2HAVA

Apo-human serum transferrin (glycosylated)
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
676
structure length
676
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Serotransferrin
publication title The Crystal Structure of Iron-free Human Serum Transferrin Provides Insight into Inter-lobe Communication and Receptor Binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
total genus 192
structure length 676
sequence length 676
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA03
3DLNA 4JXIA 2ZMBA 2OJTA 2D21A 4AB5A 3K0VA 3MPLA 1AL3A 4KYDA 4ZEDA 4Q8RA 1A99A 2RC8A 4YB6A 4ELOA 4OEUA 1PDAA 1N7XA 4RPOA 1NH7A 4XKPA 1J1NA 3PMWA 1MY4A 1TWYA 2GHAA 5HM4B 4ND9A 3PD8A 3PMVA 3IB0A 3FXQA 2DXYA 4BDOA 4H8IA 3U72A 4FIMA 4N07A 1R9LA 4ESXA 1QULA 3B6TA 3TQWA 2THIA 1N84A 4NWCA 1Q1KA 4F19A 1EH3A 2DWJA 3BFTA 5TPAB 4NMYA 3ONMA 3VDFA 1DTZA 4KCDA 4EDPA 5A5XB 4U23A 4U1OA 4R75A 2XXPA 5ITPA 5EHMA 4X9TA 4U22A 5ICQA 1BLFA 5TU0A 2I58A 3OENA 1LFIA 4DDDA 1FTOA 1LBBA 1XVXA 1UQWA 3L6GA 1MPBA 1LGBC 5I56A 1CB6A 2DYXA 5H8NB 1QVSA 1LB9A 2O51A 1LAHE 1O7TA 3OELA 4YU0A 1A54A 3MBPA 4WKMA 2ZXTA 3P7IA 2YJPA 2YLNA 4GIZA 4QSDA 2QS1A 4ONYA 1EU8A 4DZ1A 3Q25A 3UORA 1H3DA 3PUVE 5H8SA 4OWDA 4YKKA 3DP4A 2Z23A 3PU5A 3B6WA 4PFYA 1PBPA 2AL4A 1IEJA 2D3IA 4I62A 3UN6A 4XIGQ 1B0HA 3USDA 1Y20A 2HCAA 2P0SA 2QMWA 2XHDA 1D4NA 3IO4A 2RKMA 3EF7A 4F3PA 4NE4A 1D9VA 1DOTA 2DE4A 4G68C 3U93A 4OTEA 5JTYB 1T0KA 4GD5A 4PQJA 2VOZA 4RPNA 4NF6A 2H99A 1SYIA 1QUJA 1FQAA 1SW4A 3Q26A 4H5GA 1MM7A 3OO7A 4I8CA 3HCQA 5TP9B 1F9BA 3M3FA 1I6AA 2OK2A 3V89B 3HN0A 1MXUA 1PBQA 2Q2AA 3KGCA 4GOTA 1D3KA 4YKIA 4JSOA 2W7YA 2PX1A 5I59A 3G7WA 4KYSA 2ONSA 1RYXA 3W9VA 4IO2A 3KBRA 2H25A 3I3VA 1IQ7A 3G3FA 4RK2A 2AIXA 1FQBA 2Q88A 1BKAA 3TPAA 3K6VA 4KQPA 2ZYNA 5I57A 1DPPA 1SD3A 1S50A 5ITOA 1XS5A 3FATA 4HTGA 2QPQA 3TUSA 2XX9A 3Q29A 1L5TA 3H6UA 1MY0A 3I6VA 5DTBA 4AB6A 4KCCA 2DXRA 2I4CA 4F3SA 2PT1A 3FASA 3IOWA 2XXWA 3PGFA 1MY2A 1N76A 2V84A 5ICTA 3DP6A 4U4XA 5IAIA 3CRBA 3R26A 1IXGA 1JEUA 1ZU0A 5KCJA 1MXYA 1N3WA 1SQYA 5CM6A 1TFDA 4F18A 1MY1A 3EPEA 3TTMA 2XXIA 4JDFA 4QF9A 2UXAA 4JBZA 1JEVA 4X48A 3N5LA 1TFAA 4U2RA 3UIFA 2Z22A 2RINA 3PPNA 3KOSA 4FEDA 4BLAA 3PV0E 4G8HA 1ZKBA 4IO5A 3MAMA 1OIBA 2R6GE 4H6DA 5DEXB 2NWJA 3K1PA 2PYYA 2RC7A 5CMMA 1MRPA 3GXAA 3C4MA 3FJ7A 3TTKA 1N7WA 1MXWA 3Q28A 1Y4CA 3QXMA 1GR2A 4JWYA 4NEDA 4Z0IA 1GTKA 1LAFE 4HW8A 3CFZA 5L9OA 3RT6B 3O66A 3BKIB 4H0WA 4TQUQ 1XOCA 4FJPA 2NXOA 3PUXE 3RTWB 4BDQA 1RKMA 1VE4A 1B4ZA 1PC3A 4NF6B 5M2VA 4EF2A 2XXXA 2ZNSA 4F2OA 3LSXA 3O2AA 1N3XA 3RGYA 5KDTA 1UTHA 3MP8A 5I58A 1AH5A 3KEIA 4ELPA 3E13X 3O28A 2QS3A 3U1OA 1I69A 3VVDA 4LZ5A 1FQEA 3CIJA 5B7DA 5I59B 3CI8A 1FTMA 2UVIA 2F6PA 3ODBA 1MXVA 1BTJA 3ILUB 1UIVA 2F97A 1YAEA 1SYHA 4YAHX 2E1SA 3H06B 4PE5B 2ANJA 1ZMGA 4QFLA 4O3CA 3E4RA 2DVZA 2Z8FA 4GFRA 1A8FA 5JK4A 1UIUA 4OETA 1HSLA 3OSRA 4BDRA 4DXCA 2DSFA 1Y9UA 3PD9A 3O97A 4YB7A 4OVJA 4YMAA 4PFTA 1S9TA 4IO3A 4OERA 1TXFA 2IEEA 3S2VA 3SKPA 2X7PA 3VVEA 5AA4A 5KCJB 2QSXA 2O6AA 3CFXA 4DIGA 2G29A 3K6UA 4H67A 4R72A 4OFJA 3HHGA 3ZS6A 4AQ4A 3V8XB 3B6QA 1A40A 4R9FA 1XVYA 1VR5A 4ZE8A 4LVQA 2BJJX 3KG2A 3MVWA 3C31A 2Y7PA 3U94A 1P99A 5KZTA 1R1NA 5CMBA 2R9JA 2RF1A 1PB9A 2ALUA 5H8HB 4KD5A 3D4GA 1O63A 2F78A 3TAJA 3MP1A 3G3KA 4QFKA 5I84A 2V3TA 2QS2A 4NTLA 4G8NA 5F1QA 3O9PA 1LCTA 1II5A 3H6TA 2Y7IA 4U4SA 3OXNA 1NMUA 4JSDA 4GL0A 1M5CA 3FGSA 5DVIA 3A3UA 2XXTA 4F3GA 3TKDA 3FIRA 3BFUA 1SI1A 1QUKA 2O1LA 1Z7NE 4TLLB 3K00A 5AA3A 2I4BA 3QSLA 2I48A 4YICA 2Y7KA 3KJTA 3JYRA 4Q30B 1MY3A 3OEKA 1FQFA 1FCKA 4P11A 5CBSA 1M5DA 5CC2A 2AYSA 4YMBA 3IOUA 2HQ0A 1CE2A 3PPPA 1URGA 4RNSA 1UTHB 2HZLA 1US5A 5I58B 3EQ1A 2F8DA 2B3BA 3B7DA 2HFBA 3K6WA 4KPTA 4GXSB 4F1VA 3GBBA 3OEMA 1AMFA 1PB8A 1H76A 2Q9TA 2XXRA 4ESWA 1FQCA 3CG3A 1OVTA 5IKBA 2ZYMA 4ZE9A 2GH9A 1Y4TA 1MXXA 4FEBA 3IJXB 1O64A 3G3IA 4OZ9A 3IORA 4WXJA 2A5TB 1A55A 5EYFA 1USYE 4RY1A 5I2NB 4IO6A 3FJGA 1B4HA 3FVGA 3BBRA 3A09A 2A5SA 3H6VA 3U92A 4EQ7A 4ZS9A 2R71A 2Y84A 2H5YA 3TTLA 3RTFB 3THIA 3FV2A 1MQGA 2REJA 4YKPA 5H8QA 1LAGE 3KN8A 4ELQA 3OSQA 2I0BA 4XTCQ 5AA4B 3KSJA 2AL5A 4QSCA 1UTBA 1LBCA 3MZBA 3JV9A 4RYAA 3HO7A 1H43A 1M5FA 4OFLA 4LATA 2PMSA 3LUYA 4NF4A 2RCAA 3FD3A 1IZ1A 3EN3A 2DWIA 2OBGA 2O7IA 4KYEA 3S9LC 5B70A 4NF5A 2XX7A 2DP8A 4MLQA 1B6HA 1QJMA 4EQBA 3IJOB 4ZZAA 5HBCA 2REGA 4YB5A 4IO4A 1WVJA 1NNKA 3PUZE 1IXCA 1B3EA 1Y3PA 3FVOA 4LZ7A 1A7LA 1B5IA 1NNPA 1JQFA 2I3VA 1IUDA 5I2KA 2F35A 4OESA 3OO9A 3RY3A 3FXUA 1ZIUA 2Z8EA 3SERA 4OEVA 4DXUA 5K2YA 1NNTA 3PPQA 4I9DA 3MVXA 3AXFA 2XX8A 3TFLA 3SEVA 1B3HA 3SDFA 2Q8JA 5H8FA 2RCBA 4G68A 1GVCA 1DMBA 3LC8A 3RT8A 5I56B 2QJEA 4GLIA 2VHAA 3TCHA 3K02A 1FTJA 3IK6B 3TTNA 1QW0A 4LQ5A 4R9GA 1B46A 2P1SA 2V25A 3T9XB 3FVKA 3CSGA 3ILTB 3WAEA 3VVFA 4KR5A 4KI0E 4I1DA 2DVCA 3F11A 3KJ7A 3K4UA 4ISUA 4WEPA 4IY6A 4FAJA 3R7XA 3IO6A 1N0TA 3KN7A 3E9XA 1OQGA 2OZZA 1LAXA 3VE1B 1MQHA 3MZ1A 2F7AA 1P1NA 3IR1A 1H45A 3TELA 4JB7A 5AA1A 3OO8A 4F22A 4G4PA 3UK4A 4P0GA 1B5HA 4WEDA 1IITA 2DE2A 1NNFA 3MP6A 3VXBA 5AE4A 5FHOA 3K6XA 4FE8A 3T22A 2UVGA 1HSEA 5HPQA 1OLCA 4OHNA 1B3LA 5L8DA 2H4IA 4OYVA 3PPRA 1WODA 3SEXA 4OXVA 2V3UA 2OLBA 5H8QB 1JNFA 2Z8DA 4ZECA 1N04A 1NH8A 3S9EA 1H44A 4DCXA 3IAZA 5L9MA 5CBRA 1SW2A 3RLFE 3W9WA 1MQJA 2HAVA 3VLUA 2VD3A 2XXYA 3C33A 3SEYA 3TDJA 1ZLQA 3N6UA 2F7BA 2XXUA 3C32A 3MJNA 1HSJA 2UVJA 2CZLA 5CI5A 1VFEA 4QSEA 4NF5B 1NKXA 4QRZA 2DOJA 1AOVA 3LBSA 5BWJA 4F29A 4YZZA 1KWHA 2M8CA 1US4A 3QUFA 1EZPA 2B3FA 3SEUA 4ECFA 3FXRA 2F6GA 1ZTYA 1B0LA 3UP9A 4R6HA 1R6ZA 4X1BA 1ANFA 1URDA 3QYTA 1MG1A 5H8NA 1B3FA 4HCWA 5DVJA 3TQLA 2I49A 4FECA 1Y1MA 3M8UA 1LFHA 5I2KB 4PFWA 3O6GA 1MQIA 3MQ9A 3MUQA 4IY5A 1B1XA 3LSFB 5I57B 1FW0A 4Q0CA 4ZDMA 3CR9A 5F7VA 4ZEKA 3LR1A 3CSBA 1POY1 4XKRA 5H8FB 3HPIA 4NWDA 4DCYA 3N26A 4HCYA 3RQTA 2HXWA 5AA2A 1SBPA 4IGTA 3IL1B 2QL3A 2PT2A 4RA1A 2QS4A 4ZEBA 4MBPA 4UA8A 4THIA 1B2HA 4RK9A 3H03A 3QUJA 3QK6A 3C9HA 2XXQA 4GL8A 4C1TA 3R6UA 3G3HA 2X26A 4QFNA 4F31B 1B7UA 3KN3A 2F5XA 4O3BA 5ELVA 2I0CA 4XXUA 1P1OA 3KOTA 2UVHA 1R9QA 4GVOA 3C34A 5JTYA 4R2FA 1IIWA 2ONRA 1Y1ZA 3SESA 1MS7A 3A3CA 1GGGA 1YPNA 2FNCA 1OQHA 3PPOA 5LOMA 1B05A 1OMPA 2Q89A 3EHSA 4KFQA 3TCGA 1OLAA 1SVXB 3ZSFA 2O84X 3C36A 4M1VA 1MH4A 2VGQA 1NFTA 4R73A 5TP9A 1B51A 4LONB 1B40A 4FATA 3MPKA 3TCFA 2Y7RA 3LSWA 2NUVA 5JEIA 2ABHA 1OVBA 2PVUA 1M5BA 3G3JA 2F36A 1SW5A 3FVNA 5J1DA 3VLVA 1JVYA 4U1ZA 1B9JA 2FA7A 1WDNA 1B32A 3T9VA 1EZ9A 5CMKA 1I6QA 4ZEIA 3K01A 3HHFA 3W15C 2V93A 5FTIA 3SEWA 4G8MA 4DLDA 2GRVA 3K1MA 5CRYA 4Q5TA 4Z7EA 3MVYA 4P0IA 3TZAA 2UYEA 1ELJA 2ZYKA 5KDTB 1AIVA 3H6WA 3O29A 2E0SA 4OQOA 3FV1A 2GHBA 3PMXA 3S9MC 3GLBA 1YTVA 2DS9A 1XC1A 4U21A 1PB7A 4FORA 1B58A 4F3BA 4QFOA 1FTKA 1JW5A 4MLVA 2OWSA 4O3AA 3MC2A 4DXBA 1NL5A 3T96B 3GZGA 1IXIA 3FJMA 3T66A 5DVFA 4PP0A 1S7YA 4XKNA 4MH5A 3KFMA 4H65A 4LUBA 3TMGA 4BDLA 4UACA 2Q2CA 3MW0A 5K2XA 5ISUA 1RYOA 3V83A 5EHSA 2VP1A 5AA2B 3H4ZA 5FHMA 5DEXA 5AA2D 2G93A 4R74A 4POXA 3LSLA 2O69A 3TYHA 4LA9A 2F7CA 3PUWE 3EHUA 1XT8A 3D4CA 3O6HA 1B7ZA 4IB2A 4OFOA 1LSTA 3N94A 1MDP1 3IX1A 2XXVA 3I5OA 1GV8A 4YKJA 4L17A 3DP8A 4E0WA 1ZJLA 3T93B 3IOTA 4EQ9A 1Y3QA 1SDXA 2ESNA 4QHQA 3S4UA 1FTLA 3HV1A 2O68A 4GWOA 2DWAA 1MH3A 4EF1A 2ONKE 1YCJA 3GBAA 4GRKA 4EXLA 2LAOA 3O6IA 3CFLA 2P2AA 1P1WA 4G2ZA 1P1UA 3G3GA 2I6EA 3N6TA 1M5EA 4MF3A 3CG1A 1I6BA 3ZKLA 1PEBA 1JW4A 1JVXA 4K3FA 3VLWA 4LQ2A 2KLFA 2RC9A 1VSOA 2XD3A 5BUUA 1LFGA 2UYFA 2YPNA 3TODA 1MM6A 4N6PA 3MVZA 3TEPA 4OMBA 2WKYA 1EZOA 4E0XA 2PBWA 3HSTA 4F39A 3DM0A 3U8QA 4H5FA 3VV5A 2X7QA 4IGRA 4POWA 1MQDA 4NF8A 2HAUA 2QMXA 3IOVA 3L6HA 2DQVA 1MDQA 5FHNA 1B5JA 4OENA 4H1XA 2ZYOA 3TTRA 4TOZA 4TLMB 1A8EA 3FUZA 4QFPA 3VFJA 2I3WA 1Y3NA 1BIYA 2V3QA 2XXHA 1FQDA 4GXAA 4BDNA 1IXHA 3OD7A 4R2BA 1XHYA 2F34A 4C1UA 1TT1A 2ZNTA 1LCFA 3Q27A 1QKBA 4ZZEA 3V5AA 2QRYA 4ELRA 2B65A 3S9NC 1B3GA 3QIMA 2DWHA 3IB1A 2XD2A 4IO7A 1B1HA 4EXKA 3M3KA 2IA4A 5H8HA 1MPDA 1MXZA 2O7UA 1BP5A 3OO6A 3EHTA 4H8JA 4PETA 4F1YA 4G77A 5DT6A 1VFDA 1UTBB 2OWTA 4RXLA 3K2DA 1DTGA 2GFEA 3KZGA 3T9HB 5TPAA 1LB8A 1Z7ME 3T9UA 1ATGA 3H7MA 1P1QA 2Y7WA 5A5XA 4NF4B 4EUOA 1SW1A 4M4GA 5DYHA 1LLSA 3H3GA 1POTA 4KHZE 2DE3A 4X1DA 3KSXA 4RJZA 1URSA 3C35A 3RPWA 3MWBA 4JWOA 1Q35A 4R6KA 4JWXA 4GQOA 4HS7A 2OCUA 1D9YA 5CMCA 2ZNUA 3FZVA 4LZ8A 3WAFA 4XKQA 4MFIA 4DE8A 3SETA 4BDMA 1B7HA 3PUYE 1QKAA 2CMOA 3OMBA 3ZKKA 2VD2A 3OOAA 1B52A 3DELB 5L9SA 1JETA 3M3LA 4C0RA 3RN8A 1ZBMA 3K1NA 2NVUB 2H98A 3UA8A 4F1UA 4G68B 4N13A 3E3KA 3QAXA 2NOOA 1DSNA 2HEUA 2HZKA 2FYIA 4R6YA 2A5TA 2O1MA 1SI0A 4NF8B 3IB2A 3RUMA 5I2NA 2D5WA 3CVGA 4PFUA 1QUIA 5FTHA 4LP2B 3UGWA 2H9BA 1MPCA 3MZ9A 3JZJA 4GF8A 3ECRA 4ZEFA 4F2QA 1DPEA 3RNNA 1USYH 3VXCA 1JW1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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