2HEBA

Contribution of water molecules in the interior of a protein to the conformational stability
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGASLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Contribution of water molecules in the interior of a protein to the conformational stability.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 49
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2hebA00
1GD6A 2BAAA 2EKSC 4D9ZA 1LZ4A 2DQGY 1G7MC 2BQAA 1TCYA 2HECA 2N5ZA 1CJ6A 1JISA 1LJNA 4IATA 4H91A 5KXKA 5APFA 2EQLA 2BPUA 1GB7A 1NMMA 1QUTA 5APEA 1OUAA 5KKIA 5K7OA 4LT2A 1HSXA 4HP0A 4CFOA 2D6BA 3KAMA 1NQIA 1HEQA 3AJNA 4G9SA 1DPWA 1YKZX 1J1XY 3ULRA 4B49A 4LYTA 1MLCE 1YROA 2MEHA 4TX7A 4ZEEA 5LVJA 4TTDA 2YBLA 3A6CY 3TMUA 5LVIA 1VDQA 4NIJA 1MELL 4OWEA 3WUMA 3VWOA 1IP3A 2H9KA 2A7DA 2YDGA 1YKYX 1LHIA 4R0FA 1HSWA 1GB9A 3EMSA 5AMYA 1IR7A 1YL1X 1IP5A 1LOZA 2BQKA 1XGTC 1J1PY 3A92A 3T6UA 4ET9A 1LMCA 3N9EA 1D0LA 1V7TA 1QQYA 4CGEA 1B7SA 3LN2A 3LZ2A 1REYA 5IHGA 3WUAA 1LHKA 3AYQA 1LSEA 3TXBA 2PC2A 5LVHA 1WQMA 1GAZA 1GBSA 1WVUA 2CDSA 2CJLA 2IFFY 1INUA 1XEKA 4ETDA 1GB5A 4TSCA 5FSTA 2MEGA 5KXXA 1CKFA 2BQDA 2G4QA 1DI4A 2W1XA 1JWRA 1XSFA 4U3XB 3A34A 3A91A 1YIKA 4YEOA 208LA 2MEFA 3T36A 3A3QA 4MSTA 4A7DA 1B5WA 1WQOA 1JHLA 5B06A 2MEAA 1I20A 2HTXA 1B5UA 2DQFC 1LJGA 1HMLA 5L9JA 4LYOA 1C10A 1B7LA 1WQNA 1GF0A 1IOTA 1C45A 133LA 1BHZA 1IP2A 4YM8A 1GEVA 1IEEA 3WU8A 4LGKA 1F6SA 1GF5A 4HJYA 1G7JC 4KT3A 1GFGA 2Z19A 5C6JA 1IP1A 1XGQC 1IX0A 2H5ZA 2HEAA 1NBYC 2YBJA 1BWHA 3WW6A 2W1MA 3E3DA 4PGJB 4XJGA 3EO5A 1WQPA 5FHWA 2LHMA 3F6ZA 1YAPA 4WM4A 6LYZA 1AZFA 4WLYA 1HERA 1YQVY 1XFPL 1GBXA 2HUBA 5IDDA 3WXUA 1C46A 4N5RA 1OQMA 1ZMYL 5FDJA 2CGIA 2ZWBA 5J7CA 1BVXA 4NEBA 3AW7A 4NSHA 2DQAA 1G7IC 5KXYA 1HHLA 1NWGA 4P2EA 3WVXA 4DD3A 2NWDX 1GFEA 1IC7Y 1BWIA 1DXJA 3A67Y 4HV1A 5F9XA 2GV0A 1RFPA 1IC4Y 7LYZA 4LT3A 3TXKA 2D4JA 3LYOA 4HPIA 4XJFA 4HTNA 1LSZA 4NG1A 1LMNA 3P4ZA 5KXTA 4Z3MA 3CT1A 1JKAA 1HENA 3EXDA 1PS5A 4DYGA 1BGIA 4LZTA 2MEEA 3WU9A 2BQJA 5LYTA 1GF3A 1LYSA 1QSWA 4L41A 4ZIXA 4NHQA 5LA5A 1NBZC 1HNLA 1VFBC 2BQIA 3FI7A 1IR9A 1IWUA 4AXTA 1JKDA 4H9FA 1OUJA 2FBDA 4LYZA 4PPOA 4H8ZA 4HJVA 4WOAA 3AGHA 5KXZA 1IVMA 3WMKA 1HEWA 2MEDA 4J7VA 4B4EA 1RCMA 1B9OA 3QY4A 4ETBA 5LXWA 1J1OY 1HEOA 4OOTA 1G7HC 1HFXA 3LZTA 1HEPA 4C5FA 1B2KA 4WG7A 4MCKA 2CWIA 2Z37A 3AZ6A 3N9AA 3W6EA 1LPIA 4NGWA 4GN3A 5LYMA 1HC0A 2Z2FA 5DN4A 2BQFA 1ALCA 1HF4A 2LYOA 4XYYA 3RNXA 4C3WA 1B0DA 4NGYA 1QUSA 1WVVA 1D0MA 4J0LA 4CFPA 4DD2A 1OUGA 4NGLA 5E9RA 4OWAA 1IWZA 5KJ9A 4OWHA 5D5CA 5B07A 5B1FA 1WTMA 1B5XA 3AZ4A 1FN5A 4ANRA 5C6LA 4GLAA 1UIDA 1GXV2 1NDGC 3TXJA 2BQMA 1GF8A 3LYMA 1GB0A 1DKKA 1IR8A 1GBZA 1JUGA 3HBEX 1I1ZA 1B5ZA 1LSFA 4NGZA 1ZVYB 2ZIKA 1LTMA 4HPEA 2YBNA 4N1CC 5LVGA 4TUNA 5M1YA 1GB3A 2ZQ4A 1LZEA 3RW8A 2MECA 1GFRA 1LZTA 5KXLA 4EOFA 1JTOL 5A3EA 1B5YA 4OWCA 5B1GA 2ZNWY 3SP3A 5ILCA 1P2CC 1LMTA 1QIOA 1TAYA 4NSGA 1LYZA 1VDSA 5I4WA 2DQCY 4YEMA 5HMVA 1QSAA 3AW6A 3RU5A 1JEFA 1UIEA 1YL0X 4GN5C 5KXWA 4NGIA 1RE2A 4DD0A 2D4KA 4RW2A 4WM2A 5I4YA 1DZBX 2HU3A 4H8YA 4PRQA 1BB7A 4LYCA 1ZV5L 4Z41A 1D0KA 2C8PA 2B5ZA 5IELA 3W6BA 1DI5A 1LZBA 2HEBA 2YBHA 2YBIA 1LSCA 3CSRA 1LYOA 4XJBA 5F81A 1LZYA 1DQJC 1LSPA 1NF5A 1OUCA 2HU1A 3A3RX 4GCDA 4GCBA 4QDNA 4MR1A 2BQOA 1UIGA 4H9BA 1LJFA 1GHLA 4H90A 1IP4A 4N9RA 3WH1A 3A90A 4LT0A 5DLAA 3WXTA 2EIZC 1F10A 1FLQA 2H9JA 3HFMY 1LZ9A 4DDAA 3A94A 5HLLA 1LZ1A 1KXYA 1LZ5A 1UUZC 4HV2A 4NY5A 1DI3A 4GCCA 4Z46A 3TXGA 1F6RA 4N1EI 1YANA 1IWXA 1HFYA 2I26L 3ATNA 4NG8A 1JTTL 1LYYA 1TBYA 2XBSA 1LSBA 2BLXA 5DL9A 2RSCA 5KKJA 2BQHA 3W6AA 1EQEA 4EMNA 3D3DA 1C7PA 1B7NA 4WG1A 1B7OA 1BWJA 1KXWA 4H93A 1LJ3A 3IJUA 2DQDY 4DC4A 1GE2A 2DQHY 4ET8A 1CJ9A 1UIHA 6LYTA 1GBWA 1LZAA 1T6VL 2DKVA 2Z38A 1GDWA 1AT6A 1IWYA 1CJ8A 5EBHA 1HEMA 4KXIA 2Z2EA 1BB3A 4WLXA 3WULA 1LMOA 2BQLA 3LYZA 2X0AA 4GCEA 2HEEA 3AGGG 5I4XA 1JKCA 3AZ7A 1FLYA 5ILFA 1LJJA 4WM6A 1YILA 3J4GA 1JJ0A 1SLYA 1UBZA 2DQIY 5II3A 3N9CA 1A4VA 4G49A 1OUHA 1GBYA 1CKGA 3EBAB 1JKBA 1IY3A 3W6FA 2YVBA 1JITA 2Q0MX 4KPMA 4LFPA 2A7FA 3A93A 4PHIA 3WYHA 1B7PA 4ZFPA 2HEDA 1F0WA 3TMVA 3B0OA 4H9AA 1GEZA 5LAGA 3WPKA 4PJ2C 1EQ4A 4RLNA 1LSGA 4LT1A 1D6QA 4DDCA 3WUNA 1VEDA 4ETCA 3TXIA 3TXEA 3A95A 4CHXA 1GFHA 1RI8B 9LYZA 1GF9A 1CJ7A 4H9EA 4XENA 1OUIA 4NHTA 2G4PA 1LZGA 1T3PA 4G4BA 1UIFA 2XTHA 4UWNA 5B59A 3P68A 1C43A 1WQRA 2G4NA 4W96A 1B5VA 1DPXA 5FELA 5LYZA 1REZA 2F2NA 4LFXA 3W6CA 4B0DA 4DWXA 5C6IA 1XEIA 1BB4A 1IY4A 1IC5Y 1WQQA 1W6ZA 1GXXA 1HFZA 1NKHA 4RLMA 5LIOA 4NGKA 1GFJA 3B72A 4FJRA 1OP9B 4NHSA 1LJKA 1IOQA 1LCNA 1GBOA 1Z55A 3BKHA 1LZ8A 1LKRA 1JSEA 3LHMA 4W94A 1PZYA 3D9AC 3BKVA 3K3TA 4M4OA 5F9UA 1I56A 4O34A 1VDTA 2XJWA 1GFVA 1OUDA 4KL7A 1LSNA 3P64A 4NWEA 2ZYPA 4WLDA 4G4CA 1BQLY 4H9IA 1SQ2L 1JIYA 1GB2A 5HMJA 4M6DA 1KIRC 3LYTA 4FDYA 3QNGA 3WW5A 1OUEA 1UC0A 3M3UA 5L3IA 3TMWA 2ZYCA 4YOPA 3ZEKA 5HNCA 4NGOA 1E8LA 2BQCA 4QEQA 5DN5A 4OOOA 1GB6A 2ZIJA 1IO5A 3RT5X 1EQ5A 3OJPA 135LA 2Z18A 1UA6Y 4N0JA 1NHEA 1GF6A 4DD1A 4G4HA 1VAUA 1FDLY 1GAYA 2BQNA 5B05A 2YBMA 2DBTA 3P66A 2BQBA 4XJDA 5T3FA 3CB7A 4B4IA 1B7RA 1LZNA 5D5FA 4LYBA 5HQ1A 1LHHA 1W08A 4NFVA 3CQLA 4TSBA 4WMGA 4WL7A 4DD7A 4OW1A 1CNSA 1GDXA 1XEJA 2W1LA 1IIZA 2FBBA 1LSYA 2DQJY 1JPOA 1TDYA 1ZVHL 2F4AA 4IJ4A 4YF2A 3RZ4A 3J6KA 3AGIA 2F4GA 1UCOA 1IORA 1IWWA 4ETEA 3WU7A 4LYMA 4WO9A 1IOSA 1LSDA 1GPQC 4XN6A 5DM9A 1KIQC 134LA 1JSFA 1H87A 1GF4A 1LZDA 1N4FA 1CKCA 1OUFA 1UACY 1YAMA 2IHLA 4QGZA 3B6LA 5F14A 1GFUA 5LVKA 1KIPC 4H1PA 4II8A 1O23A 3CT0A 4DD9A 1QTKA 1GE3A 2MEIA 2D91A 1GE1A 3ZVQB 2LZTA 5KXMA 1REXA 4UWVA 5L3HA 1LHJA 4H9HA 1GFAA 4NSIA 1CKDA 1IWTA 3HBHA 4HTQA 2FYDA 4XJIA 5LA8A 3AB6A 4HSFA 4NGJA 5F16A 4ETAA 2FYCA 3B0IA 4GCFA 1BB6A 3ZVQA 1NDMC 4B4JA 1A2YC 3QE8A 3IJVA 1LMPA 4HTKA 3W3EA 1LHLA 1YKXX 3HBDA 5JENB 1LZSA 4NHPA 1LJIA 4WO6A 1TEWA 4UWUA 4CJ2A 2ZNXY 3A8ZA 1BB5A 2C8OA 4XJHA 3W6DA 4X3BA 1FLWA 2YSSC 4J1AA 4BAFA 1IOCA 1LZCA 3B0KA 3TXHA 1V7SA 1GB8A 1LJEA 4AGAA 1IP6A 2LZ2A 2D4IA 4H94A 3G3AB 1D6PA 1LSMA 3A96A 5KXSA 2ZILA 1BVKC 194LA 1LMAA 1QDRA 1YAOA 4GLVA 4XADA 5FEKA 5HNLA 5FCPA 5APCA 4WL6A 4ML7A 1FLUA 3WVYA 1GF7A 1VATA 1IWVA 1LZ6A 2XBRA 4WLTA 2F30A 4RDSA 5I54A 4H9CA 4NGVA 2Z12A 1UIAA 1H6MA 4NHIA 3TXFA 1LKSA 4DT3A 1WTNA 1JJ1A 4R6CA 1AKIA 3GXRA 4RW1A 1FBIX 3G3BB 2LYMA 5KXRA 4E3UA 1EL1A 4NWHA 5KXOA 4WM5A 1LJHA 2I25L 1GFTA 1LZRA 2HEFA 1LAAA 1UICA 4OWBA 154LA 4GN4A 1GWDA 4BS7A 3OK0A 2I6ZA 4H92A 3AZ5A 2WARA 1JTPL 5I5QA 1LHMA 1LJ4A 1B7MA 153LA 3A6BY 1CKHA 1QTEA 5LAFA 1OUBA 207LA 1DKJA 5LINA 3M18B 5KY1A 4NSJA 1B7QA 1QDTA 5APDA 1VDPA 1AT5A 1G7LC 2BLYA 1HELA 1AM7A 4N8ZA 8LYZA 4BADA 1C08C 2LYZA 3P65A 5KXNA 1D9UA 4WM3A 4B1AA 4QY9A 132LA 4BAPA 3FE0A 3WL2A 1FKQA 2EPEA 5KXPA 4I0CA 1FKVA 1XGUC 2Y8PA 3CT5A 1XGRC 1GFKA 3CSZA 3TMXA 1XGPC 2ZQ3A 4IASA 4J1BA 2W1YA 1IP7A 2BQEA 3CSQA 2AUBA 4TWSA 4Z98A 5I53A 4HJZA 1REMA 1RJCB 3WPJA 3WPLA 4YENA 5A3ZA 3ATOA 1GE4A 1LSAA 1LMQA 4I8SA 3GXKA 5E4PA 2Z39A 3TXDA 4DDBA 1HMKA 1YAQA 1JJ3A 2VB1A 193LA 1GE0A 1KXXA 3MGWA 4H8XA 2BQGA 1UIBA 3IWRA 4PRUA 4WM1A 2DQEY 2MEBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GD6A 4D9ZA 1G7MC 260LA 2RAZX 1C6CA 5APFA 5APEA 5KKIA 5K7OA 4HP0A 151LA 206LA 1NQIA 1PQMA 1L53A 1YKZX 5LVJA 1MELL 1L94A 1IP3A 1KNIA 1T8GA 2LC9A 1IR7A 1LOZA 1L45A 1LMCA 3CDRA 1L96A 3N9EA 1L69A 1QQYA 3FA0A 3LZ2A 3CDOA 5LVHA 1WQMA 1G07A 1GBSA 2CJLA 161LA 4ARLA 5FSTA 4YEOA 3T36A 3A3QA 2HTXA 220LA 4LYOA 1IOTA 1IP2A 4DAJA 2RBQA 1F6SA 4EPIA 1G7JC 1XGQC 3WW6A 1BWHA 3E3DA 1L12A 6LYZA 1AZFA 5IDDA 3WXUA 4N5RA 1ZMYL 4NEBA 4NSHA 2DQAA 1NWGA 3JR6A 4DD3A 1BWIA 4XJFA 1LSZA 1LMNA 3CT1A 1QSQA 3OE0A 5LYTA 1QSWA 4L41A 1NBZC 1IWUA 4I7LA 1OUJA 4LYZA 126LA 1HEWA 2MEDA 2OU9A 4J7VA 4C5FA 1B2KA 3AZ6A 1C6BA 4GN3A 1SX2A 2Z2FA 5DN4A 1ALCA 149LA 1B0DA 4NGYA 1QUSA 1WVVA 1LGWA 4DD2A 4NGLA 5E9RA 164LA 4OWHA 5D5CA 2RH1A 4I7SA 3HT8A 1L09A 5C6LA 4ARQA 3LYMA 1GBZA 125LA 1I1ZA 1L50A 1LTMA 1GB3A 1LZEA 1G0GA 1JTOL 173LA 5B1GA 5ILCA 1QIOA 4NSGA 3GULA 5I4WA 1C6HA 4YEMA 1JEFA 4GN5C 2NTGA 3GUJA 4LYCA 1L70A 2B5ZA 1LSCA 1KY0A 2HUMA 1LYIA 5F81A 1LSPA 2HU1A 3A3RX 4QDNA 177LA 1UIGA 4YXCA 1LJFA 3WH1A 4DDAA 5HLLA 3HH5A 1KXYA 1LZ5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GD6 A;  2BAA A;  2EKS C;  4D9Z A;  1LZ4 A;  2DQG Y;  1G7M C;  2BQA A;  1TCY A;  2HEC A;  2N5Z A;  1CJ6 A;  1JIS A;  1LJN A;  4IAT A;  4H91 A;  5KXK A;  5APF A;  2EQL A;  2BPU A;  1GB7 A;  1NMM A;  1QUT A;  5APE A;  1OUA A;  5KKI A;  5K7O A;  4LT2 A;  1HSX A;  4HP0 A;  4CFO A;  2D6B A;  3KAM A;  1NQI A;  1HEQ A;  3AJN A;  4G9S A;  1DPW A;  1YKZ X;  1J1X Y;  3ULR A;  4B49 A;  4LYT A;  1MLC E;  1YRO A;  2MEH A;  4TX7 A;  4ZEE A;  5LVJ A;  4TTD A;  2YBL A;  3A6C Y;  3TMU A;  5LVI A;  1VDQ A;  4NIJ A;  1MEL L;  4OWE A;  3WUM A;  3VWO A;  1IP3 A;  2H9K A;  2A7D A;  2YDG A;  1YKY X;  1LHI A;  4R0F A;  1HSW A;  1GB9 A;  3EMS A;  5AMY A;  1IR7 A;  1YL1 X;  1IP5 A;  1LOZ A;  2BQK A;  1XGT C;  1J1P Y;  3A92 A;  3T6U A;  4ET9 A;  1LMC A;  3N9E A;  1D0L A;  1V7T A;  1QQY A;  4CGE A;  1B7S A;  3LN2 A;  3LZ2 A;  1REY A;  5IHG A;  3WUA A;  1LHK A;  3AYQ A;  1LSE A;  3TXB A;  2PC2 A;  5LVH A;  1WQM A;  1GAZ A;  1GBS A;  1WVU A;  2CDS A;  2CJL A;  2IFF Y;  1INU A;  1XEK A;  4ETD A;  1GB5 A;  4TSC A;  5FST A; 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 1GF7 A;  1VAT A;  1IWV A;  1LZ6 A;  2XBR A;  4WLT A;  2F30 A;  4RDS A;  5I54 A;  4H9C A;  4NGV A;  2Z12 A;  1UIA A;  1H6M A;  4NHI A;  3TXF A;  1LKS A;  4DT3 A;  1WTN A;  1JJ1 A;  4R6C A;  1AKI A;  3GXR A;  4RW1 A;  1FBI X;  3G3B B;  2LYM A;  5KXR A;  4E3U A;  1EL1 A;  4NWH A;  5KXO A;  4WM5 A;  1LJH A;  2I25 L;  1GFT A;  1LZR A;  2HEF A;  1LAA A;  1UIC A;  4OWB A;  154L A;  4GN4 A;  1GWD A;  4BS7 A;  3OK0 A;  2I6Z A;  4H92 A;  3AZ5 A;  2WAR A;  1JTP L;  5I5Q A;  1LHM A;  1LJ4 A;  1B7M A;  153L A;  3A6B Y;  1CKH A;  1QTE A;  5LAF A;  1OUB A;  207L A;  1DKJ A;  5LIN A;  3M18 B;  5KY1 A;  4NSJ A;  1B7Q A;  1QDT A;  5APD A;  1VDP A;  1AT5 A;  1G7L C;  2BLY A;  1HEL A;  1AM7 A;  4N8Z A;  8LYZ A;  4BAD A;  1C08 C;  2LYZ A;  3P65 A;  5KXN A;  1D9U A;  4WM3 A;  4B1A A;  4QY9 A;  132L A;  4BAP A;  3FE0 A;  3WL2 A;  1FKQ A;  2EPE A;  5KXP A;  4I0C A;  1FKV A;  1XGU C;  2Y8P A;  3CT5 A;  1XGR C;  1GFK A;  3CSZ A;  3TMX A;  1XGP C;  2ZQ3 A;  4IAS A;  4J1B A;  2W1Y A;  1IP7 A;  2BQE A;  3CSQ A;  2AUB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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