IJXB 1LSTA 1IXIA 3VE1B 4MNIA 2H98A 2V3TA 2W7YA 1AOVA 1LAXA 4QBAA 4PFYA 3DLNA 5J1DA 1M5FA 1B0LA 3A09A 4U2RA 4NQ8A 3NOHA 2DXRA 1HSEA 3K6WA 2DE4A 5I3SA 1LAHE 3M8UA 5CI5A 2NXOA 2FIXA 5CMKA 2QMWA 4PE5B 3N26A 1XS5A 1PBPA 4OFOA 3VVEA 4C0RA 3O9PA 2HAUA 5ELVA 1CB6A 3CVGA 1MY1A 2PT2A 1YTVA 2B4MA 4MF3A 1QKBA 4HW8A 5EHSA 4P1EA 4MJOA 1AH5A 1FBEA 2FIEA 3TCFA 3MVXA 3QK6A 1EZ9A 1F9BA 4YKPA 3K1MA 1MXVA 2E1SA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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