2HAVA

Apo-human serum transferrin (glycosylated)
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
676
structure length
676
Chain Sequence
b'KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The Crystal Structure of Iron-free Human Serum Transferrin Provides Insight into Inter-lobe Communication and Receptor Binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Metal transport
total genus 192
structure length 676
sequence length 676
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2havA03
4TLLB 2F36A 2ZNUA 3EPEA 3E4RA 2Q89A 4OTEA 4G77A 3MVWA 1OMPA 4ZDMA 2Y7RA 4F3SA 2XHDA 2X7PA 4LQ5A 3MQ9A 2V25A 3QSLA 4P11A 2ABHA 2Y84A 4XKRA 3O6IA 3CI8A 5FHOA 1JEUA 1N0TA 2REGA 2V3QA 4TLMB 3EN3A 1B52A 3MZ1A 3KN7A 4QHQA 1GVCA 4U2RA 1SW4A 4MH5A 2XX7A 1IQ7A 2IA4A 1LLSA 2QS2A 3VLWA 3UA8A 1XT8A 3FVGA 3H6UA 4ZE8A 1EU8A 2OK2A 4PFTA 1N7WA 3UK4A 3ONMA 1XOCA 2H5YA 4H8IA 1FCKA 1VSOA 2F35A 4OHNA 2AIXA 1AMFA 4JXIA 4HS7A 3KEIA 1Y20A 1B3EA 3FUZA 4FECA 4X1DA 5KCJA 4LZ5A 3FVOA 3QIMA 3HN0A 2IEEA 2G29A 4RK2A 2HAUA 3TODA 4F29A 2QPQA 5DEXB 4YICA 3CFLA 2OCUA 3FJMA 1XC1A 4QFKA 4O3BA 4GRKA 5EYFA 2ONRA 4MF3A 1JNFA 1MM6A 3V89B 2F7AA 2D21A 4DZ1A 1DTGA 2X26A 3UORA 4U4XA 2OLBA 4ISUA 4GQOA 1MY4A 4FAJA 3V8XB 5KCJB 3GBBA 5CMMA 2V84A 1QKAA 1LB8A 4QFNA 3FV2A 3MW0A 4PQJA 4Q5TA 2RC9A 3RQTA 1MY1A 2XXTA 4LZ7A 5AA4A 1D3KA 3T96B 3OO8A 1JVXA 1B1HA 1AH5A 5I59A 1IITA 3RPWA 4NF5A 2P0SA 2RC7A 1N84A 1B6HA 1WODA 2PBWA 3PMWA 4HCWA 2F7BA 4UACA 4GLIA 4OVJA 1QULA 3V5AA 3VVDA 3U92A 1LSTA 3KOTA 3PMXA 2H25A 1IIWA 2OWSA 2HZKA 3EHSA 2W7YA 1LFHA 5I59B 4NF5B 1NNTA 1MQDA 3U93A 4I1DA 2HQ0A 3D4CA 3EHUA 1LAFE 2GH9A 3EF7A 2PT2A 5FTIA 5I2KA 2FYIA 1SYHA 2DVZA 3G3GA 4M4GA 4IGRA 1BKAA 1MXWA 4IY5A 3KGCA 3I5OA 1GGGA 4MFIA 4ESWA 2F5XA 3O2AA 2FNCA 4RA1A 4XKQA 4G8HA 1PBQA 2VHAA 3M8UA 2ZYMA 5FHMA 3GLBA 3E3KA 3QAXA 1PC3A 3FIRA 4U22A 4ZEDA 3FD3A 3TTKA 4JWYA 2ALUA 4ESXA 2P1SA 2Z22A 4YZZA 4F1UA 3D4GA 4AB6A 2Q8JA 5I2KB 3KSXA 3FATA 1R1NA 1LCFA 3VLVA 3IO4A 1WVJA 5L8DA 1A54A 2HEUA 1A99A 1F9BA 4EF1A 3M3FA 2QS4A 3IOTA 4IO3A 2UVHA 1N3XA 2D3IA 1A8EA 4RY1A 2R71A 3FXRA 3MC2A 3O6HA 2O68A 1I6QA 5I2NA 2HAVA 2I48A 1MDP1 2NXOA 1H3DA 3TTRA 4YAHX 1EZOA 4PP0A 1M5BA 1LBCA 3N5LA 4F3GA 2B3BA 2DXYA 2A5SA 4ELPA 4Q8RA 5B7DA 1R9QA 1SYIA 4YKKA 4LVQA 1SI0A 4O3AA 3H6TA 1B0LA 4K3FA 1A40A 5ISUA 3LBSA 3CG1A 4H67A 4KYDA 5CMCA 3ILUB 5FHNA 3H4ZA 1OVTA 1S50A 1LB9A 3MVZA 3VDFA 1UTHA 2OBGA 4QF9A 2RKMA 1US5A 1Y1ZA 5A5XA 1ZTYA 3QYTA 2DSFA 2UVGA 4GIZA 5L9OA 2HFBA 3K6VA 2I58A 3Q28A 2F7CA 2V3TA 2Q2AA 5I58B 1FQBA 2DWIA 1MPCA 4RJZA 1MH3A 3W15C 3C31A 4TOZA 3RN8A 1O7TA 4R2BA 4JDFA 1B58A 3OO9A 3JZJA 1MPDA 1H45A 4GL0A 2R6GE 2I0CA 1J1NA 3UP9A 5A5XB 1YPNA 1FQCA 2DVCA 3TYHA 3HSTA 2P2AA 3M3LA 1Q1KA 4OEVA 4KYEA 3T9HB 4ND9A 1ANFA 3PPRA 2VD2A 3HHGA 5L9SA 1Y9UA 1NL5A 1IXGA 2XXQA 1B2HA 4BDMA 4YB6A 2Q9TA 3L6GA 3OOAA 1IXIA 4Z7EA 3HV1A 3RNNA 4EQ9A 4OFOA 4F2OA 2ONSA 5CBRA 3C36A 3TMGA 4H6DA 1N04A 1B32A 2Q2CA 1PEBA 3K02A 4YKIA 4M1VA 3VLUA 3H7MA 4LQ2A 2ZYNA 3DLNA 2Z8FA 1RYOA 1HSLA 2E0SA 1MY3A 1SVXB 4R72A 4WXJA 3OELA 1FQFA 2I4CA 4ZS9A 2GRVA 5B70A 4RPOA 4JSDA 3L6HA 4QFOA 4FEBA 1MQJA 4C1UA 4NF4B 1OVBA 4GD5A 5AE4A 3DM0A 1Y4CA 1JEVA 3LR1A 3A3CA 1S9TA 4AQ4A 1YAEA 4R9FA 5DTBA 3FJGA 1O63A 5EHSA 3K0VA 2I3VA 3IL1B 1NMUA 1M5FA 4G2ZA 2ANJA 1XVXA 2H4IA 3K1NA 2Q88A 3T9XB 1LFIA 1MXUA 4KPTA 1TFDA 2B3FA 3PUYE 4F1VA 2GHAA 3IOWA 4H5FA 4MBPA 4PFWA 2UYFA 3DP6A 3S2VA 1JVYA 4O3CA 2RCAA 2QMXA 2G93A 1XS5A 2D5WA 1QVSA 4DDDA 4ZEIA 1POY1 4F18A 2NOOA 5H8SA 2UVJA 4H65A 3DP8A 4QFPA 4KD5A 4KFQA 4XXUA 3K1MA 2H98A 1MDQA 4MLQA 2B65A 1POTA 2QRYA 5DEXA 1B3GA 5CRYA 2PVUA 3TKDA 1Y3QA 3A3UA 4BDQA 4NTLA 5F7VA 1PDAA 1VE4A 4OEUA 3VV5A 1JW5A 3K00A 3Q27A 4FORA 3RTWB 3TTMA 5ITPA 1MQGA 2RINA 4H0WA 3MP6A 4Q0CA 2VP1A 2Y7WA 4QSDA 2OWTA 5K2YA 1OIBA 3SEUA 2XX9A 1B7HA 5DYHA 1GTKA 1UQWA 1LGBC 3OSQA 2DE2A 4PFUA 3M3KA 3O29A 1EZPA 4R6KA 3TTNA 1D9VA 4POWA 5I57A 1CE2A 4N07A 5H8QA 3PPPA 3U94A 3O66A 2GFEA 3WAFA 3G7WA 3EQ1A 4R9GA 3TTLA 1IXCA 3MPKA 1DTZA 1AL3A 2RF1A 3IOUA 3TAJA 3T22A 1KWHA 3JV9A 2UVIA 3FJ7A 3VVEA 2VD3A 4OETA 4F39A 5IKBA 1PBPA 5I57B 4YKJA 3TELA 5H8QB 3CFZA 4F3PA 1MY2A 4P0GA 3G3FA 3ZKLA 4XKNA 5JTYA 3KFMA 4RXLA 2A5TA 3OD7A 5H8HA 2DS9A 4JSOA 2O84X 3PUWE 2O6AA 4HTGA 5H8FA 2NVUB 1MQHA 2XXUA 2O1LA 2I0BA 1HSJA 1BIYA 2XX8A 1LFGA 3H06B 1MM7A 4R2FA 4KCDA 4KHZE 3B6TA 4NMYA 5JTYB 4NWCA 3W9VA 2A5TB 1EH3A 5H8HB 4JBZA 4Q30B 1FTOA 5CI5A 5H8FB 2REJA 1H43A 3ODBA 3CFXA 3FASA 4PETA 1ZMGA 3PD8A 4YMBA 2O1MA 3C32A 2I6EA 4JWXA 1P1NA 4DCYA 4YMAA 4E0WA 2E1SA 1JQFA 1TFAA 4N13A 4F19A 1L5TA 4YKPA 4DE8A 1D9YA 1MXXA 1SW1A 4WEPA 4OWDA 1URDA 2CMOA 3TCHA 4EUOA 3PD9A 4OENA 4XIGQ 3RGYA 5TPAA 3K6XA 3Q29A 3TUSA 4POXA 1VFDA 2FA7A 4R6HA 2Y7IA 4BLAA 3WAEA 3K6WA 1TWYA 1WDNA 2QJEA 4BDNA 4OFJA 3IORA 3S9NC 4GWOA 3S9EA 3B6WA 5L9MA 2AL5A 3VXCA 5I58A 2HXWA 2QL3A 1QW0A 2ONKE 3SEWA 5TPAB 4OXVA 5I56B 1MG1A 1XVYA 1RYXA 1P99A 1B9JA 4KQPA 5CC2A 1IZ1A 1URSA 2GHBA 4F22A 2Z23A 2QSXA 3K01A 3TPAA 5K2XA 3VVFA 1IUDA 2BJJX 3G3JA 1B40A 2DQVA 3E13X 4KCCA 5ELVA 1SW2A 1NH7A 4YU0A 3SETA 4XTCQ 4BDOA 1D4NA 3C4MA 1JW1A 4ONYA 1Z7NE 5EHMA 1MXYA 3E9XA 3KJ7A 5CMBA 3GBAA 3GZGA 3THIA 1USYE 5M2VA 1IEJA 5JK4A 3SEXA 1IXHA 4IGTA 5CM6A 1DMBA 1BP5A 4ZEKA 3Q25A 3H6VA 2O7IA 1OQHA 4PE5B 3TZAA 1QUJA 4NF8B 3O28A 1B5HA 5KZTA 3BFTA 1JETA 2XXRA 1LAHE 3OMBA 3PU5A 5LOMA 2DE4A 4NF4A 4ZEBA 1FW0A 3ECRA 1AOVA 1UTBA 4JWOA 5TP9A 1B5IA 4OMBA 3G3IA 1B7UA 3GXAA 4HW8A 4ZECA 3EHTA 4NWDA 4G68C 2F34A 3QUFA 3H3GA 3O6GA 3PGFA 5HBCA 1I6BA 1URGA 5H8NA 4ELRA 1DOTA 1GR2A 3VE1B 3R7XA 4L17A 4U1ZA 2YLNA 5IAIA 1UTBB 1SD3A 3C33A 3LUYA 5AA1A 1T0KA 5TP9B 1LBBA 4WEDA 3PPNA 4GXAA 3QUJA 1B4ZA 1QUKA 1EZ9A 4TQUQ 3OO7A 1ZBMA 2ZYOA 4I8CA 3MVXA 4G8MA 1Y1MA 1FTMA 2XXPA 2Y7KA 4JB7A 3SKPA 5H8NB 3FGSA 3U8QA 1MH4A 1II5A 2CZLA 4OESA 1SQYA 3VFJA 3G3HA 4FE8A 3P7IA 3O9PA 1MRPA 4U4SA 5AA2D 4FIMA 2HZLA 1BTJA 1MPBA 3B6QA 4BDLA 3PPOA 3FVNA 1A55A 2F97A 3MZBA 4I9DA 1TT1A 5CBSA 3G3KA 4EQBA 3TCGA 3RT8A 2ZYKA 4IB2A 2OZZA 4U1OA 3K2DA 1US4A 4BDRA 4FJPA 2F8DA 3TQWA 1NNKA 1UIUA 3KG2A 1TXFA 4LA9A 5AA3A 3C9HA 5ICQA 2DXRA 1ZIUA 3KBRA 2DWJA 1LCTA 3OEKA 2F6PA 1Z7ME 3C35A 3F11A 3IR1A 4DXUA 1B3LA 1ZLQA 3UGWA 3R6UA 2R9JA 4EXKA 3RLFE 1I69A 4QFLA 4MLVA 1SDXA 2KLFA 4F3BA 5DVIA 2X7QA 1PB9A 4ZE9A 3N6TA 1FQEA 5ITOA 5KDTA 3OO6A 3MP8A 3ZKKA 3W9WA 4R74A 3SDFA 2ESNA 4G68A 4X9TA 3B7DA 3FXUA 3HO7A 1H44A 1NNPA 2ZNTA 3PUVE 2Z8DA 5DT6A 1P1UA 2NWJA 2UXAA 3LSWA 3MWBA 1UIVA 1M5DA 4KR5A 2QMWA 3KZGA 3MJNA 1MXZA 1ZJLA 1O64A 4EF2A 2WKYA 3QXMA 4OQOA 2XXWA 1I6AA 4ELOA 2XXVA 5KDTB 4FATA 3I3VA 1P1WA 1DSNA 5FTHA 4GVOA 4G68B 2V3UA 3UIFA 3K6UA 2XXIA 1SI1A 3LC8A 1B0HA 3PMVA 4DXBA 4AB5A 2I49A 3CIJA 4WKMA 3TEPA 1M5CA 1A7LA 3LSXA 5HPQA 3OENA 1XHYA 1R6ZA 3CG3A 4GOTA 4GF8A 2XXXA 3MPLA 1PB7A 4G4PA 5ICTA 1OLCA 1NKXA 4GFRA 3N6UA 2DWAA 1N7XA 3O97A 4DIGA 1R9LA 5AA4B 3RY3A 4Z0IA 4QRZA 5JEIA 3N94A 4ZEFA 2UYEA 4HCYA 4IO2A 1HSEA 1JW4A 2DP8A 3SEYA 2RCBA 2YPNA 2THIA 4DLDA 4H8JA 3KJTA 3T66A 4F1YA 2VGQA 2PMSA 2XXYA 5AA2A 1YCJA 3MBPA 1Q35A 4ZZAA 1FQAA 3KOSA 4LZ8A 2DWHA 3PUZE 3IJXB 1FQDA 2DYXA 5BWJA 1QUIA 2XD3A 3MAMA 4RPNA 1ZU0A 1BLFA 1QJMA 2PT1A 3TDJA 4NF6A 1FTJA 3HCQA 1S7YA 2VOZA 4H5GA 2AL4A 1A8FA 5AA2B 3K1PA 4DXCA 4R75A 1SW5A 2YJPA 1NNFA 4EXLA 1VR5A 2DE3A 3S9MC 3N26A 5I56A 4X1BA 3U1OA 1DPEA 4PFYA 2LAOA 3LSFB 1ELJA 4YB5A 4OYVA 1P1QA 3TCFA 4NF6B 2F6GA 3IJOB 3A09A 3PUXE 3IB1A 5I84A 4R6YA 3MP1A 3HHFA 3ILTB 1N3WA 1OQGA 2O69A 4OZ9A 4IY6A 1MXVA 3LSLA 4N6PA 4R73A 3ZSFA 3OEMA 4DCXA 1B5JA 3RUMA 2DOJA 1P1OA 3IX1A 1ATGA 1MQIA 5I2NB 3BKIB 3IB2A 3IOVA 2ZMBA 3KSJA 4FEDA 4IO7A 1SBPA 4RK9A 3CR9A 4F2QA 1AIVA 4ECFA 3IK6B 4U21A 2OJTA 5J1DA 5DVFA 2QS3A 4LUBA 1CB6A 2I3WA 1MS7A 4E0XA 3MUQA 4LATA 2XXHA 4G8NA 3FVKA 1YTVA 1MY0A 1GV8A 4OFLA 3H03A 3FXQA 4IO5A 4C1TA 2PX1A 1B51A 1FTKA 1B3FA 2V93A 4NF8A 3CSGA 3CSBA 3HPIA 4EDPA 1PB8A 3IB0A 4NEDA 1VFEA 4GXSB 2O51A 3UN6A 4EQ7A 4H1XA 4UA8A 1UTHB 5TU0A 1ZKBA 2XD2A 3T9UA 1M5EA 4KYSA 1B05A 3IO6A 5BUUA 3SERA 3BFUA 4ELQA 4F31B 5DVJA 1Y3PA 4OERA 4LONB 4LP2B 3TQLA 3VXBA 4IO4A 3FV1A 1Y3NA 1RKMA 3QK6A 3SESA 4RYAA 3C34A 2HCAA 3I6VA 1B46A 1USYH 2O7UA 1B3HA 3AXFA 3U72A 2ZXTA 3S4UA 1NH8A 1Y4TA 3Q26A 3V83A 3MVYA 1OLAA 3DELB 4YB7A 4XKPA 2H9BA 2AYSA 5CMKA 4C0RA 1B4HA 4U23A 1H76A 3ZS6A 1QKBA 4RNSA 4GL8A 5F1QA 3CRBA 3BBRA 3IAZA 2QS1A 3RT6B 3H6WA 2Y7PA 3T93B 4X48A 4IO6A 4NE4A 1NFTA 2Z8EA 1LAXA 4P0IA 1N76A 2I4BA 4QSEA 3OXNA 2NUVA 3RTFB 1LAGE 3KN8A 1FTLA 3MZ9A 1DPPA 2M8CA 1B1XA 4ZZEA 4KI0E 3KN3A 3JYRA 3TFLA 5HM4B 3K4UA 3OSRA 2ZNSA 3SEVA 2H99A 3CVGA 3PPQA 4THIA 3FZVA 2F78A 3USDA 3PV0E 4I62A 3DP4A 1B7ZA 4QSCA 3T9VA 3R26A 2RC8A 2PYYA 3S9LC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TLLB 2F36A 2ZNUA 3EPEA 3E4RA 2Q89A 4OTEA 1IMDA 4G77A 3MVWA 1OMPA 4NG7A 4ZDMA 2Y7RA 4F3SA 1XI6A 3BIGA 2XHDA 2X7PA 4LQ5A 3MQ9A 2V25A 3QSLA 4P11A 2ABHA 4N91A 2Y84A 4XKRA 3O6IA 3CI8A 5ET7A 1JP4A 5FHOA 1JEUA 1N0TA 5EYHA 2REGA 2V3QA 2WEFA 4TLMB 1FPFA 3LUZA 3EN3A 5IZ3A 1B52A 4PTKA 3MZ1A 3KN7A 4QHQA 4JVDA 1GVCA 4U2RA 1SW4A 4MH5A 2XX7A 1G0HA 1IQ7A 2IA4A 1LLSA 2QS2A 3VLWA 3UA8A 1XT8A 3FVGA 3H6UA 4ZE8A 1EU8A 2OK2A 4PFTA 1N7WA 3UK4A 3ONMA 1XOCA 2H5YA 4H8IA 1FCKA 1VSOA 2F35A 4OHNA 2AIXA 1AMFA 3IFCA 4JXIA 4HS7A 3KEIA 1Y20A 1B3EA 3FUZA 4NF0A 4GWZA 4FECA 4X1DA 5KCJA 4LZ5A 3FVOA 1IMAA 5IZ3B 3QIMA 3HN0A 2IEEA 2G29A 4RK2A 2HAUA 3TODA 4F29A 1AWBA 2QPQA 5DEXB 4YICA 3CFLA 2OCUA 3FJMA 1XC1A 4QFKA 4O3BA 4GRKA 2Y5KA 5EYFA 4MIJA 2ONRA 4O7MA 4MF3A 1FBEA 1JNFA 1MM6A 3V89B 2F7AA 2D21A 2XWIA 4DZ1A 1DTGA 2X26A 1NV3A 3UORA 1EYIA 4U4XA 2OLBA 4ISUA 4GQOA 1MY4A 4FAJA 3V8XB 5KCJB 3GBBA 5CMMA 2V84A 1QKAA 4P47A 1LB8A 4QFNA 3FV2A 3MW0A 4PQJA 4Q5TA 2RC9A 3RQTA 1MY1A 4PCDA 2XXTA 4LZ7A 5AA4A 1D3KA 3T96B 3OO8A 2KR0A 1JVXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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