The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
KKSRLWVDRSGTFKVDAEFIGCAKGKIHLHKANGVKIAVAADKLSNEDLAYVEKITGFSLEKFKAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of Sla1p homology domain 1 and interaction with the NPFxD endocytic internalization motif.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Cytoskeleton assembly control protein SLA1
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| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| molecule tags |
Endocytosis, protein binding
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| total genus |
15
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-06-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HBP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HEQ A; 3NMZ C; 1YHQ A; 3MP8 A; 2L2P A; 2XDP A; 5IHI A; 3RMS A; 3CCS Q; 4JJB A; 1JO8 A; 2IIM A; 3QSU A; 1OZ3 A; 1ARK A; 2ATC B; 1QVG S; 1VQK Q; 4M78 F; 4KUD K; 3L2V A; 5LJ5 h; 4MML A; 3FDR A; 1UE9 A; 3I55 T; 4M7D D; 3ME9 A; 5LJ3 h; 1OPK A; 2JW4 A; 4JS4 A; 5A0G A; 2KXD A; 4M78 E; 1Z9Q A; 2OTL A; 3L2W A; 1WLP B; 4R0K A; 1JRI A; 4A4F A; 3EGU A; 3VU3 C; 3CC7 Q; 4CC7 A; 2O4X A; 1WA7 A; 3M57 A; 4N0A C; 1X27 A; 3A8M B; 1N9R A; 3TSW A; 5LJ5 f; 1NBE B; 3OYY A; 3FJ5 A; 3EG3 A; 1RI0 A; 1Q95 G; 1QVP A; 1ZSG A; 1TS9 A; 5C6S A; 1K0X A; 2JS2 A; 4J9G A; 2CSI A; 5LJ3 f; 1U3O A; 3TEE A; 1WNL A; 3HHT B; 3RKY A; 1VQO Q; 3CD6 T; 1I81 A; 1OUL A; 4CI0 C; 1QVG P; 5M9O A; 1JB0 E; 2H3E B; 1VQ4 A; 1VQN A; 2X51 A; 5EG2 A; 5GAN 3; 4RTY A; 2RM4 A; 3SWN A; 5KYX B; 1YIT Q; 2CRE A; 2RHU A; 2E3H A; 2GFU A; 1AWX A; 1NJI C; 2K5L A; 2K5I A; 1VIE A; 5D6X A; 1QKW A; 2CS7 A; 1KIK A; 2DMO A; 2BIV A; 1AVZ C; 4M77 C; 1ZSZ B; 4PLI A; 2L3P A; 3CCE T; 3A8O B; 3EFO B; 4F16 A; 3G6E Q; 1SRM A; 4HKE A; 5I11 A; 4XAX B; 4CC3 A; 2KQW A; 2L5Q A; 4M75 G; 1MMN A; 2GQI A; 3TRE A; 1R8O B; 4EPC A; 1QCN A; 4CRI A; 2YWW A; 1X69 A; 2EPD A; 1YN8 A; 1V76 A; 3BFM A; 4DBH A; 1S72 T; 2CGH A; 3EFS A; 4O6J A; 1Y96 A; 5KYU B; 2AZS A; 4OB1 B; 1PWT A; 4M78 A; 4FL6 A; 4DBQ A; 1OQK A; 4ESR A; 3EGD A; 1M1F A; 2NLU A; 2QEX Q; 5GJV B; 5C0M A; 1LOJ A; 3VYG A; 4C5G A; 4MMK A; 1V29 B; 4ELZ C; 3UT1 A; 1VQ8 Q; 2ZPI B; 2F2V A; 1T0H A; 2W10 A; 2FHD A; 2KK4 A; 1YJ9 A; 2EJG A; 4B6M A; 1AWJ A; 2HBP A; 4HT9 A; 3WXM B; 3CMA T; 3OYG A; 3EG9 B; 1D3B A; 4OB3 B; 5GAN j; 4E7K A; 2V8J A; 3OYH A; 2MF2 A; 3X26 B; 3CCE A; 4D8K A; 1WGS A; 2EYZ A; 3A8H B; 5DLQ E; 1NE8 A; 1VQ7 T; 2E4H A; 2EQJ A; 2RK2 A; 3FB9 A; 3MEV A; 2EQI A; 2YLC A; 1X01 A; 4EMK B; 2X35 A; 4M77 D; 3HFO A; 1QWF A; 1WXT A; 2HSP A; 3H0F A; 3OMC A; 1NJI R; 3JCM g; 4N4H A; 3E9F A; 1UEB A; 4LXC A; 3X28 B; 1RAF B; 3EFR A; 2CUD A; 3RBB B; 1I5L A; 3D7S B; 4BE0 A; 3ZEH A; 3BDU A; 4C8Q B; 3OS0 A; 1TOV A; 4ELY C; 2RMO A; 4QQD A; 4A4K A; 4B9X A; 2O9V A; 1C0M A; 5CIU A; 1BCO A; 4AFS C; 3O8V A; 2D0N A; 4ZGJ B; 2RI3 A; 1NJI U; 3EG0 A; 2VAS A; 3CMA A; 1RAI B; 4OMQ A; 2MMP A; 2K7A A; 1KQ2 A; 1YWP A; 2DNU A; 3I56 Q; 3P8B B; 2ED0 A; 4FSX A; 4FYX B; 3CCU Q; 1D1A A; 2KRN A; 3JCM d; 1I1J A; 2O88 A; 2DIQ A; 2FRW A; 3VV0 A; 2JXB A; 1H8K A; 3CCL T; 3GP8 A; 3HRS A; 4JRK A; 2RN8 A; 3CBP A; 3EGX A; 5HK0 A; 4J9D A; 4LDW A; 5LJ5 j; 4QW2 A; 3VUB A; 1XJW B; 1GCQ A; 1PRL C; 1IO6 A; 1PRM C; 4D8D A; 1YI2 A; 5LJ3 j; 1SHG A; 1IHV A; 1I0C A; 2QA4 Q; 5KYY B; 4KRT A; 3FLG A; 3OSV A; 3H0I A; 3RIR A; 2XDB A; 5KE2 A; 3CCS T; 1MMD A; 4JRP A; 4X1V A; 2M0O A; 2Y4Y A; 3SHW A; 1A0N B; 2QK0 A; 4RTW A; 3VS7 A; 4CC4 B; 1HD3 A; 1E6H A; 3TSZ A; 2M51 A; 1TTH B; 1QCO A; 3JCM W; 3OS5 A; 1UHF A; 2ED1 A; 2CZ6 B; 2Y90 A; 3A8L B; 5GMK l; 3C95 A; 2IVW A; 3TQ7 P; 1CKB A; 3GNG A; 4PJJ A; 4DBR A; 5D6W A; 2MOX A; 4OMN A; 2CYZ B; 3MPU B; 3CC7 T; 2DZ9 A; 5GAO q; 2LMJ A; 4J9F A; 2DIG A; 1VYV A; 4JJC A; 3AHU A; 2X3X D; 4M78 D; 4M7D F; 4PFO A; 4RUG A; 4M7A C; 1ZA2 B; 1G3S A; 2PU9 B; 3QZ9 B; 3HFN A; 3OBY A; 3OYE A; 2KBT A; 2RJE A; 1VQO T; 2J05 A; 3Q1J A; 4GLK A; 3LWI A; 1H3Z A; 4M7D E; 2HBW A; 3C0C A; 2HQE A; 5FRO A; 1D0Y A; 4C92 F; 3VRZ A; 2G6F X; 2HQX A; 4PJO C; 1VQ5 A; 2JUF A; 3G71 Q; 1YIT T; 3JCM J; 2K4Y A; 3OW2 A; 4F04 B; 1UGS B; 5CAI A; 3G4S Q; 2KRS A; 2OI3 A; 2FEI A; 1BIA A; 2DJZ A; 1JJ2 P; 1K73 C; 1W2B S; 1YP5 A; 1H64 1; 3JCM h; 3G6E T; 1WJQ A; 5DLO A; 1OEB A; 2NYS A; 1YIJ A; 1RI9 A; 2EGE A; 1D0Z A; 1BI1 A; 4J9C A; 2MK5 A; 4J6Y A; 2DEU A; 4FSS A; 4NS5 A; 1YJN Q; 2CDT A; 2A37 A; 2RQU A; 4KUI A; 3JCM f; 2DA9 A; 4A4H A; 2E12 A; 2RO0 A; 3RES A; 4L59 A; 4DEY A; 1PSE A; 5IAY A; 4RCB A; 4JS5 A; 3JB9 F; 1G5V A; 1Y0M A; 2K2M A; 4HCZ A; 1VQO A; 2K3B A; 2QEX T; 3GIB A; 2F2X A; 1BIB A; 3CPW P; 1GCP A; 2OAU A; 5L23 A; 3HP9 A; 4M75 B; 1VQ8 T; 2K57 A; 4JDS A; 5I21 A; 2EW3 A; 2DL3 A; 3M0T A; 3SEM A; 2DXT A; 4AG2 C; 2DTH A; 2FB7 A; 4M7D A; 2EGC A; 1HSQ A; 2CZ7 B; 3DLM A; 2A3L A; 4LD9 K; 1U1S A; 5D6Y A; 1GBR A; 4HT8 A; 4BAC A; 1Q82 R; 3GBQ A; 1TXQ A; 2LNV A; 1M9S A; 2RHI A; 3P8H A; 1W70 A; 2CP2 A; 5CQX A; 1VQP Q; 4XQ3 A; 3V8J A; 4FYY B; 4L6V 5; 1IB8 A; 5I22 A; 1KG1 A; 1VQ9 T; 3H41 A; 3NTK A; 3X20 B; 2J06 A; 4XTZ A; 2GTO A; 3M0R A; 5IH2 A; 1PC0 A; 4MZT A; 2W0Z A; 1K73 R; 3DLL A; 4BE1 A; 1VQL A; 4OF1 A; 3E1S A; 1Q82 U; 4M78 G; 2MAM A; 1LNX A; 4IUR A; 4F7U E; 4Z89 A; 2QEX A; 1SPK A; 2JN0 A; 4M77 E; 1ZUK A; 2RK1 A; 2M1H A; 5LL6 S; 1I4K 1; 2YSQ A; 3CPF A; 2G3R A; 1VQ8 A; 3ZBD A; 1LPL A; 1SKU B; 3GOX A; 3CCR Q; 1VQ6 Q; 1K73 U; 4PFP A; 1ZUY A; 3OYJ A; 3QZ5 B; 3CCJ Q; 5CKB A; 2VGM A; 4RTZ A; 2E64 A; 1M4Z A; 2E6Z A; 3I5S A; 2E41 A; 4RTT A; 3I56 T; 2EWN A; 1I07 A; 1OI1 A; 1LVK A; 2DL7 A; 2ABL A; 3CCU T; 4IKF A; 2RJC A; 2DE0 X; 2CP3 A; 2C0I A; 1RAE B; 2EAY A; 2LQN A; 1ABO A; 2HNI A; 2EBP A; 2BE7 D; 1VQ9 A; 1PD1 A; 1AEY A; 4FU6 A; 2K9G A; 2VXE A; 3MCA B; 3JV3 A; 4N0A A; 2JMA A; 2RD1 A; 5GAM h; 4JJD A; 3C12 A; 1VQM Q; 2X4X A; 1JXO A; 2DK3 A; 1UHC A; 2E1H A; 2DYB A; 3S3M A; 1UJY A; 1GFD A; 1YJW Q; 1WHJ A; 5FU7 B; 3BW1 A; 3OYI A; 2QA4 T; 1U1T A; 2QXF A; 3M55 A; 1AZG B; 5FLX E; 4C92 C; 4XTY A; 4FT4 A; 4QVC A; 5KCO A; 4N4G A; 3CC2 A; 1LJO A; 4OB0 B; 2KAF A; 1X43 A; 2HKN A; 2QQA A; 5KCH A; 4QQG A; 4M77 A; 1U8R A; 4EIK A; 3QJY A; 2KVQ G; 1JQQ A; 1PG5 B; 3CXC A; 5GAN 5; 4LE9 A; 5EC7 A; 2KT8 A; 1N5Z A; 4OP0 A; 1M2V B; 2C0T A; 1NYF A; 2VYT A; 2E5Q A; 1NLO C; 1YBY A; 4XU1 A; 3IQL A; 5CKH A; 1WHK A; 1B34 B; 2IPO B; 3A8G B; 4BY6 C; 4YTL A; 2HMA A; 4PNO A; 1O75 A; 3WVD B; 2LCL A; 1R0C B; 3EG2 A; 2FZK B; 4KH1 B; 3CC4 A; 3ZFJ A; 3PTA A; 4IUP A; 5GJW B; 1EZZ B; 4A4G A; 1X6G A; 2MWO A; 3E9G A; 3QHS A; 1M8V A; 2K5F A; 2COW A; 1M3B A; 2NUP A; 2XKO C; 1RLP C; 1HYO A; 5FW9 A; 4KGX B; 1T3L A; 1IXD A; 2RJF A; 3SDZ A; 2DL5 A; 2ROL A; 8ATC B; 4AMC A; 2KRO A; 3G4S T; 1MNE A; 3GLX A; 3J7A F; 2EGA A; 4C92 D; 2QYZ A; 2M16 A; 3CCV A; 1ZX6 A; 4OGE A; 2CZ1 B; 1U06 A; 2ENM A; 1HJD A; 3F70 A; 1AOJ A; 2J6O A; 5IXF A; 1YJN T; 2F5T X; 4N4I A; 3OY9 A; 2ZPH B; 5GMK e; 3MP1 A; 2CP7 A; 2DVJ A; 1NYG A; 2QGG A; 3VS1 A; 3VYH B; 4KBM B; 2RI5 A; 3NPF A; 3HPW A; 1PCX A; 2FZG B; 2CH4 A; 3NGP A; 2WAC A; 1GBQ A; 1QVG A; 2MI6 A; 2FPE A; 1WHH A; 2VWF A; 3REA B; 2DF6 A; 5AT1 B; 5CK9 A; 4BDY A; 3EG1 A; 4ZTF A; 2K3Y A; 1TUD A; 2VUB A; 2RA2 A; 1BK2 A; 3X25 B; 4B9W A; 2P4T A; 2RQT A; 2DRM A; 1I5O B; 1NPR A; 1MV0 B; 2EQU A; 3V7S A; 3OYF A; 4C0Z A; 4ZGE B; 3I55 A; 4BI4 A; 4XTW A; 2VVK A; 2EYY A; 5L8R E; 3JB9 D; 3I35 A; 1WDX A; 2O4X B; 4M7A F; 2F2W A; 1WI7 A; 2GTJ A; 3PMI A; 3INZ A; 3M4Y A; 3L42 A; 2EJ9 A; 3CME Q; 2LP5 A; 4LNP A; 4C5H A; 2V1Q A; 2P84 A; 1YCS B; 1VQP T; 4M7A E; 1QP3 A; 2QTX A; 5GAO m; 3VS2 A; 4J6X A; 3CD6 A; 2O2O A; 4PJO F; 9ATC B; 1MMA A; 3U23 A; 3TU4 K; 3SWN B; 4R55 A; 2XU8 A; 5FU6 B; 1SHF A; 4PJO E; 1UFF A; 1RAG B; 4Y91 A; 3MET A; 3CBM A; 1YNZ A; 1ZSZ C; 3PE0 A; 1OV3 A; 5FWB A; 2D1X A; 1BB9 A; 2YUO A; 3FC3 A; 3OYL A; 1OZ2 A; 2LCS A; 3QJ6 A; 3OB9 A; 3I5R A; 2KMT A; 3EHR A; 2KRM A; 3OA6 A; 2HAX A; 2A08 A; 1UB4 A; 1M90 C; 3RUX A; 3CCR T; 1UGP B; 3CQT A; 1VQ6 T; 4AFU C; 4M7D G; 5GAM j; 2RI2 A; 3TCJ A; 2AIR B; 1Y96 B; 1S72 A; 2DEQ A; 2BZ8 A; 1M8M A; 2EQM A; 3QXE B; 1IGU A; 2P0P A; 3PT9 A; 2WSF E; 3L2R A; 4M78 B; 1AWO A; 2KYM A; 2GGR A; 1PNJ A; 3EGD B; 2AK5 A; 3JB9 J; 1QWE A; 2KDS A; 3MEW A; 1TSF A; 5J39 A; 3NHN A; 1RAB B; 3JAM E; 1W4S A; 1K76 A; 2X3W D; 1JBM A; 1G83 A; 1G3Y A; 3ER0 A; 1WQ7 A; 1VQM T; 4M7A A; 3CCQ Q; 2XK0 A; 3DB4 A; 4GLM A; 2DXC A; 1D3B B; 1WX6 A; 3ASK A; 3DB3 A; 1FMW A; 3OYM A; 1KQS A; 2DM1 A; 4EMH A; 2DD4 A; 3SB2 A; 4A4E A; 4ME7 A; 5KYY A; 3QPH A; 5GAN 4; 4PJO A; 3MHX A; 3S3O A; 4EMK C; 4FIB A; 1VQ7 A; 1QKX A; 3CCM Q; 1FMK A; 3JRZ A; 2OTJ Q; 4II1 A; 1BI2 A; 1I8F A; 2PZ1 A; 3JB9 G; 2V26 A; 1Y7X A; 4FT2 A; 5GAN 6; 3QWX X; 1G8X A; 1MUZ A; 1KC8 C; 1YHQ Q; 4C8Q C; 1FXX A; 2LQW A; 1EIF A; 2AKL A; 4PJN A; 1M90 R; 4NL3 A; 1NPP A; 1ZLM A; 5GAN 2; 5HCK A; 4OGC A; 4M4Z A; 1M30 A; 2FPF A; 1HK9 A; 1VQM A; 4IIM A; 2LDM A; 4DEX A; 1VQK T; 2FG0 A; 4K11 A; 1BCM A; 4C0D B; 1NZ9 A; 3M0U A; 1S1N A; 3RNJ A; 2KYB A; 2E3I A; 2ZGW A; 4E7H A; 4J8O A; 1XNI A; 3OQ5 A; 2L0A A; 2JZ2 A; 2OTL Q; 3MEA A; 2JNG A; 2SRC A; 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3RER A; 1YIT A; 2ZPF B; 3JCM b; 2EFI A; 3V8L A; 1RAD B; 2KEA A; 3UPU A; 2VGN A; 2R58 A; 3JSC A; 3CPW A; 4BDZ A; 3LGL A; 3VS4 A; 2PUK B; 3CCE Q; 4PJO D; 1QVF S; 1PD0 A; 2EYW A; 3G6E A; 1Q86 U; 4Y28 E; 1M3A A; 5IHN A; 1QMC A; 3VS0 A; 2V8K A; 3LH5 A; 4C92 A; 2AZV A; 4IUT A; 2E6N A; 2V8I A; 5I2S A; 3LYI A; 3E2U A; 1N8R U; 4LDY A; 2J6F A; 3P8D A; 2YT6 A; 2P4R A; 2XID A; 1UTI A; 1VOM A; 3M56 A; 3LX7 A; 4IUV A; 4XU2 A; 4PJM A; 1WHM A; 5LJ5 g; 2JTF A; 2R5A A; 2CT4 A; 1KFZ A; 5LJ3 g; 4J6W A; 4LD6 A; 5GMK h; 3UAT A; 5FRM A; 2QG9 B; 4MZP A; 2RNA A; 1QVF P; 2K2V A; 1G3W A; 3H8Z A; 3T9N A; 3UWN A; 2DD5 A; 4M75 C; 1WYX A; 2K79 A; 2DAQ A; 2HCK A; 2RQR A; 2F5K A; 2CP6 A; 2LZ6 B; 1WJS A; 4FYW B; 4J9H A; 1K9M R; 4RKU E; 4MDW A; 3CCQ T; 3MKD A; 5D7U A; 1SG5 A; 4OMM A; 2NUT A; 4M7D B; 2PVG B; 3CMA Q; 2BUD A; 2VXF A; 3QYH B; 2NUZ A; 3LLR A; 3MEU A; 2JJ9 A; 1M1K R; 2CP5 A; 3RR6 A; 3PGG A; 1KD1 C; 5AYF A; 5GAO l; 4O5V A; 5KH6 A; 3GNF B; 1GL5 A; 2ZAE A; 1WQW A; 3VS5 A; 2EVR A; 4WCI A; 4PK4 A; 4AFQ C; 3CCM T; 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