2HEEA

Contribution of water molecules in the interior of a protein to the conformational stability
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQGNSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Contribution of water molecules in the interior of a protein to the conformational stability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 53
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2heeA00
3EO5A 1WQOA 1TBYA 2IHLA 1HELA 4GN3A 1NDGC 3WVYA 1GF8A 1GFRA 2BAAA 3RT5X 5KXLA 1B7LA 1IEEA 1YAOA 4UWUA 3A93A 1HMLA 1HENA 1LYSA 3EXDA 1G7LC 2LZTA 4HJYA 5KXPA 4BAFA 1GE3A 2D6BA 1J1PY 5I53A 8LYZA 2DQGY 3WU7A 1NBYC 3WULA 2BQKA 194LA 2YBNA 3OJPA 1ZVHL 4DC4A 1AT6A 4QDNA 1EQ4A 2HEFA 1GBXA 4H9CA 1IWUA 4HV1A 4H8XA 4B4EA 2LYZA 1SQ2L 5LYZA 3WPJA 3CB7A 5B07A 4J0LA 4I0CA 5F81A 4H8YA 4W94A 4LT3A 1KXWA 2FBDA 5C6JA 2ZQ3A 1IP4A 1YIKA 4DT3A 5IHGA 6LYZA 1GHLA 1HSXA 2DQDY 5B59A 1YAPA 1LHHA 2I6ZA 1HNLA 3QY4A 3WUNA 1BVXA 1NQIA 1VDSA 4LYBA 1TDYA 2Z38A 4QEQA 3TXFA 1LHMA 3BKHA 3A67Y 3TMXA 4NWHA 4NY5A 1WTMA 1I20A 2LZ2A 4XN6A 4TSCA 4HPIA 3EMSA 1CKHA 4J1AA 1YROA 1LSMA 1GB2A 4ML7A 1LKSA 3GXKA 4LT1A 4A7DA 4ET9A 1ALCA 2W1YA 134LA 2H9JA 1HFYA 5T3FA 1GFHA 1LTMA 2I25L 5KJ9A 3CT5A 5KY1A 2F4GA 1IP7A 4XJGA 5APCA 1QDRA 1GFJA 1HEMA 2W1XA 4DD1A 4G4BA 1QSWA 1LZAA 1IR8A 1C10A 1JKBA 1GB9A 5F16A 1QDTA 1GBYA 4NSJA 1UCOA 3E3DA 3RW8A 1NKHA 1YL1X 4OW1A 4ZFPA 4WMGA 1KXYA 3FI7A 1GF0A 5HMVA 5L3HA 1LSEA 3A96A 3TXDA 4RLMA 3ZVQB 3D3DA 4G49A 1HEQA 1JPOA 1YKYX 1AKIA 4R6CA 2C8PA 4NWEA 4YOPA 5DL9A 1LYYA 1NDMC 2BQMA 4NGIA 1UIEA 1V7TA 2MEAA 5DM9A 1GE1A 1JWRA 1AT5A 3AW6A 5DN4A 4E3UA 1LHLA 3A92A 5LAGA 4WM3A 5B1GA 1WQMA 1OQMA 4NGJA 1GFGA 1GB3A 4DDCA 1VFBC 3VWOA 4NGYA 1BVKC 208LA 2AUBA 4O34A 4H9IA 4X3BA 2DQIY 2BQLA 5E4PA 1XGTC 3B0KA 1LJ4A 3WUAA 3A6BY 1UC0A 4H9FA 5FHWA 5D5FA 4N5RA 1UICA 2BQGA 4P2EA 1IOTA 1LJKA 3WPKA 1LZCA 4OWAA 4HJVA 1C43A 1IIZA 3AZ6A 3B0OA 4MCKA 1IP1A 3A95A 4DD0A 4LYCA 4NGZA 2B5ZA 1XGRC 1DPXA 4WL6A 3WU9A 1IWXA 5IELA 4BADA 1GEVA 4GN5C 4LZTA 2G4QA 2ZNXY 3AGHA 1HSWA 2ZNWY 4ETBA 2NWDX 1LSYA 1UIHA 1IR7A 2HUBA 3WL2A 1LZRA 1OUDA 1GBOA 1I56A 1MLCE 1LZDA 2HEDA 2MEBA 1LZNA 2DQCY 1LZEA 2MEEA 4WG1A 4XJIA 3FE0A 1VDQA 3B72A 5LVKA 3WVXA 2HU1A 3OK0A 1LSPA 2IFFY 5KXNA 1JITA 2BQHA 4Z3MA 4GN4A 3BKVA 1FLWA 1BGIA 3B0IA 1NF5A 3AGGG 5C6IA 1E8LA 1I1ZA 2EPEA 3WW5A 1TEWA 3P64A 1B0DA 4R0FA 1HEPA 2YSSC 4TX7A 4DD7A 5FCPA 1QQYA 1DI4A 1H87A 3A8ZA 4PRQA 4LFPA 2ZWBA 1B5VA 4WG7A 2Z19A 3AZ7A 1OP9B 5KKIA 1IP5A 5F9UA 1JHLA 3K3TA 5ILCA 1LKRA 1OUEA 5J7CA 4H91A 1YILA 1LZTA 2PC2A 2RSCA 1GDWA 1GFEA 2MEFA 4LYMA 4NGVA 4D9ZA 1GEZA 4XJHA 4H93A 4LGKA 3W6DA 2WARA 1JTTL 4M6DA 5LIOA 3CSQA 2Z18A 5JENB 4B4JA 4N9RA 1IC7Y 1AM7A 1PZYA 4EMNA 1Z55A 1JSFA 1LZSA 1G7IC 1VEDA 2YBMA 3A94A 1GB5A 1FLQA 3IJVA 2CGIA 4XJFA 5IDDA 1YAMA 4H90A 2ZILA 1JISA 4B49A 5LVJA 1FLYA 3ZVQA 1GF9A 4NHQA 132LA 1C7PA 4OWHA 4DDBA 1GFUA 1LHKA 2MEHA 1HFZA 4MR1A 4G9SA 1LSGA 4NEBA 1DPWA 4NGLA 2XBRA 5FELA 4DYGA 1D6QA 1LZ8A 4NHIA 5KXRA 1REZA 5KKJA 4N0JA 1EQ5A 1D6PA 3W6EA 3RNXA 4MSTA 4ETCA 3TMWA 1H6MA 5KXWA 1GE2A 1GF7A 1TCYA 3WMKA 4OWBA 4WLTA 1TAYA 1LZ4A 1BHZA 4XADA 1HFXA 5L9JA 4YENA 3AZ5A 1REMA 5HNLA 1HEOA 4N8ZA 2G4PA 1NHEA 3J6KA 5KXZA 3TMVA 4WM2A 3LYMA 1REYA 2Y8PA 1LJEA 5APFA 1XFPL 1GF3A 3J4GA 1BB7A 2D4KA 5LVIA 1OUFA 1YAQA 3WUMA 3KAMA 5LINA 4RDSA 2Z37A 1B7OA 1LMPA 4PJ2C 4WLXA 5ILFA 2LHMA 154LA 4H9EA 1UIDA 1WQRA 4ETDA 1YQVY 1JUGA 4H1PA 2FYDA 2F2NA 2Z12A 4XYYA 5KXKA 4PRUA 5A3EA 1PS5A 1IWYA 2LYOA 4HTKA 1GFAA 4OOOA 1JKAA 2XTHA 3ZEKA 4YM8A 2HECA 4HTQA 3A3QA 1EQEA 1CJ8A 3W6CA 1GF4A 1CNSA 1JTPL 4QY9A 5LA8A 1BB6A 2YDGA 5D5CA 1QTKA 4H94A 2GV0A 1QUTA 1MELL 1NMMA 3N9AA 4NG8A 3A34A 4H9AA 4AXTA 1FBIX 2EQLA 3IJUA 4ET8A 1KIPC 4ETEA 1IY3A 4XJDA 2DQHY 1BWHA 2C8OA 1UACY 2BQJA 4WLYA 3TXBA 5KXOA 1D0LA 4EOFA 1LAAA 1LZYA 4NSGA 4TSBA 4U3XB 1A2YC 1IP3A 1LYZA 2ZYCA 2MEIA 1CKDA 4HPEA 4KXIA 1UIGA 1LMCA 4YF2A 2W1MA 1LMTA 2Z2EA 1XGUC 4GCCA 3G3AB 1GB7A 4H9HA 4PGJB 3TMUA 1IY4A 2EKSC 1IP6A 2A7DA 1B9OA 4FJRA 4HTNA 4YEMA 1QTEA 2YBHA 1LJGA 4WL7A 4ANRA 1YL0X 2DQAA 3WW6A 5HMJA 1T6VL 1JJ1A 2BQAA 3N9EA 2FYCA 1IORA 3CSZA 3G3BB 5KXSA 4DDAA 4NHPA 1GAYA 4CFOA 3A90A 1WQNA 1DKKA 1IWZA 1FKVA 1WQPA 4IASA 1D0MA 1DZBX 5A3ZA 3MGWA 4NSIA 3WU8A 3F6ZA 4Z98A 2DQEY 4WLDA 3AB6A 1UIBA 4WO6A 1LSNA 1XEKA 1LPIA 1HF4A 4WM4A 3TXHA 5I4XA 1GF5A 1LYOA 2HU3A 2F4AA 4N1EI 1G7HC 1CJ7A 4HSFA 1SLYA 3HBEX 5HLLA 3LZ2A 1OUAA 1BB4A 1GXXA 4LYZA 5KXXA 1GXV2 2XBSA 2BQFA 1UA6Y 4N1CC 1A4VA 1OUIA 1GFVA 1GD6A 1CKCA 1NBZC 3LZTA 1IOCA 1RI8B 5DN5A 1B2KA 4FDYA 1IR9A 2BQCA 5I5QA 1HC0A 2D91A 1FLUA 3ULRA 1VDTA 2MEGA 2BLXA 4DD9A 3A3RX 4DWXA 4LYTA 3W6BA 4GLAA 1VAUA 1B7PA 1RE2A 2BPUA 1J1OY 4XJBA 2HEEA 1HERA 1JJ0A 4C5FA 5LA5A 1DKJA 1N4FA 3M18B 1FDLY 2BQIA 2Z2FA 2I26L 4NHSA 4KPMA 1AZFA 1LCNA 1LJFA 1RJCB 1O23A 3ATOA 4CFPA 1W08A 4AGAA 4NHTA 5I54A 2F30A 4NG1A 2BQBA 1B5XA 1JIYA 1B5WA 1IOQA 1OUBA 1ZV5L 1CJ9A 1G7MC 1YANA 1YKXX 4NGKA 3TXGA 1INUA 1IC5Y 1RCMA 3WXUA 2ZQ4A 1CKGA 5KXTA 2BQDA 1IWWA 4W96A 3HBHA 1OUJA 2YBIA 4KT3A 1GBWA 4L41A 5FSTA 5C6LA 1UIAA 1LSAA 1LHJA 2YVBA 3B6LA 1XGPC 3TXIA 3WH1A 4G4CA 133LA 4WM1A 5FEKA 1GWDA 1B5UA 2MEDA 4B0DA 3N9CA 3HFMY 3SP3A 3P66A 1JTOL 1ZVYB 1RFPA 4UWVA 1LOZA 5LVHA 4RW2A 1IO5A 135LA 1XEIA 2DBTA 5FDJA 1LJNA 4PHIA 4I8SA 5I4YA 4CJ2A 1WVVA 2Q0MX 1BWJA 1FKQA 4HV2A 5EBHA 4GLVA 5AMYA 5LVGA 5APEA 153LA 5II3A 1HHLA 2W1LA 1JEFA 4GCBA 1LSFA 4GCFA 1JKDA 1VATA 3GXRA 3CQLA 2DKVA 5HNCA 3EBAB 4J7VA 1BB3A 1IX0A 1GFTA 1LZBA 3RU5A 2ZYPA 1F6SA 2H5ZA 4BAPA 1DI3A 1FN5A 4HP0A 4OWCA 1LSBA 4NGWA 1LSZA 1LMAA 1JKCA 5K7OA 1QUSA 4ETAA 2XJWA 3QE8A 1EL1A 4CHXA 1B7SA 2ZIKA 1LMOA 1B7QA 3LHMA 1WVUA 2G4NA 4RW1A 1F0WA 2H9KA 3TXJA 2YBLA 3WXTA 3A91A 4TWSA 1GFKA 4J1BA 1QSAA 1OUHA 4RLNA 5E9RA 5B05A 5LYTA 4C3WA 2VB1A 4DD3A 4H8ZA 2BQEA 5L3IA 4IJ4A 3AJNA 1B7NA 4TTDA 5F9XA 1KXXA 3M3UA 4LT0A 207LA 1LZ1A 1P2CC 1LJIA 2LYMA 3A6CY 1CKFA 3ATNA 2BQOA 4OOTA 4UWNA 1LSDA 4B1AA 1UIFA 4NFVA 5B1FA 4ZEEA 2YBJA 1DXJA 4WOAA 1GBZA 1IWVA 1GPQC 4TUNA 3T6UA 1V7SA 3W6AA 4M4OA 1IVMA 3CSRA 4HJZA 4YEOA 4NSHA 2EIZC 2FBBA 1GF6A 3LYZA 4XENA 1ZMYL 2BLYA 2BQNA 1JSEA 3CT0A 3AZ4A 4WM5A 5APDA 5F14A 3LYTA 2HEAA 1XEJA 3LN2A 4IATA 4B4IA 1F6RA 1UUZC 3W6FA 4DD2A 1C46A 2MECA 1GDXA 1J1XY 193LA 1NWGA 1T3PA 1LSCA 3T36A 1UBZA 1KIRC 1B7RA 1DI5A 1HEWA 2D4JA 2DQJY 4GCDA 5I4WA 1GB0A 1VDPA 4H9BA 1QIOA 1JJ3A 1YKZX 1LZ6A 3CT1A 4LT2A 1G7JC 1GBSA 1LHIA 1GE4A 3P4ZA 1DQJC 4OWEA 5HQ1A 4WM6A 3WPLA 2D4IA 1D0KA 7LYZA 5LYMA 1C45A 1CJ6A 1GB6A 5KXYA 1GE0A 4G4HA 1KIQC 4Z41A 3D9AC 2X0AA 3LYOA 3W3EA 3AYQA 4LYOA 4NGOA 1IP2A 1D9UA 1LJHA 3P68A 2HEBA 3P65A 4Z46A 4WO9A 1XSFA 4ZIXA 3AGIA 1OUCA 1HMKA 2DQFC 4QGZA 5DLAA 5B06A 4CGEA 1BB5A 3WYHA 1REXA 5LAFA 1IOSA 1LJJA 1BWIA 3AW7A 2ZIJA 2CDSA 1IWTA 1LZ9A 3RZ4A 3QNGA 4NIJA 9LYZA 2N5ZA 4H92A 2A7FA 2CJLA 1GB8A 1WQQA 1C08C 5KXMA 1GAZA 2Z39A 3IWRA 1WTNA 3HBDA 1OUGA 2HTXA 4II8A 4BS7A 2CWIA 5M1YA 5LXWA 1BQLY 4KL7A 1LZGA 1XGQC 3TXKA 6LYTA 1F10A 4LFXA 1LMNA 1LJ3A 1IC4Y 1B7MA 3TXEA 1B5YA 1LMQA 1LZ5A 4GCEA 1W6ZA 1B5ZA 4PPOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L40A 1WQOA 1NDGC 1GF8A 6LZMA 4UWUA 1ZWNA 1CU3A 1G7LC 4BAFA 1L17A 1GE3A 1QTZA 1SX7A 1NBYC 178LA 2BQKA 2YBNA 3HTDA 1ZVHL 4QDNA 1LYFA 4H9CA 4H8XA 1SQ2L 5B07A 4I0CA 2FBDA 1YIKA 1GHLA 3C81A 1LHHA 1HNLA 1BVXA 1NQIA 4QEQA 1L91A 4W59A 3SB8A 2LZ2A 146LA 109LA 189LA 1LYDA 2RBNA 1GB2A 4I7PA 259LA 1LKSA 4ET9A 2H9JA 5T3FA 1HFYA 5KJ9A 1GFHA 221LA 3CT5A 5KY1A 174LA 2F4GA 1C6TA 1KW5A 1GFJA 2OTZX 1L49A 1LZAA 1C10A 126LA 1L52A 244LA 1YL1X 4ZFPA 4WMGA 2QB0B 256LA 1L16A 2B6TA 4G49A 1HEQA 4R6CA 1AKIA 5DL9A 4NGIA 1L84A 5DM9A 1GE1A 1AT5A 3AW6A 4E3UA 1LHLA 5LAGA 1OQMA 4NGJA 1GB3A 4NGYA 3HTBA 4O34A 176LA 4EJ4A 1CU2A 1L74A 3WUAA 3A6BY 4N5RA 1IOTA 3WPKA 3B0OA 4GRVA 4DD0A 228LA 4LYCA 4NGZA 215LA 4WL6A 4PK0A 4LZTA 4ETBA 1UIHA 240LA 251LA 1I56A 1L90A 2DQCY 1L19A 2MEEA 4WG1A 3FE0A 5KXKA 198LA 3BKVA 1FLWA 3SB6A 3SN6R 111LA 2EPEA 2HUMA 1HEPA 2YSSC 3HT6A 5FCPA 1QT8A 1C60A 1H87A 4LFPA 188LA 3K3TA 255LA 243LA 1L04A 1LZTA 4I7TA 161LA 1C64A 1GDWA 2MEFA 1G0LA 3HDEA 4LGKA 2B72A 2WARA 3CSQA 4S0WA 4N9RA 1G7IC 206LA 3IJVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3EO5 A;  1WQO A;  1TBY A;  2IHL A;  1HEL A;  4GN3 A;  1NDG C;  3WVY A;  1GF8 A;  1GFR A;  2BAA A;  3RT5 X;  5KXL A;  1B7L A;  1IEE A;  1YAO A;  4UWU A;  3A93 A;  1HML A;  1HEN A;  1LYS A;  3EXD A;  1G7L C;  2LZT A;  4HJY A;  5KXP A;  4BAF A;  1GE3 A;  2D6B A;  1J1P Y;  5I53 A;  8LYZ A;  2DQG Y;  3WU7 A;  1NBY C;  3WUL A;  2BQK A;  194L A;  2YBN A;  3OJP A;  1ZVH L;  4DC4 A;  1AT6 A;  4QDN A;  1EQ4 A;  2HEF A;  1GBX A;  4H9C A;  1IWU A;  4HV1 A;  4H8X A;  4B4E A;  2LYZ A;  1SQ2 L;  5LYZ A;  3WPJ A;  3CB7 A;  5B07 A;  4J0L A;  4I0C A;  5F81 A;  4H8Y A;  4W94 A;  4LT3 A;  1KXW A;  2FBD A;  5C6J A;  2ZQ3 A;  1IP4 A;  1YIK A;  4DT3 A;  5IHG A;  6LYZ A;  1GHL A;  1HSX A;  2DQD Y;  5B59 A;  1YAP A;  1LHH A;  2I6Z A;  1HNL A;  3QY4 A;  3WUN A;  1BVX A;  1NQI A;  1VDS A;  4LYB A;  1TDY A;  2Z38 A;  4QEQ A;  3TXF A;  1LHM A;  3BKH A;  3A67 Y;  3TMX A;  4NWH A;  4NY5 A;  1WTM A;  1I20 A;  2LZ2 A;  4XN6 A;  4TSC A;  4HPI A;  3EMS A;  1CKH A;  4J1A A;  1YRO A;  1LSM A;  1GB2 A;  4ML7 A;  1LKS A;  3GXK A; 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 2BLY A;  2BQN A;  1JSE A;  3CT0 A;  3AZ4 A;  4WM5 A;  5APD A;  5F14 A;  3LYT A;  2HEA A;  1XEJ A;  3LN2 A;  4IAT A;  4B4I A;  1F6R A;  1UUZ C;  3W6F A;  4DD2 A;  1C46 A;  2MEC A;  1GDX A;  1J1X Y;  193L A;  1NWG A;  1T3P A;  1LSC A;  3T36 A;  1UBZ A;  1KIR C;  1B7R A;  1DI5 A;  1HEW A;  2D4J A;  2DQJ Y;  4GCD A;  5I4W A;  1GB0 A;  1VDP A;  4H9B A;  1QIO A;  1JJ3 A;  1YKZ X;  1LZ6 A;  3CT1 A;  4LT2 A;  1G7J C;  1GBS A;  1LHI A;  1GE4 A;  3P4Z A;  1DQJ C;  4OWE A;  5HQ1 A;  4WM6 A;  3WPL A;  2D4I A;  1D0K A;  7LYZ A;  5LYM A;  1C45 A;  1CJ6 A;  1GB6 A;  5KXY A;  1GE0 A;  4G4H A;  1KIQ C;  4Z41 A;  3D9A C;  2X0A A;  3LYO A;  3W3E A;  3AYQ A;  4LYO A;  4NGO A;  1IP2 A;  1D9U A;  1LJH A;  3P68 A;  2HEB A;  3P65 A;  4Z46 A;  4WO9 A;  1XSF A;  4ZIX A;  3AGI A;  1OUC A;  1HMK A;  2DQF C;  4QGZ A;  5DLA A;  5B06 A;  4CGE A;  1BB5 A;  3WYH A;  1REX A;  5LAF A;  1IOS A;  1LJJ A;  1BWI A;  3AW7 A;  2ZIJ A;  2CDS A;  1IWT A;  1LZ9 A;  3RZ4 A;  3QNG A;  4NIJ A;  9LYZ A;  2N5Z A;  4H92 A;  2A7F A;  2CJL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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